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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP LDCI_ECO57 P0A9H4 ? 1 ;MNVIAILNHMGVYFKEEPIRELHRALERLNFQIVYPNDRDDLLKLIENNARLCGVIFDWDKYNLELCEEISKMNENLPLY AFANTYSTLDVSLNDLRLQISFFEYALGAAEDIANKIKQTTDEYINTILPPLTKALFKYVREGKYTFCTPGHMGGTAFQK SPVGSLFYDFFGPNTMKSDISISVSELGSLLDHSGPHKEAEQYIARVFNADRSYMVTNGTSTANKIVGMYSAPAGSTILI DRNCHKSLTHLMMMSDVTPIYFRPTRNAYGILGGIPQSEFQHATIAKRVKETPNATWPVHAVITNSTYDGLLYNTDFIKK TLDVKSIHFDSAWVPYTNFSPIYEGKCGMSGGRVEGKVIYETQSTHKLLAAFSQASMIHVKGDVNEETFNEAYMMHTTTS PHYGIVASTETAAAMMKGNAGKRLINGSIERAIKFRKEIKRLRTESDGWFFDVWQPDHIDTTECWPLRSDSTWHGFKNID NEHMYLDPIKVTLLTPGMEKDGTMSDFGIPASIVAKYLDEHGIVVEKTGPYNLLFLFSIGIDKTKALSLLRALTDFKRAF DLNLRVKNMLPSLYREDPEFYENMRIQELAQNIHKLIVHHNLPDLMYRAFEVLPTMVMTPYAAFQKELHGMTEEVYLDEM VGRINANMILPYPPGVPLVMPGEMITEESRPVLEFLQMLCEIGAHYPGFETDIHGAYRQADGRYTVKVLKEESKK ; 1 2 UNP J7QAN2_ECOLX J7QAN2 ? 2 ;MAHPHLLAERISRLSSSLEKGLYERSHAIRLCLLAALSGESVFLLGPPGIAKSLIARRLKFAFQNARAFEYLMTRFSTPE EVFGPLSIQALKDEGRYERLTSGYLPEAEIVFLDEIWKAGPAILNTLLTAINERQFRNGAHVEKIPMRLLVAASNELPEA DSSLEALYDRMLIRLWLDKVQDKANFRSMLTSQQDENDNPVPDALQVTDEEYERWQKEIGEITLPDHVFELIFMLRQQLD KLPDAPYVSDRRWKKAIRLLQASAFFSGRSAVAPVDLILLKDCLWYDAQSLNLIQQQIDVLMTGHAWQQQGMLTRLGAIV QRHLQLQQQQSDKTALTVIRLGGIFSRRQQYQLPVNVTASTLTLLLQKPLKLHDMEVVHISFERSALEQWLSKGGEIRGK LNGIGFAQKLNLEVDSAQHLVVRDVSLQGSTLALPGSSAEGLPGEIKQQLEELESDWRKQHALFSEQQKCLFIPGDWLGR IEASLQDVGAQIRQAQQ ; 9 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6Q7M A 1 ? 715 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PLP non-polymer . "PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE" 'VITAMIN B6 Phosphate' 'C8 H10 N O6 P' 247.142 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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J LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 JA PLP . C4A ? ? J LYS 367 J PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale11 covale one ? K LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 KA PLP . C4A ? ? K LYS 367 K PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale12 covale one ? L LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 LA PLP . C4A ? ? L LYS 367 L PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale13 covale one ? M LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 MA PLP . C4A ? ? M LYS 367 M PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale14 covale one ? N LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 NA PLP . C4A ? ? N LYS 367 N PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale15 covale one ? O LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 OA PLP . C4A ? ? O LYS 367 O PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale16 covale one ? P LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 PA PLP . C4A ? ? P LYS 367 P PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale17 covale one ? Q LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 QA PLP . C4A ? ? Q LYS 367 Q PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale18 covale one ? R LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 RA PLP . C4A ? ? R LYS 367 R PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale19 covale one ? S LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 SA PLP . C4A ? ? S LYS 367 S PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale20 covale one ? T LYS 367 NZ ? ? ? 1_555 TA PLP . C4A ? ? T LYS 367 T PLP 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 149 A . ? THR 149 A PRO 150 A ? PRO 150 A 1 -1.85 2 ASN 305 A . ? ASN 305 A SER 306 A ? SER 306 A 1 0.56 3 TYR 652 A . ? TYR 652 A PRO 653 A ? PRO 653 A 1 -2.32 4 PRO 653 A . ? PRO 653 A PRO 654 A ? PRO 654 A 1 -1.56 5 THR 149 B . ? THR 149 B PRO 150 B ? PRO 150 B 1 -0.01 6 ASN 305 B . ? ASN 305 B SER 306 B ? SER 306 B 1 0.43 7 TYR 652 B . ? TYR 652 B PRO 653 B ? PRO 653 B 1 -2.33 8 PRO 653 B . ? PRO 653 B PRO 654 B ? PRO 654 B 1 -1.60 9 THR 149 C . ? THR 149 C PRO 150 C ? PRO 150 C 1 -0.44 10 ASN 305 C . ? ASN 305 C SER 306 C ? SER 306 C 1 0.81 11 TYR 652 C . ? TYR 652 C PRO 653 C ? PRO 653 C 1 -1.80 12 PRO 653 C . ? PRO 653 C PRO 654 C ? PRO 654 C 1 -2.56 13 THR 149 D . ? THR 149 D PRO 150 D ? PRO 150 D 1 -2.14 14 ASN 305 D . ? ASN 305 D SER 306 D ? SER 306 D 1 0.50 15 TYR 652 D . ? TYR 652 D PRO 653 D ? PRO 653 D 1 -2.12 16 PRO 653 D . ? PRO 653 D PRO 654 D ? PRO 654 D 1 -2.42 17 THR 149 E . ? THR 149 E PRO 150 E ? PRO 150 E 1 -1.43 18 ASN 305 E . ? ASN 305 E SER 306 E ? SER 306 E 1 0.14 19 TYR 652 E . ? TYR 652 E PRO 653 E ? PRO 653 E 1 -2.03 20 PRO 653 E . ? PRO 653 E PRO 654 E ? PRO 654 E 1 -2.67 21 THR 149 F . ? THR 149 F PRO 150 F ? PRO 150 F 1 -1.33 22 ASN 305 F . ? ASN 305 F SER 306 F ? SER 306 F 1 -0.12 23 TYR 652 F . ? TYR 652 F PRO 653 F ? PRO 653 F 1 -2.16 24 PRO 653 F . ? PRO 653 F PRO 654 F ? PRO 654 F 1 -2.38 25 THR 149 G . ? THR 149 G PRO 150 G ? PRO 150 G 1 -1.06 26 ASN 305 G . ? ASN 305 G SER 306 G ? SER 306 G 1 0.89 27 TYR 652 G . ? TYR 652 G PRO 653 G ? PRO 653 G 1 -1.84 28 PRO 653 G . ? PRO 653 G PRO 654 G ? PRO 654 G 1 -2.64 29 THR 149 H . ? THR 149 H PRO 150 H ? PRO 150 H 1 -1.45 30 ASN 305 H . ? ASN 305 H SER 306 H ? SER 306 H 1 0.74 31 TYR 652 H . ? TYR 652 H PRO 653 H ? PRO 653 H 1 -1.60 32 PRO 653 H . ? PRO 653 H PRO 654 H ? PRO 654 H 1 -2.95 33 THR 149 I . ? THR 149 I PRO 150 I ? PRO 150 I 1 -1.75 34 ASN 305 I . ? ASN 305 I SER 306 I ? SER 306 I 1 0.31 35 TYR 652 I . ? TYR 652 I PRO 653 I ? PRO 653 I 1 -1.90 36 PRO 653 I . ? PRO 653 I PRO 654 I ? PRO 654 I 1 -3.37 37 THR 149 J . ? THR 149 J PRO 150 J ? PRO 150 J 1 -0.68 38 ASN 305 J . ? ASN 305 J SER 306 J ? SER 306 J 1 0.31 39 TYR 652 J . ? TYR 652 J PRO 653 J ? PRO 653 J 1 -1.47 40 PRO 653 J . ? PRO 653 J PRO 654 J ? PRO 654 J 1 -2.18 41 THR 149 K . ? THR 149 K PRO 150 K ? PRO 150 K 1 -1.31 42 ASN 305 K . ? ASN 305 K SER 306 K ? SER 306 K 1 0.05 43 TYR 652 K . ? TYR 652 K PRO 653 K ? PRO 653 K 1 -1.94 44 PRO 653 K . ? PRO 653 K PRO 654 K ? PRO 654 K 1 -2.39 45 THR 149 L . ? THR 149 L PRO 150 L ? PRO 150 L 1 -1.16 46 ASN 305 L . ? ASN 305 L SER 306 L ? SER 306 L 1 0.92 47 TYR 652 L . ? TYR 652 L PRO 653 L ? PRO 653 L 1 -1.84 48 PRO 653 L . ? PRO 653 L PRO 654 L ? PRO 654 L 1 -2.67 49 THR 149 M . ? THR 149 M PRO 150 M ? PRO 150 M 1 -1.36 50 ASN 305 M . ? ASN 305 M SER 306 M ? SER 306 M 1 0.79 51 TYR 652 M . ? TYR 652 M PRO 653 M ? PRO 653 M 1 -1.46 52 PRO 653 M . ? PRO 653 M PRO 654 M ? PRO 654 M 1 -2.83 53 THR 149 N . ? THR 149 N PRO 150 N ? PRO 150 N 1 -1.69 54 ASN 305 N . ? ASN 305 N SER 306 N ? SER 306 N 1 0.26 55 TYR 652 N . ? TYR 652 N PRO 653 N ? PRO 653 N 1 -1.84 56 PRO 653 N . ? PRO 653 N PRO 654 N ? PRO 654 N 1 -3.36 57 THR 149 O . ? THR 149 O PRO 150 O ? PRO 150 O 1 -0.66 58 ASN 305 O . ? ASN 305 O SER 306 O ? SER 306 O 1 0.34 59 TYR 652 O . ? TYR 652 O PRO 653 O ? PRO 653 O 1 -0.82 60 PRO 653 O . ? PRO 653 O PRO 654 O ? PRO 654 O 1 -1.85 61 THR 149 P . ? THR 149 P PRO 150 P ? PRO 150 P 1 -1.21 62 ASN 305 P . ? ASN 305 P SER 306 P ? SER 306 P 1 0.20 63 TYR 652 P . ? TYR 652 P PRO 653 P ? PRO 653 P 1 -2.58 64 PRO 653 P . ? PRO 653 P PRO 654 P ? PRO 654 P 1 -1.99 65 THR 149 Q . ? THR 149 Q PRO 150 Q ? PRO 150 Q 1 -0.50 66 ASN 305 Q . ? ASN 305 Q SER 306 Q ? SER 306 Q 1 1.01 67 TYR 652 Q . ? TYR 652 Q PRO 653 Q ? PRO 653 Q 1 -1.78 68 PRO 653 Q . ? PRO 653 Q PRO 654 Q ? PRO 654 Q 1 -2.74 69 THR 149 R . ? THR 149 R PRO 150 R ? PRO 150 R 1 -1.71 70 ASN 305 R . ? ASN 305 R SER 306 R ? SER 306 R 1 0.82 71 TYR 652 R . ? TYR 652 R PRO 653 R ? PRO 653 R 1 -1.88 72 PRO 653 R . ? PRO 653 R PRO 654 R ? PRO 654 R 1 -1.33 73 THR 149 S . ? THR 149 S PRO 150 S ? PRO 150 S 1 -2.03 74 ASN 305 S . ? ASN 305 S SER 306 S ? SER 306 S 1 0.49 75 TYR 652 S . ? TYR 652 S PRO 653 S ? PRO 653 S 1 -2.10 76 PRO 653 S . ? PRO 653 S PRO 654 S ? PRO 654 S 1 -2.61 77 THR 149 T . ? THR 149 T PRO 150 T ? PRO 150 T 1 -0.05 78 ASN 305 T . ? ASN 305 T SER 306 T ? SER 306 T 1 0.38 79 TYR 652 T . ? TYR 652 T PRO 653 T ? PRO 653 T 1 -1.82 80 PRO 653 T . ? PRO 653 T PRO 654 T ? PRO 654 T 1 -3.16 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 7 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 7 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 7 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 7 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 7 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 6 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 7 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 3 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 5 ? AF5 ? 7 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 3 ? AF9 ? 2 ? AG1 ? 5 ? AG2 ? 7 ? AG3 ? 4 ? AG4 ? 2 ? AG5 ? 2 ? AG6 ? 2 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 2 ? AG9 ? 7 ? AH1 ? 4 ? AH2 ? 2 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 2 ? AH5 ? 3 ? AH6 ? 2 ? AH7 ? 7 ? AH8 ? 2 ? AH9 ? 2 ? AI1 ? 2 ? AI2 ? 2 ? AI3 ? 3 ? AI4 ? 2 ? AI5 ? 7 ? AI6 ? 3 ? AI7 ? 2 ? AI8 ? 3 ? AI9 ? 2 ? AJ1 ? 5 ? AJ2 ? 7 ? AJ3 ? 4 ? AJ4 ? 2 ? AJ5 ? 3 ? AJ6 ? 2 ? AJ7 ? 5 ? AJ8 ? 7 ? AJ9 ? 4 ? AK1 ? 2 ? AK2 ? 2 ? AK3 ? 2 ? AK4 ? 3 ? AK5 ? 2 ? AK6 ? 7 ? AK7 ? 4 ? AK8 ? 2 ? AK9 ? 2 ? AL1 ? 2 ? AL2 ? 3 ? AL3 ? 2 ? AL4 ? 7 ? AL5 ? 4 ? AL6 ? 2 ? AL7 ? 3 ? AL8 ? 2 ? AL9 ? 3 ? AM1 ? 2 ? AM2 ? 7 ? AM3 ? 3 ? AM4 ? 2 ? AM5 ? 3 ? AM6 ? 2 ? AM7 ? 5 ? AM8 ? 7 ? AM9 ? 4 ? AN1 ? 2 ? AN2 ? 2 ? AN3 ? 2 ? AN4 ? 5 ? AN5 ? 7 ? AN6 ? 4 ? AN7 ? 2 ? AN8 ? 3 ? AN9 ? 2 ? AO1 ? 3 ? AO2 ? 2 ? AO3 ? 7 ? AO4 ? 4 ? AO5 ? 2 ? AO6 ? 3 ? AO7 ? 2 ? AO8 ? 5 ? AO9 ? 2 ? AP1 ? 3 ? AP2 ? 2 ? AP3 ? 2 ? AP4 ? 2 ? AP5 ? 5 ? AP6 ? 2 ? AP7 ? 5 ? AP8 ? 2 ? AP9 ? 2 ? AQ1 ? 5 ? AQ2 ? 2 ? AQ3 ? 5 ? AQ4 ? 2 ? AQ5 ? 2 ? AQ6 ? 5 ? AQ7 ? 2 ? AQ8 ? 2 ? AQ9 ? 5 ? AR1 ? 2 ? AR2 ? 5 ? AR3 ? 2 ? AR4 ? 5 ? AR5 ? 2 ? AR6 ? 2 ? AR7 ? 5 ? AR8 ? 2 ? AR9 ? 5 ? AS1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA2 5 6 ? parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? parallel AC3 4 5 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC4 6 7 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? parallel AD2 5 6 ? parallel AD2 6 7 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? parallel AD8 1 2 ? parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? parallel AD9 3 4 ? 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For fitting of atomic models in the resulting filtered maps, we used the previously-determined X-ray structures of LdcI (PDB ID: 3N75) (Kanjee et al., 2011) and RavA (PDB ID: 3NBX) (El Bakkouri et al., 2010). In each map, two decameric LdcI molecules extracted from PDB 3N75 and one spiral RavA hexamer extracted from a continuous RavA helix generated from PDB 3NBX were fitted separately using iMODFIT (Lopez-Blanco and Chacon, 2013), followed by a single round of B-factor (ADP) refinement in Phenix. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 1 1 ? ? ? 3N75 1 2 ? ? ? 3NBX # _em_3d_reconstruction.entry_id 6Q7M _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 16513 _em_3d_reconstruction.resolution 7.8 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details '20 mM Tris pH 7.9, 300 mM NaCl, 2 mM ADP, 10 mM MgCl 2 , 0.1 mM PLP and 1 mM DTT' _em_buffer.pH 7.9 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Complex of the hexameric MoxR AAA+ ATPase RavA and the decameric lysine decarboxylase LdcI.' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1,2 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6Q7M _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 40 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 3-40 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6Q7M _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification 41270 _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ;Data collection was performed on an FEI Polara microscope operated at 300 kV. Movies of 40 frames were collected with a total exposure time of 8s and a total dose of 40e-/Angstrom^2 on a K2 summit direct electron detector (Gatan) at a magnification of 41270x, corresponding to 1.21 Angstrom/pixel at the specimen level. ; _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI POLARA 300' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.details ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 6Q7M _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6Q7M _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6Q7M _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OE2 R GLU 639 ? ? 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? -115.54 77.92 116 1 GLU C 142 ? ? -132.55 -41.64 117 1 SER C 181 ? ? -106.64 -146.69 118 1 ASN C 209 ? ? 56.54 76.85 119 1 THR C 217 ? ? -105.66 42.17 120 1 ASN C 218 ? ? -150.78 32.30 121 1 ALA C 232 ? ? -152.71 83.64 122 1 SER C 236 ? ? -93.31 -142.79 123 1 ASN C 267 ? ? -111.95 -150.50 124 1 ASN C 294 ? ? 56.59 72.15 125 1 THR C 296 ? ? -107.10 -152.82 126 1 TYR C 313 ? ? -98.22 -146.05 127 1 LYS C 320 ? ? -135.13 -34.17 128 1 PRO C 335 ? ? -84.22 44.70 129 1 TYR C 336 ? ? -155.40 17.21 130 1 THR C 337 ? ? -79.50 44.18 131 1 ASN C 338 ? ? -159.51 30.10 132 1 PHE C 339 ? ? -141.39 22.19 133 1 HIS C 366 ? ? -93.08 38.81 134 1 LEU C 369 ? ? -131.33 -134.77 135 1 ALA C 370 ? ? -154.06 89.29 136 1 TRP C 454 ? ? -69.16 81.62 137 1 ASP C 460 ? ? -84.98 48.02 138 1 HIS C 483 ? ? -148.61 -29.85 139 1 SER C 505 ? ? -123.05 -161.16 140 1 PRO C 530 ? ? -66.11 -90.90 141 1 TYR C 531 ? ? -144.55 51.01 142 1 PHE C 537 ? ? -112.68 77.75 143 1 ASN C 563 ? ? 56.77 76.23 144 1 MET C 569 ? ? -153.80 -44.96 145 1 ASP C 577 ? ? -152.64 83.98 146 1 TYR C 581 ? ? -88.10 44.47 147 1 GLU C 582 ? ? -90.54 -72.34 148 1 ASN C 601 ? ? 57.16 80.93 149 1 MET C 631 ? ? -96.74 44.39 150 1 MET C 640 ? ? -155.36 11.47 151 1 PRO C 654 ? ? -82.58 -101.30 152 1 THR C 666 ? ? -103.81 -145.61 153 1 SER C 669 ? ? -95.53 50.44 154 1 ALA C 684 ? ? -154.02 -18.22 155 1 PHE C 689 ? ? -105.09 52.31 156 1 GLN C 699 ? ? -94.87 -139.14 157 1 ASN D 2 ? ? -160.19 43.01 158 1 ASN D 8 ? ? 70.03 120.79 159 1 ASN D 30 ? ? 58.54 80.18 160 1 ASN D 37 ? ? -96.64 -93.43 161 1 ASP D 60 ? ? -95.41 49.86 162 1 LYS D 61 ? ? -151.50 -43.90 163 1 MET D 73 ? ? -101.09 -77.28 164 1 ASN D 84 ? ? -114.70 -164.38 165 1 ASP D 95 ? ? -95.66 46.92 166 1 PHE D 147 ? ? 57.57 72.05 167 1 PRO D 150 ? ? -76.03 -166.60 168 1 PHE D 171 ? ? -74.40 -76.13 169 1 SER D 181 ? ? -113.49 -150.15 170 1 ASN D 209 ? ? 