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N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 542 B NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 224 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? C ASN 224 C NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 389 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? C ASN 389 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? D ASN 542 D NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale7 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? ? covale8 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 5 ? 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AD9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC3 1 2 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 64 ? 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VAL C 267 TRP C 268 AC4 1 ILE C 288 ? LEU C 292 ? ILE C 288 LEU C 292 AC4 2 TYR C 372 ? LEU C 377 ? TYR C 372 LEU C 377 AC4 3 LEU C 382 ? ILE C 387 ? LEU C 382 ILE C 387 AC5 1 GLU C 360 ? ASN C 362 ? GLU C 360 ASN C 362 AC5 2 ASP C 366 ? LYS C 368 ? ASP C 366 LYS C 368 AC6 1 THR C 494 ? HIS C 498 ? THR C 494 HIS C 498 AC6 2 ARG C 418 ? VAL C 422 ? ARG C 418 VAL C 422 AC6 3 MET C 533 ? ILE C 534 ? MET C 533 ILE C 534 AC6 4 GLY C 782 ? MET C 783 ? GLY C 782 MET C 783 AC6 5 GLU C 549 ? PHE C 550 ? GLU C 549 PHE C 550 AC7 1 TYR C 431 ? PRO C 434 ? TYR C 431 PRO C 434 AC7 2 THR C 471 ? TYR C 477 ? THR C 471 TYR C 477 AC7 3 VAL C 455 ? PRO C 460 ? VAL C 455 PRO C 460 AC8 1 GLN C 508 ? GLU C 509 ? GLN C 508 GLU C 509 AC8 2 GLU C 518 ? TRP C 519 ? GLU C 518 TRP C 519 AC9 1 LYS C 555 ? GLN C 557 ? LYS C 555 GLN C 557 AC9 2 SER C 777 ? PHE C 779 ? SER C 777 PHE C 779 AD1 1 PHE C 750 ? ILE C 751 ? PHE C 750 ILE C 751 AD1 2 ILE C 561 ? LYS C 564 ? ILE C 561 LYS C 564 AD1 3 LEU C 767 ? THR C 770 ? LEU C 767 THR C 770 AD2 1 PRO D 97 ? ALA D 103 ? PRO D 66 ALA D 72 AD2 2 ILE D 66 ? LEU D 72 ? ILE D 35 LEU D 41 AD2 3 VAL D 128 ? ALA D 131 ? VAL D 97 ALA D 100 AD2 4 ILE D 154 ? HIS D 158 ? ILE D 123 HIS D 127 AD2 5 PHE D 174 ? GLN D 176 ? PHE D 143 GLN D 145 AD3 1 ILE D 202 ? THR D 204 ? ILE D 171 THR D 173 AD3 2 ILE D 258 ? TYR D 262 ? ILE D 227 TYR D 231 AD3 3 THR D 286 ? ILE D 288 ? THR D 255 ILE D 257 AD4 1 ILE D 309 ? SER D 310 ? ILE D 278 SER D 279 AD4 2 ILE D 396 ? LEU D 397 ? ILE D 365 LEU D 366 AD5 1 LYS D 409 ? LYS D 411 ? LYS D 378 LYS D 380 AD5 2 SER D 414 ? GLN D 416 ? SER D 383 GLN D 385 AD6 1 ILE D 439 ? VAL D 440 ? ILE D 408 VAL D 409 AD6 2 MET D 539 ? ALA D 540 ? MET D 508 ALA D 509 AD6 3 ALA D 796 ? ILE D 797 ? ALA D 765 ILE D 766 AD7 1 VAL D 465 ? PRO D 466 ? VAL D 434 PRO D 435 AD7 2 CYS D 487 ? CYS D 488 ? CYS D 456 CYS D 457 AD8 1 LYS D 519 ? LYS D 520 ? LYS D 488 LYS D 489 AD8 2 TRP D 525 ? ASN D 526 ? TRP D 494 ASN D 495 AD9 1 PHE D 714 ? GLY D 715 ? 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cisTEM 1.0.0 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' NS111745 1 'National Institutes of Health/National Institute of Mental Health (NIH/NIMH)' 'United States' MH085926 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero E 3 NAG 1 E NAG 1 A NAG 863 n E 3 NAG 2 E NAG 2 A NAG 864 n F 3 NAG 1 F NAG 1 C NAG 863 n F 3 NAG 2 F NAG 2 C NAG 864 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 3 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 3 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 3 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 4 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #