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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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SER C 1024 ILE C 1029 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 613 SG ? ? ? 1_555 A CYS 619 SG ? ? A CYS 613 A CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 715 SG ? ? ? 1_555 A CYS 726 SG ? ? A CYS 715 A CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 917 SG ? ? ? 1_555 A CYS 928 SG ? ? A CYS 917 A CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? disulf13 disulf ? ? A CYS 967 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1014 SG ? ? A CYS 967 A CYS 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 81 SG ? ? ? 1_555 B CYS 105 SG ? ? B CYS 81 B CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 145 SG ? ? ? 1_555 B CYS 168 SG ? ? B CYS 145 B CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 255 SG ? ? ? 1_555 B CYS 264 SG ? ? B CYS 255 B CYS 264 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.990 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 317 SG ? ? ? 1_555 B CYS 320 SG ? ? B CYS 317 B CYS 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 340 SG ? ? ? 1_555 B CYS 386 SG ? ? B CYS 340 B CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 369 SG ? ? ? 1_555 B CYS 396 SG ? ? B CYS 369 B CYS 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 446 SG ? ? ? 1_555 B CYS 497 SG ? ? B CYS 446 B CYS 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 543 SG ? ? ? 1_555 B CYS 556 SG ? ? B CYS 543 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 608 SG ? ? ? 1_555 B CYS 630 SG ? ? B CYS 608 B CYS 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 613 SG ? ? ? 1_555 B CYS 619 SG ? ? B CYS 613 B CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 715 SG ? ? ? 1_555 B CYS 726 SG ? ? B CYS 715 B CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf25 disulf ? ? B CYS 917 SG ? ? ? 1_555 B CYS 928 SG ? ? B CYS 917 B CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? disulf26 disulf ? ? B CYS 967 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1014 SG ? ? B CYS 967 B CYS 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf27 disulf ? ? C CYS 81 SG ? ? ? 1_555 C CYS 105 SG ? ? C CYS 81 C CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf28 disulf ? ? C CYS 145 SG ? ? ? 1_555 C CYS 168 SG ? ? C CYS 145 C CYS 168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 255 SG ? ? ? 1_555 C CYS 264 SG ? ? C CYS 255 C CYS 264 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.990 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 317 SG ? ? ? 1_555 C CYS 320 SG ? ? C CYS 317 C CYS 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 340 SG ? ? ? 1_555 C CYS 386 SG ? ? C CYS 340 C CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 369 SG ? ? ? 1_555 C CYS 396 SG ? ? C CYS 369 C CYS 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 446 SG ? ? ? 1_555 C CYS 497 SG ? ? C CYS 446 C CYS 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 543 SG ? ? ? 1_555 C CYS 556 SG ? ? C CYS 543 C CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 608 SG ? ? ? 1_555 C CYS 630 SG ? ? C CYS 608 C CYS 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 613 SG ? ? ? 1_555 C CYS 619 SG ? ? C CYS 613 C CYS 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 715 SG ? ? ? 1_555 C CYS 726 SG ? ? C CYS 715 C CYS 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 917 SG ? ? ? 1_555 C CYS 928 SG ? ? C CYS 917 C CYS 928 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 967 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1014 SG ? ? C CYS 967 C CYS 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? covale1 covale one ? A ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? A ASN 62 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 98 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? A ASN 98 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 147 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 147 A NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 171 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? A ASN 171 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 220 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 220 A NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? A ASN 243 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 326 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 326 A NAG 1217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 440 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 440 A NAG 1218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 464 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? A ASN 464 A NAG 1219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 518 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? A ASN 518 A NAG 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 538 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? A ASN 538 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 542 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 542 A NAG 1223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 663 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 663 A NAG 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 671 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? A ASN 671 A NAG 1225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 714 A NAG 1226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 930 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? A ASN 930 A NAG 1227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? B ASN 62 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 98 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 98 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 147 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? B ASN 147 B NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 171 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 171 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 220 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? B ASN 220 B NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 243 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 326 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? B ASN 326 B NAG 1217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 440 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? B ASN 440 B NAG 1218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 464 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? B ASN 464 B NAG 1219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 518 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? B ASN 518 B NAG 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 538 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 538 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 542 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? B ASN 542 B NAG 1223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 663 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? B ASN 663 B NAG 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? B ASN 671 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? B ASN 671 B NAG 1225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? B ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? B ASN 714 B NAG 1226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? B ASN 930 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? B ASN 930 B NAG 1227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? C ASN 62 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 98 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? C ASN 98 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 147 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 147 C NAG 1210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? C ASN 171 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? C ASN 171 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 220 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 220 C NAG 1213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 243 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? C ASN 243 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 326 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 326 C NAG 1217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 440 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 440 C NAG 1218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 464 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 464 C NAG 1219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? C ASN 518 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 518 C NAG 1220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? C ASN 538 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? C ASN 538 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? C ASN 542 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? C ASN 542 C NAG 1223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? C ASN 663 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? C ASN 663 C NAG 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? C ASN 671 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? C ASN 671 C NAG 1225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? C ASN 714 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? C ASN 714 C NAG 1226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? C ASN 930 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? C ASN 930 C NAG 1227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale49 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? ? covale50 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D BMA . C1 ? ? D NAG 2 D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale51 covale one ? D BMA . O3 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? D BMA 3 D MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale52 covale one ? D BMA . O6 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? D BMA 3 D MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale53 covale one ? D MAN . O2 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? D MAN 4 D MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale54 covale one ? D MAN . O3 ? ? ? 1_555 D MAN . C1 ? ? D MAN 6 D MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale55 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale56 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale57 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale58 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale59 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale60 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale61 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale62 covale one ? I BMA . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale63 covale one ? I BMA . O6 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale64 covale one ? I MAN . O2 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I MAN 4 I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale65 covale one ? I MAN . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I MAN 6 I MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale66 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale67 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale68 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale69 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? L NAG 2 L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale70 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale71 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? ? covale72 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale73 covale one ? N BMA . O3 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N BMA 3 N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale74 covale one ? N BMA . O6 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N BMA 3 N MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale75 covale one ? N MAN . O2 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N MAN 4 N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? ? covale76 covale one ? N MAN . O3 ? ? ? 