56.54 76.05 171 1 ASN D 218 ? ? -152.05 37.83 172 1 ALA D 232 ? ? -153.71 84.26 173 1 SER D 236 ? ? -101.01 -147.38 174 1 ASN D 267 ? ? -116.19 -151.70 175 1 THR D 296 ? ? -105.90 -153.59 176 1 PRO D 335 ? ? -85.94 42.25 177 1 TYR D 336 ? ? -152.74 11.49 178 1 ASN D 338 ? ? -163.12 -39.66 179 1 PHE D 339 ? ? -87.37 30.61 180 1 THR D 362 ? ? -113.05 71.33 181 1 LEU D 369 ? ? -135.54 -127.32 182 1 TRP D 454 ? ? -69.80 81.96 183 1 ASN D 478 ? ? 57.50 79.22 184 1 HIS D 483 ? ? -138.78 -32.35 185 1 SER D 505 ? ? -131.78 -156.33 186 1 PRO D 530 ? ? -65.65 -89.37 187 1 TYR D 531 ? ? -143.64 53.31 188 1 PHE D 537 ? ? -111.17 64.91 189 1 SER D 538 ? ? -89.42 -156.65 190 1 ASP D 542 ? ? -88.68 -158.10 191 1 ASN D 563 ? ? 56.75 76.47 192 1 ASN D 568 ? ? -92.45 34.63 193 1 MET D 569 ? ? -158.17 -46.02 194 1 ASP D 577 ? ? -152.01 84.15 195 1 TYR D 581 ? ? -89.18 41.73 196 1 GLU D 582 ? ? -87.68 -73.25 197 1 ASN D 601 ? ? 57.32 82.42 198 1 MET D 640 ? ? -152.42 13.02 199 1 PRO D 654 ? ? -81.74 -102.04 200 1 PRO D 661 ? ? -62.60 99.07 201 1 THR D 666 ? ? -107.78 -156.83 202 1 SER D 669 ? ? -93.39 53.77 203 1 ALA D 684 ? ? -153.91 -18.80 204 1 PHE D 689 ? ? -102.55 54.27 205 1 GLN D 699 ? ? -97.55 -150.72 206 1 ASN E 2 ? ? -160.77 41.51 207 1 ASN E 8 ? ? 69.06 158.59 208 1 ASN E 30 ? ? 58.46 79.95 209 1 ASN E 37 ? ? -94.61 -98.21 210 1 CYS E 53 ? ? -142.44 -4.16 211 1 ASP E 60 ? ? -95.02 47.80 212 1 LYS E 61 ? ? -148.44 -46.66 213 1 ASN E 84 ? ? -123.30 -164.79 214 1 ASP E 95 ? ? -104.06 45.70 215 1 PHE E 171 ? ? -74.28 -70.25 216 1 SER E 181 ? ? -93.35 -148.50 217 1 ASN E 209 ? ? 56.65 78.27 218 1 ALA E 232 ? ? -151.71 84.35 219 1 SER E 236 ? ? -103.25 -144.76 220 1 LEU E 239 ? ? -117.21 78.07 221 1 ASN E 267 ? ? -109.94 -152.63 222 1 THR E 296 ? ? -107.42 -152.98 223 1 THR E 307 ? ? -78.73 -169.08 224 1 TYR E 313 ? ? -109.13 -160.25 225 1 TRP E 333 ? ? -142.08 -3.76 226 1 PRO E 335 ? ? -86.90 36.48 227 1 TYR E 336 ? ? -143.09 -1.04 228 1 ASN E 338 ? ? -164.08 -47.76 229 1 PHE E 339 ? ? -89.49 44.19 230 1 HIS E 366 ? ? -94.58 36.58 231 1 LEU E 369 ? ? -131.06 -134.87 232 1 ASN E 478 ? ? 56.38 79.12 233 1 HIS E 483 ? ? -135.37 -34.85 234 1 PRO E 530 ? ? -65.36 -87.65 235 1 TYR E 531 ? ? -140.46 55.49 236 1 PHE E 537 ? ? -113.76 77.08 237 1 ASN E 563 ? ? 56.70 77.37 238 1 ASN E 568 ? ? -91.71 33.43 239 1 MET E 569 ? ? -157.63 -45.55 240 1 ASP E 577 ? ? -154.38 84.45 241 1 TYR E 581 ? ? -91.07 51.18 242 1 GLU E 582 ? ? -94.81 -70.46 243 1 ASN E 601 ? ? 57.25 82.68 244 1 MET E 631 ? ? -97.57 49.58 245 1 MET E 640 ? ? -156.44 12.46 246 1 PRO E 654 ? ? -82.14 -100.90 247 1 LEU E 658 ? ? -109.86 -61.05 248 1 THR E 666 ? ? -108.32 -154.45 249 1 SER E 669 ? ? -92.84 55.28 250 1 ALA E 684 ? ? -150.82 -0.85 251 1 PHE E 689 ? ? -109.27 49.40 252 1 GLN E 699 ? ? -95.25 -146.76 253 1 ASN F 2 ? ? -160.77 42.44 254 1 ASN F 8 ? ? 68.30 163.37 255 1 ASN F 30 ? ? 58.52 80.37 256 1 ASN F 37 ? ? -94.56 -98.98 257 1 CYS F 53 ? ? -145.22 12.20 258 1 ASP F 60 ? ? -95.54 47.13 259 1 LYS F 61 ? ? -147.98 -48.26 260 1 ASN F 84 ? ? -123.68 -161.10 261 1 ASP F 95 ? ? -105.79 45.51 262 1 TYR F 105 ? ? -115.51 57.86 263 1 GLU F 142 ? ? -131.31 -51.40 264 1 PHE F 171 ? ? -77.83 -84.23 265 1 SER F 181 ? ? -88.99 -145.31 266 1 ASN F 209 ? ? 56.97 76.15 267 1 SER F 231 ? ? -86.20 41.42 268 1 ALA F 232 ? ? -154.48 81.06 269 1 SER F 236 ? ? -145.06 -150.80 270 1 LEU F 239 ? ? -114.83 76.02 271 1 ASN F 267 ? ? -109.42 -151.91 272 1 THR F 296 ? ? -107.55 -151.29 273 1 TYR F 313 ? ? -112.17 -162.02 274 1 SER F 331 ? ? -89.99 49.77 275 1 PRO F 335 ? ? -86.48 45.33 276 1 TYR F 336 ? ? -155.16 3.31 277 1 ASN F 338 ? ? -163.23 -47.33 278 1 PHE F 339 ? ? -86.43 42.55 279 1 THR F 362 ? ? -107.82 74.73 280 1 HIS F 366 ? ? -94.23 40.81 281 1 LYS F 367 ? ? -120.34 -56.26 282 1 LEU F 369 ? ? -127.85 -129.24 283 1 GLU F 387 ? ? -98.52 51.19 284 1 THR F 388 ? ? -149.30 -56.95 285 1 ASN F 478 ? ? 56.34 78.90 286 1 HIS F 483 ? ? -135.57 -35.72 287 1 PRO F 530 ? ? -65.28 -87.28 288 1 PHE F 537 ? ? -113.49 78.85 289 1 ASN F 563 ? ? 56.69 77.86 290 1 ASN F 568 ? ? -91.75 34.18 291 1 MET F 569 ? ? -158.11 -46.63 292 1 ASP F 577 ? ? -154.23 84.42 293 1 TYR F 581 ? ? -90.57 51.25 294 1 GLU F 582 ? ? -94.97 -70.69 295 1 ASN F 601 ? ? 57.11 82.36 296 1 MET F 640 ? ? -156.46 12.26 297 1 PRO F 654 ? ? -84.93 -116.25 298 1 LEU F 658 ? ? -107.79 -62.34 299 1 PRO F 661 ? ? -62.65 96.38 300 1 THR F 666 ? ? -107.60 -155.99 301 1 SER F 669 ? ? -92.94 52.49 302 1 ALA F 684 ? ? -150.22 -1.46 303 1 PHE F 689 ? ? -109.71 49.52 304 1 GLN F 699 ? ? -95.38 -147.76 305 1 ASN G 2 ? ? -160.84 41.83 306 1 ASN G 8 ? ? 68.52 109.65 307 1 ASN G 30 ? ? 58.52 80.09 308 1 ASN G 37 ? ? -94.70 -91.04 309 1 CYS G 53 ? ? -146.33 17.26 310 1 ASP G 60 ? ? -95.22 49.93 311 1 LYS G 61 ? ? -152.48 -46.67 312 1 MET G 73 ? ? -105.34 -67.60 313 1 ASN G 84 ? ? -122.89 -161.22 314 1 ASP G 95 ? ? -98.80 45.39 315 1 TYR G 105 ? ? -115.51 75.94 316 1 SER G 181 ? ? -106.24 -141.22 317 1 ASN G 209 ? ? 57.56 76.39 318 1 ASN G 218 ? ? -155.29 31.28 319 1 ALA G 232 ? ? -155.23 84.92 320 1 SER G 236 ? ? -94.26 -141.32 321 1 ASN G 267 ? ? -112.21 -149.75 322 1 ASN G 294 ? ? 56.70 72.23 323 1 THR G 296 ? ? -107.32 -154.73 324 1 TYR G 313 ? ? -99.53 -148.28 325 1 PRO G 335 ? 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? -96.94 -148.74 356 1 ASN H 2 ? ? -160.37 41.82 357 1 ASN H 8 ? ? 70.13 125.89 358 1 ASN H 30 ? ? 58.58 80.08 359 1 ASN H 37 ? ? -93.96 -92.46 360 1 CYS H 53 ? ? -144.06 12.76 361 1 ASP H 60 ? ? -95.45 47.50 362 1 LYS H 61 ? ? -148.93 -46.16 363 1 MET H 73 ? ? -100.71 -77.60 364 1 ASN H 84 ? ? -127.02 -156.84 365 1 ASP H 95 ? ? -97.47 45.57 366 1 PHE H 171 ? ? -73.15 -77.00 367 1 SER H 181 ? ? -107.41 -157.24 368 1 ASN H 209 ? ? 57.43 76.78 369 1 THR H 217 ? ? -108.23 42.11 370 1 ASN H 218 ? ? -153.44 30.61 371 1 MET H 229 ? ? -99.69 46.74 372 1 TYR H 230 ? ? -147.62 -36.59 373 1 ALA H 232 ? ? -151.31 84.42 374 1 SER H 236 ? ? -90.07 -147.19 375 1 ASN H 267 ? ? -116.39 -150.85 376 1 ASN H 294 ? ? 56.71 70.02 377 1 THR H 296 ? ? -106.35 -152.80 378 1 TYR H 313 ? ? -99.79 -152.71 379 1 PRO H 335 ? ? -85.50 42.24 380 1 TYR H 336 ? ? -153.14 10.70 381 1 ASN H 338 ? ? -164.18 -33.72 382 1 THR H 362 ? ? -118.47 73.00 383 1 HIS H 366 ? ? -94.92 38.93 384 1 LEU H 369 ? ? -128.01 -131.04 385 1 ASN H 478 ? ? 56.01 75.76 386 1 HIS H 483 ? ? -133.99 -45.20 387 1 LYS H 490 ? ? -114.69 79.24 388 1 SER H 505 ? ? -111.69 -169.30 389 1 PRO H 530 ? ? -65.82 -89.35 390 1 TYR H 531 ? ? -144.11 51.90 391 1 PHE H 537 ? ? -113.53 71.20 392 1 ASN H 563 ? ? 56.73 77.12 393 1 ASN H 568 ? ? -92.62 35.98 394 1 MET H 569 ? ? -159.61 -44.45 395 1 ASP H 577 ? ? -153.55 84.31 396 1 TYR H 581 ? ? -92.28 44.91 397 1 GLU H 582 ? ? -89.89 -72.38 398 1 ASN H 583 ? ? -91.09 44.14 399 1 ASN H 601 ? ? 57.33 83.01 400 1 MET H 631 ? ? -95.59 49.79 401 1 MET H 640 ? ? -150.36 12.59 402 1 THR H 666 ? ? -109.35 -141.64 403 1 SER H 669 ? ? -96.42 58.60 404 1 ALA H 684 ? ? -154.54 -15.05 405 1 PHE H 689 ? ? -106.75 53.01 406 1 GLN H 699 ? ? -97.60 -148.41 407 1 ASN I 2 ? ? -160.02 40.18 408 1 ASN I 8 ? ? 69.38 115.68 409 1 ASN I 30 ? ? 58.67 79.72 410 1 ASN I 37 ? ? -96.23 -93.44 411 1 ASP I 60 ? ? -95.23 48.37 412 1 LYS I 61 ? ? -150.24 -43.99 413 1 MET I 73 ? ? -101.22 -77.14 414 1 TYR I 80 ? ? -90.77 59.54 415 1 ASN I 84 ? ? -115.72 -164.76 416 1 ASP I 95 ? ? -93.64 45.10 417 1 TYR I 105 ? ? -119.55 74.22 418 1 SER I 181 ? ? -109.18 -156.05 419 1 ASN I 209 ? ? 56.52 76.02 420 1 ASN I 218 ? ? -148.71 37.43 421 1 ALA I 232 ? ? -153.22 85.11 422 1 SER I 236 ? ? -87.21 -144.40 423 1 ASN I 267 ? ? -115.55 -150.87 424 1 ASN I 294 ? ? 56.69 71.23 425 1 THR I 296 ? ? -106.51 -155.91 426 1 THR I 307 ? ? -78.27 -167.31 427 1 PRO I 335 ? ? -87.61 34.50 428 1 TYR I 336 ? ? -146.82 10.99 429 1 ASN I 338 ? ? -164.01 -41.19 430 1 LEU I 369 ? ? -134.35 -131.98 431 1 TRP I 454 ? ? -69.87 81.45 432 1 ASP I 460 ? ? -84.94 46.01 433 1 ASN I 478 ? ? 55.71 71.24 434 1 HIS I 483 ? ? -138.55 -32.92 435 1 SER I 505 ? ? -131.67 -156.72 436 1 PRO I 530 ? ? -65.96 -89.52 437 1 TYR I 531 ? ? -144.15 48.39 438 1 PHE I 537 ? ? -113.35 69.44 439 1 SER I 538 ? ? -91.58 -156.30 440 1 ASP I 542 ? ? -87.02 -155.67 441 1 ASN I 563 ? ? 56.84 77.22 442 1 ASN I 568 ? ? -92.24 34.09 443 1 MET I 569 ? ? -157.83 -45.03 444 1 ASP I 577 ? ? -152.62 83.85 445 1 TYR I 581 ? ? -89.14 42.36 446 1 GLU I 582 ? ? -88.56 -73.47 447 1 ASN I 601 ? ? 57.36 82.53 448 1 MET I 631 ? ? -95.32 51.00 449 1 MET I 640 ? ? -152.93 12.71 450 1 LEU I 658 ? ? -103.12 -61.40 451 1 THR I 666 ? ? -108.50 -155.99 452 1 SER I 669 ? ? -94.20 53.83 453 1 ALA I 684 ? ? -153.81 -19.38 454 1 PHE I 689 ? ? -102.53 54.26 455 1 GLN I 699 ? ? -94.97 -140.73 456 1 ASN J 2 ? ? -160.21 43.24 457 1 ASN J 8 ? ? 68.97 113.46 458 1 ASN J 30 ? ? 58.45 79.97 459 1 ASN J 37 ? ? -93.23 -91.57 460 1 ASP J 60 ? ? -96.00 46.68 461 1 LYS J 61 ? ? -148.55 -45.54 462 1 MET J 73 ? ? -92.55 -80.06 463 1 TYR J 80 ? ? -96.42 52.78 464 1 ASN J 84 ? ? -120.49 -166.45 465 1 ASP J 95 ? ? -106.63 44.38 466 1 SER J 181 ? ? -116.24 -144.39 467 1 ASN J 209 ? ? 57.38 76.81 468 1 ASN J 218 ? ? -141.33 37.05 469 1 TYR J 230 ? ? -127.50 -51.76 470 1 ALA J 232 ? ? -152.08 85.99 471 1 SER J 236 ? ? -110.32 -149.99 472 1 ASN J 267 ? ? -111.88 -149.60 473 1 THR J 296 ? ? -109.00 -153.33 474 1 THR J 307 ? ? -78.20 -169.10 475 1 TRP J 333 ? ? -142.46 -1.66 476 1 PRO J 335 ? ? -86.99 41.13 477 1 ASN J 338 ? ? -165.26 -35.54 478 1 PHE J 339 ? ? -87.42 30.65 479 1 THR J 362 ? ? -119.07 79.21 480 1 HIS J 366 ? ? -90.81 38.59 481 1 ASN J 478 ? ? 55.58 70.06 482 1 HIS J 483 ? ? -134.37 -34.36 483 1 THR J 503 ? ? -93.21 -156.94 484 1 PRO J 530 ? ? -65.57 -88.95 485 1 TYR J 531 ? ? -142.31 57.16 486 1 ASN J 563 ? ? 56.75 76.23 487 1 ASN J 568 ? ? -91.43 31.25 488 1 MET J 569 ? ? -155.64 -46.29 489 1 ASP J 577 ? ? -153.21 84.05 490 1 TYR J 581 ? ? -90.81 37.41 491 1 GLU J 582 ? ? -83.67 -72.32 492 1 ASN J 583 ? ? -92.88 59.74 493 1 ASN J 601 ? ? 57.30 82.91 494 1 MET J 640 ? ? -148.81 13.54 495 1 PRO J 654 ? ? -82.86 -106.56 496 1 LEU J 658 ? ? -107.24 -62.41 497 1 THR J 666 ? ? -105.58 -152.38 498 1 SER J 669 ? ? -94.43 53.14 499 1 ALA J 684 ? ? -150.93 12.47 500 1 PHE J 689 ? ? -108.37 46.31 501 1 GLN J 699 ? ? -97.25 -151.14 502 1 ASN K 2 ? ? -160.84 42.63 503 1 ASN K 8 ? ? 68.12 164.05 504 1 ASN K 30 ? ? 58.45 80.39 505 1 ASN K 37 ? ? -94.59 -98.97 506 1 CYS K 53 ? ? -145.25 11.76 507 1 ASP K 60 ? ? -95.52 47.09 508 1 LYS K 61 ? ? -147.91 -48.28 509 1 ASN K 84 ? ? -123.68 -160.84 510 1 ASP K 95 ? ? -105.86 45.35 511 1 TYR K 105 ? ? -115.39 57.97 512 1 GLU K 142 ? ? -131.40 -51.22 513 1 PHE K 171 ? ? -77.51 -83.56 514 1 SER K 181 ? ? -89.26 -144.96 515 1 ASN K 209 ? ? 56.27 76.61 516 1 SER K 231 ? ? -90.32 35.25 517 1 ALA K 232 ? ? -153.29 84.54 518 1 ALA K 234 ? ? -69.04 89.04 519 1 SER K 236 ? ? -130.03 -150.57 520 1 LEU K 239 ? ? -115.23 76.23 521 1 ASN K 267 ? ? -110.56 -153.71 522 1 THR K 296 ? ? -107.83 -151.72 523 1 TYR K 313 ? ? -110.60 -164.70 524 1 PRO K 335 ? ? -84.96 43.47 525 1 TYR K 336 ? ? -152.64 1.36 526 1 ASN K 338 ? ? -161.82 -43.77 527 1 PHE K 339 ? ? -88.70 40.68 528 1 THR K 362 ? ? -119.63 78.12 529 1 HIS K 366 ? ? -93.09 40.21 530 1 LEU K 369 ? ? -131.34 -130.36 531 1 ASN K 478 ? ? 56.31 78.86 532 1 HIS K 483 ? ? -135.53 -36.31 533 1 PRO K 530 ? ? -65.17 -86.22 534 1 PHE K 537 ? ? -113.79 78.86 535 1 ASN K 563 ? ? 56.74 77.79 536 1 ASN K 568 ? ? -91.67 34.16 537 1 MET K 569 ? ? -158.11 -46.65 538 1 ASP K 577 ? ? -154.22 84.51 539 1 TYR K 581 ? ? -90.69 51.33 540 1 GLU K 582 ? ? -94.99 -70.64 541 1 ASN K 601 ? ? 57.37 83.16 542 1 MET K 640 ? ? -156.67 11.38 543 1 PRO K 654 ? ? -85.12 -117.09 544 1 LEU K 658 ? ? -107.44 -62.41 545 1 PRO K 661 ? ? -62.28 95.03 546 1 THR K 666 ? ? -110.79 -154.59 547 1 SER K 669 ? ? -92.24 54.92 548 1 ALA K 684 ? ? -150.15 -1.13 549 1 PHE K 689 ? ? -109.61 49.41 550 1 GLN K 699 ? ? -97.12 -141.90 551 1 ASN L 2 ? ? -160.84 41.91 552 1 ASN L 8 ? ? 68.63 109.66 553 1 ASN L 30 ? ? 58.64 80.02 554 1 ASN L 37 ? ? -94.78 -91.04 555 1 CYS L 53 ? ? -146.22 16.80 556 1 ASP L 60 ? ? -95.21 49.95 557 1 LYS L 61 ? ? -152.48 -46.65 558 1 MET L 73 ? ? -105.38 -67.63 559 1 ASN L 84 ? ? -122.71 -161.49 560 1 ASP L 95 ? ? -99.04 45.30 561 1 TYR L 105 ? ? -115.53 75.96 562 1 SER L 181 ? ? -106.33 -141.29 563 1 ASN L 209 ? ? 56.62 74.10 564 1 ASN L 218 ? ? -155.18 31.39 565 1 ALA L 232 ? 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? -155.32 11.68 596 1 PRO L 654 ? ? -82.14 -99.46 597 1 THR L 666 ? ? -104.25 -145.59 598 1 SER L 669 ? ? -94.30 49.97 599 1 ALA L 684 ? ? -153.87 -17.75 600 1 PHE L 689 ? ? -105.45 52.01 601 1 GLN L 699 ? ? -96.91 -148.75 602 1 ASN M 2 ? ? -160.44 41.71 603 1 ASN M 8 ? ? 70.19 125.97 604 1 ASN M 30 ? ? 58.54 80.07 605 1 ASN M 37 ? ? -93.82 -92.51 606 1 CYS M 53 ? ? -144.08 12.49 607 1 ASP M 60 ? ? -95.47 47.40 608 1 LYS M 61 ? ? -148.92 -46.13 609 1 MET M 73 ? ? -100.64 -77.57 610 1 ASN M 84 ? ? -126.26 -157.35 611 1 ASP M 95 ? ? -97.36 45.61 612 1 PHE M 171 ? ? -73.18 -77.04 613 1 SER M 181 ? ? -107.20 -157.30 614 1 ASN M 209 ? ? 57.46 76.83 615 1 THR M 217 ? ? -107.73 43.29 616 1 ASN M 218 ? ? -154.80 30.02 617 1 MET M 229 ? ? -99.95 46.86 618 1 TYR M 230 ? ? -148.08 -36.32 619 1 ALA M 232 ? ? -151.04 84.41 620 1 SER M 236 ? ? -90.08 -147.29 621 1 ASN M 267 ? ? -115.29 -150.47 622 1 ASN M 294 ? ? 56.65 70.10 623 1 THR M 296 ? ? -106.38 -152.65 624 1 TYR M 313 ? ? -100.12 -151.93 625 1 LYS M 320 ? 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? 57.38 76.83 716 1 ASN O 218 ? ? -141.45 37.03 717 1 TYR O 230 ? ? -127.44 -51.74 718 1 ALA O 232 ? ? -152.12 86.06 719 1 SER O 236 ? ? -110.45 -149.99 720 1 ASN O 267 ? ? -112.81 -149.88 721 1 THR O 296 ? ? -108.99 -153.31 722 1 THR O 307 ? ? -78.40 -168.22 723 1 TRP O 333 ? ? -142.21 -1.25 724 1 PRO O 335 ? ? -87.12 40.23 725 1 ASN O 338 ? ? -165.27 -35.45 726 1 PHE O 339 ? ? -87.51 30.42 727 1 THR O 362 ? ? -119.04 79.14 728 1 HIS O 366 ? ? -90.61 38.66 729 1 ASN O 478 ? ? 55.56 70.02 730 1 HIS O 483 ? ? -134.14 -34.83 731 1 THR O 503 ? ? -93.22 -157.74 732 1 PRO O 530 ? ? -65.28 -88.09 733 1 TYR O 531 ? ? -142.44 56.53 734 1 ASN O 563 ? ? 56.74 76.21 735 1 ASN O 568 ? ? -91.41 31.37 736 1 MET O 569 ? ? -155.76 -46.48 737 1 ASP O 577 ? ? -153.14 84.01 738 1 TYR O 581 ? ? -90.86 37.38 739 1 GLU O 582 ? ? -83.63 -72.29 740 1 ASN O 583 ? ? -92.91 59.86 741 1 ASN O 601 ? ? 57.30 82.99 742 1 MET O 640 ? ? -148.95 13.65 743 1 PRO O 654 ? ? -84.08 -112.51 744 1 LEU O 658 ? ? -107.83 -62.65 745 1 THR O 666 ? 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? -115.54 77.92 806 1 GLU Q 142 ? ? -132.60 -41.63 807 1 SER Q 181 ? ? -106.89 -146.62 808 1 ASN Q 209 ? ? 56.57 75.42 809 1 THR Q 217 ? ? -105.56 41.42 810 1 ASN Q 218 ? ? -150.47 32.14 811 1 ALA Q 232 ? ? -152.69 83.69 812 1 SER Q 236 ? ? -93.19 -142.77 813 1 ASN Q 267 ? ? -112.63 -150.79 814 1 ASN Q 294 ? ? 56.63 72.23 815 1 THR Q 296 ? ? -107.14 -152.86 816 1 TYR Q 313 ? ? -98.77 -145.47 817 1 ASP Q 323 ? ? -103.91 70.34 818 1 PRO Q 335 ? ? -84.31 44.15 819 1 TYR Q 336 ? ? -155.14 16.58 820 1 THR Q 337 ? ? -79.52 45.71 821 1 ASN Q 338 ? ? -160.39 29.45 822 1 PHE Q 339 ? ? -142.04 22.59 823 1 HIS Q 366 ? ? -92.99 39.01 824 1 LEU Q 369 ? ? -131.40 -134.62 825 1 ALA Q 370 ? ? -154.22 89.12 826 1 TRP Q 454 ? ? -69.27 81.59 827 1 ASP Q 460 ? ? -84.91 47.96 828 1 HIS Q 483 ? ? -147.91 -29.85 829 1 SER Q 505 ? ? -123.15 -161.11 830 1 PRO Q 530 ? ? -66.09 -90.76 831 1 TYR Q 531 ? ? -144.53 51.33 832 1 PHE Q 537 ? ? -112.59 76.64 833 1 ASN Q 563 ? ? 56.63 76.27 834 1 MET Q 569 ? ? -153.81 -45.01 835 1 ASP Q 577 ? ? -152.66 83.94 836 1 TYR Q 581 ? ? -88.12 44.50 837 1 GLU Q 582 ? ? -90.55 -72.35 838 1 ASN Q 601 ? ? 57.09 80.96 839 1 MET Q 631 ? ? -96.62 44.38 840 1 MET Q 640 ? ? -155.38 11.51 841 1 PRO Q 654 ? ? -82.52 -100.39 842 1 THR Q 666 ? ? -103.79 -145.61 843 1 SER Q 669 ? ? -95.60 50.49 844 1 ALA Q 684 ? ? -154.12 -18.19 845 1 PHE Q 689 ? ? -105.17 52.30 846 1 GLN Q 699 ? ? -94.85 -139.19 847 1 ASN R 2 ? ? -160.68 43.39 848 1 ASN R 8 ? ? 70.39 132.27 849 1 ASN R 30 ? ? 58.50 80.81 850 1 ASN R 37 ? ? -93.56 -92.94 851 1 CYS R 53 ? ? -145.93 19.34 852 1 ASP R 60 ? ? -95.97 46.83 853 1 LYS R 61 ? ? -148.50 -46.69 854 1 MET R 73 ? ? -103.61 -77.54 855 1 ASN R 84 ? ? -127.28 -161.39 856 1 ASP R 95 ? ? -96.80 43.74 857 1 TYR R 105 ? ? -110.76 52.58 858 1 PHE R 171 ? ? -75.64 -88.37 859 1 SER R 181 ? ? -88.71 -149.96 860 1 ASN R 209 ? ? 57.29 76.11 861 1 ASN R 218 ? ? -149.95 38.95 862 1 TYR R 230 ? ? -102.32 -66.00 863 1 SER R 231 ? ? -89.29 38.10 864 1 ALA R 232 ? ? -153.50 82.90 865 1 ALA R 234 ? ? -69.45 88.72 866 1 SER R 236 ? ? -132.33 -149.56 867 1 LEU R 239 ? ? -114.62 72.37 868 1 ASN R 267 ? ? -116.60 -151.45 869 1 ASN R 294 ? ? 57.26 73.22 870 1 THR R 296 ? ? -109.18 -164.47 871 1 TYR R 313 ? ? -97.08 -154.87 872 1 SER R 326 ? ? -153.37 79.74 873 1 SER R 331 ? ? -92.04 45.35 874 1 PRO R 335 ? ? -84.63 48.85 875 1 TYR R 336 ? ? -157.06 10.70 876 1 ASN R 338 ? ? -163.96 -40.00 877 1 PHE R 339 ? ? -84.65 30.69 878 1 THR R 362 ? ? -114.36 75.38 879 1 HIS R 366 ? ? -94.69 44.35 880 1 LYS R 367 ? ? -123.20 -59.90 881 1 LEU R 369 ? ? -131.43 -130.96 882 1 VAL R 384 ? ? -128.43 -157.93 883 1 GLU R 386 ? ? -142.21 -41.32 884 1 ASN R 478 ? ? 57.67 82.04 885 1 HIS R 483 ? ? -133.75 -42.85 886 1 LYS R 490 ? ? -110.85 76.98 887 1 SER R 505 ? ? -114.64 -168.47 888 1 PRO R 530 ? ? -65.27 -87.70 889 1 TYR R 531 ? ? -142.03 49.45 890 1 PHE R 537 ? ? -113.26 73.09 891 1 SER R 538 ? ? -95.60 -157.39 892 1 ASN R 563 ? ? 56.80 77.28 893 1 ASN R 568 ? ? -91.74 32.25 894 1 MET R 569 ? ? -155.44 -48.45 895 1 ASP R 577 ? ? -153.46 84.32 896 1 TYR R 581 ? ? -92.51 46.01 897 1 GLU R 582 ? ? -91.15 -71.75 898 1 ASN R 583 ? ? -91.22 43.46 899 1 ASN R 601 ? ? 57.77 84.39 900 1 PRO R 654 ? ? -82.07 -107.84 901 1 LEU R 658 ? ? -103.67 -60.34 902 1 THR R 666 ? ? -119.27 -135.88 903 1 SER R 669 ? ? -108.91 46.78 904 1 ALA R 684 ? ? -154.93 -15.75 905 1 PHE R 689 ? ? -106.93 52.70 906 1 GLN R 699 ? ? -93.85 -109.07 907 1 ALA R 700 ? ? -154.94 -9.34 908 1 ASN S 2 ? ? -160.15 43.03 909 1 ASN S 8 ? ? 69.96 120.82 910 1 ASN S 30 ? ? 58.61 80.09 911 1 ASN S 37 ? ? -96.65 -93.44 912 1 ASP S 60 ? ? -95.37 49.89 913 1 LYS S 61 ? ? -151.54 -43.96 914 1 MET S 73 ? ? -101.09 -77.24 915 1 ASN S 84 ? ? -114.62 -164.37 916 1 ASP S 95 ? ? -95.77 46.94 917 1 PHE S 147 ? ? 57.60 73.42 918 1 PRO S 150 ? ? -75.56 -168.55 919 1 PHE S 171 ? ? -74.42 -76.11 920 1 SER S 181 ? ? -105.82 -148.96 921 1 ASN S 209 ? ? 56.44 76.08 922 1 ASN S 218 ? ? -152.05 37.16 923 1 ALA S 232 ? ? -153.73 84.21 924 1 SER S 236 ? ? -101.05 -147.36 925 1 ASN S 267 ? ? -116.55 -150.97 926 1 THR S 296 ? ? -105.86 -153.63 927 1 THR S 307 ? ? -78.60 -169.75 928 1 TYR S 313 ? ? -108.45 -166.96 929 1 PRO S 335 ? ? -86.08 41.52 930 1 TYR S 336 ? ? -152.23 11.65 931 1 ASN S 338 ? ? -163.26 -39.56 932 1 PHE S 339 ? ? -87.36 30.41 933 1 THR S 362 ? ? -113.08 71.36 934 1 LEU S 369 ? ? -135.52 -127.22 935 1 TRP S 454 ? ? -69.88 82.11 936 1 ASN S 478 ? ? 57.57 79.44 937 1 HIS S 483 ? ? -135.29 -34.04 938 1 SER S 505 ? ? -131.92 -157.14 939 1 PRO S 530 ? ? -65.59 -88.99 940 1 TYR S 531 ? ? -143.83 53.38 941 1 PHE S 537 ? ? -111.25 64.57 942 1 SER S 538 ? ? -89.18 -156.60 943 1 ASP S 542 ? ? -88.87 -158.23 944 1 ASN S 563 ? ? 56.79 76.37 945 1 ASN S 568 ? ? -92.41 34.58 946 1 MET S 569 ? ? -158.21 -46.10 947 1 ASP S 577 ? ? -152.09 84.11 948 1 TYR S 581 ? ? -89.23 41.70 949 1 GLU S 582 ? ? -87.62 -73.24 950 1 ASN S 601 ? ? 57.25 82.26 951 1 MET S 640 ? ? -152.44 13.03 952 1 PRO S 654 ? ? -81.82 -98.06 953 1 PRO S 661 ? ? -62.59 98.67 954 1 THR S 666 ? ? -107.69 -156.85 955 1 SER S 669 ? ? -93.29 54.04 956 1 ALA S 684 ? ? -153.93 -18.93 957 1 PHE S 689 ? ? -102.80 54.22 958 1 GLN S 699 ? ? -97.51 -150.69 959 1 ASN T 2 ? ? -160.45 41.21 960 1 ASN T 8 ? ? 69.15 114.87 961 1 ASN T 30 ? ? 58.57 80.23 962 1 ASN T 37 ? ? -92.74 -92.30 963 1 ASP T 60 ? ? -95.75 48.52 964 1 LYS T 61 ? ? -149.95 -45.27 965 1 MET T 73 ? ? -91.99 -81.35 966 1 TYR T 80 ? ? -107.12 53.90 967 1 ASN T 84 ? ? -122.87 -164.45 968 1 ASP T 95 ? ? -103.28 46.09 969 1 TYR T 105 ? ? -117.75 73.44 970 1 SER T 181 ? ? -89.39 -148.58 971 1 ASN T 209 ? ? 57.29 76.99 972 1 THR T 217 ? ? -108.70 46.37 973 1 ASN T 218 ? ? -154.87 22.20 974 1 MET T 229 ? ? -100.45 41.53 975 1 TYR T 230 ? ? -140.34 -37.19 976 1 SER T 236 ? ? -89.81 -143.23 977 1 ASN T 267 ? ? -111.71 -149.02 978 1 ASN T 294 ? ? 56.68 70.81 979 1 THR T 296 ? ? -106.69 -153.10 980 1 THR T 307 ? ? -79.04 -165.45 981 1 TRP T 333 ? ? -142.63 -2.65 982 1 PRO T 335 ? ? -86.03 46.57 983 1 TYR T 336 ? ? -155.78 3.05 984 1 ASN T 338 ? ? -165.29 -40.98 985 1 HIS T 366 ? ? -93.37 36.09 986 1 LEU T 369 ? ? -130.56 -131.38 987 1 ALA T 370 ? ? -157.05 89.27 988 1 ASN T 478 ? ? 55.59 70.31 989 1 HIS T 483 ? ? -133.64 -35.71 990 1 THR T 503 ? ? -93.76 -157.94 991 1 PRO T 530 ? ? -65.66 -89.48 992 1 TYR T 531 ? ? -143.56 57.26 993 1 ASN T 563 ? ? 56.79 76.43 994 1 ASN T 568 ? ? -91.88 35.41 995 1 MET T 569 ? ? -159.21 -46.18 996 1 ASP T 577 ? ? -153.29 84.02 997 1 TYR T 581 ? ? -91.05 36.40 998 1 GLU T 582 ? ? -82.76 -72.61 999 1 ASN T 601 ? ? 57.37 83.10 1000 1 MET T 631 ? ? -91.82 43.75 1001 1 MET T 640 ? ? -149.40 13.25 1002 1 PRO T 654 ? ? -81.17 -82.71 1003 1 LEU T 658 ? ? -102.66 -61.16 1004 1 THR T 666 ? ? -105.63 -149.56 1005 1 SER T 669 ? ? -95.51 53.09 1006 1 ALA T 684 ? ? -151.14 12.66 1007 1 PHE T 689 ? ? -108.35 46.49 1008 1 GLN T 699 ? ? -97.55 -145.37 1009 1 ALA U 51 ? ? 58.04 82.47 1010 1 PHE U 63 ? ? -107.51 -161.58 1011 1 THR U 101 ? ? -96.93 48.37 1012 1 TYR U 104 ? ? -144.67 -85.19 1013 1 LEU U 105 ? ? -143.31 -45.74 1014 1 LYS U 118 ? ? -149.52 13.19 1015 1 ALA U 140 ? ? -84.08 -74.80 1016 1 SER U 154 ? ? -154.77 -141.15 1017 1 ASN U 155 ? ? -151.24 -51.44 1018 1 LEU U 172 ? ? -101.06 -69.43 1019 1 THR U 191 ? ? -98.05 33.92 1020 1 ALA U 306 ? ? -67.26 -72.51 1021 1 TRP U 307 ? ? -94.66 36.01 1022 1 ALA U 335 ? ? -90.48 -155.22 1023 1 PRO U 354 ? ? -74.08 -104.66 1024 1 THR U 361 ? ? -114.31 59.38 1025 1 GLN U 367 ? ? -82.12 -86.62 1026 1 SER U 392 ? ? -93.58 -76.76 1027 1 ASN U 411 ? ? -100.34 67.51 1028 1 ASP U 424 ? ? -125.64 -153.79 1029 1 SER U 465 ? ? -87.29 38.86 1030 1 GLU U 466 ? ? -153.56 -30.37 1031 1 ALA V 51 ? ? 57.90 75.86 1032 1 THR V 101 ? ? -96.96 40.92 1033 1 TYR V 104 ? ? -144.12 -88.74 1034 1 LEU V 105 ? ? -141.24 -45.39 1035 1 LYS V 118 ? ? -153.28 15.10 1036 1 ALA V 140 ? ? -86.73 -81.03 1037 1 SER V 154 ? ? -156.45 -136.72 1038 1 ASN V 155 ? ? -154.82 -54.56 1039 1 LEU V 172 ? ? -85.30 -70.44 1040 1 THR V 191 ? ? -118.15 69.01 1041 1 ALA V 306 ? ? -67.41 -84.17 1042 1 TRP V 307 ? ? -88.30 35.09 1043 1 GLN V 330 ? 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Dataset expansion (C5) resulted in a dataset containing 59330 particles.' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 18902 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? EMAN2 ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Latitude ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? iMODFIT ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.0 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.0 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION 2.0 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION 2.0 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.98 _em_specimen.details 'Concentrations of LdcI and RavA were 0.38 mg/ml (4.67 microM) and 0.6 mg/ml (10.64 microM) respectively.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'European Union' France 647784 1 'Grenoble Instruct-ERIC Center' France 'UMS 3518 CNRS-CEA-UJF-EMBL' 2 'French Infrastructure for Integrated Structural Biology' France ANR-10-INSB-05-02 3 'European Molecular Biology Organization' France ALTF441-2017 4 # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 3 "PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE" PLP 4 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #