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EMD-8407 'other EM volume' EMDB 'BG505 SOSIP in complex with sCD4, 17b, 8ANC195' EMD-7516 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6CM3 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-03-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, H.' 1 ? 'Bjorkman, P.J.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Cell Host Microbe' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1934-6069 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 24 _citation.language ? _citation.page_first 579 _citation.page_last 592.e4 _citation.title 'Partially Open HIV-1 Envelope Structures Exhibit Conformational Changes Relevant for Coreceptor Binding and Fusion.' _citation.year 2018 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.chom.2018.09.003 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30308160 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, H.' 1 ? primary 'Barnes, C.O.' 2 ? primary 'Yang, Z.' 3 ? primary 'Nussenzweig, M.C.' 4 ? primary 'Bjorkman, P.J.' 5 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6CM3 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6CM3 _symmetry.cell_setting ? 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VLQNQKKVEFKIDIVVLAFQKAIDGRHHHHHH ; G,H,I ? 4 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASESVSSDLAWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGVPARFSGSGSGAEFTLTISSLQS EDFAVYYCQQYNNWPPRYTFGQGTRLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG ; ;DIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASESVSSDLAWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGVPARFSGSGSGAEFTLTISSLQS EDFAVYYCQQYNNWPPRYTFGQGTRLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG ; J,L,N ? 5 'polypeptide(L)' no no ;EVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKASGDTFIRYSFTWVRQAPGQGLEWMGRIITILDVAHYAPHLQGRVTITADKSTSTVY LELRNLRSDDTAVYFCAGVYEGEADEGEYDNNGFLKHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDY FPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPK ; ;EVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKASGDTFIRYSFTWVRQAPGQGLEWMGRIITILDVAHYAPHLQGRVTITADKSTSTVY LELRNLRSDDTAVYFCAGVYEGEADEGEYDNNGFLKHWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDY FPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPK ; K,M,O ? 6 'polypeptide(L)' no no ;QIHLVQSGTEVKKPGSSVTVSCKAYGVNTFGLYAVNWVRQAPGQSLEYIGQIWRWKSSASHHFRGRVLISAVDLTGSSPP ISSLEIKNLTSDDTAVYFCTTTSTYDKWSGLHHDGVMAFSSWGQGTLISVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHH HHHH ; ;QIHLVQSGTEVKKPGSSVTVSCKAYGVNTFGLYAVNWVRQAPGQSLEYIGQIWRWKSSASHHFRGRVLISAVDLTGSSPP ISSLEIKNLTSDDTAVYFCTTTSTYDKWSGLHHDGVMAFSSWGQGTLISVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCL VKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHH HHHH ; P,R,T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSTLSASIGDTVRISCRASQSITGNWVAWYQQRPGKAPRLLIYRGAALLGGVPSRFSGSAAGTDFTLTIGNLQ AEDFGTFYCQQYDTYPGTFGQGTKVEVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQSPSTLSASIGDTVRISCRASQSITGNWVAWYQQRPGKAPRLLIYRGAALLGGVPSRFSGSAAGTDFTLTIGNLQ AEDFGTFYCQQYDTYPGTFGQGTKVEVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; Q,S,U ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 VAL n 1 3 GLY n 1 4 ILE n 1 5 GLY n 1 6 ALA n 1 7 VAL n 1 8 PHE n 1 9 LEU n 1 10 GLY n 1 11 PHE n 1 12 LEU n 1 13 GLY n 1 14 ALA n 1 15 ALA n 1 16 GLY n 1 17 SER n 1 18 THR n 1 19 MET n 1 20 GLY n 1 21 ALA n 1 22 ALA n 1 23 SER n 1 24 MET n 1 25 THR n 1 26 LEU n 1 27 THR n 1 28 VAL n 1 29 GLN n 1 30 ALA n 1 31 ARG n 1 32 ASN n 1 33 LEU n 1 34 LEU n 1 35 SER n 1 36 GLY n 1 37 ILE n 1 38 VAL n 1 39 GLN n 1 40 GLN n 1 41 GLN n 1 42 SER n 1 43 ASN n 1 44 LEU n 1 45 LEU n 1 46 ARG n 1 47 ALA n 1 48 PRO n 1 49 GLU n 1 50 ALA n 1 51 GLN n 1 52 GLN n 1 53 HIS n 1 54 LEU n 1 55 LEU n 1 56 LYS n 1 57 LEU n 1 58 THR n 1 59 VAL n 1 60 TRP n 1 61 GLY n 1 62 ILE n 1 63 LYS n 1 64 GLN n 1 65 LEU n 1 66 GLN n 1 67 ALA n 1 68 ARG n 1 69 VAL n 1 70 LEU n 1 71 ALA n 1 72 VAL n 1 73 GLU n 1 74 ARG n 1 75 TYR n 1 76 LEU n 1 77 ARG n 1 78 ASP n 1 79 GLN n 1 80 GLN n 1 81 LEU n 1 82 LEU n 1 83 GLY n 1 84 ILE n 1 85 TRP n 1 86 GLY n 1 87 CYS n 1 88 SER n 1 89 GLY n 1 90 LYS n 1 91 LEU n 1 92 ILE n 1 93 CYS n 1 94 CYS n 1 95 THR n 1 96 ASN n 1 97 VAL n 1 98 PRO n 1 99 TRP n 1 100 ASN n 1 101 SER n 1 102 SER n 1 103 TRP n 1 104 SER n 1 105 ASN n 1 106 ARG n 1 107 ASN n 1 108 LEU n 1 109 SER n 1 110 GLU n 1 111 ILE n 1 112 TRP n 1 113 ASP n 1 114 ASN n 1 115 MET n 1 116 THR n 1 117 TRP n 1 118 LEU n 1 119 GLN n 1 120 TRP n 1 121 ASP n 1 122 LYS n 1 123 GLU n 1 124 ILE n 1 125 SER n 1 126 ASN n 1 127 TYR n 1 128 THR n 1 129 GLN n 1 130 ILE n 1 131 ILE n 1 132 TYR n 1 133 GLY n 1 134 LEU n 1 135 LEU n 1 136 GLU n 1 137 GLU n 1 138 SER n 1 139 GLN n 1 140 ASN n 1 141 GLN n 1 142 GLN n 1 143 GLU n 1 144 LYS n 1 145 ASN n 1 146 GLU n 1 147 GLN n 1 148 ASP n 1 149 LEU n 1 150 LEU n 1 151 ALA n 1 152 LEU n 1 153 ASP n 2 1 ALA n 2 2 GLU n 2 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THR F 337 GLY F 354 1 ? 18 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP F 337 ? THR F 342 ? ASP F 368 THR F 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P36 AD9 MET F 443 ? ARG F 448 ? MET F 475 ARG F 480 1 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 ARG G 58 ? GLN G 64 ? ARG G 58 GLN G 64 5 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 ARG H 58 ? GLN H 64 ? ARG H 58 GLN H 64 5 ? 7 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG I 58 ? GLN I 64 ? ARG I 58 GLN I 64 5 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 THR K 28 ? ILE K 30 ? THR K 28 ILE K 30 5 ? 3 HELX_P HELX_P41 AE5 ARG K 87 ? THR K 91 ? ARG K 87 THR K 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 AE6 THR M 28 ? ILE M 30 ? THR M 28 ILE M 30 5 ? 3 HELX_P HELX_P43 AE7 ARG M 87 ? THR M 91 ? ARG M 87 THR M 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 AE8 THR O 28 ? ILE O 30 ? THR O 28 ILE O 30 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 AE9 ARG O 87 ? THR O 91 ? ARG O 87 THR O 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 TRP P 53 ? LYS P 56 ? TRP P 53 LYS P 56 5 ? 4 HELX_P HELX_P47 AF2 TRP R 53 ? LYS R 56 ? TRP R 53 LYS R 56 5 ? 4 HELX_P HELX_P48 AF3 TRP T 53 ? LYS T 56 ? TRP T 53 LYS T 56 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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D CYS 188 SG ? ? ? 1_555 D CYS 217 SG ? ? D CYS 218 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf11 disulf ? ? D CYS 198 SG ? ? ? 1_555 D CYS 209 SG ? ? D CYS 228 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 266 SG ? ? ? 1_555 D CYS 300 SG ? ? D CYS 296 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 347 SG ? ? ? 1_555 D CYS 413 SG ? ? D CYS 378 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 354 SG ? ? ? 1_555 D CYS 386 SG ? ? D CYS 385 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 24 SG ? ? ? 1_555 E CYS 44 SG ? ? E CYS 54 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf16 disulf ? ? E CYS 89 SG ? ? ? 1_555 E CYS 175 SG ? ? E CYS 119 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 96 SG ? ? ? 1_555 E CYS 166 SG ? ? E CYS 126 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 188 SG ? ? ? 1_555 E CYS 217 SG ? ? E CYS 218 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf19 disulf ? ? E CYS 198 SG ? ? ? 1_555 E CYS 209 SG ? ? E CYS 228 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf20 disulf ? ? E CYS 266 SG ? ? ? 1_555 E CYS 300 SG ? ? E CYS 296 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf21 disulf ? ? E CYS 347 SG ? ? ? 1_555 E CYS 413 SG ? ? E CYS 378 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf22 disulf ? ? E CYS 354 SG ? ? ? 1_555 E CYS 386 SG ? ? E CYS 385 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf23 disulf ? ? F CYS 24 SG ? ? ? 1_555 F CYS 44 SG ? ? F CYS 54 F CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf24 disulf ? ? F CYS 89 SG ? ? ? 1_555 F CYS 175 SG ? ? F CYS 119 F CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf25 disulf ? ? F CYS 96 SG ? ? ? 1_555 F CYS 166 SG ? ? F CYS 126 F CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf26 disulf ? ? F CYS 188 SG ? ? ? 1_555 F CYS 217 SG ? ? F CYS 218 F CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf27 disulf ? ? F CYS 198 SG ? ? ? 1_555 F CYS 209 SG ? ? F CYS 228 F CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? F CYS 266 SG ? ? ? 1_555 F CYS 300 SG ? ? F CYS 296 F CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf29 disulf ? ? F CYS 347 SG ? ? ? 1_555 F CYS 413 SG ? ? F CYS 378 F CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? ? disulf30 disulf ? ? F CYS 354 SG ? ? ? 1_555 F CYS 386 SG ? ? F CYS 385 F CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf31 disulf ? ? G CYS 16 SG ? ? ? 1_555 G CYS 84 SG ? ? G CYS 16 G CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf32 disulf ? ? H CYS 16 SG ? ? ? 1_555 H CYS 84 SG ? ? H CYS 16 H CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf33 disulf ? ? I CYS 16 SG ? ? ? 1_555 I CYS 84 SG ? ? I CYS 16 I CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf34 disulf ? ? J CYS 23 SG ? ? ? 1_555 J CYS 88 SG ? ? J CYS 23 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf35 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG ? ? K CYS 22 K CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf36 disulf ? ? L CYS 23 SG ? ? ? 1_555 L CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf37 disulf ? ? M CYS 22 SG ? ? ? 1_555 M CYS 96 SG ? ? M CYS 22 M CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf38 disulf ? ? N CYS 23 SG ? ? ? 1_555 N CYS 88 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf39 disulf ? ? O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 96 SG ? ? O CYS 22 O CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf40 disulf ? ? P CYS 22 SG ? ? ? 1_555 P CYS 99 SG ? ? P CYS 22 P CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf41 disulf ? ? Q CYS 23 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 89 SG ? ? Q CYS 23 Q CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf42 disulf ? ? R CYS 22 SG ? ? ? 1_555 R CYS 99 SG ? ? R CYS 22 R CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf43 disulf ? ? S CYS 23 SG ? ? ? 1_555 S CYS 89 SG ? ? S CYS 23 S CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf44 disulf ? ? T CYS 22 SG ? ? ? 1_555 T CYS 99 SG ? ? T CYS 22 T CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf45 disulf ? ? U CYS 23 SG ? ? ? 1_555 U CYS 89 SG ? ? U CYS 23 U CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? covale1 covale one ? A ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 637 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 637 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? C ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 637 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? D ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? D ASN 234 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? D ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? D ASN 262 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? D ASN 276 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? D ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? D ASN 295 D NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? D ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? D ASN 332 D NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? D ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? D ASN 339 D NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? D ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? D ASN 363 D NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? D ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? D ASN 386 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? D ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? D ASN 392 D NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale13 covale none ? D GLN 408 OE1 ? ? ? 1_555 Z MAN . C4 ? ? D GLN 440 Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.379 ? ? covale14 covale one ? D ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? D ASN 448 D NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? E ASN 234 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? E ASN 262 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? E ASN 276 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? E ASN 295 E NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? E ASN 332 E NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? E ASN 339 E NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? E ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? E ASN 363 E NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? E ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? E ASN 386 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? E ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? E ASN 392 E NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale24 covale none ? E GLN 408 OE1 ? ? ? 1_555 DA MAN . C4 ? ? E GLN 440 d MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.380 ? ? covale25 covale one ? E ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? E ASN 448 E NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? F ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? F ASN 234 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? F ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? F ASN 262 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? F ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? F ASN 276 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? F ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? F ASN 295 F NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? F ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? F ASN 332 F NAG 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? F ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? F ASN 339 F NAG 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? F ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? F ASN 363 F NAG 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? F ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? F ASN 386 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? F ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? F ASN 392 F NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale35 covale none ? F GLN 408 OE1 ? ? ? 1_555 HA MAN . C4 ? ? F GLN 440 h MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.380 ? ? covale36 covale one ? F ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? F ASN 448 F NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? N-Glycosylation covale37 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale38 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale39 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale40 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale41 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale42 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale43 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? ? covale44 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 4 Y MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale45 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 5 Y MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale46 covale both ? Y MAN . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 7 Y MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale47 covale both ? Y MAN . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 7 Y MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale48 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y MAN 8 Y MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale49 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale50 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale51 covale both ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale52 covale both ? Z MAN . O2 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? Z MAN 4 Z MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? ? covale53 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale54 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale55 covale both ? AA BMA . O3 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a BMA 3 a MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale56 covale both ? AA BMA . O6 ? ? ? 1_555 AA MAN . C1 ? ? a BMA 3 a MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale57 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale58 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale59 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale60 covale both ? CA BMA . O3 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale61 covale both ? CA BMA . O6 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale62 covale both ? CA MAN . O2 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c MAN 4 c MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale63 covale both ? CA MAN . O2 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c MAN 5 c MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale64 covale both ? CA MAN . O6 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c MAN 7 c MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale65 covale both ? CA MAN . O3 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c MAN 7 c MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale66 covale both ? CA MAN . O2 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? c MAN 8 c MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale67 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale68 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale69 covale both ? DA BMA . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale70 covale both ? DA MAN . O2 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d MAN 4 d MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? ? covale71 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale72 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale73 covale both ? EA BMA . O3 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale74 covale both ? EA BMA . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale75 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale76 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale77 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale78 covale both ? GA BMA . O3 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale79 covale both ? GA BMA . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale80 covale both ? GA MAN . O2 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 4 g MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale81 covale both ? GA MAN . O2 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 5 g MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale82 covale both ? GA MAN . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 7 g MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale83 covale both ? GA MAN . O3 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 7 g MAN 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale84 covale both ? GA MAN . O2 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? g MAN 8 g MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale85 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale86 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? h NAG 2 h BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale87 covale both ? HA BMA . O3 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h BMA 3 h MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? ? covale88 covale both ? HA MAN . O2 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? h MAN 4 h MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? ? covale89 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale90 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale91 covale both ? IA BMA . O3 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale92 covale both ? IA BMA . O6 ? ? ? 1_555 IA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale93 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 CYS 24 D . ? CYS 54 D ALA 25 D ? ALA 55 D 1 -2.70 2 LYS 159 D . ? LYS 189 D GLU 160 D ? GLU 190 D 1 -2.48 3 GLU 160 D . ? GLU 190 D TYR 161 D ? 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SER 463 F THR 432 F ? THR 464 F 1 11.24 22 TRP 94 J . ? TRP 94 J PRO 95 J ? PRO 95 J 1 -2.86 23 TRP 94 L . ? TRP 94 L PRO 95 L ? PRO 95 L 1 -2.98 24 TRP 94 N . ? TRP 94 N PRO 95 N ? PRO 95 N 1 -2.90 25 SER 7 Q . ? SER 7 Q PRO 8 Q ? PRO 8 Q 1 -6.61 26 TYR 95 Q . ? TYR 95 Q PRO 96 Q ? PRO 96 Q 1 -5.49 27 SER 7 S . ? SER 7 S PRO 8 S ? PRO 8 S 1 -6.65 28 TYR 95 S . ? TYR 95 S PRO 96 S ? PRO 96 S 1 -5.50 29 SER 7 U . ? SER 7 U PRO 8 U ? PRO 8 U 1 -6.67 30 TYR 95 U . ? TYR 95 U PRO 96 U ? PRO 96 U 1 -5.37 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 7 ? AB7 ? 6 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 6 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 6 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 6 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 4 ? 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? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number 'HIVRAD P01 AI100148' _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero V 8 NAG 1 V NAG 1 A NAG 6370 n V 8 NAG 2 V NAG 2 A NAG 6371 n W 8 NAG 1 W NAG 1 B NAG 6370 n W 8 NAG 2 W NAG 2 B NAG 6371 n X 8 NAG 1 X NAG 1 C NAG 6370 n X 8 NAG 2 X NAG 2 C NAG 6371 n Y 9 NAG 1 Y NAG 1 D NAG 2340 n Y 9 NAG 2 Y NAG 2 D NAG 2341 n Y 9 BMA 3 Y BMA 3 D BMA 2342 n Y 9 MAN 4 Y MAN 4 D MAN 2347 n Y 9 MAN 5 Y MAN 5 D MAN 2348 n Y 9 MAN 6 Y MAN 6 D MAN 2349 n Y 9 MAN 7 Y MAN 7 D MAN 2343 n Y 9 MAN 8 Y MAN 8 D MAN 2345 n Y 9 MAN 9 Y MAN 9 D MAN 2346 n Y 9 MAN 10 Y MAN 10 D MAN 2344 n Z 10 NAG 1 Z NAG 1 D NAG 2620 n Z 10 NAG 2 Z NAG 2 D NAG 2621 n Z 10 BMA 3 Z BMA 3 D BMA 2622 n Z 10 MAN 4 Z MAN 4 D MAN 2624 n Z 10 MAN 5 Z MAN 5 D MAN 2625 n AA 11 NAG 1 a NAG 1 D NAG 2760 n AA 11 NAG 2 a NAG 2 D NAG 2761 n AA 11 BMA 3 a BMA 3 D BMA 2762 n AA 11 MAN 4 a MAN 4 D MAN 2763 n AA 11 MAN 5 a MAN 5 D MAN 2764 n BA 8 NAG 1 b NAG 1 D NAG 3860 n BA 8 NAG 2 b NAG 2 D NAG 3861 n CA 9 NAG 1 c NAG 1 E NAG 2340 n CA 9 NAG 2 c NAG 2 E NAG 2341 n CA 9 BMA 3 c BMA 3 E BMA 2342 n CA 9 MAN 4 c MAN 4 E MAN 2347 n CA 9 MAN 5 c MAN 5 E MAN 2348 n CA 9 MAN 6 c MAN 6 E MAN 2349 n CA 9 MAN 7 c MAN 7 E MAN 2343 n CA 9 MAN 8 c MAN 8 E MAN 2345 n CA 9 MAN 9 c MAN 9 E MAN 2346 n CA 9 MAN 10 c MAN 10 E MAN 2344 n DA 10 NAG 1 d NAG 1 E NAG 2620 n DA 10 NAG 2 d NAG 2 E NAG 2621 n DA 10 BMA 3 d BMA 3 E BMA 2622 n DA 10 MAN 4 d MAN 4 E MAN 2624 n DA 10 MAN 5 d MAN 5 E MAN 2625 n EA 11 NAG 1 e NAG 1 E NAG 2760 n EA 11 NAG 2 e NAG 2 E NAG 2761 n EA 11 BMA 3 e BMA 3 E BMA 2762 n EA 11 MAN 4 e MAN 4 E MAN 2763 n EA 11 MAN 5 e MAN 5 E MAN 2764 n FA 8 NAG 1 f NAG 1 E NAG 3860 n FA 8 NAG 2 f NAG 2 E NAG 3861 n GA 9 NAG 1 g NAG 1 F NAG 2340 n GA 9 NAG 2 g NAG 2 F NAG 2341 n GA 9 BMA 3 g BMA 3 F BMA 2342 n GA 9 MAN 4 g MAN 4 F MAN 2347 n GA 9 MAN 5 g MAN 5 F MAN 2348 n GA 9 MAN 6 g MAN 6 F MAN 2349 n GA 9 MAN 7 g MAN 7 F MAN 2343 n GA 9 MAN 8 g MAN 8 F MAN 2345 n GA 9 MAN 9 g MAN 9 F MAN 2346 n GA 9 MAN 10 g MAN 10 F MAN 2344 n HA 10 NAG 1 h NAG 1 F NAG 2620 n HA 10 NAG 2 h NAG 2 F NAG 2621 n HA 10 BMA 3 h BMA 3 F BMA 2622 n HA 10 MAN 4 h MAN 4 F MAN 2624 n HA 10 MAN 5 h MAN 5 F MAN 2625 n IA 11 NAG 1 i NAG 1 F NAG 2760 n IA 11 NAG 2 i NAG 2 F NAG 2761 n IA 11 BMA 3 i BMA 3 F BMA 2762 n IA 11 MAN 4 i MAN 4 F MAN 2763 n IA 11 MAN 5 i MAN 5 F MAN 2764 n JA 8 NAG 1 j NAG 1 F NAG 3860 n JA 8 NAG 2 j NAG 2 F NAG 3861 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 8 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 8 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 8 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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16 11 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 17 11 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 18 11 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 9 BMA 3 n 9 MAN 4 n 9 MAN 5 n 9 MAN 6 n 9 MAN 7 n 9 MAN 8 n 9 MAN 9 n 9 MAN 10 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 10 MAN 4 n 10 MAN 5 n 11 NAG 1 n 11 NAG 2 n 11 BMA 3 n 11 MAN 4 n 11 MAN 5 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 12 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #