data_5L9T # _entry.id 5L9T # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.279 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 5L9T WWPDB D_1200000259 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.db_id EMD-3433 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5L9T _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2016-06-11 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Brown, N.G.' 1 'VanderLinden, R.' 2 'Dube, P.' 3 'Haselbach, D.' 4 'Peters, J.M.' 5 'Stark, H.' 6 'Schulman, B.A.' 7 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 165 _citation.language ? _citation.page_first 1440 _citation.page_last 1453 _citation.title 'Dual RING E3 Architectures Regulate Multiubiquitination and Ubiquitin Chain Elongation by APC/C.' _citation.year 2016 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2016.05.037 _citation.pdbx_database_id_PubMed 27259151 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Brown, N.G.' 1 primary 'VanderLinden, R.' 2 primary 'Watson, E.R.' 3 primary 'Weissmann, F.' 4 primary 'Ordureau, A.' 5 primary 'Wu, K.P.' 6 primary 'Zhang, W.' 7 primary 'Yu, S.' 8 primary 'Mercredi, P.Y.' 9 primary 'Harrison, J.S.' 10 primary 'Davidson, I.F.' 11 primary 'Qiao, R.' 12 primary 'Lu, Y.' 13 primary 'Dube, P.' 14 primary 'Brunner, M.R.' 15 primary 'Grace, C.R.' 16 primary 'Miller, D.J.' 17 primary 'Haselbach, D.' 18 primary 'Jarvis, M.A.' 19 primary 'Yamaguchi, M.' 20 primary 'Yanishevski, D.' 21 primary 'Petzold, G.' 22 primary 'Sidhu, S.S.' 23 primary 'Kuhlman, B.' 24 primary 'Kirschner, M.W.' 25 primary 'Harper, J.W.' 26 primary 'Peters, J.M.' 27 primary 'Stark, H.' 28 primary 'Schulman, B.A.' 29 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 1' 216725.469 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 11' 9854.647 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Cell division cycle protein 23 homolog' 68921.031 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 15' 14286.727 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 16' 11677.995 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'Cell division cycle protein 27 homolog' 91973.125 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit CDC26' 9793.999 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 4' 93207.328 1 ? ? ? ? 9 polymer man 'Cell division cycle protein 16 homolog' 71747.516 2 ? ? ? ? 10 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 10' 21282.143 1 ? ? ? ? 11 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 13' 8528.309 1 ? ? ? ? 12 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 2' 93938.977 1 ? ? ? ? 13 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 5' 85179.766 1 ? ? ? ? 14 polymer man 'Fizzy-related protein homolog' 54838.688 1 ? ? ? ? 15 polymer man 'Ubiquitin_variant-Hsl1(substrate) fusion' 12030.880 1 2.7.11.1 ? ? 'This construct comprises a Ubiquitin variant(UBV) fused to APC/C substrate Hsl1 residues 818-842' 16 polymer man 'Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S' 20519.662 1 2.3.2.23 'C118F, delta 161-201' ? ;This construct as an N-terminal remnant of cleavage site and linker. C95 of this construct is cross-linked to UBv K11C and UB G75C via TMEA. ; 17 polymer man 'Anaphase-promoting complex subunit 7' 63204.020 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'APC1,Cyclosome subunit 1,Mitotic checkpoint regulator,Testis-specific gene 24 protein' 2 'APC11,Cyclosome subunit 11,Hepatocellular carcinoma-associated RING finger protein' 3 'Anaphase-promoting complex subunit 8,APC8,Cyclosome subunit 8' 4 APC15 5 'APC16,Cyclosome subunit 16' 6 'Anaphase-promoting complex subunit 3,APC3,CDC27 homolog,CDC27Hs,H-NUC' 7 'Anaphase-promoting complex subunit 12,APC12,Cell division cycle protein 26 homolog' 8 'APC4,Cyclosome subunit 4' 9 'Anaphase-promoting complex subunit 6,APC6,CDC16 homolog,CDC16Hs,Cyclosome subunit 6' 10 'APC10,Cyclosome subunit 10' 11 'APC13,Cyclosome subunit 13' 12 'APC2,Cyclosome subunit 2' 13 'APC5,Cyclosome subunit 5' 14 'Fzr,CDC20-like protein 1,Cdh1/Hct1 homolog,hCDH1' 16 ;E2 ubiquitin-conjugating enzyme S,E2-EPF,Ubiquitin carrier protein S,Ubiquitin-conjugating enzyme E2-24 kDa,Ubiquitin-conjugating enzyme E2-EPF5,Ubiquitin-protein ligase S ; 17 'APC7,Cyclosome subunit 7' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSNFYEERTTMIAARDLQEFVPFGRDHCKHHPNALNLQLRQLQPASELWSSDGAAGLVGSLQEVTIHEKQKESWQLRKGV SEIGEDVDYDEELYVAGNMVIWSKGSKSQALAVYKAFTVDSPVQQALWCDFIISQDKSEKAYSSNEVEKCICILQSSCIN MHSIEGKDYIASLPFQVANVWPTKYGLLFERSASSHEVPPGSPREPLPTMFSMLHPLDEITPLVCKSGSLFGSSRVQYVV DHAMKIVFLNTDPSIVMTYDAVQNVHSVWTLRRVKSEEENVVLKFSEQGGTPQNVATSSSLTAHLRSLSKGDSPVTSPFQ NYSSIHSQSRSTSSPSLHSRSPSISNMAALSRAHSPALGVHSFSGVQRFNISSHNQSPKRHSISHSPNSNSNGSFLAPET EPIVPELCIDHLWTETITNIREKNSQASKVFITSDLCGQKFLCFLVESQLQLRCVKFQESNDKTQLIFGSVTNIPAKDAA PVEKIDTMLVLEGSGNLVLYTGVVRVGKVFIPGLPAPSLTMSNTMPRPSTPLDGVSTPKPLSKLLGSLDEVVLLSPVPEL 