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BC 5 HOH 115 815 3001 HOH HOH B . BC 5 HOH 116 816 43 HOH HOH B . BC 5 HOH 117 817 2620 HOH HOH B . BC 5 HOH 118 818 3945 HOH HOH B . BC 5 HOH 119 819 2242 HOH HOH B . BC 5 HOH 120 820 4279 HOH HOH B . BC 5 HOH 121 821 2917 HOH HOH B . BC 5 HOH 122 822 851 HOH HOH B . BC 5 HOH 123 823 1215 HOH HOH B . BC 5 HOH 124 824 2013 HOH HOH B . BC 5 HOH 125 825 524 HOH HOH B . BC 5 HOH 126 826 733 HOH HOH B . BC 5 HOH 127 827 3311 HOH HOH B . BC 5 HOH 128 828 782 HOH HOH B . BC 5 HOH 129 829 4122 HOH HOH B . BC 5 HOH 130 830 456 HOH HOH B . BC 5 HOH 131 831 4232 HOH HOH B . BC 5 HOH 132 832 3543 HOH HOH B . BC 5 HOH 133 833 1283 HOH HOH B . BC 5 HOH 134 834 2927 HOH HOH B . BC 5 HOH 135 835 2605 HOH HOH B . BC 5 HOH 136 836 47 HOH HOH B . BC 5 HOH 137 837 1716 HOH HOH B . BC 5 HOH 138 838 2720 HOH HOH B . BC 5 HOH 139 839 3435 HOH HOH B . BC 5 HOH 140 840 3021 HOH HOH B . BC 5 HOH 141 841 438 HOH HOH B . BC 5 HOH 142 842 2376 HOH HOH B . BC 5 HOH 143 843 1190 HOH HOH B . BC 5 HOH 144 844 3362 HOH HOH B . BC 5 HOH 145 845 3102 HOH HOH B . BC 5 HOH 146 846 3744 HOH HOH B . BC 5 HOH 147 847 4418 HOH HOH B . BC 5 HOH 148 848 4392 HOH HOH B . BC 5 HOH 149 849 3231 HOH HOH B . BC 5 HOH 150 850 4223 HOH HOH B . BC 5 HOH 151 851 3416 HOH HOH B . BC 5 HOH 152 852 3994 HOH HOH B . BC 5 HOH 153 853 4462 HOH HOH B . BC 5 HOH 154 854 4096 HOH HOH B . BC 5 HOH 155 855 3228 HOH HOH B . BC 5 HOH 156 856 3245 HOH HOH B . BC 5 HOH 157 857 2712 HOH HOH B . CC 5 HOH 1 701 2268 HOH HOH C . CC 5 HOH 2 702 2590 HOH HOH C . CC 5 HOH 3 703 4194 HOH HOH C . CC 5 HOH 4 704 3323 HOH HOH C . CC 5 HOH 5 705 919 HOH HOH C . CC 5 HOH 6 706 1289 HOH HOH C . CC 5 HOH 7 707 23 HOH HOH C . CC 5 HOH 8 708 4230 HOH HOH C . CC 5 HOH 9 709 387 HOH HOH C . CC 5 HOH 10 710 1421 HOH HOH C . CC 5 HOH 11 711 1118 HOH HOH C . CC 5 HOH 12 712 2159 HOH HOH C . CC 5 HOH 13 713 890 HOH HOH C . CC 5 HOH 14 714 1249 HOH HOH C . CC 5 HOH 15 715 3987 HOH HOH C . CC 5 HOH 16 716 887 HOH HOH C . CC 5 HOH 17 717 3334 HOH HOH C . CC 5 HOH 18 718 2617 HOH HOH C . CC 5 HOH 19 719 1140 HOH HOH C . CC 5 HOH 20 720 2002 HOH HOH C . CC 5 HOH 21 721 212 HOH HOH C . CC 5 HOH 22 722 1123 HOH HOH C . CC 5 HOH 23 723 985 HOH HOH C . CC 5 HOH 24 724 2673 HOH HOH C . CC 5 HOH 25 725 395 HOH HOH C . CC 5 HOH 26 726 902 HOH HOH C . CC 5 HOH 27 727 2891 HOH HOH C . CC 5 HOH 28 728 3909 HOH HOH C . CC 5 HOH 29 729 1512 HOH HOH C . CC 5 HOH 30 730 1183 HOH HOH C . CC 5 HOH 31 731 2771 HOH HOH C . CC 5 HOH 32 732 2480 HOH HOH C . CC 5 HOH 33 733 4240 HOH HOH C . CC 5 HOH 34 734 1615 HOH HOH C . CC 5 HOH 35 735 681 HOH HOH C . CC 5 HOH 36 736 1818 HOH HOH C . CC 5 HOH 37 737 3208 HOH HOH C . CC 5 HOH 38 738 1168 HOH HOH C . CC 5 HOH 39 739 201 HOH HOH C . CC 5 HOH 40 740 3623 HOH HOH C . CC 5 HOH 41 741 254 HOH HOH C . CC 5 HOH 42 742 2245 HOH HOH C . CC 5 HOH 43 743 2182 HOH HOH C . CC 5 HOH 44 744 2822 HOH HOH C . CC 5 HOH 45 745 4435 HOH HOH C . CC 5 HOH 46 746 583 HOH HOH C . 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HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES REFINED INDIVIDUALLY ; _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 5EUJ _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 2.1500 _refine.ls_d_res_low 75.4 _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 814954 _refine.ls_number_reflns_R_free 42940 _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs 98.8300 _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0000 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.1877 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2198 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.1860 _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details MASK _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.000 _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 2VBI _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.2150 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.1750 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.2000 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.8000 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.8000 _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.overall_SU_B 5.5010 _refine.overall_SU_ML 0.1370 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # _refine_hist.cycle_id final _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.d_res_high 2.1500 _refine_hist.d_res_low 75.4 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 668 _refine_hist.number_atoms_solvent 4316 _refine_hist.number_atoms_total 105938 _refine_hist.pdbx_number_residues_total 13323 _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand 24.42 _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_solvent 25.54 _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 100954 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'X-RAY DIFFRACTION' ? 0.008 0.019 104825 ? r_bond_refined_d ? ? 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H MG 601 H TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.080 ? ? metalc47 metalc ? ? OA MG . MG ? ? ? 1_555 PA TPP . O3B ? ? H MG 601 H TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? ? metalc48 metalc ? ? OA MG . MG ? ? ? 1_555 HC HOH . O ? ? H MG 601 H HOH 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.140 ? ? metalc49 metalc ? ? I ASP 435 OD1 ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? I ASP 435 I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? metalc50 metalc ? ? I ASN 462 OD1 ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? I ASN 462 I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? ? metalc51 metalc ? ? I GLY 464 O ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? I GLY 464 I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? ? metalc52 metalc ? ? QA MG . MG ? ? ? 1_555 RA TPP . O1A ? ? I MG 601 I TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.050 ? ? metalc53 metalc ? ? QA MG . MG ? ? ? 1_555 RA TPP . O1B ? ? I MG 601 I TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? ? metalc54 metalc ? ? QA MG . MG ? ? ? 1_555 IC HOH . O ? ? I MG 601 I HOH 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? ? metalc55 metalc ? ? J ASP 435 OD1 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? J ASP 435 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? ? metalc56 metalc ? ? J ASN 462 OD1 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? J ASN 462 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? ? metalc57 metalc ? ? J GLY 464 O ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? J GLY 464 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? ? metalc58 metalc ? ? TA MG . MG ? ? ? 1_555 UA TPP . O1B ? ? J MG 601 J TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.969 ? ? metalc59 metalc ? ? TA MG . MG ? ? ? 1_555 UA TPP . O1A ? ? J MG 601 J TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.928 ? ? metalc60 metalc ? ? TA MG . MG ? ? ? 1_555 JC HOH . O ? ? J MG 601 J HOH 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? ? metalc61 metalc ? ? K ASP 435 OD1 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? K ASP 435 K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? metalc62 metalc ? ? K ASN 462 OD1 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? K ASN 462 K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? ? metalc63 metalc ? ? K GLY 464 O ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? K GLY 464 K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? ? metalc64 metalc ? ? VA MG . MG ? ? ? 1_555 WA TPP . O2A ? ? 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P ASP 435 P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? ? metalc92 metalc ? ? P ASN 462 OD1 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? P ASN 462 P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.160 ? ? metalc93 metalc ? ? P GLY 464 O ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? P GLY 464 P MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? ? metalc94 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 HB TPP . O1B ? ? P MG 601 P TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? ? metalc95 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 HB TPP . O1A ? ? P MG 601 P TPP 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.957 ? ? metalc96 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 PC HOH . O ? ? P MG 601 P HOH 785 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? ? metalc97 metalc ? ? Q ASP 435 OD1 ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? Q ASP 435 Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc98 metalc ? ? Q ASN 462 OD1 ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? Q ASN 462 Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? metalc99 metalc ? ? Q GLY 464 O ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? Q GLY 464 Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? ? metalc100 metalc ? ? IB MG . MG ? ? ? 1_555 JB TPP . O2A ? ? 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R TPP 602 ? 1_555 92.3 ? 264 O ? R GLY 464 ? R GLY 464 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O3B ? MB TPP . ? R TPP 602 ? 1_555 89.1 ? 265 O2A ? MB TPP . ? R TPP 602 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O3B ? MB TPP . ? R TPP 602 ? 1_555 88.6 ? 266 OD1 ? R ASP 435 ? R ASP 435 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O ? RC HOH . ? R HOH 735 ? 1_555 88.3 ? 267 OD1 ? R ASN 462 ? R ASN 462 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O ? RC HOH . ? R HOH 735 ? 1_555 83.3 ? 268 O ? R GLY 464 ? R GLY 464 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O ? RC HOH . ? R HOH 735 ? 1_555 167.1 ? 269 O2A ? MB TPP . ? R TPP 602 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O ? RC HOH . ? R HOH 735 ? 1_555 93.8 ? 270 O3B ? MB TPP . ? R TPP 602 ? 1_555 MG ? LB MG . ? R MG 601 ? 1_555 O ? RC HOH . ? R HOH 735 ? 1_555 80.7 ? 271 OD1 ? S ASP 435 ? S ASP 435 ? 1_555 MG ? OB MG . ? S MG 601 ? 1_555 OD1 ? S ASN 462 ? S ASN 462 ? 1_555 88.2 ? 272 OD1 ? S ASP 435 ? S ASP 435 ? 1_555 MG ? OB MG . ? S MG 601 ? 1_555 O ? 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T HOH 773 ? 1_555 168.9 ? 299 O1B ? RB TPP . ? T TPP 602 ? 1_555 MG ? QB MG . ? T MG 601 ? 1_555 O ? TC HOH . ? T HOH 773 ? 1_555 85.2 ? 300 O1A ? RB TPP . ? T TPP 602 ? 1_555 MG ? QB MG . ? T MG 601 ? 1_555 O ? TC HOH . ? T HOH 773 ? 1_555 92.9 ? 301 OD1 ? U ASP 435 ? U ASP 435 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 OD1 ? U ASN 462 ? U ASN 462 ? 1_555 89.3 ? 302 OD1 ? U ASP 435 ? U ASP 435 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 O ? U GLY 464 ? U GLY 464 ? 1_555 94.7 ? 303 OD1 ? U ASN 462 ? U ASN 462 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 O ? U GLY 464 ? U GLY 464 ? 1_555 87.3 ? 304 OD1 ? U ASP 435 ? U ASP 435 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 O1A ? TB TPP . ? U TPP 602 ? 1_555 92.3 ? 305 OD1 ? U ASN 462 ? U ASN 462 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 O1A ? TB TPP . ? U TPP 602 ? 1_555 178.4 ? 306 O ? U GLY 464 ? U GLY 464 ? 1_555 MG ? SB MG . ? U MG 601 ? 1_555 O1A ? TB TPP . ? U TPP 602 ? 1_555 92.9 ? 307 OD1 ? U ASP 435 ? U ASP 435 ? 1_555 MG ? SB MG . ? 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EDO O1 HO1 sing N N 87 EDO C2 O2 sing N N 88 EDO C2 H21 sing N N 89 EDO C2 H22 sing N N 90 EDO O2 HO2 sing N N 91 GLN N CA sing N N 92 GLN N H sing N N 93 GLN N H2 sing N N 94 GLN CA C sing N N 95 GLN CA CB sing N N 96 GLN CA HA sing N N 97 GLN C O doub N N 98 GLN C OXT sing N N 99 GLN CB CG sing N N 100 GLN CB HB2 sing N N 101 GLN CB HB3 sing N N 102 GLN CG CD sing N N 103 GLN CG HG2 sing N N 104 GLN CG HG3 sing N N 105 GLN CD OE1 doub N N 106 GLN CD NE2 sing N N 107 GLN NE2 HE21 sing N N 108 GLN NE2 HE22 sing N N 109 GLN OXT HXT sing N N 110 GLU N CA sing N N 111 GLU N H sing N N 112 GLU N H2 sing N N 113 GLU CA C sing N N 114 GLU CA CB sing N N 115 GLU CA HA sing N N 116 GLU C O doub N N 117 GLU C OXT sing N N 118 GLU CB CG sing N N 119 GLU CB HB2 sing N N 120 GLU CB HB3 sing N N 121 GLU CG CD sing N N 122 GLU CG HG2 sing N N 123 GLU CG HG3 sing N N 124 GLU CD OE1 doub N N 125 GLU CD OE2 sing N N 126 GLU OE2 HE2 sing N N 127 GLU OXT HXT sing N N 128 GLY N CA sing N N 129 GLY N H 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