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primary _citation.journal_abbrev Elife _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2050-084X _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 8 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure of a bacterial ATP synthase.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.7554/eLife.43128 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30724163 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Guo, H.' 1 ? primary 'Suzuki, T.' 2 ? primary 'Rubinstein, J.L.' 3 0000-0003-0566-2209 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6N30 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.000 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.000 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ENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVIEKELTEQDQRKLIEAYIKDV QEVGGARM ; ;EAAHGISGGTIIYQLLMFIILLALLRKFAWQPLMNIMKQREEHIANEIDQAEKRRQEAEKLLEEQRELMKQSRQEAQALI ENARKLAEEQKEQIVASARAEAERVKETAKKEIEREKEQAMAALREQVASLSVLIASKVIEKELTEQDQRKLIEAYIKDV QEVGGARM ; b1 ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MEHKAPLVEFLGLTFNLSDMLMITITCLIVFIIAVAATRSLQLRPTGMQNFMEWVFDFVRGIINSTMDWQTGGRFLTLGV TLIMYVFVANMLGLPFSVHVNGELWWKSPTADATVTLTLAVMVVALTHYYGVKMKGASDYLRDYTRPVAWLFPLKIIEEF ANTLTLGLRLFGNIYAGEILLGLLASLGTHYGVLGAVGAAIPMMVWQAFSIFVGTIQAFIFTMLTMVYMAHKVSHDH ; ;MEHKAPLVEFLGLTFNLSDMLMITITCLIVFIIAVAATRSLQLRPTGMQNFMEWVFDFVRGIINSTMDWQTGGRFLTLGV TLIMYVFVANMLGLPFSVHVNGELWWKSPTADATVTLTLAVMVVALTHYYGVKMKGASDYLRDYTRPVAWLFPLKIIEEF ANTLTLGLRLFGNIYAGEILLGLLASLGTHYGVLGAVGAAIPMMVWQAFSIFVGTIQAFIFTMLTMVYMAHKVSHDH ; a ? 4 'polypeptide(L)' no no MSLGVLAAAIAVGLGALGAGIGNGLIVSRTIEGIARQPELRPVLQTTMFIGVALVEALPIIGVVFSFIYLGR MSLGVLAAAIAVGLGALGAGIGNGLIVSRTIEGIARQPELRPVLQTTMFIGVALVEALPIIGVVFSFIYLGR c3,c4,c5,c6,c7,c8,c9,c0,c1,c2 ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSIRAEEISALIKQQIENYESQIQVSDVGTVIQVGDGIARAHGLDNVMSGELVEFANGVMGMALNLEENNVGIVILGPYT GIKEGDEVRRTGRIMEVPVGEALIGRVVNPLGQPVDGLGPVETTETRPIESPAPGVMDRRSVHEPLQTGIKAIDALVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSVAIDTIINQKDQNMISIYVAIGQKESTVRTVVETLRKHGALDYTIVVTASASQPAPLLFLAPY AGVAMGEYFMYKGKHVLVVYDDLSKQAAAYRELSLLLRRPPGREAYPGDIFYLHSRLLERAAKLSDAKGGGSLTALPFVE TQAGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFSGVRPAINAGLSVSRVGGAAQIKAMKKVAGTLRLDLAAYRELEAFAQFGS DLDKATQAKLARGARTVEVLKQDLHQPIPVEKQVLIIYALTRGFLDDIPVEDVRRFEKEFYLFLDQNGQHLLEHIRTTKD LPNEDDLNKAIEAFKKTFVVSQ ; ;MSIRAEEISALIKQQIENYESQIQVSDVGTVIQVGDGIARAHGLDNVMSGELVEFANGVMGMALNLEENNVGIVILGPYT GIKEGDEVRRTGRIMEVPVGEALIGRVVNPLGQPVDGLGPVETTETRPIESPAPGVMDRRSVHEPLQTGIKAIDALVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSVAIDTIINQKDQNMISIYVAIGQKESTVRTVVETLRKHGALDYTIVVTASASQPAPLLFLAPY AGVAMGEYFMYKGKHVLVVYDDLSKQAAAYRELSLLLRRPPGREAYPGDIFYLHSRLLERAAKLSDAKGGGSLTALPFVE TQAGDISAYIPTNVISITDGQIFLQSDLFFSGVRPAINAGLSVSRVGGAAQIKAMKKVAGTLRLDLAAYRELEAFAQFGS DLDKATQAKLARGARTVEVLKQDLHQPIPVEKQVLIIYALTRGFLDDIPVEDVRRFEKEFYLFLDQNGQHLLEHIRTTKD LPNEDDLNKAIEAFKKTFVVSQ ; C,A,B ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTRGRVIQVMGPVVDVKFENGHLPAIYNALKIQHKARNENEVDIDLTLEVALHLGDDTVRTIAMASTDGLIRGMEVIDTG APISVPVGEVTLGRVFNVLGEPIDLEGDIPADARRDPIHRPAPKFEELATEVEILETGIKVVDLLAPYIKGGKIGLFGGA GVGKTVLIQELIHNIAQEHGGISVFAGVGERTREGNDLYHEMKDSGVISKTAMVFGQMNEPPGARMRVALTGLTMAEYFR DEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTAKGSITSIQAIYVPADDYTDPAPAT TFSHLDATTNLERKLAEMGIYPAVDPLASTSRALAPEIVGEEHYQVARKVQQTLQRYKELQDIIAILGMDELSDEDKLVV HRARRIQFFLSQNFHVAEQFTGQPGSYVPVKETVRGFKEILEGKYDHLPEDAFRLVGRIEEVVEKAKAMGVEV ; ;MTRGRVIQVMGPVVDVKFENGHLPAIYNALKIQHKARNENEVDIDLTLEVALHLGDDTVRTIAMASTDGLIRGMEVIDTG APISVPVGEVTLGRVFNVLGEPIDLEGDIPADARRDPIHRPAPKFEELATEVEILETGIKVVDLLAPYIKGGKIGLFGGA GVGKTVLIQELIHNIAQEHGGISVFAGVGERTREGNDLYHEMKDSGVISKTAMVFGQMNEPPGARMRVALTGLTMAEYFR DEQGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTAKGSITSIQAIYVPADDYTDPAPAT TFSHLDATTNLERKLAEMGIYPAVDPLASTSRALAPEIVGEEHYQVARKVQQTLQRYKELQDIIAILGMDELSDEDKLVV HRARRIQFFLSQNFHVAEQFTGQPGSYVPVKETVRGFKEILEGKYDHLPEDAFRLVGRIEEVVEKAKAMGVEV ; F,D,E ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MASLRDIKTRINATKKTSQITKAMEMVSTSKLNRAEQNAKSFVPYMEKIQEVVANVALGAGGASHPMLVSRPVKKTGYLV ITSDRGLAGAYNSNVLRLVYQTIQKRHASPDEYAIIVIGRVGLSFFRKRNMPVILDITRLPDQPSFADIKEIARKTVGLF ADGTFDELYMYYNHYVSAIQQEVTERKLLPLTDLAENKQRTVYEFEPSQEEILDVLLPQYAESLIYGALLDAKASEHAAR MTAMKNATDNANELIRTLTLSYNRARQAAITQEITEIVAGANALQ ; ;MASLRDIKTRINATKKTSQITKAMEMVSTSKLNRAEQNAKSFVPYMEKIQEVVANVALGAGGASHPMLVSRPVKKTGYLV ITSDRGLAGAYNSNVLRLVYQTIQKRHASPDEYAIIVIGRVGLSFFRKRNMPVILDITRLPDQPSFADIKEIARKTVGLF ADGTFDELYMYYNHYVSAIQQEVTERKLLPLTDLAENKQRTVYEFEPSQEEILDVLLPQYAESLIYGALLDAKASEHAAR MTAMKNATDNANELIRTLTLSYNRARQAAITQEITEIVAGANALQ ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MKTIHVSVVTPDGPVYEDDVEMVSVKAKSGELGILPGHIPLVAPLEISAARLKKGGKTQYIAVSGGFLEVRPDKVTILAQ AAERAEDIDVLRAKAAKERAERRLQSQQDDIDFKRAELALKRAMNRLSVAEMK ; ;MKTIHVSVVTPDGPVYEDDVEMVSVKAKSGELGILPGHIPLVAPLEISAARLKKGGKTQYIAVSGGFLEVRPDKVTILAQ AAERAEDIDVLRAKAAKERAERRLQSQQDDIDFKRAELALKRAMNRLSVAEMK ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MNQEVIAKRYASALFQIALEQGQLDRIEEDVRAVRQALAENGEFLSLLSYPKLSLDQKKALIAEAFAGVSTPVQNTLLLL LERHRFGLVPELAEQFLALVDDARGIAKAVAYSARPLTDEELRALSDVFAQKVGKQTLEIENIIDPELIGGVRLRIGNRI YDGSVSGQLERIRRQLIG ; ;MNQEVIAKRYASALFQIALEQGQLDRIEEDVRAVRQALAENGEFLSLLSYPKLSLDQKKALIAEAFAGVSTPVQNTLLLL LERHRFGLVPELAEQFLALVDDARGIAKAVAYSARPLTDEELRALSDVFAQKVGKQTLEIENIIDPELIGGVRLRIGNRI YDGSVSGQLERIRRQLIG ; I ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLU n 1 2 ALA n 1 3 ALA n 1 4 HIS n 1 5 GLY n 1 6 ILE n 1 7 SER n 1 8 GLY n 1 9 GLY n 1 10 THR n 1 11 ILE n 1 12 ILE n 1 13 TYR n 1 14 GLN n 1 15 LEU n 1 16 LEU n 1 17 MET n 1 18 PHE n 1 19 ILE n 1 20 ILE n 1 21 LEU n 1 22 LEU n 1 23 ALA n 1 24 LEU n 1 25 LEU n 1 26 ARG n 1 27 LYS n 1 28 PHE n 1 29 ALA n 1 30 TRP n 1 31 GLN n 1 32 PRO n 1 33 LEU n 1 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1 123 ALA n 1 124 LEU n 1 125 ARG n 1 126 GLU n 1 127 GLN n 1 128 VAL n 1 129 ALA n 1 130 SER n 1 131 LEU n 1 132 SER n 1 133 VAL n 1 134 LEU n 1 135 ILE n 1 136 ALA n 1 137 SER n 1 138 LYS n 1 139 VAL n 1 140 ILE n 1 141 UNK n 1 142 UNK n 1 143 UNK n 1 144 UNK n 1 145 UNK n 1 146 UNK n 1 147 UNK n 1 148 UNK n 1 149 UNK n 1 150 UNK n 1 151 UNK n 1 152 UNK n 1 153 UNK n 1 154 UNK n 1 155 UNK n 1 156 UNK n 1 157 UNK n 1 158 LYS n 1 159 ASP n 1 160 VAL n 1 161 GLN n 1 162 GLU n 1 163 VAL n 1 164 GLY n 1 165 GLY n 1 166 ALA n 1 167 ARG n 1 168 MET n 2 1 GLU n 2 2 ALA n 2 3 ALA n 2 4 HIS n 2 5 GLY n 2 6 ILE n 2 7 SER n 2 8 GLY n 2 9 GLY n 2 10 THR n 2 11 ILE n 2 12 ILE n 2 13 TYR n 2 14 GLN n 2 15 LEU n 2 16 LEU n 2 17 MET n 2 18 PHE n 2 19 ILE n 2 20 ILE n 2 21 LEU n 2 22 LEU n 2 23 ALA n 2 24 LEU n 2 25 LEU n 2 26 ARG n 2 27 LYS n 2 28 PHE n 2 29 ALA n 2 30 TRP n 2 31 GLN n 2 32 PRO n 2 33 LEU n 2 34 MET n 2 35 ASN n 2 36 ILE n 2 37 MET n 2 38 LYS n 2 39 GLN n 2 40 ARG n 2 41 GLU n 2 42 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 285 ? ? 'uncG, atpG' ? PS3 ? ? ? ? 'Bacillus sp. (strain PS3)' 2334 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 'Biological sequence' 1 133 ? ? 'uncC, atpC' ? PS3 ? ? ? ? 'Bacillus sp. (strain PS3)' 2334 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 'Biological sequence' 1 178 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Bacillus sp. PS3' 2334 ? ? ? ? ? ? ? ? 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O2G ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc6 metalc ? ? W ATP . O2B ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc7 metalc ? ? W ATP . O3B ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? metalc8 metalc ? ? Y ATP . O2B ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? A ATP 600 A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc9 metalc ? ? AA ATP . O3G ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? B ATP 600 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc10 metalc ? ? AA ATP . O2B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? B ATP 600 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc11 metalc ? ? DA ADP . O2B ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? E ADP 600 E MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 354 N . ? ARG 354 C PRO 355 N ? PRO 355 C 1 5.96 2 ARG 354 O . ? ARG 354 A PRO 355 O ? PRO 355 A 1 0.95 3 ARG 354 P . ? ARG 354 B PRO 355 P ? 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AD1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? anti-parallel AA5 7 8 ? anti-parallel AA5 8 9 ? anti-parallel AA5 9 10 ? anti-parallel AA5 10 11 ? anti-parallel AA5 11 12 ? anti-parallel AA5 12 13 ? anti-parallel AA5 13 14 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA7 6 7 ? parallel AA7 7 8 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB2 6 7 ? parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB5 6 7 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB7 6 7 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? parallel AB9 6 7 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? parallel AC3 6 7 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY N 29 ? 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