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UK ? ? 1 Nature NATUAS 0006 1476-4687 ? ? 523 ? 47 52 'The architecture of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP.' 2015 ? 10.1038/nature14548 26106855 ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nguyen, T.H.D.' 1 ? primary 'Galej, W.P.' 2 ? primary 'Bai, X.C.' 3 ? primary 'Oubridge, C.' 4 ? primary 'Scheres, S.H.W.' 5 ? primary 'Newman, A.J.' 6 ? primary 'Nagai, K.' 7 ? 1 'Nguyen, T.H.D.' 8 ? 1 'Galej, W.' 9 ? 1 'Bai, X.C.' 10 ? 1 'Savva, C.G.' 11 ? 1 'Newman, A.J.' 12 ? 1 'Scheres, S.H.W.' 13 ? 1 'Nagai, K.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'U5 snRNA' 57138.711 1 ? ? ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.724 37.858 8057 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.725 37.856 8056 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 31.175 56.750 10038 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 31.174 56.752 10039 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.398 40.954 11938 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 20.397 40.955 11939 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 32.512 60.952 17735 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 41.905 ? 40349 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 41.905 ? 40349 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.700 _refine_ls_shell.d_res_low 3.796 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 9041 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 3.610 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # _struct.entry_id 5GAM _struct.title 'Foot region of the yeast spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 5GAM _struct_keywords.text 'Transcription, pre-mRNA splicing, snRNP, GTPase, U5 snRNA, Prp8, spliceosome' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 GB CP011085.1 807071959 ? 1 ;AAGCAGCUUUACAGAUCAAUGGCGGAGGGAGGUCAACAUCAAGAACUGUGGGCCUUUUAUUGCCUAUAGAACUUAUAACG AACAUGGUUCUUGCCUUUUACCAGAACCAUCCGGGUGUUGUCUCCAUAGAAACAGGUAAAGCUGUCCGUUACUGUGGGCU UGCCAUAUUUUUUGGAAC ; 909079 2 UNP PRP8_YEAST P33334 ? 2 ;MSGLPPPPPGFEEDSDLALPPPPPPPPGYEIEELDNPMVPSSVNEDTFLPPPPPPPSNFEINAEEIVDFTLPPPPPPPGL DELETKAEKKVELHGKRKLDIGKDTFVTRKSRKRAKKMTKKAKRSNLYTPKAEMPPEHLRKIINTHSDMASKMYNTDKKA FLGALKYLPHAILKLLENMPHPWEQAKEVKVLYHTSGAITFVNETPRVIEPVYTAQWSATWIAMRREKRDRTHFKRMRFP PFDDDEPPLSYEQHIENIEPLDPINLPLDSQDDEYVKDWLYDSRPLEEDSKKVNGTSYKKWSFDLPEMSNLYRLSTPLRD EVTDKNYYYLFDKKSFFNGKALNNAIPGGPKFEPLYPREEEEDYNEFNSIDRVIFRVPIRSEYKVAFPHLYNSRPRSVRI PWYNNPVSCIIQNDEEYDTPALFFDPSLNPIPHFIDNNSSLNVSNTKENGDFTLPEDFAPLLAEEEELILPNTKDAMSLY HSPFPFNRTKGKMVRAQDVALAKKWFLQHPDEEYPVKVKVSYQKLLKNYVLNELHPTLPTNHNKTKLLKSLKNTKYFQQT TIDWVEAGLQLCRQGHNMLNLLIHRKGLTYLHLDYNFNLKPTKTLTTKERKKSRLGNSFHLMRELLKMMKLIVDTHVQFR LGNVDAFQLADGIHYILNHIGQLTGIYRYKYKVMHQIRACKDLKHIIYYKFNKNLGKGPGCGFWQPAWRVWLNFLRGTIP LLERYIGNLITRQFE ; 1 3 UNP SN114_YEAST P36048 ? 3 ;MEGDDLFDEFGNLIGVDPFDSDEEESVLDEQEQYQTNTFEGSGNNNEIESRQLTSLGSKKELGISLEHPYGKEVEVLMET KNTQSPQTPLVEPVTERTKLQEHTIFTQLKKNIPKTRYNRDYMLSMANIPERIINVGVIGPLHSGKTSLMDLLVIDSHKR IPDMSKNVELGWKPLRYLDNLKQEIDRGLSIKLNGSTLLCTDLESKSRMINFLDAPGHVNFMDETAVALAASDLVLIVID VVEGVTFVVEQLIKQSIKNNVAMCFVINKLDRLILDLKLPPMDAYLKLNHIIANINSFTKGNVFSPIDNNIIFASTKLGF TFTIKEFVSYYYAHSIPSSKIDDFTTRLWGSVYYHKGNFRTKPFENVEKYPTFVEFILIPLYKIFSYALSMEKDKLKNLL RSNFRVNLSQEALQYDPQPFLKHVLQLIFRQQTGLVDAITRCYQPFELFDNKTAHLSIPGKSTPEGTLWAHVLKTVDYGG AEWSLVRIYSGLLKRGDTVRILDTSQSESRQKRQLHDISKTETSNEDEDEDDETPSCEVEEIGLLGGRYVYPVHEAHKGQ IVLIKGISSAYIKSATLYSVKSKEDMKQLKFFKPLDYITEAVFKIVLQPLLPRELPKLLDALNKISKYYPGVIIKVEESG EHVILGNGELYMDCLLYDLRASYAKIEIKISDPLTVFSESCSNESFASIPVSNSISRLGEENLPGLSISVAAEPMDSKMI QDLSRNTLGKGQNCLDIDGIMDNPRKLSKILRTEYGWDSLASRNVWSFYNGNVLINDTLPDEISPELLSKYKEQIIQGFY WAVKEGPLAEEPIYGVQYKLLSISVPSDVNIDVMKSQIIPLMKKACYVGLLTAIPILLEPIYEVDITVHAPLLPIVEELM KKRRGSRIYKTIKVAGTPLLEVRGQVPVIESAGFETDLRLSTNGLGMCQLYFWHKIWRKVPGDVLDKDAFIPKLKPAPIN SLSRDFVMKTRRRKGISTGGFMSNDGPTLEKYISAELYAQLRENGLVP ; 1 4 PDB 5GAM 5GAM ? 4 ? 1 5 UNP RSMB_YEAST P40018 ? 5 ;MSKIQVAHSSRLANLIDYKLRVLTQDGRVYIGQLMAFDKHMNLVLNECIEERVPKTQLDKLRPRKDSKDGTTLNIKVEKR VLGLTILRGEQILSTVVEDKPLLSKKERLVRDKKEKKQAQKQTKLRKEKEKKPGKIAKPNTANAKHTSSNSREIAQPSSS RYNGGNDNIGANRSRFNNEAPPQTRKFQPPPGFKRK ; 1 6 UNP RUXE_YEAST Q12330 ? 6 ;MSNKVKTKAMVPPINCIFNFLQQQTPVTIWLFEQIGIRIKGKIVGFDEFMNVVIDEAVEIPVNSADGKEDVEKGTPLGKI LLKGDNITLITSAD ; 1 7 UNP RUXF_YEAST P54999 ? 7 ;MSESSDISAMQPVNPKPFLKGLVNHRVGVKLKFNSTEYRGTLVSTDNYFNLQLNEAEEFVAGVSHGTLGEIFIRCNNVLY IRELPN ; 1 8 UNP RUXG_YEAST P40204 ? 8 MVSTPELKKYMDKKILLNINGSRKVAGILRGYDIFLNVVLDDAMEINGEDPANNHQLGLQTVIRGNSIISLEALDAI 1 9 PDB 5GAM 5GAM ? 9 ? 1 10 UNP SMD3_YEAST P43321 ? 10 ;MTMNGIPVKLLNEAQGHIVSLELTTGATYRGKLVESEDSMNVQLRDVIATEPQGAVTHMDQIFVRGSQIKFIVVPDLLKN APLFKKNSSRPMPPIRGPKRR ; 1 11 UNP SMD1_YEAST Q02260 ? 11 ;MKLVNFLKKLRNEQVTIELKNGTTVWGTLQSVSPQMNAILTDVKLTLPQPRLNKLNSNGIAMASLYLTGGQQPTASDNIA SLQYINIRGNTIRQIILPDSLNLDSLLVDQKQLNSLRRSGQIANDPSKKRRRDFGAPANKRPRRGL ; 1 12 UNP SMD2_YEAST Q06217 ? 12 ;MSSQIIDRPKHELSRAELEELEEFEFKHGPMSLINDAMVTRTPVIISLRNNHKIIARVKAFDRHCNMVLENVKELWTEKK GKNVINRERFISKLFLRGDSVIVVLKTPVE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5GAM U 1 ? 178 ? 807071959 909079 ? 908902 ? 1 178 2 2 5GAM A 1 ? 735 ? P33334 1 ? 735 ? 1 735 3 3 5GAM C 1 ? 1008 ? P36048 1 ? 1008 ? 1 1008 4 4 5GAM W 1 ? 31 ? 5GAM 1 ? 31 ? 1 31 5 5 5GAM b 1 ? 196 ? P40018 1 ? 196 ? 1 196 6 6 5GAM e 1 ? 94 ? Q12330 1 ? 94 ? 1 94 7 7 5GAM f 1 ? 86 ? P54999 1 ? 86 ? 1 86 8 8 5GAM g 1 ? 77 ? P40204 1 ? 77 ? 1 77 9 9 5GAM x 1 ? 18 ? 5GAM 201 ? 218 ? 201 218 10 10 5GAM d 1 ? 101 ? P43321 1 ? 101 ? 1 101 11 11 5GAM h 1 ? 146 ? Q02260 1 ? 146 ? 1 146 12 12 5GAM j 1 ? 110 ? Q06217 1 ? 110 ? 1 110 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 5GAM SER C 530 ? UNP P36048 GLU 530 conflict 530 1 3 5GAM LYS C 531 ? UNP P36048 ASP 531 conflict 531 2 3 5GAM THR C 532 ? UNP P36048 ASP 532 conflict 532 3 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details Dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 35960 ? 1 MORE -246 ? 1 'SSA (A^2)' 107930 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS B 110 ? ARG B 124 ? LYS A 110 ARG A 124 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO B 135 ? ALA B 150 ? PRO A 135 ALA A 150 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS B 158 ? LYS B 166 ? LYS A 158 LYS A 166 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 TYR B 167 ? ASN B 178 ? TYR A 167 ASN A 178 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE B 209 ? ARG B 231 ? ILE A 209 ARG A 231 1 ? 23 HELX_P HELX_P6 AA6 TYR B 251 ? GLU B 256 ? TYR A 251 GLU A 256 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP B 304 ? THR B 316 ? ASP A 304 THR A 316 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 324 ? TYR B 329 ? ASP A 324 TYR A 329 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP B 332 ? ALA B 341 ? ASP A 332 ALA A 341 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 ARG B 380 ? PHE B 387 ? ARG A 380 PHE A 387 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN B 472 ? SER B 482 ? ASN A 472 SER A 482 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO B 483 ? ARG B 488 ? PRO A 483 ARG A 488 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 ALA B 502 ? LEU B 507 ? ALA A 502 LEU A 507 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 PRO B 515 ? HIS B 535 ? PRO A 515 HIS A 535 1 ? 21 HELX_P HELX_P15 AB6 LYS B 544 ? ASN B 553 ? LYS A 544 ASN A 553 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 TRP B 564 ? LYS B 586 ? TRP A 564 LYS A 586 1 ? 23 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 606 ? SER B 613 ? THR A 606 SER A 613 1 ? 8 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY B 616 ? LEU B 641 ? GLY A 616 LEU A 641 1 ? 26 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP B 645 ? HIS B 659 ? ASP A 645 HIS A 659 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 HIS B 659 ? THR B 664 ? HIS A 659 THR A 664 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 TYR B 671 ? ASN B 692 ? TYR A 671 ASN A 692 1 ? 22 HELX_P HELX_P22 AC4 TRP B 704 ? THR B 731 ? TRP A 704 THR A 731 1 ? 28 HELX_P HELX_P23 AC5 HIS C 103 ? ASN C 112 ? HIS C 103 ASN C 112 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN C 119 ? ASN C 128 ? ASN C 119 ASN C 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS C 146 ? HIS C 158 ? LYS C 146 HIS C 158 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 SER C 165 ? GLY C 171 ? SER C 165 GLY C 171 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU C 181 ? GLY C 188 ? LEU C 181 GLY C 188 1 ? 8 HELX_P HELX_P28 AD1 HIS C 218 ? ASN C 220 ? HIS C 218 ASN C 220 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 PHE C 221 ? SER C 232 ? 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U 135 ? 8 1 1 A G 14 1_555 A A 134 1_555 0.848 1.693 0.691 -1.587 1.832 -9.588 11 U_G14:A134_U U 14 ? U 134 ? 8 1 1 A A 15 1_555 A C 133 1_555 -4.867 -1.985 -0.339 7.415 8.954 -95.360 12 U_A15:C133_U U 15 ? U 133 ? ? ? 1 A U 20 1_555 A A 132 1_555 -1.054 -0.122 -0.131 19.130 -10.787 -0.673 13 U_U20:A132_U U 20 ? U 132 ? 20 1 1 A G 21 1_555 A A 131 1_555 -0.367 1.204 -0.402 18.985 -12.111 -11.207 14 U_G21:A131_U U 21 ? U 131 ? 8 1 1 A G 22 1_555 A A 130 1_555 -0.045 1.070 -0.811 9.230 -6.005 -22.263 15 U_G22:A130_U U 22 ? U 130 ? 8 1 1 A G 28 1_555 A C 125 1_555 -0.711 -0.248 0.243 7.286 -10.506 -1.635 16 U_G28:C125_U U 28 ? U 125 ? 19 1 1 A G 29 1_555 A C 124 1_555 -0.121 -0.088 -0.251 -0.589 -4.114 -0.752 17 U_G29:C124_U U 29 ? U 124 ? 19 1 1 A A 30 1_555 A U 123 1_555 0.124 -0.102 -0.254 -1.515 -6.290 0.326 18 U_A30:U123_U U 30 ? U 123 ? 20 1 1 A G 31 1_555 A C 122 1_555 -0.373 -0.181 0.387 -5.131 -15.386 -2.421 19 U_G31:C122_U U 31 ? U 122 ? 19 1 1 A G 32 1_555 A U 121 1_555 -0.278 -0.155 1.633 8.651 -12.256 -3.091 20 U_G32:U121_U U 32 ? U 121 ? ? 1 1 A C 34 1_555 A G 120 1_555 0.790 -0.433 0.696 6.219 -21.423 -5.110 21 U_C34:G120_U U 34 ? U 120 ? 19 1 1 A A 35 1_555 A U 119 1_555 -0.316 -0.277 0.617 0.048 -19.847 -5.561 22 U_A35:U119_U U 35 ? U 119 ? 20 1 1 A A 36 1_555 A U 118 1_555 -0.188 -0.141 -0.225 -6.487 -16.910 0.459 23 U_A36:U118_U U 36 ? U 118 ? 20 1 1 A C 37 1_555 A G 117 1_555 -0.005 -0.060 0.042 -11.627 -9.631 -0.335 24 U_C37:G117_U U 37 ? U 117 ? 19 1 1 A A 38 1_555 A U 116 1_555 -0.295 -0.187 -0.520 -5.018 -8.420 1.621 25 U_A38:U116_U U 38 ? U 116 ? 20 1 1 A U 39 1_555 A G 115 1_555 2.666 -0.777 -1.307 10.746 0.737 -5.826 26 U_U39:G115_U U 39 ? U 115 ? 28 1 1 A C 40 1_555 A G 114 1_555 -0.383 -0.353 -1.550 14.189 1.508 -3.433 27 U_C40:G114_U U 40 ? U 114 ? 19 1 1 A A 41 1_555 A U 74 1_555 0.210 -0.266 0.766 -26.804 2.501 4.290 28 U_A41:U74_U U 41 ? 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