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_citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Microbiol' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2058-5276 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 1 _citation.language ? _citation.page_first 16128 _citation.page_last 16128 _citation.title 'Structures of Ebola virus GP and sGP in complex with therapeutic antibodies.' _citation.year 2016 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nmicrobiol.2016.128 _citation.pdbx_database_id_PubMed 27562261 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Pallesen, J.' 1 ? primary 'Murin, C.D.' 2 ? primary 'de Val, N.' 3 ? primary 'Cottrell, C.A.' 4 ? primary 'Hastie, K.M.' 5 ? primary 'Turner, H.L.' 6 ? primary 'Fusco, 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'expression tag' 642 6 2 5KEL ASP B 142 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 643 7 2 5KEL ASP B 143 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 644 8 8 5KEL THR G 43 ? UNP Q05320 ILE 544 conflict 544 9 8 5KEL LEU G 137 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 638 10 8 5KEL GLU G 138 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 639 11 8 5KEL VAL G 139 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 640 12 8 5KEL ASP G 140 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 641 13 8 5KEL ASP G 141 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 642 14 8 5KEL ASP G 142 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 643 15 8 5KEL ASP G 143 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 644 16 14 5KEL THR I 43 ? UNP Q05320 ILE 544 conflict 544 17 14 5KEL LEU I 137 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 638 18 14 5KEL GLU I 138 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 639 19 14 5KEL VAL I 139 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 640 20 14 5KEL ASP I 140 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 641 21 14 5KEL ASP I 141 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 642 22 14 5KEL ASP I 142 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 643 23 14 5KEL ASP I 143 ? UNP Q05320 ? ? 'expression tag' 644 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5KEL _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5KEL _struct.title 'EBOV GP in complex with variable Fab domains of IgGs c2G4 and c13C6' _struct.pdbx_descriptor ;Ebola surface glycoprotein, GP1, Ebola surface glycoprotein, GP2, c2G4 variable Fab domain heavy chain, c2G4 variable Fab domain light chain, c13C6 variable Fab domain heavy chain, c13C6 variable Fab domain light chain ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5KEL _struct_keywords.text 'Ebola virus surface glycoprotein, therapeutic antibody cocktail, ZMapp, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 1 ? N N N 2 ? O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 5 ? R N N 6 ? S N N 7 ? T N N 8 ? U N N 9 ? V N N 10 ? W N N 7 ? X N N 8 ? Y N N 9 ? Z N N 10 ? AA N N 7 ? BA N N 8 ? CA N N 9 ? DA N N 10 ? EA N N 11 ? FA N N 11 ? GA N N 11 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 27 ? ASN A 29 ? 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ILE N 31 ? ILE I 527 ILE I 532 5 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 ASN N 49 ? ASP N 51 ? ASN I 550 ASP I 552 5 ? 3 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY N 52 ? THR N 75 ? GLY I 553 THR I 576 1 ? 24 HELX_P HELX_P48 AF3 ILE N 83 ? TRP N 96 ? ILE I 584 TRP I 597 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 AF4 THR O 28 ? TYR O 32 ? THR Q 28 TYR Q 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 LEU O 53 A ASN O 57 ? LEU Q 52 ASN Q 54 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 ARG O 106 ? ASP O 109 ? ARG Q 100 ASP Q 101 5 ? 4 HELX_P HELX_P52 AF7 GLN P 79 ? PHE P 83 ? GLN U 79 PHE U 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 PRO Q 42 ? LYS Q 45 ? PRO M 40 LYS M 43 5 ? 4 HELX_P HELX_P54 AF9 ASN Q 62 ? SER Q 67 ? ASN M 60 SER M 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 AG1 PHE Q 75 ? ARG Q 77 ? PHE M 73 ARG M 75 5 ? 3 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP Q 88 ? THR Q 92 ? ASP M 83 THR M 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 AG3 GLN R 79 ? LEU R 83 ? 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G CYS 21 SG ? ? ? 1_555 H CYS 108 SG ? ? E CYS 53 G CYS 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf11 disulf ? ? G CYS 76 SG ? ? ? 1_555 G CYS 103 SG ? ? E CYS 108 E CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 89 SG ? ? ? 1_555 G CYS 115 SG ? ? E CYS 121 E CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 10 SG ? ? ? 1_555 H CYS 55 SG ? ? G CYS 511 G CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf14 disulf ? ? H CYS 100 SG ? ? ? 1_555 H CYS 107 SG ? ? G CYS 601 G CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 98 SG ? ? P CYS 22 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? ? disulf16 disulf ? ? J CYS 23 SG ? ? ? 1_555 J CYS 88 SG ? ? T CYS 23 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? ? disulf17 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 97 SG ? ? J CYS 22 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf18 disulf ? ? L CYS 23 SG ? ? ? 1_555 L CYS 88 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? ? disulf19 disulf ? ? M CYS 21 SG ? ? ? 1_555 N CYS 108 SG ? ? F CYS 53 I CYS 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf20 disulf ? ? M CYS 76 SG ? ? ? 1_555 M CYS 103 SG ? ? F CYS 108 F CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf21 disulf ? ? M CYS 89 SG ? ? ? 1_555 M CYS 115 SG ? ? F CYS 121 F CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf22 disulf ? ? N CYS 10 SG ? ? ? 1_555 N CYS 55 SG ? ? I CYS 511 I CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf23 disulf ? ? N CYS 100 SG ? ? ? 1_555 N CYS 107 SG ? ? I CYS 601 I CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf24 disulf ? ? O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 98 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? ? disulf25 disulf ? ? P CYS 23 SG ? ? ? 1_555 P CYS 88 SG ? ? U CYS 23 U CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? ? disulf26 disulf ? ? Q CYS 22 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 97 SG ? ? M CYS 22 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf27 disulf ? ? R CYS 23 SG ? ? ? 