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'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.0649 ? 54608 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0578 ? 6020 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0073 ? 6546 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.0268 ? 23708 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6GYS _struct.title 'Cryo-EM structure of the CBF3-CEN3 complex of the budding yeast kinetochore' _struct.pdbx_descriptor ;Centromere DNA-binding protein complex CBF3 subunit C, Centromere DNA-binding protein complex CBF3 subunit B, Suppressor of kinetochore protein 1, Centromere DNA-binding protein complex CBF3 subunit A/DNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6GYS _struct_keywords.text 'Complex, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 7 ? N N N 7 ? 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F DG 27 O6 ? ? ? 1_555 G DC 26 N4 ? ? F DG 31 G DC 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog61 hydrog ? ? F DA 28 N1 ? ? ? 1_555 G DT 25 N3 ? ? F DA 32 G DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog62 hydrog ? ? F DA 28 N6 ? ? ? 1_555 G DT 25 O4 ? ? F DA 32 G DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog63 hydrog ? ? F DA 29 N1 ? ? ? 1_555 G DT 24 N3 ? ? F DA 33 G DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog64 hydrog ? ? F DA 29 N6 ? ? ? 1_555 G DT 24 O4 ? ? F DA 33 G DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog65 hydrog ? ? F DA 30 N1 ? ? ? 1_555 G DT 23 N3 ? ? F DA 34 G DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog66 hydrog ? ? F DA 30 N6 ? ? ? 1_555 G DT 23 O4 ? ? F DA 34 G DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog67 hydrog ? ? F DG 31 N1 ? ? ? 1_555 G DC 22 N3 ? ? F DG 35 G DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog68 hydrog ? ? F DG 31 N2 ? ? ? 1_555 G DC 22 O2 ? ? F DG 35 G DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog69 hydrog ? ? F DG 31 O6 ? ? ? 1_555 G DC 22 N4 ? ? F DG 35 G DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog70 hydrog ? ? F DT 32 N3 ? ? ? 1_555 G DA 21 N1 ? ? F DT 36 G DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog71 hydrog ? ? F DT 32 O4 ? ? ? 1_555 G DA 21 N6 ? ? F DT 36 G DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog72 hydrog ? ? F DT 33 N3 ? ? ? 1_555 G DA 20 N1 ? ? F DT 37 G DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog73 hydrog ? ? F DT 33 O4 ? ? ? 1_555 G DA 20 N6 ? ? F DT 37 G DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog74 hydrog ? ? F DA 34 N1 ? ? ? 1_555 G DT 19 N3 ? ? F DA 38 G DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog75 hydrog ? ? F DA 34 N6 ? ? ? 1_555 G DT 19 O4 ? ? F DA 38 G DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog76 hydrog ? ? F DA 35 N1 ? ? ? 1_555 G DT 18 N3 ? ? F DA 39 G DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog77 hydrog ? ? F DA 35 N6 ? ? ? 1_555 G DT 18 O4 ? ? F DA 39 G DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog78 hydrog ? ? F DA 36 N1 ? ? ? 1_555 G DT 17 N3 ? ? F DA 40 G DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog79 hydrog ? ? F DA 36 N6 ? ? ? 1_555 G DT 17 O4 ? ? F DA 40 G DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog80 hydrog ? ? F DA 37 N1 ? ? ? 1_555 G DT 16 N3 ? ? F DA 41 G DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog81 hydrog ? ? F DA 37 N6 ? ? ? 1_555 G DT 16 O4 ? ? F DA 41 G DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog82 hydrog ? ? F DA 38 N1 ? ? ? 1_555 G DT 15 N3 ? ? F DA 42 G DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog83 hydrog ? ? F DA 38 N6 ? ? ? 1_555 G DT 15 O4 ? ? F DA 42 G DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog84 hydrog ? ? F DA 39 N1 ? ? ? 1_555 G DT 14 N3 ? ? F DA 43 G DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog85 hydrog ? ? F DA 39 N6 ? ? ? 1_555 G DT 14 O4 ? ? F DA 43 G DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog86 hydrog ? ? F DG 40 N1 ? ? ? 1_555 G DC 13 N3 ? ? F DG 44 G DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog87 hydrog ? ? 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'DA-DT PAIR' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 28 B . ? ILE 28 B PRO 29 B ? PRO 29 B 1 -1.22 2 ILE 28 C . ? ILE 28 C PRO 29 C ? PRO 29 C 1 -0.54 3 ILE 28 I . ? ILE 28 I PRO 29 I ? PRO 29 I 1 -16.60 4 ILE 28 J . ? 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HIS E 267 GLN E 268 AA8 1 VAL H 45 ? GLU H 46 ? VAL H 45 GLU H 46 AA8 2 SER L 72 ? VAL L 73 ? SER L 72 VAL L 73 AA9 1 LEU H 118 ? TRP H 120 ? LEU H 118 TRP H 120 AA9 2 LEU H 129 ? PHE H 132 ? LEU H 129 PHE H 132 AA9 3 LEU H 138 ? VAL H 140 ? LEU H 138 VAL H 140 AB1 1 ILE H 276 ? VAL H 278 ? ILE H 276 VAL H 278 AB1 2 GLU H 311 ? MET H 317 ? GLU H 311 MET H 317 AB1 3 LYS H 336 ? VAL H 342 ? LYS H 336 VAL H 342 AB1 4 SER H 358 ? MET H 361 ? SER H 358 MET H 361 AB2 1 TYR H 344 ? ILE H 345 ? TYR H 344 ILE H 345 AB2 2 LYS H 366 ? ILE H 367 ? LYS H 366 ILE H 367 AB3 1 ILE H 410 ? LYS H 411 ? ILE H 410 LYS H 411 AB3 2 VAL H 475 ? LEU H 476 ? VAL H 475 LEU H 476 AB3 3 ILE H 452 ? ILE H 453 ? ILE H 452 ILE H 453 AB4 1 PHE K 16 ? ASP K 19 ? PHE K 16 ASP K 19 AB4 2 ASN K 5 ? SER K 10 ? ASN K 5 SER K 10 AB4 3 PRO K 78 ? VAL K 79 ? PRO K 78 VAL K 79 AB5 1 LYS L 240 ? LEU L 241 ? LYS L 240 LEU L 241 AB5 2 ILE L 249 ? HIS L 252 ? ILE L 249 HIS L 252 AB5 3 LEU L 269 ? LEU L 270 ? LEU L 269 LEU L 270 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O GLU A 139 ? 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