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n L 12 51 GLU 51 52 52 GLU GLU t . n L 12 52 ALA 52 53 53 ALA ALA t . n L 12 53 VAL 53 54 54 VAL VAL t . n L 12 54 LYS 54 55 55 LYS LYS t . n L 12 55 ALA 55 56 56 ALA ALA t . n L 12 56 VAL 56 57 57 VAL VAL t . n L 12 57 ASP 57 58 58 ASP ASP t . n L 12 58 MET 58 59 59 MET MET t . n L 12 59 ALA 59 60 60 ALA ALA t . n L 12 60 ALA 60 61 61 ALA ALA t . n L 12 61 THR 61 62 62 THR THR t . n L 12 62 LYS 62 63 63 LYS LYS t . n L 12 63 GLY 63 64 64 GLY GLY t . n L 12 64 LEU 64 65 65 LEU LEU t . n L 12 65 ILE 65 66 66 ILE ILE t . n L 12 66 HIS 66 67 67 HIS HIS t . n L 12 67 LYS 67 68 68 LYS LYS t . n L 12 68 ASN 68 69 69 ASN ASN t . n L 12 69 LYS 69 70 70 LYS LYS t . n L 12 70 ALA 70 71 71 ALA ALA t . n L 12 71 ASN 71 72 72 ASN ASN t . n L 12 72 ARG 72 73 73 ARG ARG t . n L 12 73 ASP 73 74 74 ASP ASP t . n L 12 74 LYS 74 75 75 LYS LYS t . n L 12 75 ILE 75 76 76 ILE ILE t . n L 12 76 ARG 76 77 77 ARG ARG t . n L 12 77 LEU 77 78 78 LEU LEU t . n L 12 78 SER 78 79 79 SER SER t . n L 12 79 LYS 79 80 80 LYS LYS t . n L 12 80 LEU 80 81 81 LEU LEU t . n L 12 81 ALA 81 82 82 ALA ALA t . n L 12 82 LYS 82 83 83 LYS LYS t . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6WUB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6WUB _struct.title '30S subunit (head) of 70S Ribosome Enterococcus faecalis MultiBody refinement' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6WUB _struct_keywords.text '70S, ribosome, pathogen, antibiotic development, antibiotic resistant' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? 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A0A1B4XQJ7 2 ? 83 ? 2 83 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 TRP B 8 ? 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A A 145 N6 ? ? ? 1_555 A U 235 O4 ? ? a A 147 a U 237 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog205 hydrog ? ? A G 146 N2 ? ? ? 1_555 A A 215 N3 ? ? a G 148 a A 217 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog206 hydrog ? ? A G 146 N1 ? ? ? 1_555 A C 234 N3 ? ? a G 148 a C 236 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog207 hydrog ? ? A G 146 N2 ? ? ? 1_555 A C 234 O2 ? ? a G 148 a C 236 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog208 hydrog ? ? A G 146 O6 ? ? ? 1_555 A C 234 N4 ? ? a G 148 a C 236 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog209 hydrog ? ? A G 148 N1 ? ? ? 1_555 A C 182 N3 ? ? a G 150 a C 184 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog210 hydrog ? ? A G 148 N2 ? ? ? 1_555 A C 182 O2 ? ? a G 150 a C 184 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog211 hydrog ? ? A G 148 O6 ? ? ? 1_555 A C 182 N4 ? ? a G 150 a C 184 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog212 hydrog ? ? A G 150 N1 ? ? ? 1_555 A C 180 N3 ? ? a G 152 a C 182 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog213 hydrog ? ? A G 150 N2 ? ? ? 1_555 A C 180 O2 ? ? a G 152 a C 182 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog214 hydrog ? ? A G 150 O6 ? ? ? 1_555 A C 180 N4 ? ? a G 152 a C 182 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog215 hydrog ? ? A G 151 N1 ? ? ? 1_555 A C 179 N3 ? ? a G 153 a C 181 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog216 hydrog ? ? A G 151 N2 ? ? ? 1_555 A C 179 O2 ? ? a G 153 a C 181 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog217 hydrog ? ? A G 151 O6 ? ? ? 1_555 A C 179 N4 ? ? a G 153 a C 181 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog218 hydrog ? ? A G 151 N2 ? ? ? 1_555 A A 1460 N3 ? ? a G 153 a A 1462 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog219 hydrog ? ? A G 152 N1 ? ? ? 1_555 A A 178 N1 ? ? a G 154 a A 180 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog220 hydrog ? ? A G 152 O6 ? ? ? 1_555 A A 178 N6 ? ? a G 154 a A 180 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog221 hydrog ? ? A A 153 N1 ? ? ? 1_555 A A 176 N6 ? ? a A 155 a A 178 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? ? hydrog222 hydrog ? ? A A 153 N6 ? ? ? 1_555 A A 176 N7 ? ? a A 155 a A 178 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? ? hydrog223 hydrog ? ? A U 154 N3 ? ? ? 1_555 A A 175 N7 ? ? a U 156 a A 177 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog224 hydrog ? ? A U 154 O2 ? ? ? 1_555 A A 175 N6 ? ? a U 156 a A 177 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog225 hydrog ? ? A A 155 N6 ? ? ? 1_555 A U 174 O2 ? ? a A 157 a U 176 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog226 hydrog ? ? A A 155 N7 ? ? ? 1_555 A U 174 N3 ? ? a A 157 a U 176 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog227 hydrog ? ? A A 156 N6 ? ? ? 1_555 A C 173 N3 ? ? a A 158 a C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog228 hydrog ? ? A A 156 N7 ? ? ? 1_555 A C 173 N4 ? ? a A 158 a C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog229 hydrog ? ? A C 157 N3 ? ? ? 1_555 A G 172 N1 ? ? a C 159 a G 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog230 hydrog ? ? A C 157 N4 ? ? ? 1_555 A G 172 O6 ? ? a C 159 a G 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog231 hydrog ? ? A C 157 O2 ? ? ? 1_555 A G 172 N2 ? ? a C 159 a G 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? A A 158 N1 ? ? ? 1_555 A U 171 N3 ? ? a A 160 a U 173 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? A A 158 N6 ? ? ? 1_555 A U 171 O4 ? ? a A 160 a U 173 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? A C 159 N3 ? ? ? 1_555 A G 170 N1 ? ? a C 161 a G 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? A C 159 N4 ? ? ? 1_555 A G 170 O6 ? ? a C 161 a G 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? A C 159 O2 ? ? ? 1_555 A G 170 N2 ? ? a C 161 a G 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? A U 160 N3 ? ? ? 1_555 A G 169 O6 ? ? a U 162 a G 171 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? 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TYPE_10_PAIR ? ? ? hydrog247 hydrog ? ? A U 177 O4 ? ? ? 1_555 A G 217 N2 ? ? a U 179 a G 219 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog248 hydrog ? ? A A 183 N1 ? ? ? 1_555 A A 215 N6 ? ? a A 185 a A 217 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? ? hydrog249 hydrog ? ? A A 183 N6 ? ? ? 1_555 A A 215 N7 ? ? a A 185 a A 217 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? ? hydrog250 hydrog ? ? A U 184 N3 ? ? ? 1_555 A A 214 N7 ? ? a U 186 a A 216 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog251 hydrog ? ? A U 184 O2 ? ? ? 1_555 A A 214 N6 ? ? a U 186 a A 216 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog252 hydrog ? ? A A 186 N6 ? ? ? 1_555 A U 212 O2 ? ? a A 188 a U 214 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog253 hydrog ? ? A A 186 N7 ? ? ? 1_555 A U 212 N3 ? ? a A 188 a U 214 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog254 hydrog ? ? A A 188 N6 ? ? ? 1_555 A G 211 O6 ? ? a A 190 a G 213 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog255 hydrog ? ? A G 189 N1 ? ? ? 1_555 A A 210 N1 ? ? a G 191 a A 212 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog256 hydrog ? ? A G 189 O6 ? ? ? 1_555 A A 210 N6 ? ? a G 191 a A 212 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog257 hydrog ? ? A U 190 N3 ? ? ? 1_555 A G 209 O6 ? ? a U 192 a G 211 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog258 hydrog ? ? A U 190 O2 ? ? ? 1_555 A G 209 N1 ? ? a U 192 a G 211 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog259 hydrog ? ? A U 191 N3 ? ? ? 1_555 A A 208 N1 ? ? a U 193 a A 210 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog260 hydrog ? ? A U 191 O4 ? ? ? 1_555 A A 208 N6 ? ? a U 193 a A 210 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog261 hydrog ? ? A U 192 N3 ? ? ? 1_555 A A 207 N1 ? ? a U 194 a A 209 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog262 hydrog ? ? A U 192 O4 ? ? ? 1_555 A A 207 N6 ? ? a U 194 a A 209 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog263 hydrog ? ? A A 193 N1 ? ? ? 1_555 A U 206 N3 ? ? a A 195 a U 208 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog264 hydrog ? ? A A 193 N6 ? ? ? 1_555 A U 206 O4 ? ? a A 195 a U 208 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog265 hydrog ? ? A U 194 N3 ? ? ? 1_555 A A 205 N1 ? ? a U 196 a A 207 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog266 hydrog ? ? A U 194 O4 ? ? ? 1_555 A A 205 N6 ? ? a U 196 a A 207 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog267 hydrog ? ? A G 195 N1 ? ? ? 1_555 A C 204 N3 ? ? a G 197 a C 206 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog268 hydrog ? ? A G 195 N2 ? ? ? 1_555 A C 204 O2 ? ? a G 197 a C 206 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog269 hydrog ? ? A G 195 O6 ? ? ? 1_555 A C 204 N4 ? ? a G 197 a C 206 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog270 hydrog ? ? A C 196 N3 ? ? ? 1_555 A G 203 N1 ? ? a C 198 a G 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog271 hydrog ? ? A C 196 N4 ? ? ? 1_555 A G 203 O6 ? ? a C 198 a G 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog272 hydrog ? ? A C 196 O2 ? ? ? 1_555 A G 203 N2 ? ? a C 198 a G 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog273 hydrog ? ? A C 197 N3 ? ? ? 1_555 A G 202 N1 ? ? a C 199 a G 204 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog274 hydrog ? ? A C 197 N4 ? ? ? 1_555 A G 202 O6 ? ? a C 199 a G 204 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog275 hydrog ? ? A C 197 O2 ? ? ? 1_555 A G 202 N2 ? ? a C 199 a G 204 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog276 hydrog ? ? A A 216 N3 ? ? ? 1_555 A G 233 N2 ? ? a A 218 a G 235 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog277 hydrog ? ? A G 217 N1 ? ? ? 1_555 A C 232 N3 ? ? a G 219 a C 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog278 hydrog ? ? A G 217 N2 ? ? ? 1_555 A C 232 O2 ? ? a G 219 a C 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog279 hydrog ? ? A G 217 O6 ? ? ? 1_555 A C 232 N4 ? ? a G 219 a C 234 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog280 hydrog ? ? A G 218 N1 ? ? ? 1_555 A U 231 O2 ? ? a G 220 a U 233 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog281 hydrog ? ? A G 218 O6 ? ? ? 1_555 A U 231 N3 ? ? a G 220 a U 233 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog282 hydrog ? ? A C 219 N3 ? ? ? 1_555 A G 230 N1 ? ? a C 221 a G 232 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog283 hydrog ? ? A C 219 N4 ? ? ? 1_555 A G 230 O6 ? ? a C 221 a G 232 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog284 hydrog ? ? A C 219 O2 ? ? ? 1_555 A G 230 N2 ? ? a C 221 a G 232 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog285 hydrog ? ? A G 220 N1 ? ? ? 1_555 A U 229 O2 ? ? a G 222 a U 231 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog286 hydrog ? ? A G 220 O6 ? ? ? 1_555 A U 229 N3 ? ? a G 222 a U 231 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog287 hydrog ? ? A C 221 N3 ? ? ? 1_555 A G 228 N1 ? ? a C 223 a G 230 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog288 hydrog ? ? A C 221 N4 ? ? ? 1_555 A G 228 O6 ? ? a C 223 a G 230 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog289 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog417 hydrog ? ? A C 382 O2 ? ? ? 1_555 A G 405 N2 ? ? a C 384 a G 407 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog418 hydrog ? ? A G 383 N1 ? ? ? 1_555 A C 404 N3 ? ? a G 385 a C 406 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog419 hydrog ? ? A G 383 N2 ? ? ? 1_555 A C 404 O2 ? ? a G 385 a C 406 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog420 hydrog ? ? A G 383 O6 ? ? ? 1_555 A C 404 N4 ? ? a G 385 a C 406 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog421 hydrog ? ? A G 384 N1 ? ? ? 1_555 A C 403 N3 ? ? a G 386 a C 405 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog422 hydrog ? ? A G 384 N2 ? ? ? 1_555 A C 403 O2 ? ? a G 386 a C 405 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog423 hydrog ? ? A G 384 O6 ? ? ? 1_555 A C 403 N4 ? ? a G 386 a C 405 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog424 hydrog ? ? A C 385 N3 ? ? ? 1_555 A A 402 N6 ? ? a C 387 a A 404 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog425 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog451 hydrog ? ? A G 421 N1 ? ? ? 1_555 A C 447 N3 ? ? a G 423 a C 449 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog452 hydrog ? ? A G 421 N2 ? ? ? 1_555 A C 447 O2 ? ? a G 423 a C 449 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog453 hydrog ? ? A G 421 O6 ? ? ? 1_555 A C 447 N4 ? ? a G 423 a C 449 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog454 hydrog ? ? A U 422 N3 ? ? ? 1_555 A A 446 N1 ? ? a U 424 a A 448 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog455 hydrog ? ? A U 422 O4 ? ? ? 1_555 A A 446 N6 ? ? a U 424 a A 448 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog456 hydrog ? ? A G 423 N2 ? ? ? 1_555 A A 445 N7 ? ? a G 425 a A 447 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog457 hydrog ? ? A G 423 N3 ? ? ? 1_555 A A 445 N6 ? ? a G 425 a A 447 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog458 hydrog ? ? A A 424 N1 ? ? ? 1_555 A A 443 N6 ? ? a A 426 a A 445 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? ? hydrog459 hydrog ? ? 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A G 470 N1 ? ? ? 1_555 A C 489 N3 ? ? a G 472 a C 491 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog511 hydrog ? ? A G 470 N2 ? ? ? 1_555 A C 489 O2 ? ? a G 472 a C 491 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog512 hydrog ? ? A G 470 O6 ? ? ? 1_555 A C 489 N4 ? ? a G 472 a C 491 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog513 hydrog ? ? A A 471 N1 ? ? ? 1_555 A U 488 N3 ? ? a A 473 a U 490 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog514 hydrog ? ? A A 471 N6 ? ? ? 1_555 A U 488 O4 ? ? a A 473 a U 490 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog515 hydrog ? ? A C 472 N3 ? ? ? 1_555 A G 487 N1 ? ? a C 474 a G 489 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog516 hydrog ? ? A C 472 N4 ? ? ? 1_555 A G 487 O6 ? ? a C 474 a G 489 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog517 hydrog ? ? A C 472 O2 ? ? ? 1_555 A G 487 N2 ? ? a C 474 a G 489 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog518 hydrog ? ? A G 473 N2 ? ? ? 1_555 A C 486 N3 ? ? a G 475 a C 488 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog519 hydrog ? ? A U 474 N3 ? ? ? 1_555 A A 485 N1 ? ? a U 476 a A 487 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog520 hydrog ? ? A U 474 O2 ? ? ? 1_555 A C 486 N4 ? ? a U 476 a C 488 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-C MISPAIR' ? ? ? hydrog521 hydrog ? ? A U 475 N3 ? ? ? 1_555 A A 484 N1 ? ? a U 477 a A 486 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog522 hydrog ? ? A U 475 O4 ? ? ? 1_555 A A 484 N6 ? ? a U 477 a A 486 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog523 hydrog ? ? A A 476 N6 ? ? ? 1_555 A G 483 O6 ? ? a A 478 a G 485 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog524 hydrog ? ? A G 477 N2 ? ? ? 1_555 A U 482 O4 ? ? a G 479 a U 484 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog525 hydrog ? ? A U 478 O2 ? ? ? 1_555 A C 481 N4 ? ? a U 480 a C 483 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-C MISPAIR' ? ? ? hydrog526 hydrog ? ? A G 509 N1 ? ? ? 1_555 A A 511 N7 ? ? a G 511 a A 513 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_9_PAIR ? ? ? hydrog527 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog536 hydrog ? ? A C 515 O2 ? ? ? 1_555 A G 556 N2 ? ? a C 517 a G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog537 hydrog ? ? A A 516 N1 ? ? ? 1_555 A U 555 N3 ? ? a A 518 a U 557 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog538 hydrog ? ? A A 516 N6 ? ? ? 1_555 A U 555 O4 ? ? a A 518 a U 557 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog539 hydrog ? ? A C 517 N3 ? ? ? 1_555 A G 554 N1 ? ? a C 519 a G 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog540 hydrog ? ? A C 517 N4 ? ? ? 1_555 A G 554 O6 ? ? a C 519 a G 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog541 hydrog ? ? A C 517 O2 ? ? ? 1_555 A G 554 N2 ? ? a C 519 a G 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog542 hydrog ? ? A G 518 N1 ? ? ? 1_555 A C 539 N3 ? ? a G 520 a C 541 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog543 hydrog ? ? A G 518 N2 ? ? ? 1_555 A C 539 O2 ? ? a G 520 a C 541 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog544 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog553 hydrog ? ? A C 524 N4 ? ? ? 1_555 A G 553 O6 ? ? a C 526 a G 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog554 hydrog ? ? A C 524 O2 ? ? ? 1_555 A G 553 N2 ? ? a C 526 a G 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog555 hydrog ? ? A U 525 N3 ? ? ? 1_555 A A 552 N1 ? ? a U 527 a A 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog556 hydrog ? ? A U 525 O4 ? ? ? 1_555 A A 552 N6 ? ? a U 527 a A 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog557 hydrog ? ? A A 526 N1 ? ? ? 1_555 A U 551 N3 ? ? a A 528 a U 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog558 hydrog ? ? A A 526 N6 ? ? ? 1_555 A U 551 O4 ? ? a A 528 a U 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog559 hydrog ? ? A C 527 N3 ? ? ? 1_555 A G 550 N1 ? ? a C 529 a G 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog560 hydrog ? ? A C 527 N4 ? ? ? 1_555 A G 550 O6 ? ? a C 529 a G 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog561 hydrog ? ? 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'G-A MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 57 E . ? GLY 58 h VAL 58 E ? VAL 59 h 1 11.21 2 LYS 56 G . ? LYS 57 l PRO 57 G ? PRO 58 l 1 2.23 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 5 ? 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VAL q 10 SER q 17 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 O LYS B 124 ? 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FREALIGN 9.03 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 0.63 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 1.5 _em_specimen.details 'Sample was monodisperse.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6WUB 'double helix' 6WUB 'a-form double helix' 6WUB 'parallel strands' 6WUB 'hairpin loop' 6WUB tetraloop 6WUB 'bulge loop' 6WUB 'mismatched base pair' 6WUB 'internal loop' 6WUB 'triple helix' 6WUB 'quadruple helix' 6WUB 'three-way junction' 6WUB 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 2 1_555 A U 573 1_555 4.893 3.147 -0.234 35.059 8.986 -60.278 1 a_G4:U575_a a 4 ? a 575 ? ? ? 1 A G 571 1_555 A A 21 1_555 6.793 -4.135 -0.273 -15.619 5.657 -0.855 2 a_G573:A23_a a 573 ? a 23 ? 11 10 1 A G 4 1_555 A C 20 1_555 -0.150 -0.221 0.211 -6.956 -1.479 -2.471 3 a_G6:C22_a a 6 ? a 22 ? 19 1 1 A A 5 1_555 A U 19 1_555 0.077 -0.133 -0.069 -2.534 -6.258 0.193 4 a_A7:U21_a a 7 ? a 21 ? 20 1 1 A G 6 1_555 A C 18 1_555 -0.137 -0.120 -0.081 -1.714 -4.912 -3.040 5 a_G8:C20_a a 8 ? a 20 ? 19 1 1 A U 7 1_555 A G 17 1_555 2.513 -0.341 -0.123 0.515 -6.596 -1.696 6 a_U9:G19_a a 9 ? a 19 ? 28 1 1 A A 928 1_555 A G 16 1_555 -6.831 -4.429 -0.407 1.492 4.159 -5.470 7 a_A930:G18_a a 930 ? a 18 ? 11 10 1 A A 929 1_555 A U 8 1_555 0.363 -3.435 0.151 -4.946 1.715 64.731 8 a_A931:U10_a a 931 ? a 10 ? 23 3 1 A G 930 1_555 A C 14 1_555 -0.313 -0.168 -0.033 -0.828 -7.963 -0.870 9 a_G932:C16_a a 932 ? a 16 ? 19 1 1 A G 931 1_555 A C 13 1_555 -0.214 -0.025 -0.190 -4.815 -7.553 1.670 10 a_G933:C15_a a 933 ? a 15 ? 19 1 1 A A 932 1_555 A U 12 1_555 0.321 0.146 0.015 3.779 -7.238 1.504 11 a_A934:U14_a a 934 ? 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