1_555 R CYS 88 SG ? ? O CYS 23 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? ? covale1 covale one ? A ASN 196 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 228 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? A ASN 238 A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 225 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 257 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 268 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 563 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? G ASN 196 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? E ASN 228 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? G ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? E ASN 238 E NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? G ASN 225 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? E ASN 257 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? G ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? E ASN 268 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? H ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? G ASN 563 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? M ASN 196 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? F ASN 228 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? M ASN 206 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? F ASN 238 F NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? M ASN 225 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? F ASN 257 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? M ASN 236 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? F ASN 268 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? N ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? I ASN 563 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? N-Glycosylation covale16 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale17 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale18 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? R NAG 2 R BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale19 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale20 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale21 covale one ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale22 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale23 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale24 covale one ? V BMA . O3 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale25 covale one ? V BMA . O6 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale26 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale27 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale28 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale29 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale30 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale31 covale one ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale32 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale33 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale34 covale one ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale35 covale one ? Z BMA . O6 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale36 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale37 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale38 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale39 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale40 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale41 covale one ? CA BMA . O3 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale42 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale43 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale44 covale one ? DA BMA . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale45 covale one ? DA BMA . O6 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 D . ? SER 7 L PRO 8 D ? 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AB8 ? 5 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 7 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 5 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 7 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 6 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 5 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 5 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC2 6 7 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD7 4 5 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? parallel AE1 4 5 ? parallel AE1 5 6 ? anti-parallel AE1 6 7 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE4 4 5 ? anti-parallel AE4 5 6 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE9 1 2 ? parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF2 4 5 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF6 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 10 ? 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The refinement target was optimizing using the MolProbity score while maintaining a high (good) EMRinger score. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria EMRinger _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5KEL _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 6 _em_3d_reconstruction.num_particles 86000 _em_3d_reconstruction.resolution 4.3 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Ebola virus trimeric surface glycoprotein in complex with IgG c2G4 and c13C6 Fabs' _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2,3,4,5,6 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5KEL _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 50 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-50 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5KEL _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_magnification 22500 _em_imaging.recording_temperature_maximum 77 _em_imaging.recording_temperature_minimum 77 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type 'C-flat-2/2 4C' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.entry_id 5KEL _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5KEL _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5KEL _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C3 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OE1 G GLN 567 ? ? 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2 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 6 9 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 7 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 8 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 9 10 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 10 10 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 9 BMA 3 n 9 MAN 4 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 10 MAN 4 n 10 MAN 5 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 11 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG #