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;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHEDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNYAPNLLSNMRGELKQCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKE YRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEV IIRSENITNNAKNILVQLNTPVQINCTRPNNNTVKSIRIGPGQAFYYFGDIIGDIRMAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRK HFGNNTIIRFAQSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSIVLPCRIKQIINMWQRIGQ AMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRV ; B,G,I ? 3 'polypeptide(L)' no no ;EVQLQESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFTFSRYGMSWVRQTPDKRLEWVATISSGGSYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNTLY LQMSSLKSEDTAMYYCARHGITTVGVAMDYWGQGTYSHVSSA ; ;EVQLQESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFTFSRYGMSWVRQTPDKRLEWVATISSGGSYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNTLY LQMSSLKSEDTAMYYCARHGITTVGVAMDYWGQGTYSHVSSA ; D,H,J ? 4 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNLESGIPARFSGSGSGTDFTLNIH PVEEEDAATYYCQQSNEDPYTFGAGTKLELKRTDAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQ 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I CYS 354 SG ? ? ? 1_555 I CYS 386 SG ? ? I CYS 385 I CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? covale1 covale one ? A ASN 95 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? A ASN 611 A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 102 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? A ASN 618 A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 121 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? A ASN 637 A NAG 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? B ASN 88 B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? B ASN 160 B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 197 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? B ASN 234 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? 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C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale83 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 280 B . ? GLY 312 B PRO 281 B ? 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AF6 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB1 6 7 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 87 ? 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MET B 434 TYR B 435 AA8 3 ILE B 391 ? ILE B 392 ? ILE B 423 ILE B 424 AA9 1 LEU B 229 ? LEU B 231 ? LEU B 259 LEU B 261 AA9 2 ARG B 412 ? LEU B 422 ? ARG B 444 LEU B 454 AA9 3 ILE B 254 ? GLN B 257 ? ILE B 284 GLN B 287 AA9 4 ILE B 241 ? ARG B 243 ? ILE B 271 ARG B 273 AB1 1 LEU B 229 ? LEU B 231 ? LEU B 259 LEU B 261 AB1 2 ARG B 412 ? LEU B 422 ? ARG B 444 LEU B 454 AB1 3 VAL B 262 ? THR B 267 ? VAL B 292 THR B 297 AB1 4 HIS B 299 ? ASN B 301 ? HIS B 330 ASN B 332 AB1 5 LEU B 384 ? ILE B 388 ? LEU B 416 ILE B 420 AB1 6 GLU B 350 ? CYS B 354 ? GLU B 381 CYS B 385 AB1 7 HIS B 343 ? CYS B 347 ? HIS B 374 CYS B 378 AB2 1 LYS B 275 ? ARG B 278 ? LYS B 305 ARG B 308 AB2 2 ALA B 284 ? TYR B 287 ? ALA B 316 TYR B 319 AB3 1 THR B 363 ? TRP B 364 ? THR B 394 TRP B 395 AB3 2 ILE B 328 ? PHE B 330 ? ILE B 359 PHE B 361 AB3 3 THR B 435 ? PHE B 436 ? THR B 467 PHE B 468 AB4 1 ILE C 87 ? PRO C 93 ? ILE C 603 PRO C 609 AB4 2 TRP G 5 ? TYR G 10 ? TRP G 35 TYR G 40 AB4 3 LEU G 462 ? PRO G 466 ? LEU G 494 PRO G 498 AB5 1 LYS D 19 ? SER D 21 ? LYS D 19 SER D 21 AB5 2 TYR D 80 ? GLN D 82 ? TYR D 79 GLN D 81 AB6 1 VAL D 48 ? ALA D 49 ? VAL D 48 ALA D 49 AB6 2 MET D 34 ? VAL D 37 ? MET D 34 VAL D 37 AB6 3 TYR D 95 ? ARG D 98 ? TYR D 91 ARG D 94 AB7 1 LYS E 49 ? LEU E 50 ? LYS E 45 LEU E 46 AB7 2 TRP E 39 ? GLN E 42 ? TRP E 35 GLN E 38 AB7 3 THR E 89 ? CYS E 92 ? THR E 85 CYS E 88 AB8 1 ILE E 52 ? TYR E 53 ? ILE E 48 TYR E 49 AB8 2 ASN E 57 ? LEU E 58 ? ASN E 53 LEU E 54 AB9 1 SER E 67 ? GLY E 68 ? SER E 63 GLY E 64 AB9 2 LEU E 77 ? ASN E 78 ? LEU E 73 ASN E 74 AC1 1 ILE F 87 ? PRO F 93 ? ILE F 603 PRO F 609 AC1 2 TRP I 5 ? TYR I 10 ? TRP I 35 TYR I 40 AC1 3 LEU I 462 ? THR I 467 ? LEU I 494 THR I 499 AC2 1 TRP G 15 ? LYS G 16 ? TRP G 45 LYS G 46 AC2 2 LYS G 455 ? ILE G 459 ? LYS G 487 ILE G 491 AC2 3 PHE G 193 ? CYS G 198 ? PHE G 223 CYS G 228 AC2 4 VAL G 212 ? VAL G 215 ? VAL G 242 VAL G 245 AC2 5 ILE G 54 ? HIS G 55 ? ILE G 84 HIS G 85 AC3 1 PHE G 23 ? CYS G 24 ? 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'Mus musculoides' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 1 '293 6E' 9606 'Homo sapiens' ? ? 2 2 Expi293 9606 'Homo sapiens' ? ? 3 3 Expi293 9606 'Homo sapiens' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 40 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 328 # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf 1.06 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2.1 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2.1 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? cryoSPARC 2.1 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 2.1 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.14 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 1.25 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'P01 AI100148' 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'P50 GM082545-06' 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 M NAG 1 B NAG 4500 n M 5 NAG 2 M NAG 2 B NAG 4501 n N 5 NAG 1 N NAG 1 B NAG 4502 n N 5 NAG 2 N NAG 2 B NAG 4503 n O 6 NAG 1 O NAG 1 B NAG 4504 n O 6 NAG 2 O NAG 2 B NAG 4505 n O 6 BMA 3 O BMA 3 B BMA 4506 n O 6 MAN 4 O MAN 4 B MAN 4509 n O 6 MAN 5 O MAN 5 B MAN 4507 n P 7 NAG 1 P NAG 1 B NAG 4510 n P 7 NAG 2 P NAG 2 B NAG 4511 n P 7 BMA 3 P BMA 3 B BMA 4512 n Q 5 NAG 1 Q NAG 1 B NAG 4515 n Q 5 NAG 2 Q NAG 2 B NAG 4516 n R 5 NAG 1 R NAG 1 B NAG 4519 n R 5 NAG 2 R NAG 2 B NAG 4520 n S 5 NAG 1 S NAG 1 G NAG 4499 n S 5 NAG 2 S NAG 2 G NAG 4500 n T 5 NAG 1 T NAG 1 G NAG 4503 n T 5 NAG 2 T NAG 2 G NAG 4504 n U 7 NAG 1 U NAG 1 G NAG 4505 n U 7 NAG 2 U NAG 2 G NAG 4506 n U 7 BMA 3 U BMA 3 G BMA 4507 n V 5 NAG 1 V NAG 1 G NAG 4508 n V 5 NAG 2 V NAG 2 G NAG 4509 n W 5 NAG 1 W NAG 1 G NAG 4511 n W 5 NAG 2 W NAG 2 G NAG 4512 n X 7 NAG 1 X NAG 1 G NAG 4513 n X 7 NAG 2 X NAG 2 G NAG 4514 n X 7 BMA 3 X BMA 3 G BMA 4515 n Y 5 NAG 1 Y NAG 1 G NAG 4518 n Y 5 NAG 2 Y NAG 2 G NAG 4519 n Z 5 NAG 1 Z NAG 1 G NAG 4521 n Z 5 NAG 2 Z NAG 2 G NAG 4522 n AA 5 NAG 1 a NAG 1 G NAG 4523 n AA 5 NAG 2 a NAG 2 G NAG 4524 n BA 5 NAG 1 b NAG 1 I NAG 4500 n BA 5 NAG 2 b NAG 2 I NAG 4501 n CA 5 NAG 1 c NAG 1 I NAG 4502 n CA 5 NAG 2 c NAG 2 I NAG 4503 n DA 6 NAG 1 d NAG 1 I NAG 4504 n DA 6 NAG 2 d NAG 2 I NAG 4505 n DA 6 BMA 3 d BMA 3 I BMA 4506 n DA 6 MAN 4 d MAN 4 I MAN 4509 n DA 6 MAN 5 d MAN 5 I MAN 4507 n EA 5 NAG 1 e NAG 1 I NAG 4510 n EA 5 NAG 2 e NAG 2 I NAG 4511 n FA 7 NAG 1 f NAG 1 I NAG 4514 n FA 7 NAG 2 f NAG 2 I NAG 4515 n FA 7 BMA 3 f BMA 3 I BMA 4516 n GA 5 NAG 1 g NAG 1 I NAG 4519 n GA 5 NAG 2 g NAG 2 I NAG 4520 n HA 5 NAG 1 h NAG 1 I NAG 4522 n HA 5 NAG 2 h NAG 2 I NAG 4523 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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