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n 2 420 PRO n 2 421 LEU n 2 422 LEU n 2 423 VAL n 2 424 LYS n 2 425 GLY n 2 426 THR n 2 427 LEU n 2 428 ILE n 2 429 ALA n 2 430 ILE n 2 431 ASP n # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.pdbx_src_id _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag _entity_src_gen.pdbx_seq_type _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num _entity_src_gen.gene_src_common_name _entity_src_gen.gene_src_genus _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene _entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 316 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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A2T085_RVFV A2T085 ? 1 ;EDPHLRNRPGKGHNYIDGMTQEDATCKPVTYAGACSSFDVLLEKGKFPLFQSYAHHRTLLEAVHDTIIAKADPPSCDLQS AHGNPCMKEKLVMKTHCPNDYQSAHYLNNDGKMASVKCPPKYELTEDCNFCRQMTGASLKKGSYPLQDLFCQSSEDDGSK LKTKMKGVCEVGVQALKKCDGQLSTAHEVVPFAVFKNSKKVYLDKLDLKTEENLLPDSFVCFEHKGQYKGKLDSGQTKRE LKSFDISQCPKIGGHGSKKCTGDAAFCSAYECTAQYANAYCSHANGSGIVQIQVSGVWKKPLCVGYERVVVKRELS ; 154 2 UNP A2T072_RVFV A2T072 ? 2 ;CSELIQASSRITTCSTEGVNTKCRLSGTALIRAGSVGAEACLMLKGVKEDQTKFLKIKTVSSELSCREGQSYWTGSFSPK CLSSRRCHLVGECHVNRCLSWRDNETSAEFSFVGESTTMRENKCFEQCGGWGCGCFNVNPSCLFVHTYLQSVRKEALRVF NCIDWVHKLTLEITDFDGSVSTIDLGASSSRFTNWGSVSLSLDAEGISGSNSFSFIESPGKGYAIVDEPFSEIPRQGFLG EIRCNSESSVLSAHESCLRAPNLISYKPMIDQLECTTNLIDPFVVFERGSLPQTRNDKTFAASKGNRGVQAFSKGSVQAD LTLMFDNFEVDFVGAAVSCDAAFLNLTGCYSCNAGARVCLSITSTGTGSLSAHNKDGSLHIVLPSENGTKDQCQILHFTV PEVEEEFMYSCDGDERPLLVKGTLIAID ; 691 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6F9F A 1 ? 316 ? 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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6F9F _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6F9F _struct.title 'Model of the Rift Valley fever virus glycoprotein pentamer' _struct.pdbx_descriptor Glycoprotein _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6F9F _struct_keywords.text 'enveloped virus, RVFV, glycoprotein, fusion protein, VIRUS' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 1 ? J N N 2 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 CYS A 35 ? VAL A 40 ? CYS A 188 VAL A 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 41 ? GLU A 43 ? LEU A 194 GLU A 196 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 PHE A 47 ? TYR A 53 ? PHE A 200 TYR A 206 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 THR A 58 ? HIS A 64 ? THR A 211 HIS A 217 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 MET A 87 ? VAL A 92 ? MET A 240 VAL A 245 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU A 215 ? ASP A 217 ? 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CYS I 188 VAL I 193 1 ? 6 HELX_P HELX_P49 AF4 LEU I 41 ? GLU I 43 ? LEU I 194 GLU I 196 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 PHE I 47 ? TYR I 53 ? PHE I 200 TYR I 206 1 ? 7 HELX_P HELX_P51 AF6 LEU I 59 ? HIS I 64 ? LEU I 212 HIS I 217 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 AF7 MET I 87 ? VAL I 92 ? MET I 240 VAL I 245 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 AF8 ASP I 245 ? CYS I 249 ? ASP I 398 CYS I 402 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP I 263 ? SER I 268 ? ASP I 416 SER I 421 1 ? 6 HELX_P HELX_P55 AG1 THR I 273 ? ALA I 277 ? THR I 426 ALA I 430 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 AG2 SER J 249 ? SER J 255 ? SER J 936 SER J 942 1 ? 7 HELX_P HELX_P57 AG3 ASP J 284 ? GLY J 292 ? ASP J 971 GLY J 979 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LYS 27 A . ? LYS 180 A PRO 28 A ? PRO 181 A 1 -1.83 2 ASP 72 A . ? ASP 225 A PRO 73 A ? PRO 226 A 1 -0.77 3 PRO 120 A . ? PRO 273 A LYS 121 A ? LYS 274 A 1 0.26 4 LEU 294 B . ? LEU 981 B PRO 295 B ? 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parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? 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anti-parallel AF5 3 4 ? parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF5 5 6 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AF9 5 6 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? parallel AG5 1 2 ? parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? parallel AG9 4 5 ? anti-parallel AG9 5 6 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH1 3 4 ? parallel AH1 4 5 ? 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