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KFIKYLSTAHLNYMNIAVYENGSKIKARVENVVNGKSVGARDFDSTEQLESWFYGLPGSGLGRIENAMNEISRRENP I,J ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MHHHHHHIAQQHKDTVAACEAAEAIAIAKDQVWDGEGYTKYTFDDNSVLIQSGTTQYAMDADDADSIKGYADWLDDEARS AEASEIERLLESVEEE ; ;MHHHHHHIAQQHKDTVAACEAAEAIAIAKDQVWDGEGYTKYTFDDNSVLIQSGTTQYAMDADDADSIKGYADWLDDEARS AEASEIERLLESVEEE ; K ? 6 'polypeptide(L)' no no ;FTMDHYLDIRLRPDPEFPPAQLMCVLFGKLHQALVAQGGDRIGVSFPDLDESRSRLGERLRIHASADDLRALLARPWLEG LRDHLQFGEPAVVPHPTPYRQVSRVQAKSNPERLRRRLMRRHDLSEEEARKRIPDTVARALDLPFVTLRSQSTGQHFRLF IRHGPLQVTAEEGGFTCYGLSKGGFVPWF ; ;FTMDHYLDIRLRPDPEFPPAQLMCVLFGKLHQALVAQGGDRIGVSFPDLDESRSRLGERLRIHASADDLRALLARPWLEG LRDHLQFGEPAVVPHPTPYRQVSRVQAKSNPERLRRRLMRRHDLSEEEARKRIPDTVARALDLPFVTLRSQSTGQHFRLF IRHGPLQVTAEEGGFTCYGLSKGGFVPWF ; L ? 7 polyribonucleotide no no CUAAGAAAUUCACGGCGGGCUUGAUGUCCGCGUCUACCUGGUUCACUGCCGUAUAGGCAG CUAAGAAAUUCACGGCGGGCUUGAUGUCCGCGUCUACCUGGUUCACUGCCGUAUAGGCAG M ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 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_refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.006 ? ? 24948 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_angle_d 0.942 ? ? 34087 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_dihedral_angle_d 6.731 ? ? 14566 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_chiral_restr 0.050 ? ? 3750 'ELECTRON MICROSCOPY' ? f_plane_restr 0.006 ? ? 4350 'ELECTRON MICROSCOPY' ? # _struct.entry_id 5UZ9 _struct.title 'Cryo EM structure of anti-CRISPRs, AcrF1 and AcrF2, bound to type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5UZ9 _struct_keywords.text 'CRISPR RNA-recognition-motif (RRM), pseudo-helical, Type 1-F CRISPR, IMMUNE SYSTEM-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CSY1_PSEAB Q02ML9 ? 1 ;MTSPLPTPTWQELRQFIESFIQERLQGKLDKLQPDEDDKRQTLLATHRREAWLADAARRVGQLQLVTHTLKPIHPDARGS NLHSLPQAPGQPGLAGSHELGDRLVSDVVGNAAALDVFKFLSLQYQGKNLLNWLTEDSAEALQALSDNAEQAREWRQAFI GITTVKGAPASHSLAKQLYFPLPGSGYHLLAPLFPTSLVHHVHALLREARFGDAAKAAREARSRQESWPHGFSEYPNLAI QKFGGTKPQNISQLNNERRGENWLLPSLPPNWQRQNVNAPMRHSSVFEHDFGRTPEVSRLTRTLQRFLAKTVHNNLAIRQ RRAQLVAQICDEALQYAARLRELEPGWSATPGCQLHDAEQLWLDPLRAQTDETFLQRRLRGDWPAEVGNRFANWLNRAVS SDSQILGSPEAAQWSQELSKELTMFKEILEDERD ; 1 2 UNP CSY2_PSEAB Q02MM0 ? 2 ;MSVTDPEALLLLPRLSIQNANAISSPLTWGFPSPGAFTGFVHALQRRVGISLDIELDGVGIVCHRFEAQISQPAGKRTKV FNLTRNPLNRDGSTAAIVEEGRAHLEVSLLLGVHGDGLDDHPAQEIARQVQEQAGAMRLAGGSILPWCNERFPAPNAELL MLGGSDEQRRKNQRRLTRRLLPGFALVSREALLQQHLETLRTTLPEATTLDALLDLCRINFEPPATSSEEEASPPDAAWQ VRDKPGWLVPIPAGYNALSPLYLPGEVRNARDRETPLRFVENLFGLGEWLSPHRVAALSDLLWYHHAEPDKGLYRWSTPR FVEHAIA ; 1 3 UNP CSY3_PSEAB Q02MM1 ? 3 ;SKPILSTASVLAFERKLDPSDALMSAGAWAQRDASQEWPAVTVREKSVRGTISNRLKTKDRDPAKLDASIQSPNLQTVDV ANLPSDADTLKVRFTLRVLGGAGTPSACNDAAYRDKLLQTVATYVNDQGFAELARRYAHNLANARFLWRNRVGAEAVEVR INHIRQGEVARAWRFDALAIGLRDFKADAELDALAELIASGLSGSGHVLLEVVAFARIGDGQEVFPSQELILDKGDKKGQ KSKTLYSVRDAAAIHSQKIGNALRTIDTWYPDEDGLGPIAVEPYGSVTSQGKAYRQPKQKLDFYTLLDNWVLRDEAPAVE QQHYVIANLIRGGVFGEAEEK ; 2 4 UNP L7P7M1_9CAUD L7P7M1 ? 4 KFIKYLSTAHLNYMNIAVYENGSKIKARVENVVNGKSVGARDFDSTEQLESWFYGLPGSGLGRIENAMNEISRRENP 2 5 UNP ACR30_BPD31 Q6TM72 ? 5 ;IAQQHKDTVAACEAAEAIAIAKDQVWDGEGYTKYTFDDNSVLIQSGTTQYAMDADDADSIKGYADWLDDEARSAEASEIE RLLESVEEE ; 2 6 UNP CAS6_PSEAB Q02MM2 ? 6 ;MDHYLDIRLRPDPEFPPAQLMSVLFGKLHQALVAQGGDRIGVSFPDLDESRSRLGERLRIHASADDLRALLARPWLEGLR DHLQFGEPAVVPHPTPYRQVSRVQAKSNPERLRRRLMRRHDLSEEEARKRIPDTVARALDLPFVTLRSQSTGQHFRLFIR HGPLQVTAEEGGFTCYGLSKGGFVPWF ; 1 7 GB CP000438.1 115583796 ? 7 CUAAGAAAUUCACGGCGGGCUUGAUGUCCGCGUCUACCUGGUUCACUGCCGUGUAGGCAG 2936044 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 5UZ9 A 1 ? 434 ? Q02ML9 1 ? 434 ? 1 434 2 2 5UZ9 B 1 ? 327 ? Q02MM0 1 ? 327 ? 1 327 3 3 5UZ9 C 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 4 3 5UZ9 D 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 5 3 5UZ9 E 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 6 3 5UZ9 F 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 7 3 5UZ9 G 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 8 3 5UZ9 H 1 ? 341 ? Q02MM1 2 ? 342 ? 21 361 9 4 5UZ9 I 1 ? 77 ? L7P7M1 2 ? 78 ? 2 78 10 4 5UZ9 J 1 ? 77 ? L7P7M1 2 ? 78 ? 2 78 11 5 5UZ9 K 8 ? 96 ? Q6TM72 2 ? 90 ? 8 96 12 6 5UZ9 L 3 ? 189 ? Q02MM2 1 ? 187 ? 1 187 13 7 5UZ9 M 1 ? 60 ? 115583796 2936044 ? 2935985 ? 1 60 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 11 5UZ9 MET K 1 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 1 1 11 5UZ9 HIS K 2 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 2 2 11 5UZ9 HIS K 3 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 3 3 11 5UZ9 HIS K 4 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 4 4 11 5UZ9 HIS K 5 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 5 5 11 5UZ9 HIS K 6 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 6 6 11 5UZ9 HIS K 7 ? UNP Q6TM72 ? ? 'expression tag' 7 7 12 5UZ9 PHE L 1 ? UNP Q02MM2 ? ? 'expression tag' -1 8 12 5UZ9 THR L 2 ? UNP Q02MM2 ? ? 'expression tag' 0 9 12 5UZ9 CYS L 24 ? UNP Q02MM2 SER 22 'see remark 999' 22 10 13 5UZ9 A M 53 ? GB 115583796 G 2935992 'see remark 999' 53 11 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tridecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ;This RNA protein complex forms a stable assembly and has been observed as a single peak in size exclusion chromatography and also verified by electron microscopy. ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 13 ? LYS A 28 ? LEU A 13 LYS A 28 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 GLN A 33 ? GLU A 50 ? GLN A 33 GLU A 50 1 ? 18 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 50 ? ARG A 59 ? GLU A 50 ARG A 59 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN A 111 ? ALA A 113 ? ASN A 111 ALA A 113 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA A 114 ? LEU A 123 ? ALA A 114 LEU A 123 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 131 ? GLU A 136 ? LEU A 131 GLU A 136 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 ALA A 139 ? ALA A 144 ? ALA A 139 ALA A 144 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN A 148 ? GLY A 161 ? ASN A 148 GLY A 161 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 195 ? PHE A 211 ? PRO A 195 PHE A 211 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP A 213 ? GLN A 225 ? ASP A 213 GLN A 225 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN A 255 ? ARG A 259 ? ASN A 255 ARG A 259 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ARG A 282 ? GLU A 288 ? ARG A 282 GLU A 288 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 THR A 294 ? ARG A 306 ? THR A 294 ARG A 306 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 THR A 311 ? HIS A 313 ? THR A 311 HIS A 313 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN A 314 ? ARG A 319 ? ASN A 314 ARG A 319 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 AB7 GLN A 320 ? VAL A 326 ? GLN A 320 VAL A 326 1 ? 7 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL A 326 ? GLU A 342 ? VAL A 326 GLU A 342 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP A 357 ? LEU A 363 ? ASP A 357 LEU A 363 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 GLU A 386 ? VAL A 399 ? GLU A 386 VAL A 399 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO A 409 ? LEU A 429 ? PRO A 409 LEU A 429 1 ? 21 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU A 430 ? GLU A 432 ? GLU A 430 GLU A 432 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 AC4 SER B 33 ? VAL B 48 ? SER B 33 VAL B 48 1 ? 16 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP B 116 ? HIS B 121 ? ASP B 116 HIS B 121 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO B 122 ? GLY B 135 ? PRO B 122 GLY B 135 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 AC7 SER B 165 ? THR B 177 ? SER B 165 THR B 177 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 ARG B 189 ? LEU B 200 ? ARG B 189 LEU B 200 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA B 207 ? LEU B 213 ? ALA B 207 LEU B 213 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA B 297 ? LEU B 301 ? ALA B 297 LEU B 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA C 111 ? GLN C 128 ? ALA C 131 GLN C 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P30 AD3 PHE C 130 ? ASN C 143 ? PHE C 150 ASN C 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP C 188 ? SER C 203 ? ASP C 208 SER C 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 AD5 HIS C 255 ? ARG C 264 ? HIS C 275 ARG C 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP C 302 ? LEU C 312 ? ASP C 322 LEU C 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA C 318 ? GLY C 332 ? ALA C 338 GLY C 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP D 62 ? GLN D 71 ? ASP D 82 GLN D 91 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 ALA D 111 ? GLN D 128 ? ALA D 131 GLN D 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P37 AE1 PHE D 130 ? ASN D 143 ? PHE D 150 ASN D 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP D 188 ? SER D 203 ? ASP D 208 SER D 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 AE3 HIS D 255 ? ARG D 264 ? HIS D 275 ARG D 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P40 AE4 ASP D 302 ? LEU D 312 ? ASP D 322 LEU D 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P41 AE5 ALA D 318 ? GLY D 332 ? ALA D 338 GLY D 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP E 62 ? SER E 72 ? ASP E 82 SER E 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA E 111 ? GLN E 128 ? ALA E 131 GLN E 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P44 AE8 PHE E 130 ? ASN E 143 ? PHE E 150 ASN E 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 AE9 ASP E 188 ? SER E 203 ? ASP E 208 SER E 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P46 AF1 HIS E 255 ? ARG E 264 ? HIS E 275 ARG E 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP E 302 ? LEU E 312 ? ASP E 322 LEU E 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA E 318 ? GLY E 332 ? ALA E 338 GLY E 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP F 62 ? ILE F 70 ? ASP F 82 ILE F 90 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 AF5 ALA F 111 ? GLN F 128 ? ALA F 131 GLN F 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P51 AF6 PHE F 130 ? ASN F 143 ? PHE F 150 ASN F 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 AF7 ASP F 188 ? SER F 203 ? ASP F 208 SER F 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P53 AF8 HIS F 255 ? ARG F 264 ? HIS F 275 ARG F 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP F 302 ? LEU F 312 ? ASP F 322 LEU F 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P55 AG1 ALA F 318 ? GLY F 332 ? ALA F 338 GLY F 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 AG2 ASP G 62 ? SER G 72 ? ASP G 82 SER G 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 ALA G 111 ? GLN G 128 ? ALA G 131 GLN G 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P58 AG4 PHE G 130 ? ASN G 143 ? PHE G 150 ASN G 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP G 188 ? SER G 203 ? ASP G 208 SER G 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P60 AG6 HIS G 255 ? ARG G 264 ? HIS G 275 ARG G 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P61 AG7 ASP G 302 ? LEU G 312 ? ASP G 322 LEU G 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ALA G 318 ? GLY G 332 ? ALA G 338 GLY G 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P63 AG9 ASP H 62 ? GLN H 71 ? ASP H 82 GLN H 91 1 ? 10 HELX_P HELX_P64 AH1 ALA H 111 ? GLN H 128 ? ALA H 131 GLN H 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P65 AH2 PHE H 130 ? ASN H 143 ? PHE H 150 ASN H 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P66 AH3 ASP H 188 ? SER H 203 ? ASP H 208 SER H 223 1 ? 16 HELX_P HELX_P67 AH4 HIS H 255 ? ARG H 264 ? HIS H 275 ARG H 284 1 ? 10 HELX_P HELX_P68 AH5 ASP H 302 ? LEU H 312 ? ASP H 322 LEU H 332 1 ? 11 HELX_P HELX_P69 AH6 ALA H 318 ? GLY H 332 ? ALA H 338 GLY H 352 1 ? 15 HELX_P HELX_P70 AH7 SER I 45 ? TYR I 54 ? SER I 46 TYR I 55 1 ? 10 HELX_P HELX_P71 AH8 GLY I 60 ? SER I 72 ? 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? -98.20 36.99 177 3 ARG A 40 ? ? -90.43 54.03 178 3 HIS A 68 ? ? 60.82 65.75 179 3 LEU A 82 ? ? 62.25 71.43 180 3 LYS A 166 ? ? -76.38 -166.35 181 3 LEU A 174 ? ? -99.38 35.91 182 3 HIS A 230 ? ? -116.65 -168.44 183 3 SER A 267 ? ? -102.22 63.35 184 3 ALA A 279 ? ? -152.27 89.17 185 3 TRP A 383 ? ? 52.22 74.70 186 3 SER A 401 ? ? -98.24 36.89 187 3 PRO B 13 ? ? -77.12 -169.45 188 3 ASN B 19 ? ? 60.82 63.32 189 3 PRO B 32 ? ? -85.66 42.58 190 3 SER B 33 ? ? -158.57 87.77 191 3 CYS B 63 ? ? 60.06 72.29 192 3 PHE B 66 ? ? -161.89 118.32 193 3 ARG B 77 ? ? -96.60 36.10 194 3 ALA B 270 ? ? -103.62 -67.75 195 3 ARG B 271 ? ? -152.09 -151.86 196 3 ASP B 272 ? ? -38.33 121.02 197 3 LEU C 43 ? ? 60.43 68.65 198 3 ALA C 50 ? ? 68.61 -4.97 199 3 GLN C 51 ? ? -95.38 31.00 200 3 ALA C 54 ? ? 53.08 70.67 201 3 SER C 55 ? ? -42.04 152.48 202 3 ALA C 122 ? ? -97.71 30.09 203 3 GLU C 243 ? ? 58.92 72.69 204 3 VAL C 268 ? ? -125.33 -160.91 205 3 ARG C 269 ? ? -65.84 84.64 206 3 LEU D 43 ? ? 60.45 68.65 207 3 ALA D 50 ? ? 68.59 -5.01 208 3 GLN D 51 ? ? -95.42 31.08 209 3 ALA D 54 ? ? 53.09 70.70 210 3 SER D 55 ? ? -41.99 152.41 211 3 PRO D 93 ? ? -73.84 -169.97 212 3 ALA D 122 ? ? -97.80 30.12 213 3 GLU D 243 ? ? 58.94 72.58 214 3 GLN D 260 ? ? 60.02 66.59 215 3 SER D 262 ? ? 76.06 -8.66 216 3 VAL D 268 ? ? -125.23 -160.88 217 3 ARG D 269 ? ? -65.83 84.67 218 3 LEU E 43 ? ? 60.45 68.68 219 3 ALA E 50 ? ? 68.59 -4.92 220 3 GLN E 51 ? ? -95.42 31.07 221 3 ALA E 54 ? ? 53.14 70.67 222 3 SER E 55 ? ? -42.07 152.49 223 3 ARG E 81 ? ? -99.03 36.89 224 3 ALA E 122 ? ? -97.78 30.16 225 3 GLU E 243 ? ? 58.91 72.57 226 3 SER E 262 ? ? 67.27 -3.30 227 3 VAL E 268 ? ? -125.30 -160.91 228 3 ARG E 269 ? ? -65.82 84.68 229 3 LEU F 43 ? ? 60.44 68.64 230 3 ALA F 50 ? ? 68.59 -4.94 231 3 GLN F 51 ? ? -95.42 31.00 232 3 ALA F 54 ? ? 53.10 70.72 233 3 SER F 55 ? ? -42.08 152.44 234 3 ALA F 122 ? ? -97.77 30.14 235 3 GLU F 243 ? ? 58.98 72.60 236 3 VAL F 268 ? ? -125.27 -160.86 237 3 ARG F 269 ? ? -65.91 84.68 238 3 LEU G 43 ? ? 60.46 68.62 239 3 ALA G 50 ? ? 68.60 -5.01 240 3 GLN G 51 ? ? -95.37 31.11 241 3 ALA G 54 ? ? 53.07 70.69 242 3 SER G 55 ? ? -41.97 152.40 243 3 SER G 73 ? ? -140.28 43.03 244 3 ARG G 75 ? ? -120.89 -50.09 245 3 ASP G 80 ? ? -97.38 31.85 246 3 ALA G 122 ? ? -97.73 30.14 247 3 GLU G 243 ? ? 58.94 72.61 248 3 LYS G 263 ? ? -160.47 107.74 249 3 VAL G 268 ? ? -125.24 -160.92 250 3 ARG G 269 ? ? -65.82 84.63 251 3 LEU H 43 ? ? 60.50 68.61 252 3 ALA H 50 ? ? 68.55 -4.99 253 3 GLN H 51 ? ? -95.41 31.08 254 3 ALA H 54 ? ? 53.19 70.62 255 3 SER H 55 ? ? -41.95 152.43 256 3 SER H 73 ? ? -98.88 -60.78 257 3 LYS H 77 ? ? -94.52 32.08 258 3 ALA H 122 ? ? -97.77 30.20 259 3 GLU H 243 ? ? 58.99 72.60 260 3 VAL H 268 ? ? -125.26 -160.90 261 3 ARG H 269 ? ? -65.84 84.66 262 3 ILE I 4 ? ? -107.22 -64.63 263 3 ASN I 13 ? ? -150.97 87.46 264 3 VAL I 39 ? ? -125.44 -56.02 265 3 SER I 73 ? ? -92.02 33.20 266 3 ILE J 4 ? ? -107.28 -64.57 267 3 ASN J 13 ? ? -150.95 87.50 268 3 VAL J 39 ? ? -125.40 -56.08 269 3 SER J 73 ? ? -91.94 33.10 270 3 ALA L 72 ? ? -94.27 32.77 271 3 ASP L 140 ? ? -91.24 51.66 272 3 LEU L 178 ? ? -127.68 -169.74 273 4 SER A 19 ? ? -93.78 45.12 274 4 PHE A 20 ? ? -131.40 -40.31 275 4 LEU A 29 ? ? -98.31 37.02 276 4 ARG A 40 ? ? -91.13 53.37 277 4 HIS A 68 ? ? 60.58 65.44 278 4 LEU A 82 ? ? 62.29 71.07 279 4 ASN A 148 ? ? -98.67 33.84 280 4 LYS A 166 ? ? -76.57 -166.39 281 4 LEU A 174 ? ? -99.25 36.00 282 4 HIS A 230 ? ? -116.59 -168.94 283 4 SER A 267 ? ? -102.29 63.72 284 4 TRP A 383 ? ? 52.41 74.45 285 4 SER A 401 ? ? -98.23 36.84 286 4 PRO B 13 ? ? -76.86 -168.97 287 4 ASN B 19 ? ? 61.71 61.82 288 4 ALA B 20 ? ? -79.41 -166.34 289 4 PRO B 32 ? ? -85.52 42.49 290 4 SER B 33 ? ? -158.29 88.33 291 4 CYS B 63 ? ? 60.01 71.95 292 4 PHE B 66 ? ? -162.23 117.47 293 4 ARG B 77 ? ? -96.95 35.77 294 4 ALA B 270 ? ? -103.70 -67.28 295 4 ARG B 271 ? ? -151.68 -152.48 296 4 ASP B 272 ? ? -38.30 121.45 297 4 LEU C 43 ? ? 60.18 68.56 298 4 ALA C 50 ? ? 68.31 -3.22 299 4 ALA C 54 ? ? 53.00 70.69 300 4 SER C 55 ? ? -44.57 155.23 301 4 PHE C 150 ? ? -92.62 30.18 302 4 GLU C 243 ? ? 59.05 71.62 303 4 VAL C 268 ? ? -125.62 -161.40 304 4 ARG C 269 ? ? -66.20 83.64 305 4 LEU D 43 ? ? 60.07 68.64 306 4 ALA D 50 ? ? 68.24 -3.22 307 4 ALA D 54 ? ? 53.03 70.70 308 4 SER D 55 ? ? -44.57 155.20 309 4 PHE D 150 ? ? -92.64 30.23 310 4 GLU D 243 ? ? 59.10 71.64 311 4 SER D 262 ? ? 71.96 -8.74 312 4 VAL D 268 ? ? -125.63 -161.39 313 4 ARG D 269 ? ? -66.17 83.57 314 4 LEU E 43 ? ? 60.16 68.57 315 4 ALA E 50 ? ? 68.22 -3.16 316 4 ALA E 54 ? ? 53.08 70.65 317 4 SER E 55 ? ? -44.53 155.24 318 4 ARG E 81 ? ? -99.89 37.42 319 4 PHE E 150 ? ? -92.55 30.23 320 4 GLU E 243 ? ? 59.09 71.56 321 4 GLN E 260 ? ? -79.23 -169.40 322 4 SER E 262 ? ? 67.78 -4.45 323 4 VAL E 268 ? ? -125.62 -161.42 324 4 ARG E 269 ? ? -66.16 83.60 325 4 LEU F 25 ? ? 61.34 84.30 326 4 LEU F 43 ? ? 60.14 68.62 327 4 ALA F 50 ? ? 68.24 -3.14 328 4 ALA F 54 ? ? 53.08 70.62 329 4 SER F 55 ? ? -44.49 155.24 330 4 PHE F 150 ? ? -92.63 30.19 331 4 GLU F 243 ? ? 59.01 71.66 332 4 LYS F 263 ? ? -160.49 111.26 333 4 VAL F 268 ? ? -125.69 -161.37 334 4 ARG F 269 ? ? -66.17 83.59 335 4 LEU G 43 ? ? 60.15 68.58 336 4 ALA G 50 ? ? 68.22 -3.16 337 4 ALA G 54 ? ? 53.01 70.71 338 4 SER G 55 ? ? -44.53 155.21 339 4 THR G 71 ? ? -118.93 -169.92 340 4 SER G 73 ? ? -140.93 43.99 341 4 ARG G 75 ? ? -120.69 -50.09 342 4 ASP G 80 ? ? -95.53 30.02 343 4 LYS G 85 ? ? -38.58 -39.64 344 4 SER G 92 ? ? 54.04 73.29 345 4 PHE G 150 ? ? -92.56 30.20 346 4 GLU G 243 ? ? 59.11 71.63 347 4 SER G 262 ? ? 65.85 -0.35 348 4 LYS G 263 ? ? -160.83 111.25 349 4 VAL G 268 ? ? -125.63 -161.42 350 4 ARG G 269 ? ? -66.20 83.66 351 4 LEU H 43 ? ? 60.18 68.56 352 4 ALA H 50 ? ? 68.19 -3.09 353 4 ALA H 54 ? ? 53.09 70.63 354 4 SER H 55 ? ? -44.54 155.20 355 4 SER H 73 ? ? -93.93 -62.60 356 4 LYS H 77 ? ? -94.47 32.15 357 4 PHE H 150 ? ? -92.58 30.17 358 4 GLU H 243 ? ? 59.10 71.59 359 4 VAL H 268 ? ? -125.63 -161.44 360 4 ARG H 269 ? ? -66.08 83.53 361 4 ILE I 4 ? ? -106.67 -64.65 362 4 ASN I 13 ? ? -151.10 87.86 363 4 VAL I 39 ? ? -125.53 -56.55 364 4 SER I 73 ? ? -92.45 33.62 365 4 ILE J 4 ? ? -106.61 -64.61 366 4 ASN J 13 ? ? -151.07 87.88 367 4 VAL J 39 ? ? -125.58 -56.60 368 4 SER J 73 ? ? -92.45 33.62 369 4 PHE L 15 ? ? -172.03 145.32 370 4 ALA L 72 ? ? -94.90 32.72 371 4 PRO L 94 ? ? -88.14 49.52 372 4 ASP L 140 ? ? -91.29 51.40 373 4 PHE L 155 ? ? -126.70 -169.01 374 5 ILE A 17 ? ? -123.62 -50.96 375 5 ALA A 51 ? ? -91.28 56.24 376 5 GLN A 124 ? ? -97.92 36.53 377 5 THR A 163 ? ? -109.98 40.96 378 5 LYS A 176 ? ? -85.88 -79.03 379 5 GLN A 177 ? ? -146.23 -25.45 380 5 GLU A 226 ? ? -142.68 19.90 381 5 SER A 227 ? ? -60.45 -72.47 382 5 PRO A 229 ? ? -90.33 54.39 383 5 ASN A 271 ? ? -97.56 36.80 384 5 ARG A 282 ? ? -125.32 -166.64 385 5 LEU B 11 ? ? 59.19 73.66 386 5 ALA B 20 ? ? -79.74 -166.65 387 5 CYS B 63 ? ? 59.68 70.33 388 5 GLN B 69 ? ? -92.58 34.46 389 5 ARG B 85 ? ? -83.95 -74.25 390 5 CYS B 148 ? ? -78.22 -167.82 391 5 ASN B 149 ? ? -83.11 -70.88 392 5 GLU B 150 ? ? -150.02 3.87 393 5 LEU B 180 ? ? -140.07 27.36 394 5 ARG B 201 ? ? -68.75 1.92 395 5 ASP B 272 ? ? -172.57 -177.27 396 5 ARG B 273 ? ? -98.49 36.11 397 5 GLU B 274 ? ? -142.74 25.56 398 5 ASN B 282 ? ? 37.44 65.28 399 5 LEU B 290 ? ? -127.48 -167.06 400 5 HIS B 293 ? ? -93.18 33.52 401 5 PRO B 309 ? ? -72.01 -164.71 402 5 ASP B 310 ? ? -68.13 73.05 403 5 SER B 317 ? ? -170.67 -176.24 404 5 SER C 40 ? ? -129.69 -169.39 405 5 LEU C 43 ? ? 60.80 68.28 406 5 TRP C 168 ? ? -76.53 22.09 407 5 ASN C 170 ? ? -99.05 35.37 408 5 GLN C 186 ? ? -137.54 -158.65 409 5 GLU C 249 ? ? -141.97 26.37 410 5 VAL C 268 ? ? -118.24 -163.69 411 5 ARG C 269 ? ? -65.51 91.93 412 5 PRO C 337 ? ? -77.95 -168.41 413 5 SER D 40 ? ? -129.72 -169.34 414 5 LEU D 43 ? ? 60.90 68.30 415 5 ARG D 81 ? ? -142.16 16.16 416 5 PRO D 93 ? ? -73.98 -167.52 417 5 PHE D 150 ? ? -91.10 30.00 418 5 TRP D 168 ? ? -76.50 22.07 419 5 ASN D 170 ? ? -99.01 35.36 420 5 GLN D 186 ? ? -137.54 -158.62 421 5 VAL D 268 ? ? -118.20 -163.67 422 5 ARG D 269 ? ? -65.46 91.82 423 5 PRO D 337 ? ? -78.03 -168.43 424 5 SER E 40 ? ? -129.74 -169.38 425 5 LEU E 43 ? ? 60.93 68.23 426 5 ARG E 81 ? ? -99.62 33.95 427 5 PHE E 150 ? ? -91.18 30.01 428 5 TRP E 168 ? ? -76.52 22.09 429 5 ASN E 170 ? ? -99.02 35.38 430 5 GLN E 186 ? ? -137.53 -158.63 431 5 GLU E 249 ? ? -141.95 26.48 432 5 SER E 262 ? ? 81.37 -1.00 433 5 VAL E 268 ? ? -118.20 -163.71 434 5 ARG E 269 ? ? -65.43 91.83 435 5 PRO E 337 ? ? -77.93 -168.43 436 5 LEU F 25 ? ? 44.96 76.34 437 5 SER F 40 ? ? -129.72 -169.39 438 5 LEU F 43 ? ? 60.90 68.23 439 5 TRP F 168 ? ? -76.44 22.06 440 5 ASN F 170 ? ? -99.01 35.33 441 5 GLN F 186 ? ? -137.58 -158.67 442 5 GLU F 249 ? ? -141.97 26.47 443 5 GLN F 260 ? ? 69.64 -2.53 444 5 LYS F 263 ? ? -161.95 110.81 445 5 VAL F 268 ? ? -118.24 -163.70 446 5 ARG F 269 ? ? -65.46 91.89 447 5 PRO F 337 ? ? -77.98 -168.43 448 5 SER G 40 ? ? -129.77 -169.41 449 5 LEU G 43 ? ? 60.90 68.28 450 5 SER G 92 ? ? 53.10 74.00 451 5 TRP G 168 ? ? -76.52 22.09 452 5 ASN G 170 ? ? -98.96 35.31 453 5 GLN G 186 ? ? -137.56 -158.59 454 5 GLU G 249 ? ? -141.99 26.43 455 5 LYS G 257 ? ? 69.28 -8.57 456 5 VAL G 268 ? ? -118.21 -163.67 457 5 ARG G 269 ? ? -65.50 91.90 458 5 PRO G 337 ? ? -77.96 -168.42 459 5 SER H 40 ? ? -129.69 -169.37 460 5 LEU H 43 ? ? 60.93 68.32 461 5 SER H 73 ? ? -141.54 28.47 462 5 ARG H 75 ? ? -174.19 148.32 463 5 TRP H 168 ? ? -76.48 22.08 464 5 ASN H 170 ? ? -99.00 35.31 465 5 GLN H 186 ? ? -137.51 -158.62 466 5 GLU H 249 ? ? -142.02 26.47 467 5 VAL H 268 ? ? -118.19 -163.68 468 5 ARG H 269 ? ? -65.51 91.83 469 5 PRO H 337 ? ? -77.93 -168.43 470 5 ILE I 4 ? ? -106.86 -64.69 471 5 ILE J 4 ? ? -106.91 -64.68 472 5 HIS K 12 ? ? -99.15 35.33 473 5 ASP K 34 ? ? -158.40 -159.40 474 5 ARG K 88 ? ? 74.43 -4.92 475 5 ARG L 39 ? ? -91.77 57.39 476 5 ALA L 72 ? ? -98.62 36.53 477 5 ASP L 140 ? ? -90.97 52.27 478 5 PHE L 155 ? ? -127.23 -168.43 479 5 LEU L 178 ? ? -129.70 -169.50 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 2 VAL A 66 ? ? THR A 67 ? ? 140.77 2 2 TRP C 168 ? ? ARG C 169 ? ? 149.33 3 2 GLU C 249 ? ? LEU C 250 ? ? 147.35 4 2 TRP D 168 ? ? ARG D 169 ? ? 149.37 5 2 GLU D 249 ? ? LEU D 250 ? ? 147.33 6 2 TRP E 168 ? ? ARG E 169 ? ? 149.36 7 2 GLU E 249 ? ? LEU E 250 ? ? 147.41 8 2 TRP F 168 ? ? ARG F 169 ? ? 149.34 9 2 GLU F 249 ? ? LEU F 250 ? ? 147.40 10 2 ASN G 74 ? ? ARG G 75 ? ? 149.88 11 2 TRP G 168 ? ? ARG G 169 ? ? 149.38 12 2 GLU G 249 ? ? LEU G 250 ? ? 147.32 13 2 TRP H 168 ? ? ARG H 169 ? ? 149.32 14 2 GLU H 249 ? ? LEU H 250 ? ? 147.36 15 3 VAL A 66 ? ? THR A 67 ? ? 148.22 16 3 SER C 55 ? ? GLN C 56 ? ? -141.87 17 3 TRP C 58 ? ? PRO C 59 ? ? 141.03 18 3 GLN C 242 ? ? GLU C 243 ? ? 144.60 19 3 SER D 55 ? ? GLN D 56 ? ? -141.86 20 3 TRP D 58 ? ? PRO D 59 ? ? 140.97 21 3 GLN D 242 ? ? GLU D 243 ? ? 144.64 22 3 SER E 55 ? ? GLN E 56 ? ? -141.89 23 3 TRP E 58 ? ? PRO E 59 ? ? 140.99 24 3 GLN E 242 ? ? GLU E 243 ? ? 144.63 25 3 SER F 55 ? ? GLN F 56 ? ? -141.86 26 3 TRP F 58 ? ? PRO F 59 ? ? 141.05 27 3 GLN F 242 ? ? GLU F 243 ? ? 144.64 28 3 SER G 55 ? ? GLN G 56 ? ? -141.85 29 3 TRP G 58 ? ? PRO G 59 ? ? 141.03 30 3 ASN G 94 ? ? LEU G 95 ? ? -141.57 31 3 LEU G 95 ? ? GLN G 96 ? ? -147.25 32 3 GLN G 242 ? ? GLU G 243 ? ? 144.65 33 3 SER H 55 ? ? GLN H 56 ? ? -141.90 34 3 TRP H 58 ? ? PRO H 59 ? ? 141.03 35 3 GLN H 242 ? ? GLU H 243 ? ? 144.64 36 3 LEU H 250 ? ? ILE H 251 ? ? 148.57 37 4 VAL A 66 ? ? THR A 67 ? ? 148.70 38 4 ALA C 54 ? ? SER C 55 ? ? -148.99 39 4 SER C 55 ? ? GLN C 56 ? ? -142.26 40 4 TRP C 58 ? ? PRO C 59 ? ? 140.72 41 4 GLN C 242 ? ? GLU C 243 ? ? 146.56 42 4 ALA D 54 ? ? SER D 55 ? ? -149.00 43 4 SER D 55 ? ? GLN D 56 ? ? -142.24 44 4 TRP D 58 ? ? PRO D 59 ? ? 140.76 45 4 GLN D 242 ? ? GLU D 243 ? ? 146.49 46 4 ALA E 54 ? ? SER E 55 ? ? -148.98 47 4 SER E 55 ? ? GLN E 56 ? ? -142.24 48 4 TRP E 58 ? ? PRO E 59 ? ? 140.74 49 4 GLN E 242 ? ? GLU E 243 ? ? 146.55 50 4 ALA F 54 ? ? SER F 55 ? ? -148.98 51 4 SER F 55 ? ? GLN F 56 ? ? -142.26 52 4 TRP F 58 ? ? PRO F 59 ? ? 140.77 53 4 GLN F 242 ? ? GLU F 243 ? ? 146.57 54 4 ALA G 54 ? ? SER G 55 ? ? -148.99 55 4 SER G 55 ? ? GLN G 56 ? ? -142.26 56 4 TRP G 58 ? ? PRO G 59 ? ? 140.76 57 4 GLN G 242 ? ? GLU G 243 ? ? 146.53 58 4 ALA H 54 ? ? SER H 55 ? ? -149.03 59 4 SER H 55 ? ? GLN H 56 ? ? -142.17 60 4 TRP H 58 ? ? PRO H 59 ? ? 140.73 61 4 GLN H 242 ? ? GLU H 243 ? ? 146.50 62 4 LEU H 250 ? ? ILE H 251 ? ? 148.60 63 5 LEU A 178 ? ? TYR A 179 ? ? 136.05 64 5 GLU A 226 ? ? SER A 227 ? ? -137.12 65 5 ASN B 86 ? ? PRO B 87 ? ? 139.97 66 5 GLU B 281 ? ? ASN B 282 ? ? 135.76 67 5 ARG C 171 ? ? VAL C 172 ? ? -148.30 68 5 GLU C 249 ? ? LEU C 250 ? ? -149.97 69 5 ARG D 171 ? ? VAL D 172 ? ? -148.27 70 5 LEU E 95 ? ? GLN E 96 ? ? -146.47 71 5 ARG E 171 ? ? VAL E 172 ? ? -148.26 72 5 GLU E 249 ? ? LEU E 250 ? ? -149.97 73 5 LEU E 250 ? ? ILE E 251 ? ? -134.68 74 5 ARG F 171 ? ? VAL F 172 ? ? -148.22 75 5 GLU F 249 ? ? LEU F 250 ? ? -150.00 76 5 ARG G 171 ? ? VAL G 172 ? ? -148.31 77 5 LEU G 250 ? ? ILE G 251 ? ? -137.51 78 5 ARG H 171 ? ? VAL H 172 ? ? -148.27 79 5 GLU H 249 ? ? LEU H 250 ? ? -149.99 80 5 LEU H 250 ? ? ILE H 251 ? ? -122.82 # _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.entry_id 5UZ9 _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details 'The sequence was taken from the PDB entry 4AL5 used for rigid body fitting.' _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _em_3d_fitting.entry_id _em_3d_fitting.id _em_3d_fitting.details _em_3d_fitting.overall_b_value _em_3d_fitting.ref_protocol _em_3d_fitting.ref_space _em_3d_fitting.target_criteria _em_3d_fitting.method 5UZ9 1 ;Top scoring five models out of two hundred models generated using Rosetta were refined using Phenix and deposited as an ensemble atomic model for the final EM map. ; ? 'AB INITIO MODEL' REAL ? ? 5UZ9 2 ;The docked Cas6F structure in the "head" region of the complex was reduced to C-alpha backbone. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? 5UZ9 3 ;Initially two copies were fitted using Chimera and then backbones and side chains were fixed using Coot, followed by real space refinement in Phenix. ; ? 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 5UZ9 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ;Per-frame dose weighting was performed using the RELION particle polishing method. A B-factor of -71 square angstrom was applied to sharpen the final map. Signal subtracted focused classification and refinement was performed for the "tail" region of the complex. This lead to a 4 angstrom (Gold standard FSC 0.143) map. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 51212 _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Buffer was filtered before use.' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ;Cas5F, Cas6F, Cas7F, Cas8F and CRISPR RNA (crRNA) forms the Csy surveillance complex. Cas5F, Cas8F and 5'crRNA handle forms the "tail" of the complex, and 3' crRNA stem-loop along with Cas6F forms the "head". Six copies Cas7F along with crRNA spacer forms the "core" of the complex. ; _em_entity_assembly.name 'Anti-CRISPRs AcrF1 and AcrF2 bound P. aeruginosa crRNA-guided CRISPR surveillance(Csy)complex.' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5UZ9 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 3710 _em_image_scans.dimension_width 3838 _em_image_scans.frames_per_image 30 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 15 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-30 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 5UZ9 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 100 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details 'Objective astigmatism was corrected at nominal magnification of 29000X, using Thon rings visualized with a K2 camera.' _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 1200 _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.recording_temperature_maximum 79 _em_imaging.recording_temperature_minimum 77 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'Holey grid was coated with an amorphous carbon film.' _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 400 _em_sample_support.grid_type C-flat-2/2 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Sample was applied to poly-L-lysine hydrobromide pre-treated amorphous carbon film coated over a holey grid. Excess sample was blotted with Whatman-1 filter paper and plunge frozen. Manual plunge freezing was performed in a cold room. ; _em_vitrification.humidity 98 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.entry_id 5UZ9 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5UZ9 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 5UZ9 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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"O5'" "C5'" sing N N 115 C "C5'" "C4'" sing N N 116 C "C5'" "H5'" sing N N 117 C "C5'" "H5''" sing N N 118 C "C4'" "O4'" sing N N 119 C "C4'" "C3'" sing N N 120 C "C4'" "H4'" sing N N 121 C "O4'" "C1'" sing N N 122 C "C3'" "O3'" sing N N 123 C "C3'" "C2'" sing N N 124 C "C3'" "H3'" sing N N 125 C "O3'" "HO3'" sing N N 126 C "C2'" "O2'" sing N N 127 C "C2'" "C1'" sing N N 128 C "C2'" "H2'" sing N N 129 C "O2'" "HO2'" sing N N 130 C "C1'" N1 sing N N 131 C "C1'" "H1'" sing N N 132 C N1 C2 sing N N 133 C N1 C6 sing N N 134 C C2 O2 doub N N 135 C C2 N3 sing N N 136 C N3 C4 doub N N 137 C C4 N4 sing N N 138 C C4 C5 sing N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 CYS N CA sing N N 145 CYS N H sing N N 146 CYS N H2 sing N N 147 CYS CA C sing N N 148 CYS CA CB sing N N 149 CYS CA HA sing N N 150 CYS C O doub N N 151 CYS C OXT sing N N 152 CYS CB SG sing N N 153 CYS CB HB2 sing N N 154 CYS CB HB3 sing N N 155 CYS SG HG sing N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 G OP3 P sing N N 158 G OP3 HOP3 sing N N 159 G P OP1 doub N N 160 G P OP2 sing N N 161 G P "O5'" sing N N 162 G OP2 HOP2 sing N N 163 G "O5'" "C5'" sing N N 164 G "C5'" "C4'" sing N N 165 G "C5'" "H5'" sing N N 166 G "C5'" "H5''" sing N N 167 G "C4'" "O4'" sing N N 168 G "C4'" "C3'" sing N N 169 G "C4'" "H4'" sing N N 170 G "O4'" "C1'" sing N N 171 G "C3'" "O3'" sing N N 172 G "C3'" "C2'" sing N N 173 G "C3'" "H3'" sing N N 174 G "O3'" "HO3'" sing N N 175 G "C2'" "O2'" sing N N 176 G "C2'" "C1'" sing N N 177 G "C2'" "H2'" sing N N 178 G "O2'" "HO2'" sing N N 179 G "C1'" N9 sing N N 180 G "C1'" "H1'" sing N N 181 G N9 C8 sing Y N 182 G N9 C4 sing Y N 183 G C8 N7 doub Y N 184 G C8 H8 sing N N 185 G N7 C5 sing Y N 186 G C5 C6 sing N N 187 G C5 C4 doub Y N 188 G C6 O6 doub N N 189 G C6 N1 sing N N 190 G N1 C2 sing N N 191 G N1 H1 sing N N 192 G C2 N2 sing N N 193 G C2 N3 doub N N 194 G N2 H21 sing N N 195 G N2 H22 sing N N 196 G N3 C4 sing N N 197 GLN N CA 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N N 241 GLY C OXT sing N N 242 GLY OXT HXT sing N N 243 HIS N CA sing N N 244 HIS N H sing N N 245 HIS N H2 sing N N 246 HIS CA C sing N N 247 HIS CA CB sing N N 248 HIS CA HA sing N N 249 HIS C O doub N N 250 HIS C OXT sing N N 251 HIS CB CG sing N N 252 HIS CB HB2 sing N N 253 HIS CB HB3 sing N N 254 HIS CG ND1 sing Y N 255 HIS CG CD2 doub Y N 256 HIS ND1 CE1 doub Y N 257 HIS ND1 HD1 sing N N 258 HIS CD2 NE2 sing Y N 259 HIS CD2 HD2 sing N N 260 HIS CE1 NE2 sing Y N 261 HIS CE1 HE1 sing N N 262 HIS NE2 HE2 sing N N 263 HIS OXT HXT sing N N 264 ILE N CA sing N N 265 ILE N H sing N N 266 ILE N H2 sing N N 267 ILE CA C sing N N 268 ILE CA CB sing N N 269 ILE CA HA sing N N 270 ILE C O doub N N 271 ILE C OXT sing N N 272 ILE CB CG1 sing N N 273 ILE CB CG2 sing N N 274 ILE CB HB sing N N 275 ILE CG1 CD1 sing N N 276 ILE CG1 HG12 sing N N 277 ILE CG1 HG13 sing N N 278 ILE CG2 HG21 sing N N 279 ILE CG2 HG22 sing N N 280 ILE CG2 HG23 sing N N 281 ILE CD1 HD11 sing N N 282 ILE CD1 HD12 sing N N 283 ILE CD1 HD13 sing N N 284 ILE OXT HXT sing N N 285 LEU N CA sing N N 286 LEU N H sing N N 287 LEU N H2 sing N N 288 LEU CA C sing N N 289 LEU CA CB sing N N 290 LEU CA HA sing N N 291 LEU C O doub N N 292 LEU C OXT sing N N 293 LEU CB CG sing N N 294 LEU CB HB2 sing N N 295 LEU CB HB3 sing N N 296 LEU CG CD1 sing N N 297 LEU CG CD2 sing N N 298 LEU CG HG sing N N 299 LEU CD1 HD11 sing N N 300 LEU CD1 HD12 sing N N 301 LEU CD1 HD13 sing N N 302 LEU CD2 HD21 sing N N 303 LEU CD2 HD22 sing N N 304 LEU CD2 HD23 sing N N 305 LEU OXT HXT sing N N 306 LYS N CA sing N N 307 LYS N H sing N N 308 LYS N H2 sing N N 309 LYS CA C sing N N 310 LYS CA CB sing N N 311 LYS CA HA sing N N 312 LYS C O doub N N 313 LYS C OXT sing N N 314 LYS CB CG sing N N 315 LYS CB HB2 sing N N 316 LYS CB HB3 sing N N 317 LYS CG CD sing N N 318 LYS CG HG2 sing N N 319 LYS CG HG3 sing N N 320 LYS CD CE sing N N 321 LYS CD HD2 sing N N 322 LYS CD HD3 sing N N 323 LYS CE NZ sing N N 324 LYS CE HE2 sing N N 325 LYS CE HE3 sing N N 326 LYS NZ HZ1 sing N N 327 LYS NZ HZ2 sing N N 328 LYS NZ HZ3 sing N N 329 LYS OXT HXT sing N N 330 MET N CA sing N N 331 MET N H sing N N 332 MET N H2 sing N N 333 MET CA C sing N N 334 MET CA CB sing N N 335 MET CA HA sing N N 336 MET C O doub N N 337 MET C OXT sing N N 338 MET CB CG sing N N 339 MET CB HB2 sing N N 340 MET CB HB3 sing N N 341 MET CG SD sing N N 342 MET CG HG2 sing N N 343 MET CG HG3 sing N N 344 MET SD CE sing N N 345 MET CE HE1 sing N N 346 MET CE HE2 sing N N 347 MET CE HE3 sing N N 348 MET OXT HXT sing N N 349 PHE N CA sing N N 350 PHE N H sing N N 351 PHE N H2 sing N N 352 PHE CA C sing N N 353 PHE CA CB sing N N 354 PHE CA HA sing N N 355 PHE C O doub N N 356 PHE C OXT sing N N 357 PHE CB CG sing N N 358 PHE CB HB2 sing N N 359 PHE CB HB3 sing N N 360 PHE CG CD1 doub Y N 361 PHE CG CD2 sing Y N 362 PHE CD1 CE1 sing Y N 363 PHE CD1 HD1 sing N N 364 PHE CD2 CE2 doub Y N 365 PHE CD2 HD2 sing N N 366 PHE CE1 CZ doub Y N 367 PHE CE1 HE1 sing N N 368 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sing N N 454 TYR CB CG sing N N 455 TYR CB HB2 sing N N 456 TYR CB HB3 sing N N 457 TYR CG CD1 doub Y N 458 TYR CG CD2 sing Y N 459 TYR CD1 CE1 sing Y N 460 TYR CD1 HD1 sing N N 461 TYR CD2 CE2 doub Y N 462 TYR CD2 HD2 sing N N 463 TYR CE1 CZ doub Y N 464 TYR CE1 HE1 sing N N 465 TYR CE2 CZ sing Y N 466 TYR CE2 HE2 sing N N 467 TYR CZ OH sing N N 468 TYR OH HH sing N N 469 TYR OXT HXT sing N N 470 U OP3 P sing N N 471 U OP3 HOP3 sing N N 472 U P OP1 doub N N 473 U P OP2 sing N N 474 U P "O5'" sing N N 475 U OP2 HOP2 sing N N 476 U "O5'" "C5'" sing N N 477 U "C5'" "C4'" sing N N 478 U "C5'" "H5'" sing N N 479 U "C5'" "H5''" sing N N 480 U "C4'" "O4'" sing N N 481 U "C4'" "C3'" sing N N 482 U "C4'" "H4'" sing N N 483 U "O4'" "C1'" sing N N 484 U "C3'" "O3'" sing N N 485 U "C3'" "C2'" sing N N 486 U "C3'" "H3'" sing N N 487 U "O3'" "HO3'" sing N N 488 U "C2'" "O2'" sing N N 489 U "C2'" "C1'" sing N N 490 U "C2'" "H2'" sing N N 491 U "O2'" "HO2'" sing N N 492 U "C1'" N1 sing N N 493 U "C1'" "H1'" sing N N 494 U N1 C2 sing N N 495 U N1 C6 sing N N 496 U C2 O2 doub N N 497 U C2 N3 sing N N 498 U N3 C4 sing N N 499 U N3 H3 sing N N 500 U C4 O4 doub N N 501 U C4 C5 sing N N 502 U C5 C6 doub N N 503 U C5 H5 sing N N 504 U C6 H6 sing N N 505 VAL N CA sing N N 506 VAL N H sing N N 507 VAL N H2 sing N N 508 VAL CA C sing N N 509 VAL CA CB sing N N 510 VAL CA HA sing N N 511 VAL C O doub N N 512 VAL C OXT sing N N 513 VAL CB CG1 sing N N 514 VAL CB CG2 sing N N 515 VAL CB HB sing N N 516 VAL CG1 HG11 sing N N 517 VAL CG1 HG12 sing N N 518 VAL CG1 HG13 sing N N 519 VAL CG2 HG21 sing N N 520 VAL CG2 HG22 sing N N 521 VAL CG2 HG23 sing N N 522 VAL OXT HXT sing N N 523 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C4H11NO3 Tris 1 2 100 mM KCl 'Potassium Chloride' 1 3 1 mM C9H15O6P TCEP # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type NONE _em_ctf_correction.details 'Particles were ctf-corrected during 2D and 3D processing.' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.45 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 208963 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'Raw movie frames were aligned using MotionCorr.' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 46 _em_image_recording.average_exposure_time 6 _em_image_recording.details ;Images were collected in movie mode using Leginon automated data acquisition software. Movie frames were aligned using MotionCorr program. ; _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 2261 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Template based particle picking was done using FindEM program implemented in Appion processing package.' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 199348 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' 'Implemented within Appion processing pipeline' FindEM ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' 'Automated data acquisition' Leginon ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' 'CTF parameters were calculated using the aligned micrographs' CTFFIND3 3 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' 'Ab initio model buiding' Coot 0.8.7 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION 1.4 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION 1.4 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' 'Real space refinement' PHENIX 1.11.1 ? 1 ? 21 'MODEL FITTING' 'Initially rigid body fitted to a low resolution map' 'UCSF Chimera' 1.12 ? 2 ? 26 'MODEL REFINEMENT' 'Rigid body refinement' PHENIX 1.11.1 ? 2 ? 27 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? ? ? ? 28 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? ? 30 'CTF CORRECTION' ? ? ? ? ? ? 34 'MODEL FITTING' 'Initially rigid body fitted into the map' 'UCSF Chimera' 1.12 ? 3 ? 35 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? ? ? ? 36 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? ? ? ? 37 CLASSIFICATION ? ? ? ? ? ? 38 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? 39 'MODEL REFINEMENT' 'Real Space refinement' PHENIX 1.11.1 ? 3 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.1 _em_specimen.details 'Sample was free from any aggregation and monodisperse.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 M C 46 1_555 M G 60 1_555 0.166 -0.148 -0.673 -1.845 -11.410 9.183 1 M_C46:G60_M M 46 ? M 60 ? 19 1 1 M U 47 1_555 M A 59 1_555 5.087 -1.903 -1.267 -27.648 -9.917 2.019 2 M_U47:A59_M M 47 ? M 59 ? ? ? # _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number 1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 M _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 C _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 46 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 1_555 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 M _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 G _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 60 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 1_555 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 M _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 U _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 47 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 1_555 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 M _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 A _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 59 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 1_555 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift -5.077 _ndb_struct_na_base_pair_step.slide 0.347 _ndb_struct_na_base_pair_step.rise 4.649 _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt 11.057 _ndb_struct_na_base_pair_step.roll 6.494 _ndb_struct_na_base_pair_step.twist 24.812 _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement -1.012 _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement 13.487 _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise 2.243 _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination 13.984 _ndb_struct_na_base_pair_step.tip -23.809 _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist 27.884 _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number 1 _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name MM_C46U47:A59G60_MM _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 M _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 46 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 ? _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 M _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 60 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 ? _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 M _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 47 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 ? _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 M _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 59 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 ? # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'P20GM103500, P30GM110732-03, R01GM110270, R01GM108888, P20GM103474, F32GM108436, DP2EB020402, DP5OD021344' 1 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' EPS-110134 2 'Canadian Institutes of Health Research (CIHR)' Canada 'MOP-130482, MOP-136845' 3 # _atom_sites.entry_id 5UZ9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O P S # loop_