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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 3 1 sample 1 60 'synthetic construct' ? 32630 ? 4 1 sample 1 60 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A037YDI0_ECOLX A0A037YDI0 ? 1 ;MKILSLRLKNLNSLKGEWKIDFTREPFASNGLFAITGPTGAGKTTLLDAICLALYHETPRLSNVSQSQNDLMTRDTAECL AEVEFEVKGEAYRAFWSQNRARNQPDGNLQVPRVELARCADGKILADKVKDKLELTATLTGLDYGRFTRSMLLSQGQFAA FLNAKPKERAELLEELTGTEIYGQISAMVFEQHKSARTELEKLQAQASGVTLLTPEQVQSLTASLQVLTDEEKQLITAQQ QEQQSLNWLTRQDELQQEASRRQQALQQALAEEEKAQPQLAALSLAQPARNLRPHWERIAEHSAALAHIRQQIEEVNTRL QSTMALRASIRHHAAKQSAELQQQQQSLNTWLQEHDRFRQWNNEPAGWRAQFSQQTSDREHLRQWQQQLTHAEQKLNALA AITLTLTADEVATALAQHAEQRPLRQHLVALHGQIVPQQKRLAQLQVAIQNVTQEQTQRNAALNEMRQRYKEKTQQLADV KTICEQEARIKTLEAQRAQLQAGQPCPLCGSTSHPAVEAYQALEPGVNQSRLLALENEVKKLGEEGATLRGQLDAITKQL QRDENEAQSLRQDEQALTQQWQAVTASLNITLQPLDDIQPWLDAQDEHERQLRLLSQRHELQGQIAAHNQQIIQYQQQIE QRQQLLLTTLTGYALTLPQEDEEESWLATRQQEAQSWQQRQNELTALQNRIQQLTPILETLPQSDELPHCEETVVLENWR QVHEQCLALHSQQQTLQQQDVLAAQSLQKAQAQFDTALQASVFDDQQAFLAALMDEQTLTQLEQLKQNLENQRRQAQTLV TQTAETLAQHQQHRPDDGLALTVTVEQIQQELAQTHQKLRENTTSQGEIRQQLKQDADNRQQQQTLMQQIAQMTQQVEDW GYLNSLIGSKEGDKFRKFAQGLTLDNLVHLANQQLTRLHGRYLLQRKASEALEVEVVDTWQADAVRDTRTLSGGESFLVS LALALALSDLVSHKTRIDSLFLDEGFGTLDSETLDTALDALDALNASGKTIGVISHVEAMKERIPVQIKVKKINGLGYSK LESTFAVK ; 1 2 UNP C3TMC7_ECOLX C3TMC7 ? 2 ;MRILHTSDWHLGQNFYSKSREAEHQAFLDWLLETAQTHQVDAIIVAGDVFDTGSPPSYARTLYNRFVVNLQQTGCHLVVL AGNHDSVATLNESRDIMAFLNTTVVASAGHAPQILPRRDGTPGAVLCPIPFLRPRDIITSQAGLNGIEKQQHLLAAITDY YQQHYADACKLRGDQPLPIIATGHLTTVGASKSDAVRDIYIGTLDAFPAQNFPPADYIALGHIHRAQIIGGMEHVRYCGS PIPLSFDECGKSKYVHLVTFSNGKLESVENLNVPVTQPMAVLKGDLASITAQLEQWRDVSQEPPVWLDIEITTDEYLHDI QRKIQALTESLPVEVLLVRRSREQRERVLASQQRETLSELSVEEVFNRRLALEELDESQQQRLQHLFTTTLHTLAGEHEA ; 1 3 PDB 6S85 6S85 ? 3 ? 1 4 PDB 6S85 6S85 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6S85 C 1 ? 1048 ? 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'expression tag' 404 5 3 6S85 HIS A 405 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 405 6 3 6S85 HIS A 406 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 406 7 3 6S85 HIS A 407 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 407 8 4 6S85 SER B 84 ? UNP C3TMC7 HIS 84 conflict 84 9 4 6S85 GLY B 401 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 401 10 4 6S85 HIS B 402 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 402 11 4 6S85 HIS B 403 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 403 12 4 6S85 HIS B 404 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 404 13 4 6S85 HIS B 405 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 405 14 4 6S85 HIS B 406 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 406 15 4 6S85 HIS B 407 ? UNP C3TMC7 ? ? 'expression tag' 407 16 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 MN non-polymer . 'MANGANESE (II) ION' ? 'Mn 2' 54.938 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6S85 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6S85 _struct.title 'Cutting state of the E. coli Mre11-Rad50 (SbcCD) head complex bound to ADP and dsDNA.' _struct.pdbx_descriptor 'Nuclease SbcCD subunit C, Nuclease SbcCD subunit D/DNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6S85 _struct_keywords.text 'Nuclease, DNA repair, ABC-type ATPase, DNA double-strand breaks, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 7 ? M N N 7 ? N N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 48 ? HIS A 56 ? ASP C 48 HIS C 56 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 101 ? GLN A 104 ? ALA C 101 GLN C 104 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 AA3 LYS A 128 ? GLY A 141 ? LYS C 128 GLY C 141 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 143 ? MET A 151 ? 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ASP B 285 GLU B 294 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 AF2 GLN D 295 ? ARG D 297 ? GLN B 295 ARG B 297 5 ? 3 HELX_P HELX_P48 AF3 TYR D 316 ? LEU D 331 ? TYR B 316 LEU B 331 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 AF4 SER D 361 ? ARG D 369 ? SER B 361 ARG B 369 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 AF5 GLU D 377 ? LEU D 394 ? 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