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'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? plasmid ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RBL1_RHOSH P27997 ? 1 ;RYKAGVLKYAQMGYWDGDYVPKDTDVLALFRITPQEGVDPVEAAAAVAGESSTATWTVVWTDRLTACDSYRAKAYRVEPV PGTPGQYFCYVAYDLILFEEGSIANLTASIIGNVFSFKPLKAARLEDMRFPVAYVKTYKGPPTGIVGERERLDKFGKPLL GATTKPKLGLSGKNYGRVVYEGLKGGLDFMKDDENINSQPFMHWRDRFLYVMEAVNLASAQTGEVKGHYLNITAGTMEEM YRRAEFAKSLGSVIVMVDLIIGYTAIQSISEWCRQNDMILHMHRAGHGTYTRQKNHGISFRVIAKWLRLAGVDHLHCGTA VGKLEGDPLTVQGYYNVCREPFNTVDLPRGIFFEQDWADLRKVMPVASGGIHAGQMHQLLSLFGDDVVLQFGGGTIGHPM GIQAGATANRVALEAMVLARNEGRNIDVEGPEILRAAAKWCKPLEAALDTWGNITFNYTSTDTSDFV ; 13 2 UNP RBS1_RHOSH P27998 ? 2 ;MRITQGCFSFLPDLTDEQISAQVDYCLGRGWAVSLEHTDDPHPRNTYWEMWGMPMFDLRDPKGVMIELDECRKAWPGRYI RINAFDSTRGFETVTMSFIVNRPEVEPSLRMERTEVDGRSIRYTHSIVR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5NV3 A 1 ? 467 ? 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'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CAP saccharide . 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE ? 'C6 H14 O13 P2' 356.115 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 KCX 'L-peptide linking' n 'LYSINE NZ-CARBOXYLIC ACID' ? 'C7 H14 N2 O4' 190.197 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 5NV3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 5NV3 _struct.title 'Structure of Rubisco from Rhodobacter sphaeroides in complex with CABP' _struct.pdbx_descriptor 'Ribulose bisphosphate carboxylase large chain (E.C.4.1.1.39), Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 1 (E.C.4.1.1.39)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5NV3 _struct_keywords.text 'beta barrel, lyase' _struct_keywords.pdbx_keywords LYASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? 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K KCX 191 OQ1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F KCX 203 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? metalc17 metalc ? ? K ASP 193 OD2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F ASP 205 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? metalc18 metalc ? ? K GLU 194 OE1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F GLU 206 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.350 ? covale13 covale both ? M MET 190 C ? ? ? 1_555 M KCX 191 N ? ? G MET 202 G KCX 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale14 covale both ? M KCX 191 C ? ? ? 1_555 M ASP 192 N ? ? G KCX 203 G ASP 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? metalc19 metalc ? ? M KCX 191 OQ1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G KCX 203 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc20 metalc ? ? M ASP 193 OD2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G ASP 205 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc21 metalc ? ? M GLU 194 OE1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G GLU 206 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? covale15 covale both ? O MET 190 C ? ? ? 1_555 O KCX 191 N ? ? H MET 202 H KCX 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale16 covale both ? O KCX 191 C ? ? ? 1_555 O ASP 192 N ? ? H KCX 203 H ASP 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? metalc22 metalc ? ? O KCX 191 OQ1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H KCX 203 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc23 metalc ? ? O ASP 193 OD2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H ASP 205 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? metalc24 metalc ? ? O GLU 194 OE1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H GLU 206 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc25 metalc ? ? Q CAP . O2 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? A CAP 1001 A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc26 metalc ? ? Q CAP . O3 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? A CAP 1001 A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc27 metalc ? ? Q CAP . O7 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? A CAP 1001 A MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.880 ? metalc28 metalc ? ? S CAP . O2 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? B CAP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc29 metalc ? ? S CAP . O3 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? B CAP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc30 metalc ? ? S CAP . O7 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? B CAP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc31 metalc ? ? U CAP . O2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? C CAP 1001 C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc32 metalc ? ? U CAP . O3 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? C CAP 1001 C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc33 metalc ? ? U CAP . O7 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? C CAP 1001 C MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc34 metalc ? ? W CAP . O2 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? D CAP 1001 D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc35 metalc ? ? W CAP . O3 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? D CAP 1001 D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc36 metalc ? ? W CAP . O7 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? D CAP 1001 D MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc37 metalc ? ? Y CAP . O2 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? E CAP 1001 E MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc38 metalc ? ? Y CAP . O3 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? E CAP 1001 E MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc39 metalc ? ? Y CAP . O6 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? E CAP 1001 E MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc40 metalc ? ? AA CAP . O2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F CAP 1001 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc41 metalc ? ? AA CAP . O3 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F CAP 1001 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc42 metalc ? ? AA CAP . O6 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F CAP 1001 F MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc43 metalc ? ? CA CAP . O2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G CAP 1001 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc44 metalc ? ? CA CAP . O3 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G CAP 1001 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc45 metalc ? ? CA CAP . O6 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? G CAP 1001 G MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? metalc46 metalc ? ? EA CAP . O2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H CAP 1001 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc47 metalc ? ? EA CAP . O3 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H CAP 1001 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc48 metalc ? ? EA CAP . O6 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? H CAP 1001 H MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LYS 165 A . ? LYS 177 A PRO 166 A ? PRO 178 A 1 2.23 2 LYS 165 C . ? LYS 177 B PRO 166 C ? PRO 178 B 1 2.24 3 LYS 165 E . ? LYS 177 C PRO 166 E ? PRO 178 C 1 2.12 4 LYS 165 G . ? LYS 177 D PRO 166 G ? PRO 178 D 1 2.32 5 LYS 165 I . ? LYS 177 E PRO 166 I ? PRO 178 E 1 1.98 6 LYS 165 K . ? LYS 177 F PRO 166 K ? PRO 178 F 1 1.99 7 LYS 165 M . ? LYS 177 G PRO 166 M ? PRO 178 G 1 1.99 8 LYS 165 O . ? LYS 177 H PRO 166 O ? PRO 178 H 1 2.18 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 9 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 9 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 9 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 9 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 9 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 9 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 9 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 9 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 9 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 9 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA2 7 8 ? parallel AA2 8 9 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? anti-parallel AA5 7 8 ? anti-parallel AA5 8 9 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? parallel AA7 7 8 ? parallel AA7 8 9 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB2 6 7 ? parallel AB2 7 8 ? parallel AB2 8 9 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB6 6 7 ? parallel AB6 7 8 ? parallel AB6 8 9 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC1 6 7 ? parallel AC1 7 8 ? parallel AC1 8 9 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC4 6 7 ? anti-parallel AC4 7 8 ? anti-parallel AC4 8 9 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? parallel AC6 4 5 ? parallel AC6 5 6 ? parallel AC6 6 7 ? parallel AC6 7 8 ? parallel AC6 8 9 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD1 5 6 ? parallel AD1 6 7 ? parallel AD1 7 8 ? parallel AD1 8 9 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD5 4 5 ? parallel AD5 5 6 ? parallel AD5 6 7 ? parallel AD5 7 8 ? parallel AD5 8 9 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 73 ? PRO A 79 ? LYS A 85 PRO A 91 AA1 2 TYR A 87 ? ASP A 94 ? TYR A 99 ASP A 106 AA1 3 ASP A 25 ? PRO A 34 ? ASP A 37 PRO A 46 AA1 4 LEU A 120 ? ARG A 129 ? LEU A 132 ARG A 141 AA1 5 GLY A 297 ? ILE A 298 ? GLY A 309 ILE A 310 AA2 1 LEU A 159 ? THR A 163 ? LEU A 171 THR A 175 AA2 2 PHE A 189 ? KCX A 191 ? PHE A 201 KCX A 203 AA2 3 GLY A 227 ? ASN A 231 ? GLY A 239 ASN A 243 AA2 4 ILE A 254 ? ASP A 258 ? ILE A 266 ASP A 270 AA2 5 ILE A 279 ? HIS A 283 ? ILE A 291 HIS A 295 AA2 6 HIS A 314 ? HIS A 316 ? HIS A 326 HIS A 328 AA2 7 MET A 364 ? SER A 368 ? MET A 376 SER A 380 AA2 8 VAL A 388 ? GLN A 390 ? VAL A 400 GLN A 402 AA2 9 LEU A 159 ? THR A 163 ? LEU A 171 THR A 175 AA3 1 PHE A 342 ? ASN A 343 ? PHE A 354 ASN A 355 AA3 2 GLN A 355 ? ASP A 356 ? GLN A 367 ASP A 368 AA4 1 GLU B 49 ? MET B 50 ? GLU I 49 MET I 50 AA4 2 ALA B 32 ? THR B 38 ? ALA I 32 THR I 38 AA4 3 TYR B 79 ? PHE B 85 ? TYR I 79 PHE I 85 AA4 4 VAL B 94 ? ASN B 101 ? VAL I 94 ASN I 101 AA5 1 LEU B 109 ? GLU B 115 ? 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? 57.74 4.54 64 1 ASP N 57 ? ? -108.33 76.67 65 1 PHE N 91 ? ? -73.73 -75.93 66 1 VAL N 116 ? ? -109.92 -141.78 67 1 THR G 36 ? ? -103.10 64.12 68 1 SER G 64 ? ? -124.15 -90.47 69 1 THR G 155 ? ? -121.76 -52.55 70 1 ASN G 209 ? ? -139.11 -90.39 71 1 ALA G 370 ? ? 51.88 71.58 72 1 PHE G 395 ? ? -105.31 -69.08 73 1 PRO O 41 ? ? -94.25 47.67 74 1 ARG O 44 ? ? 56.24 8.73 75 1 ASP O 57 ? ? -108.15 77.27 76 1 PHE O 91 ? ? -73.54 -75.78 77 1 VAL O 116 ? ? -110.17 -141.77 78 1 THR H 36 ? ? -102.71 64.43 79 1 SER H 64 ? ? -123.39 -91.82 80 1 THR H 155 ? ? -122.92 -52.45 81 1 ASN H 209 ? ? -139.21 -89.66 82 1 ALA H 370 ? ? 51.46 73.00 83 1 PHE H 395 ? ? -104.64 -70.05 84 1 PRO P 41 ? ? -94.21 48.13 85 1 ARG P 44 ? ? 57.90 3.82 86 1 ASP P 57 ? ? -108.17 76.94 87 1 PHE P 91 ? ? -73.32 -75.75 88 1 VAL P 116 ? ? -110.06 -140.92 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C4H12ClNO3 TRiS-HCl 1 2 50 mM NaCl NaCl 1 3 1 mM C10H16N5O13P3 ATP 1 4 1 mM C10H12Li4N5O12P3S ATP-gammaS 1 5 1 mM C5H12O11P2 RuBP # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 1063 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Rhodobacter sphaeroides' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time 1.25 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON II (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.8.2 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? REFMAC 5.8.0155 ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ;RcaCC hexamers (20 micromolar monomer) were mixed with E.C.M-CABP octamers (10 micromolar monomer) in a reaction containing 20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 mM ATP and 1mM RuBP, for 1 min at 25oC prior to addition of 0.125 % of glutaraldehyde (GA). After 10 min the reaction was quenched by addition of 0.1M Tris HCl pH 8 followed by gel filtration on a Superdex 200 PC 3.2/30 column (GE Healthcare).The fractions were eluted in buffer A and analyzed on a 6 % native gel. Fraction 13 containing HMW complexes with the least amount of free Rubisco were chosen for cryo-EM. The crosslinked E.C.M.-CABP-RcaCC complexes were diluted to 0.0030-0.0035 g ml-1 in 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 50 mM NaCl, 1 mM ATP, 1 mM ATP-gammaS and 1 mM RuBP ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 3 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE CAP 4 'MAGNESIUM ION' MG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'mass spectrometry' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #