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_citation.page_first 482 _citation.page_last 482 _citation.title 'Structural basis of redox modulation on chloroplast ATP synthase.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s42003-020-01221-8 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32879423 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, J.H.' 1 ? primary 'Williams, D.' 2 ? primary 'Kandiah, E.' 3 ? primary 'Fromme, P.' 4 ? primary 'Chiu, P.L.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha, chloroplastic' 55505.199 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase subunit beta, chloroplastic' 53797.367 3 7.1.2.2 ? ? ? 3 polymer nat 'ATP synthase delta chain, chloroplastic' 27708.582 1 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;MANMLVASSSKTLPTTTTTTITPKPKFPLLKTPLLKLSPPQLPPLKHLNLSVLKSAAITATPLTLSFLLPYPSLAEEIEK ASLFDFNLTLPIIMAEFLFLMFALDKIYYTPLGDFMDKRDASIKEQLSGVKDTSSEVKQLEEQANAVMRAARAEISAALN KMKKETQLEVEAKLAEGRKKIEVELQEALGSLEQQKEDTIKSLDSQISALSDDIVKKVLPVS ; J ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNVLSYSINPLKGLYAISGVEVGQHFYWQIGGFQIHGQVLITSWVVIAILLGSAAIAVRSPQTIPTGGQNFFEYVLEFIR DVSKTQIGEEYRPWVPFIGTMFLFIFVSNWSGALLPWKIIQLPHGELAAPTNDINTTVALALLTSVAYFYAGLTKKGLGY FGKYIQPTPILLPINILEDFTKPLSLSFRLFGNILADELVVVVLVSLVPLVVPIPVMFLGLFTSGIQALIFATLAAAYIG ESLEGHH ; ;MNVLSYSINPLKGLYAISGVEVGQHFYWQIGGFQIHGQVLITSWVVIAILLGSAAIAVRSPQTIPTGGQNFFEYVLEFIR DVSKTQIGEEYRPWVPFIGTMFLFIFVSNWSGALLPWKIIQLPHGELAAPTNDINTTVALALLTSVAYFYAGLTKKGLGY FGKYIQPTPILLPINILEDFTKPLSLSFRLFGNILADELVVVVLVSLVPLVVPIPVMFLGLFTSGIQALIFATLAAAYIG ESLEGHH ; a ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MNPLIAAASVIAAGLAVGLASIGPGVGQGTAAGQAVEGIARQPEAEGKIRGTLLLSLAFMEALTIYGLVVALALLFANPF V ; ;MNPLIAAASVIAAGLAVGLASIGPGVGQGTAAGQAVEGIARQPEAEGKIRGTLLLSLAFMEALTIYGLVVALALLFANPF V ; M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z ? # 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AD5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA2 8 9 ? anti-parallel AA2 9 10 ? anti-parallel AA2 11 12 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 6 7 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA7 9 10 ? anti-parallel AA7 10 11 ? anti-parallel AA7 11 12 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? parallel AC2 6 7 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? parallel AC5 5 6 ? parallel AC5 6 7 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC8 3 4 ? parallel AC8 4 5 ? parallel AC8 5 6 ? parallel AC8 6 7 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 30 ? GLN A 34 ? GLY A 30 GLN A 34 AA1 2 ILE A 39 ? GLY A 44 ? ILE A 39 GLY A 44 AA1 3 ASN A 71 ? LEU A 76 ? ASN A 71 LEU A 76 AA1 4 ILE A 61 ? LEU A 67 ? ILE A 61 LEU A 67 AA1 5 LEU F 20 ? ILE F 27 ? LEU F 20 ILE F 27 AA1 6 LEU A 53 ? PHE A 56 ? LEU A 53 PHE A 56 AA1 7 VAL A 89 ? ALA A 91 ? VAL A 89 ALA A 91 AA2 1 GLY A 30 ? GLN A 34 ? GLY A 30 GLN A 34 AA2 2 ILE A 39 ? GLY A 44 ? ILE A 39 GLY A 44 AA2 3 ASN A 71 ? LEU A 76 ? ASN A 71 LEU A 76 AA2 4 ILE A 61 ? LEU A 67 ? ILE A 61 LEU A 67 AA2 5 GLU F 90 ? ASP F 93 ? GLU F 90 ASP F 93 AA2 6 ALA F 46 ? LYS F 50 ? ALA F 46 LYS F 50 AA2 7 ASN F 60 ? GLN F 67 ? ASN F 60 GLN F 67 AA2 8 ARG F 73 ? ALA F 78 ? ARG F 73 ALA F 78 AA2 9 VAL F 30 ? ALA F 34 ? VAL F 30 ALA F 34 AA2 10 LEU F 20 ? ILE F 27 ? LEU F 20 ILE F 27 AA2 11 LEU A 53 ? PHE A 56 ? LEU A 53 PHE A 56 AA2 12 VAL A 89 ? ALA A 91 ? VAL A 89 ALA A 91 AA3 1 ILE A 98 ? VAL A 100 ? ILE A 98 VAL A 100 AA3 2 GLU A 126 ? ARG A 128 ? GLU A 126 ARG A 128 AA4 1 ILE A 319 ? GLU A 321 ? ILE A 319 GLU A 321 AA4 2 GLU A 166 ? GLY A 170 ? GLU A 166 GLY A 170 AA4 3 GLY A 341 ? PHE A 344 ? GLY A 341 PHE A 344 AA5 1 ILE A 223 ? THR A 228 ? ILE A 223 THR A 228 AA5 2 ILE A 193 ? GLN A 201 ? ILE A 193 GLN A 201 AA5 3 THR A 257 ? ASP A 262 ? THR A 257 ASP A 262 AA5 4 MET A 314 ? ALA A 316 ? MET A 314 ALA A 316 AA6 1 LEU B 53 ? GLU B 55 ? LEU B 53 GLU B 55 AA6 2 ILE B 61 ? LEU B 67 ? ILE B 61 LEU B 67 AA6 3 GLY D 21 ? ILE D 27 ? GLY D 21 ILE D 27 AA6 4 ASN B 71 ? LEU B 76 ? ASN B 71 LEU B 76 AA6 5 ILE B 39 ? GLY B 44 ? ILE B 39 GLY B 44 AA6 6 GLY B 30 ? VAL B 35 ? GLY B 30 VAL B 35 AA6 7 SER B 88 ? VAL B 89 ? SER B 88 VAL B 89 AA7 1 LEU B 53 ? GLU B 55 ? LEU B 53 GLU B 55 AA7 2 ILE B 61 ? LEU B 67 ? ILE B 61 LEU B 67 AA7 3 GLU D 90 ? ASP D 93 ? GLU D 90 ASP D 93 AA7 4 ALA D 46 ? ARG D 52 ? ALA D 46 ARG D 52 AA7 5 PRO D 58 ? GLY D 70 ? PRO D 58 GLY D 70 AA7 6 ARG D 73 ? ALA D 78 ? ARG D 73 ALA D 78 AA7 7 VAL D 30 ? ALA D 34 ? VAL D 30 ALA D 34 AA7 8 GLY D 21 ? ILE D 27 ? GLY D 21 ILE D 27 AA7 9 ASN B 71 ? LEU B 76 ? ASN B 71 LEU B 76 AA7 10 ILE B 39 ? GLY B 44 ? ILE B 39 GLY B 44 AA7 11 GLY B 30 ? VAL B 35 ? GLY B 30 VAL B 35 AA7 12 SER B 88 ? VAL B 89 ? SER B 88 VAL B 89 AA8 1 GLN B 97 ? PRO B 99 ? GLN B 97 PRO B 99 AA8 2 SER B 127 ? LEU B 129 ? SER B 127 LEU B 129 AA9 1 VAL B 108 ? ILE B 109 ? VAL B 108 ILE B 109 AA9 2 VAL B 224 ? VAL B 225 ? VAL B 224 VAL B 225 AB1 1 ILE B 319 ? GLU B 321 ? ILE B 319 GLU B 321 AB1 2 LEU B 167 ? GLY B 170 ? LEU B 167 GLY B 170 AB1 3 GLN B 342 ? ILE B 343 ? GLN B 342 ILE B 343 AB2 1 ILE B 193 ? ALA B 198 ? ILE B 193 ALA B 198 AB2 2 THR B 257 ? ASP B 262 ? THR B 257 ASP B 262 AB2 3 MET B 314 ? ALA B 316 ? MET B 314 ALA B 316 AB3 1 VAL C 27 ? ASN C 28 ? VAL C 27 ASN C 28 AB3 2 LYS G 231 ? ASP G 234 ? LYS d 231 ASP d 234 AB3 3 THR G 222 ? TYR G 225 ? THR d 222 TYR d 225 AB3 4 THR G 175 ? SER G 182 ? THR d 175 SER d 182 AB3 5 ASN G 206 ? ILE G 213 ? ASN d 206 ILE d 213 AB4 1 ILE C 39 ? ILE C 42 ? ILE C 39 ILE C 42 AB4 2 VAL C 72 ? LEU C 76 ? VAL C 72 LEU C 76 AB4 3 GLY C 62 ? LEU C 67 ? GLY C 62 LEU C 67 AB5 1 VAL C 54 ? PHE C 56 ? VAL C 54 PHE C 56 AB5 2 VAL C 89 ? ALA C 91 ? VAL C 89 ALA C 91 AB6 1 GLN C 97 ? PRO C 99 ? GLN C 97 PRO C 99 AB6 2 SER C 127 ? LEU C 129 ? SER C 127 LEU C 129 AB7 1 VAL C 108 ? ILE C 109 ? VAL C 108 ILE C 109 AB7 2 THR C 222 ? THR C 228 ? THR C 222 THR C 228 AB7 3 VAL C 192 ? GLN C 201 ? VAL C 192 GLN C 201 AB7 4 HIS C 256 ? ASP C 262 ? HIS C 256 ASP C 262 AB7 5 SER C 313 ? ALA C 316 ? SER C 313 ALA C 316 AB8 1 ARG C 140 ? ARG C 141 ? ARG C 140 ARG C 141 AB8 2 LYS C 304 ? LEU C 305 ? LYS C 304 LEU C 305 AB9 1 ILE C 319 ? GLU C 321 ? ILE C 319 GLU C 321 AB9 2 GLU C 166 ? GLY C 170 ? GLU C 166 GLY C 170 AB9 3 GLY C 341 ? LEU C 345 ? GLY C 341 LEU C 345 AC1 1 VAL D 100 ? PRO D 101 ? VAL D 100 PRO D 101 AC1 2 THR D 129 ? SER D 130 ? THR D 129 SER D 130 AC2 1 ILE D 110 ? PHE D 111 ? ILE D 110 PHE D 111 AC2 2 VAL D 232 ? GLY D 237 ? VAL D 232 GLY D 237 AC2 3 VAL D 196 ? VAL D 202 ? VAL D 196 VAL D 202 AC2 4 VAL D 268 ? ASP D 273 ? VAL D 268 ASP D 273 AC2 5 ILE D 321 ? TYR D 328 ? ILE D 321 TYR D 328 AC2 6 LYS D 167 ? GLY D 172 ? LYS D 167 GLY D 172 AC2 7 THR D 350 ? VAL D 351 ? THR D 350 VAL D 351 AC3 1 LEU E 20 ? ILE E 27 ? LEU E 20 ILE E 27 AC3 2 VAL E 30 ? ALA E 34 ? VAL E 30 ALA E 34 AC3 3 ARG E 73 ? ALA E 78 ? ARG E 73 ALA E 78 AC3 4 THR E 62 ? LEU E 68 ? THR E 62 LEU E 68 AC3 5 ASN E 45 ? VAL E 49 ? ASN E 45 VAL E 49 AC3 6 GLU E 90 ? PRO E 97 ? GLU E 90 PRO E 97 AC3 7 LEU E 20 ? ILE E 27 ? LEU E 20 ILE E 27 AC4 1 SER E 99 ? PRO E 101 ? SER E 99 PRO E 101 AC4 2 THR E 129 ? PRO E 131 ? THR E 129 PRO E 131 AC5 1 ILE E 110 ? PHE E 111 ? ILE E 110 PHE E 111 AC5 2 LEU E 234 ? GLY E 237 ? LEU E 234 GLY E 237 AC5 3 SER E 197 ? VAL E 202 ? SER E 197 VAL E 202 AC5 4 ASP E 267 ? ASP E 273 ? ASP E 267 ASP E 273 AC5 5 SER E 320 ? TYR E 328 ? SER E 320 TYR E 328 AC5 6 LYS E 167 ? GLY E 172 ? LYS E 167 GLY E 172 AC5 7 VAL E 351 ? LEU E 352 ? VAL E 351 LEU E 352 AC6 1 ILE E 148 ? PHE E 149 ? ILE E 148 PHE E 149 AC6 2 TYR E 162 ? ARG E 163 ? TYR E 162 ARG E 163 AC7 1 SER F 99 ? PRO F 101 ? SER F 99 PRO F 101 AC7 2 THR F 129 ? PRO F 131 ? THR F 129 PRO F 131 AC8 1 ILE F 110 ? PHE F 111 ? ILE F 110 PHE F 111 AC8 2 VAL F 232 ? TYR F 236 ? VAL F 232 TYR F 236 AC8 3 GLY F 195 ? GLY F 201 ? GLY F 195 GLY F 201 AC8 4 ASP F 267 ? ILE F 272 ? ASP F 267 ILE F 272 AC8 5 SER F 320 ? ALA F 326 ? SER F 320 ALA F 326 AC8 6 LYS F 167 ? LEU F 170 ? LYS F 167 LEU F 170 AC8 7 ALA F 348 ? THR F 350 ? ALA F 348 THR F 350 AC9 1 ILE F 148 ? PHE F 149 ? ILE F 148 PHE F 149 AC9 2 TYR F 162 ? ARG F 163 ? TYR F 162 ARG F 163 AD1 1 LEU H 3 ? ASN H 4 ? LEU e 3 ASN e 4 AD1 2 GLU H 18 ? VAL H 19 ? GLU e 18 VAL e 19 AD2 1 SER H 13 ? TRP H 15 ? SER e 13 TRP e 15 AD2 2 VAL H 7 ? LEU H 8 ? VAL e 7 LEU e 8 AD2 3 ILE H 74 ? VAL H 78 ? ILE e 74 VAL e 78 AD2 4 GLY H 65 ? ILE H 69 ? GLY e 65 ILE e 69 AD2 5 ALA H 41 ? THR H 42 ? ALA e 41 THR e 42 AD3 1 GLN H 30 ? ILE H 31 ? GLN e 30 ILE e 31 AD3 2 GLU H 21 ? SER H 25 ? GLU e 21 SER e 25 AD3 3 LEU H 49 ? ARG H 52 ? LEU e 49 ARG e 52 AD3 4 LEU H 58 ? LEU H 62 ? LEU e 58 LEU e 62 AD3 5 ALA H 81 ? ARG H 83 ? ALA e 81 ARG e 83 AD4 1 VAL I 176 ? TYR I 179 ? VAL g 176 TYR g 179 AD4 2 THR I 156 ? SER I 159 ? THR g 156 SER g 159 AD4 3 ALA I 119 ? VAL I 122 ? ALA g 119 VAL g 122 AD4 4 VAL I 210 ? TYR I 214 ? VAL g 210 TYR g 214 AD4 5 VAL I 226 ? THR I 229 ? VAL g 226 THR g 229 AD5 1 TRP L 28 ? ILE L 30 ? TRP a 28 ILE a 30 AD5 2 GLN L 34 ? HIS L 36 ? GLN a 34 HIS a 36 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N THR A 31 ? 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N TYR A 196 AA5 2 3 N ILE A 199 ? N ILE A 199 O ASP A 262 ? O ASP A 262 AA5 3 4 N ILE A 259 ? N ILE A 259 O THR A 315 ? O THR A 315 AA6 1 2 N VAL B 54 ? N VAL B 54 O GLY B 62 ? O GLY B 62 AA6 2 3 N LEU B 67 ? N LEU B 67 O ILE D 26 ? O ILE D 26 AA6 4 5 O VAL B 72 ? O VAL B 72 N ILE B 42 ? N ILE B 42 AA6 5 6 O HIS B 43 ? O HIS B 43 N THR B 31 ? N THR B 31 AA6 6 7 N GLY B 30 ? N GLY B 30 O VAL B 89 ? O VAL B 89 AA7 1 2 N VAL B 54 ? N VAL B 54 O GLY B 62 ? O GLY B 62 AA7 3 4 O ILE D 92 ? O ILE D 92 N ILE D 48 ? N ILE D 48 AA7 4 5 N LEU D 47 ? N LEU D 47 O CYS D 63 ? O CYS D 63 AA7 5 6 N GLU D 64 ? N GLU D 64 O VAL D 77 ? O VAL D 77 AA7 6 7 O ALA D 76 ? O ALA D 76 N LEU D 31 ? N LEU D 31 AA7 7 8 O ASP D 32 ? O ASP D 32 N ALA D 24 ? N ALA D 24 AA7 9 10 O VAL B 72 ? O VAL B 72 N ILE B 42 ? N ILE B 42 AA7 10 11 O HIS B 43 ? O HIS B 43 N THR B 31 ? N THR B 31 AA7 11 12 N GLY B 30 ? N GLY B 30 O VAL B 89 ? O VAL B 89 AA8 1 2 N ILE B 98 ? N ILE B 98 O ARG B 128 ? 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