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loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LYS n 1 3 ILE n 1 4 ASN n 1 5 ASP n 1 6 ASP n 1 7 ILE n 1 8 LYS n 1 9 GLU n 1 10 LEU n 1 11 ILE n 1 12 LEU n 1 13 GLU n 1 14 TYR n 1 15 MET n 1 16 SER n 1 17 ARG n 1 18 TYR n 1 19 PHE n 1 20 LYS n 1 21 PHE n 1 22 GLU n 1 23 ASN n 1 24 ASP n 1 25 PHE n 1 26 TYR n 1 27 LYS n 1 28 LEU n 1 29 PRO n 1 30 GLY n 1 31 ILE n 1 32 LYS n 1 33 PHE n 1 34 THR n 1 35 ASP n 1 36 ALA n 1 37 ASN n 1 38 TRP n 1 39 GLN n 1 40 LYS n 1 41 PHE n 1 42 LYS n 1 43 ASN n 1 44 GLY n 1 45 GLY n 1 46 THR n 1 47 ASP n 1 48 ILE n 1 49 GLU n 1 50 LYS n 1 51 MET n 1 52 GLY n 1 53 ALA n 1 54 ALA n 1 55 ARG n 1 56 VAL n 1 57 ASN n 1 58 ALA n 1 59 MET n 1 60 LEU n 1 61 ASP n 1 62 CYS n 1 63 LEU n 1 64 PHE n 1 65 ASP n 1 66 ASP n 1 67 PHE n 1 68 GLU n 1 69 LEU n 1 70 ALA n 1 71 MET n 1 72 ILE n 1 73 GLY n 1 74 LYS n 1 75 ALA n 1 76 GLN n 1 77 THR n 1 78 ASN n 1 79 TYR n 1 80 TYR n 1 81 ASN n 1 82 ASP n 1 83 ASN n 1 84 SER n 1 85 LEU n 1 86 LYS n 1 87 MET n 1 88 ASN n 1 89 MET n 1 90 PRO n 1 91 PHE n 1 92 TYR n 1 93 THR n 1 94 TYR n 1 95 TYR n 1 96 ASP n 1 97 MET n 1 98 PHE n 1 99 LYS n 1 100 LYS n 1 101 GLN n 1 102 GLN n 1 103 LEU n 1 104 LEU n 1 105 LYS n 1 106 TRP n 1 107 LEU n 1 108 LYS n 1 109 ASN n 1 110 ASN n 1 111 ARG n 1 112 ASP n 1 113 ASP n 1 114 VAL n 1 115 ILE n 1 116 GLY n 1 117 GLY n 1 118 THR n 1 119 GLY n 1 120 ARG n 1 121 MET n 1 122 TYR n 1 123 THR n 1 124 ALA n 1 125 SER n 1 126 GLY n 1 127 ASN n 1 128 TYR n 1 129 ILE n 1 130 ALA n 1 131 ASN n 1 132 ALA n 1 133 TYR n 1 134 LEU n 1 135 GLU n 1 136 VAL n 1 137 ALA n 1 138 LEU n 1 139 GLU n 1 140 SER n 1 141 SER n 1 142 SER n 1 143 LEU n 1 144 GLY n 1 145 SER n 1 146 GLY n 1 147 SER n 1 148 TYR n 1 149 MET n 1 150 LEU n 1 151 GLN n 1 152 MET n 1 153 ARG n 1 154 PHE n 1 155 LYS n 1 156 ASP n 1 157 TYR n 1 158 SER n 1 159 LYS n 1 160 GLY n 1 161 GLN n 1 162 GLU n 1 163 PRO n 1 164 ILE n 1 165 PRO n 1 166 SER n 1 167 GLY n 1 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_refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0054 ? 21136 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8465 ? 29302 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0497 ? 3318 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0062 ? 3048 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.0859 ? 12340 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6RJA _struct.title 'Cryo-EM structure of St1Cas9-sgRNA-tDNA20-AcrIIA6 dimeric assembly.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6RJA _struct_keywords.text 'CRISPR-Cas9, anti-CRISPR protein, bacteriophages, Streptococcus thermophilus Cas9, St1Cas9, hydrolase' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A2U7VKE8_9CAUD A0A2U7VKE8 ? 1 ;MKINDDIKELILEYMSRYFKFENDFYKLPGIKFTDANWQKFKNGGTDIEKMGAARVNAMLDCLFDDFELAMIGKAQTNYY NDNSLKMNMPFYTYYDMFKKQQLLKWLKNNRDDVIGGTGRMYTASGNYIANAYLEVALESSSLGSGSYMLQMRFKDYSKG QEPIPSGRQNRLEWIENNLENIR ; 1 2 UNP CAS9A_STRTD Q03LF7 ? 2 ;MSDLVLGLDIGIGSVGVGILNKVTGEIIHKNSRIFPAAQAENNLVRRTNRQGRRLARRKKHRRVRLNRLFEESGLITDFT KISINLNPYQLRVKGLTDELSNEELFIALKNMVKHRGISYLDDASDDGNSSVGDYAQIVKENSKQLETKTPGQIQLERYQ TYGQLRGDFTVEKDGKKHRLINVFPTSAYRSEALRILQTQQEFNPQITDEFINRYLEILTGKRKYYHGPGNEKSRTDYGR YRTSGETLDNIFGILIGKCTFYPDEFRAAKASYTAQEFNLLNDLNNLTVPTETKKLSKEQKNQIINYVKNEKAMGPAKLF KYIAKLLSCDVADIKGYRIDKSGKAEIHTFEAYRKMKTLETLDIEQMDRETLDKLAYVLTLNTEREGIQEALEHEFADGS FSQKQVDELVQFRKANSSIFGKGWHNFSVKLMMELIPELYETSEEQMTILTRLGKQKTTSSSNKTKYIDEKLLTEEIYNP VVAKSVRQAIKIVNAAIKEYGDFDNIVIEMARETNEDDEKKAIQKIQKANKDEKDAAMLKAANQYNGKAELPHSVFHGHK QLATKIRLWHQQGERCLYTGKTISIHDLINNSNQFEVDHILPLSITFDDSLANKVLVYATANQEKGQRTPYQALDSMDDA WSFRELKAFVRESKTLSNKKKEYLLTEEDISKFDVRKKFIERNLVDTRYASRVVLNALQEHFRAHKIDTKVSVVRGQFTS QLRRHWGIEKTRDTYHHHAVDALIIAASSQLNLWKKQKNTLVSYSEDQLLDIETGELISDDEYKESVFKAPYQHFVDTLK SKEFEDSILFSYQVDSKFNRKISDATIYATRQAKVGKDKADETYVLGKIKDIYTQDGYDAFMKIYKKDKSKFLMYRHDPQ TFEKVIEPILENYPNKQINEKGKEVPCNPFLKYKEEHGYIRKYSKKGNGPEIKSLKYYDSKLGNHIDITPKDSNNKVVLQ SVSPWRADVYFNKTTGKYEILGLKYADLQFEKGTGTYKISQEKYNDIKKKEGVDSDSEFKFTLYKNDLLLVKDTETKEQQ LFRFLSRTMPKQKHYVELKPYDKQKFEGGEALIKVLGNVANSGQCKKGLGKSNISIYKVRTDVLGNQHIIKNEGDKPKLD F ; 1 3 PDB 6RJA 6RJA ? 3 ? 1 4 PDB 6RJA 6RJA ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6RJA A 1 ? 183 ? A0A2U7VKE8 1 ? 183 ? 1 183 2 1 6RJA B 1 ? 183 ? A0A2U7VKE8 1 ? 183 ? 1 183 3 2 6RJA C 1 ? 1121 ? Q03LF7 1 ? 1121 ? 1 1121 4 3 6RJA D 1 ? 117 ? 6RJA 1 ? 117 ? 1 117 5 4 6RJA E 1 ? 20 ? 6RJA 1 ? 20 ? 1 20 6 2 6RJA F 1 ? 1121 ? Q03LF7 1 ? 1121 ? 1 1121 7 3 6RJA G 1 ? 117 ? 6RJA 1 ? 117 ? 1 117 8 4 6RJA H 1 ? 20 ? 6RJA 1 ? 20 ? 1 20 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 6RJA THR C 56 ? UNP Q03LF7 ALA 56 conflict 56 1 3 6RJA ILE C 132 ? UNP Q03LF7 VAL 132 conflict 132 2 6 6RJA THR F 56 ? UNP Q03LF7 ALA 56 conflict 56 3 6 6RJA ILE F 132 ? UNP Q03LF7 VAL 132 conflict 132 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 42390 ? 1 MORE -263 ? 1 'SSA (A^2)' 119400 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 4 ? PHE A 19 ? ASN A 4 PHE A 19 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 PHE A 21 ? PHE A 25 ? PHE A 21 PHE A 25 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 34 ? ASN A 43 ? THR A 34 ASN A 43 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 47 ? MET A 51 ? ASP A 47 MET A 51 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 52 ? PHE A 64 ? GLY A 52 PHE A 64 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 65 ? TYR A 80 ? ASP A 65 TYR A 80 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 82 ? MET A 89 ? ASP A 82 MET A 89 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO A 90 ? ASN A 110 ? PRO A 90 ASN A 110 1 ? 21 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 167 ? ASN A 178 ? GLY A 167 ASN A 178 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN B 4 ? PHE B 19 ? ASN B 4 PHE B 19 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 PHE B 21 ? PHE B 25 ? PHE B 21 PHE B 25 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 THR B 34 ? ASN B 43 ? THR B 34 ASN B 43 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP B 47 ? MET B 51 ? ASP B 47 MET B 51 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY B 52 ? PHE B 64 ? GLY B 52 PHE B 64 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP B 65 ? TYR B 80 ? ASP B 65 TYR B 80 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP B 82 ? MET B 89 ? ASP B 82 MET B 89 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO B 90 ? ASN B 110 ? PRO B 90 ASN B 110 1 ? 21 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY B 167 ? ASN B 178 ? GLY B 167 ASN B 178 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 AC1 ALA C 40 ? SER C 73 ? ALA C 40 SER C 73 1 ? 34 HELX_P HELX_P20 AC2 ASN C 87 ? GLY C 95 ? ASN C 87 GLY C 95 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 GLU C 103 ? HIS C 115 ? GLU C 103 HIS C 115 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP C 134 ? GLU C 147 ? ASP C 134 GLU C 147 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 THR C 150 ? GLY C 163 ? THR C 150 GLY C 163 1 ? 14 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO C 185 ? ASN C 204 ? PRO C 185 ASN C 204 1 ? 20 HELX_P HELX_P25 AC7 THR C 208 ? GLY C 221 ? THR C 208 GLY C 221 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN C 250 ? ILE C 254 ? ASN C 250 ILE C 254 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 SER C 272 ? ASN C 285 ? SER C 272 ASN C 285 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 AD1 LYS C 298 ? GLU C 311 ? LYS C 298 GLU C 311 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY C 315 ? LEU C 327 ? GLY C 315 LEU C 327 1 ? 13 HELX_P HELX_P30 AD3 PHE C 350 ? MET C 356 ? PHE C 350 MET C 356 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 ARG C 369 ? ASN C 382 ? ARG C 369 ASN C 382 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 GLU C 384 ? GLU C 395 ? GLU C 384 GLU C 395 1 ? 12 HELX_P HELX_P33 AD6 SER C 402 ? ASN C 416 ? SER C 402 ASN C 416 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 SER C 428 ? ILE C 436 ? SER C 428 ILE C 436 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 AD8 GLU C 445 ? GLY C 454 ? GLU C 445 GLY C 454 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU C 470 ? GLU C 476 ? GLU C 470 GLU C 476 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN C 479 ? TYR C 500 ? ASN C 479 TYR C 500 1 ? 22 HELX_P HELX_P38 AE2 ARG C 692 ? HIS C 705 ? ARG C 692 HIS C 705 1 ? 14 HELX_P HELX_P39 AE3 HIS C 737 ? SER C 748 ? HIS C 737 SER C 748 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 AE4 THR C 854 ? ASP C 868 ? THR C 854 ASP C 868 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 LYS C 869 ? LYS C 871 ? LYS C 869 LYS C 871 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 AE6 PHE C 872 ? ASP C 878 ? PHE C 872 ASP C 878 1 ? 7 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP C 878 ? GLU C 891 ? ASP C 878 GLU C 891 1 ? 14 HELX_P HELX_P44 AE8 PHE C 910 ? GLY C 918 ? 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'C-G PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 5 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 2 ? 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