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'cabbage looper' 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP G5ED39_CAEEL G5ED39 ? 1 ;MKITNKSVDKQHIEKLDELRKNVSCTVIGFAEQTAELQQEISELFIAEFGVNGPIDMNSLSKLARITSYYASSEYFQGLA KYQRTACKMFITWQTLRKEAMECRSKDREIFASIPAKLCFFYFYNGELCRAVVCLLDYIDLSDDTLAKEAALRWLMFLGE TELIEKKLKTWKMDKSSKDMFSATEFAMNYLKKSEYRVEMLEKLMKLRDKVKSDPTRSFSRYELASYVSWLCSTLSNVPV GSALRECEFPDRVSHIQEAALKSDSLVRNRIPGLASSQFDNSVNASIWPFLDGHQEDSNYYVHIGSTIAWHFEMRRECAL VNVTTAQTRDSMSAMILNLRVALKSASFFRVLQTTNTLAYYSSIIEEAGSEKNAKLMRVSCVNLLSSNPIIVRCSTPKET GATSRAHTPMAGSSVSEKQNTMRPDLADLLGDLELLDEQSFHPITRSCVCNVCTIYPLHSSFAAEYMMSYAIHSDFSQLS IKHFNDEFARIRERGMSSQVLMHRDSSVRPRPNIIQNEIFGMCVIRWLTKKLDSKESADEDTMEIFNNALKIVRYLQQRT TDMILAVTQLGRQLEFPMECNYSWMRPTIRKPRVKATIDCAVDILRAVSPFGRRPKVEKLEKNLQPFDKERFEKVRLAMR NEMNHYGHILYREWRCRLFAYVGRTSRDPWEAAYAWAESTQIGARNAVQSRLEKCKRGLVTMSGHDRFKTCVQSMPDEMT LVQIAMADDKTIYLVKLHADRDPIIMPLAHYSQAVELMDKFTFLLDEDEMIAKYPGDITPEEFWKRRKIVDGRMMTFVDE VQKHFLGVAASLLMPSGQLGPKAAELAIKIHKLSKGGLLLGEAKEMVYQSKLMDAKSWEALILRFCEMRTTDEKFKSFLP LMHRNSVEVMNQDDSIVTEKKYTYLVICPHLSQFCWERLPIFDEYPYVGRQVSIHSTFSQLEAMKSQEKQIPLQIDVQNA YYILDPDNNLGETQKRMVEYINKFNWEGTVGSAPKSNEISAALSQRDAFFFIGHGSGSSVMPRSVLKQSTCNAISLLMGC GSVRTIPQALGFDGKTAILDYAMAKCPLIVGCLWTVTDGEIDRFLIRMIDDCFEDSKSLTGIDKLRQLSEAMHEARSKAR LKYLTGAAVVMYGLPVVAKQTTPFVEKDQRNLPQTPKTSARTSMRMETVPKTPKQEFVTSKSVPMTPIFSNNENKSPSRA RMPSRVLKTPRQVKTFQEEDDEAPKRSTTRQLKPLVAPPIPATPTTRTTRSSARTPSRSRNL ; 1 2 UNP Q18235_CAEEL Q18235 ? 2 ;MEDLNFEERGSTQIPASLQQHFSAKLGRQNELEKTPSRGGLGLVVNSSKTPGGKSLQSLASACKVPPSTKKNTIPIAFEC YEDETDDQIADVATIKKTEKHPCSPIDTANRCETFDSLAADIEDDMLNLEDQDVVLSEDRPYGDVIDPAESEAEALAELG VEEWDSYPPIDPASRIGDDFNYVLRTEDFAEEGDVKLEETRHRTVIADIDEVKMSKAERNELFSMLADDLDSYDLLAEEA NLPL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5MZ6 1 1 ? 1262 ? 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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PRO 1 272 ALA 1 275 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 AC3 ILE A 304 ? VAL A 321 ? ILE 1 304 VAL 1 321 1 ? 18 HELX_P HELX_P22 AC4 ARG A 329 ? ALA A 346 ? ARG 1 329 ALA 1 346 1 ? 18 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 347 ? ILE A 365 ? SER 1 347 ILE 1 365 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 AC6 SER A 370 ? SER A 386 ? SER 1 370 SER 1 386 1 ? 17 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN A 451 ? TYR A 456 ? ASN 1 451 TYR 1 456 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 HIS A 459 ? ASP A 475 ? HIS 1 459 ASP 1 475 1 ? 17 HELX_P HELX_P27 AC9 SER A 477 ? GLY A 495 ? SER 1 477 GLY 1 495 1 ? 19 HELX_P HELX_P28 AD1 GLY A 495 ? ARG A 504 ? GLY 1 495 ARG 1 504 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN A 513 ? LYS A 535 ? ASN 1 513 LYS 1 535 1 ? 23 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP A 539 ? ARG A 554 ? ASP 1 539 ARG 1 554 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 THR A 560 ? PHE A 576 ? THR 1 560 PHE 1 576 1 ? 17 HELX_P HELX_P32 AD5 LYS A 629 ? HIS A 645 ? LYS 1 629 HIS 1 645 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 AD6 TYR A 651 ? SER A 666 ? TYR 1 651 SER 1 666 1 ? 16 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO A 669 ? SER A 679 ? 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PRO B 169 ILE B 176 1 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_conn.id disulf1 _struct_conn.conn_type_id disulf _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.ptnr1_label_asym_id A _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 1031 _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id A _struct_conn.ptnr2_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 1066 _struct_conn.ptnr2_label_atom_id SG _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id 1 _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 1031 _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id 1 _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 1066 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.details ? _struct_conn.pdbx_dist_value 2.024 _struct_conn.pdbx_value_order ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 744 ? HIS A 750 ? ILE 1 744 HIS 1 750 AA1 2 THR A 731 ? LEU A 737 ? THR 1 731 LEU 1 737 AA1 3 MET A 719 ? MET A 726 ? MET 1 719 MET 1 726 AA1 4 TYR A 902 ? VAL A 906 ? TYR 1 902 VAL 1 906 AA1 5 ARG A 930 ? GLN A 931 ? ARG 1 930 GLN 1 931 AA2 1 LEU A 953 ? ILE A 955 ? LEU 1 953 ILE 1 955 AA2 2 VAL A 1136 ? ALA A 1138 ? VAL 1 1136 ALA 1 1138 AA3 1 GLU A 987 ? VAL A 990 ? GLU 1 987 VAL 1 990 AA3 2 TYR A 961 ? LEU A 964 ? TYR 1 961 LEU 1 964 AA3 3 ALA A 1008 ? PHE A 1011 ? ALA 1 1008 PHE 1 1011 AA3 4 ILE A 1034 ? LEU A 1037 ? ILE 1 1034 LEU 1 1037 AA3 5 LEU A 1068 ? VAL A 1070 ? LEU 1 1068 VAL 1 1070 AA3 6 MET A 1131 ? GLY A 1133 ? 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O ILE 1 744 N LYS A 736 ? N LYS 1 736 AA1 2 3 O VAL A 735 ? O VAL 1 735 N GLN A 723 ? N GLN 1 723 AA1 3 4 N ILE A 724 ? N ILE 1 724 O VAL A 906 ? O VAL 1 906 AA1 4 5 N LEU A 905 ? N LEU 1 905 O GLN A 931 ? O GLN 1 931 AA2 1 2 N LEU A 953 ? N LEU 1 953 O VAL A 1137 ? O VAL 1 1137 AA3 1 2 O GLU A 987 ? O GLU 1 987 N TYR A 962 ? N TYR 1 962 AA3 2 3 N ILE A 963 ? N ILE 1 963 O PHE A 1010 ? O PHE 1 1010 AA3 3 4 N PHE A 1011 ? N PHE 1 1011 O LEU A 1036 ? O LEU 1 1036 AA3 4 5 N LEU A 1037 ? N LEU 1 1037 O VAL A 1070 ? O VAL 1 1070 AA3 5 6 N ILE A 1069 ? N ILE 1 1069 O TYR A 1132 ? O TYR 1 1132 # _atom_sites.entry_id 5MZ6 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 1 . n A 1 2 LYS 2 2 ? ? ? 1 . n A 1 3 ILE 3 3 ? ? ? 1 . n A 1 4 THR 4 4 ? ? ? 1 . n A 1 5 ASN 5 5 ? ? ? 1 . n A 1 6 LYS 6 6 ? ? ? 1 . n A 1 7 SER 7 7 ? ? ? 1 . n A 1 8 VAL 8 8 ? ? ? 1 . n A 1 9 ASP 9 9 ? ? ? 1 . n A 1 10 LYS 10 10 ? ? ? 1 . n A 1 11 GLN 11 11 ? ? ? 1 . n A 1 12 HIS 12 12 12 HIS HIS 1 . n A 1 13 ILE 13 13 13 ILE ILE 1 . n A 1 14 GLU 14 14 14 GLU GLU 1 . n A 1 15 LYS 15 15 15 LYS LYS 1 . n A 1 16 LEU 16 16 16 LEU LEU 1 . n A 1 17 ASP 17 17 17 ASP ASP 1 . n A 1 18 GLU 18 18 18 GLU GLU 1 . n A 1 19 LEU 19 19 19 LEU LEU 1 . n A 1 20 ARG 20 20 20 ARG ARG 1 . n A 1 21 LYS 21 21 21 LYS LYS 1 . n A 1 22 ASN 22 22 22 ASN ASN 1 . n A 1 23 VAL 23 23 23 VAL VAL 1 . n A 1 24 SER 24 24 24 SER SER 1 . n A 1 25 CYS 25 25 25 CYS CYS 1 . n A 1 26 THR 26 26 26 THR THR 1 . n A 1 27 VAL 27 27 27 VAL VAL 1 . n A 1 28 ILE 28 28 28 ILE ILE 1 . n A 1 29 GLY 29 29 29 GLY GLY 1 . n A 1 30 PHE 30 30 30 PHE PHE 1 . n A 1 31 ALA 31 31 31 ALA ALA 1 . n 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For detailed information see: https://figshare.com/articles/Graphene_Oxide_Grid_Preparation/3178669 ; _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details 'Custom Manual Plunger' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 5MZ6 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5MZ6 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5MZ6 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CA 1 CYS 580 ? ? 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