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'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 237 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 76 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 111 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 150 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 70 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample 1 437 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample 1 149 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample 1 110 ? 'Thermosynechococcus elongatus (strain BP-1)' 197221 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NU1C_THEEB Q8DL32 ? 1 ;MESGIDLQGQFISALQSLGLSHDLAKLLWLPLPMLMMLIVATVGVLVAVWLERKISAAVQQRIGPEYIGPLGILAPLADG LKLIFKEDVLPANSDRWLFTLGPAVVVIPVFLSYIIVPFGQNLLISNLAMGVFLWIALSSIAPIGLLMAGYASNNKYSLL GGLRAAAQSISYEIPLALAVLAVAMMSNGLGTVEIVEQQSQYGILSWNVWRQPIGFLVFWIAALAECERLPFDLPEAEEE LVAGYQTEYAGMKFALFYLGAYVNLVLSALLVSVLYFGGWSFPIPLETIANLLGVSETNPFLQIAFAVLGITMTLIKAYF FVFLAILLRWTVPRVRIDQLLDLGWKFLLPVGLVNLLLTAGLKLAFPVAFGG ; 1 2 UNP NU2C_THEEB Q8DMR6 ? 2 ;MDLVTLAGQLNAGTILPETILIVTLLVVLLADLIQGRQADRWTPYFAIVGLGGAIATMIPLWTQPATISFFGSFISDHLS LFFRGLIALSALGTILMSIRYVEQTGSSLGEFMTILLTATVGGMFIAGAQELVFIFVALETLSIASYLLTGYTKRDSRSN EAALKYLLIGAASSAIFLYGSSLLYGLSGGHTQLPAIAQALSSESLGLVVALVFVIAGISFKISAVPFHQWTPDVYEGAP TPVVAFLSVGSKAAGFALAIRFLTLAFPSVTDQWQLIFTVLAILSMILGNVVALAQTSMKRMLAYSSIGQAGFVMIGFVV GTEAGYASMLFYLLVYLFMNLGAFTCVILFSLRTGTDQISEYAGLYQKDPLLTLGLSLCLLSLGGIPPLAGFFGKIYLFW AGWQAGAYGLVLLGLLTSVISIYYYIRVVKMMVVKEPQEMSEAVRNYPEVSWSSFGLRPLQVGLVMTVIATSLAGILANP LFNLVNTAVWDVPQLANQPTVMEVAYQALSPAGKS ; 1 3 UNP NU3C_THEEB Q8DJ02 ? 3 ;MVAIPRLRDTATVFVLSGYEYFLGFLIICSLVPVLALAASALLRPKSGRMIRLTTYESGMEPIGGAWIQFNVRYYMFALV FVIFDVETVFLYPWAVAFHQLGLLAFIEALIFIAILVVALVYAWRKRALEWS ; 1 4 UNP Q8DKF4_THEEB Q8DKF4 ? 4 ;MLHSLRFLPMLTLLIVLPVIGALLMPLLPERVLRSVALVIAGLTFALSLWMLTQFDVHQSALQFTEFVPWLLPLGLNYSL GVDGLSLPLIVLGTFLTLGVVFTGEKTGQRLFYALVLLANAGITGALAAQNLLLFFLFYELELVPFYLLILIWGGQRREQ AAVKFLIYTAVSGILVLAAFLAMGWLTHAPSFDSADIQIAGLAPTTQGILLLLLILGFGIKMPLVPLHSWLPDAYVEAST PTAILLGGALAKLGAYGLVRFALGYFPEAWAQFSGLLAIVAAVGIAYGALAAIAQKDIKRMVAYSSIGHMSYVLLAAAAH THLSMVGAIAQMISHGLILALLFYLVGVIETKVGTRELNVLNGLLNPLRGLPTTSALLILGGMASAGIPGLVGFVAEFLI FQGSYGMFPLPTLVAVVGTGLTAVYFVIMINRTCFGRLDNRTAYYPRVVWSEKMPALVLTLLIVFLGVQPTWLVRWSETT SAQIVAAVPRTNELVATLAKR ; 1 5 UNP Q8DL29_THEEB Q8DL29 ? 