data_6XKW # _entry.id 6XKW # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.338 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6XKW WWPDB D_1000250195 EMDB EMD-22227 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB '6XI0 contains the CIII2 part of this super-complex which was obtained from the same dataset and used to build this model' 6XI0 unspecified EMDB 'R. capsulatus CIII2CIV bipartite super-complex (SC-2A) with CcoH/cy' EMD-22227 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6XKW _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-06-27 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Steimle, S.' 1 0000-0002-5552-0463 'Van Eeuwen, T.' 2 0000-0003-0549-1702 'Ozturk, Y.' 3 ? 'Kim, H.J.' 4 0000-0002-0823-5301 'Braitbard, M.' 5 ? 'Selamoglu, N.' 6 ? 'Garcia, B.A.' 7 ? 'Schneidman-Duhovny, D.' 8 ? 'Murakami, K.' 9 0000-0002-2017-5575 'Daldal, F.' 10 0000-0002-2865-9574 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 929 _citation.page_last 929 _citation.title ;Cryo-EM structures of engineered active bc 1 -cbb 3 type CIII 2 CIV super-complexes and electronic communication between the complexes. ; _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-21051-4 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33568648 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Steimle, S.' 1 ? primary 'van Eeuwen, T.' 2 0000-0003-0549-1702 primary 'Ozturk, Y.' 3 ? primary 'Kim, H.J.' 4 0000-0002-0823-5301 primary 'Braitbard, M.' 5 ? primary 'Selamoglu, N.' 6 ? primary 'Garcia, B.A.' 7 ? primary 'Schneidman-Duhovny, D.' 8 ? primary 'Murakami, K.' 9 0000-0002-2017-5575 primary 'Daldal, F.' 10 0000-0002-2865-9574 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6XKW _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6XKW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit I' 58975.086 1 1.9.3.1 ? ? ? 2 polymer nat 'Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit II' 26998.650 1 1.9.3.1 ? ? ? 3 polymer man 'Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoP' 31739.598 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, biogenesis protein CcoH' 16285.735 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Cytochrome c-type cyt cy' 20681.783 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit' 20465.109 2 7.1.1.8 ? ? ? 7 polymer man 'Cytochrome b' 49386.469 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Cytochrome c1' 30352.615 2 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'HEME C' 618.503 11 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'COPPER (II) ION' 63.546 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' 175.820 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 3 'Cbb3-Cox subunit CcoP,C-type cytochrome CcoP,Cyt c(P),Cytochrome c oxidase subunit III' 6 'Rieske iron-sulfur protein,RISP' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MWDYVKLVALGVVVAIAAYAASQARDLPYMVNMVEVALAAVIAFIWVLRTMGDAKPSKDEYFDGVIRAGVIATTFWGIVG FLVAVIIAFQLAFPALNLEFGNGMLNFGRLRPLHTSAVIFAFGGNALIASAFYVVQRTSAARLFGGTALGWFVFWGWQLI IVTAATSYLLGGSQGKEYAELNWHLDILVAIVWVAYLIAFLGTIFKRKEPHIYVANWFYLSFIVTIAMLHIVNNLAVPVS IFGTKSVQLMAGVQDAMTQWWYGHNAVGFFLTAGFLGMMYYFVPKQAERPVYSYKLSIVHFWALIFLYIWAGPHHLHYTA LPDWASTLGMVMSVILWMPSWGGMINGLMTLSGAWDKLRTDPVIRMMVVSIGFYGMSTFEGPMMSIKAVNSLSHYTDWTI GHVHSGALGWNGMITFGMLYFLTPRLWGRSGLYSLKLVSWHFWLATIGIVLYASSMWVSGIMEGLMWREVDAQGFLVNGF ADTVGAKFPMNVVRGVGGVLYLTGGLIMAYNLWATVAKQPKTANLAVAVPAE ; ;MWDYVKLVALGVVVAIAAYAASQARDLPYMVNMVEVALAAVIAFIWVLRTMGDAKPSKDEYFDGVIRAGVIATTFWGIVG FLVAVIIAFQLAFPALNLEFGNGMLNFGRLRPLHTSAVIFAFGGNALIASAFYVVQRTSAARLFGGTALGWFVFWGWQLI IVTAATSYLLGGSQGKEYAELNWHLDILVAIVWVAYLIAFLGTIFKRKEPHIYVANWFYLSFIVTIAMLHIVNNLAVPVS IFGTKSVQLMAGVQDAMTQWWYGHNAVGFFLTAGFLGMMYYFVPKQAERPVYSYKLSIVHFWALIFLYIWAGPHHLHYTA LPDWASTLGMVMSVILWMPSWGGMINGLMTLSGAWDKLRTDPVIRMMVVSIGFYGMSTFEGPMMSIKAVNSLSHYTDWTI GHVHSGALGWNGMITFGMLYFLTPRLWGRSGLYSLKLVSWHFWLATIGIVLYASSMWVSGIMEGLMWREVDAQGFLVNGF ADTVGAKFPMNVVRGVGGVLYLTGGLIMAYNLWATVAKQPKTANLAVAVPAE ; n ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSIMDKHHVLEKNATLLLIFAFLVVTIGGIVEIAPLFYLENTIEKVEGMRPYTPLELTGRDIYIREGCYVCHSQMIRPMR DEVERYGHYSLAAESMYDHPFQWGSKRTGPDLARVGGRYSDAWHVEHLSNPQSVVPESVMPSYSYLANVPLDSTWIEDRV STDALVGVPYSAEMIAAAKADFVAQADPNADSATLVANYGEKVNIRNFDGKPGLTEMDALVAYLQVLGTMVDFSTFQPVA SR ; ;MSIMDKHHVLEKNATLLLIFAFLVVTIGGIVEIAPLFYLENTIEKVEGMRPYTPLELTGRDIYIREGCYVCHSQMIRPMR DEVERYGHYSLAAESMYDHPFQWGSKRTGPDLARVGGRYSDAWHVEHLSNPQSVVPESVMPSYSYLANVPLDSTWIEDRV STDALVGVPYSAEMIAAAKADFVAQADPNADSATLVANYGEKVNIRNFDGKPGLTEMDALVAYLQVLGTMVDFSTFQPVA SR ; o ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSKKPTTKKEVQTTGHSWDGIEELNTPLPRWWLWTFYATIVWGVAYSIAMPAWPIFASGATPGILGSSTRADVEKDIAKF AEMNKAVEDKLVATDLTAIAADPELVTYTRNAGAAVFRTWCAQCHGAGAGGNTGFPSLLDGDWLHGGSIETIYTNIKHGI RDPLDPDTLPVANMPAHLTDELLEPAQIDDVVQYVLKISGQPADEARATAGQQVFADNCVSCHGEDAKGMVEMGAPNLTD GIWLYGGDANTITTTIQLGRGGVMPSWSWAADGAKPRLSEAQIRAVASYVHSLGGGQ ; ;MSKKPTTKKEVQTTGHSWDGIEELNTPLPRWWLWTFYATIVWGVAYSIAMPAWPIFASGATPGILGSSTRADVEKDIAKF AEMNKAVEDKLVATDLTAIAADPELVTYTRNAGAAVFRTWCAQCHGAGAGGNTGFPSLLDGDWLHGGSIETIYTNIKHGI RDPLDPDTLPVANMPAHLTDELLEPAQIDDVVQYVLKISGQPADEARATAGQQVFADNCVSCHGEDAKGMVEMGAPNLTD GIWLYGGDANTITTTIQLGRGGVMPSWSWAADGAKPRLSEAQIRAVASYVHSLGGGQ ; p ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAKPLTGRKVLLMFVAFFGLIIAVNVTMAVQAVKTFPGLEVANSYVASQTFDADRAAQERLGWTVKPAYADGVLSLDIRD RAGQPAPLGQLEVLVGRTTMAAEDRTPQMTRTDGVYSAPLSLAPGAWLIHLSATSADGVLFRQRLDFFVEG ; ;MAKPLTGRKVLLMFVAFFGLIIAVNVTMAVQAVKTFPGLEVANSYVASQTFDADRAAQERLGWTVKPAYADGVLSLDIRD RAGQPAPLGQLEVLVGRTTMAAEDRTPQMTRTDGVYSAPLSLAPGAWLIHLSATSADGVLFRQRLDFFVEG ; h ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MLVKTHITKIGVTLFAVALFYGFIYMLSNSLFATRPATAVAVGADGKALLPSVDEAAMPAKAPAAAAPAAETAEAAAPAE PAAPPPPAYVEVDPATITGDAKAGEEKFNKTCKACHKIDGKNAVGPHLNGVIGRATATVEGFKYSTAMKNHVGNWTPERL DIYLVSPKAEVPGTKMSFVGLPEAADRANVIAYLNTLPR ; ;MLVKTHITKIGVTLFAVALFYGFIYMLSNSLFATRPATAVAVGADGKALLPSVDEAAMPAKAPAAAAPAAETAEAAAPAE PAAPPPPAYVEVDPATITGDAKAGEEKFNKTCKACHKIDGKNAVGPHLNGVIGRATATVEGFKYSTAMKNHVGNWTPERL DIYLVSPKAEVPGTKMSFVGLPEAADRANVIAYLNTLPR ; Y ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSHAEDNAGTRRDFLYHATAATGVVVTGAAVWPLINQMNASADVKAMASIFVDVSAVEVGTQLTVKWRGKPVFIRRRDEK DIELARSVPLGALRDTSAENANKPGAEATDENRTLPAFDGTNTGEWLVMLGVCTHLGCVPMGDKSGDFGGWFCPCHGSHY DSAGRIRKGPAPRNLDIPVAAFVDETTIKLG ; ;MSHAEDNAGTRRDFLYHATAATGVVVTGAAVWPLINQMNASADVKAMASIFVDVSAVEVGTQLTVKWRGKPVFIRRRDEK DIELARSVPLGALRDTSAENANKPGAEATDENRTLPAFDGTNTGEWLVMLGVCTHLGCVPMGDKSGDFGGWFCPCHGSHY DSAGRIRKGPAPRNLDIPVAAFVDETTIKLG ; E,R ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSGIPHDHYEPKTGIEKWLHDRLPIVGLVYDTIMIPTPKNLNWWWIWGIVLAFTLVLQIVTGIVLAMHYTPHVDLAFASV EHIMRDVNGGWAMRYIHANGASLFFLAVYIHIFRGLYYGSYKAPREITWIVGMVIYLLMMGTAFMGYVLPWGQMSFWGAT VITGLFGAIPGIGPSIQAWLLGGPAVDNATLNRFFSLHYLLPFVIAALVAIHIWAFHTTGNNNPTGVEVRRTSKADAEKD TLPFWPYFVIKDLFALALVLLGFFAVVAYMPNYLGHPDNYVQANPLSTPAHIVPEWYFLPFYAILRAFAADVWVVILVDG LTFGIVDAKFFGVIAMFGAIAVMALAPWLDTSKVRSGAYRPKFRMWFWFLVLDFVVLTWVGAMPTEYPYDWISLIASTYW FAYFLVILPLLGATEKPEPIPASIEEDFNSHYGNPAE ; ;MSGIPHDHYEPKTGIEKWLHDRLPIVGLVYDTIMIPTPKNLNWWWIWGIVLAFTLVLQIVTGIVLAMHYTPHVDLAFASV EHIMRDVNGGWAMRYIHANGASLFFLAVYIHIFRGLYYGSYKAPREITWIVGMVIYLLMMGTAFMGYVLPWGQMSFWGAT VITGLFGAIPGIGPSIQAWLLGGPAVDNATLNRFFSLHYLLPFVIAALVAIHIWAFHTTGNNNPTGVEVRRTSKADAEKD TLPFWPYFVIKDLFALALVLLGFFAVVAYMPNYLGHPDNYVQANPLSTPAHIVPEWYFLPFYAILRAFAADVWVVILVDG LTFGIVDAKFFGVIAMFGAIAVMALAPWLDTSKVRSGAYRPKFRMWFWFLVLDFVVLTWVGAMPTEYPYDWISLIASTYW FAYFLVILPLLGATEKPEPIPASIEEDFNSHYGNPAE ; C,P ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MKKLLISAVSALVLGSGAAFANSNVPDHAFSFEGIFGKYDQAQLRRGFQVYNEVCSACHGMKFVPIRTLADDGGPQLDPT FVREYAAGLDTIIDKDSGEERDRKETDMFPTRVGDGMGPDLSVMAKARAGFSGPAGSGMNQLFKGMGGPEYIYNYVIGFE ENPECAPEGIDGYYYNKTFQIGGVPDTCKDAAGVKITHGSWARMPPPLVDDQVTYEDGTPATVDQMAQDVSAFLMWAAEP KLVARKQMGLVAMVMLGLLSVMLYLTNKRLWAPYKGHKA ; ;MKKLLISAVSALVLGSGAAFANSNVPDHAFSFEGIFGKYDQAQLRRGFQVYNEVCSACHGMKFVPIRTLADDGGPQLDPT FVREYAAGLDTIIDKDSGEERDRKETDMFPTRVGDGMGPDLSVMAKARAGFSGPAGSGMNQLFKGMGGPEYIYNYVIGFE ENPECAPEGIDGYYYNKTFQIGGVPDTCKDAAGVKITHGSWARMPPPLVDDQVTYEDGTPATVDQMAQDVSAFLMWAAEP KLVARKQMGLVAMVMLGLLSVMLYLTNKRLWAPYKGHKA ; D,Q ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 TRP n 1 3 ASP n 1 4 TYR n 1 5 VAL n 1 6 LYS n 1 7 LEU n 1 8 VAL n 1 9 ALA n 1 10 LEU n 1 11 GLY n 1 12 VAL n 1 13 VAL n 1 14 VAL n 1 15 ALA n 1 16 ILE n 1 17 ALA n 1 18 ALA n 1 19 TYR n 1 20 ALA n 1 21 ALA n 1 22 SER n 1 23 GLN n 1 24 ALA n 1 25 ARG n 1 26 ASP n 1 27 LEU n 1 28 PRO n 1 29 TYR n 1 30 MET n 1 31 VAL n 1 32 ASN n 1 33 MET n 1 34 VAL n 1 35 GLU n 1 36 VAL n 1 37 ALA n 1 38 LEU n 1 39 ALA n 1 40 ALA n 1 41 VAL n 1 42 ILE n 1 43 ALA n 1 44 PHE n 1 45 ILE n 1 46 TRP n 1 47 VAL n 1 48 LEU n 1 49 ARG n 1 50 THR n 1 51 MET n 1 52 GLY n 1 53 ASP n 1 54 ALA n 1 55 LYS n 1 56 PRO n 1 57 SER n 1 58 LYS n 1 59 ASP n 1 60 GLU n 1 61 TYR n 1 62 PHE n 1 63 ASP n 1 64 GLY n 1 65 VAL n 1 66 ILE n 1 67 ARG n 1 68 ALA n 1 69 GLY n 1 70 VAL n 1 71 ILE n 1 72 ALA n 1 73 THR n 1 74 THR n 1 75 PHE n 1 76 TRP n 1 77 GLY n 1 78 ILE n 1 79 VAL n 1 80 GLY n 1 81 PHE n 1 82 LEU n 1 83 VAL n 1 84 ALA n 1 85 VAL n 1 86 ILE n 1 87 ILE n 1 88 ALA n 1 89 PHE n 1 90 GLN n 1 91 LEU n 1 92 ALA n 1 93 PHE n 1 94 PRO n 1 95 ALA n 1 96 LEU n 1 97 ASN n 1 98 LEU n 1 99 GLU n 1 100 PHE n 1 101 GLY n 1 102 ASN n 1 103 GLY n 1 104 MET n 1 105 LEU n 1 106 ASN n 1 107 PHE n 1 108 GLY n 1 109 ARG n 1 110 LEU n 1 111 ARG n 1 112 PRO n 1 113 LEU n 1 114 HIS n 1 115 THR n 1 116 SER n 1 117 ALA n 1 118 VAL n 1 119 ILE n 1 120 PHE n 1 121 ALA n 1 122 PHE n 1 123 GLY n 1 124 GLY n 1 125 ASN n 1 126 ALA n 1 127 LEU n 1 128 ILE n 1 129 ALA n 1 130 SER n 1 131 ALA n 1 132 PHE n 1 133 TYR n 1 134 VAL n 1 135 VAL n 1 136 GLN n 1 137 ARG n 1 138 THR n 1 139 SER n 1 140 ALA n 1 141 ALA n 1 142 ARG n 1 143 LEU n 1 144 PHE n 1 145 GLY n 1 146 GLY n 1 147 THR n 1 148 ALA n 1 149 LEU n 1 150 GLY n 1 151 TRP n 1 152 PHE n 1 153 VAL n 1 154 PHE n 1 155 TRP n 1 156 GLY n 1 157 TRP n 1 158 GLN n 1 159 LEU n 1 160 ILE n 1 161 ILE n 1 162 VAL n 1 163 THR n 1 164 ALA n 1 165 ALA n 1 166 THR n 1 167 SER n 1 168 TYR n 1 169 LEU n 1 170 LEU n 1 171 GLY n 1 172 GLY n 1 173 SER n 1 174 GLN n 1 175 GLY n 1 176 LYS n 1 177 GLU n 1 178 TYR n 1 179 ALA n 1 180 GLU n 1 181 LEU n 1 182 ASN n 1 183 TRP n 1 184 HIS n 1 185 LEU n 1 186 ASP n 1 187 ILE n 1 188 LEU n 1 189 VAL n 1 190 ALA n 1 191 ILE n 1 192 VAL n 1 193 TRP n 1 194 VAL n 1 195 ALA n 1 196 TYR n 1 197 LEU n 1 198 ILE n 1 199 ALA n 1 200 PHE n 1 201 LEU n 1 202 GLY n 1 203 THR n 1 204 ILE n 1 205 PHE n 1 206 LYS n 1 207 ARG n 1 208 LYS n 1 209 GLU n 1 210 PRO n 1 211 HIS n 1 212 ILE n 1 213 TYR n 1 214 VAL n 1 215 ALA n 1 216 ASN n 1 217 TRP n 1 218 PHE n 1 219 TYR n 1 220 LEU n 1 221 SER n 1 222 PHE n 1 223 ILE n 1 224 VAL n 1 225 THR n 1 226 ILE n 1 227 ALA n 1 228 MET n 1 229 LEU n 1 230 HIS n 1 231 ILE n 1 232 VAL n 1 233 ASN n 1 234 ASN n 1 235 LEU n 1 236 ALA n 1 237 VAL n 1 238 PRO n 1 239 VAL n 1 240 SER n 1 241 ILE n 1 242 PHE n 1 243 GLY n 1 244 THR n 1 245 LYS n 1 246 SER n 1 247 VAL n 1 248 GLN n 1 249 LEU n 1 250 MET n 1 251 ALA 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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 3 1 sample 'Biological sequence' 1 297 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'Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003)' 272942 ? ? 'ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 242 ? 'Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003)' 272942 ? ? 'ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 151 ? 'Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003)' 272942 ? ? 'ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 199 ? 'Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003)' 272942 ? ? 'ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP D5ARP4_RHOCB D5ARP4 ? 1 ;MWDYVKLVALGVVVAIAAYAASQARDLPYMVNMVEVALAAVIAFIWVLRTMGDAKPSKDEYFDGVIRAGVIATTFWGIVG FLVAVIIAFQLAFPALNLEFGNGMLNFGRLRPLHTSAVIFAFGGNALIASAFYVVQRTSAARLFGGTALGWFVFWGWQLI IVTAATSYLLGGSQGKEYAELNWHLDILVAIVWVAYLIAFLGTIFKRKEPHIYVANWFYLSFIVTIAMLHIVNNLAVPVS IFGTKSVQLMAGVQDAMTQWWYGHNAVGFFLTAGFLGMMYYFVPKQAERPVYSYKLSIVHFWALIFLYIWAGPHHLHYTA LPDWASTLGMVMSVILWMPSWGGMINGLMTLSGAWDKLRTDPVIRMMVVSIGFYGMSTFEGPMMSIKAVNSLSHYTDWTI GHVHSGALGWNGMITFGMLYFLTPRLWGRSGLYSLKLVSWHFWLATIGIVLYASSMWVSGIMEGLMWREVDAQGFLVNGF ADTVGAKFPMNVVRGVGGVLYLTGGLIMAYNLWATVAKQPKTANLAVAVPAE ; 1 2 UNP D5ARP5_RHOCB D5ARP5 ? 2 ;MSIMDKHHVLEKNATLLLIFAFLVVTIGGIVEIAPLFYLENTIEKVEGMRPYTPLELTGRDIYIREGCYVCHSQMIRPMR DEVERYGHYSLAAESMYDHPFQWGSKRTGPDLARVGGRYSDAWHVEHLSNPQSVVPESVMPSYSYLANVPLDSTWIEDRV STDALVGVPYSAEMIAAAKADFVAQADPNADSATLVANYGEKVNIRNFDGKPGLTEMDALVAYLQVLGTMVDFSTFQPVA SR ; 1 3 UNP CCOP_RHOCB D5ARP7 ? 3 ;MSKKPTTKKEVQTTGHSWDGIEELNTPLPRWWLWTFYATIVWGVAYSIAMPAWPIFASGATPGILGSSTRADVEKDIAKF AEMNKAVEDKLVATDLTAIAADPELVTYTRNAGAAVFRTWCAQCHGAGAGGNTGFPSLLDGDWLHGGSIETIYTNIKHGI RDPLDPDTLPVANMPAHLTDELLEPAQIDDVVQYVLKISGQPADEARATAGQQVFADNCVSCHGEDAKGMVEMGAPNLTD GIWLYGGDANTITTTIQLGRGGVMPSWSWAADGAKPRLSEAQIRAVASYVHSLGGGQ ; 1 4 UNP D5ARP9_RHOCB D5ARP9 ? 4 ;MAKPLTGRKVLLMFVAFFGLIIAVNVTMAVQAVKTFPGLEVANSYVASQTFDADRAAQERLGWTVKPAYADGVLSLDIRD RAGQPAPLGQLEVLVGRTTMAAEDRTPQMTRTDGVYSAPLSLAPGAWLIHLSATSADGVLFRQRLDFFVEG ; 1 5 UNP CYCY_RHOCB Q05389 ? 5 ;MLVKTHITKIGVTLFAVALFYGFIYMLSNSLFATRPATAVAVGADGKALLPSVDEAAMPAKAPAAAAPAAETAEAAAPAE PAAPPPPAYVEVDPATITGDAKAGEEKFNKTCKACHKIDGKNAVGPHLNGVIGRATATVEGFKYSTAMKNHVGNWTPERL DIYLVSPKAEVPGTKMSFVGLPEAADRANVIAYLNTLPR ; 1 6 UNP UCRI_RHOCB D5ANZ2 ? 6 ;MSHAEDNAGTRRDFLYHATAATGVVVTGAAVWPLINQMNASADVKAMASIFVDVSAVEVGTQLTVKWRGKPVFIRRRDEK DIELARSVPLGALRDTSAENANKPGAEATDENRTLPAFDGTNTGEWLVMLGVCTHLGCVPMGDKSGDFGGWFCPCHGSHY DSAGRIRKGPAPRNLDIPVAAFVDETTIKLG ; 1 7 UNP CYB_RHOCB D5ANZ3 ? 7 ;MSGIPHDHYEPKTGIEKWLHDRLPIVGLVYDTIMIPTPKNLNWWWIWGIVLAFTLVLQIVTGIVLAMHYTPHVDLAFASV EHIMRDVNGGWAMRYIHANGASLFFLAVYIHIFRGLYYGSYKAPREITWIVGMVIYLLMMGTAFMGYVLPWGQMSFWGAT VITGLFGAIPGIGPSIQAWLLGGPAVDNATLNRFFSLHYLLPFVIAALVAIHIWAFHTTGNNNPTGVEVRRTSKADAEKD TLPFWPYFVIKDLFALALVLLGFFAVVAYMPNYLGHPDNYVQANPLSTPAHIVPEWYFLPFYAILRAFAADVWVVILVDG LTFGIVDAKFFGVIAMFGAIAVMALAPWLDTSKVRSGAYRPKFRMWFWFLVLDFVVLTWVGAMPTEYPYDWISLIASTYW FAYFLVILPLLGATEKPEPIPASIEEDFNSHYGNPAE ; 1 8 UNP CY1_RHOCB D5ANZ4 ? 8 ;MKKLLISAVSALVLGSGAAFANSNVPDHAFSFEGIFGKYDQAQLRRGFQVYNEVCSACHGMKFVPIRTLADDGGPQLDPT FVREYAAGLDTIIDKDSGEERDRKETDMFPTRVGDGMGPDLSVMAKARAGFSGPAGSGMNQLFKGMGGPEYIYNYVIGFE ENPECAPEGIDGYYYNKTFQIGGVPDTCKDAAGVKITHGSWARMPPPLVDDQVTYEDGTPATVDQMAQDVSAFLMWAAEP KLVARKQMGLVAMVMLGLLSVMLYLTNKRLWAPYKGHKA ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6XKW n 1 ? 532 ? D5ARP4 1 ? 532 ? 1 532 2 2 6XKW o 1 ? 242 ? D5ARP5 1 ? 242 ? 1 242 3 3 6XKW p 1 ? 297 ? D5ARP7 1 ? 297 ? 1 297 4 4 6XKW h 1 ? 151 ? D5ARP9 1 ? 151 ? 1 151 5 5 6XKW Y 1 ? 199 ? Q05389 1 ? 199 ? 1 199 6 6 6XKW E 1 ? 191 ? D5ANZ2 1 ? 191 ? 1 191 7 7 6XKW C 1 ? 437 ? D5ANZ3 1 ? 437 ? 1 437 8 8 6XKW D 1 ? 279 ? D5ANZ4 1 ? 279 ? -20 258 9 7 6XKW P 1 ? 437 ? D5ANZ3 1 ? 437 ? 1 437 10 8 6XKW Q 1 ? 279 ? D5ANZ4 1 ? 279 ? -20 258 11 6 6XKW R 1 ? 191 ? D5ANZ2 1 ? 191 ? 1 191 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CU non-polymer . 'COPPER (II) ION' ? 'Cu 2' 63.546 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FES non-polymer . 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' ? 'Fe2 S2' 175.820 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HEC non-polymer . 'HEME C' ? 'C34 H34 Fe N4 O4' 618.503 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6XKW _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6XKW _struct.title 'R. capsulatus CIII2CIV bipartite super-complex (SC-2A) with CcoH/cy' _struct.pdbx_descriptor ;Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit (E.C.7.1.1.8), Cytochrome b, Cytochrome c1, Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit I (E.C.1.9.3.1), Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit II (E.C.1.9.3.1), Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoP, Cytochrome c oxidase, Cbb3-type, biogenesis protein CcoH, Cytochrome c-type cyt cy ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6XKW _struct_keywords.text 'cytochrome bc1, cbb3-COX, Complex III, Complex IV, OXIDOREDUCTASE, TRANSLOCASE-Oxidoreductase complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLOCASE/Oxidoreductase # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 6 ? L N N 9 ? M N N 9 ? N N N 10 ? O N N 9 ? P N N 9 ? Q N N 9 ? R N N 11 ? S N N 9 ? T N N 9 ? U N N 9 ? V N N 9 ? W N N 9 ? X N N 9 ? Y N N 11 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 63 ? PHE A 93 ? ASP n 63 PHE n 93 1 ? 31 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 94 ? ASN A 97 ? 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ILE n 386 HIS n 394 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 AB8 THR A 396 ? TRP A 410 ? THR n 396 TRP n 410 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 AB9 TRP A 410 ? TRP A 427 ? TRP n 410 TRP n 427 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 SER A 434 ? GLU A 469 ? SER n 434 GLU n 469 1 ? 36 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY A 479 ? LYS A 518 ? GLY n 479 LYS n 518 1 ? 40 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN B 13 ? ILE B 33 ? ASN o 13 ILE o 33 1 ? 21 HELX_P HELX_P22 AC4 ILE B 33 ? LEU B 39 ? ILE o 33 LEU o 39 1 ? 7 HELX_P HELX_P23 AC5 THR B 53 ? GLY B 67 ? THR o 53 GLY o 67 1 ? 15 HELX_P HELX_P24 AC6 CYS B 68 ? CYS B 71 ? CYS o 68 CYS o 71 5 ? 4 HELX_P HELX_P25 AC7 MET B 79 ? GLY B 87 ? MET o 79 GLY o 87 1 ? 9 HELX_P HELX_P26 AC8 LEU B 91 ? MET B 96 ? LEU o 91 MET o 96 5 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 SER B 120 ? ASN B 130 ? SER o 120 ASN o 130 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 ASN B 130 ? VAL B 135 ? ASN o 130 VAL o 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 AD2 SER B 144 ? VAL B 149 ? SER o 144 VAL o 149 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 TRP B 155 ? VAL B 166 ? 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ASP p 248 GLY p 259 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 SER C 266 ? ALA C 271 ? SER p 266 ALA p 271 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 GLN C 282 ? GLY C 294 ? GLN p 282 GLY p 294 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 AF2 LEU D 12 ? THR D 35 ? LEU h 12 THR h 35 1 ? 24 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU E 2 ? ILE E 10 ? LEU Y 2 ILE Y 10 1 ? 9 HELX_P HELX_P49 AF4 GLY E 11 ? SER E 30 ? GLY Y 11 SER Y 30 1 ? 20 HELX_P HELX_P50 AF5 ARG F 12 ? GLN F 37 ? ARG E 12 GLN E 37 1 ? 26 HELX_P HELX_P51 AF6 SER F 41 ? ALA F 46 ? SER E 41 ALA E 46 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 AF7 ASP F 78 ? SER F 87 ? ASP E 78 SER E 87 1 ? 10 HELX_P HELX_P53 AF8 THR F 109 ? THR F 114 ? THR E 109 THR E 114 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 GLY G 14 ? LEU G 19 ? GLY C 14 LEU C 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 AG1 LEU G 23 ? ILE G 33 ? LEU C 23 ILE C 33 1 ? 11 HELX_P HELX_P56 AG2 ILE G 46 ? ALA G 66 ? ILE C 46 ALA C 66 1 ? 21 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU G 75 ? ASP G 86 ? LEU C 75 ASP C 86 1 ? 12 HELX_P HELX_P58 AG4 GLY G 90 ? TYR G 118 ? GLY C 90 TYR C 118 1 ? 29 HELX_P HELX_P59 AG5 ARG G 125 ? VAL G 148 ? ARG C 125 VAL C 148 1 ? 24 HELX_P HELX_P60 AG6 GLN G 153 ? ILE G 169 ? GLN C 153 ILE C 169 1 ? 17 HELX_P HELX_P61 AG7 ILE G 172 ? GLY G 182 ? ILE C 172 GLY C 182 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ASP G 187 ? TYR G 199 ? ASP C 187 TYR C 199 1 ? 13 HELX_P HELX_P63 AG9 LEU G 200 ? THR G 219 ? LEU C 200 THR C 219 1 ? 20 HELX_P HELX_P64 AH1 PRO G 246 ? MET G 270 ? PRO C 246 MET C 270 1 ? 25 HELX_P HELX_P65 AH2 HIS G 276 ? VAL G 281 ? HIS C 276 VAL C 281 5 ? 6 HELX_P HELX_P66 AH3 PHE G 298 ? PHE G 308 ? PHE C 298 PHE C 308 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 AH4 ILE G 316 ? LEU G 321 ? ILE C 316 LEU C 321 1 ? 6 HELX_P HELX_P68 AH5 ASP G 327 ? ALA G 346 ? ASP C 327 ALA C 346 1 ? 20 HELX_P HELX_P69 AH6 PRO G 347 ? LEU G 349 ? PRO C 347 LEU C 349 5 ? 3 HELX_P HELX_P70 AH7 SER G 356 ? TYR G 359 ? SER C 356 TYR C 359 5 ? 4 HELX_P HELX_P71 AH8 ARG G 360 ? GLY G 381 ? ARG C 360 GLY C 381 1 ? 22 HELX_P HELX_P72 AH9 PRO G 388 ? GLU G 415 ? PRO C 388 GLU C 415 1 ? 28 HELX_P HELX_P73 AI1 ASP H 40 ? VAL H 54 ? ASP D 19 VAL D 33 1 ? 15 HELX_P HELX_P74 AI2 CYS H 55 ? CYS H 58 ? CYS D 34 CYS D 37 5 ? 4 HELX_P HELX_P75 AI3 PRO H 65 ? ALA H 70 ? PRO D 44 ALA D 49 5 ? 6 HELX_P HELX_P76 AI4 ASP H 78 ? GLY H 88 ? ASP D 57 GLY D 67 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 AI5 GLY H 148 ? ILE H 157 ? GLY D 127 ILE D 136 1 ? 10 HELX_P HELX_P78 AI6 THR H 222 ? GLU H 239 ? THR D 201 GLU D 218 1 ? 18 HELX_P HELX_P79 AI7 LYS H 241 ? TRP H 271 ? LYS D 220 TRP D 250 1 ? 31 HELX_P HELX_P80 AI8 GLY I 14 ? LEU I 19 ? GLY P 14 LEU P 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P81 AI9 LEU I 23 ? ILE I 33 ? LEU P 23 ILE P 33 1 ? 11 HELX_P HELX_P82 AJ1 ILE I 46 ? ALA I 66 ? ILE P 46 ALA P 66 1 ? 21 HELX_P HELX_P83 AJ2 LEU I 75 ? ASP I 86 ? LEU P 75 ASP P 86 1 ? 12 HELX_P HELX_P84 AJ3 GLY I 90 ? TYR I 118 ? GLY P 90 TYR P 118 1 ? 29 HELX_P HELX_P85 AJ4 ARG I 125 ? VAL I 148 ? ARG P 125 VAL P 148 1 ? 24 HELX_P HELX_P86 AJ5 GLN I 153 ? ILE I 169 ? GLN P 153 ILE P 169 1 ? 17 HELX_P HELX_P87 AJ6 ILE I 172 ? GLY I 182 ? ILE P 172 GLY P 182 1 ? 11 HELX_P HELX_P88 AJ7 ASP I 187 ? TYR I 199 ? ASP P 187 TYR P 199 1 ? 13 HELX_P HELX_P89 AJ8 LEU I 200 ? THR I 219 ? LEU P 200 THR P 219 1 ? 20 HELX_P HELX_P90 AJ9 PRO I 246 ? MET I 270 ? PRO P 246 MET P 270 1 ? 25 HELX_P HELX_P91 AK1 HIS I 276 ? VAL I 281 ? HIS P 276 VAL P 281 5 ? 6 HELX_P HELX_P92 AK2 PHE I 298 ? PHE I 308 ? PHE P 298 PHE P 308 1 ? 11 HELX_P HELX_P93 AK3 ILE I 316 ? LEU I 321 ? ILE P 316 LEU P 321 1 ? 6 HELX_P HELX_P94 AK4 ASP I 327 ? ALA I 346 ? ASP P 327 ALA P 346 1 ? 20 HELX_P HELX_P95 AK5 PRO I 347 ? LEU I 349 ? PRO P 347 LEU P 349 5 ? 3 HELX_P HELX_P96 AK6 SER I 356 ? TYR I 359 ? SER P 356 TYR P 359 5 ? 4 HELX_P HELX_P97 AK7 ARG I 360 ? GLY I 381 ? ARG P 360 GLY P 381 1 ? 22 HELX_P HELX_P98 AK8 PRO I 388 ? GLU I 415 ? PRO P 388 GLU P 415 1 ? 28 HELX_P HELX_P99 AK9 ASP J 40 ? VAL J 54 ? ASP Q 19 VAL Q 33 1 ? 15 HELX_P HELX_P100 AL1 CYS J 55 ? CYS J 58 ? 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THR R 109 THR R 114 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? F CYS 138 SG ? ? ? 1_555 F CYS 155 SG ? ? E CYS 138 E CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf2 disulf ? ? K CYS 138 SG ? ? ? 1_555 K CYS 155 SG ? ? R CYS 138 R CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale none ? B CYS 68 SG ? ? ? 1_555 O HEC . CAB ? ? o CYS 68 o HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.633 ? ? covale2 covale none ? B CYS 71 SG ? ? ? 1_555 O HEC . CAC ? ? o CYS 71 o HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.695 ? ? covale3 covale none ? C CYS 121 SG ? ? ? 1_555 Q HEC . CAB ? ? p CYS 121 p HEC 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.608 ? ? covale4 covale none ? C CYS 124 SG ? ? ? 1_555 Q HEC . CAC ? ? p CYS 124 p HEC 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.659 ? ? covale5 covale none ? C CYS 219 SG ? ? ? 1_555 P HEC . CAB ? ? p CYS 219 p HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.599 ? ? covale6 covale none ? C CYS 222 SG ? ? ? 1_555 P HEC . CAC ? ? p CYS 222 p HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.654 ? ? covale7 covale none ? H CYS 55 SG ? ? ? 1_555 U HEC . CAB ? ? D CYS 34 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.781 ? ? covale8 covale none ? H CYS 58 SG ? ? ? 1_555 U HEC . CAC ? ? D CYS 37 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.858 ? ? covale9 covale none ? J CYS 55 SG ? ? ? 1_555 X HEC . CAB ? ? Q CYS 34 Q HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.780 ? ? covale10 covale none ? J CYS 58 SG ? ? ? 1_555 X HEC . CAC ? ? Q CYS 37 Q HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.858 ? ? metalc1 metalc ? ? A HIS 114 NE2 ? ? ? 1_555 M HEC . FE ? ? n HIS 114 n HEC 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? ? metalc2 metalc ? ? A HIS 264 ND1 ? ? ? 1_555 N CU . CU ? ? n HIS 264 n CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? ? metalc3 metalc ? ? A HIS 314 NE2 ? ? ? 1_555 N CU . CU ? ? n HIS 314 n CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? metalc4 metalc ? ? A HIS 315 NE2 ? ? ? 1_555 N CU . CU ? ? n HIS 315 n CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? metalc5 metalc ? ? A HIS 402 NE2 ? ? ? 1_555 L HEC . FE ? ? n HIS 402 n HEC 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.746 ? ? metalc6 metalc ? ? A HIS 404 NE2 ? ? ? 1_555 M HEC . FE ? ? n HIS 404 n HEC 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.964 ? ? metalc7 metalc ? ? B HIS 72 NE2 ? ? ? 1_555 O HEC . FE ? ? o HIS 72 o HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.865 ? ? metalc8 metalc ? ? B MET 140 SD ? ? ? 1_555 O HEC . FE ? ? o MET 140 o HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? ? metalc9 metalc ? ? C HIS 125 NE2 ? ? ? 1_555 Q HEC . FE ? ? p HIS 125 p HEC 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.857 ? ? metalc10 metalc ? ? C MET 174 SD ? ? ? 1_555 P HEC . FE ? ? p MET 174 p HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.210 ? ? metalc11 metalc ? ? C HIS 223 NE2 ? ? ? 1_555 P HEC . FE ? ? p HIS 223 p HEC 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.870 ? ? metalc12 metalc ? ? C MET 264 SD ? ? ? 1_555 Q HEC . FE ? ? p MET 264 p HEC 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? ? metalc13 metalc ? ? F CYS 133 SG ? ? ? 1_555 R FES . FE1 ? ? E CYS 133 E FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? ? metalc14 metalc ? ? F HIS 135 ND1 ? ? ? 1_555 R FES . FE2 ? ? E HIS 135 E FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? ? metalc15 metalc ? ? F CYS 153 SG ? ? ? 1_555 R FES . FE1 ? ? E CYS 153 E FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc16 metalc ? ? F HIS 156 ND1 ? ? ? 1_555 R FES . FE2 ? ? E HIS 156 E FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? metalc17 metalc ? ? G HIS 97 NE2 ? ? ? 1_555 S HEC . FE ? ? C HIS 97 C HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.960 ? ? metalc18 metalc ? ? G HIS 111 NE2 ? ? ? 1_555 T HEC . FE ? ? C HIS 111 C HEC 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? metalc19 metalc ? ? G HIS 198 NE2 ? ? ? 1_555 S HEC . FE ? ? C HIS 198 C HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? metalc20 metalc ? ? G HIS 212 NE2 ? ? ? 1_555 T HEC . FE ? ? C HIS 212 C HEC 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? metalc21 metalc ? ? H HIS 59 NE2 ? ? ? 1_555 U HEC . FE ? ? D HIS 38 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? ? metalc22 metalc ? ? H MET 204 SD ? ? ? 1_555 U HEC . FE ? ? D MET 183 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc23 metalc ? ? I HIS 97 NE2 ? ? ? 1_555 V HEC . FE ? ? P HIS 97 P HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? ? metalc24 metalc ? ? I HIS 111 NE2 ? ? ? 1_555 W HEC . FE ? ? P HIS 111 P HEC 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? metalc25 metalc ? ? I HIS 198 NE2 ? ? ? 1_555 V HEC . FE ? ? P HIS 198 P HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? metalc26 metalc ? ? I HIS 212 NE2 ? ? ? 1_555 W HEC . FE ? ? P HIS 212 P HEC 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? metalc27 metalc ? ? J HIS 59 NE2 ? ? ? 1_555 X HEC . FE ? ? Q HIS 38 Q HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? ? metalc28 metalc ? ? J MET 204 SD ? ? ? 1_555 X HEC . FE ? ? Q MET 183 Q HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc29 metalc ? ? K CYS 133 SG ? ? ? 1_555 Y FES . FE1 ? ? R CYS 133 R FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc30 metalc ? ? K HIS 135 ND1 ? ? ? 1_555 Y FES . FE2 ? ? R HIS 135 R FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? metalc31 metalc ? ? K CYS 153 SG ? ? ? 1_555 Y FES . FE1 ? ? R CYS 153 R FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc32 metalc ? ? K HIS 156 ND1 ? ? ? 1_555 Y FES . FE2 ? ? R HIS 156 R FES 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 HIS 99 B . ? HIS 99 o PRO 100 B ? PRO 100 o 1 -5.30 2 LYS 34 D . ? LYS 34 h THR 35 D ? THR 35 h 1 -4.28 3 ALA 123 G . ? ALA 123 C PRO 124 G ? 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AA9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ALA A 236 ? 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ILE R 166 ARG R 167 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 237 ? 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L HEC . ? n HEC 601 ? 1_555 177.6 ? 28 NC ? L HEC . ? n HEC 601 ? 1_555 FE ? L HEC . ? n HEC 601 ? 1_555 ND ? L HEC . ? n HEC 601 ? 1_555 92.6 ? 29 NE2 ? B HIS 72 ? o HIS 72 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NA ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 85.0 ? 30 NE2 ? B HIS 72 ? o HIS 72 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NB ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 92.8 ? 31 NA ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NB ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 84.5 ? 32 NE2 ? B HIS 72 ? o HIS 72 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NC ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 95.5 ? 33 NA ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NC ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 178.7 ? 34 NB ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 NC ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 94.2 ? 35 NE2 ? B HIS 72 ? o HIS 72 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 ND ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 86.9 ? 36 NA ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 ND ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 93.9 ? 37 NB ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 ND ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 178.4 ? 38 NC ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 ND ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 87.3 ? 39 NE2 ? B HIS 72 ? o HIS 72 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 SD ? B MET 140 ? o MET 140 ? 1_555 172.0 ? 40 NA ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 SD ? B MET 140 ? o MET 140 ? 1_555 87.1 ? 41 NB ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 SD ? B MET 140 ? o MET 140 ? 1_555 88.0 ? 42 NC ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 SD ? B MET 140 ? o MET 140 ? 1_555 92.4 ? 43 ND ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 FE ? O HEC . ? o HEC 301 ? 1_555 SD ? B MET 140 ? o MET 140 ? 1_555 92.0 ? 44 NE2 ? C HIS 125 ? p HIS 125 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NA ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 96.6 ? 45 NE2 ? C HIS 125 ? p HIS 125 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NB ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 89.4 ? 46 NA ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NB ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 91.5 ? 47 NE2 ? C HIS 125 ? p HIS 125 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NC ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 81.4 ? 48 NA ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NC ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 178.0 ? 49 NB ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 NC ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 88.8 ? 50 NE2 ? C HIS 125 ? p HIS 125 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 ND ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 91.1 ? 51 NA ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 ND ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 90.4 ? 52 NB ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 ND ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 178.0 ? 53 NC ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 ND ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 89.3 ? 54 NE2 ? C HIS 125 ? p HIS 125 ? 1_555 FE ? Q HEC . ? p HEC 302 ? 1_555 SD ? 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P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 179.3 ? 64 NB ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 NC ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 89.0 ? 65 SD ? C MET 174 ? p MET 174 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 ND ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 93.2 ? 66 NA ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 ND ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 88.3 ? 67 NB ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 ND ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 179.2 ? 68 NC ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 ND ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 91.8 ? 69 SD ? C MET 174 ? p MET 174 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 NE2 ? C HIS 223 ? p HIS 223 ? 1_555 175.1 ? 70 NA ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 NE2 ? C HIS 223 ? p HIS 223 ? 1_555 92.9 ? 71 NB ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 NE2 ? C HIS 223 ? p HIS 223 ? 1_555 88.3 ? 72 NC ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 FE ? P HEC . ? p HEC 301 ? 1_555 NE2 ? 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S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 NC ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 179.6 ? 91 NB ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 NC ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 90.8 ? 92 NE2 ? G HIS 97 ? C HIS 97 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 ND ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 96.1 ? 93 NA ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 ND ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 87.9 ? 94 NB ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 ND ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 176.8 ? 95 NC ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 ND ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 92.4 ? 96 NE2 ? G HIS 97 ? C HIS 97 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 NE2 ? G HIS 198 ? C HIS 198 ? 1_555 167.6 ? 97 NA ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 NE2 ? G HIS 198 ? C HIS 198 ? 1_555 91.0 ? 98 NB ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 NE2 ? G HIS 198 ? C HIS 198 ? 1_555 85.2 ? 99 NC ? S HEC . ? C HEC 501 ? 1_555 FE ? 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