1_555 N MAN . C1 ? ? N MAN 6 N MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale77 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale78 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? ? covale79 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale80 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale81 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 7 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 6 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 6 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 6 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 6 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 3 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 6 7 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC8 5 6 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD1 5 6 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD3 5 6 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? parallel AD9 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 65 ? 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Y 5 NAG 1 1223 2131 NAG NAG A . Z 5 NAG 1 1224 2171 NAG NAG A . AA 5 NAG 1 1225 2181 NAG NAG A . BA 5 NAG 1 1226 2191 NAG NAG A . CA 5 NAG 1 1227 2201 NAG NAG A . DA 5 NAG 1 1210 2031 NAG NAG B . EA 5 NAG 1 1213 2051 NAG NAG B . FA 5 NAG 1 1217 2071 NAG NAG B . GA 5 NAG 1 1218 2091 NAG NAG B . HA 5 NAG 1 1219 2101 NAG NAG B . IA 5 NAG 1 1220 2111 NAG NAG B . JA 5 NAG 1 1223 2131 NAG NAG B . KA 5 NAG 1 1224 2171 NAG NAG B . LA 5 NAG 1 1225 2181 NAG NAG B . MA 5 NAG 1 1226 2191 NAG NAG B . NA 5 NAG 1 1227 2201 NAG NAG B . OA 5 NAG 1 1210 2031 NAG NAG C . PA 5 NAG 1 1213 2051 NAG NAG C . QA 5 NAG 1 1217 2071 NAG NAG C . RA 5 NAG 1 1218 2091 NAG NAG C . SA 5 NAG 1 1219 2101 NAG NAG C . TA 5 NAG 1 1220 2111 NAG NAG C . UA 5 NAG 1 1223 2131 NAG NAG C . VA 5 NAG 1 1224 2171 NAG NAG C . WA 5 NAG 1 1225 2181 NAG NAG C . XA 5 NAG 1 1226 2191 NAG NAG C . YA 5 NAG 1 1227 2201 NAG NAG C . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 44130 ? 1 MORE 121 ? 1 'SSA (A^2)' 126000 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-11-13 2 'Structure model' 1 1 2020-01-15 3 'Structure model' 2 0 2020-07-29 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 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_pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _em_3d_fitting.entry_id 6U7H _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;Manual model building was done in COOT and ChimeraX/ISOLDE. A homology model based on PDB:5SZS was used as a reference during model building. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id A _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 5SZS # _em_3d_reconstruction.entry_id 6U7H _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 71350 _em_3d_reconstruction.resolution 3.1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 8.0 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Ectodomain generated by recombinant expression in HEK293 Freestyle cells' _em_entity_assembly.name 'Human coronavirus 229E spike glycoprotein' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6U7H _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 4096 _em_image_scans.dimension_width 4096 _em_image_scans.frames_per_image ? _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? 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C ILE 1095 519 1 Y 1 C ASN 1096 ? C ASN 1096 520 1 Y 1 C SER 1097 ? C SER 1097 521 1 Y 1 C THR 1098 ? C THR 1098 522 1 Y 1 C LEU 1099 ? C LEU 1099 523 1 Y 1 C VAL 1100 ? C VAL 1100 524 1 Y 1 C ASP 1101 ? C ASP 1101 525 1 Y 1 C LEU 1102 ? C LEU 1102 526 1 Y 1 C LYS 1103 ? C LYS 1103 527 1 Y 1 C TRP 1104 ? C TRP 1104 528 1 Y 1 C LEU 1105 ? C LEU 1105 529 1 Y 1 C ASN 1106 ? C ASN 1106 530 1 Y 1 C ARG 1107 ? C ARG 1107 531 1 Y 1 C VAL 1108 ? C VAL 1108 532 1 Y 1 C GLU 1109 ? C GLU 1109 533 1 Y 1 C THR 1110 ? C THR 1110 534 1 Y 1 C TYR 1111 ? C TYR 1111 535 1 Y 1 C ILE 1112 ? C ILE 1112 536 1 Y 1 C LYS 1113 ? C LYS 1113 537 1 Y 1 C SER 1114 ? C SER 1114 538 1 Y 1 C GLY 1115 ? C GLY 1115 539 1 Y 1 C GLY 1116 ? C GLY 1116 540 1 Y 1 C TYR 1117 ? C TYR 1117 541 1 Y 1 C ILE 1118 ? C ILE 1118 542 1 Y 1 C PRO 1119 ? C PRO 1119 543 1 Y 1 C GLU 1120 ? C GLU 1120 544 1 Y 1 C ALA 1121 ? C ALA 1121 545 1 Y 1 C PRO 1122 ? C PRO 1122 546 1 Y 1 C ARG 1123 ? C ARG 1123 547 1 Y 1 C ASP 1124 ? 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C SER 1153 577 1 Y 1 C HIS 1154 ? C HIS 1154 578 1 Y 1 C HIS 1155 ? C HIS 1155 579 1 Y 1 C HIS 1156 ? C HIS 1156 580 1 Y 1 C HIS 1157 ? C HIS 1157 581 1 Y 1 C HIS 1158 ? C HIS 1158 582 1 Y 1 C HIS 1159 ? 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4 3 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 3 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 3 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 4 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 4 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 2 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 2 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 2 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 4 2 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 5 2 6 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 6 2 7 MAN C1 O1 6 MAN O3 HO3 sing ? 7 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 8 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 9 4 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 2 NAG 1 n 2 NAG 2 n 2 BMA 3 n 2 MAN 4 n 2 MAN 5 n 2 MAN 6 n 2 MAN 7 n 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 BMA 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #