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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5KC1 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2016-06-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Ohashi, Y.' 1 'Soler, N.' 2 'Garcia-Ortegon, M.' 3 'Zhang, L.' 4 'Perisic, O.' 5 'Masson, G.R.' 6 'Johnson, C.M.' 7 'Williams, R.J.' 8 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Autophagy _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1554-8635 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 2129 _citation.page_last 2144 _citation.title 'Characterization of Atg38 and NRBF2, a fifth subunit of the autophagic Vps34/PIK3C3 complex.' _citation.year 2016 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1080/15548627.2016.1226736 _citation.pdbx_database_id_PubMed 27630019 _citation.unpublished_flag ? # 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Q05789 1 ? 226 ? 1 226 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? tetrameric 4 2 author_defined_assembly ? tetrameric 4 3 author_defined_assembly ? tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,LB,MB,NB,OB 2 1 E,F,I,J,CA,DA,EA,FA,GA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,PB,QB,TB,UB 3 1 G,H,K,L,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,RB,SB,VB,WB # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 124 ? 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GLU J 208 LEU J 213 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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J LYS 172 O ? ? ? 1_555 YA NA . NA ? ? F LYS 172 F NA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.070 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O ? NB HOH . ? A HOH 406 ? 1_556 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 OD1 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 85.6 ? 2 O ? NB HOH . ? A HOH 406 ? 1_556 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 OD2 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 105.8 ? 3 OD1 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 OD2 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 45.6 ? 4 O ? NB HOH . ? A HOH 406 ? 1_556 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O2 ? PA SO4 . ? K SO4 309 ? 1_555 101.4 ? 5 OD1 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O2 ? PA SO4 . ? K SO4 309 ? 1_555 128.6 ? 6 OD2 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O2 ? PA SO4 . ? K SO4 309 ? 1_555 84.3 ? 7 O ? NB HOH . ? A HOH 406 ? 1_556 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O ? TB HOH . ? E HOH 402 ? 1_556 118.5 ? 8 OD1 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O ? TB HOH . ? E HOH 402 ? 1_556 79.9 ? 9 OD2 ? G ASP 145 ? K ASP 145 ? 1_555 NA ? HA NA . ? K NA 301 ? 1_555 O ? TB HOH . ? E HOH 402 ? 1_556 104.9 ? 10 O2 ? 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