data_6SH8 # _entry.id 6SH8 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.332 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6SH8 WWPDB D_1292103307 EMDB EMD-10196 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB 'Contains the same complex in the same state, only ssDNA was not present in the sample' 6S91 unspecified EMDB 'Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 2, in the presence of ssDNA' EMD-10196 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6SH8 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-08-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Sofos, N.' 1 ? 'Montoya, G.' 2 ? 'Stella, S.' 3 ? # loop_ _citation.abstract _citation.abstract_id_CAS _citation.book_id_ISBN _citation.book_publisher _citation.book_publisher_city _citation.book_title _citation.coordinate_linkage _citation.country _citation.database_id_Medline _citation.details _citation.id _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ASTM _citation.journal_id_CSD _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_full _citation.journal_issue _citation.journal_volume _citation.language _citation.page_first _citation.page_last _citation.title _citation.year _citation.database_id_CSD _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.unpublished_flag ? ? ? ? ? ? ? US ? ? primary Mol.Cell MOCEFL 2168 1097-2765 ? ? 79 ? 741 757.e7 'Structures of the Cmr-beta Complex Reveal the Regulation of the Immunity Mechanism of Type III-B CRISPR-Cas.' 2020 ? 10.1016/j.molcel.2020.07.008 32730741 ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Structures of the Cmr-beta Complex Reveal the Regulation of the Immunity Mechanism of Type III-B CRISPR-Cas' 2020 ? 10.1101/2020.06.24.163345 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Sofos, N.' 1 ? primary 'Feng, M.' 2 ? primary 'Stella, S.' 3 ? primary 'Pape, T.' 4 ? primary 'Fuglsang, A.' 5 ? primary 'Lin, J.' 6 ? primary 'Huang, Q.' 7 ? primary 'Li, Y.' 8 ? primary 'She, Q.' 9 ? primary 'Montoya, G.' 10 ? 1 'Sofos, N.' 11 ? 1 'Feng, M.' 12 ? 1 'Stella, S.' 13 ? 1 'Pape, T.' 14 ? 1 'Fuglsang, A.' 15 ? 1 'Lin, J.' 16 ? 1 'Huang, Q.' 17 ? 1 'Li, Y.' 18 ? 1 'She, Q.' 19 ? 1 'Montoya, G.' 20 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6SH8 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6SH8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'CRISPR-associated protein, Cmr5 family' 17961.834 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family' 32322.359 4 ? D31A ? ? 3 polymer nat 'CRISPR-associated protein, Cmr3 family' 36008.547 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family' 33945.914 1 ? ? ? 'C-terminal histidine-tag for co-purification of the complex.' 5 polymer nat 'Cmr1,CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family' 55388.965 1 ? ? ? ;The N-terminal "MEEELL" sequence is not part of the annotated sequence (F0NDX4) due to an annotation mistake. ; 6 polymer nat 'CRISPR-associated protein, Cmr2 family' 120856.453 1 ? ? ? ? 7 polymer nat 'CRISPR-associated protein Cmrx' 19705.607 26 ? ? ? ? 8 polymer syn 'Cognate target RNA' 14704.712 1 ? ? ? ? 9 polymer man crRNA 16409.871 1 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER' 506.196 2 ? ? ? ? 12 non-polymer syn 'MANGANESE (II) ION' 54.938 3 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MLYEEDYKLALEAFKKVFNALTHYGAKQAFRSRARDLVEEIYNSGFIPTFFYIISKAELNSDSLDSLISLFSSDNAILRG SDENVSYSAYLFIILYYLIKRGIIEQKFLIQALRCEKTRLDLIDKLYNLAPIISAKIRTYLLAIKRLSEALIEAR ; ;MLYEEDYKLALEAFKKVFNALTHYGAKQAFRSRARDLVEEIYNSGFIPTFFYIISKAELNSDSLDSLISLFSSDNAILRG SDENVSYSAYLFIILYYLIKRGIIEQKFLIQALRCEKTRLDLIDKLYNLAPIISAKIRTYLLAIKRLSEALIEAR ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MPYYAFAEPFFIHAITHLHVGSGSSVEEEIALPFQRDELGYPTIYASSLKGAIKSFLLKEFPDKRDVIYKVLGEDENPEE ASLGTFLDAILFAIPSRIIEIDSAKPYVWVYVTTYELLKKVKLYLDSISQLSNASFSNLKNKIDTILAKEGKNITLDSDL KSAILNEDFYVELEALNNKIPSIINAGVPLLVLEDSIGREVINRSLIRVRRIRIDRDKKVVETGGLWSEEYVPMKTIFFS VLLGKESKESAIFASCILRNLRYVILGGKETIGKGIVELRWVKDVI ; ;MPYYAFAEPFFIHAITHLHVGSGSSVEEEIALPFQRDELGYPTIYASSLKGAIKSFLLKEFPDKRDVIYKVLGEDENPEE ASLGTFLDAILFAIPSRIIEIDSAKPYVWVYVTTYELLKKVKLYLDSISQLSNASFSNLKNKIDTILAKEGKNITLDSDL KSAILNEDFYVELEALNNKIPSIINAGVPLLVLEDSIGREVINRSLIRVRRIRIDRDKKVVETGGLWSEEYVPMKTIFFS VLLGKESKESAIFASCILRNLRYVILGGKETIGKGIVELRWVKDVI ; D,E,F,G ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKRVLIKPLEPLMFRSQGEFEPLITGSHTAAQSLIIPRPSTIAGMLGYILFNKSSGTGDWLSDLTNLLATIYGTFIETNG EYLFPLRMGNHLALVDQQHLINLPTLLEKEYERREKGIYELFYDKNKLFQIINHQDRIGISIDKSTRTVKEHYLYSARYL AFKKEVNYVIFIDNDAISDKINGKIVNFGGENRIAKLEVDDYKVDTSIEEEYYLALSPILIPDEALDNFLDNISDYVAMG KVDKISLGFDIANTKRKEMLTAILEGSIVKRSIIDFIKNEIKNDLRYRFSKYEKIGYNTLMSLCKLALRKILS ; ;MKRVLIKPLEPLMFRSQGEFEPLITGSHTAAQSLIIPRPSTIAGMLGYILFNKSSGTGDWLSDLTNLLATIYGTFIETNG EYLFPLRMGNHLALVDQQHLINLPTLLEKEYERREKGIYELFYDKNKLFQIINHQDRIGISIDKSTRTVKEHYLYSARYL AFKKEVNYVIFIDNDAISDKINGKIVNFGGENRIAKLEVDDYKVDTSIEEEYYLALSPILIPDEALDNFLDNISDYVAMG KVDKISLGFDIANTKRKEMLTAILEGSIVKRSIIDFIKNEIKNDLRYRFSKYEKIGYNTLMSLCKLALRKILS ; H ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAIDFLVNILELIKEKQCNINLFSAISLTSIVYNNFGEFLSNNQSYSTNNPLLKYHIIILNDKNKTKDVEEKRNIFKREV AELISRNFKLDGEKVRNYFDSLKEVLKSLKYTIVDVEITTRTRALIGVSTSLGKLIFGSGISFDPYMNLPYIPASEIKGI VRSYIEGKLGEQEAEEIFGNEEREGNVNFTDAYPTRSKDFLFVPDVITPHYNGKKSEADAEPRPVIHLTIAPKVTFRFLI YYKREDVGKPICDSMPIILIRGLGARSSVGYSLFELRKIEVIKAAAHHHHHHHHHH ; ;MAIDFLVNILELIKEKQCNINLFSAISLTSIVYNNFGEFLSNNQSYSTNNPLLKYHIIILNDKNKTKDVEEKRNIFKREV AELISRNFKLDGEKVRNYFDSLKEVLKSLKYTIVDVEITTRTRALIGVSTSLGKLIFGSGISFDPYMNLPYIPASEIKGI VRSYIEGKLGEQEAEEIFGNEEREGNVNFTDAYPTRSKDFLFVPDVITPHYNGKKSEADAEPRPVIHLTIAPKVTFRFLI YYKREDVGKPICDSMPIILIRGLGARSSVGYSLFELRKIEVIKAAAHHHHHHHHHH ; I ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MEELLMSLKLKALYPLTGGYNRHSINPFYEELVRPTEIKGLWRWWNRVLFNTLAYSTKGKLYTYESIDRLFEDVFGSENK KSAVRLEVITDEGNDNRFELSYVELDKVIDCLRNYKRKVSLDFIDNTLIAEIEGSTKIPISFKSNLDIDKIIKDLVHNNK LLSFELLGFKSVEIDATKISDKKILKEILRDLITNYLEYFNIKQEVTFTLNIYLDKSREHKQNFEDKLKFALYSLLVFIL LGGIGRKTSRGFGSLSIIDVKCYDNSICKKIEDLAKNFLKISSGNELKSKIESILDCIKNSCIDTLYIENNILSEIDPKK NVVYFINSDLFEVKRINDKEKVLANIYKAVSSEGCCIKSIITDKYVRKSFLIAFGGYRKVEKDKGLDIGFIKNYLCETCE TVSSFNIVDFLLSEGSFMSDYILQYEHRNSLLRFKLISDNSNNSYLIGYILHSSYFKKIDIKYVRCILEKLTYCVI ; ;MEELLMSLKLKALYPLTGGYNRHSINPFYEELVRPTEIKGLWRWWNRVLFNTLAYSTKGKLYTYESIDRLFEDVFGSENK KSAVRLEVITDEGNDNRFELSYVELDKVIDCLRNYKRKVSLDFIDNTLIAEIEGSTKIPISFKSNLDIDKIIKDLVHNNK LLSFELLGFKSVEIDATKISDKKILKEILRDLITNYLEYFNIKQEVTFTLNIYLDKSREHKQNFEDKLKFALYSLLVFIL LGGIGRKTSRGFGSLSIIDVKCYDNSICKKIEDLAKNFLKISSGNELKSKIESILDCIKNSCIDTLYIENNILSEIDPKK NVVYFINSDLFEVKRINDKEKVLANIYKAVSSEGCCIKSIITDKYVRKSFLIAFGGYRKVEKDKGLDIGFIKNYLCETCE TVSSFNIVDFLLSEGSFMSDYILQYEHRNSLLRFKLISDNSNNSYLIGYILHSSYFKKIDIKYVRCILEKLTYCVI ; J ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSIDNVLREFLDYKIIALLHDPPNKAWVITGRARNLTQQLSNIRASRKHEKVAKYIINQLFGKNYSEKVDNADKLASSID RYLGSIVYKERSLFENRSIFLKNILLSNIQRDIGNLFPKDKSKLDNLILEYKKLLNVINKTNLILKYQLFYLIYELVWID SKYENTPSDTRNPTHTIFDHLYATAAMMNWILSLEKEAKGYLLGIDTIGVADFISKGRKTRDLWISSYLVSALLWYVITW FIEEYGPDVILFPSLRFNQFYAFYLLEKLRKEGVSEDVIDEIKELITKYIFNGDDLFENLKIPPYPIIPGRITLILPGLI REGEEYKKVQDDNCFISKVKERYNEGWRKLIEGLRCYSERKREDGFWNLVCRVLKLTEDLLQTTPLNIRVKQVSVTEDEI FNNNKLRSDSWKIYDNKYRQLVSEFKKSKLVKVTPESRLKLFELTKFDKLPQIGEKSKRGYEFCTSCGVLPAVVIMPKED ELEKKLIDLGIARDEKDVRSIKNMISPGERLCPWCLVKRALGAEPRLMRILLLGDLYSVEKIVNEIVSRDVKIEIPSTSD IASIKTFEEMIEKKNEICEDLKEEEVCEKPSESVLSMWQWFNKNYYNGINLTIDPEEYWFSEKRRRYYFSVFRRHRITFP SPYYALVRADSDYLGDLLEGKLTPYLAGIIDSGDYANISEKKEEVNKLLEEYLVNAGSGSIVDYVKTVLKCIRENLNKCS CAEKIYSNEVAKVMFRVNVEKANVEEEVKNSLEYFETILNEGRIIVTPAWHVSISSALNRGLLVELELVNKHKGFVIYAG GDDLLAMLPVDEVLDFIKESRRAFAGFGTEKLGNMCLENGFVRINNAYYPSLPIVGRSYSVIIAHYADPLFFVINDSYNL LEEGKEIIRYRVMYNGEYKDAKKDVAIFRYQGLTSVIPLSLKRPIVSSVSDFNEIASIIDVILELKKRIDEGRISVSLLY DYEKYKHLIVASDEKYLTEFLVKDWIKRNSLRKHVEFTIDEKLYGVRLTIENYPIKIPNDLISNIVYTLRIIYGGEK ; ;MSIDNVLREFLDYKIIALLHDPPNKAWVITGRARNLTQQLSNIRASRKHEKVAKYIINQLFGKNYSEKVDNADKLASSID RYLGSIVYKERSLFENRSIFLKNILLSNIQRDIGNLFPKDKSKLDNLILEYKKLLNVINKTNLILKYQLFYLIYELVWID SKYENTPSDTRNPTHTIFDHLYATAAMMNWILSLEKEAKGYLLGIDTIGVADFISKGRKTRDLWISSYLVSALLWYVITW FIEEYGPDVILFPSLRFNQFYAFYLLEKLRKEGVSEDVIDEIKELITKYIFNGDDLFENLKIPPYPIIPGRITLILPGLI REGEEYKKVQDDNCFISKVKERYNEGWRKLIEGLRCYSERKREDGFWNLVCRVLKLTEDLLQTTPLNIRVKQVSVTEDEI FNNNKLRSDSWKIYDNKYRQLVSEFKKSKLVKVTPESRLKLFELTKFDKLPQIGEKSKRGYEFCTSCGVLPAVVIMPKED ELEKKLIDLGIARDEKDVRSIKNMISPGERLCPWCLVKRALGAEPRLMRILLLGDLYSVEKIVNEIVSRDVKIEIPSTSD IASIKTFEEMIEKKNEICEDLKEEEVCEKPSESVLSMWQWFNKNYYNGINLTIDPEEYWFSEKRRRYYFSVFRRHRITFP SPYYALVRADSDYLGDLLEGKLTPYLAGIIDSGDYANISEKKEEVNKLLEEYLVNAGSGSIVDYVKTVLKCIRENLNKCS CAEKIYSNEVAKVMFRVNVEKANVEEEVKNSLEYFETILNEGRIIVTPAWHVSISSALNRGLLVELELVNKHKGFVIYAG GDDLLAMLPVDEVLDFIKESRRAFAGFGTEKLGNMCLENGFVRINNAYYPSLPIVGRSYSVIIAHYADPLFFVINDSYNL LEEGKEIIRYRVMYNGEYKDAKKDVAIFRYQGLTSVIPLSLKRPIVSSVSDFNEIASIIDVILELKKRIDEGRISVSLLY DYEKYKHLIVASDEKYLTEFLVKDWIKRNSLRKHVEFTIDEKLYGVRLTIENYPIKIPNDLISNIVYTLRIIYGGEK ; K ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSTQREYVFIPITNSITIDVKITIGGSDHITNIDERGIHNVLVITGYAVDEKNGRLVPTLDPCDYVKGILVAGTPQQAQS NDFLTLKLPANKLYLIRKKGNISDDLKIYIPYSSPDARNSMKTKPVSISDDTIVNNIIKEVFDKIYNITQKEKVKIEKVK EDIKELFSYYALEQ ; ;MSTQREYVFIPITNSITIDVKITIGGSDHITNIDERGIHNVLVITGYAVDEKNGRLVPTLDPCDYVKGILVAGTPQQAQS NDFLTLKLPANKLYLIRKKGNISDDLKIYIPYSSPDARNSMKTKPVSISDDTIVNNIIKEVFDKIYNITQKEKVKIEKVK EDIKELFSYYALEQ ; L,M,N,O,P,Q,R,S,T,W,X,l,m,n,o,p,q,r,s,t,w,x,Z,z,Y,y ? 8 polyribonucleotide no no UGUUAAGUCUGGUUUCCCUCCAGGGUAUCUAAGCUUUGAAAAAAAA UGUUAAGUCUGGUUUCCCUCCAGGGUAUCUAAGCUUUGAAAAAAAA U ? 9 polyribonucleotide no no AUUGAAAGUUCAAAGCUUAGAUACCCUGGAGGGAAACCAGACUUAACACCA AUUGAAAGUUCAAAGCUUAGAUACCCUGGAGGGAAACCAGACUUAACACCA V ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LEU n 1 3 TYR n 1 4 GLU n 1 5 GLU n 1 6 ASP n 1 7 TYR n 1 8 LYS n 1 9 LEU n 1 10 ALA n 1 11 LEU n 1 12 GLU n 1 13 ALA n 1 14 PHE n 1 15 LYS n 1 16 LYS n 1 17 VAL n 1 18 PHE n 1 19 ASN n 1 20 ALA n 1 21 LEU n 1 22 THR n 1 23 HIS n 1 24 TYR n 1 25 GLY n 1 26 ALA n 1 27 LYS n 1 28 GLN n 1 29 ALA n 1 30 PHE n 1 31 ARG n 1 32 SER n 1 33 ARG n 1 34 ALA n 1 35 ARG n 1 36 ASP n 1 37 LEU n 1 38 VAL n 1 39 GLU n 1 40 GLU n 1 41 ILE n 1 42 TYR n 1 43 ASN n 1 44 SER n 1 45 GLY n 1 46 PHE n 1 47 ILE n 1 48 PRO n 1 49 THR n 1 50 PHE n 1 51 PHE n 1 52 TYR n 1 53 ILE n 1 54 ILE n 1 55 SER n 1 56 LYS n 1 57 ALA n 1 58 GLU n 1 59 LEU n 1 60 ASN n 1 61 SER n 1 62 ASP n 1 63 SER n 1 64 LEU n 1 65 ASP n 1 66 SER n 1 67 LEU n 1 68 ILE n 1 69 SER n 1 70 LEU n 1 71 PHE n 1 72 SER n 1 73 SER n 1 74 ASP n 1 75 ASN n 1 76 ALA n 1 77 ILE n 1 78 LEU n 1 79 ARG n 1 80 GLY n 1 81 SER n 1 82 ASP n 1 83 GLU n 1 84 ASN n 1 85 VAL n 1 86 SER n 1 87 TYR n 1 88 SER n 1 89 ALA n 1 90 TYR n 1 91 LEU n 1 92 PHE n 1 93 ILE n 1 94 ILE n 1 95 LEU n 1 96 TYR n 1 97 TYR n 1 98 LEU n 1 99 ILE n 1 100 LYS n 1 101 ARG n 1 102 GLY n 1 103 ILE n 1 104 ILE n 1 105 GLU n 1 106 GLN n 1 107 LYS n 1 108 PHE n 1 109 LEU n 1 110 ILE n 1 111 GLN n 1 112 ALA n 1 113 LEU n 1 114 ARG n 1 115 CYS n 1 116 GLU n 1 117 LYS n 1 118 THR n 1 119 ARG n 1 120 LEU n 1 121 ASP n 1 122 LEU n 1 123 ILE n 1 124 ASP n 1 125 LYS n 1 126 LEU n 1 127 TYR n 1 128 ASN n 1 129 LEU n 1 130 ALA n 1 131 PRO n 1 132 ILE n 1 133 ILE n 1 134 SER n 1 135 ALA n 1 136 LYS n 1 137 ILE n 1 138 ARG n 1 139 THR n 1 140 TYR n 1 141 LEU n 1 142 LEU n 1 143 ALA n 1 144 ILE n 1 145 LYS n 1 146 ARG n 1 147 LEU n 1 148 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'Sulfolobus islandicus REY15A' 930945 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 8 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 46 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP F0NDX5_SULIR F0NDX5 ? 1 ;MLYEEDYKLALEAFKKVFNALTHYGAKQAFRSRARDLVEEIYNSGFIPTFFYIISKAELNSDSLDSLISLFSSDNAILRG SDENVSYSAYLFIILYYLIKRGIIEQKFLIQALRCEKTRLDLIDKLYNLAPIISAKIRTYLLAIKRLSEALIEAR ; 1 2 UNP F0NDX6_SULIR F0NDX6 ? 2 ;MPYYAFAEPFFIHAITHLHVGSGSSVEEEIDLPFQRDELGYPTIYASSLKGAIKSFLLKEFPDKRDVIYKVLGEDENPEE ASLGTFLDAILFAIPSRIIEIDSAKPYVWVYVTTYELLKKVKLYLDSISQLSNASFSNLKNKIDTILAKEGKNITLDSDL KSAILNEDFYVELEALNNKIPSIINAGVPLLVLEDSIGREVINRSLIRVRRIRIDRDKKVVETGGLWSEEYVPMKTIFFS VLLGKESKESAIFASCILRNLRYVILGGKETIGKGIVELRWVKDVI ; 1 3 UNP F0NDX1_SULIR F0NDX1 ? 3 ;MKRVLIKPLEPLMFRSQGEFEPLITGSHTAAQSLIIPRPSTIAGMLGYILFNKSSGTGDWLSDLTNLLATIYGTFIETNG EYLFPLRMGNHLALVDQQHLINLPTLLEKEYERREKGIYELFYDKNKLFQIINHQDRIGISIDKSTRTVKEHYLYSARYL AFKKEVNYVIFIDNDAISDKINGKIVNFGGENRIAKLEVDDYKVDTSIEEEYYLALSPILIPDEALDNFLDNISDYVAMG KVDKISLGFDIANTKRKEMLTAILEGSIVKRSIIDFIKNEIKNDLRYRFSKYEKIGYNTLMSLCKLALRKILS ; 1 4 UNP F0NDX3_SULIR F0NDX3 ? 4 ;MAIDFLVNILELIKEKQCNINLFSAISLTSIVYNNFGEFLSNNQSYSTNNPLLKYHIIILNDKNKTKDVEEKRNIFKREV AELISRNFKLDGEKVRNYFDSLKEVLKSLKYTIVDVEITTRTRALIGVSTSLGKLIFGSGISFDPYMNLPYIPASEIKGI VRSYIEGKLGEQEAEEIFGNEEREGNVNFTDAYPTRSKDFLFVPDVITPHYNGKKSEADAEPRPVIHLTIAPKVTFRFLI YYKREDVGKPICDSMPIILIRGLGARSSVGYSLFELRKIEVIK ; 1 5 PDB 6SH8 6SH8 ? 5 ? 1 6 UNP F0NDX4_SULIR F0NDX4 ? 5 ;MSLKLKALYPLTGGYNRHSINPFYEELVRPTEIKGLWRWWNRVLFNTLAYSTKGKLYTYESIDRLFEDVFGSENKKSAVR LEVITDEGNDNRFELSYVELDKVIDCLRNYKRKVSLDFIDNTLIAEIEGSTKIPISFKSNLDIDKIIKDLVHNNKLLSFE LLGFKSVEIDATKISDKKILKEILRDLITNYLEYFNIKQEVTFTLNIYLDKSREHKQNFEDKLKFALYSLLVFILLGGIG RKTSRGFGSLSIIDVKCYDNSICKKIEDLAKNFLKISSGNELKSKIESILDCIKNSCIDTLYIENNILSEIDPKKNVVYF INSDLFEVKRINDKEKVLANIYKAVSSEGCCIKSIITDKYVRKSFLIAFGGYRKVEKDKGLDIGFIKNYLCETCETVSSF NIVDFLLSEGSFMSDYILQYEHRNSLLRFKLISDNSNNSYLIGYILHSSYFKKIDIKYVRCILEKLTYCVI ; 1 7 UNP F0NDX2_SULIR F0NDX2 ? 6 ;MSIDNVLREFLDYKIIALLHDPPNKAWVITGRARNLTQQLSNIRASRKHEKVAKYIINQLFGKNYSEKVDNADKLASSID RYLGSIVYKERSLFENRSIFLKNILLSNIQRDIGNLFPKDKSKLDNLILEYKKLLNVINKTNLILKYQLFYLIYELVWID SKYENTPSDTRNPTHTIFDHLYATAAMMNWILSLEKEAKGYLLGIDTIGVADFISKGRKTRDLWISSYLVSALLWYVITW FIEEYGPDVILFPSLRFNQFYAFYLLEKLRKEGVSEDVIDEIKELITKYIFNGDDLFENLKIPPYPIIPGRITLILPGLI REGEEYKKVQDDNCFISKVKERYNEGWRKLIEGLRCYSERKREDGFWNLVCRVLKLTEDLLQTTPLNIRVKQVSVTEDEI FNNNKLRSDSWKIYDNKYRQLVSEFKKSKLVKVTPESRLKLFELTKFDKLPQIGEKSKRGYEFCTSCGVLPAVVIMPKED ELEKKLIDLGIARDEKDVRSIKNMISPGERLCPWCLVKRALGAEPRLMRILLLGDLYSVEKIVNEIVSRDVKIEIPSTSD IASIKTFEEMIEKKNEICEDLKEEEVCEKPSESVLSMWQWFNKNYYNGINLTIDPEEYWFSEKRRRYYFSVFRRHRITFP SPYYALVRADSDYLGDLLEGKLTPYLAGIIDSGDYANISEKKEEVNKLLEEYLVNAGSGSIVDYVKTVLKCIRENLNKCS CAEKIYSNEVAKVMFRVNVEKANVEEEVKNSLEYFETILNEGRIIVTPAWHVSISSALNRGLLVELELVNKHKGFVIYAG GDDLLAMLPVDEVLDFIKESRRAFAGFGTEKLGNMCLENGFVRINNAYYPSLPIVGRSYSVIIAHYADPLFFVINDSYNL LEEGKEIIRYRVMYNGEYKDAKKDVAIFRYQGLTSVIPLSLKRPIVSSVSDFNEIASIIDVILELKKRIDEGRISVSLLY DYEKYKHLIVASDEKYLTEFLVKDWIKRNSLRKHVEFTIDEKLYGVRLTIENYPIKIPNDLISNIVYTLRIIYGGEK ; 1 8 UNP F0NDX7_SULIR F0NDX7 ? 7 ;MSTQREYVFIPITNSITIDVKITIGGSDHITNIDERGIHNVLVITGYAVDEKNGRLVPTLDPCDYVKGILVAGTPQQAQS NDFLTLKLPANKLYLIRKKGNISDDLKIYIPYSSPDARNSMKTKPVSISDDTIVNNIIKEVFDKIYNITQKEKVKIEKVK EDIKELFSYYALEQ ; 1 9 PDB 6SH8 6SH8 ? 8 ? 1 10 GB CP002425.1 323473489 ? 9 CUGGAAAGUUCAAAGCUUAGAUACCCUGGAGGGAAACCAGACUUAACACCA 2068518 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6SH8 A 1 ? 155 ? 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U U 3 V A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? HA U 3 O4 ? ? ? 1_555 IA A 46 N6 ? ? U U 3 V A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? HA U 4 N3 ? ? ? 1_555 IA A 45 N1 ? ? U U 4 V A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? HA U 4 O4 ? ? ? 1_555 IA A 45 N6 ? ? U U 4 V A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? HA A 5 N1 ? ? ? 1_555 IA U 44 N3 ? ? U A 5 V U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? HA A 5 N6 ? ? ? 1_555 IA U 44 O4 ? ? U A 5 V U 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? HA A 6 N1 ? ? ? 1_555 IA U 43 N3 ? ? U A 6 V U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? HA A 6 N6 ? ? ? 1_555 IA U 43 O4 ? ? U A 6 V U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? HA G 7 N1 ? ? ? 1_555 IA C 42 N3 ? ? U G 7 V C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? HA G 7 N2 ? ? ? 1_555 IA C 42 O2 ? ? U G 7 V C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? HA G 7 O6 ? ? ? 1_555 IA C 42 N4 ? ? U G 7 V C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? HA U 8 N3 ? ? ? 1_555 IA A 41 N1 ? ? U U 8 V A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? HA U 8 O4 ? ? ? 1_555 IA A 41 N6 ? ? U U 8 V A 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? HA C 9 N3 ? ? ? 1_555 IA G 40 N1 ? ? U C 9 V G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? HA C 9 N4 ? ? ? 1_555 IA G 40 O6 ? ? U C 9 V G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? HA C 9 O2 ? ? ? 1_555 IA G 40 N2 ? ? U C 9 V G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? HA U 10 N3 ? ? ? 1_555 IA A 39 N1 ? ? U U 10 V A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? HA U 10 O4 ? ? ? 1_555 IA A 39 N6 ? ? U U 10 V A 39 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? HA G 12 N1 ? ? ? 1_555 IA C 37 N3 ? ? U G 12 V C 37 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? HA C 16 N4 ? ? ? 1_555 IA G 33 O6 ? ? U C 16 V G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? HA C 16 O2 ? ? ? 1_555 IA G 33 N2 ? ? U C 16 V G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? HA C 18 N3 ? ? ? 1_555 IA G 31 N1 ? ? U C 18 V G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? HA C 18 N4 ? ? ? 1_555 IA G 31 O6 ? ? U C 18 V G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? HA C 18 O2 ? ? ? 1_555 IA G 31 N2 ? ? U C 18 V G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? HA U 19 N3 ? ? ? 1_555 IA A 30 N1 ? ? U U 19 V A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? HA U 19 O4 ? ? ? 1_555 IA A 30 N6 ? ? U U 19 V A 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? HA C 20 N3 ? ? ? 1_555 IA G 29 N1 ? ? U C 20 V G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? HA C 20 N4 ? ? ? 1_555 IA G 29 O6 ? ? U C 20 V G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? HA C 20 O2 ? ? ? 1_555 IA G 29 N2 ? ? U C 20 V G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? HA C 21 N3 ? ? ? 1_555 IA G 28 N1 ? ? U C 21 V G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? HA C 21 N4 ? ? ? 1_555 IA G 28 O6 ? ? U C 21 V G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? HA C 21 O2 ? ? ? 1_555 IA G 28 N2 ? ? U C 21 V G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? HA A 22 N1 ? ? ? 1_555 IA U 27 N3 ? ? U A 22 V U 27 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? HA G 24 N1 ? ? ? 1_555 IA C 25 N3 ? ? U G 24 V C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? HA G 24 N2 ? ? ? 1_555 IA C 25 O2 ? ? U G 24 V C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? HA G 24 O6 ? ? ? 1_555 IA C 25 N4 ? ? U G 24 V C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? HA G 25 N1 ? ? ? 1_555 IA C 24 O2 ? ? U G 25 V C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? HA G 25 N2 ? ? ? 1_555 IA C 24 N3 ? ? U G 25 V C 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? HA U 26 N3 ? ? ? 1_555 IA A 23 N1 ? ? U U 26 V A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? HA U 26 O4 ? ? ? 1_555 IA A 23 N6 ? ? U U 26 V A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? HA A 27 N1 ? ? ? 1_555 IA U 22 N3 ? ? U A 27 V U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? HA A 27 N6 ? ? ? 1_555 IA U 22 O4 ? ? U A 27 V U 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? HA U 28 N3 ? ? ? 1_555 IA A 21 N1 ? ? U U 28 V A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? HA U 28 O4 ? ? ? 1_555 IA A 21 N6 ? ? U U 28 V A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? HA U 36 N3 ? ? ? 1_555 IA A 13 N1 ? ? U U 36 V A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? HA U 36 O4 ? ? ? 1_555 IA A 13 N6 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 252 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id K _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id PHE _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 252 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id K _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 253 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 K _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 253 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 K _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -3.61 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 3 ? C ? 2 ? D ? 2 ? 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I HIS 287 18 1 Y 1 I HIS 288 ? I HIS 288 19 1 Y 1 I HIS 289 ? I HIS 289 20 1 Y 1 I HIS 290 ? I HIS 290 21 1 Y 1 I HIS 291 ? I HIS 291 22 1 Y 1 I HIS 292 ? I HIS 292 23 1 Y 1 I HIS 293 ? I HIS 293 24 1 Y 1 I HIS 294 ? I HIS 294 25 1 Y 1 I HIS 295 ? I HIS 295 26 1 Y 1 I HIS 296 ? I HIS 296 27 1 Y 1 J MET 1 ? J MET 1 28 1 Y 1 J LYS 382 ? J LYS 382 29 1 Y 1 J ASP 383 ? J ASP 383 30 1 Y 1 J LYS 384 ? J LYS 384 31 1 Y 1 J GLY 385 ? J GLY 385 32 1 Y 1 J LEU 386 ? J LEU 386 33 1 Y 1 J ASP 387 ? J ASP 387 34 1 Y 1 J ILE 388 ? J ILE 388 35 1 Y 1 J GLY 389 ? J GLY 389 36 1 Y 1 K MET 1 ? K MET 1 37 1 Y 1 K SER 2 ? K SER 2 38 1 Y 1 K ILE 3 ? K ILE 3 39 1 Y 1 K ASP 4 ? K ASP 4 40 1 Y 1 K ASN 5 ? K ASN 5 41 1 Y 1 K VAL 6 ? K VAL 6 42 1 Y 1 K LEU 7 ? K LEU 7 43 1 Y 1 K ARG 8 ? K ARG 8 44 1 Y 1 K ASN 42 ? K ASN 42 45 1 Y 1 K ILE 43 ? K ILE 43 46 1 Y 1 K ARG 44 ? K ARG 44 47 1 Y 1 K ALA 45 ? K ALA 45 48 1 Y 1 K SER 46 ? K SER 46 49 1 Y 1 L MET 1 ? L MET 1 50 1 Y 1 M MET 1 ? M MET 1 51 1 Y 1 N MET 1 ? N MET 1 52 1 Y 1 O MET 1 ? O MET 1 53 1 Y 1 P MET 1 ? P MET 1 54 1 Y 1 Q MET 1 ? Q MET 1 55 1 Y 1 R MET 1 ? R MET 1 56 1 Y 1 S MET 1 ? S MET 1 57 1 Y 1 T MET 1 ? T MET 1 58 1 Y 1 W MET 1 ? U MET 1 59 1 Y 1 X MET 1 ? V MET 1 60 1 Y 1 l MET 1 ? W MET 1 61 1 Y 1 m MET 1 ? X MET 1 62 1 Y 1 n MET 1 ? Y MET 1 63 1 Y 1 o MET 1 ? Z MET 1 64 1 Y 1 p MET 1 ? AA MET 1 65 1 Y 1 q MET 1 ? BA MET 1 66 1 Y 1 r MET 1 ? CA MET 1 67 1 Y 1 s MET 1 ? DA MET 1 68 1 Y 1 t MET 1 ? EA MET 1 69 1 Y 1 w MET 1 ? FA MET 1 70 1 Y 1 x MET 1 ? GA MET 1 71 1 Y 1 U U 1 ? HA U 1 72 1 Y 1 U U 30 ? HA U 30 73 1 Y 1 U A 31 ? HA A 31 74 1 Y 1 U A 32 ? HA A 32 75 1 Y 1 U G 33 ? HA G 33 76 1 Y 1 U C 34 ? HA C 34 77 1 Y 1 U U 35 ? HA U 35 78 1 Y 1 U A 40 ? HA A 40 79 1 Y 1 U A 41 ? HA A 41 80 1 Y 1 U A 42 ? HA A 42 81 1 Y 1 U A 43 ? HA A 43 82 1 Y 1 U A 44 ? HA A 44 83 1 Y 1 U A 45 ? HA A 45 84 1 Y 1 U A 46 ? HA A 46 85 1 Y 1 V C 49 ? IA C 49 86 1 Y 1 V C 50 ? IA C 50 87 1 Y 1 V A 51 ? IA A 51 88 1 Y 1 Z MET 1 ? JA MET 1 89 1 Y 1 z MET 1 ? KA MET 1 90 1 Y 1 Y MET 1 ? LA MET 1 91 1 Y 1 y MET 1 ? MA MET 1 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 0.15 M NaCl 'sodium chloride' 1 2 0.01 M ? MES 1 3 1 mM CaCl2 'Calcium Chloride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag YES _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.9 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 5 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 2 6 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 3 7 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 4 8 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 5 9 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 6 2 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 7 3 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 8 4 ? ? 930945 ? ? 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? 9 10 ? ? 32630 ? ? 'synthetic construct' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain ? 2 1 930945 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? ? 3 2 930945 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? ? 4 3 930945 'Sulfolobus islandicus REY15A' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 41 _em_image_recording.average_exposure_time 40 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 5298 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 429000 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf 1.06 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 8 'MODEL FITTING' ? Coot ? ? 1 ? 9 'MODEL FITTING' map_to_model PHENIX ? ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? 12 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' beta RELION 3.0 1 ? ? 13 'FINAL EULER ASSIGNMENT' beta cisTEM 1.0 1 ? ? 14 CLASSIFICATION beta cisTEM 1.0 1 ? ? 15 RECONSTRUCTION beta cisTEM 1.0 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.8 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6SH8 'double helix' 6SH8 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 HA G 2 1_555 IA C 47 1_555 -0.972 -0.203 0.043 12.496 -14.066 16.608 1 U_G2:C47_V U 2 ? V 47 ? 19 1 1 HA U 3 1_555 IA A 46 1_555 0.875 -0.352 -1.378 2.532 -19.918 -10.660 2 U_U3:A46_V U 3 ? V 46 ? 20 1 1 HA U 4 1_555 IA A 45 1_555 0.111 -0.557 0.708 -15.957 -3.468 -4.959 3 U_U4:A45_V U 4 ? V 45 ? 20 1 1 HA A 5 1_555 IA U 44 1_555 -0.174 0.215 0.096 16.716 -10.912 6.999 4 U_A5:U44_V U 5 ? V 44 ? 20 1 1 HA A 6 1_555 IA U 43 1_555 0.208 0.299 0.470 37.179 -7.480 -1.179 5 U_A6:U43_V U 6 ? V 43 ? 20 1 1 HA G 7 1_555 IA C 42 1_555 -0.421 -0.495 0.103 -19.054 5.220 -6.632 6 U_G7:C42_V U 7 ? V 42 ? 19 1 1 HA U 8 1_555 IA A 41 1_555 -0.091 -0.362 0.411 -10.086 10.036 -1.487 7 U_U8:A41_V U 8 ? V 41 ? 20 1 1 HA C 9 1_555 IA G 40 1_555 -0.161 0.147 0.370 -5.183 11.141 5.654 8 U_C9:G40_V U 9 ? V 40 ? 19 1 1 HA U 10 1_555 IA A 39 1_555 -0.263 -0.184 -0.488 6.955 48.581 7.947 9 U_U10:A39_V U 10 ? V 39 ? 20 1 1 HA G 12 1_555 IA C 37 1_555 0.185 0.178 -0.891 -32.548 9.719 13.021 10 U_G12:C37_V U 12 ? V 37 ? 19 1 1 HA U 13 1_555 IA A 36 1_555 -0.127 -0.046 0.358 -17.732 10.892 4.570 11 U_U13:A36_V U 13 ? V 36 ? 20 1 1 HA U 14 1_555 IA A 35 1_555 0.026 -0.419 0.103 -3.127 11.780 -1.141 12 U_U14:A35_V U 14 ? V 35 ? 20 1 1 HA U 15 1_555 IA A 34 1_555 -0.599 -0.269 0.138 5.494 7.886 -12.342 13 U_U15:A34_V U 15 ? V 34 ? 20 1 1 HA C 16 1_555 IA G 33 1_555 -0.180 -0.113 -0.973 16.949 28.014 8.159 14 U_C16:G33_V U 16 ? V 33 ? 19 1 1 HA C 18 1_555 IA G 31 1_555 -0.080 -0.039 -0.505 -16.439 -1.410 3.161 15 U_C18:G31_V U 18 ? V 31 ? 19 1 1 HA U 19 1_555 IA A 30 1_555 0.018 -0.452 0.199 -16.488 6.921 -2.056 16 U_U19:A30_V U 19 ? V 30 ? 20 1 1 HA C 20 1_555 IA G 29 1_555 0.458 -0.199 0.105 -16.125 -5.462 7.495 17 U_C20:G29_V U 20 ? V 29 ? 19 1 1 HA C 21 1_555 IA G 28 1_555 0.043 0.096 -0.076 -2.764 2.266 7.718 18 U_C21:G28_V U 21 ? V 28 ? 19 1 1 HA A 22 1_555 IA U 27 1_555 -0.569 0.461 -0.534 18.953 36.135 24.101 19 U_A22:U27_V U 22 ? V 27 ? ? 1 1 HA G 24 1_555 IA C 25 1_555 0.005 -0.068 -0.477 -31.026 -4.392 1.454 20 U_G24:C25_V U 24 ? V 25 ? 19 1 1 HA G 25 1_555 IA C 24 1_555 -0.302 -0.751 -0.310 -10.817 7.347 2.062 21 U_G25:C24_V U 25 ? V 24 ? 22 1 1 HA U 26 1_555 IA A 23 1_555 0.318 -0.559 0.461 -5.729 -3.017 6.205 22 U_U26:A23_V U 26 ? V 23 ? 20 1 1 HA A 27 1_555 IA U 22 1_555 0.328 -0.334 0.376 -8.039 2.106 4.641 23 U_A27:U22_V U 27 ? V 22 ? 20 1 1 HA U 28 1_555 IA A 21 1_555 -0.307 -0.179 -0.518 9.769 40.031 13.738 24 U_U28:A21_V U 28 ? V 21 ? 20 1 1 HA U 36 1_555 IA A 13 1_555 -0.190 -0.568 -0.041 -30.158 4.135 -1.245 25 U_U36:A13_V U 36 ? V 13 ? 20 1 1 HA U 37 1_555 IA A 12 1_555 -0.143 0.160 0.229 -12.916 2.951 24.715 26 U_U37:A12_V U 37 ? V 12 ? ? 1 1 HA G 38 1_555 IA C 11 1_555 -1.649 -0.640 -0.034 -10.815 -22.511 12.791 27 U_G38:C11_V U 38 ? V 11 ? 19 1 1 HA A 39 1_555 IA U 10 1_555 -0.229 -0.895 0.641 -15.323 -28.592 -17.421 28 U_A39:U10_V U 39 ? 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