5 ;MQLTYVLILAALLFCIGIYGLVTSRNAVRVLMSIELLLNAVNLNLIGFANYLDGQQIKGQVFAVFVITVAAAEAAVGLAI ILAIYRNRDTVDMEKFNLLKW ; 1 6 UNP Q8DKF5_THEEB Q8DKF5 ? 6 ;MLQSFADTVWLIPFYSLAGMVLSLIWSPGITRKTGPRPAGYLNILLTFFSFVHALLATVAIANQPPQYLHWTWLDVAGLH LDIPVEISILTTTALMLITALNLMAQVFAVGYMEMDWGWARFFALLALFEGGMGALVLLDSLFFNYVVLEILTLATYLLI GLWFNQPLVVTGARDAFLTKRVGDLVLLMGVLAIYPLAGSWNYDDLAAWAATAQVNSTLITLICLALIAGPMGKCAQFPL HLWLDEAMEGPIPASILRNAVVVATGAWVLVKLTPVLSLSPVALTALLVIGSVTALGGTLIAIAQVDIKRALSYLVSAYM GWVFIAVGLKEPGLAFVFILTYSLAMAVLMMSIGSIIWNSVTQDLRLLGGLWSRRPISGISFLVGSAGLLAVPPLASFFP QAELLDTAFAQLPWVGGVLLLMNTFAAFSLGRTFCLVWGGEVKPMTARSPEVFWPMILPMTVDLGLVLHLPILMARFDWV IWTQPSLATAAALTITALLGWGVAAWVYLGKAIPKPVQFPLPSVQNLLAYDFYTPKLYRATVVGVVDMISRITAWFDRTF VDGTGNAFGVVTLLGGDRLKYSTTGQSQAYILTILMGIAILVIAICWPLLA ; 1 7 UNP Q8DL30_THEEB Q8DL30 ? 7 ;MDLATLTQTITFFALAAAVIIAALGVVLLDNVVYSAFLLGGVFLSIAGLYILMNADFVSAAQILIYVGAVNVLILFAIML VNKRETYTPVPGRWLRQGGAAVVSLGVFALLTKMILQTPWQLSSVPPTPDSITTIGQHFFSDFLLPFELASVLLLMALIG AVVLARRELVLEPEPILGEEVVPPLELPERPREPVALSEK ; 1 8 UNP NDHH_THEEB Q8DJD9 ? 8 ;MPKIETRTEPMVINMGPHHPSMHGVLRLMVTLDGEDVIDCEPVIGYLHRGMEKIAENRTNIMFIPYVSRWDYAAGMFNEA VTVNAPEKLAGIPVPKRASYIRVIMLELNRIANHLLWLGPFLADVGAQTPFFYIFREREYIYDLFEAATGMRFINNNYFR IGGVAADLTYGWVTKCRDFCDYFLPKVDEYERLITNNPIFVRRLQGVGKISREEAINWGLSGPMLRASGVKWDLRKVDHY ECYDDFDWDVPVATEGDCLARYIVRIQEMRESVKIIRQALDGLPGGPYENLEAKRMLEGAKSEWNGFDYQYIGKKLSPTF KIPKGEHYVRVESGKGELGIYLIGDDNVFPWRWKIRPPDFNNLQVLPQLLKGMKVADIVAILGSIDVIMGSVDR ; 1 9 UNP NDHI_THEEB Q8DL31 ? 9 ;MKFLNQITNYAKEAVQSAKYIGQGLSVTFDHMRRRPITVQYPYEKLIPSERFRGRIHFEFDKCIACEVCVRVCPINLPVV DWVFNKELKKKELKHYSIDFGVCIFCANCVEYCPTNCLSVTEEYELATYDRHELNYDSVAMGRIPYKVTQDPMVTPIREF AYLPAGVMSGHDLPAGAQRAGERPEAIANTAKSSEN ; 1 10 UNP NDHJ_THEEB Q8DJ01 ? 10 ;MSDTPEAPIVEAGPVGRLLQSQNLSVESLGRDASGVEMIKVDRDRLLAVCQTLYADGFNYLRCQAAYDSGPGQDLVSTYH LIKLSDNADRPPEVRIKVFVPRDDPRVPSVYWIWKTADWQERESYDMFGIVYEGHPNLKRILMPEDWVGWPLRKDYITPD FYELQEAY ; 1 11 UNP NDHK_THEEB Q8DKZ4 ? 11 ;MTNTTSPAILNPIARPEVPQELAENIILTSLNDVYDWARLSSLWPLMYGTACCFIEFAAMIGSRFDFDRFGLVPRNSPRQ ADLIITSGTITMKMAPALVRLYEQMPSPKYVIAMGACTITGGMFSSDSYSAVRGVDKLIPVDVYLPGCPPRPEAIMDAIV KLRKKIANEHINERGNLAQTHRLFTAKHKMKPVPPILTGQYLNAPSRQAPPPALAAAMGIAVPALGEAVSETTSVAE ; 1 12 UNP NDHL_THEEB Q8DKZ3 ? 12 MAVSTELLVLGVYGALAGLYLLVVPAIVYAYLNARWYVASSFERAFMYFLVTFFFPGLLLLAPFINFRPQPRSLNS 1 13 UNP NDHM_THEEB Q8DLN5 ? 13 ;MLLKSTTRHVHIYAGHVVDGEVHPDTETLTLNVDPDNELEWNEAALAKVEAKFRELVANAAGEDLTEYNLRRIGSDLEHF IRSLLMQGEIGYNLNSRVRNYSLGIPRVNHS ; 1 14 UNP NDHN_THEEB Q8DJU2 ? 14 ;MGLLAGYQFVKDLESAGALALFVPPEGGFEGRYQRRLRSKGYTTLPMSAPGLGDLAAYLTQEHGIRPAHTGKEDIRVYFQ PPLVTYHLENLPPNAKGLVLWLIDGKRLSKQEFAYLAQLTQTLPKFKVVVEVGGDRVVRWEPLADWVAAA ; 1 15 UNP NDHO_THEEB Q8DMU4 ? 15 MAIKKGDLVKVVAEKLANSLEALASDHRYPPYLFEGRGEVVDIRGDYAQIKFPVPTPTVWLRLDQLEVAQ 1 16 UNP Q8DKF3_THEEB Q8DKF3 ? 16 ;MVQAMERPSSAKLPPLDHPLADIIYRLEAGGALIPDTPVNLMKIIGMYKAYSIPMDFYWRDLLYLGERVFINPFPFFKYF PTKEYFELPNHYAGDTADLRIWRGPAHAHPELMEFIEKGETGKMPRLLHHLWHDRINMEFSEDLARAMMWHRMGGQLDIY LDSEEYKAAADKAIRAYFKRNPLMLGLYKLFPDLFLEQARQATYMNVLGLFWEVMAPVFFEISDRYDEGSITSVKDAMNF LVNGIFAIAGRPIYHHVYIDDEVHVLVPKEKGFMWLYEAAFPYVEAVFYRTSPFRGTKSYNAQANQVPTDQVDFHYGILF ADKFPVGTAGIPPTLLHQDMYHFLPQYLKDYFHQHCRGEDDILVQLGIAFQHAMYTVTSAVLQATRAAFYYPLDDPNPEH LMANRRFFVAQMDRFLRPQYGIAEACKIRNVQDPNYL ; 1 17 UNP Q8DMA1_THEEB Q8DMA1 ? 17 ;MATIVDIAVNTPGFSTLVTAVKVANLVEALQSPGPFTVFAPNDDAFAKLPDGTITSLVQNPPQLGRILKYHVVAGAYKAT DLKRMGIVTSLEGSTIPIHGDNPLEVKNATVLAADIEAENGIIHVIDTVILMGLDPAHSFQETNIPYKV ; 1 18 UNP Q8DL61_THEEB Q8DL61 ? 18 ;MIRPIADTYPLLPLSKAQMGQRQEIINSHKRLWDKTMATDLIMTILPGMTVKVTNPNDTYYQFQGIVQRITDGKVAVLFE GGNWDKLVTFQASELEPVVVTPKEKAKAKK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6TJV A 1 ? 372 ? 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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCR non-polymer . BETA-CAROTENE ? 'C40 H56' 536.873 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5 2' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DGD saccharide . 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' ? 'C51 H96 O15' 949.299 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PGT non-polymer . '(1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE' 'PHOSPHATIDYLGLYCEROL; 1-PALMITOYL-2-OLEOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-RAC-(1-GLYCEROL)](SODIUM SALT)' 'C40 H79 O10 P' 751.023 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 SQD non-polymer . '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' SULFOQUINOVOSYLDIACYLGLYCEROL 'C41 H78 O12 S' 795.116 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6TJV _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6TJV _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.014 ? 69418 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.933 ? 126090 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 15.548 ? 27582 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.076 ? 5484 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 9843 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6TJV _struct.title 'Structure of the NDH-1MS complex from Thermosynechococcus elongatus' _struct.pdbx_descriptor ;NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1 (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3 (E.C.7.1.1.-), NADH dehydrogenase subunit 4, NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L (E.C.7.1.1.-), NADH dehydrogenase subunit 5, NADH dehydrogenase subunit 6 (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N (E.C.7.1.1.-), NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O (E.C.7.1.1.-), Tlr0906 protein, Tll0220 protein, Tlr0636 protein ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6TJV _struct_keywords.text 'carbon concentrating photosynthetic complex I, proton pump, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ASN K 25 SER K 41 1 ? 17 HELX_P HELX_P142 AP7 ALA K 51 ? GLY K 62 ? ALA K 51 GLY K 62 1 ? 12 HELX_P HELX_P143 AP8 MET K 94 ? GLN K 104 ? MET K 94 GLN K 104 1 ? 11 HELX_P HELX_P144 AP9 ALA K 116 ? ILE K 119 ? ALA K 116 ILE K 119 5 ? 4 HELX_P HELX_P145 AQ1 GLY K 121 ? SER K 125 ? GLY K 121 SER K 125 5 ? 5 HELX_P HELX_P146 AQ2 GLY K 134 ? LEU K 138 ? GLY K 134 LEU K 138 5 ? 5 HELX_P HELX_P147 AQ3 ARG K 151 ? ALA K 167 ? ARG K 151 ALA K 167 1 ? 17 HELX_P HELX_P148 AQ4 ASN K 168 ? GLU K 169 ? ASN K 168 GLU K 169 5 ? 2 HELX_P HELX_P149 AQ5 HIS K 170 ? ARG K 174 ? HIS K 170 ARG K 174 5 ? 5 HELX_P HELX_P150 AQ6 ALA K 204 ? GLN K 208 ? ALA K 204 GLN K 208 5 ? 5 HELX_P HELX_P151 AQ7 SER L 4 ? LEU L 22 ? SER L 4 LEU L 22 1 ? 19 HELX_P HELX_P152 AQ8 VAL L 23 ? ARG L 35 ? VAL L 23 ARG L 35 1 ? 13 HELX_P HELX_P153 AQ9 SER L 40 ? LEU L 61 ? SER L 40 LEU L 61 1 ? 22 HELX_P HELX_P154 AR1 ALA L 62 ? ILE L 65 ? ALA L 62 ILE L 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P155 AR2 ASN M 42 ? ALA M 58 ? ASN M 42 ALA M 58 1 ? 17 HELX_P HELX_P156 AR3 THR M 66 ? GLY M 88 ? THR M 66 GLY M 88 1 ? 23 HELX_P HELX_P157 AR4 TYR N 7 ? GLY N 17 ? TYR N 7 GLY N 17 1 ? 11 HELX_P HELX_P158 AR5 GLU N 30 ? LYS N 40 ? GLU N 30 LYS N 40 1 ? 11 HELX_P HELX_P159 AR6 VAL N 84 ? ASN N 90 ? VAL N 84 ASN N 90 1 ? 7 HELX_P HELX_P160 AR7 ASP N 104 ? LEU N 108 ? ASP N 104 LEU N 108 5 ? 5 HELX_P HELX_P161 AR8 SER N 109 ? THR N 122 ? SER N 109 THR N 122 1 ? 14 HELX_P HELX_P162 AR9 PRO O 30 ? PHE O 34 ? PRO O 30 PHE O 34 5 ? 5 HELX_P HELX_P163 AS1 ASP O 64 ? LEU O 66 ? ASP O 64 LEU O 66 5 ? 3 HELX_P HELX_P164 AS2 LEU P 20 ? ALA P 29 ? LEU P 20 ALA P 29 1 ? 10 HELX_P HELX_P165 AS3 THR P 37 ? ARG P 68 ? THR P 37 ARG P 68 1 ? 32 HELX_P HELX_P166 AS4 THR P 82 ? PHE P 86 ? THR P 82 PHE P 86 5 ? 5 HELX_P HELX_P167 AS5 HIS P 109 ? GLY P 119 ? HIS P 109 GLY P 119 1 ? 11 HELX_P HELX_P168 AS6 PRO P 125 ? TRP P 132 ? PRO P 125 TRP P 132 1 ? 8 HELX_P HELX_P169 AS7 MET P 138 ? MET P 149 ? MET P 138 MET P 149 1 ? 12 HELX_P HELX_P170 AS8 GLN P 156 ? LEU P 161 ? GLN P 156 LEU P 161 1 ? 6 HELX_P HELX_P171 AS9 GLU P 165 ? PHE P 178 ? GLU P 165 PHE P 178 1 ? 14 HELX_P HELX_P172 AT1 ASN P 181 ? PHE P 191 ? ASN P 181 PHE P 191 1 ? 11 HELX_P HELX_P173 AT2 PHE P 195 ? GLY P 229 ? PHE P 195 GLY P 229 1 ? 35 HELX_P HELX_P174 AT3 SER P 233 ? ILE P 248 ? SER P 233 ILE P 248 1 ? 16 HELX_P HELX_P175 AT4 PRO P 268 ? GLY P 272 ? PRO P 268 GLY P 272 5 ? 5 HELX_P HELX_P176 AT5 MET P 274 ? ALA P 279 ? MET P 274 ALA P 279 1 ? 6 HELX_P HELX_P177 AT6 ALA P 280 ? PHE P 288 ? ALA P 280 PHE P 288 1 ? 9 HELX_P HELX_P178 AT7 PRO P 333 ? MET P 340 ? PRO P 333 MET P 340 1 ? 8 HELX_P HELX_P179 AT8 PRO P 345 ? GLN P 354 ? PRO P 345 GLN P 354 1 ? 10 HELX_P HELX_P180 AT9 ASP P 361 ? TYR P 390 ? ASP P 361 TYR P 390 1 ? 30 HELX_P HELX_P181 AU1 PRO P 398 ? ARG P 414 ? PRO P 398 ARG P 414 1 ? 17 HELX_P HELX_P182 AU2 THR Q 3 ? THR Q 11 ? THR Q 3 THR Q 11 1 ? 9 HELX_P HELX_P183 AU3 THR Q 16 ? ALA Q 24 ? THR Q 16 ALA Q 24 1 ? 9 HELX_P HELX_P184 AU4 PRO Q 50 ? GLN Q 59 ? PRO Q 50 GLN Q 59 1 ? 10 HELX_P HELX_P185 AU5 ASN Q 60 ? VAL Q 72 ? ASN Q 60 VAL Q 72 1 ? 13 HELX_P HELX_P186 AU6 LYS Q 78 ? GLY Q 86 ? LYS Q 78 GLY Q 86 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale none ? A VAL 43 CG1 ? ? ? 1_555 EA DGD . CIA ? ? A VAL 43 L DGD 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.188 ? covale2 covale none ? L PRO 56 CG ? ? ? 1_555 EA DGD . CFA ? ? L PRO 56 L DGD 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.616 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 226 B . ? VAL 226 B PRO 227 B ? PRO 227 B 1 2.14 2 MET 222 D . ? MET 222 D PRO 223 D ? PRO 223 D 1 -4.49 3 PHE 238 F . ? PHE 238 F PRO 239 F ? PRO 239 F 1 0.01 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLN D 63 ? VAL D 68 ? GLN D 63 VAL D 68 AA1 2 TYR D 78 ? VAL D 82 ? TYR D 78 VAL D 82 AA2 1 LEU F 69 ? LEU F 74 ? LEU F 69 LEU F 74 AA2 2 LEU F 81 ? VAL F 85 ? LEU F 81 VAL F 85 AA3 1 MET H 11 ? ASN H 14 ? MET H 11 ASN H 14 AA3 2 MET H 29 ? LEU H 32 ? MET H 29 LEU H 32 AA3 3 ASP H 39 ? GLU H 41 ? ASP H 39 GLU H 41 AA4 1 PHE H 159 ? ARG H 160 ? PHE H 159 ARG H 160 AA4 2 GLY H 163 ? VAL H 164 ? GLY H 163 VAL H 164 AA5 1 HIS H 327 ? GLU H 332 ? HIS H 327 GLU H 332 AA5 2 GLU H 337 ? LEU H 342 ? GLU H 337 LEU H 342 AA5 3 LYS H 354 ? ARG H 356 ? LYS H 354 ARG H 356 AA6 1 ILE I 56 ? PHE I 58 ? ILE I 56 PHE I 58 AA6 2 LEU I 118 ? VAL I 120 ? LEU I 118 VAL I 120 AA7 1 VAL I 79 ? TRP I 82 ? VAL I 79 TRP I 82 AA7 2 LEU I 93 ? ASP I 99 ? LEU I 93 ASP I 99 AA7 3 ASN I 135 ? TYR I 136 ? ASN I 135 TYR I 136 AA8 1 GLY J 30 ? ARG J 31 ? GLY J 30 ARG J 31 AA8 2 GLU J 37 ? LYS J 40 ? GLU J 37 LYS J 40 AA8 3 ARG J 95 ? LYS J 97 ? ARG J 95 LYS J 97 AA8 4 TYR J 79 ? HIS J 80 ? TYR J 79 HIS J 80 AA9 1 ALA J 66 ? ASP J 68 ? ALA J 66 ASP J 68 AA9 2 LEU J 75 ? SER J 77 ? LEU J 75 SER J 77 AB1 1 VAL J 107 ? PRO J 108 ? VAL J 107 PRO J 108 AB1 2 TYR J 132 ? GLU J 133 ? TYR J 132 GLU J 133 AB2 1 LEU K 83 ? SER K 87 ? LEU K 83 SER K 87 AB2 2 TYR K 110 ? MET K 114 ? TYR K 110 MET K 114 AB2 3 VAL K 143 ? LEU K 145 ? VAL K 143 LEU K 145 AB3 1 ARG K 182 ? PHE K 184 ? ARG K 182 PHE K 184 AB3 2 LEU M 31 ? VAL M 33 ? LEU M 31 VAL M 33 AB4 1 SER M 5 ? THR M 7 ? SER M 5 THR M 7 AB4 2 VAL M 10 ? ILE M 12 ? VAL M 10 ILE M 12 AB5 1 LEU M 39 ? GLU M 40 ? LEU M 39 GLU M 40 AB5 2 GLY M 91 ? TYR M 92 ? GLY M 91 TYR M 92 AB6 1 ALA N 18 ? LEU N 19 ? ALA N 18 LEU N 19 AB6 2 LYS N 127 ? VAL N 130 ? LYS N 127 VAL N 130 AB6 3 GLY N 97 ? LEU N 102 ? GLY N 97 LEU N 102 AB6 4 TYR N 42 ? PRO N 46 ? TYR N 42 PRO N 46 AB7 1 VAL O 40 ? ARG O 44 ? VAL O 40 ARG O 44 AB7 2 TYR O 47 ? ILE O 50 ? TYR O 47 ILE O 50 AB7 3 VAL O 59 ? ARG O 62 ? VAL O 59 ARG O 62 AB8 1 VAL P 257 ? ILE P 259 ? VAL P 257 ILE P 259 AB8 2 GLU P 262 ? HIS P 264 ? GLU P 262 HIS P 264 AB9 1 VAL Q 38 ? ALA Q 40 ? VAL Q 38 ALA Q 40 AB9 2 ILE Q 123 ? VAL Q 125 ? ILE Q 123 VAL Q 125 AC1 1 LYS R 86 ? PHE R 90 ? LYS S 86 PHE S 90 AC1 2 LYS R 74 ? PHE R 79 ? LYS S 74 PHE S 79 AC1 3 GLN R 64 ? THR R 71 ? GLN S 64 THR S 71 AC1 4 THR R 50 ? VAL R 53 ? THR S 50 VAL S 53 AC1 5 LEU R 95 ? GLU R 96 ? LEU S 95 GLU S 96 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N GLN D 63 ? N GLN D 63 O VAL D 82 ? O VAL D 82 AA2 1 2 N TRP F 71 ? N TRP F 71 O ILE F 83 ? O ILE F 83 AA3 1 2 N ILE H 13 ? N ILE H 13 O VAL H 30 ? O VAL H 30 AA3 2 3 N MET H 29 ? N MET H 29 O GLU H 41 ? O GLU H 41 AA4 1 2 N ARG H 160 ? N ARG H 160 O GLY H 163 ? O GLY H 163 AA5 1 2 N VAL H 331 ? N VAL H 331 O LEU H 338 ? O LEU H 338 AA5 2 3 N GLY H 339 ? N GLY H 339 O ARG H 356 ? O ARG H 356 AA6 1 2 N HIS I 57 ? N HIS I 57 O SER I 119 ? O SER I 119 AA7 1 2 N ASP I 81 ? N ASP I 81 O LYS I 94 ? O LYS I 94 AA7 2 3 N ILE I 98 ? N ILE I 98 O TYR I 136 ? O TYR I 136 AA8 1 2 N GLY J 30 ? N GLY J 30 O MET J 38 ? O MET J 38 AA8 2 3 N GLU J 37 ? N GLU J 37 O ARG J 95 ? O ARG J 95 AA8 3 4 O ILE J 96 ? O ILE J 96 N TYR J 79 ? N TYR J 79 AA9 1 2 N TYR J 67 ? N TYR J 67 O VAL J 76 ? O VAL J 76 AB1 1 2 N VAL J 107 ? N VAL J 107 O GLU J 133 ? O GLU J 133 AB2 1 2 N ILE K 84 ? N ILE K 84 O ILE K 112 ? O ILE K 112 AB2 2 3 N ALA K 113 ? N ALA K 113 O VAL K 143 ? O VAL K 143 AB3 1 2 N PHE K 184 ? N PHE K 184 O LEU M 31 ? O LEU M 31 AB4 1 2 N THR M 7 ? N THR M 7 O VAL M 10 ? O VAL M 10 AB5 1 2 N GLU M 40 ? N GLU M 40 O GLY M 91 ? O GLY M 91 AB6 1 2 N LEU N 19 ? N LEU N 19 O VAL N 128 ? O VAL N 128 AB6 2 3 O VAL N 129 ? O VAL N 129 N LEU N 100 ? N LEU N 100 AB6 3 4 O VAL N 99 ? O VAL N 99 N THR N 43 ? N THR N 43 AB7 1 2 N VAL O 41 ? N VAL O 41 O GLN O 49 ? O GLN O 49 AB7 2 3 N ILE O 50 ? N ILE O 50 O VAL O 59 ? O VAL O 59 AB8 1 2 N VAL P 257 ? N VAL P 257 O HIS P 264 ? O HIS P 264 AB9 1 2 N ALA Q 40 ? N ALA Q 40 O HIS Q 124 ? O HIS Q 124 AC1 1 2 O PHE R 90 ? O PHE S 90 N VAL R 75 ? N VAL S 75 AC1 2 3 O LEU R 78 ? O LEU S 78 N ILE R 66 ? N ILE S 66 AC1 3 4 O GLY R 65 ? O GLY S 65 N VAL R 51 ? N VAL S 51 AC1 4 5 N LYS R 52 ? N LYS S 52 O GLU R 96 ? O GLU S 96 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A DGD 501 ? 20 'binding site for residue DGD A 501' AC2 Software C PGT 201 ? 11 'binding site for residue PGT C 201' AC3 Software D SQD 601 ? 13 'binding site for residue SQD D 601' AC4 Software D PGT 602 ? 11 'binding site for residue PGT D 602' AC5 Software F SQD 701 ? 19 'binding site for residue SQD F 701' AC6 Software F BCR 702 ? 10 'binding site for residue BCR F 702' AC7 Software F SQD 703 ? 14 'binding site for residue SQD F 703' AC8 Software F CLA 704 ? 3 'binding site for residue CLA F 704' AC9 Software I SF4 201 ? 8 'binding site for residue SF4 I 201' AD1 Software I SF4 202 ? 9 'binding site for residue SF4 I 202' AD2 Software K SF4 501 ? 11 'binding site for residue SF4 K 501' AD3 Software K SQD 502 ? 7 'binding site for residue SQD K 502' AD4 Software L SQD 402 ? 13 'binding site for residue SQD L 402' AD5 Software P ZN 501 ? 1 'binding site for residue ZN P 501' AD6 Software ? ? ? ? 44 'binding site for Poly-Saccharide residues VAL A 43 through DGD L 401' AD7 Software L DGD 401 ? 20 'binding site for Di-Saccharide DGD L 401 and PRO L 56' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 20 ASP A 6 ? 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GLU I 67 . ? 1_555 ? 115 AD1 9 CYS I 69 ? CYS I 69 . ? 1_555 ? 116 AD1 9 CYS I 113 ? CYS I 113 . ? 1_555 ? 117 AD1 9 PRO I 114 ? PRO I 114 . ? 1_555 ? 118 AD1 9 CYS I 117 ? CYS I 117 . ? 1_555 ? 119 AD2 11 ARG H 69 ? ARG H 69 . ? 1_555 ? 120 AD2 11 ALA K 51 ? ALA K 51 . ? 1_555 ? 121 AD2 11 CYS K 52 ? CYS K 52 . ? 1_555 ? 122 AD2 11 CYS K 53 ? CYS K 53 . ? 1_555 ? 123 AD2 11 THR K 89 ? THR K 89 . ? 1_555 ? 124 AD2 11 GLY K 115 ? GLY K 115 . ? 1_555 ? 125 AD2 11 ALA K 116 ? ALA K 116 . ? 1_555 ? 126 AD2 11 CYS K 117 ? CYS K 117 . ? 1_555 ? 127 AD2 11 MET K 123 ? MET K 123 . ? 1_555 ? 128 AD2 11 CYS K 148 ? CYS K 148 . ? 1_555 ? 129 AD2 11 PRO K 149 ? PRO K 149 . ? 1_555 ? 130 AD3 7 LEU C 43 ? LEU C 43 . ? 1_555 ? 131 AD3 7 LYS C 46 ? LYS C 46 . ? 1_555 ? 132 AD3 7 LEU K 31 ? LEU K 31 . ? 1_555 ? 133 AD3 7 ILE K 171 ? ILE K 171 . ? 1_555 ? 134 AD3 7 ASN K 172 ? ASN K 172 . ? 1_555 ? 135 AD3 7 ARG K 174 ? ARG K 174 . ? 1_555 ? 136 AD3 7 SQD FA . ? 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