data_6CUF # _entry.id 6CUF # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.329 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6CUF WWPDB D_1000233399 EMDB EMD-7622 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;Cryo-EM structure at 4.0 A resolution of vaccine-elicited antibody vFP1.01 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122 ; _pdbx_database_related.db_id EMD-7622 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6CUF _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-03-26 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Acharya, P.' 1 ? 'Carragher, B.' 2 ? 'Potter, C.S.' 3 ? 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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Dingens, A.S.' 1 ? primary 'Acharya, P.' 2 ? primary 'Haddox, H.K.' 3 ? primary 'Rawi, R.' 4 ? primary 'Xu, K.' 5 ? primary 'Chuang, G.Y.' 6 ? primary 'Wei, H.' 7 ? primary 'Zhang, B.' 8 ? primary 'Mascola, J.R.' 9 ? primary 'Carragher, B.' 10 ? primary 'Potter, C.S.' 11 ? primary 'Overbaugh, J.' 12 ? primary 'Kwong, P.D.' 13 ? primary 'Bloom, J.D.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'vFP1.01 heavy chain' 22972.848 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'vFP1.01 Light chain' 24127.859 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'PGT122 Heavy chain' 14838.731 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'PGT122 light chain' 11423.534 3 ? ? ? ? 5 polymer man 'VRC03 light chain' 11386.774 3 ? ? ? ? 6 polymer man 'VRC03 heavy chain' 14506.331 3 ? ? ? ? 7 polymer man 'Envelope glycoprotein gp120' 52964.922 3 ? ? ? 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;TFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDEAD YYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVL ; ;TFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDEAD YYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVL ; 6,N,n ? 5 'polypeptide(L)' no no ;EIVLTQSPGILSLSPGETATLFCKASQGGNAMTWYQKRRGQVPRLLIYDTSRRASGVPDRFVGSGSGTDFFLTINKLDRE DFAVYYCQQFEFFGLGSELEVH ; ;EIVLTQSPGILSLSPGETATLFCKASQGGNAMTWYQKRRGQVPRLLIYDTSRRASGVPDRFVGSGSGTDFFLTINKLDRE DFAVYYCQQFEFFGLGSELEVH ; 7,R,r ? 6 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAVIKTPGSSVKISCRASGYNFRDYSIHWVRLIPDKGFEWIGWIKPLWGAVSYARQLQGRVSMTRQLSQDPDD PDWGVAYMEFSGLTPADTAEYFCVRRGSCDYCGDFPWQYWGQGTVVVV ; ;QVQLVQSGAVIKTPGSSVKISCRASGYNFRDYSIHWVRLIPDKGFEWIGWIKPLWGAVSYARQLQGRVSMTRQLSQDPDD PDWGVAYMEFSGLTPADTAEYFCVRRGSCDYCGDFPWQYWGQGTVVVV ; 8,Q,q ? 7 'polypeptide(L)' no no ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKE 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;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; D,A,c ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 VAL n 1 3 GLN n 1 4 LEU n 1 5 GLN n 1 6 GLN n 1 7 SER n 1 8 GLY n 1 9 THR n 1 10 GLU n 1 11 LEU n 1 12 VAL n 1 13 TRP n 1 14 PRO n 1 15 GLY n 1 16 THR n 1 17 SER n 1 18 VAL n 1 19 THR n 1 20 LEU n 1 21 SER n 1 22 CYS n 1 23 LYS n 1 24 ALA n 1 25 SER n 1 26 GLY n 1 27 TYR n 1 28 THR n 1 29 PHE n 1 30 THR n 1 31 ASP n 1 32 TYR n 1 33 GLU n 1 34 ILE n 1 35 HIS n 1 36 TRP n 1 37 VAL n 1 38 LYS n 1 39 GLN n 1 40 THR n 1 41 PRO n 1 42 VAL n 1 43 HIS n 1 44 GLY n 1 45 LEU n 1 46 GLU n 1 47 TRP n 1 48 ILE n 1 49 GLY n 1 50 ALA n 1 51 ILE n 1 52 VAL n 1 53 PRO n 1 54 LYS n 1 55 THR n 1 56 GLY n 1 57 TYR n 1 58 THR n 1 59 ALA n 1 60 TYR n 1 61 ASN n 1 62 GLN n 1 63 LYS n 1 64 PHE n 1 65 ARG n 1 66 GLY n 1 67 LYS n 1 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A CYS 22 SG ? ? ? 1_555 A CYS 96 SG ? ? 3 CYS 22 3 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 23 SG ? ? ? 1_555 B CYS 93 SG ? ? 4 CYS 23 4 CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 95 SG ? ? 5 CYS 22 5 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 15 SG ? ? ? 1_555 D CYS 83 SG ? ? 6 CYS 23 6 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf5 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 103 SG ? ? 8 CYS 22 8 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 109 SG ? ? ? 1_555 F CYS 112 SG ? A 8 CYS 98 8 CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? G CYS 89 SG ? ? ? 1_555 G CYS 175 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf8 disulf ? ? G CYS 96 SG ? ? ? 1_555 G CYS 166 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf9 disulf ? ? G CYS 101 SG ? ? ? 1_555 G CYS 119 SG ? ? C CYS 131 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf10 disulf ? ? G CYS 188 SG ? ? ? 1_555 G CYS 217 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? G CYS 198 SG ? ? ? 1_555 G CYS 209 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 266 SG ? ? ? 1_555 G CYS 300 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf13 disulf ? ? G CYS 347 SG ? ? ? 1_555 G CYS 413 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf14 disulf ? ? G CYS 354 SG ? ? ? 1_555 G CYS 386 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf15 disulf ? ? H CYS 87 SG ? ? ? 1_555 H CYS 93 SG ? ? D CYS 598 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf16 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf17 disulf ? ? J CYS 23 SG ? ? ? 1_555 J CYS 93 SG ? ? L CYS 23 L CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf18 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 95 SG ? ? M CYS 22 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf19 disulf ? ? L CYS 15 SG ? ? ? 1_555 L CYS 83 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf20 disulf ? ? M CYS 22 SG ? ? ? 1_555 M CYS 103 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf21 disulf ? ? M CYS 109 SG ? ? ? 1_555 M CYS 112 SG ? A Q CYS 98 Q CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf22 disulf ? ? O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 96 SG ? ? h CYS 22 h CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf23 disulf ? ? P CYS 23 SG ? ? ? 1_555 P CYS 93 SG ? ? l CYS 23 l CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf24 disulf ? ? Q CYS 22 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 95 SG ? ? m CYS 22 m CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf25 disulf ? ? R CYS 15 SG ? ? ? 1_555 R CYS 83 SG ? ? n CYS 23 n CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf26 disulf ? ? S CYS 22 SG ? ? ? 1_555 S CYS 103 SG ? ? q CYS 22 q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf27 disulf ? ? S CYS 109 SG ? ? ? 1_555 S CYS 112 SG ? A q CYS 98 q CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf28 disulf ? ? U CYS 89 SG ? ? ? 1_555 U CYS 175 SG ? ? 2 CYS 119 2 CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf29 disulf ? ? U CYS 96 SG ? ? ? 1_555 U CYS 166 SG ? ? 2 CYS 126 2 CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf30 disulf ? ? U CYS 101 SG ? ? ? 1_555 U CYS 119 SG ? ? 2 CYS 131 2 CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf31 disulf ? ? U CYS 188 SG ? ? ? 1_555 U CYS 217 SG ? ? 2 CYS 218 2 CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf32 disulf ? ? U CYS 198 SG ? ? ? 1_555 U CYS 209 SG ? ? 2 CYS 228 2 CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf33 disulf ? ? U CYS 266 SG ? ? ? 1_555 U CYS 300 SG ? ? 2 CYS 296 2 CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf34 disulf ? ? U CYS 347 SG ? ? ? 1_555 U CYS 413 SG ? ? 2 CYS 378 2 CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf35 disulf ? ? U CYS 354 SG ? ? ? 1_555 U CYS 386 SG ? ? 2 CYS 385 2 CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf36 disulf ? ? V CYS 87 SG ? ? ? 1_555 V CYS 93 SG ? ? A CYS 598 A CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf37 disulf ? ? W CYS 87 SG ? ? ? 1_555 W CYS 93 SG ? ? c CYS 598 c CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf38 disulf ? ? X CYS 89 SG ? ? ? 1_555 X CYS 175 SG ? ? d CYS 119 d CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf39 disulf ? ? X CYS 96 SG ? ? ? 1_555 X CYS 166 SG ? ? d CYS 126 d CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf40 disulf ? ? X CYS 101 SG ? ? ? 1_555 X CYS 119 SG ? ? d CYS 131 d CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf41 disulf ? ? X CYS 188 SG ? ? ? 1_555 X CYS 217 SG ? ? d CYS 218 d CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf42 disulf ? ? X CYS 198 SG ? ? ? 1_555 X CYS 209 SG ? ? d CYS 228 d CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf43 disulf ? ? X CYS 266 SG ? ? ? 1_555 X CYS 300 SG ? ? d CYS 296 d CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf44 disulf ? ? X CYS 347 SG ? ? ? 1_555 X CYS 413 SG ? ? d CYS 378 d CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf45 disulf ? ? X CYS 354 SG ? ? ? 1_555 X CYS 386 SG ? ? d CYS 385 d CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? covale1 covale one ? G ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? C ASN 133 C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? N-Glycosylation covale2 covale none ? G ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C2 ? ? C ASN 133 C NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.595 ? ? covale3 covale one ? G ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 137 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? G ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? C ASN 156 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? G ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? C ASN 160 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? G ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? C ASN 197 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? G ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? C ASN 234 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? N-Glycosylation covale8 covale none ? G ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . O5 ? ? C ASN 234 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale9 covale one ? G ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 262 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? G ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 276 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? G ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 301 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? G ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 332 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? G ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? C ASN 355 C NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? G ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 363 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? G ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 386 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? G ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 392 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? G ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 448 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? H ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? D ASN 637 D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? U ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? 2 ASN 133 2 NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? N-Glycosylation covale20 covale none ? U ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C2 ? ? 2 ASN 133 2 NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.595 ? ? covale21 covale one ? U ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? 2 ASN 137 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? U ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? 2 ASN 156 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? N-Glycosylation covale23 covale none ? U ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . O5 ? ? 2 ASN 156 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.363 ? ? covale24 covale one ? U ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? 2 ASN 160 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? U ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? 2 ASN 197 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? U ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? 2 ASN 234 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? N-Glycosylation covale27 covale none ? U ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . O5 ? ? 2 ASN 234 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale28 covale one ? U ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? 2 ASN 262 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? U ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? 2 ASN 276 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? U ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? 2 ASN 301 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? U ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? 2 ASN 332 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? U ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? 2 ASN 355 2 NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? U ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? 2 ASN 363 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? U ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? 2 ASN 386 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? U ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? 2 ASN 392 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? U ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? 2 ASN 448 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? V ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? A ASN 637 A NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? W ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? c ASN 637 c NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? X ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C1 ? ? d ASN 133 d NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? N-Glycosylation covale40 covale none ? X ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 VB NAG . C2 ? ? d ASN 133 d NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.595 ? ? covale41 covale one ? X ASN 107 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? d ASN 137 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.517 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? X ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? d ASN 156 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.382 ? N-Glycosylation covale43 covale none ? X ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . O5 ? ? d ASN 156 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.363 ? ? covale44 covale one ? X ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? d ASN 160 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? X ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? d ASN 197 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? X ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? d ASN 234 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? N-Glycosylation covale47 covale none ? X ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . O5 ? ? d ASN 234 x NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale48 covale one ? X ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? d ASN 262 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? X ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? d ASN 276 DA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? X ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? d ASN 301 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? X ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? d ASN 332 BA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? X ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 WB NAG . C1 ? ? d ASN 355 d NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? X ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? d ASN 363 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? X ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? d ASN 386 9 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? X ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? d ASN 392 AA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? X ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? d ASN 448 CA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? N-Glycosylation covale57 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale58 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? B NAG 2 B BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale59 covale one ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? B BMA 3 B MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale60 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale61 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? E NAG 2 E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale62 covale one ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? E BMA 3 E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale63 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale64 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale65 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale66 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale67 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale68 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale69 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale70 covale one ? DA BMA . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale71 covale one ? DA BMA . O6 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale72 covale one ? DA MAN . O2 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale73 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale74 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale75 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale76 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale77 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale78 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale79 covale one ? HA BMA . O3 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale80 covale one ? HA BMA . O6 ? ? ? 1_555 HA MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale81 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale82 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale83 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale84 covale one ? JA BMA . O3 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale85 covale one ? JA BMA . O6 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale86 covale one ? JA MAN . O2 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U MAN 4 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale87 covale one ? JA MAN . O2 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U MAN 5 U MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? ? covale88 covale one ? JA MAN . O3 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U MAN 7 U MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale89 covale one ? JA MAN . O6 ? ? ? 1_555 JA MAN . C1 ? ? U MAN 7 U MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale90 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale91 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale92 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale93 covale one ? LA BMA . O3 ? ? ? 1_555 LA MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale94 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale95 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale96 covale one ? MA BMA . O3 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale97 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale98 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale99 covale one ? NA BMA . O3 ? ? ? 1_555 NA MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale100 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale101 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale102 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale103 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale104 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale105 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale106 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale107 covale one ? RA BMA . O3 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale108 covale one ? RA BMA . O6 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? e BMA 3 e MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale109 covale one ? RA MAN . O2 ? ? ? 1_555 RA MAN . C1 ? ? e MAN 4 e MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale110 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale111 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale112 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale113 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale114 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale115 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale116 covale one ? VA BMA . O3 ? ? ? 1_555 VA MAN . C1 ? ? j BMA 3 j MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale117 covale one ? VA BMA . O6 ? ? ? 1_555 VA MAN . C1 ? ? j BMA 3 j MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale118 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA NAG . 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C1 ? ? u BMA 3 u MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale137 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale138 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB BMA . C1 ? ? v NAG 2 v BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale139 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? w NAG 1 w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale140 covale both ? EB NAG . O4 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? x NAG 1 x NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale141 covale both ? EB NAG . O4 ? ? ? 1_555 EB BMA . C1 ? ? x NAG 2 x BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale142 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? y NAG 1 y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale143 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB BMA . C1 ? ? y NAG 2 y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale144 covale one ? FB BMA . O3 ? ? ? 1_555 FB MAN . C1 ? ? y BMA 3 y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale145 covale one ? FB BMA . O6 ? ? ? 1_555 FB MAN . 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DA BMA 3 DA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 7 B . ? THR 7 4 PRO 8 B ? PRO 8 4 1 2.77 2 VAL 99 B . ? VAL 99 4 PRO 100 B ? PRO 100 4 1 -1.48 3 THR 7 J . ? THR 7 L PRO 8 J ? PRO 8 L 1 2.79 4 VAL 99 J . ? 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AJ1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? 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_pdbx_entity_nonpoly.entity_id 15 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #