data_6YY0 # _entry.id 6YY0 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.333 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6YY0 WWPDB D_1292108418 EMDB EMD-11001 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'bovine ATP synthase F1-peripheral stalk domain, state 1' _pdbx_database_related.db_id EMD-11001 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6YY0 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-05-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Spikes, T.' 1 ? 'Montgomery, M.G.' 2 ? 'Walker, J.E.' 3 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 117 _citation.language ? _citation.page_first 23519 _citation.page_last 23526 _citation.title 'Structure of the dimeric ATP synthase from bovine mitochondria.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2013998117 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32900941 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Spikes, T.E.' 1 0000-0002-2432-8006 primary 'Montgomery, M.G.' 2 ? primary 'Walker, J.E.' 3 0000-0001-7929-2162 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6YY0 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6YY0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha, mitochondrial' 55302.191 3 ? ? ? ;In chains ABC, Glu 1 is technically correct. The DNA sequence for this protein encodes GLU. The actual residue is pyroGLU. However pyroGLU and pyroGLN are the same. Residue 481 in chains A, B, and C can be Gly or SER. e.g. in this structure should be GLY. There is no density to support a SER. It should be considered microheterogeneity. We have used the following REMARK in previous PDB files: REMARK 999 SER 481 GLY IN CHAINS A, B AND C REMARK 999 WAS IDENTIFIED AS A GLY FROM THE PROTEIN REMARK 999 SEQUENCE. IN THE CDNA SEQUENCE, THE CODON FOR THIS REMARK 999 RESIDUE WAS AGC SER IN THREE CLONES WHILE IN TWO REMARK 999 OTHERS IT WAS GGC GLY. THE DIFFERENCE WAS THOUGHT TO REMARK 999 BE DUE TO A MUTATION OCCURRING DURING EITHER PROPAGATION REMARK 999 OF THE CLONES IN THE LIBRARY OR SUBCLONING INTO M13 REMARK 999 VECTORS. THE ELECTRON DENSITY SUGGESTS A GLY IN REMARK 999 THIS POSITION. ; 2 polymer nat 'ATP synthase subunit beta, mitochondrial' 51757.836 3 7.1.2.2 ? ? 'The mature protein starts AAQA. UNIPROT are updating entry P00829 to reflect this.' 3 polymer nat 'ATP synthase subunit gamma, mitochondrial' 30300.760 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase subunit delta, mitochondrial' 15074.813 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial' 5662.693 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'ATPase inhibitor, mitochondrial' 7462.098 1 ? ? ? 'bovine ATP synthase inhibitor protein IF1 residues 1-60 plus 6 Histidines' 7 polymer nat 'ATP synthase subunit O, mitochondrial' 20959.777 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial' 24702.709 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'ATP synthase subunit d, mitochondrial' 18588.256 1 ? ? ? ? 10 polymer nat 'ATP synthase-coupling factor 6, mitochondrial' 8971.079 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 3 ? ? ? ? 12 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 5 ? ? ? ? 13 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 3 ? ? ? ? 14 water nat water 18.015 17 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 subunit alpha' 3 'F-ATPase gamma subunit' 4 'F-ATPase delta subunit' 5 'ATPase subunit epsilon' 6 'Inhibitor of F(1)F(o)-ATPase,IF1' 7 'ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP,Oligomycin sensitivity conferral protein,OSCP' 8 'ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b,ATP synthase subunit b,ATPase subunit b' 9 'ATPase subunit d,ATP synthase peripheral stalk subunit d' 10 'ATPase subunit F6,ATP synthase peripheral stalk subunit F6' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;EKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; ;EKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD LTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDEL SEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEE HS ; ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD LTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDEL SEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEE HS ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE I ? 6 'polypeptide(L)' no no GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; S ? 8 'polypeptide(L)' no no ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; b ? 9 'polypeptide(L)' no no ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; d ? 10 'polypeptide(L)' no no NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS h ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLU n 1 2 LYS n 1 3 THR n 1 4 GLY n 1 5 THR n 1 6 ALA n 1 7 GLU n 1 8 VAL n 1 9 SER n 1 10 SER n 1 11 ILE n 1 12 LEU n 1 13 GLU n 1 14 GLU n 1 15 ARG n 1 16 ILE n 1 17 LEU n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 ASP n 1 21 THR n 1 22 SER n 1 23 VAL n 1 24 ASP n 1 25 LEU n 1 26 GLU n 1 27 GLU n 1 28 THR n 1 29 GLY n 1 30 ARG n 1 31 VAL n 1 32 LEU n 1 33 SER n 1 34 ILE n 1 35 GLY n 1 36 ASP n 1 37 GLY n 1 38 ILE n 1 39 ALA n 1 40 ARG n 1 41 VAL n 1 42 HIS n 1 43 GLY n 1 44 LEU n 1 45 ARG n 1 46 ASN n 1 47 VAL n 1 48 GLN n 1 49 ALA n 1 50 GLU n 1 51 GLU n 1 52 MET n 1 53 VAL n 1 54 GLU n 1 55 PHE n 1 56 SER n 1 57 SER n 1 58 GLY n 1 59 LEU n 1 60 LYS n 1 61 GLY n 1 62 MET n 1 63 SER n 1 64 LEU n 1 65 ASN n 1 66 LEU n 1 67 GLU n 1 68 PRO n 1 69 ASP n 1 70 ASN n 1 71 VAL n 1 72 GLY n 1 73 VAL n 1 74 VAL n 1 75 VAL n 1 76 PHE n 1 77 GLY n 1 78 ASN n 1 79 ASP n 1 80 LYS n 1 81 LEU n 1 82 ILE n 1 83 LYS n 1 84 GLU n 1 85 GLY n 1 86 ASP n 1 87 ILE n 1 88 VAL n 1 89 LYS n 1 90 ARG n 1 91 THR n 1 92 GLY n 1 93 ALA n 1 94 ILE n 1 95 VAL n 1 96 ASP n 1 97 VAL n 1 98 PRO n 1 99 VAL n 1 100 GLY n 1 101 GLU n 1 102 GLU n 1 103 LEU n 1 104 LEU n 1 105 GLY n 1 106 ARG n 1 107 VAL n 1 108 VAL n 1 109 ASP n 1 110 ALA n 1 111 LEU n 1 112 GLY n 1 113 ASN n 1 114 ALA n 1 115 ILE n 1 116 ASP n 1 117 GLY n 1 118 LYS n 1 119 GLY n 1 120 PRO n 1 121 ILE n 1 122 GLY n 1 123 SER n 1 124 LYS n 1 125 ALA n 1 126 ARG n 1 127 ARG n 1 128 ARG n 1 129 VAL n 1 130 GLY n 1 131 LEU n 1 132 LYS n 1 133 ALA n 1 134 PRO n 1 135 GLY n 1 136 ILE n 1 137 ILE n 1 138 PRO n 1 139 ARG n 1 140 ILE n 1 141 SER n 1 142 VAL n 1 143 ARG n 1 144 GLU n 1 145 PRO n 1 146 MET n 1 147 GLN n 1 148 THR n 1 149 GLY n 1 150 ILE n 1 151 LYS n 1 152 ALA n 1 153 VAL n 1 154 ASP n 1 155 SER n 1 156 LEU n 1 157 VAL n 1 158 PRO n 1 159 ILE n 1 160 GLY n 1 161 ARG n 1 162 GLY n 1 163 GLN n 1 164 ARG n 1 165 GLU n 1 166 LEU n 1 167 ILE n 1 168 ILE n 1 169 GLY n 1 170 ASP n 1 171 ARG n 1 172 GLN n 1 173 THR n 1 174 GLY n 1 175 LYS n 1 176 THR n 1 177 SER n 1 178 ILE n 1 179 ALA n 1 180 ILE n 1 181 ASP n 1 182 THR n 1 183 ILE n 1 184 ILE n 1 185 ASN n 1 186 GLN n 1 187 LYS n 1 188 ARG n 1 189 PHE n 1 190 ASN n 1 191 ASP n 1 192 GLY n 1 193 THR n 1 194 ASP n 1 195 GLU n 1 196 LYS n 1 197 LYS n 1 198 LYS n 1 199 LEU n 1 200 TYR n 1 201 CYS n 1 202 ILE n 1 203 TYR n 1 204 VAL n 1 205 ALA n 1 206 ILE n 1 207 GLY n 1 208 GLN n 1 209 LYS n 1 210 ARG n 1 211 SER n 1 212 THR n 1 213 VAL n 1 214 ALA n 1 215 GLN n 1 216 LEU n 1 217 VAL n 1 218 LYS n 1 219 ARG n 1 220 LEU n 1 221 THR 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_entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 510 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 482 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 273 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 146 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 50 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 190 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 214 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 160 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 1 76 cattle 'Bos taurus' 9913 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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7 UNP ATPO_BOVIN P13621 ? 7 ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; 24 8 UNP AT5F1_BOVIN P13619 ? 8 ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; 43 9 UNP ATP5H_BOVIN P13620 ? 9 ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; 2 10 UNP ATP5J_BOVIN P02721 ? 10 NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS 33 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6YY0 A 1 ? 510 ? 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P02721 33 ? 108 ? 1 76 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6YY0 GLU A 1 ? UNP P19483 GLN 44 variant 1 1 1 6YY0 GLY A 481 ? UNP P19483 SER 524 microheterogeneity 481 2 2 6YY0 GLU B 1 ? UNP P19483 GLN 44 variant 1 3 2 6YY0 GLY B 481 ? UNP P19483 SER 524 microheterogeneity 481 4 3 6YY0 GLU C 1 ? UNP P19483 GLN 44 variant 1 5 3 6YY0 GLY C 481 ? UNP P19483 SER 524 microheterogeneity 481 6 10 6YY0 HIS J 61 ? UNP P01096 ? ? 'expression tag' 61 7 10 6YY0 HIS J 62 ? UNP P01096 ? ? 'expression tag' 62 8 10 6YY0 HIS J 63 ? UNP P01096 ? ? 'expression tag' 63 9 10 6YY0 HIS J 64 ? 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GLN h 8 SER h 25 1 ? 18 HELX_P HELX_P156 AR3 ALA N 31 ? GLY N 51 ? ALA h 31 GLY h 51 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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B MG 601 B HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc11 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 AA HOH . O ? ? B MG 601 B HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? metalc12 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 AA HOH . O ? ? B MG 601 B HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc13 metalc ? ? C THR 176 OG1 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C THR 176 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? metalc14 metalc ? ? S ATP . O2G ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc15 metalc ? ? S ATP . O2B ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc16 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 BA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc17 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 BA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc18 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 BA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc19 metalc ? ? D THR 167 OG1 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? 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F MG 601 F HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 269 A . ? ASP 269 A ASP 270 A ? ASP 270 A 1 10.60 2 ARG 362 A . ? ARG 362 A PRO 363 A ? PRO 363 A 1 6.84 3 ASP 269 B . ? ASP 269 B ASP 270 B ? 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X ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? parallel C 3 4 ? parallel C 4 5 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? parallel J 2 3 ? parallel J 3 4 ? parallel J 4 5 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? anti-parallel K 6 7 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? parallel M 3 4 ? parallel M 4 5 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? anti-parallel N 6 7 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? parallel P 4 5 ? parallel P 5 6 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? anti-parallel Q 6 7 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel S 2 3 ? parallel S 3 4 ? parallel S 4 5 ? parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel X 1 2 ? parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 THR A 28 ? 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Then the grids were blotted with filter paper for 8-10 sec before blotting. ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 6YY0 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6YY0 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6YY0 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C2 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 HE21 A GLN 163 ? ? 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