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HNLCEIDKYRVETCCVIGNYYSLRSQHEKAALYFQRALKLNPRYLGAWTLMGHEYMEMKNTSAAIQAYRHAIEVNKRDYR AWYGLGQTYEILKMPFYCLYYYRRAHQLRPNDSRMLVALGECYEKLNQLVEAKKCYWRAYAVGDVEKMALVKLAKLHEQL TESEQAAQCYIKYIQDIYSCGEIVEHLEESTAFRYLAQYYFKCKLWDEASTCAQKCCAFNDTREEGKALLRQILQLRNQG ETPTTEVPAPFFLPASLSANNTPTRRVSPLNLSSVTP ; ;MAASTSMVPVAVTAAVAPVLSINSDFSDLREIKKQLLLIAGLTRERGLLHSSKWSAELAFSLPALPLAELQPPPPITEED AQDMDAYTLAKAYFDVKEYDRAAHFLHGCNSKKAYFLYMYSRYLSGEKKKDDETVDSLGPLEKGQVKNEALRELRVELSK KHQARELDGFGLYLYGVVLRKLDLVKEAIDVFVEATHVLPLHWGAWLELCNLITDKEMLKFLSLPDTWMKEFFLAHIYTE LQLIEEALQKYQNLIDVGFSKSSYIVSQIAVAYHNIRDIDKALSIFNELRKQDPYRIENMDTFSNLLYVRSMKSELSYLA HNLCEIDKYRVETCCVIGNYYSLRSQHEKAALYFQRALKLNPRYLGAWTLMGHEYMEMKNTSAAIQAYRHAIEVNKRDYR AWYGLGQTYEILKMPFYCLYYYRRAHQLRPNDSRMLVALGECYEKLNQLVEAKKCYWRAYAVGDVEKMALVKLAKLHEQL TESEQAAQCYIKYIQDIYSCGEIVEHLEESTAFRYLAQYYFKCKLWDEASTCAQKCCAFNDTREEGKALLRQILQLRNQG ETPTTEVPAPFFLPASLSANNTPTRRVSPLNLSSVTP ; C,P ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDS EDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI ; ;MSTLFPSLFPRVTETLWFNLDRPCVEETELQQQEQQHQAWLQSIAEKDNNLVPIGKPASEHYDDEEEEDDEDDEDSEEDS EDDEDMQDMDEMNDYNESPDDGEVNEVDMEGNEQDQDQWMI ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAASSSSSSAGGVSGSSVTGSGFSVSDLAPPRKALFTYPKGAGEMLEDGSERFLCESVFSYQVASTLKQVKHDQQVARME KLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTPSSG ; ;MAASSSSSSAGGVSGSSVTGSGFSVSDLAPPRKALFTYPKGAGEMLEDGSERFLCESVFSYQVASTLKQVKHDQQVARME KLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTPSSG ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTVLQEPVQAAIWQALNHYAYRDAVFLAERLYAEVHSEEALFLLATCYYRSGKAYKAYRLLKGHSCTTPQCKYLLAKCCV DLSKLAEGEQILSGGVFNKQKSHDDIVTEFGDSACFTLSLLGHVYCKTDRLAKGSECYQKSLSLNPFLWSPFESLCEIGE KPDPDQTFKFTSLQNFSNCLPNSCTTQVPNHSLSHRQPETVLTETPQDTIELNRLNLESSNSKYSLNTDSSVSYIDSAVI SPDTVPLGTGTSILSKQVQNKPKTGRSLLGGPAALSPLTPSFGILPLETPSPGDGSYLQNYTNTPPVIDVPSTGAPSKKS VARIGQTGTKSVFSQSGNSREVTPILAQTQSSGPQTSTTPQVLSPTITSPPNALPRRSSRLFTSDSSTTKENSKKLKMKF 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DMDKNSPEAWCAAGNCFSLQREHDIAIKFFQRAIQVDPNYAYAYTLLGHEFVLTEELDKALACFRNAIRVNPRHYNAWYG LGMIYYKQEKFSLAEMHFQKALDINPQSSVLLCHIGVVQHALKKSEKALDTLNKAIVIDPKNPLCKFHRASVLFANEKYK SALQELEELKQIVPKESLVYFLIGKVYKKLGQTHLALMNFSWAMDLDPKGANNQIKEAIDKRYLPDDEEPITQEEQIMGT DESQESSMTDADDTQLHAAESDEF ; F,H ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MLRRKPTRLELKLDDIEEFENIRKDLETRKKQKEDVEVVGGSDGEGAIGLSSDPKSREQMINDRIGYKPQPKPNNRSSQF GSLEF ; ;MLRRKPTRLELKLDDIEEFENIRKDLETRKKQKEDVEVVGGSDGEGAIGLSSDPKSREQMINDRIGYKPQPKPNNRSSQF GSLEF ; G,W ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLRFPTCFPSFRVVGEKQLPQEIIFLVWSPKRDLIALANTAGEVLLHRLASFHRVWSFPPNENTGKEVTCLAWRPDGKLL AFALADTKKIVLCDVEKPESLHSFSVEAPVSCMHWMEVTVESSVLTSFYNAEDESNLLLPKLPTLPKNYSNTSKIFSEEN SDEIIKLLGDVRLNILVLGGSSGFIELYAYGMFKIARVTGIAGTCLALCLSSDLKSLSVVTEVSTNGASEVSYFQLETNL LYSFLPEVTRMARKFTHISALLQYINLSLTCMCEAWEEILMQMDSRLTKFVQEKNTTTSVQDEFMHLLLWGKASAELQTL LMNQLTVKGLKKLGQSIESSYSSIQKLVISHLQSGSESLLYHLSELKGMASWKQKYEPLGLDAAGIEEAITAVGSFILKA NELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVAEFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVERVGQYLK DEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDQCLQKPADVIGKSMNQAICIPLYRDT RSEDSTRRLFKFPFLWNNKTSNLHYLLFTILEDSLYKMCILRRHTDISQSVSNGLIAIKFGSFTYATTEKVRRSIYSCLD AQFYDDETVTVVLKDTVGREGRDRLLVQLPLSLVYNSEDSAEYQFTGTYSTRLDEQCSAIPTRTMHFEKHWRLLESMKAQ YVAGNGFRKVSCVLSSNLRHVRVFEMDIDDEWELDESSDEEEEASNKPVKIKEEVLSESEAENQQAGAAALAPEIVIKVE KLDPELDSGGSLEVLFQG ; ;MLRFPTCFPSFRVVGEKQLPQEIIFLVWSPKRDLIALANTAGEVLLHRLASFHRVWSFPPNENTGKEVTCLAWRPDGKLL AFALADTKKIVLCDVEKPESLHSFSVEAPVSCMHWMEVTVESSVLTSFYNAEDESNLLLPKLPTLPKNYSNTSKIFSEEN SDEIIKLLGDVRLNILVLGGSSGFIELYAYGMFKIARVTGIAGTCLALCLSSDLKSLSVVTEVSTNGASEVSYFQLETNL LYSFLPEVTRMARKFTHISALLQYINLSLTCMCEAWEEILMQMDSRLTKFVQEKNTTTSVQDEFMHLLLWGKASAELQTL LMNQLTVKGLKKLGQSIESSYSSIQKLVISHLQSGSESLLYHLSELKGMASWKQKYEPLGLDAAGIEEAITAVGSFILKA NELLQVIDSSMKNFKAFFRWLYVAMLRMTEDHVLPELNKMTQKDITFVAEFLTEHFNEAPDLYNRKGKYFNVERVGQYLK DEDDDLVSPPNTEGNQWYDFLQNSSHLKESPLLFPYYPRKSLHFVKRRMENIIDQCLQKPADVIGKSMNQAICIPLYRDT RSEDSTRRLFKFPFLWNNKTSNLHYLLFTILEDSLYKMCILRRHTDISQSVSNGLIAIKFGSFTYATTEKVRRSIYSCLD 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YAAKEHQQALDVLDMEEPINKRLFEKYLKDESGFKDPSSDWEMSQSSIKSSICLLRGKIYDALDNRTLATYSYKEALKLD VYCFEAFDLLTSHHMLTAQEEKELLESLPLSKLCNEEQELLRFLFENKLKKYNKPSETVIPESVDGLQENLDVVVSLAER HYYNCDFKMCYKLTSVVMEKDPFHASCLPVHIGTLVELNKANELFYLSHKLVDLYPSNPVSWFAVGCYYLMVGHKNEHAR RYLSKATTLEKTYGPAWIAYGHSFAVESEHDQAMAAYFTAAQLMKGCHLPMLYIGLEYGLTNNSKLAERFFSQALSIAPE DPFVMHEVGVVAFQNGEWKTAEKWFLDALEKIKAIGNEVTVDKWEPLLNNLGHVCRKLKKYAEALDYHRQALVLIPQNAS TYSAIGYIHSLMGNFENAVDYFHTALGLRRDDTFSVTMLGHCIEMYIGDSEAYIGADIKDKLKCYDFDVHTMKTLKNIIS PPWDFREFEVEKQTAEETGLTPLETSRKTPDSRPSLEETFEIEMNESDMMLETSMSDHST ; J,K ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MTTPNKTPPGADPKQLERTGTVREIGSQAVWSLSSCKPGFGVDQLRDDNLETYWQSDGSQPHLVNIQFRRKTTVKTLCIY ADYKSDESYTPSKISVRVGNNFHNLQEIRQLELVEPSGWIHVPLTDNHKKPTRTFMIQIAVLANHQNGRDTHMRQIKIYT PVEESSIGKFPRCTTIDFMMYRSIR ; ;MTTPNKTPPGADPKQLERTGTVREIGSQAVWSLSSCKPGFGVDQLRDDNLETYWQSDGSQPHLVNIQFRRKTTVKTLCIY ADYKSDESYTPSKISVRVGNNFHNLQEIRQLELVEPSGWIHVPLTDNHKKPTRTFMIQIAVLANHQNGRDTHMRQIKIYT PVEESSIGKFPRCTTIDFMMYRSIR ; L ? 11 'polypeptide(L)' no no MDSEVQRDGRILDLIDDAWREDKLPYEDVAIPLNELPEPEQDNGGTTESVKEQEMKWTDLALQYLHENVPPIGN MDSEVQRDGRILDLIDDAWREDKLPYEDVAIPLNELPEPEQDNGGTTESVKEQEMKWTDLALQYLHENVPPIGN M ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MAAAVVVAEGDSDSRPGQELLVAWNTVSTGLVPPAALGLVSSRTSGAVPPKEEELRAAVEVLRGHGLHSVLEEWFVEVLQ NDLQANISPEFWNAISQCENSADEPQCLLLLLDAFGLLESRLDPYLRSLELLEKWTRLGLLMGTGAQGLREEVHTMLRGV LFFSTPRTFQEMIQRLYGCFLRVYMQSKRKGEGGTDPELEGELDSRYARRRYYRLLQSPLCAGCSSDKQQCWCRQALEQF HQLSQVLHRLSLLERVSAEAVTTTLHQVTRERMEDRCRGEYERSFLREFHKWIERVVGWLGKVFLQDGPARPASPEAGNT LRRWRCHVQRFFYRIYASLRIEELFSIVRDFPDSRPAIEDLKYCLERTDQRQQLLVSLKAALETRLLHPGVNTCDIITLY ISAIKALRVLDPSMVILEVACEPIRRYLRTREDTVRQIVAGLTGDSDGTGDLAVELSKTDPASLETGQDSEDDSGEPEDW VPDPVDADPGKSSSKRRSSDIISLLVSIYGSKDLFINEYRSLLADRLLHQFSFSPEREIRNVELLKLRFGEAPMHFCEVM LKDMADSRRINANIREEDEKRPAEEQPPFGVYAVILSSEFWPPFKDEKLEVPEDIRAALEAYCKKYEQLKAMRTLSWKHT LGLVTMDVELADRTLSVAVTPVQAVILLYFQDQASWTLEELSKAVKMPVALLRRRMSVWLQQGVLREEPPGTFSVIEEER PQDRDNMVLIDSDDESDSGMASQADQKEEELLLFWTYIQAMLTNLESLSLDRIYNMLRMFVVTGPALAEIDLQELQGYLQ 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NNLLKFNPDFAEAHYLSYLNNLRVQDVFSSTHSLLHYFDRLILTGAESKSNGEEGYGRSLRYAALNLAALHCRFGHYQQA ELALQEAIRIAQESNDHVCLQHCLSWLYVLGQKRSDSYVLLEHSVKKAVHFGLPYLASLGIQSLVQQRAFAGKTANKLMD ALKDSDLLHWKHSLSELIDISIAQKTAIWRLYGRSTMALQQAQMLLSMNSLEAVNAGVQQNNTESFAVALCHLAELHAEQ GCFAAASEVLKHLKERFPPNSQHAQLWMLCDQKIQFDRAMNDGKYHLADSLVTGITALNSIEGVYRKAVVLQAQNQMSEA HKLLQKLLVHCQKLKNTEMVISVLLSVAELYWRSSSPTIALPMLLQALALSKEYRLQYLASETVLNLAFAQLILGIPEQA LSLLHMAIEPILADGAILDKGRAMFLVAKCQVASAASYDQPKKAEALEAAIENLNEAKNYFAKVDCKERIRDVVYFQARL YHTLGKTQERNRCAMLFRQLHQELPSHGVPLINHL ; O ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPVSSPSKHGDRFIPSRAGANWSVNFHRINENEKSPSQNRKAKDA TSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQDPQTEDRRLQPSTPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKL LRSPRKPTRKISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSER GNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLK WSTDHQLLASGGNDNKLLVWNHSSLSPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGS 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ANAPC13 ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 'Biological sequence' 1 822 Human ? 'ANAPC2, APC2, KIAA1406' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 'Biological sequence' 1 755 Human ? 'ANAPC5, APC5' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 'Biological sequence' 1 493 Human ? 'FZR1, CDH1, FYR, FZR, KIAA1242' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? 'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 'Biological sequence' 1 82 Human ? UBB ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 2 sample 'Biological sequence' 83 108 ;Baker's yeast ; ? 'HSL1, YKL101W, YKL453' ? 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'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP APC1_HUMAN Q9H1A4 ? 1 ;MSNFYEERTTMIAARDLQEFVPFGRDHCKHHPNALNLQLRQLQPASELWSSDGAAGLVGSLQEVTIHEKQKESWQLRKGV SEIGEDVDYDEELYVAGNMVIWSKGSKSQALAVYKAFTVDSPVQQALWCDFIISQDKSEKAYSSNEVEKCICILQSSCIN MHSIEGKDYIASLPFQVANVWPTKYGLLFERSASSHEVPPGSPREPLPTMFSMLHPLDEITPLVCKSGSLFGSSRVQYVV DHAMKIVFLNTDPSIVMTYDAVQNVHSVWTLRRVKSEEENVVLKFSEQGGTPQNVATSSSLTAHLRSLSKGDSPVTSPFQ NYSSIHSQSRSTSSPSLHSRSPSISNMAALSRAHSPALGVHSFSGVQRFNISSHNQSPKRHSISHSPNSNSNGSFLAPET EPIVPELCIDHLWTETITNIREKNSQASKVFITSDLCGQKFLCFLVESQLQLRCVKFQESNDKTQLIFGSVTNIPAKDAA PVEKIDTMLVLEGSGNLVLYTGVVRVGKVFIPGLPAPSLTMSNTMPRPSTPLDGVSTPKPLSKLLGSLDEVVLLSPVPEL RDSSKLHDSLYNEDCTFQQLGTYIHSIRDPVHNRVTLELSNGSMVRITIPEIATSELVQTCLQAIKFILPKEIAVQMLVK WYNVHSAPGGPSYHSEWNLFVTCLMNMMGYNTDRLAWTRNFDFEGSLSPVIAPKKARPSETGSDDDWEYLLNSDYHQNVE SHLLNRSLCLSPSEASQMKDEDFSQNLSLDSSTLLFTHIPAIFFVLHLVYEELKLNTLMGEGICSLVELLVQLARDLKLG PYVDHYYRDYPTLVRTTGQVCTIDPGQTGFMHHPSFFTSEPPSIYQWVSSCLKGEGMPPYPYLPGICERSRLVVLSIALY ILGDESLVSDESSQYLTRITIAPQKLQVEQEENRFSFRHSTSVSSLAERLVVWMTNVGFTLRDLETLPFGIALPIRDAIY HCREQPASDWPEAVCLLIGRQDLSKQACEGNLPKGKSVLSSDVPSGTETEEEDDGMNDMNHEVMSLIWSEDLRVQDVRRL LQSAHPVRVNVVQYPELSDHEFIEEKENRLLQLCQRTMALPVGRGMFTLFSYHPVPTEPLPIPKLNLTGRAPPRNTTVDL NSGNIDVPPNMTSWASFHNGVAAGLKIAPASQIDSAWIVYNKPKHAELANEYAGFLMALGLNGHLTKLATLNIHDYLTKG HEMTSIGLLLGVSAAKLGTMDMSITRLLSIHIPALLPPTSTELDVPHNVQVAAVVGIGLVYQGTAHRHTAEVLLAEIGRP PGPEMEYCTDRESYSLAAGLALGMVCLGHGSNLIGMSDLNVPEQLYQYMVGGHRRFQTGMHREKHKSPSYQIKEGDTINV DVTCPGATLALAMIYLKTNNRSIADWLRAPDTMYLLDFVKPEFLLLRTLARCLILWDDILPNSKWVDSNVPQIIRENSIS LSEIELPCSEDLNLETLSQAHVYIIAGACLSLGFRFAGSENLSAFNCLHKFAKDFMTYLSAPNASVTGPHNLETCLSVVL LSLAMVMAGSGNLKVLQLCRFLHMKTGGEMNYGFHLAHHMALGLLFLGGGRYSLSTSNSSIAALLCALYPHFPAHSTDNR YHLQALRHLYVLAAEPRLLVPVDVDTNTPCYALLEVTYKGTQWYEQTKEELMAPTLLPELHLLKQIKVKGPRYWELLIDL SKGTQHLKSILSKDGVLYVKLRAGQLSYKEDPMGWQSLLAQTVANRNSEARAFKPETISAFTSDPALLSFAEYFCKPTVN MGQKQEILDLFSSVLYECVTQETPEMLPAYIAMDQAIRRLGRREMSETSELWQIKLVLEFFSSRSHQERLQNHPKRGLFM NSEFLPVVKCTIDNTLDQWLQVGGDMCVHAYLSGQPLEESQLSMLACFLVYHSVPAPQHLPPIGLEGSTSFAELLFKFKQ LKMPVRALLRLAPLLLGNPQPMVM ; 1 2 UNP APC11_HUMAN Q9NYG5 ? 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Y . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 22-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 22 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-10-26 2 'Structure model' 1 1 2016-11-02 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # _pdbx_audit_revision_group.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_group.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_group.group Other # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 5L9T _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5L9T _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 135578 _em_3d_reconstruction.resolution 6.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ;Due to the low resolution of electron density corresponding to the APC11-APC2 catalytic core and cross linked substrate-Ubiquitin variant-UBE2S complex, these regions are included in the coordinates as representative of domain-domain interactions, but their precise relative positions are approximate and not definitive. ; _em_entity_assembly.name ;Multi-protein complex of APC/C, coactivator CDH1, and cross-linked complex comprising UBE2S, Ubiquitin, Ubiquitin_variant-substrate (HSL1) fusion. ; _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5L9T _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.details ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5L9T _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.details ? _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 5L9T _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5L9T _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A SER 2 ? A SER 2 3 1 Y 1 A ASN 3 ? A ASN 3 4 1 Y 1 A PHE 4 ? A PHE 4 5 1 Y 1 A TYR 5 ? A TYR 5 6 1 Y 1 A GLU 6 ? A GLU 6 7 1 Y 1 A GLU 7 ? A GLU 7 8 1 Y 1 A ARG 8 ? A ARG 8 9 1 Y 1 A THR 9 ? A THR 9 10 1 Y 1 A THR 10 ? A THR 10 11 1 Y 1 A ASN 33 ? A ASN 33 12 1 Y 1 A ALA 34 ? A ALA 34 13 1 Y 1 A LEU 35 ? A LEU 35 14 1 Y 1 A ASN 36 ? A ASN 36 15 1 Y 1 A LEU 37 ? A LEU 37 16 1 Y 1 A GLN 38 ? A GLN 38 17 1 Y 1 A LEU 39 ? A LEU 39 18 1 Y 1 A ARG 40 ? A ARG 40 19 1 Y 1 A GLN 41 ? A GLN 41 20 1 Y 1 A LEU 42 ? A LEU 42 21 1 Y 1 A GLN 43 ? A GLN 43 22 1 Y 1 A PRO 44 ? A PRO 44 23 1 Y 1 A ALA 45 ? A ALA 45 24 1 Y 1 A SER 46 ? A SER 46 25 1 Y 1 A GLU 47 ? A GLU 47 26 1 Y 1 A LEU 48 ? A LEU 48 27 1 Y 1 A TRP 49 ? A TRP 49 28 1 Y 1 A SER 50 ? A SER 50 29 1 Y 1 A SER 51 ? A SER 51 30 1 Y 1 A ASP 52 ? A ASP 52 31 1 Y 1 A GLY 53 ? A GLY 53 32 1 Y 1 A ALA 54 ? A ALA 54 33 1 Y 1 A ALA 55 ? A ALA 55 34 1 Y 1 A GLY 56 ? A GLY 56 35 1 Y 1 A LEU 57 ? A LEU 57 36 1 Y 1 A VAL 58 ? 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A SER 202 70 1 Y 1 A PRO 203 ? A PRO 203 71 1 Y 1 A ARG 204 ? A ARG 204 72 1 Y 1 A GLU 205 ? A GLU 205 73 1 Y 1 A SER 227 ? A SER 227 74 1 Y 1 A GLY 228 ? A GLY 228 75 1 Y 1 A SER 229 ? A SER 229 76 1 Y 1 A LEU 230 ? A LEU 230 77 1 Y 1 A PHE 231 ? A PHE 231 78 1 Y 1 A GLY 232 ? A GLY 232 79 1 Y 1 A SER 233 ? A SER 233 80 1 Y 1 A SER 234 ? A SER 234 81 1 Y 1 A ARG 235 ? A ARG 235 82 1 Y 1 A GLU 277 ? A GLU 277 83 1 Y 1 A GLU 278 ? A GLU 278 84 1 Y 1 A GLU 279 ? A GLU 279 85 1 Y 1 A ASN 280 ? A ASN 280 86 1 Y 1 A VAL 281 ? A VAL 281 87 1 Y 1 A VAL 282 ? A VAL 282 88 1 Y 1 A LEU 283 ? A LEU 283 89 1 Y 1 A LYS 284 ? A LYS 284 90 1 Y 1 A PHE 285 ? A PHE 285 91 1 Y 1 A SER 286 ? A SER 286 92 1 Y 1 A GLU 287 ? A GLU 287 93 1 Y 1 A GLN 288 ? A GLN 288 94 1 Y 1 A GLY 289 ? A GLY 289 95 1 Y 1 A GLY 290 ? A GLY 290 96 1 Y 1 A THR 291 ? A THR 291 97 1 Y 1 A PRO 292 ? A PRO 292 98 1 Y 1 A GLN 293 ? A GLN 293 99 1 Y 1 A ASN 294 ? A ASN 294 100 1 Y 1 A VAL 295 ? A VAL 295 101 1 Y 1 A ALA 296 ? A ALA 296 102 1 Y 1 A THR 297 ? A THR 297 103 1 Y 1 A SER 298 ? A SER 298 104 1 Y 1 A SER 299 ? A SER 299 105 1 Y 1 A SER 300 ? A SER 300 106 1 Y 1 A LEU 301 ? A LEU 301 107 1 Y 1 A THR 302 ? A THR 302 108 1 Y 1 A ALA 303 ? A ALA 303 109 1 Y 1 A HIS 304 ? A HIS 304 110 1 Y 1 A LEU 305 ? A LEU 305 111 1 Y 1 A ARG 306 ? A ARG 306 112 1 Y 1 A SER 307 ? A SER 307 113 1 Y 1 A LEU 308 ? A LEU 308 114 1 Y 1 A SER 309 ? A SER 309 115 1 Y 1 A LYS 310 ? A LYS 310 116 1 Y 1 A GLY 311 ? A GLY 311 117 1 Y 1 A ASP 312 ? A ASP 312 118 1 Y 1 A SER 313 ? A SER 313 119 1 Y 1 A PRO 314 ? A PRO 314 120 1 Y 1 A VAL 315 ? A VAL 315 121 1 Y 1 A THR 316 ? A THR 316 122 1 Y 1 A SER 317 ? A SER 317 123 1 Y 1 A PRO 318 ? A PRO 318 124 1 Y 1 A PHE 319 ? A PHE 319 125 1 Y 1 A GLN 320 ? A GLN 320 126 1 Y 1 A ASN 321 ? A ASN 321 127 1 Y 1 A TYR 322 ? A TYR 322 128 1 Y 1 A SER 323 ? A SER 323 129 1 Y 1 A SER 324 ? A SER 324 130 1 Y 1 A ILE 325 ? A ILE 325 131 1 Y 1 A HIS 326 ? A HIS 326 132 1 Y 1 A SER 327 ? 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