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P03088 1 ? 362 ? 1 362 5 1 5FUA 5 1 ? 362 ? P03088 1 ? 362 ? 1 362 6 1 5FUA 6 1 ? 362 ? P03088 1 ? 362 ? 1 362 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 360-MERIC 360 2 'icosahedral asymmetric unit' ? hexameric 6 3 'icosahedral pentamer' ? 30-meric 30 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 36-meric 36 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? hexameric 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F 2 1 A,B,C,D,E,F 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F 5 P A,B,C,D,E,F # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? -0.95105231 0.30902995 0.00002035 -0.00614 -0.26286849 -0.80902317 0.52572014 0.99519 0.16247973 0.49998200 0.85065759 1.63115 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 -0.95105652 -0.00000703 -0.01451 0.95105652 0.30901699 -0.00002744 0.00287 0.00002827 0.00000179 1.00000000 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.58778525 0.00001689 -0.02173 0.58778525 -0.80901700 -0.00004260 -0.01004 0.00003871 -0.00002454 1.00000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.58778525 0.00003871 -0.01168 -0.58778525 -0.80901699 -0.00002454 -0.02090 0.00001690 -0.00004261 1.00000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.95105651 0.00002827 0.00175 -0.95105652 0.30901700 0.00000179 -0.01469 -0.00000703 -0.00002744 1.00000000 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.94720067 0.16247388 0.27642923 0.51153 0.16247388 -0.50003600 0.85062697 1.61406 0.27642923 0.85062697 0.44723667 -1.04638 7 'point symmetry operation' ? ? -0.13817145 0.95104906 0.27643143 0.52574 -0.42533125 -0.30903993 0.85063955 1.61026 0.89442830 -0.00004084 0.44721139 -1.04795 8 'point symmetry operation' ? ? 0.86181189 0.42529967 0.27640631 0.53048 -0.42532498 0.30901700 0.85065102 1.61555 0.27636736 -0.85066367 0.44720510 -1.06093 9 'point symmetry operation' ? ? 0.67080637 -0.68820650 0.27638858 0.51920 0.16248402 0.50000112 0.85064553 1.62261 -0.72361438 -0.52570970 0.44722650 -1.06739 10 'point symmetry operation' ? ? -0.44722489 -0.85064177 0.27640275 0.50748 0.52576370 -0.00002112 0.85063067 1.62169 -0.72357614 0.52574574 0.44724601 -1.05840 11 'point symmetry operation' ? ? -0.86180031 0.42533341 -0.27639053 -0.54174 0.42533340 0.30903698 -0.85063955 -1.62730 -0.27639052 -0.85063955 -0.44723667 -2.77510 12 'point symmetry operation' ? ? 0.13819735 0.95105555 -0.27639614 -0.52801 0.42532284 -0.30901995 -0.85065102 -1.63258 -0.89442830 0.00000013 -0.44721139 -2.77353 13 'point symmetry operation' ? ? 0.94720510 0.16245834 -0.27642320 -0.52728 -0.16248750 -0.50000000 -0.85064553 -1.63964 -0.27640607 0.85065110 -0.44720510 -2.76055 14 'point symmetry operation' ? ? 0.44720172 -0.85064369 -0.27643432 -0.54056 -0.52576370 0.00002477 -0.85063067 -1.63872 0.72359045 0.52574263 -0.44722650 -2.75409 15 'point symmetry operation' ? ? -0.67082510 -0.68817796 -0.27641412 -0.54950 -0.16247041 0.50003712 -0.85062697 -1.63109 0.72360006 -0.52571281 -0.44724601 -2.76309 16 'point symmetry operation' ? ? 0.80900098 -0.58780729 -0.00003871 -0.00685 -0.58780728 -0.80900098 0.00001258 -0.02083 -0.00003871 0.00001258 -1.00000000 -3.82148 17 'point symmetry operation' ? ? -0.30904290 -0.95104810 -0.00002827 -0.02028 -0.95104810 0.30904290 0.00003891 -0.01462 -0.00002827 0.00003891 -1.00000000 -3.82148 18 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00002725 0.00000000 -0.01853 0.00002723 1.00000000 0.00003711 0.00007 0.00000000 0.00003712 -1.00000000 -3.82148 19 'point symmetry operation' ? ? -0.30899109 0.95106493 0.00000703 -0.00401 0.95106493 0.30899109 0.00000967 0.00294 0.00000703 0.00000967 -1.00000000 -3.82148 20 'point symmetry operation' ? ? 0.80903300 0.58776321 -0.00001689 0.00320 0.58776322 -0.80903300 -0.00000549 -0.00997 -0.00001690 -0.00000549 -1.00000000 -3.82148 21 'point symmetry operation' ? ? 0.05276417 -0.68819314 -0.72360634 -1.39726 0.68820494 -0.50000001 0.52571281 0.99810 -0.72359512 -0.52572826 0.44723584 -1.06737 22 'point symmetry operation' ? ? -0.63822600 -0.26284637 -0.72358783 -1.40000 -0.26284637 -0.80902935 0.52572169 0.98668 -0.72358784 0.52572170 0.44725535 -1.05838 23 'point symmetry operation' ? ? -0.44722490 0.52576370 -0.72357613 -1.39150 -0.85064177 -0.00002111 0.52574574 0.98817 0.27640274 0.85063066 0.44724601 -1.04636 24 'point symmetry operation' ? ? 0.36181044 0.58780477 -0.72358742 -1.38349 -0.26286798 0.80900282 0.52575172 1.00051 0.89442363 -0.00001450 0.44722073 -1.04793 25 'point symmetry operation' ? ? 0.67082068 -0.16246182 -0.72360609 -1.38706 0.68819159 0.49999886 0.52573137 1.00665 0.27639096 -0.85065110 0.44721444 -1.06091 26 'point symmetry operation' ? ? -0.36181761 -0.26282493 -0.89443338 -1.72389 -0.58778274 0.80901882 0.00004452 -0.00699 0.72360173 0.52574861 -0.44720121 -2.75405 27 'point symmetry operation' ? ? -0.36179444 0.26289003 -0.89442363 -1.71939 0.58778777 0.80901516 0.00002645 0.00387 0.72360924 -0.52572170 -0.44722072 -2.76304 28 'point symmetry operation' ? ? 0.13819735 0.42532284 -0.89442829 -1.71338 0.95105556 -0.30901996 0.00000013 -0.00234 -0.27639613 -0.85065102 -0.44721139 -2.77505 29 'point symmetry operation' ? ? 0.44718610 -0.00000312 -0.89444094 -1.71417 -0.00000311 -1.00000000 0.00000192 -0.01703 -0.89444094 0.00000193 -0.44718610 -2.77348 30 'point symmetry operation' ? ? 0.13815986 -0.42530182 -0.89444408 -1.72066 -0.95105748 -0.30901403 0.00002936 -0.01990 -0.27640827 0.85066367 -0.44717982 -2.76050 31 'point symmetry operation' ? ? -0.13818577 0.42529340 0.89444408 1.70213 -0.95106397 -0.30899404 -0.00001159 -0.01998 0.27637297 -0.85067514 0.44717982 -1.06098 32 'point symmetry operation' ? ? 0.36180160 0.26284697 0.89443338 1.70536 -0.58776574 0.80903118 0.00000357 -0.00706 -0.72362355 -0.52571858 0.44720121 -1.06744 33 'point symmetry operation' ? ? 0.36181045 -0.26286798 0.89442363 1.70086 0.58780477 0.80900281 -0.00001450 0.00379 -0.72358742 0.52575172 0.44722072 -1.05844 34 'point symmetry operation' ? ? -0.13817144 -0.42533126 0.89442829 1.69485 0.95104906 -0.30903994 -0.00004083 -0.00242 0.27643143 0.85063955 0.44721138 -1.04643 35 'point symmetry operation' ? ? -0.44718610 -0.00002413 0.89444094 1.69564 -0.00002412 -1.00000000 -0.00003903 -0.01711 0.89444094 -0.00003904 0.44718610 -1.04800 36 'point symmetry operation' ? ? 0.44723922 0.52572466 0.72359565 1.38196 0.85064177 -0.00002477 -0.52574574 -1.00520 -0.27637958 0.85065479 -0.44721444 -2.76057 37 'point symmetry operation' ? ? 0.63821884 -0.26289062 0.72357808 1.37698 0.26282435 -0.80901699 -0.52575172 -1.01755 0.72360215 0.52571858 -0.44723584 -2.75411 38 'point symmetry operation' ? ? -0.05278291 -0.68821856 0.72358080 1.36696 -0.68821856 -0.49996174 -0.52573137 -1.02369 0.72358081 -0.52573137 -0.44725535 -2.76310 39 'point symmetry operation' ? ? -0.67082511 -0.16247040 0.72360006 1.36575 -0.68817797 0.50003713 -0.52571281 -1.01513 -0.27641412 -0.85062697 -0.44724601 -2.77512 40 'point symmetry operation' ? ? -0.36179444 0.58778777 0.72360923 1.37502 0.26289001 0.80901517 -0.52572169 -1.00371 -0.89442363 0.00002646 -0.44722073 -2.77355 41 'point symmetry operation' ? ? 0.05276416 0.68820494 -0.72359513 -1.38552 -0.68819314 -0.49999999 -0.52572826 -1.02368 -0.72360635 0.52571281 0.44723584 -1.05842 42 'point symmetry operation' ? 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THR 6 184 VAL 6 189 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 31 ARG F 215 ? ALA F 219 ? ARG 6 215 ALA 6 219 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 PRO F 301 ? THR F 314 ? PRO 6 301 THR 6 314 1 ? 14 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details 1A ? 4 ? 1B ? 5 ? 1C ? 4 ? 1D ? 3 ? 1E ? 6 ? 1F ? 5 ? 1G ? 2 ? 2A ? 2 ? 2B ? 5 ? 2C ? 3 ? 2D ? 2 ? 3A ? 2 ? 3B ? 2 ? 3C ? 4 ? 3D ? 4 ? 3E ? 5 ? 3F ? 3 ? 3G ? 6 ? 3H ? 5 ? 4A ? 4 ? 4B ? 3 ? 4C ? 5 ? 5A ? 4 ? 5B ? 3 ? 5C ? 2 ? 6A ? 4 ? 6B ? 4 ? 6C ? 3 ? 6D ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense 1A 1 2 ? anti-parallel 1A 2 3 ? anti-parallel 1A 3 4 ? anti-parallel 1B 1 2 ? anti-parallel 1B 2 3 ? anti-parallel 1B 3 4 ? anti-parallel 1B 4 5 ? anti-parallel 1C 1 2 ? anti-parallel 1C 2 3 ? anti-parallel 1C 3 4 ? parallel 1D 1 2 ? anti-parallel 1D 2 3 ? anti-parallel 1E 1 2 ? anti-parallel 1E 2 3 ? anti-parallel 1E 3 4 ? anti-parallel 1E 4 5 ? parallel 1E 5 6 ? parallel 1F 1 2 ? anti-parallel 1F 2 3 ? anti-parallel 1F 3 4 ? anti-parallel 1F 4 5 ? anti-parallel 1G 1 2 ? anti-parallel 2A 1 2 ? anti-parallel 2B 1 2 ? anti-parallel 2B 2 3 ? anti-parallel 2B 3 4 ? anti-parallel 2B 4 5 ? anti-parallel 2C 1 2 ? anti-parallel 2C 2 3 ? anti-parallel 2D 1 2 ? anti-parallel 3A 1 2 ? anti-parallel 3B 1 2 ? parallel 3C 1 2 ? anti-parallel 3C 2 3 ? anti-parallel 3C 3 4 ? parallel 3D 1 2 ? anti-parallel 3D 2 3 ? anti-parallel 3D 3 4 ? anti-parallel 3E 1 2 ? anti-parallel 3E 2 3 ? anti-parallel 3E 3 4 ? anti-parallel 3E 4 5 ? anti-parallel 3F 1 2 ? anti-parallel 3F 2 3 ? anti-parallel 3G 1 2 ? anti-parallel 3G 2 3 ? anti-parallel 3G 3 4 ? anti-parallel 3G 4 5 ? anti-parallel 3G 5 6 ? anti-parallel 3H 1 2 ? anti-parallel 3H 2 3 ? anti-parallel 3H 3 4 ? anti-parallel 3H 4 5 ? anti-parallel 4A 1 2 ? anti-parallel 4A 2 3 ? anti-parallel 4A 3 4 ? anti-parallel 4B 1 2 ? anti-parallel 4B 2 3 ? anti-parallel 4C 1 2 ? anti-parallel 4C 2 3 ? anti-parallel 4C 3 4 ? anti-parallel 4C 4 5 ? anti-parallel 5A 1 2 ? anti-parallel 5A 2 3 ? anti-parallel 5A 3 4 ? anti-parallel 5B 1 2 ? anti-parallel 5B 2 3 ? anti-parallel 5C 1 2 ? anti-parallel 6A 1 2 ? anti-parallel 6A 2 3 ? anti-parallel 6A 3 4 ? anti-parallel 6B 1 2 ? anti-parallel 6B 2 3 ? anti-parallel 6B 3 4 ? anti-parallel 6C 1 2 ? anti-parallel 6C 2 3 ? anti-parallel 6D 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id 1A 1 THR A 46 ? 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CB 2 LYS 288 ? ? 124.18 110.60 13.58 1.80 N 98 1 N 2 ILE 289 ? ? CA 2 ILE 289 ? ? C 2 ILE 289 ? ? 127.85 111.00 16.85 2.70 N 99 1 CB 2 LYS 293 ? ? CA 2 LYS 293 ? ? C 2 LYS 293 ? ? 97.21 110.40 -13.19 2.00 N 100 1 N 2 LYS 293 ? ? CA 2 LYS 293 ? ? CB 2 LYS 293 ? ? 126.91 110.60 16.31 1.80 N 101 1 CB 2 LEU 306 ? ? CA 2 LEU 306 ? ? C 2 LEU 306 ? ? 98.51 110.20 -11.69 1.90 N 102 1 N 2 SER 307 ? ? CA 2 SER 307 ? ? CB 2 SER 307 ? ? 101.22 110.50 -9.28 1.50 N 103 1 CG 2 MET 322 ? ? SD 2 MET 322 ? ? CE 2 MET 322 ? ? 88.01 100.20 -12.19 1.60 N 104 1 CB 2 GLU 330 ? ? CA 2 GLU 330 ? ? C 2 GLU 330 ? ? 124.70 110.40 14.30 2.00 N 105 1 N 2 ASP 344 ? ? CA 2 ASP 344 ? ? C 2 ASP 344 ? ? 92.45 111.00 -18.55 2.70 N 106 1 N 2 ILE 348 ? ? CA 2 ILE 348 ? ? C 2 ILE 348 ? ? 94.57 111.00 -16.43 2.70 N 107 1 CB 2 TYR 350 ? ? CG 2 TYR 350 ? ? CD2 2 TYR 350 ? ? 116.89 121.00 -4.11 0.60 N 108 1 CB 2 TYR 350 ? ? CG 2 TYR 350 ? ? CD1 2 TYR 350 ? ? 124.71 121.00 3.71 0.60 N 109 1 N 2 ILE 351 ? ? CA 2 ILE 351 ? ? 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C 3 GLY 147 ? ? 89.02 113.10 -24.08 2.50 N 122 1 CB 3 PHE 150 ? ? CG 3 PHE 150 ? ? CD1 3 PHE 150 ? ? 115.10 120.80 -5.70 0.70 N 123 1 CA 3 HIS 151 ? ? CB 3 HIS 151 ? ? CG 3 HIS 151 ? ? 99.29 113.60 -14.31 1.70 N 124 1 CB 3 PHE 153 ? ? CG 3 PHE 153 ? ? CD1 3 PHE 153 ? ? 114.43 120.80 -6.37 0.70 N 125 1 N 3 ALA 154 ? ? CA 3 ALA 154 ? ? CB 3 ALA 154 ? ? 119.16 110.10 9.06 1.40 N 126 1 CB 3 LEU 160 ? ? CA 3 LEU 160 ? ? C 3 LEU 160 ? ? 124.23 110.20 14.03 1.90 N 127 1 CG 3 MET 162 ? ? SD 3 MET 162 ? ? CE 3 MET 162 ? ? 87.16 100.20 -13.04 1.60 N 128 1 CG 3 MET 167 ? ? SD 3 MET 167 ? ? CE 3 MET 167 ? ? 88.42 100.20 -11.78 1.60 N 129 1 CB 3 TYR 169 ? ? CG 3 TYR 169 ? ? CD2 3 TYR 169 ? ? 124.90 121.00 3.90 0.60 N 130 1 CB 3 TYR 169 ? ? CG 3 TYR 169 ? ? CD1 3 TYR 169 ? ? 115.50 121.00 -5.50 0.60 N 131 1 CB 3 TYR 173 ? ? CG 3 TYR 173 ? ? CD2 3 TYR 173 ? ? 117.21 121.00 -3.79 0.60 N 132 1 N 3 THR 177 ? ? CA 3 THR 177 ? ? C 3 THR 177 ? ? 93.68 111.00 -17.32 2.70 N 133 1 CB 3 TYR 197 ? ? 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C 4 PRO 159 ? ? 95.75 112.10 -16.35 2.60 N 181 1 CG 4 MET 162 ? ? SD 4 MET 162 ? ? CE 4 MET 162 ? ? 89.69 100.20 -10.51 1.60 N 182 1 N 4 GLN 163 ? ? CA 4 GLN 163 ? ? CB 4 GLN 163 ? ? 121.98 110.60 11.38 1.80 N 183 1 CB 4 TYR 169 ? ? CG 4 TYR 169 ? ? CD2 4 TYR 169 ? ? 124.99 121.00 3.99 0.60 N 184 1 CB 4 TYR 169 ? ? CG 4 TYR 169 ? ? CD1 4 TYR 169 ? ? 115.38 121.00 -5.62 0.60 N 185 1 CG 4 MET 190 ? ? SD 4 MET 190 ? ? CE 4 MET 190 ? ? 86.87 100.20 -13.33 1.60 N 186 1 CB 4 TYR 197 ? ? CG 4 TYR 197 ? ? CD2 4 TYR 197 ? ? 115.65 121.00 -5.35 0.60 N 187 1 N 4 ALA 203 ? ? CA 4 ALA 203 ? ? CB 4 ALA 203 ? ? 119.19 110.10 9.09 1.40 N 188 1 CB 4 TYR 204 ? ? CG 4 TYR 204 ? ? CD2 4 TYR 204 ? ? 114.86 121.00 -6.14 0.60 N 189 1 CB 4 PHE 222 ? ? CA 4 PHE 222 ? ? C 4 PHE 222 ? ? 95.46 110.40 -14.94 2.00 N 190 1 CB 4 PHE 222 ? ? CG 4 PHE 222 ? ? CD1 4 PHE 222 ? ? 114.67 120.80 -6.13 0.70 N 191 1 C 4 GLU 229 ? ? N 4 ASN 230 ? ? CA 4 ASN 230 ? ? 138.45 121.70 16.75 2.50 Y 192 1 N 4 ALA 257 ? ? CA 4 ALA 257 ? ? C 4 ALA 257 ? ? 87.50 111.00 -23.50 2.70 N 193 1 CA 4 TYR 261 ? ? CB 4 TYR 261 ? ? CG 4 TYR 261 ? ? 98.87 113.40 -14.53 1.90 N 194 1 CB 4 TYR 261 ? ? CG 4 TYR 261 ? ? CD2 4 TYR 261 ? ? 116.22 121.00 -4.78 0.60 N 195 1 N 4 GLY 269 ? ? CA 4 GLY 269 ? ? C 4 GLY 269 ? ? 94.34 113.10 -18.76 2.50 N 196 1 CB 4 ASN 273 ? ? CA 4 ASN 273 ? ? C 4 ASN 273 ? ? 122.91 110.40 12.51 2.00 N 197 1 CB 4 TRP 280 ? ? CA 4 TRP 280 ? ? C 4 TRP 280 ? ? 94.76 110.40 -15.64 2.00 N 198 1 CB 4 TRP 280 ? ? CG 4 TRP 280 ? ? CD2 4 TRP 280 ? ? 106.50 126.60 -20.10 1.30 N 199 1 CB 4 TYR 286 ? ? CG 4 TYR 286 ? ? CD1 4 TYR 286 ? ? 115.16 121.00 -5.84 0.60 N 200 1 CB 4 LEU 291 ? ? CG 4 LEU 291 ? ? CD1 4 LEU 291 ? ? 121.64 111.00 10.64 1.70 N 201 1 N 4 ARG 292 ? ? CA 4 ARG 292 ? ? CB 4 ARG 292 ? ? 98.88 110.60 -11.72 1.80 N 202 1 CD 4 ARG 292 ? ? NE 4 ARG 292 ? ? CZ 4 ARG 292 ? ? 113.85 123.60 -9.75 1.40 N 203 1 O 4 ARG 292 ? ? C 4 ARG 292 ? ? N 4 LYS 293 ? ? 111.89 122.70 -10.81 1.60 Y 204 1 C 4 ARG 294 ? ? N 4 SER 295 ? ? CA 4 SER 295 ? ? 138.40 121.70 16.70 2.50 Y 205 1 N 4 LYS 297 ? ? CA 4 LYS 297 ? ? CB 4 LYS 297 ? ? 124.38 110.60 13.78 1.80 N 206 1 CB 4 TYR 300 ? ? CG 4 TYR 300 ? ? CD2 4 TYR 300 ? ? 117.20 121.00 -3.80 0.60 N 207 1 CB 4 PHE 304 ? ? CG 4 PHE 304 ? ? CD2 4 PHE 304 ? ? 125.05 120.80 4.25 0.70 N 208 1 NE 4 ARG 312 ? ? CZ 4 ARG 312 ? ? NH2 4 ARG 312 ? ? 115.84 120.30 -4.46 0.50 N 209 1 C 4 GLY 319 ? ? N 4 GLN 320 ? ? CA 4 GLN 320 ? ? 136.96 121.70 15.26 2.50 Y 210 1 N 4 GLN 320 ? ? CA 4 GLN 320 ? ? C 4 GLN 320 ? ? 87.93 111.00 -23.07 2.70 N 211 1 CG 4 MET 322 ? ? SD 4 MET 322 ? ? CE 4 MET 322 ? ? 85.02 100.20 -15.18 1.60 N 212 1 N 4 MET 325 ? ? CA 4 MET 325 ? ? C 4 MET 325 ? ? 94.47 111.00 -16.53 2.70 N 213 1 C 4 PHE 335 ? ? N 4 ASP 336 ? ? CA 4 ASP 336 ? ? 141.05 121.70 19.35 2.50 Y 214 1 C 4 THR 338 ? ? N 4 GLU 339 ? ? CA 4 GLU 339 ? ? 137.10 121.70 15.40 2.50 Y 215 1 N 4 ASP 344 ? ? CA 4 ASP 344 ? ? 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_em_3d_reconstruction.details ;A HOMOLOGY MODEL OF THE BKPYV VP1 ASYMMETRIC UNIT BASED ON THE CRYSTAL STRUCTURE OF SV40 (PDB 1SVA) WAS BUILT USING THE SWISS-MODEL SERVER. THIS WAS THEN FITTED (AS A RIGID BODY) INTO A CORRESPONDING SEGMENT OF THE BKPYV CRYO-EM DENSITY MAP GENERATED USING UCSF CHIMERA. FLEXIBLE FITTING OF THE HOMOLOGY MODEL WAS THEN CARRIED OUT USING MDFF (TRABUCO ET AL. 10 2008). SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-3283. (DEPOSITION ID: 14117). ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '10MM HEPES PH 7.9, 1MM CACL2, 1MM MGCL2, 5MM KCL' _em_buffer.pH 7.9 _em_buffer.details '10MM HEPES PH 7.9, 1MM CACL2, 1MM MGCL2, 5MM KCL' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'BK POLYOMAVIRUS' _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5FUA _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 432 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 5FUA _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2014-12-15 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI F20' _em_imaging.nominal_defocus_min 600 _em_imaging.nominal_defocus_max 4800 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 19000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 5FUA _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details '6.5 SECONDS BLOT BEFORE PLUNGING IN LIQUID ETHAN' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5FUA _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 5FUA _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry I _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 1 MET 1 ? 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