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EMD-8091 'associated EM volume' PDB '5fwy contains the crystal structure of the N-terminal Domain of the same complex (GluA2/3 NTD)' 5fwy unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5IDF _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2016-02-24 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Herguedas, B.' 1 'Garcia-Nafria, J.' 2 'Fernandez-Leiro, R.' 3 'Greger, I.H.' 4 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 352 _citation.language ? _citation.page_first aad3873 _citation.page_last aad3873 _citation.title 'Structure and organization of heteromeric AMPA-type glutamate receptors.' _citation.year 2016 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aad3873 _citation.pdbx_database_id_PubMed 26966189 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Herguedas, B.' 1 primary 'Garcia-Nafria, J.' 2 primary 'Cais, O.' 3 primary 'Fernandez-Leiro, R.' 4 primary 'Krieger, J.' 5 primary 'Ho, H.' 6 primary 'Greger, I.H.' 7 # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90 _cell.angle_gamma_esd ? 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_entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Glutamate receptor 2' 97663.188 2 ? ? ? ;The sequence corresponds to mature rat GluA2 (residues 22-883, isoform Flip, edited at R/G and Q/R sites) with a Myc tag after the first residue and the N292C mutation ; 2 polymer man 'Glutamate receptor 3' 99075.664 2 ? ? ? ;The sequence corresponds to the mature rat GluA3 subunit (residues 23-888, Flip isoform) with a Flag tag after the first residue and mutated at R439G and R265C ; # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'GluR-2,AMPA-selective glutamate receptor 2,GluR-B,GluR-K2,Glutamate receptor ionotropic,AMPA 2,GluA2' 2 'GluR-3,AMPA-selective glutamate receptor 3,GluR-C,GluR-K3,Glutamate receptor ionotropic,AMPA 3,GluA3' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;VEQKLISEEDLSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGF YDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEK KWQVTAINVGNINNDKKDETYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQ FGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTATIKYTSALTYDAVQVMTEAFRCLRKQRIEISRRGNAGDCL ANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGL ENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYG KADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYE WHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMV SPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNE YIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLS NVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNPQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI ; ;VEQKLISEEDLSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGF 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'HEK293 GntI-' ? ? ? ? ? plasmid ? ? ? prk5 ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP GRIA2_RAT P19491 P19491-2 1 ;SSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITS FCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGN INNDKKDETYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQI VDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTATIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGV EIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTIL ESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTI TLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRE TQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSK QTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTM KVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVG GLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNPQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI ; 23 2 UNP GRIA3_RAT P19492 P19492-2 2 ;FPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMS MNTLTSFCGALHTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLSYYKWEKFVYLYDTERGFSVLQAIMEAAVQNNWQVT ARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITG FQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWS QGIDIERALKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSSSSENRTIVVTT ILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPL TITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEE PRDPQSPPDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAE DLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKP CDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFY ILVGGLGLAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI ; 24 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5IDF A 12 ? 872 ? 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'expression tag' -3 7 1 5IDF GLU A 8 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -2 8 1 5IDF GLU A 9 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -1 9 1 5IDF ASP A 10 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' 0 10 1 5IDF LEU A 11 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' 1 11 1 5IDF CYS A 302 ? UNP P19491 ASN 313 'engineered mutation' 292 12 2 5IDF GLY B 1 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -7 13 2 5IDF ASP B 2 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -6 14 2 5IDF TYR B 3 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -5 15 2 5IDF LYS B 4 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -4 16 2 5IDF ASP B 5 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -3 17 2 5IDF ASP B 6 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -2 18 2 5IDF ASP B 7 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -1 19 2 5IDF ASP B 8 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' 0 20 2 5IDF LYS B 9 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' 1 21 2 5IDF CYS B 273 ? UNP P19492 ARG 287 'engineered mutation' 265 22 2 5IDF GLY B 447 ? UNP P19492 ARG 461 'engineered mutation' 439 23 3 5IDF VAL C 1 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -9 24 3 5IDF GLU C 2 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -8 25 3 5IDF GLN C 3 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -7 26 3 5IDF LYS C 4 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -6 27 3 5IDF LEU C 5 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -5 28 3 5IDF ILE C 6 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -4 29 3 5IDF SER C 7 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -3 30 3 5IDF GLU C 8 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -2 31 3 5IDF GLU C 9 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' -1 32 3 5IDF ASP C 10 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' 0 33 3 5IDF LEU C 11 ? UNP P19491 ? ? 'expression tag' 1 34 3 5IDF CYS C 302 ? UNP P19491 ASN 313 'engineered mutation' 292 35 4 5IDF GLY D 1 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -7 36 4 5IDF ASP D 2 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -6 37 4 5IDF TYR D 3 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -5 38 4 5IDF LYS D 4 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -4 39 4 5IDF ASP D 5 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -3 40 4 5IDF ASP D 6 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -2 41 4 5IDF ASP D 7 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' -1 42 4 5IDF ASP D 8 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' 0 43 4 5IDF LYS D 9 ? UNP P19492 ? ? 'expression tag' 1 44 4 5IDF CYS D 273 ? UNP P19492 ARG 287 'engineered mutation' 265 45 4 5IDF GLY D 447 ? UNP P19492 ARG 461 'engineered mutation' 439 46 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5IDF _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5IDF _struct.title 'Cryo-EM structure of GluA2/3 AMPA receptor heterotetramer (model II)' _struct.pdbx_descriptor 'Glutamate receptor 2, Glutamate receptor 3' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? # _struct_keywords.entry_id 5IDF _struct_keywords.text 'AMPA glutamate receptor, Signaling protein' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 26 ? SER A 41 ? ALA A 16 SER A 31 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 58 ? GLY A 73 ? ASN A 48 GLY A 63 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 85 ? HIS A 97 ? SER A 75 HIS A 87 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 121 ? TYR A 132 ? LEU A 111 TYR A 122 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 LEU A 147 ? LYS A 161 ? LEU A 137 LYS A 151 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 GLY A 170 ? ILE A 172 ? GLY A 160 ILE A 162 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 176 ? GLU A 189 ? LYS A 166 GLU A 179 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 201 ? ASP A 203 ? GLU A 191 ASP A 193 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 AA9 LYS A 204 ? GLY A 216 ? LYS A 194 GLY A 206 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 AB1 HIS A 218 ? GLY A 221 ? HIS A 208 GLY A 211 5 ? 4 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 230 ? GLY A 234 ? GLY A 220 GLY A 224 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP A 256 ? SER A 267 ? ASP A 246 SER A 257 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS A 283 ? ARG A 301 ? LYS A 273 ARG A 291 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY A 317 ? ASN A 322 ? GLY A 307 ASN A 312 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 AB6 PRO A 326 ? GLN A 339 ? PRO A 316 GLN A 329 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 GLU A 426 ? GLU A 429 ? GLU A 416 GLU A 419 5 ? 4 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY A 433 ? GLY A 447 ? GLY A 423 GLY A 437 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN A 471 ? TYR A 479 ? ASN A 461 TYR A 469 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 THR A 492 ? GLU A 497 ? THR A 482 GLU A 487 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY A 523 ? PHE A 527 ? GLY A 513 PHE A 517 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA A 532 ? VAL A 548 ? ALA A 522 VAL A 538 1 ? 17 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL A 549 ? VAL A 553 ? VAL A 539 VAL A 543 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 605 ? VAL A 640 ? SER A 595 VAL A 630 1 ? 36 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 645 ? LYS A 651 ? SER A 635 LYS A 641 1 ? 7 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY A 663 ? SER A 672 ? GLY A 653 SER A 662 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE A 674 ? ALA A 687 ? ILE A 664 ALA A 677 1 ? 14 HELX_P HELX_P27 AC9 THR A 695 ? SER A 706 ? THR A 685 SER A 696 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 SER A 716 ? GLN A 724 ? SER A 706 GLN A 714 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU A 752 ? GLN A 766 ? LEU A 742 GLN A 756 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY A 767 ? TYR A 778 ? GLY A 757 TYR A 768 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU A 799 ? LYS A 827 ? LEU A 789 LYS A 817 1 ? 29 HELX_P HELX_P32 AD5 THR B 24 ? ASN B 41 ? THR B 16 ASN B 33 1 ? 18 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN B 62 ? ARG B 76 ? ASN B 54 ARG B 68 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 SER B 89 ? LEU B 100 ? SER B 81 LEU B 92 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU B 125 ? LYS B 137 ? LEU B 117 LYS B 129 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 PHE B 151 ? ASN B 164 ? PHE B 143 ASN B 156 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP B 178 ? ARG B 191 ? ASP B 170 ARG B 183 1 ? 14 HELX_P HELX_P38 AE2 GLU B 202 ? GLY B 217 ? GLU B 194 GLY B 209 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY B 231 ? ILE B 235 ? GLY B 223 ILE B 227 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 LEU B 237 ? HIS B 242 ? LEU B 229 HIS B 234 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN B 257 ? VAL B 268 ? ASN B 249 VAL B 260 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 AE6 LYS B 284 ? GLN B 307 ? LYS B 276 GLN B 299 1 ? 24 HELX_P HELX_P43 AE7 SER B 329 ? VAL B 341 ? SER B 321 VAL B 333 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 ASN B 421 ? LEU B 425 ? ASN B 413 LEU B 417 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 GLU B 426 ? GLU B 429 ? GLU B 418 GLU B 421 5 ? 4 HELX_P HELX_P46 AF1 GLY B 433 ? GLY B 447 ? GLY B 425 GLY B 439 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 AF2 ASN B 471 ? TYR B 479 ? ASN B 463 TYR B 471 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 AF3 THR B 492 ? GLU B 497 ? 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ASN C 48 GLY C 63 1 ? 16 HELX_P HELX_P63 AG9 SER C 85 ? HIS C 97 ? SER C 75 HIS C 87 1 ? 13 HELX_P HELX_P64 AH1 LEU C 121 ? TYR C 132 ? LEU C 111 TYR C 122 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 AH2 LEU C 147 ? LYS C 161 ? LEU C 137 LYS C 151 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 AH3 GLY C 170 ? ILE C 172 ? GLY C 160 ILE C 162 5 ? 3 HELX_P HELX_P67 AH4 LYS C 176 ? GLU C 189 ? LYS C 166 GLU C 179 1 ? 14 HELX_P HELX_P68 AH5 GLU C 201 ? ASP C 203 ? GLU C 191 ASP C 193 5 ? 3 HELX_P HELX_P69 AH6 LYS C 204 ? GLY C 216 ? LYS C 194 GLY C 206 1 ? 13 HELX_P HELX_P70 AH7 HIS C 218 ? GLY C 221 ? HIS C 208 GLY C 211 5 ? 4 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY C 230 ? GLY C 234 ? GLY C 220 GLY C 224 5 ? 5 HELX_P HELX_P72 AH9 ASP C 256 ? SER C 267 ? ASP C 246 SER C 257 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 AI1 LYS C 283 ? ARG C 301 ? LYS C 273 ARG C 291 1 ? 19 HELX_P HELX_P74 AI2 GLY C 317 ? ASN C 322 ? GLY C 307 ASN C 312 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 AI3 PRO C 326 ? GLN C 339 ? PRO C 316 GLN C 329 1 ? 14 HELX_P HELX_P76 AI4 GLU C 426 ? GLU C 429 ? 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D . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-03-16 2 'Structure model' 1 1 2016-03-23 3 'Structure model' 1 2 2016-05-11 4 'Structure model' 1 3 2016-06-15 5 'Structure model' 1 4 2017-08-30 6 'Structure model' 1 5 2017-10-11 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Database references' 3 4 'Structure model' 'Database references' 4 5 'Structure model' 'Data collection' 5 6 'Structure model' 'Source and taxonomy' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 5 'Structure model' em_imaging_optics 2 5 'Structure model' em_software 3 6 'Structure model' entity_src_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 5 'Structure model' '_em_imaging_optics.energyfilter_name' 2 5 'Structure model' '_em_software.name' 3 5 'Structure model' '_em_software.version' 4 6 'Structure model' '_entity_src_gen.host_org_common_name' # _em_3d_fitting.entry_id 5IDF _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;For GluA2 chains (A,C), 2 copies of GluA2 NTD (3HSY) and two copies of GluA2 LBD (1FTO) were fitted. For GluA3 chains (B,D), 2 copies of GluA3NTD (3O21) and two copies of GluA2 LBD (3UA8) were fitted.For the TMD region, the 4 chains of 3KG2 TMD (residues 509-544 594-629 784-817) were fitted as a rigid body. After fitting the sequence was corrected including mutations and side chains were removed. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 1 1 ? B ? 3HSY 1 2 ? B ? 1FTO 1 3 ? ? ? 3UA8 1 4 ? 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_em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5IDF _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 20 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-20 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.citation_id ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5IDF _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 28409 _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode OTHER _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_magnification ? 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