data_5XTE # _entry.id 5XTE # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.318 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 5XTE WWPDB D_1300004149 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.db_id EMD-6774 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 5XTE _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2017-06-19 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Gu, J.' 1 ? 'Wu, M.' 2 ? 'Yang, M.' 3 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 170 _citation.language ? _citation.page_first 1247 _citation.page_last 1257.e12 _citation.title 'Architecture of Human Mitochondrial Respiratory Megacomplex I2III2IV2.' _citation.year 2017 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2017.07.050 _citation.pdbx_database_id_PubMed 28844695 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Guo, R.' 1 ? primary 'Zong, S.' 2 ? primary 'Wu, M.' 3 ? primary 'Gu, J.' 4 ? primary 'Yang, M.' 5 ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 5XTE _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5XTE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 8' 9791.181 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial' 5893.814 2 1.10.2.2 ? 'UNP RESIDUES 1-57' ? 3 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial' 21645.578 2 1.10.2.2 ? ? ? 4 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 9' 7189.299 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial' 8990.854 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 7' 13037.842 2 ? ? 'UNP RESIDUES 6-111' ? 7 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 10' 5958.912 2 ? ? 'UNP RESIDUES 2-52' ? 8 polymer nat 'Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial' 27388.395 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Cytochrome b' 42543.016 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial' 44946.582 2 ? ? 'UNP RESIDUES 35-453' ? 11 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial' 49181.430 2 ? ? ? ? 12 non-polymer syn CARDIOLIPIN 1464.043 9 ? ? ? ? 13 non-polymer syn 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' 175.820 2 ? ? ? ? 14 non-polymer syn 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine 749.073 6 ? ? ? ? 15 non-polymer syn 'HEME C' 618.503 2 ? ? ? ? 16 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' 616.487 4 ? ? ? ? 17 non-polymer syn ;(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL ; 767.132 3 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;Complex III subunit 8,Complex III subunit VIII,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 9.5 kDa protein,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein QP-C ; 2 ;Complex III subunit 5,Cytochrome b-c1 complex subunit 5,Rieske iron-sulfur protein,RISP,Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit ; 3 ;Complex III subunit 5,Cytochrome b-c1 complex subunit 5,Rieske iron-sulfur protein,RISP,Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit ; 4 ;Complex III subunit 9,Complex III subunit X,Cytochrome c1 non-heme 7 kDa protein,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2 kDa protein ; 5 ;Complex III subunit 6,Complex III subunit VIII,Cytochrome c1 non-heme 11 kDa protein,Mitochondrial hinge protein,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 11 kDa protein ; 6 'Complex III subunit 7,Complex III subunit VII,QP-C,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 14 kDa protein' 7 'Complex III subunit 10,Complex III subunit XI,Ubiquinol-cytochrome c reductase complex 6.4 kDa protein' 8 ;Complex III subunit 4,Complex III subunit IV,Cytochrome b-c1 complex subunit 4,Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex cytochrome c1 subunit,Cytochrome c-1 ; 9 ;Complex III subunit 3,Complex III subunit III,Cytochrome b-c1 complex subunit 3,Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex cytochrome b subunit ; 10 'Complex III subunit 2,Core protein II,Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 2' 11 'Complex III subunit 1,Core protein I,Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core protein 1' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;GREFGNLTRMRHVISYSLSPFEQRAYPHVFTKGIPNVLRRIRESFFRVVPQFVVFYLIYTWGTEEFERSKRKNPAAYEND K ; ;GREFGNLTRMRHVISYSLSPFEQRAYPHVFTKGIPNVLRRIRESFFRVVPQFVVFYLIYTWGTEEFERSKRKNPAAYEND K ; A,N ? 2 'polypeptide(L)' no no MLSVASRSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQATVPATPEQPVLDLKRPFLSRESLSG MLSVASRSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQATVPATPEQPVLDLKRPFLSRESLSG B,O ? 3 'polypeptide(L)' no no ;SHTDIKVPDFSEYRRLEVLDSTKSSRESSEARKGFSYLVTGVTTVGVAYAAKNAVTQFVSSMSASADVLALAKIEIKLSD IPEGKNMAFKWRGKPLFVRHRTQKEIEQEAAVELSQLRDPQHDLDRVKKPEWVILIGVCTHLGCVPIANAGDFGGYYCPC HGSHYDASGRIRLGPAPLNLEVPTYEFTSDDMVIVG ; ;SHTDIKVPDFSEYRRLEVLDSTKSSRESSEARKGFSYLVTGVTTVGVAYAAKNAVTQFVSSMSASADVLALAKIEIKLSD IPEGKNMAFKWRGKPLFVRHRTQKEIEQEAAVELSQLRDPQHDLDRVKKPEWVILIGVCTHLGCVPIANAGDFGGYYCPC HGSHYDASGRIRLGPAPLNLEVPTYEFTSDDMVIVG ; C,P ? 4 'polypeptide(L)' no no AAATLTSKLYSLLFRRTSTFALTIIVGVMFFERAFDQGADAIYDHINEGKLWKHIKHKYENK AAATLTSKLYSLLFRRTSTFALTIIVGVMFFERAFDQGADAIYDHINEGKLWKHIKHKYENK D,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no EEEEEEEEELVDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSHTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNNLK EEEEEEEEELVDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSHTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNNLK E,R ? 6 'polypeptide(L)' no no ;AVSASGKWLDGIRKWYYNAAGFNKLGLMRDDTIYEDEDVKEAIRRLPENLYNDRMFRIKRALDLNLKHQILPKEQWTKYE EENFYLEPYLKEVIRERKEREEWAKK ; ;AVSASGKWLDGIRKWYYNAAGFNKLGLMRDDTIYEDEDVKEAIRRLPENLYNDRMFRIKRALDLNLKHQILPKEQWTKYE EENFYLEPYLKEVIRERKEREEWAKK ; F,S ? 7 'polypeptide(L)' no no VTRFLGPRYRELVKNWVPTAYTWGAVGAVGLVWATDWRLILDWVPYINGKF VTRFLGPRYRELVKNWVPTAYTWGAVGAVGLVWATDWRLILDWVPYINGKF G,T ? 8 'polypeptide(L)' no no ;SDLELHPPSYPWSHRGLLSSLDHTSIRRGFQVYKQVCASCHSMDFVAYRHLVGVCYTEDEAKELAAEVEVQDGPNEDGEM FMRPGKLFDYFPKPYPNSEAARAANNGALPPDLSYIVRARHGGEDYVFSLLTGYCEPPTGVSLREGLYFNPYFPGQAIAM APPIYTDVLEFDDGTPATMSQIAKDVCTFLRWASEPEHDHRKRMGLKMLMMMALLVPLVYTIKRHKWSVLKSRKLAYRPP K ; ;SDLELHPPSYPWSHRGLLSSLDHTSIRRGFQVYKQVCASCHSMDFVAYRHLVGVCYTEDEAKELAAEVEVQDGPNEDGEM FMRPGKLFDYFPKPYPNSEAARAANNGALPPDLSYIVRARHGGEDYVFSLLTGYCEPPTGVSLREGLYFNPYFPGQAIAM APPIYTDVLEFDDGTPATMSQIAKDVCTFLRWASEPEHDHRKRMGLKMLMMMALLVPLVYTIKRHKWSVLKSRKLAYRPP K ; H,U ? 9 'polypeptide(L)' no no ;TPMRKTNPLMKLINHSFIDLPTPSNISAWWNFGSLLGACLILQITTGLFLAMHYSPDASTAFSSIAHITRDVNYGWIIRY LHANGASMFFICLFLHIGRGLYYGSFLYSETWNIGIILLLATMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLLSAIPYIGTDLV QWIWGGYSVDSPTLTRFFTFHFILPFIIAALATLHLLFLHETGSNNPLGITSHSDKITFHPYYTIKDALGLLLFLLSLMT LTLFSPDLLGDPDNYTLANPLNTPPHIKPEWYFLFAYTILRSVPNKLGGVLALLLSILILAMIPILHMSKQQSMMFRPLS QSLYWLLAADLLILTWIGGQPVSYPFTIIGQVASVLYFTTILILMPTISLIENKMLKW ; ;TPMRKTNPLMKLINHSFIDLPTPSNISAWWNFGSLLGACLILQITTGLFLAMHYSPDASTAFSSIAHITRDVNYGWIIRY LHANGASMFFICLFLHIGRGLYYGSFLYSETWNIGIILLLATMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLLSAIPYIGTDLV QWIWGGYSVDSPTLTRFFTFHFILPFIIAALATLHLLFLHETGSNNPLGITSHSDKITFHPYYTIKDALGLLLFLLSLMT LTLFSPDLLGDPDNYTLANPLNTPPHIKPEWYFLFAYTILRSVPNKLGGVLALLLSILILAMIPILHMSKQQSMMFRPLS QSLYWLLAADLLILTWIGGQPVSYPFTIIGQVASVLYFTTILILMPTISLIENKMLKW ; J,V ? 10 'polypeptide(L)' no no ;PQDLEFTKLPNGLVIASLENYSPVSRIGLFIKAGSRYEDFSNLGTTHLLRLTSSLTTKGASSFKITRGIEAVGGKLSVTA TRENMAYTVECLRGDVDILMEFLLNVTTAPEFRRWEVADLQPQLKIDKAVAFQNPQTHVIENLHAAAYRNALANPLYCPD YRIGKVTSEELHYFVQNHFTSARMALIGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKANYRGGEIREQNGDSLVHAAFVAE SAVAGSAEANAFSVLQHVLGAGPHVKRGSNTTSHLHQAVAKATQQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIKAA YNQVKTIAQGNLSNTDVQAAKNKLKAGYLMSVESSECFLEEVGSQALVAGSYMPPSTVLQQIDSVANADIINAAKKFVSG QKSMAASGNLGHTPFVDEL ; ;PQDLEFTKLPNGLVIASLENYSPVSRIGLFIKAGSRYEDFSNLGTTHLLRLTSSLTTKGASSFKITRGIEAVGGKLSVTA TRENMAYTVECLRGDVDILMEFLLNVTTAPEFRRWEVADLQPQLKIDKAVAFQNPQTHVIENLHAAAYRNALANPLYCPD YRIGKVTSEELHYFVQNHFTSARMALIGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKANYRGGEIREQNGDSLVHAAFVAE SAVAGSAEANAFSVLQHVLGAGPHVKRGSNTTSHLHQAVAKATQQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIKAA YNQVKTIAQGNLSNTDVQAAKNKLKAGYLMSVESSECFLEEVGSQALVAGSYMPPSTVLQQIDSVANADIINAAKKFVSG QKSMAASGNLGHTPFVDEL ; K,W ? 11 'polypeptide(L)' no no ;TATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVE SMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRDVVFNYLHATAFQG TPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSE IRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLL GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLAEWESRIA EVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF ; ;TATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVE SMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRDVVFNYLHATAFQG TPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSE IRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLL GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLAEWESRIA EVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF ; L,Y ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLY n 1 2 ARG n 1 3 GLU n 1 4 PHE n 1 5 GLY n 1 6 ASN n 1 7 LEU n 1 8 THR n 1 9 ARG n 1 10 MET n 1 11 ARG n 1 12 HIS n 1 13 VAL n 1 14 ILE n 1 15 SER n 1 16 TYR n 1 17 SER n 1 18 LEU n 1 19 SER n 1 20 PRO n 1 21 PHE n 1 22 GLU n 1 23 GLN n 1 24 ARG n 1 25 ALA n 1 26 TYR n 1 27 PRO n 1 28 HIS n 1 29 VAL n 1 30 PHE n 1 31 THR n 1 32 LYS n 1 33 GLY n 1 34 ILE n 1 35 PRO n 1 36 ASN n 1 37 VAL n 1 38 LEU n 1 39 ARG n 1 40 ARG n 1 41 ILE n 1 42 ARG n 1 43 GLU n 1 44 SER n 1 45 PHE n 1 46 PHE n 1 47 ARG n 1 48 VAL n 1 49 VAL n 1 50 PRO n 1 51 GLN n 1 52 PHE n 1 53 VAL n 1 54 VAL n 1 55 PHE n 1 56 TYR n 1 57 LEU n 1 58 ILE n 1 59 TYR n 1 60 THR n 1 61 TRP n 1 62 GLY n 1 63 THR n 1 64 GLU n 1 65 GLU n 1 66 PHE n 1 67 GLU n 1 68 ARG n 1 69 SER n 1 70 LYS n 1 71 ARG n 1 72 LYS n 1 73 ASN n 1 74 PRO n 1 75 ALA n 1 76 ALA n 1 77 TYR n 1 78 GLU n 1 79 ASN n 1 80 ASP n 1 81 LYS n 2 1 MET n 2 2 LEU n 2 3 SER n 2 4 VAL n 2 5 ALA n 2 6 SER n 2 7 ARG n 2 8 SER n 2 9 GLY n 2 10 PRO n 2 11 PHE n 2 12 ALA n 2 13 PRO n 2 14 VAL n 2 15 LEU n 2 16 SER n 2 17 ALA n 2 18 THR n 2 19 SER n 2 20 ARG n 2 21 GLY n 2 22 VAL n 2 23 ALA n 2 24 GLY n 2 25 ALA n 2 26 LEU n 2 27 ARG n 2 28 PRO n 2 29 LEU n 2 30 VAL n 2 31 GLN n 2 32 ALA n 2 33 THR n 2 34 VAL n 2 35 PRO n 2 36 ALA n 2 37 THR n 2 38 PRO n 2 39 GLU n 2 40 GLN n 2 41 PRO n 2 42 VAL n 2 43 LEU n 2 44 ASP n 2 45 LEU n 2 46 LYS n 2 47 ARG n 2 48 PRO n 2 49 PHE n 2 50 LEU n 2 51 SER n 2 52 ARG n 2 53 GLU n 2 54 SER n 2 55 LEU n 2 56 SER n 2 57 GLY n 3 1 SER n 3 2 HIS n 3 3 THR n 3 4 ASP n 3 5 ILE n 3 6 LYS n 3 7 VAL n 3 8 PRO n 3 9 ASP n 3 10 PHE n 3 11 SER n 3 12 GLU n 3 13 TYR n 3 14 ARG n 3 15 ARG n 3 16 LEU n 3 17 GLU n 3 18 VAL n 3 19 LEU n 3 20 ASP n 3 21 SER n 3 22 THR n 3 23 LYS n 3 24 SER n 3 25 SER n 3 26 ARG n 3 27 GLU n 3 28 SER n 3 29 SER n 3 30 GLU n 3 31 ALA n 3 32 ARG n 3 33 LYS n 3 34 GLY n 3 35 PHE n 3 36 SER n 3 37 TYR n 3 38 LEU n 3 39 VAL n 3 40 THR n 3 41 GLY n 3 42 VAL n 3 43 THR n 3 44 THR n 3 45 VAL n 3 46 GLY n 3 47 VAL n 3 48 ALA n 3 49 TYR n 3 50 ALA n 3 51 ALA n 3 52 LYS n 3 53 ASN n 3 54 ALA n 3 55 VAL n 3 56 THR n 3 57 GLN n 3 58 PHE n 3 59 VAL n 3 60 SER n 3 61 SER n 3 62 MET n 3 63 SER n 3 64 ALA n 3 65 SER n 3 66 ALA n 3 67 ASP n 3 68 VAL n 3 69 LEU n 3 70 ALA n 3 71 LEU n 3 72 ALA n 3 73 LYS n 3 74 ILE n 3 75 GLU n 3 76 ILE n 3 77 LYS n 3 78 LEU n 3 79 SER n 3 80 ASP n 3 81 ILE n 3 82 PRO n 3 83 GLU n 3 84 GLY n 3 85 LYS n 3 86 ASN n 3 87 MET n 3 88 ALA n 3 89 PHE n 3 90 LYS n 3 91 TRP n 3 92 ARG n 3 93 GLY n 3 94 LYS n 3 95 PRO n 3 96 LEU n 3 97 PHE n 3 98 VAL n 3 99 ARG n 3 100 HIS n 3 101 ARG n 3 102 THR n 3 103 GLN n 3 104 LYS n 3 105 GLU n 3 106 ILE n 3 107 GLU n 3 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sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 446 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP QCR8_HUMAN O14949 ? 1 ;GREFGNLTRMRHVISYSLSPFEQRAYPHVFTKGIPNVLRRIRESFFRVVPQFVVFYLIYTWGTEEFERSKRKNPAAYEND K ; 2 2 UNP UCRI_HUMAN P47985 ? 2 MLSVASRSGPFAPVLSATSRGVAGALRPLVQATVPATPEQPVLDLKRPFLSRESLSG 1 3 UNP UCRI_HUMAN P47985 ? 3 ;SHTDIKVPDFSEYRRLEVLDSTKSSRESSEARKGFSYLVTGVTTVGVAYAAKNAVTQFVSSMSASADVLALAKIEIKLSD IPEGKNMAFKWRGKPLFVRHRTQKEIEQEAAVELSQLRDPQHDLDRVKKPEWVILIGVCTHLGCVPIANAGDFGGYYCPC HGSHYDASGRIRLGPAPLNLEVPTYEFTSDDMVIVG ; 79 4 UNP QCR9_HUMAN Q9UDW1 ? 4 AAATLTSKLYSLLFRRTSTFALTIIVGVMFFERAFDQGADAIYDHINEGKLWKHIKHKYENK 2 5 UNP QCR6_HUMAN P07919 ? 5 EEEEEEEEELVDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSHTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNNLK 17 6 UNP QCR7_HUMAN P14927 ? 6 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TRENMAYTVECLRGDVDILMEFLLNVTTAPEFRRWEVADLQPQLKIDKAVAFQNPQTHVIENLHAAAYRNALANPLYCPD YRIGKVTSEELHYFVQNHFTSARMALIGLGVSHPVLKQVAEQFLNMRGGLGLSGAKANYRGGEIREQNGDSLVHAAFVAE SAVAGSAEANAFSVLQHVLGAGPHVKRGSNTTSHLHQAVAKATQQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIKAA YNQVKTIAQGNLSNTDVQAAKNKLKAGYLMSVESSECFLEEVGSQALVAGSYMPPSTVLQQIDSVANADIINAAKKFVSG QKSMAASGNLGHTPFVDEL ; 35 11 UNP QCR1_HUMAN P31930 ? 11 ;TATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVE SMGAHLNAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRDVVFNYLHATAFQG TPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSE IRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDNVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLL GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYGRRIPLAEWESRIA EVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF ; 35 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg 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ASN W 184 ASN W 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P162 AR9 PRO U 159 ? ILE U 163 ? PRO W 193 ILE W 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P163 AS1 THR U 167 ? PHE U 179 ? THR W 201 PHE W 213 1 ? 13 HELX_P HELX_P164 AS2 SER U 192 ? ASN U 205 ? SER W 226 ASN W 239 1 ? 14 HELX_P HELX_P165 AS3 SER U 246 ? LEU U 259 ? SER W 280 LEU W 293 1 ? 14 HELX_P HELX_P166 AS4 SER U 273 ? THR U 283 ? SER W 307 THR W 317 1 ? 11 HELX_P HELX_P167 AS5 ALA U 312 ? GLN U 329 ? ALA W 346 GLN W 363 1 ? 18 HELX_P HELX_P168 AS6 SER U 333 ? SER U 354 ? SER W 367 SER W 388 1 ? 22 HELX_P HELX_P169 AS7 SER U 354 ? ALA U 369 ? SER W 388 ALA W 403 1 ? 16 HELX_P HELX_P170 AS8 PRO U 374 ? SER U 384 ? PRO W 408 SER W 418 1 ? 11 HELX_P HELX_P171 AS9 ALA U 386 ? GLY U 400 ? ALA W 420 GLY W 434 1 ? 15 HELX_P HELX_P172 AT1 THR V 3 ? LEU V 8 ? THR Y 37 LEU Y 42 1 ? 6 HELX_P HELX_P173 AT2 GLY V 44 ? GLU V 48 ? GLY Y 78 GLU Y 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P174 AT3 THR V 49 ? ASN V 53 ? THR Y 83 ASN Y 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P175 AT4 GLY V 54 ? ALA V 63 ? GLY Y 88 ALA Y 97 1 ? 10 HELX_P HELX_P176 AT5 PRO V 71 ? MET V 82 ? PRO Y 105 MET Y 116 1 ? 12 HELX_P HELX_P177 AT6 ASP V 105 ? ASN V 119 ? ASP Y 139 ASN Y 153 1 ? 15 HELX_P HELX_P178 AT7 GLU V 123 ? ALA V 143 ? GLU Y 157 ALA Y 177 1 ? 21 HELX_P HELX_P179 AT8 MET V 145 ? GLN V 159 ? MET Y 179 GLN Y 193 1 ? 15 HELX_P HELX_P180 AT9 THR V 161 ? GLN V 165 ? THR Y 195 GLN Y 199 5 ? 5 HELX_P HELX_P181 AU1 GLU V 172 ? LEU V 177 ? GLU Y 206 LEU Y 211 5 ? 6 HELX_P HELX_P182 AU2 SER V 178 ? TYR V 190 ? SER Y 212 TYR Y 224 1 ? 13 HELX_P HELX_P183 AU3 GLU V 204 ? LYS V 214 ? GLU Y 238 LYS Y 248 1 ? 11 HELX_P HELX_P184 AU4 HIS V 215 ? ILE V 219 ? HIS Y 249 ILE Y 253 5 ? 5 HELX_P HELX_P185 AU5 TYR V 223 ? ALA V 227 ? TYR Y 257 ALA Y 261 5 ? 5 HELX_P HELX_P186 AU6 PRO V 265 ? GLY V 278 ? PRO Y 299 GLY Y 312 1 ? 14 HELX_P HELX_P187 AU7 SER V 292 ? VAL V 299 ? SER Y 326 VAL Y 333 1 ? 8 HELX_P HELX_P188 AU8 LYS V 330 ? THR V 347 ? LYS Y 364 THR Y 381 1 ? 18 HELX_P HELX_P189 AU9 THR V 350 ? HIS V 368 ? 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ASP Y 467 GLY Y 474 1 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? C CYS 144 SG ? ? ? 1_555 C CYS 160 SG ? ? C CYS 222 C CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf2 disulf ? ? N CYS 144 SG ? ? ? 1_555 N CYS 160 SG ? ? P CYS 222 P CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? metalc1 metalc ? ? C HIS 141 ND1 ? ? ? 1_555 X FES . FE2 ? ? C HIS 219 C FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc2 metalc ? ? C HIS 161 ND1 ? ? ? 1_555 X FES . FE2 ? ? C HIS 239 C FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc3 metalc ? ? H HIS 41 NE2 ? ? ? 1_555 AA HEC . FE ? ? H HIS 125 H HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc4 metalc ? ? I HIS 82 NE2 ? ? ? 1_555 CA HEM . FE ? ? J HIS 83 J HEM 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc5 metalc ? ? I HIS 96 NE2 ? ? ? 1_555 DA HEM . FE ? ? J HIS 97 J HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc6 metalc ? ? I HIS 181 NE2 ? ? ? 1_555 CA HEM . FE ? ? J HIS 182 J HEM 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc7 metalc ? ? I HIS 195 NE2 ? ? ? 1_555 DA HEM . FE ? ? J HIS 196 J HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.540 ? metalc8 metalc ? ? N HIS 161 ND1 ? ? ? 1_555 LA FES . FE2 ? ? P HIS 239 P FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc9 metalc ? ? S HIS 41 NE2 ? ? ? 1_555 PA HEC . FE ? ? U HIS 125 U HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc10 metalc ? ? T HIS 82 NE2 ? ? ? 1_555 RA HEM . FE ? ? V HIS 83 V HEM 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc11 metalc ? ? T HIS 96 NE2 ? ? ? 1_555 SA HEM . FE ? ? V HIS 97 V HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.540 ? metalc12 metalc ? ? T HIS 181 NE2 ? ? ? 1_555 RA HEM . FE ? ? V HIS 182 V HEM 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc13 metalc ? ? T HIS 195 NE2 ? ? ? 1_555 SA HEM . FE ? ? V HIS 196 V HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 26 B . ? LEU 26 B ARG 27 B ? ARG 27 B 1 -14.55 2 VAL 243 J . ? VAL 277 K ALA 244 J ? ALA 278 K 1 4.51 3 ALA 192 K . ? ALA 226 L PRO 193 K ? PRO 227 L 1 3.23 4 GLY 426 K . ? GLY 460 L PRO 427 K ? PRO 461 L 1 2.64 5 LEU 26 M . ? LEU 26 O ARG 27 M ? ARG 27 O 1 -10.19 6 VAL 243 U . ? VAL 277 W ALA 244 U ? ALA 278 W 1 -8.47 7 ALA 192 V . ? ALA 226 Y PRO 193 V ? PRO 227 Y 1 5.66 8 GLY 426 V . ? GLY 460 Y PRO 427 V ? PRO 461 Y 1 8.60 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 16 ? 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VAL C 271 VAL C 273 AA6 1 VAL H 70 ? GLN H 71 ? VAL H 154 GLN H 155 AA6 2 MET H 82 ? ARG H 83 ? MET H 166 ARG H 167 AA7 1 PRO I 21 ? PRO I 23 ? PRO J 22 PRO J 24 AA7 2 LYS I 216 ? THR I 218 ? LYS J 217 THR J 219 AA8 1 GLU J 223 ? ARG J 225 ? GLU K 257 ARG K 259 AA8 2 SER J 403 ? ALA J 406 ? SER K 437 ALA K 440 AA8 3 LEU J 232 ? SER J 241 ? LEU K 266 SER K 275 AA8 4 GLY J 300 ? GLN J 309 ? GLY K 334 GLN K 343 AA8 5 PHE J 287 ? ALA J 294 ? PHE K 321 ALA K 328 AA9 1 THR K 34 ? CYS K 35 ? THR L 68 CYS L 69 AA9 2 ALA K 101 ? LEU K 102 ? ALA L 135 LEU L 136 AB1 1 ASN K 87 ? SER K 90 ? ASN L 121 SER L 124 AB1 2 THR K 95 ? TYR K 98 ? THR L 129 TYR L 132 AB1 3 GLY K 38 ? VAL K 39 ? GLY L 72 VAL L 73 AB1 4 LEU K 197 ? ALA K 198 ? LEU L 231 ALA L 232 AB2 1 SER L 15 ? SER L 17 ? SER N 16 SER N 18 AB2 2 GLU V 240 ? ARG V 242 ? GLU Y 274 ARG Y 276 AB2 3 ALA V 421 ? TYR V 425 ? ALA Y 455 TYR Y 459 AB2 4 ALA V 251 ? GLU V 258 ? ALA Y 285 GLU Y 292 AB2 5 LEU V 319 ? CYS V 326 ? 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EMAN 2.1 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? AutoEMation 2.0 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 3.0 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? Coot 0.8.2 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 1.4 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION 1.4 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION 1.4 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.11.1 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Natural Science Foundation of China' China 21532004 1 'National Natural Science Foundation of China' China 31570733 2 'Ministry of Science and Technology' China 2016YFA0501100 3 'Ministry of Science and Technology' China 2017YFA0504600 4 'National Science Fund for Distinguished Young Scholars' China 31625008 5 # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 12 CARDIOLIPIN CDL 13 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' FES 14 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine PEE 15 'HEME C' HEC 16 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEM 17 ;(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL ; PLX # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #