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EFCDEPSVGVKTMKTFVIHIQEKNFQTGIFVYQNNITPSAMKLVPSIPPATIETFNEAALVVNITHHELVPKHIRLSSDE KRELLKRYRLKESQLPRIQRADPVALYLGLKRGEVVKIIRKSETSGRYASYRICM ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSDYEEAFNDGNENFEDFDVEHFSDEETYEEKPQFKDGETTDANGKTIVTGGNGPEDFQQHEQIRRKTLKEKAIPKDQRA TTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVFVDLEGETDPLRIAMKELAEKKIPLVIRRYLPDGSFEDWSVEELIVDL ; ;MSDYEEAFNDGNENFEDFDVEHFSDEETYEEKPQFKDGETTDANGKTIVTGGNGPEDFQQHEQIRRKTLKEKAIPKDQRA TTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVFVDLEGETDPLRIAMKELAEKKIPLVIRRYLPDGSFEDWSVEELIVDL ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MFFIKDLSLNITLHPSFFGPRMKQYLKTKLLEEVEGSCTGKFGYILCVLDYDNIDIQRGRILPTDGSAEFNVKYRAVVFK PFKGEVVDGTVVSCSQHGFEVQVGPMKVFVTKHLMPQDLTFNAGSNPPSYQSSEDVITIKSRIRVKIEGCISQVSSIHAI GSIKEDYLGAI ; ;MFFIKDLSLNITLHPSFFGPRMKQYLKTKLLEEVEGSCTGKFGYILCVLDYDNIDIQRGRILPTDGSAEFNVKYRAVVFK PFKGEVVDGTVVSCSQHGFEVQVGPMKVFVTKHLMPQDLTFNAGSNPPSYQSSEDVITIKSRIRVKIEGCISQVSSIHAI GSIKEDYLGAI ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSNTLFDDIFQVSEVDPGRYNKVCRIEAASTTQDQCKLTLDINVELFPVAAQDSLTVTIASSLNLEDTPANDSSATRSWR PPQAGDRSLADDYDYVMYGTAYKFEEVSKDLIAVYYSFGGLLMRLEGNYRNLNNLKQENAYLLIRR ; ;MSNTLFDDIFQVSEVDPGRYNKVCRIEAASTTQDQCKLTLDINVELFPVAAQDSLTVTIASSLNLEDTPANDSSATRSWR PPQAGDRSLADDYDYVMYGTAYKFEEVSKDLIAVYYSFGGLLMRLEGNYRNLNNLKQENAYLLIRR ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MTTFRFCRDCNNMLYPREDKENNRLLFECRTCSYVEEAGSPLVYRHELITNIGETAGVVQDIGSDPTLPRSDRECPKCHS RENVFFQSQQRRKDTSMVLFFVCLSCSHIFTSDQKNKRTQFS ; ;MTTFRFCRDCNNMLYPREDKENNRLLFECRTCSYVEEAGSPLVYRHELITNIGETAGVVQDIGSDPTLPRSDRECPKCHS RENVFFQSQQRRKDTSMVLFFVCLSCSHIFTSDQKNKRTQFS ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no MIVPVRCFSCGKVVGDKWESYLNLLQEDELDEGTALSRLGLKRYCCRRMILTHVDLIEKFLRYNPLEKRD MIVPVRCFSCGKVVGDKWESYLNLLQEDELDEGTALSRLGLKRYCCRRMILTHVDLIEKFLRYNPLEKRD J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MNAPDRFELFLLGEGESKLKIDPDTKAPNAVVITFEKEDHTLGNLIRAELLNDRKVLFAAYKVEHPFFARFKLRIQTTEG YDPKDALKNACNSIINKLGALKTNFETEWNLQTLAADDAF ; ;MNAPDRFELFLLGEGESKLKIDPDTKAPNAVVITFEKEDHTLGNLIRAELLNDRKVLFAAYKVEHPFFARFKLRIQTTEG YDPKDALKNACNSIINKLGALKTNFETEWNLQTLAADDAF ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no MSREGFQIPTNLDAAAAGTSQARTATLKYICAECSSKLSLSRTDAVRCKDCGHRILLKARTKRLVQFEAR MSREGFQIPTNLDAAAAGTSQARTATLKYICAECSSKLSLSRTDAVRCKDCGHRILLKARTKRLVQFEAR L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MMTRESIDKRAGRRGPNLNIVLTCPECKVYPPKIVERFSEGDVVCALCGLVLSDKLVDTRSEWRTFSNDDHNGDDPSRVG EASNPLLDGNNLSTRIGKGETTDMRFTKELNKAQGKNVMDKKDNEVQAAFAKITMLCDAAELPKIVKDCAKEAYKLCHDE KTLKGKSMESIMAASILIGCRRAEVARTFKEIQSLIHVKTKEFGKTLNIMKNILRGKSEDGFLKIDTDNMSGAQNLTYIP RFCSHLGLPMQVTTSAEYTAKKCKEIKEIAGKSPITIAVVSIYLNILLFQIPITAAKVGQTLQVTEGTIKSGYKILYEHR DKLVDPQLIANGVVSLDNLPGVEKK ; ;MMTRESIDKRAGRRGPNLNIVLTCPECKVYPPKIVERFSEGDVVCALCGLVLSDKLVDTRSEWRTFSNDDHNGDDPSRVG EASNPLLDGNNLSTRIGKGETTDMRFTKELNKAQGKNVMDKKDNEVQAAFAKITMLCDAAELPKIVKDCAKEAYKLCHDE KTLKGKSMESIMAASILIGCRRAEVARTFKEIQSLIHVKTKEFGKTLNIMKNILRGKSEDGFLKIDTDNMSGAQNLTYIP RFCSHLGLPMQVTTSAEYTAKKCKEIKEIAGKSPITIAVVSIYLNILLFQIPITAAKVGQTLQVTEGTIKSGYKILYEHR DKLVDPQLIANGVVSLDNLPGVEKK ; M ? 14 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT) (DA)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DT)(DC) (DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT) ; AACAGTAGCACGCTGTGTATATAATAGCTATGGAACGTTCGATTCACCTCCGATGT N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRL DLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNI VGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM ; ;MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRL DLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNI VGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MSRRNPPGSRNGGGPTNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQNGSNSSSPGVPNGDNSRGSLVKKDDPEYAEEREKMLLQIGVE ADAGRSNVKVKDEDPNEYNEFPLRAIPKEDLENMRTHLLKFQSKKKINPVTDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQ KEISEYKKKAEQERSTPNSGGMNKSGTVSLNNTVKDGSQTPTVDSVTKDNTANGVNSSIPTVTGSSVPPASPTTVSAVES 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IIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEEAPSENEEDELFGEKKIDEDGERIKKALQKTELAALYSSDENEINPYLS ESDIENKENESPVKKEEDSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEPTLRVKSIKNCVIILKGDKKILKSFPEGEWNPQTT KAVDSSNNASNTVPSPIKQEEGLNSTVAEREETPAPTITEKDIIEAIGDGKVNIKEFGKFIRRKYPGAENKKLMFAIVKK LCRKVGNDHMELKKE ; Q ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MSSGSAGAPALSNNSTNSVAKEKSGNISGDEYLSQEEEVFDGNDIENNETKVYEESLDLDLERSNRQVWLVRLPMFLAEK WRDRNNLHGQELGKIRINKDGSKITLLLNENDNDSIPHEYDLELTKKVVENEYVFTEQNLKKYQQRKKELEADPEKQRQA YLKKQEREEELKKKQQQQKRRNNRKKFNHRVMTDRDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVCHECQVMPSMNDPNYHKIVEQR RNIVKLNNKERITTLDETVGVTMSHTGMSMRSDNSNFLKVGREKAKSNIKSIRMPKKEILDYLFKLFDEYDYWSLKGLKE RTRQPEAHLKECLDKVATLVKKGPYAFKYTLRPEYKKLKEEERKATLGELADEQTGSAGDNAQGDAEADLEDEIEMEDVV ; ;MSSGSAGAPALSNNSTNSVAKEKSGNISGDEYLSQEEEVFDGNDIENNETKVYEESLDLDLERSNRQVWLVRLPMFLAEK WRDRNNLHGQELGKIRINKDGSKITLLLNENDNDSIPHEYDLELTKKVVENEYVFTEQNLKKYQQRKKELEADPEKQRQA YLKKQEREEELKKKQQQQKRRNNRKKFNHRVMTDRDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVCHECQVMPSMNDPNYHKIVEQR RNIVKLNNKERITTLDETVGVTMSHTGMSMRSDNSNFLKVGREKAKSNIKSIRMPKKEILDYLFKLFDEYDYWSLKGLKE RTRQPEAHLKECLDKVATLVKKGPYAFKYTLRPEYKKLKEEERKATLGELADEQTGSAGDNAQGDAEADLEDEIEMEDVV ; R ? 18 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DC) (DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DA)(DT) (DC)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA) (DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DG) ; ;TGATATTTTTATGTATGTACAACACACATCGGAGGTGAATCGAACGTTCCATAGCTATTATATACACAGCGTGCTACTGT TCTCG ; T ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MSNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNEGNINGVQNDLNFNLATPG VNSSEFNIKEENTGNEGLILPNINSNNNIPHSGETNINTNTVEATNNSGATLNTNTSGNTNADVTSQPKIEVKPEIELTI NNANITTVENIDDESEKKDDEEKEEDVEKTRKEKEQIEQVKLQAKKEKRSALLDTDEVGSELDDSDDDYLISEGEEDGPD ENLMLCLYDKVTRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV ; ;MSNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNEGNINGVQNDLNFNLATPG VNSSEFNIKEENTGNEGLILPNINSNNNIPHSGETNINTNTVEATNNSGATLNTNTSGNTNADVTSQPKIEVKPEIELTI NNANITTVENIDDESEKKDDEEKEEDVEKTRKEKEQIEQVKLQAKKEKRSALLDTDEVGSELDDSDDDYLISEGEEDGPD ENLMLCLYDKVTRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV ; U ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MAVPGYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIV KNCQVTVEDSHRDASQNGSGDSQSVISVDKLRIVACNSKKSE ; ;MAVPGYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIV KNCQVTVEDSHRDASQNGSGDSQSVISVDKLRIVACNSKKSE ; V ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MDRPIDDIVKNLLKFVVRGFYGGSFVLVLDAILFHSVLAEDDLKQLLSINKTELGPLIARLRSDRLISIHKQREYPPNSK SVERVYYYVKYPHAIDAIKWKVHQVVQRLKDDLDKNSEPNGYMCPICLTKYTQLEAVQLLNFDRTEFLCSLCDEPLVEDD SGKKNKEKQDKLNRLMDQIQPIIDSLKKIDDSRIEENTFEIALARLIPPQNQSHAAYTYNPKKGSTMFRPGDSAPLPNLM GTALGNDSSRRAGANSQATLHINITTASDEVAQRELQERQAEEKRKQNAVPEWHKQSTIGKTALGRLDNEEEFDPVVTAS AMDSINPDNEPAQETSYQNNRTLTEQEMEERENEKTLNDYYAALAKKQAKLNKEEEEEEEEEEDEEEEEEEEMEDVMDDN DETARENALEDEFEDVTDTAGTAKTESNTSNDVKQESINDKTEDAVNATATASGPSANAKPNDGDDDDDDDDDEMDIEFE DV ; ;MDRPIDDIVKNLLKFVVRGFYGGSFVLVLDAILFHSVLAEDDLKQLLSINKTELGPLIARLRSDRLISIHKQREYPPNSK SVERVYYYVKYPHAIDAIKWKVHQVVQRLKDDLDKNSEPNGYMCPICLTKYTQLEAVQLLNFDRTEFLCSLCDEPLVEDD SGKKNKEKQDKLNRLMDQIQPIIDSLKKIDDSRIEENTFEIALARLIPPQNQSHAAYTYNPKKGSTMFRPGDSAPLPNLM GTALGNDSSRRAGANSQATLHINITTASDEVAQRELQERQAEEKRKQNAVPEWHKQSTIGKTALGRLDNEEEFDPVVTAS AMDSINPDNEPAQETSYQNNRTLTEQEMEERENEKTLNDYYAALAKKQAKLNKEEEEEEEEEEDEEEEEEEEMEDVMDDN DETARENALEDEFEDVTDTAGTAKTESNTSNDVKQESINDKTEDAVNATATASGPSANAKPNDGDDDDDDDDDEMDIEFE DV ; W ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MSKNRDPLLANLNAFKSKVKSAPVIAPAKVGQKKTNDTVITIDGNTRKRTASERAQENTLNSAKNPVLVDIKKEAGSNSS NAISLDDDDDDEDFGSSPSKKVRPGSIAAAALQANQTDISKSHDSSKLLWATEYIQKKGKPVLVNELLDYLSMKKDDKVI ELLKKLDRIEFDPKKGTFKYLSTYDVHSPSELLKLLRSQVTFKGISCKDLKDGWPQCDETINQLEEDSKILVLRTKKDKT 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1 32 VAL n 1 33 ALA n 1 34 LYS n 1 35 ILE n 1 36 ARG n 1 37 PHE n 1 38 PRO n 1 39 GLU n 1 40 THR n 1 41 MET n 1 42 ASP n 1 43 GLU n 1 44 THR n 1 45 GLN n 1 46 THR n 1 47 ARG n 1 48 ALA n 1 49 LYS n 1 50 ILE n 1 51 GLY n 1 52 GLY n 1 53 LEU n 1 54 ASN n 1 55 ASP n 1 56 PRO n 1 57 ARG n 1 58 LEU n 1 59 GLY n 1 60 SER n 1 61 ILE n 1 62 ASP n 1 63 ARG n 1 64 ASN n 1 65 LEU n 1 66 LYS n 1 67 CYS n 1 68 GLN n 1 69 THR n 1 70 CYS n 1 71 GLN n 1 72 GLU n 1 73 GLY n 1 74 MET n 1 75 ASN n 1 76 GLU n 1 77 CYS n 1 78 PRO n 1 79 GLY n 1 80 HIS n 1 81 PHE n 1 82 GLY n 1 83 HIS n 1 84 ILE n 1 85 ASP n 1 86 LEU n 1 87 ALA n 1 88 LYS n 1 89 PRO n 1 90 VAL n 1 91 PHE n 1 92 HIS n 1 93 VAL n 1 94 GLY n 1 95 PHE n 1 96 ILE n 1 97 ALA n 1 98 LYS n 1 99 ILE n 1 100 LYS n 1 101 LYS n 1 102 VAL n 1 103 CYS n 1 104 GLU n 1 105 CYS n 1 106 VAL n 1 107 CYS n 1 108 MET n 1 109 HIS n 1 110 CYS n 1 111 GLY n 1 112 LYS n 1 113 LEU n 1 114 LEU n 1 115 LEU n 1 116 ASP n 1 117 GLU n 1 118 HIS n 1 119 ASN n 1 120 GLU n 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M ZN 1327 ? 1_555 SG ? M CYS 48 ? M CYS 48 ? 1_555 126.0 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 447 A . ? GLN 447 A PRO 448 A ? PRO 448 A 1 2.48 2 LYS 567 A . ? LYS 567 A PRO 568 A ? PRO 568 A 1 11.94 3 PRO 128 E . ? PRO 128 E PRO 129 E ? PRO 129 E 1 -3.28 4 ASN 126 G . ? ASN 126 G PRO 127 G ? PRO 127 G 1 -1.20 5 GLU 108 O . ? GLU 108 O PRO 109 O ? PRO 109 O 1 -0.66 6 LYS 199 O . ? LYS 199 O PRO 200 O ? PRO 200 O 1 -1.28 7 LEU 135 P . ? LEU 135 Q PRO 136 P ? PRO 136 Q 1 -4.67 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 3 ? AB ? 2 ? AC ? 3 ? AD ? 2 ? AE ? 2 ? AF ? 5 ? AG ? 5 ? AH ? 2 ? AI ? 2 ? AJ ? 4 ? AK ? 2 ? AL ? 2 ? AM ? 10 ? AN ? 3 ? AO ? 2 ? AP ? 2 ? AQ ? 3 ? AR ? 2 ? AS ? 4 ? AT ? 5 ? AU ? 2 ? AV ? 3 ? BA ? 2 ? BB ? 2 ? BC ? 2 ? QA ? 4 ? QB ? 5 ? BD ? 3 ? BE ? 2 ? BF ? 5 ? BG ? 2 ? BH ? 2 ? BI ? 2 ? BJ ? 2 ? BK ? 4 ? BL ? 4 ? BM ? 5 ? BN ? 6 ? BO ? 5 ? BP ? 2 ? BQ ? 4 ? BR ? 7 ? BS ? 2 ? BT ? 4 ? BU ? 2 ? BV ? 2 ? BW ? 2 ? BX ? 2 ? CA ? 4 ? CB ? 5 ? CC ? 2 ? DA ? 2 ? DB ? 4 ? DC ? 5 ? GA ? 2 ? EA ? 4 ? EB ? 2 ? EC ? 4 ? GB ? 6 ? GC ? 3 ? IA ? 3 ? IB ? 4 ? KA ? 4 ? MA ? 3 ? OA ? 10 ? QC ? 5 ? 156 ? 1 ? 157 ? 1 ? 158 ? 1 ? 159 ? 1 ? QC1 ? 3 ? 150 ? 1 ? 151 ? 1 ? 144 ? 1 ? 145 ? 1 ? 147 ? 1 ? 148 ? 1 ? RA ? 2 ? UA ? 7 ? WA ? 2 ? WB ? 2 ? XA ? 2 ? XB ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AF 4 5 ? parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? anti-parallel AG 4 5 ? anti-parallel AH 1 2 ? parallel AI 1 2 ? parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AM 4 5 ? anti-parallel AM 5 6 ? anti-parallel AM 6 7 ? anti-parallel AM 7 8 ? anti-parallel AM 8 9 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AV 2 3 ? anti-parallel BA 1 2 ? parallel BB 1 2 ? parallel BC 1 2 ? anti-parallel QA 1 2 ? anti-parallel QA 2 3 ? anti-parallel QA 3 4 ? parallel QB 1 2 ? anti-parallel QB 2 3 ? anti-parallel QB 3 4 ? anti-parallel QB 4 5 ? parallel BD 1 2 ? anti-parallel BD 2 3 ? anti-parallel BE 1 2 ? anti-parallel BF 1 2 ? anti-parallel BF 2 3 ? anti-parallel BF 3 4 ? anti-parallel BF 4 5 ? anti-parallel BG 1 2 ? anti-parallel BH 1 2 ? parallel BI 1 2 ? anti-parallel BJ 1 2 ? anti-parallel BK 1 2 ? parallel BK 2 3 ? anti-parallel BK 3 4 ? anti-parallel BL 1 2 ? parallel BL 2 3 ? anti-parallel BL 3 4 ? anti-parallel BM 1 2 ? anti-parallel BM 2 3 ? anti-parallel BM 3 4 ? parallel BM 4 5 ? anti-parallel BN 1 2 ? anti-parallel BN 2 3 ? anti-parallel BN 3 4 ? anti-parallel BN 4 5 ? anti-parallel BN 5 6 ? anti-parallel BO 1 2 ? anti-parallel BO 2 3 ? anti-parallel BO 3 4 ? anti-parallel BO 4 5 ? anti-parallel BP 1 2 ? parallel BQ 1 2 ? anti-parallel BQ 2 3 ? anti-parallel BQ 3 4 ? anti-parallel BR 1 2 ? anti-parallel BR 2 3 ? anti-parallel BR 3 4 ? anti-parallel BR 4 5 ? parallel BR 5 6 ? anti-parallel BR 6 7 ? parallel BS 1 2 ? anti-parallel BT 1 2 ? anti-parallel BT 2 3 ? anti-parallel BT 3 4 ? parallel BU 1 2 ? anti-parallel BV 1 2 ? anti-parallel BW 1 2 ? anti-parallel BX 1 2 ? anti-parallel CA 1 2 ? anti-parallel CA 2 3 ? anti-parallel CA 3 4 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CB 2 3 ? anti-parallel CB 3 4 ? anti-parallel CB 4 5 ? anti-parallel CC 1 2 ? anti-parallel DA 1 2 ? anti-parallel DB 1 2 ? anti-parallel DB 2 3 ? anti-parallel DB 3 4 ? anti-parallel DC 1 2 ? anti-parallel DC 2 3 ? anti-parallel DC 3 4 ? anti-parallel DC 4 5 ? anti-parallel GA 1 2 ? anti-parallel EA 1 2 ? anti-parallel EA 2 3 ? parallel EA 3 4 ? parallel EB 1 2 ? parallel EC 1 2 ? anti-parallel EC 2 3 ? anti-parallel EC 3 4 ? parallel GB 1 2 ? anti-parallel GB 2 3 ? anti-parallel GB 3 4 ? parallel GB 4 5 ? anti-parallel GC 1 2 ? anti-parallel GC 2 3 ? anti-parallel IA 1 2 ? anti-parallel IA 2 3 ? anti-parallel IB 1 2 ? anti-parallel IB 2 3 ? anti-parallel IB 3 4 ? anti-parallel KA 1 2 ? anti-parallel KA 2 3 ? anti-parallel KA 3 4 ? anti-parallel MA 1 2 ? anti-parallel MA 2 3 ? anti-parallel OA 1 2 ? anti-parallel OA 2 3 ? anti-parallel OA 3 4 ? anti-parallel OA 4 5 ? anti-parallel OA 5 6 ? anti-parallel OA 6 7 ? anti-parallel OA 7 8 ? anti-parallel OA 8 9 ? anti-parallel OA 9 10 ? anti-parallel QC 1 2 ? anti-parallel QC 2 3 ? anti-parallel QC 3 4 ? anti-parallel QC 4 5 ? parallel QC1 1 2 ? anti-parallel RA 1 2 ? anti-parallel UA 1 2 ? parallel UA 2 3 ? anti-parallel UA 3 4 ? anti-parallel UA 4 5 ? parallel UA 5 6 ? anti-parallel UA 6 7 ? anti-parallel WA 1 2 ? anti-parallel WB 1 2 ? anti-parallel XA 1 2 ? anti-parallel XB 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 LEU A 1418 ? 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? 60.73 79.41 116 1 THR H 76 ? ? 65.82 -9.97 117 1 GLN H 83 ? ? -75.65 -75.37 118 1 ALA H 84 ? ? 175.82 158.27 119 1 LEU H 89 ? ? 55.42 -144.65 120 1 ALA H 90 ? ? 57.92 -11.34 121 1 VAL H 107 ? ? -93.44 -64.09 122 1 LYS H 109 ? ? 53.33 -123.15 123 1 ASN H 131 ? ? -55.76 2.37 124 1 LEU H 132 ? ? 174.11 -8.97 125 1 GLN H 137 ? ? 57.96 -12.56 126 1 ASP I 9 ? ? 70.02 -18.31 127 1 ASN I 11 ? ? 67.05 -4.52 128 1 VAL I 43 ? ? -128.68 -60.51 129 1 GLU I 47 ? ? 54.24 73.56 130 1 LYS I 77 ? ? -87.73 -72.16 131 1 SER I 105 ? ? -104.16 -68.25 132 1 SER I 107 ? ? 68.57 -0.50 133 1 ILE J 2 ? ? 47.90 73.23 134 1 VAL J 3 ? ? 53.09 83.36 135 1 ARG J 6 ? ? 56.38 -146.33 136 1 SER J 9 ? ? -124.78 -75.64 137 1 GLU J 29 ? ? 64.13 -2.11 138 1 MET J 49 ? ? -51.70 -70.89 139 1 PHE K 10 ? ? -128.88 -53.57 140 1 HIS K 65 ? ? -174.06 137.73 141 1 GLU L 33 ? ? -91.97 -66.11 142 1 LEU L 38 ? ? -109.91 -62.34 143 1 ALA L 45 ? ? 54.91 -146.53 144 1 ASP L 50 ? ? 89.97 -12.59 145 1 ALA L 59 ? ? 60.58 87.03 146 1 ASN M 17 ? ? 60.20 -120.58 147 1 LEU M 18 ? ? 70.55 -6.19 148 1 LYS M 28 ? ? 63.70 -5.91 149 1 PRO M 31 ? ? -57.89 -175.15 150 1 LEU M 47 ? ? -100.07 -76.66 151 1 HIS M 158 ? ? 57.90 -117.50 152 1 LYS M 166 ? ? 89.25 -2.52 153 1 MET M 168 ? ? 88.59 -10.79 154 1 GLU M 184 ? ? 69.18 -11.28 155 1 THR M 200 ? ? 79.55 -92.16 156 1 LYS M 267 ? ? 61.45 -132.30 157 1 GLU M 268 ? ? 59.15 86.07 158 1 ILE M 269 ? ? 92.20 -6.57 159 1 ALA M 270 ? ? 61.79 -4.03 160 1 SER M 273 ? ? 77.07 149.66 161 1 THR M 294 ? ? 57.68 -136.96 162 1 ALA M 295 ? ? -128.56 -61.47 163 1 TYR O 94 ? ? -162.49 106.41 164 1 ARG Q 26 ? ? -68.55 23.70 165 1 LYS Q 124 ? ? 77.22 -13.82 166 1 ILE Q 127 ? ? -60.45 -73.07 167 1 ASN Q 128 ? ? 35.01 56.99 168 1 HIS Q 134 ? ? 67.82 -136.31 169 1 GLN Q 331 ? ? -123.54 -163.42 170 1 ALA Q 367 ? ? 73.84 -21.34 171 1 ASP Q 371 ? ? 42.21 -129.30 172 1 ASP Q 390 ? ? -73.81 -72.70 173 1 ILE Q 406 ? ? 50.47 -134.12 174 1 ARG R 63 ? ? -137.62 -65.24 175 1 SER R 64 ? ? 75.70 -16.31 176 1 VAL R 215 ? ? -98.87 -72.27 177 1 GLU R 257 ? ? -68.81 -179.29 178 1 VAL R 259 ? ? 76.66 -19.43 179 1 MET R 270 ? ? 59.62 19.94 180 1 ASP R 273 ? ? 58.44 -133.82 181 1 ASN R 274 ? ? 75.55 -6.56 182 1 VAL R 336 ? ? -87.32 -72.76 183 1 ILE U 30 ? ? -80.23 -81.73 184 1 ASP U 31 ? ? 172.19 128.04 185 1 ASN U 242 ? ? 64.70 61.97 186 1 CYS U 246 ? ? -166.96 -166.09 187 1 LYS U 255 ? ? 62.35 -131.53 188 1 ASP U 264 ? ? 29.28 79.69 189 1 TYR V 6 ? ? 61.57 115.31 190 1 ARG V 31 ? ? -153.34 24.97 191 1 GLU V 33 ? ? -41.61 108.51 192 1 SER V 35 ? ? 74.51 -41.28 193 1 GLN V 57 ? ? -132.22 -36.85 194 1 CYS V 72 ? ? -170.79 141.06 195 1 PHE W 20 ? ? -74.22 -72.93 196 1 GLU W 40 ? ? 55.35 -27.24 197 1 SER W 79 ? ? 56.13 -128.69 198 1 SER W 81 ? ? 63.71 -142.40 199 1 GLU W 146 ? ? 176.48 163.27 200 1 LYS X 175 ? ? 46.78 -143.66 201 1 LYS X 229 ? ? -121.69 -63.33 202 1 LEU X 231 ? ? -24.23 141.72 203 1 LYS X 237 ? ? -129.27 -51.85 204 1 GLU X 264 ? ? -129.95 -66.83 205 1 ASN X 265 ? ? 55.13 -138.31 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 LEU B 1175 ? ? ASN B 1176 ? ? 123.50 2 1 ASN H 131 ? ? LEU H 132 ? ? -121.73 3 1 ILE J 2 ? ? VAL J 3 ? ? 149.74 4 1 PRO M 292 ? ? ILE M 293 ? ? 145.10 # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DA T 43 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 2 1 DC T 45 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' # _pdbx_validate_main_chain_plane.id 1 _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id ASN _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id H _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id 131 _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id ? _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle -13.82 # _pdbx_validate_polymer_linkage.id 1 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_1 C _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_1 H _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_1 ASN _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_1 131 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_2 N _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_2 H _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_2 LEU _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_2 132 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_polymer_linkage.dist 1.04 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AM" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 9-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 10-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "GB" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 5-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 6-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "QC" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 8-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 9-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "UA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 6-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 7-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _em_3d_reconstruction.entry_id 5FZ5 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 5690 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'RELION 1.3' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 8.8 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;THE MODEL FOR THE CLOSED COMPLEX WAS DERIVED FROM THE OPEN COMPLEX MODEL (5FYW). THREE RIGID-BODY GROUPS (1. POL II, TFIIA, TFIIB, TBP, TFIIE E-RIBBON AND TFIIF DIMERIZATION DOMAIN, 2. TFIIE DOMAINS TFA1 AND TFA2 WH, 3.TFIIE TFA2 WH1 AND TFIIF TFG2 WH) WERE INDIVIDUALLY FITTED INTO THE CLOSED COMPLEX EM DENSITY BY AN AUTOMATED CORRELATION SEARCH IN SITUS. TO MODEL CLOSED PROMOTER DNA, UPSTREAM DNA WAS EXTENDED WITH CANONICAL DUPLEX B-FORM DNA IN COOT AND RIGID-BODY FITTED IN UCSF CHIMERA TO REFLECT THE DENSITY. SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-3383. (DEPOSITION ID: 14367). ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'YEAST POL II TRANSCRIPTION INITIATION COMPLEX (CLOSED DNA)' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 5FZ5 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 959 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 5FZ5 _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2016-06-20 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 5000 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 37000 _em_imaging.calibrated_magnification 37037 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 5FZ5 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'LIQUID ETHANE' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 5FZ5 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 5FZ5 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? 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A SER 1091 33 1 Y 1 A LYS 1092 ? A LYS 1092 34 1 Y 1 A LEU 1176 ? A LEU 1176 35 1 Y 1 A LEU 1177 ? A LEU 1177 36 1 Y 1 A ASP 1178 ? A ASP 1178 37 1 Y 1 A GLU 1179 ? A GLU 1179 38 1 Y 1 A GLU 1180 ? A GLU 1180 39 1 Y 1 A ALA 1181 ? A ALA 1181 40 1 Y 1 A GLU 1182 ? A GLU 1182 41 1 Y 1 A GLN 1183 ? A GLN 1183 42 1 Y 1 A SER 1184 ? A SER 1184 43 1 Y 1 A PHE 1185 ? A PHE 1185 44 1 Y 1 A ASP 1186 ? A ASP 1186 45 1 Y 1 A ARG 1244 ? A ARG 1244 46 1 Y 1 A PRO 1245 ? A PRO 1245 47 1 Y 1 A LYS 1246 ? A LYS 1246 48 1 Y 1 A SER 1247 ? A SER 1247 49 1 Y 1 A LEU 1248 ? A LEU 1248 50 1 Y 1 A ASP 1249 ? A ASP 1249 51 1 Y 1 A ALA 1250 ? A ALA 1250 52 1 Y 1 A GLU 1251 ? A GLU 1251 53 1 Y 1 A THR 1252 ? A THR 1252 54 1 Y 1 A GLU 1253 ? A GLU 1253 55 1 Y 1 A TYR 1453 ? A TYR 1453 56 1 Y 1 A MET 1454 ? A MET 1454 57 1 Y 1 A PRO 1455 ? A PRO 1455 58 1 Y 1 A GLU 1456 ? A GLU 1456 59 1 Y 1 A GLN 1457 ? A GLN 1457 60 1 Y 1 A LYS 1458 ? A LYS 1458 61 1 Y 1 A ILE 1459 ? A ILE 1459 62 1 Y 1 A THR 1460 ? 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