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UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 22 12 5WJT CYS L 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 23 12 5WJT TYR L 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 24 13 5WJT CYS M 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 25 13 5WJT TYR M 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 26 14 5WJT CYS N 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 27 14 5WJT TYR N 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 28 15 5WJT CYS O 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 29 15 5WJT TYR O 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 30 16 5WJT CYS P 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 31 16 5WJT TYR P 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 32 17 5WJT CYS Q 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 33 17 5WJT TYR Q 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 34 18 5WJT CYS R 209 ? 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UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 74 38 5WJT CYS l 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 75 38 5WJT TYR l 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 76 39 5WJT CYS m 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 77 39 5WJT TYR m 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 78 40 5WJT CYS n 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 79 40 5WJT TYR n 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 80 41 5WJT CYS o 209 ? UNP A0A162QQD4 THR 209 'engineered mutation' 209 81 41 5WJT TYR o 226 ? UNP A0A162QQD4 ASN 226 'engineered mutation' 226 82 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 41-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 41 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 300570 ? 1 MORE -998 ? 1 'SSA (A^2)' 421770 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'helical filament was observed by negative staining and Cryo-EM' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.details 'A helical assembly can be generated by applying the helical parameters to a single subunit, e.g., chain A.' _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_aggregation_state ? _struct_biol.pdbx_assembly_method ? _struct_biol.pdbx_formula_weight ? _struct_biol.pdbx_formula_weight_method ? _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 10 ? 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ASP B 267 ASN B 293 1 ? 27 HELX_P HELX_P16 AB7 GLN B 295 ? ARG B 304 ? GLN B 295 ARG B 304 1 ? 10 HELX_P HELX_P17 AB8 LEU C 10 ? SER C 31 ? LEU C 10 SER C 31 1 ? 22 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP C 42 ? GLY C 98 ? ASP C 42 GLY C 98 1 ? 57 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA C 106 ? THR C 130 ? ALA C 106 THR C 130 1 ? 25 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP C 139 ? LYS C 143 ? ASP C 139 LYS C 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 THR C 148 ? GLN C 152 ? THR C 148 GLN C 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY C 213 ? ARG C 264 ? GLY C 213 ARG C 264 1 ? 52 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP C 267 ? ASN C 293 ? ASP C 267 ASN C 293 1 ? 27 HELX_P HELX_P24 AC6 GLN C 295 ? ARG C 304 ? GLN C 295 ARG C 304 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU D 10 ? SER D 31 ? LEU D 10 SER D 31 1 ? 22 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP D 42 ? GLY D 98 ? ASP D 42 GLY D 98 1 ? 57 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA D 106 ? THR D 130 ? ALA D 106 THR D 130 1 ? 25 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP D 139 ? LYS D 143 ? ASP D 139 LYS D 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 THR D 148 ? GLN D 152 ? THR D 148 GLN D 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 GLY D 213 ? ARG D 264 ? GLY D 213 ARG D 264 1 ? 52 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP D 267 ? ASN D 293 ? ASP D 267 ASN D 293 1 ? 27 HELX_P HELX_P32 AD5 GLN D 295 ? ARG D 304 ? GLN D 295 ARG D 304 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU E 10 ? SER E 31 ? LEU E 10 SER E 31 1 ? 22 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP E 42 ? GLY E 98 ? ASP E 42 GLY E 98 1 ? 57 HELX_P HELX_P35 AD8 ALA E 106 ? THR E 130 ? ALA E 106 THR E 130 1 ? 25 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP E 139 ? LYS E 143 ? ASP E 139 LYS E 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 THR E 148 ? GLN E 152 ? THR E 148 GLN E 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P38 AE2 GLY E 213 ? ARG E 264 ? GLY E 213 ARG E 264 1 ? 52 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP E 267 ? ASN E 293 ? ASP E 267 ASN E 293 1 ? 27 HELX_P HELX_P40 AE4 GLN E 295 ? ARG E 304 ? GLN E 295 ARG E 304 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 AE5 LEU F 10 ? SER F 31 ? LEU F 10 SER F 31 1 ? 22 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP F 42 ? GLY F 98 ? ASP F 42 GLY F 98 1 ? 57 HELX_P HELX_P43 AE7 ALA F 106 ? THR F 130 ? 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The full dose image stack was used for the estimation of the CTF as well as for boxing filaments. Only the first two parts were used for the reconstruction (~5 electrons per Angstrom^2). ; _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON II (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? EMAN2 ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND3 ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Rosetta ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 10 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? 11 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? SPIDER ? 1 ? ? 12 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? SPIDER ? 1 ? ? 13 CLASSIFICATION ? SPIDER ? 1 ? ? 14 RECONSTRUCTION ? SPIDER ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.1 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied YES _em_specimen.vitrification_applied YES # _em_staining.details ? _em_staining.id 1 _em_staining.material 'negative stain' _em_staining.specimen_id 1 _em_staining.type NEGATIVE # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM122510 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM093030 2 # _atom_sites.entry_id 5WJT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O S # loop_