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;MSNKVKTKAMVPPINCIFNFLQQQTPVTIWLFEQIGIRIKGKIVGFDEFMNVVIDEAVEIPVNSADGKEDVEKGTPLGKI LLKGDNITLITSAD ; e ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MSESSDISAMQPVNPKPFLKGLVNHRVGVKLKFNSTEYRGTLVSTDNYFNLQLNEAEEFVAGVSHGTLGEIFIRCNNVLY IRELPN ; ;MSESSDISAMQPVNPKPFLKGLVNHRVGVKLKFNSTEYRGTLVSTDNYFNLQLNEAEEFVAGVSHGTLGEIFIRCNNVLY IRELPN ; f ? 16 'polypeptide(L)' no no MVSTPELKKYMDKKILLNINGSRKVAGILRGYDIFLNVVLDDAMEINGEDPANNHQLGLQTVIRGNSIISLEALDAI MVSTPELKKYMDKKILLNINGSRKVAGILRGYDIFLNVVLDDAMEINGEDPANNHQLGLQTVIRGNSIISLEALDAI g ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MRDIVFVSPQLYLSSQEGWKSDSAKSGFIPILKNDLQRFQDSLKHIVDARNSLSETLLNSNDDGSIHNSDQNTGLNKDKE ASIADNNSANKCATSSSRYQELKQFLPISLDQQIHTVSLQGVSSSFSRGQIESLLDHCLNLALTETQSNSALKVEAWSSF SSFLDTQDIFIRFSKVDEDEAFVNTLNYCKALFAFIRKLHEDFKIELHLDLNTKEYVEDRTGTIPSVKPEKASEFYSVFK NIEDQTDERNSKKEQLDDSSTQYKVDTNTLSDLPSDALDQLCKDIIEFRTKVVSIEKEKKMKSTYEESRRQRHQMQKVFD QIRKNHSGAKGSANTEEEDTNMEDEDEEDDTEDDLALEKRKEERDLEESNRRYEDMLHQLHSNTEPKIKSIRADIMSAEN YEEHLEKNRSLYLKELLHLANDVHYDHHRSFKEQEERRDEEDRAKNGNAKELAPIQLSDGKAISAGKAAAITLPEGTVKS ENYNADKNVSESSEHVKIKFDFKKAIDHSVESSSEDEGYRESELPPTKPSERSAAEDRLPFTADELNIRLTNLKESRYVD ELVREFLGVYEDELVEYILENIRVNQSKQALLNELRETFDEDGETIADRLWSRKEFRLG ; ;MRDIVFVSPQLYLSSQEGWKSDSAKSGFIPILKNDLQRFQDSLKHIVDARNSLSETLLNSNDDGSIHNSDQNTGLNKDKE ASIADNNSANKCATSSSRYQELKQFLPISLDQQIHTVSLQGVSSSFSRGQIESLLDHCLNLALTETQSNSALKVEAWSSF SSFLDTQDIFIRFSKVDEDEAFVNTLNYCKALFAFIRKLHEDFKIELHLDLNTKEYVEDRTGTIPSVKPEKASEFYSVFK NIEDQTDERNSKKEQLDDSSTQYKVDTNTLSDLPSDALDQLCKDIIEFRTKVVSIEKEKKMKSTYEESRRQRHQMQKVFD QIRKNHSGAKGSANTEEEDTNMEDEDEEDDTEDDLALEKRKEERDLEESNRRYEDMLHQLHSNTEPKIKSIRADIMSAEN YEEHLEKNRSLYLKELLHLANDVHYDHHRSFKEQEERRDEEDRAKNGNAKELAPIQLSDGKAISAGKAAAITLPEGTVKS ENYNADKNVSESSEHVKIKFDFKKAIDHSVESSSEDEGYRESELPPTKPSERSAAEDRLPFTADELNIRLTNLKESRYVD ELVREFLGVYEDELVEYILENIRVNQSKQALLNELRETFDEDGETIADRLWSRKEFRLG ; X ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MSTMSTPAAEQRKLVEQLMGRDFSFRHNRYSHQKRDLGLHDPKICKSYLVGECPYDLFQGTKQSLGKCPQMHLTKHKIQY 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_entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 A n 1 3 A n 1 4 A n 1 5 A n 1 6 A n 1 7 A n 1 8 A n 1 9 A n 1 10 A n 1 11 G n 1 12 G n 1 13 U n 1 14 A n 1 15 U n 1 16 G n 1 17 U n 1 18 A n 1 19 U n 1 20 U n 1 21 A n 1 22 A n 2 1 A n 2 2 U n 2 3 A n 2 4 C n 2 5 U n 2 6 U n 2 7 A n 2 8 C n 2 9 C n 2 10 U n 2 11 U n 2 12 A n 2 13 A n 2 14 G n 2 15 A n 2 16 U n 2 17 A n 2 18 U n 2 19 C n 2 20 A n 2 21 G n 2 22 A n 2 23 G n 2 24 G n 2 25 A n 2 26 G n 2 27 A n 2 28 U n 2 29 C n 2 30 A n 2 31 A n 2 32 G n 2 33 A n 2 34 A n 2 35 G n 2 36 U n 2 37 C n 2 38 C n 2 39 U n 2 40 A n 2 41 C n 2 42 U n 2 43 G n 2 44 A n 2 45 U n 2 46 C n 2 47 A n 2 48 A n 2 49 A n 2 50 C n 2 51 A n 2 52 U n 2 53 G n 2 54 C n 2 55 G n 2 56 C n 2 57 U n 2 58 U n 2 59 C n 2 60 C n 2 61 A n 2 62 A n 2 63 U n 2 64 A n 2 65 G n 2 66 U n 2 67 A n 2 68 G n 2 69 A n 2 70 A n 2 71 G n 2 72 G n 2 73 A n 2 74 C n 2 75 G n 2 76 U n 2 77 U n 2 78 A n 2 79 A n 2 80 G n 2 81 C n 2 82 A n 2 83 U n 2 84 U n 2 85 U n 2 86 A n 2 87 U n 2 88 C n 2 89 A n 2 90 U n 2 91 U n 2 92 G n 2 93 A n 2 94 A n 2 95 C n 2 96 U n 2 97 A n 2 98 U n 2 99 A n 2 100 A n 2 101 U n 2 102 U n 2 103 G n 2 104 U n 2 105 U n 2 106 C n 2 107 A n 2 108 U n 2 109 U n 2 110 G n 2 111 A n 2 112 A n 2 113 G n 2 114 U n 2 115 C n 2 116 A n 2 117 U n 2 118 U n 2 119 G n 2 120 A n 2 121 U n 2 122 G n 2 123 C n 2 124 A n 2 125 A n 2 126 A n 2 127 C n 2 128 U n 2 129 C n 2 130 C n 2 131 U n 2 132 U n 2 133 G n 2 134 G n 2 135 U n 2 136 C n 2 137 A n 2 138 C n 2 139 A n 2 140 C n 2 141 A n 2 142 C n 2 143 A n 2 144 C n 2 145 A n 2 146 U n 2 147 A n 2 148 C n 2 149 G n 2 150 G n 2 151 C n 2 152 G n 2 153 C n 2 154 G n 2 155 G n 2 156 A n 2 157 A n 2 158 G n 2 159 G n 2 160 C n 2 161 G n 2 162 U n 2 163 G n 2 164 U n 2 165 U n 2 166 U n 2 167 G n 2 168 C n 2 169 U n 2 170 G n 2 171 A n 2 172 C n 2 173 G n 2 174 U n 2 175 U n 2 176 U n 2 177 C n 2 178 C n 2 179 A n 2 180 U n 2 181 U n 2 182 C n 2 183 C n 2 184 C n 2 185 U n 2 186 U n 2 187 G n 2 188 U n 2 189 U n 2 190 U n 2 191 C n 2 192 A n 2 193 A n 2 194 U n 2 195 C n 2 196 A n 2 197 U n 2 198 U n 2 199 G n 2 200 G n 2 201 U n 2 202 U n 2 203 A n 2 204 A n 2 205 U n 2 206 C n 2 207 C n 2 208 C n 2 209 U n 2 210 U n 2 211 G n 2 212 A n 2 213 U n 2 214 U n 2 215 C n 2 216 C n 2 217 U n 2 218 U n 2 219 U n 2 220 G n 2 221 G n 2 222 G n 2 223 G n 2 224 A n 2 225 U n 2 226 U n 2 227 U n 2 228 U n 2 229 U n 2 230 G n 2 231 G n 2 232 G n 2 233 U n 2 234 U n 2 235 A n 2 236 A n 2 237 A n 2 238 C n 2 239 U n 2 240 G n 2 241 A n 2 242 U n 2 243 U n 2 244 U n 2 245 U n 2 246 U n 2 247 G n 2 248 G n 2 249 G n 2 250 G n 2 251 C n 2 252 C n 2 253 C n 2 254 U n 2 255 U n 2 256 U n 2 257 G n 2 258 U n 2 259 U n 2 260 U n 2 261 C n 2 262 U n 2 263 U n 2 264 C n 2 265 U n 2 266 G n 2 267 C n 2 268 C n 2 269 U n 2 270 G n 2 271 G n 2 272 A n 2 273 G n 2 274 A n 2 275 A n 2 276 G n 2 277 U n 2 278 U n 2 279 U n 2 280 G n 2 281 A n 2 282 C n 2 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.300 _refine_ls_shell.d_res_low 3.386 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 38897 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.477 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # _struct.entry_id 5ZWN _struct.title 'Cryo-EM structure of the yeast pre-B complex at an average resolution of 3.3 angstrom (Part II: U1 snRNP region)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 5ZWN _struct_keywords.text 'spliceosme, assemply, pre-B complex, U1 snRNP, Splicing' _struct_keywords.pdbx_keywords SPLICING # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 21 ? W N N 21 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 5ZWN 5ZWN ? 1 ? 1 2 PDB 5ZWN 5ZWN ? 2 ? 1 3 UNP RU17_YEAST Q00916 ? 3 ;MNYNLSKYPDDVSRLFKPRPPLSYKRPTDYPYAKRQTNPNITGVANLLSTSLKHYMEEFPEGSPNNHLQRYEDIKLSKIK NAQLLDRRLQNWNPNVDPHIKDTDPYRTIFIGRLPYDLDEIELQKYFVKFGEIEKIRIVKDKITQKSKGYAFIVFKDPIS SKMAFKEIGVHRGIQIKDRICIVDIERGRTVKYFKPRRLGGGLGGRGYSNRDSRLPGRFASASTSNPAERNYAPRLPRRE TSSSAYSADRYGSSTLDARYRGNRPLLSAATPTAAVTSVYKSRNSRTRESQPAPKEAPDY ; 1 4 UNP RU1C_YEAST Q05900 ? 4 ;MTRYYCEYCHSYLTHDTLSVRKSHLVGKNHLRITADYYRNKARDIINKHNHKRRHIGKRGRKERENSSQNETLKVTCLSN KEKRHIMHVKKMNQKELAQTSIDTLKLLYDGSPGYSKVFVDANRFDIGDLVKASKLPQRANEKSAHHSFKQTSRSRDETC ESNPFPRLNNPKKLEPPKILSQWSNTIPKTSIFYSVDILQTTIKESKKRMHSDGIRKPSSANGYKRRRYGN ; 1 5 UNP RU1A_YEAST P32605 ? 5 ;MSALYFQNLPSRPANKENYTRLLLKHINPNNKYAINPSLPLPHNKLQISSQPLMLLDDQMGLLEVSISRSSKMTNQAFLT FVTQEEADRFLEKYTTTALKVQGRKVRMGKARTNSLLGLSIEMQKKKGNDETYNLDIKKVLKARKLKRKLRSDDICAKKF RLKRQIRRLKHKLRSRKVEEAEIDRIVKEFETRRLENMKSQQENLKQSQKPLKRAKVSNTMENPPNKVLLIQNLPSGTTE QLLSQILGNEALVEIRLVSVRNLAFVEYETVADATKIKNQLGSTYKLQNNDVTIGFAK ; 1 6 UNP PRP42_YEAST Q03776 ? 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8 ;MSYKQTTYYPSRGNLVRNDSSPYTNTISSETNNSSTSVLSLQGASNVSLGTTGNQLYMGDLDPTWDKNTVRQIWASLGEA NINVRMMWNNTLNNGSRSSMGPKNNQGYCFVDFPSSTHAANALLKNGMLIPNFPNKKLKLNWATSSYSNSNNSLNNVKSG NNCSIFVGDLAPNVTESQLFELFINRYASTSHAKIVHDQVTGMSKGYGFVKFTNSDEQQLALSEMQGVFLNGRAIKVGPT SGQQQHVSGNNDYNRSSSSLNNENVDSRFLSKGQSFLSNGNNNMGFKRNHMSQFIYPVQQQPSLNHFTDPNNTTVFIGGL SSLVTEDELRAYFQPFGTIVYVKIPVGKCCGFVQYVDRLSAEAAIAGMQGFPIANSRVRLSWGRSAKQTALLQQAMLSNS LQVQQQQPGLQQPNYGYIPSSTCEAPVLPDNNVSSTMLPGCQILNYSNPYANANGLGSNNFSFYSNNNATNTQATSLLAD TSSMDLSGTGGQQVIMQGSEAVVNSTNAMLNRLEQGSNGFMFA ; 1 9 UNP SNU56_YEAST Q03782 ? 9 ;MRPRRRGLAYHHTKPKGQLSQGHYPTTSNDGQRRKVGNSEAFQSFDIWKNLDRIRSTKKNAGQFIKGSLLILPMRTEDKQ QFDECMDELHKYISKDILRCYPQKEQKDEGMLFYIVLKDFNILDSCFVLSVLLAFQKRLWMAPSEKSYFRVPKNINLTGS FYLPKNIETGRGHIITSYRREQPSSSIVEVGFNVVPDFQQFQVKACHVSKFMNELSNFFSQVEFGKCEANVINYFKREYN RTYSQISLALYELPLIGDGLFDIKSYISKTRPIIETSKAQMIKHISEMKAYNEISGLQGDQFPRQQRPLSNSPSSNSISS SQTIEAGATSYQTQPQRHAVNKPSNVLNSSNRHSGPKTFEDGRYSEGNKPGFMTQDEIKQHCIGTIKASMDAVKKKSSYQ ILKTYVRCPRQNYIDIVYQNLNDLRSKTNCNIVVLNLNNLHESQMWLESLNTTNYTIFAQAPHPSTIRVISIGGVGEYIV KALELILNILEH ; 1 10 UNP RSMB_YEAST P40018 ? 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P23394 1 ? 588 ? 1 588 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details eicosameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 20 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO C 9 ? 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