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no ;MKLHELKPAEGSRKERNRVGRGVATGNGKTSGRGHKGQKARSGGGVRPGFEGGQLPLFRRLPKRGFTNINRKEYAIVNLD QLNKFEDGTEVTPALLVESGVVKNEKSGIKILGNGSLDKKLTVKAHKFSASAAEAIDAKGGAHEVI ; ;MKLHELKPAEGSRKERNRVGRGVATGNGKTSGRGHKGQKARSGGGVRPGFEGGQLPLFRRLPKRGFTNINRKEYAIVNLD QLNKFEDGTEVTPALLVESGVVKNEKSGIKILGNGSLDKKLTVKAHKFSASAAEAIDAKGGAHEVI ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MLLPKRVKYRRQHRPKTTGRSKGGNYVTFGEFGLQATTTSWITSRQIESARIAMTRYMKRGGKVWIKIFPHTPYTKKPLE VRMGAGKGAVEGWIAVVKPGRILFEVAGVSEEVAREALRLASHKLPVKTKFVKREEL ; ;MLLPKRVKYRRQHRPKTTGRSKGGNYVTFGEFGLQATTTSWITSRQIESARIAMTRYMKRGGKVWIKIFPHTPYTKKPLE VRMGAGKGAVEGWIAVVKPGRILFEVAGVSEEVAREALRLASHKLPVKTKFVKREEL ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;YRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTAL QKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV ; ;YRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTAL QKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MISKIDKNKVRLKRHARVRTNLSGTAEKPRLNVYRSNKHIYAQIIDDNKGVTLAQASSKDSDIATTATKVELATKVGEAI AKKAADKGIKEIVFDRGGYLYHGRVKALAEAARESGLEF ; ;MISKIDKNKVRLKRHARVRTNLSGTAEKPRLNVYRSNKHIYAQIIDDNKGVTLAQASSKDSDIATTATKVELATKVGEAI AKKAADKGIKEIVFDRGGYLYHGRVKALAEAARESGLEF ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;TNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTP KIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEI ; ;TNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTP KIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEI ; N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;PRVKGGTVTRARRKKTIKLAKGYFGSKHTLYKVAKQQVMKSGQYAFRDRRQRKRDFRKLWITRINAAARQHEMSYSRLMN GLKKAGIDINRKMLSEIAISDEKAFAQLVTKAKDAL ; ;PRVKGGTVTRARRKKTIKLAKGYFGSKHTLYKVAKQQVMKSGQYAFRDRRQRKRDFRKLWITRINAAARQHEMSYSRLMN GLKKAGIDINRKMLSEIAISDEKAFAQLVTKAKDAL ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MFAIIETGGKQIKVEEGQEIFVEKLDVNEGDTFTFDKVLFVGGDSVKVGAPTVEGATVTATVNKQGRGKKITVFTYKRRK NSKRKKGHRQPYTKLTIDKINA ; ;MFAIIETGGKQIKVEEGQEIFVEKLDVNEGDTFTFDKVLFVGGDSVKVGAPTVEGATVTATVNKQGRGKKITVFTYKRRK NSKRKKGHRQPYTKLTIDKINA ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAVARTIRIAPRKVRLVLDLIRGKNAAEAIAILKLTNKASSPVIEKVLMSALANAEHNYDMNTDELVVKEAYANEGP TLKRFRPQGRASAINKRTSHITIVVSDGKE ; ;MEAKAVARTIRIAPRKVRLVLDLIRGKNAAEAIAILKLTNKASSPVIEKVLMSALANAEHNYDMNTDELVVKEAYANEGP TLKRFRPQGRASAINKRTSHITIVVSDGKE ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;EARDILKRPVITEKSSEAMAEDKYTFDVDTRVNKTQVKMAVEEIFNVKVASVNIMNYKPKKKRMGRYQGYTNKRRKAIVT LKEGSIDLF ; ;EARDILKRPVITEKSSEAMAEDKYTFDVDTRVNKTQVKMAVEEIFNVKVASVNIMNYKPKKKRMGRYQGYTNKRRKAIVT LKEGSIDLF ; R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;HIKKGDNVKVIAGKDKGKEGKVIATLPKKDRVVVEGVNIMKKHQKPTQLNPEGGILETEAAIHVSNVQLLDPKTNEPTRV GYKFVDGKKVRIAKKSGEEIKSN ; ;HIKKGDNVKVIAGKDKGKEGKVIATLPKKDRVVVEGVNIMKKHQKPTQLNPEGGILETEAAIHVSNVQLLDPKTNEPTRV GYKFVDGKKVRIAKKSGEEIKSN ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;ASLKSIIRQGKQTRSDLKQLRKSGKVPAVVYGYGTKNVSVKVDEVEFIKVIREVGRNGVIELGVGSKTIKVMVADYQFDP LKNQITHIDFLAIN ; ;ASLKSIIRQGKQTRSDLKQLRKSGKVPAVVYGYGTKNVSVKVDEVEFIKVIREVGRNGVIELGVGSKTIKVMVADYQFDP LKNQITHIDFLAIN ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no ;KKGVSSTKNGRDSESKRLGAKRADGQFVTGGSILYRQRGTKIYPGENVGRGGDDTLFAKIDGVVKFERKGRDKKQVSVYA VA ; ;KKGVSSTKNGRDSESKRLGAKRADGQFVTGGSILYRQRGTKIYPGENVGRGGDDTLFAKIDGVVKFERKGRDKKQVSVYA VA ; U ? 22 'polypeptide(L)' no no KQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVT KQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVT V ? 23 'polypeptide(L)' no no KAKEIRDLTTSEIEEQIKSSKEELFNLRFQLATGQLEETARIRTVRKTIARLKTVAREREIEQSKAN KAKEIRDLTTSEIEEQIKSSKEELFNLRFQLATGQLEETARIRTVRKTIARLKTVAREREIEQSKAN W ? 24 'polypeptide(L)' no no AKLQITLTRSVIGRPETQRKTVEALGLKKTNSSVVVEDNPAIRGQINKVKHLVTVEEK AKLQITLTRSVIGRPETQRKTVEALGLKKTNSSVVVEDNPAIRGQINKVKHLVTVEEK X ? 25 'polypeptide(L)' no no MKQGIHPEYHQVIFLDTTTNFKFLSGSTKTSSEMMEWEDGKEYPVIRLDISSDSHPFYT MKQGIHPEYHQVIFLDTTTNFKFLSGSTKTSSEMMEWEDGKEYPVIRLDISSDSHPFYT Y ? 26 'polypeptide(L)' no no AVPKRRTSKTRKNKRRTHFKISVPGMTECPNCGEYKLSHRVCKNCGSY AVPKRRTSKTRKNKRRTHFKISVPGMTECPNCGEYKLSHRVCKNCGSY Z ? 27 'polypeptide(L)' no no RVNVTLACTECGDRNYITTKNKRNNPERIEMKKYCPRLNKYTLHRET RVNVTLACTECGDRNYITTKNKRNNPERIEMKKYCPRLNKYTLHRET 1 ? 28 'polypeptide(L)' no no VKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLS VKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLS 2 ? 29 'polypeptide(L)' no no PKMKTHRGAAKRVKRTASGQLKRSRAFTSHLFANKSTKQKRQLRKARLVSKSDMKRVKQLLAYK PKMKTHRGAAKRVKRTASGQLKRSRAFTSHLFANKSTKQKRQLRKARLVSKSDMKRVKQLLAYK 3 ? 30 'polypeptide(L)' no no MKVRPSVKPICEKCKVIKRKGKVMVICENPKHKQRQG MKVRPSVKPICEKCKVIKRKGKVMVICENPKHKQRQG 4 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 U n 1 3 A n 1 4 A n 1 5 G n 1 6 U n 1 7 U n 1 8 A n 1 9 U n 1 10 U n 1 11 A n 1 12 A n 1 13 G n 1 14 G n 1 15 G n 1 16 C n 1 17 G n 1 18 C n 1 19 A n 1 20 C n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 U n 1 24 G n 1 25 G n 1 26 A n 1 27 U n 1 28 G n 1 29 C n 1 30 C n 1 31 U n 1 32 U n 1 33 G n 1 34 G n 1 35 C n 1 36 A n 1 37 C n 1 38 U n 1 39 A n 1 40 G n 1 41 A n 1 42 A n 1 43 G n 1 44 C n 1 45 C n 1 46 G n 1 47 A n 1 48 U n 1 49 G n 1 50 A n 1 51 A n 1 52 G n 1 53 G n 1 54 A n 1 55 C n 1 56 G n 1 57 U n 1 58 U n 1 59 A n 1 60 C n 1 61 U n 1 62 A n 1 63 A n 1 64 C n 1 65 G n 1 66 A n 1 67 C n 1 68 G n 1 69 A n 1 70 U n 1 71 A n 1 72 U n 1 73 G n 1 74 C n 1 75 U n 1 76 U n 1 77 U n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 G n 1 81 G n 1 82 A n 1 83 G n 1 84 C n 1 85 U n 1 86 G n 1 87 U n 1 88 A n 1 89 A n 1 90 G n 1 91 U n 1 92 A n 1 93 A n 1 94 G n 1 95 C n 1 96 U n 1 97 U n 1 98 U n 1 99 G n 1 100 A n 1 101 U n 1 102 C n 1 103 C n 1 104 A n 1 105 G n 1 106 A n 1 107 G n 1 108 A n 1 109 U n 1 110 U n 1 111 U n 1 112 C n 1 113 C n 1 114 G n 1 115 A n 1 116 A n 1 117 U n 1 118 G n 1 119 G n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 A n 1 123 A n 1 124 A n 1 125 C n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 A n 1 129 G n 1 130 C n 1 131 A n 1 132 U n 1 133 G n 1 134 A n 1 135 G n 1 136 U n 1 137 U n 1 138 A n 1 139 U n 1 140 G n 1 141 U n 1 142 C n 1 143 A n 1 144 U n 1 145 G n 1 146 U n 1 147 U n 1 148 A n 1 149 U n 1 150 C n 1 151 G n 1 152 A n 1 153 U n 1 154 A n 1 155 U n 1 156 G n 1 157 U n 1 158 G n 1 159 A n 1 160 A n 1 161 U n 1 162 A n 1 163 C n 1 164 A n 1 165 U n 1 166 A n 1 167 G n 1 168 C n 1 169 A n 1 170 U n 1 171 A n 1 172 U n 1 173 C n 1 174 A n 1 175 G n 1 176 A n 1 177 A n 1 178 G n 1 179 G n 1 180 C n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 A n 1 184 C n 1 185 C n 1 186 C n 1 187 G n 1 188 G n 1 189 A n 1 190 G n 1 191 A n 1 192 A n 1 193 C n 1 194 U n 1 195 G n 1 196 A n 1 197 A n 1 198 A n 1 199 C n 1 200 A n 1 201 U n 1 202 C n 1 203 U n 1 204 U n 1 205 A n 1 206 G n 1 207 U n 1 208 A n 1 209 C n 1 210 C n 1 211 C n 1 212 G n 1 213 G n 1 214 A n 1 215 G n 1 216 G n 1 217 A n 1 218 A n 1 219 G n 1 220 A n 1 221 G n 1 222 A n 1 223 A n 1 224 A n 1 225 G n 1 226 A n 1 227 A n 1 228 A n 1 229 A n 1 230 U n 1 231 U n 1 232 C n 1 233 G n 1 234 A n 1 235 U n 1 236 U n 1 237 C n 1 238 C n 1 239 C n 1 240 U n 1 241 U n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 U n 1 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345 U n 1 346 G n 1 347 G n 1 348 A n 1 349 A n 1 350 A n 1 351 G n 1 352 A n 1 353 U n 1 354 G n 1 355 A n 1 356 A n 1 357 U n 1 358 C n 1 359 A n 1 360 A n 1 361 A n 1 362 G n 1 363 A n 1 364 A n 1 365 G n 1 366 G n 1 367 U n 1 368 A n 1 369 A n 1 370 U n 1 371 A n 1 372 A n 1 373 U n 1 374 C n 1 375 C n 1 376 U n 1 377 G n 1 378 U n 1 379 A n 1 380 G n 1 381 U n 1 382 C n 1 383 G n 1 384 A n 1 385 A n 1 386 A n 1 387 A n 1 388 U n 1 389 G n 1 390 U n 1 391 U n 1 392 G n 1 393 U n 1 394 C n 1 395 U n 1 396 C n 1 397 U n 1 398 C n 1 399 U n 1 400 U n 1 401 G n 1 402 A n 1 403 G n 1 404 U n 1 405 G n 1 406 G n 1 407 A n 1 408 U n 1 409 C n 1 410 C n 1 411 U n 1 412 G n 1 413 A n 1 414 G n 1 415 U n 1 416 A n 1 417 C n 1 418 G n 1 419 A n 1 420 C n 1 421 G n 1 422 G n 1 423 A n 1 424 G n 1 425 C n 1 426 A n 1 427 C n 1 428 G n 1 429 U n 1 430 G n 1 431 A n 1 432 A n 1 433 A n 1 434 U n 1 435 U n 1 436 C n 1 437 C n 1 438 G n 1 439 U n 1 440 C n 1 441 G n 1 442 G n 1 443 A n 1 444 A n 1 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24 AKLQITLTRSVIGRPETQRKTVEALGLKKTNSSVVVEDNPAIRGQINKVKHLVTVEEK 2 25 UNP A0A380EL30_STAAU A0A380EL30 ? 25 MKQGIHPEYHQVIFLDTTTNFKFLSGSTKTSSEMMEWEDGKEYPVIRLDISSDSHPFYT 1 26 UNP A0A1Q8DAT0_STAAU A0A1Q8DAT0 ? 26 AVPKRRTSKTRKNKRRTHFKISVPGMTECPNCGEYKLSHRVCKNCGSY 2 27 UNP A0A077V2P0_STAAU A0A077V2P0 ? 27 RVNVTLACTECGDRNYITTKNKRNNPERIEMKKYCPRLNKYTLHRET 2 28 UNP W8TQ59_STAAU W8TQ59 ? 28 VKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLS 2 29 UNP A0A077UL47_STAAU A0A077UL47 ? 29 PKMKTHRGAAKRVKRTASGQLKRSRAFTSHLFANKSTKQKRQLRKARLVSKSDMKRVKQLLAYK 2 30 UNP A0A077UGV8_STAAU A0A077UGV8 ? 30 MKVRPSVKPICEKCKVIKRKGKVMVICENPKHKQRQG 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6S12 A 1 ? 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UNP A0A077UKF9 ALA 89 deletion ? 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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N2 A G 575 ? ? 108.95 116.20 -7.25 0.90 N 91 1 N3 A G 575 ? ? C2 A G 575 ? ? N2 A G 575 ? ? 124.98 119.90 5.08 0.70 N 92 1 C4 A G 575 ? ? N9 A G 575 ? ? "C1'" A G 575 ? ? 134.48 126.50 7.98 1.30 N 93 1 C2 A U 576 ? ? N1 A U 576 ? ? "C1'" A U 576 ? ? 125.47 117.70 7.77 1.20 N 94 1 C2 A G 602 ? ? N3 A G 602 ? ? C4 A G 602 ? ? 108.83 111.90 -3.07 0.50 N 95 1 N3 A C 608 ? ? C4 A C 608 ? ? C5 A C 608 ? ? 124.60 121.90 2.70 0.40 N 96 1 C5 A C 608 ? ? C4 A C 608 ? ? N4 A C 608 ? ? 113.92 120.20 -6.28 0.70 N 97 1 N1 A C 623 ? ? C2 A C 623 ? ? O2 A C 623 ? ? 123.91 118.90 5.01 0.60 N 98 1 N3 A C 623 ? ? C2 A C 623 ? ? O2 A C 623 ? ? 117.27 121.90 -4.63 0.70 N 99 1 C5 A C 627 ? ? C4 A C 627 ? ? N4 A C 627 ? ? 115.90 120.20 -4.30 0.70 N 100 1 "O4'" A G 630 ? ? "C1'" A G 630 ? ? N9 A G 630 ? ? 112.72 108.50 4.22 0.70 N 101 1 C4 A A 636 ? ? C5 A A 636 ? ? N7 A A 636 ? ? 114.24 110.70 3.54 0.50 N 102 1 C5 A A 636 ? ? N7 A A 636 ? ? C8 A A 636 ? ? 100.38 103.90 -3.52 0.50 N 103 1 N1 A A 636 ? ? C6 A A 636 ? ? N6 A A 636 ? ? 122.91 118.60 4.31 0.60 N 104 1 C5 A A 636 ? ? C6 A A 636 ? ? N6 A A 636 ? ? 117.94 123.70 -5.76 0.80 N 105 1 C2 A G 640 ? ? N3 A G 640 ? ? C4 A G 640 ? ? 108.48 111.90 -3.42 0.50 N 106 1 N1 A A 652 ? ? C6 A A 652 ? ? N6 A A 652 ? ? 122.56 118.60 3.96 0.60 N 107 1 N9 A A 655 ? ? C4 A A 655 ? ? C5 A A 655 ? ? 103.14 105.80 -2.66 0.40 N 108 1 C6 A G 679 ? ? C5 A G 679 ? ? N7 A G 679 ? ? 126.62 130.40 -3.78 0.60 N 109 1 N1 A C 685 ? ? C2 A C 685 ? ? O2 A C 685 ? ? 122.67 118.90 3.77 0.60 N 110 1 N1 A C 717 ? ? C2 A C 717 ? ? O2 A C 717 ? ? 123.02 118.90 4.12 0.60 N 111 1 C4 A A 721 ? ? C5 A A 721 ? ? N7 A A 721 ? ? 114.44 110.70 3.74 0.50 N 112 1 C5 A A 721 ? ? N7 A A 721 ? ? C8 A A 721 ? ? 100.01 103.90 -3.89 0.50 N 113 1 N7 A A 721 ? ? C8 A A 721 ? ? N9 A A 721 ? ? 117.16 113.80 3.36 0.50 N 114 1 C6 A A 721 ? ? C5 A A 721 ? ? N7 A A 721 ? ? 127.59 132.30 -4.71 0.70 N 115 1 N1 A A 721 ? ? C6 A A 721 ? ? N6 A A 721 ? ? 122.94 118.60 4.34 0.60 N 116 1 C5 A A 721 ? ? C6 A A 721 ? ? N6 A A 721 ? ? 118.13 123.70 -5.57 0.80 N 117 1 C5 A C 723 ? ? C4 A C 723 ? ? N4 A C 723 ? ? 115.94 120.20 -4.26 0.70 N 118 1 C6 A C 724 ? ? N1 A C 724 ? ? C2 A C 724 ? ? 117.83 120.30 -2.47 0.40 N 119 1 C5 A A 725 ? ? C6 A A 725 ? ? N6 A A 725 ? ? 118.49 123.70 -5.21 0.80 N 120 1 N1 A C 735 ? ? C2 A C 735 ? ? O2 A C 735 ? ? 122.82 118.90 3.92 0.60 N 121 1 N3 A C 735 ? ? C2 A C 735 ? ? O2 A C 735 ? ? 116.81 121.90 -5.09 0.70 N 122 1 C5 A C 737 ? ? C4 A C 737 ? ? N4 A C 737 ? ? 115.86 120.20 -4.34 0.70 N 123 1 C2 A G 740 ? ? N3 A G 740 ? ? C4 A G 740 ? ? 108.73 111.90 -3.17 0.50 N 124 1 C4 A A 751 ? ? C5 A A 751 ? ? N7 A A 751 ? ? 114.40 110.70 3.70 0.50 N 125 1 N9 A A 751 ? ? C4 A A 751 ? ? C5 A A 751 ? ? 102.60 105.80 -3.20 0.40 N 126 1 N1 A A 751 ? ? C6 A A 751 ? ? N6 A A 751 ? ? 124.05 118.60 5.45 0.60 N 127 1 C5 A A 751 ? ? C6 A A 751 ? ? N6 A A 751 ? ? 115.58 123.70 -8.12 0.80 N 128 1 C4 A G 752 ? ? C5 A G 752 ? ? N7 A G 752 ? ? 113.85 110.80 3.05 0.40 N 129 1 N1 A C 755 ? ? C2 A C 755 ? ? O2 A C 755 ? ? 123.38 118.90 4.48 0.60 N 130 1 C2 A C 755 ? ? N1 A C 755 ? ? "C1'" A C 755 ? ? 125.50 118.80 6.70 1.10 N 131 1 C4 A A 756 ? ? C5 A A 756 ? ? C6 A A 756 ? ? 120.77 117.00 3.77 0.50 N 132 1 N3 A A 756 ? ? C4 A A 756 ? ? N9 A A 756 ? ? 132.56 127.40 5.16 0.80 N 133 1 C6 A A 756 ? ? C5 A A 756 ? ? N7 A A 756 ? ? 126.11 132.30 -6.19 0.70 N 134 1 N1 A A 756 ? ? C6 A A 756 ? ? N6 A A 756 ? ? 122.29 118.60 3.69 0.60 N 135 1 C4 A A 756 ? ? N9 A A 756 ? ? "C1'" A A 756 ? ? 137.45 126.30 11.15 1.80 N 136 1 C4 A G 757 ? ? C5 A G 757 ? ? N7 A G 757 ? ? 114.05 110.80 3.25 0.40 N 137 1 C5 A G 757 ? ? N7 A G 757 ? ? C8 A G 757 ? ? 100.90 104.30 -3.40 0.50 N 138 1 N7 A G 757 ? ? C8 A G 757 ? ? N9 A G 757 ? ? 117.01 113.10 3.91 0.50 N 139 1 C6 A G 757 ? ? C5 A G 757 ? ? N7 A G 757 ? ? 125.64 130.40 -4.76 0.60 N 140 1 C4 A G 758 ? ? N9 A G 758 ? ? "C1'" A G 758 ? ? 134.77 126.50 8.27 1.30 N 141 1 "O4'" A U 759 ? ? "C1'" A U 759 ? ? N1 A U 759 ? ? 114.26 108.50 5.76 0.70 N 142 1 N9 A G 766 ? ? C4 A G 766 ? ? C5 A G 766 ? ? 102.45 105.40 -2.95 0.40 N 143 1 C2 A G 778 ? ? N3 A G 778 ? ? C4 A G 778 ? ? 108.64 111.90 -3.26 0.50 N 144 1 N3 A C 789 ? ? C4 A C 789 ? ? C5 A C 789 ? ? 124.65 121.90 2.75 0.40 N 145 1 C4 A A 806 ? ? C5 A A 806 ? ? N7 A A 806 ? ? 114.55 110.70 3.85 0.50 N 146 1 C5 A A 806 ? ? N7 A A 806 ? ? C8 A A 806 ? ? 100.20 103.90 -3.70 0.50 N 147 1 N9 A A 806 ? ? C4 A A 806 ? ? C5 A A 806 ? ? 102.86 105.80 -2.94 0.40 N 148 1 C6 A A 806 ? ? C5 A A 806 ? ? N7 A A 806 ? ? 126.81 132.30 -5.49 0.70 N 149 1 N1 A A 806 ? ? C6 A A 806 ? ? N6 A A 806 ? ? 126.45 118.60 7.85 0.60 N 150 1 C5 A A 806 ? ? C6 A A 806 ? ? N6 A A 806 ? ? 115.68 123.70 -8.02 0.80 N 151 1 C5 A A 814 ? ? C6 A A 814 ? ? N6 A A 814 ? ? 118.59 123.70 -5.11 0.80 N 152 1 C5 A A 819 ? ? C6 A A 819 ? ? N6 A A 819 ? ? 117.99 123.70 -5.71 0.80 N 153 1 N1 A A 838 ? ? C6 A A 838 ? ? N6 A A 838 ? ? 114.91 118.60 -3.69 0.60 N 154 1 N1 A C 840 ? ? C2 A C 840 ? ? O2 A C 840 ? ? 122.71 118.90 3.81 0.60 N 155 1 N3 A C 851 ? ? C4 A C 851 ? ? C5 A C 851 ? ? 124.38 121.90 2.48 0.40 N 156 1 N1 A C 851 ? ? C2 A C 851 ? ? O2 A C 851 ? ? 124.54 118.90 5.64 0.60 N 157 1 N3 A C 851 ? ? C2 A C 851 ? ? O2 A C 851 ? ? 117.10 121.90 -4.80 0.70 N 158 1 N1 A C 862 ? ? C2 A C 862 ? ? O2 A C 862 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 159 1 N3 A C 862 ? ? C2 A C 862 ? ? O2 A C 862 ? ? 117.39 121.90 -4.51 0.70 N 160 1 C2 A G 863 ? ? N3 A G 863 ? ? C4 A G 863 ? ? 108.57 111.90 -3.33 0.50 N 161 1 N3 A G 863 ? ? C4 A G 863 ? ? C5 A G 863 ? ? 131.69 128.60 3.09 0.50 N 162 1 C6 A C 882 ? ? N1 A C 882 ? ? "C1'" A C 882 ? ? 113.40 120.80 -7.40 1.20 N 163 1 N1 A C 883 ? ? C2 A C 883 ? ? O2 A C 883 ? ? 122.64 118.90 3.74 0.60 N 164 1 "O5'" A A 891 ? ? P A A 891 ? ? OP1 A A 891 ? ? 100.08 105.70 -5.62 0.90 N 165 1 C4 A A 897 ? ? 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N9 A G 924 ? ? 129.72 126.00 3.72 0.60 N 178 1 C6 A G 924 ? ? C5 A G 924 ? ? N7 A G 924 ? ? 125.81 130.40 -4.59 0.60 N 179 1 C8 A G 924 ? ? N9 A G 924 ? ? "C1'" A G 924 ? ? 118.02 127.00 -8.98 1.30 N 180 1 C4 A G 924 ? ? N9 A G 924 ? ? "C1'" A G 924 ? ? 136.06 126.50 9.56 1.30 N 181 1 C2 A G 983 ? ? N3 A G 983 ? ? C4 A G 983 ? ? 108.56 111.90 -3.34 0.50 N 182 1 N1 A C 988 ? ? C2 A C 988 ? ? O2 A C 988 ? ? 124.16 118.90 5.26 0.60 N 183 1 N3 A C 988 ? ? C2 A C 988 ? ? O2 A C 988 ? ? 117.38 121.90 -4.52 0.70 N 184 1 C6 A C 988 ? ? N1 A C 988 ? ? "C1'" A C 988 ? ? 111.74 120.80 -9.06 1.20 N 185 1 C2 A C 988 ? ? N1 A C 988 ? ? "C1'" A C 988 ? ? 128.31 118.80 9.51 1.10 N 186 1 N1 A G 997 ? ? C2 A G 997 ? ? N2 A G 997 ? ? 110.53 116.20 -5.67 0.90 N 187 1 N1 A A 1004 ? ? C6 A A 1004 ? ? N6 A A 1004 ? ? 122.72 118.60 4.12 0.60 N 188 1 C5 A A 1004 ? ? C6 A A 1004 ? ? N6 A A 1004 ? ? 118.83 123.70 -4.87 0.80 N 189 1 N3 A G 1021 ? ? C4 A G 1021 ? ? C5 A G 1021 ? ? 132.02 128.60 3.42 0.50 N 190 1 N1 A A 1024 ? ? C6 A A 1024 ? ? N6 A A 1024 ? ? 123.19 118.60 4.59 0.60 N 191 1 C5 A A 1024 ? ? C6 A A 1024 ? ? N6 A A 1024 ? ? 117.44 123.70 -6.26 0.80 N 192 1 N9 A A 1072 ? ? C4 A A 1072 ? ? C5 A A 1072 ? ? 103.32 105.80 -2.48 0.40 N 193 1 N1 A A 1072 ? ? C6 A A 1072 ? ? N6 A A 1072 ? ? 123.75 118.60 5.15 0.60 N 194 1 C5 A A 1072 ? ? C6 A A 1072 ? ? N6 A A 1072 ? ? 117.45 123.70 -6.25 0.80 N 195 1 N9 A G 1075 ? ? C4 A G 1075 ? ? C5 A G 1075 ? ? 107.91 105.40 2.51 0.40 N 196 1 N3 A G 1075 ? ? C4 A G 1075 ? ? N9 A G 1075 ? ? 121.41 126.00 -4.59 0.60 N 197 1 N3 A G 1081 ? ? C4 A G 1081 ? ? N9 A G 1081 ? ? 120.71 126.00 -5.29 0.60 N 198 1 N3 A G 1081 ? ? C2 A G 1081 ? ? N2 A G 1081 ? ? 114.98 119.90 -4.92 0.70 N 199 1 C6 A C 1087 ? ? N1 A C 1087 ? ? C2 A C 1087 ? ? 117.05 120.30 -3.25 0.40 N 200 1 C6 A C 1087 ? ? N1 A C 1087 ? ? "C1'" A C 1087 ? ? 129.16 120.80 8.36 1.20 N 201 1 N1 A C 1179 ? ? C2 A C 1179 ? ? 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O2 A C 1370 ? ? 123.11 118.90 4.21 0.60 N 214 1 C8 A G 1380 ? ? N9 A G 1380 ? ? "C1'" A G 1380 ? ? 118.87 127.00 -8.13 1.30 N 215 1 C4 A G 1380 ? ? N9 A G 1380 ? ? "C1'" A G 1380 ? ? 134.73 126.50 8.23 1.30 N 216 1 N3 A G 1384 ? ? C4 A G 1384 ? ? C5 A G 1384 ? ? 131.74 128.60 3.14 0.50 N 217 1 N1 A A 1391 ? ? C6 A A 1391 ? ? N6 A A 1391 ? ? 124.12 118.60 5.52 0.60 N 218 1 C5 A A 1391 ? ? C6 A A 1391 ? ? N6 A A 1391 ? ? 117.96 123.70 -5.74 0.80 N 219 1 N1 A C 1393 ? ? C2 A C 1393 ? ? O2 A C 1393 ? ? 123.00 118.90 4.10 0.60 N 220 1 N3 A C 1393 ? ? C2 A C 1393 ? ? O2 A C 1393 ? ? 117.65 121.90 -4.25 0.70 N 221 1 N1 A A 1396 ? ? C6 A A 1396 ? ? N6 A A 1396 ? ? 114.94 118.60 -3.66 0.60 N 222 1 N3 A G 1406 ? ? C4 A G 1406 ? ? C5 A G 1406 ? ? 131.67 128.60 3.07 0.50 N 223 1 N3 A G 1406 ? ? C4 A G 1406 ? ? N9 A G 1406 ? ? 122.29 126.00 -3.71 0.60 N 224 1 N1 A A 1410 ? ? C6 A A 1410 ? ? N6 A A 1410 ? ? 122.92 118.60 4.32 0.60 N 225 1 C5 A A 1410 ? ? C6 A A 1410 ? ? N6 A A 1410 ? ? 118.74 123.70 -4.96 0.80 N 226 1 N1 A C 1413 ? ? C2 A C 1413 ? ? O2 A C 1413 ? ? 122.76 118.90 3.86 0.60 N 227 1 C2 A G 1414 ? ? N3 A G 1414 ? ? C4 A G 1414 ? ? 108.66 111.90 -3.24 0.50 N 228 1 N1 A A 1421 ? ? C6 A A 1421 ? ? N6 A A 1421 ? ? 122.29 118.60 3.69 0.60 N 229 1 C6 A A 1422 ? ? N1 A A 1422 ? ? C2 A A 1422 ? ? 114.53 118.60 -4.07 0.60 N 230 1 N1 A A 1422 ? ? C2 A A 1422 ? ? N3 A A 1422 ? ? 132.89 129.30 3.59 0.50 N 231 1 C5 A C 1435 ? ? C4 A C 1435 ? ? N4 A C 1435 ? ? 115.52 120.20 -4.68 0.70 N 232 1 N3 A G 1438 ? ? C4 A G 1438 ? ? C5 A G 1438 ? ? 131.91 128.60 3.31 0.50 N 233 1 N3 A G 1438 ? ? C4 A G 1438 ? ? N9 A G 1438 ? ? 121.97 126.00 -4.03 0.60 N 234 1 C8 A A 1440 ? ? N9 A A 1440 ? ? C4 A A 1440 ? ? 108.51 105.80 2.71 0.40 N 235 1 N9 A A 1440 ? ? C4 A A 1440 ? ? C5 A A 1440 ? ? 103.31 105.80 -2.49 0.40 N 236 1 N9 A A 1447 ? ? C4 A A 1447 ? ? C5 A A 1447 ? ? 103.39 105.80 -2.41 0.40 N 237 1 N3 A G 1453 ? ? C2 A G 1453 ? ? 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N7 A G 1467 ? ? 123.69 130.40 -6.71 0.60 N 250 1 N1 A G 1467 ? ? C6 A G 1467 ? ? O6 A G 1467 ? ? 124.39 119.90 4.49 0.60 N 251 1 C4 A G 1467 ? ? N9 A G 1467 ? ? "C1'" A G 1467 ? ? 134.36 126.50 7.86 1.30 N 252 1 C4 A G 1468 ? ? C5 A G 1468 ? ? N7 A G 1468 ? ? 114.15 110.80 3.35 0.40 N 253 1 C5 A G 1468 ? ? N7 A G 1468 ? ? C8 A G 1468 ? ? 101.17 104.30 -3.13 0.50 N 254 1 C6 A G 1468 ? ? C5 A G 1468 ? ? N7 A G 1468 ? ? 126.43 130.40 -3.97 0.60 N 255 1 C2 A G 1470 ? ? N3 A G 1470 ? ? C4 A G 1470 ? ? 108.79 111.90 -3.11 0.50 N 256 1 C6 A C 1472 ? ? N1 A C 1472 ? ? C2 A C 1472 ? ? 117.89 120.30 -2.41 0.40 N 257 1 N7 A G 1480 ? ? C8 A G 1480 ? ? N9 A G 1480 ? ? 117.42 113.10 4.32 0.50 N 258 1 C8 A G 1480 ? ? N9 A G 1480 ? ? C4 A G 1480 ? ? 103.64 106.40 -2.76 0.40 N 259 1 N3 A G 1494 ? ? C4 A G 1494 ? ? C5 A G 1494 ? ? 131.86 128.60 3.26 0.50 N 260 1 N3 A G 1494 ? ? C4 A G 1494 ? ? N9 A G 1494 ? ? 121.51 126.00 -4.49 0.60 N 261 1 C5 A U 1499 ? ? C6 A U 1499 ? ? 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C5 A A 1538 ? ? 108.41 105.80 2.61 0.40 N 274 1 N1 A A 1538 ? ? C6 A A 1538 ? ? N6 A A 1538 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 275 1 C5 A A 1538 ? ? C6 A A 1538 ? ? N6 A A 1538 ? ? 129.08 123.70 5.38 0.80 N 276 1 N1 A A 1539 ? ? C6 A A 1539 ? ? N6 A A 1539 ? ? 114.57 118.60 -4.03 0.60 N 277 1 C5 A U 1598 ? ? C6 A U 1598 ? ? N1 A U 1598 ? ? 126.16 122.70 3.46 0.50 N 278 1 C4 A A 1607 ? ? C5 A A 1607 ? ? N7 A A 1607 ? ? 114.23 110.70 3.53 0.50 N 279 1 C8 A A 1607 ? ? N9 A A 1607 ? ? C4 A A 1607 ? ? 108.52 105.80 2.72 0.40 N 280 1 N9 A A 1607 ? ? C4 A A 1607 ? ? C5 A A 1607 ? ? 102.16 105.80 -3.64 0.40 N 281 1 C5 A U 1623 ? ? C6 A U 1623 ? ? N1 A U 1623 ? ? 126.19 122.70 3.49 0.50 N 282 1 N3 A U 1625 ? ? C2 A U 1625 ? ? O2 A U 1625 ? ? 116.88 122.20 -5.32 0.70 N 283 1 N1 A A 1632 ? ? C6 A A 1632 ? ? N6 A A 1632 ? ? 122.79 118.60 4.19 0.60 N 284 1 C4 A A 1634 ? ? C5 A A 1634 ? ? N7 A A 1634 ? ? 113.95 110.70 3.25 0.50 N 285 1 N9 A A 1634 ? ? C4 A A 1634 ? ? 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"C1'" A U 1892 ? ? 125.58 117.70 7.88 1.20 N 310 1 C6 A C 1906 ? ? N1 A C 1906 ? ? C2 A C 1906 ? ? 117.82 120.30 -2.48 0.40 N 311 1 N1 A C 1906 ? ? C2 A C 1906 ? ? O2 A C 1906 ? ? 124.86 118.90 5.96 0.60 N 312 1 N3 A C 1906 ? ? C2 A C 1906 ? ? O2 A C 1906 ? ? 116.08 121.90 -5.82 0.70 N 313 1 C2 A C 1906 ? ? N1 A C 1906 ? ? "C1'" A C 1906 ? ? 125.94 118.80 7.14 1.10 N 314 1 C6 A C 1920 ? ? N1 A C 1920 ? ? C2 A C 1920 ? ? 117.72 120.30 -2.58 0.40 N 315 1 N3 A C 1920 ? ? C2 A C 1920 ? ? O2 A C 1920 ? ? 116.36 121.90 -5.54 0.70 N 316 1 N3 A G 1924 ? ? C4 A G 1924 ? ? N9 A G 1924 ? ? 122.25 126.00 -3.75 0.60 N 317 1 N7 A A 1954 ? ? C8 A A 1954 ? ? N9 A A 1954 ? ? 117.11 113.80 3.31 0.50 N 318 1 N3 A G 1975 ? ? C4 A G 1975 ? ? C5 A G 1975 ? ? 131.65 128.60 3.05 0.50 N 319 1 N1 A A 1979 ? ? C6 A A 1979 ? ? N6 A A 1979 ? ? 122.74 118.60 4.14 0.60 N 320 1 C5 A A 1979 ? ? C6 A A 1979 ? ? N6 A A 1979 ? ? 118.24 123.70 -5.46 0.80 N 321 1 N3 A G 1991 ? ? C4 A G 1991 ? ? 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N2 A G 2099 ? ? 110.14 116.20 -6.06 0.90 N 334 1 N3 A U 2102 ? ? C4 A U 2102 ? ? O4 A U 2102 ? ? 124.13 119.40 4.73 0.70 N 335 1 C5 A U 2102 ? ? C4 A U 2102 ? ? O4 A U 2102 ? ? 121.57 125.90 -4.33 0.60 N 336 1 C6 A C 2131 ? ? N1 A C 2131 ? ? C2 A C 2131 ? ? 117.77 120.30 -2.53 0.40 N 337 1 C5 A A 2150 ? ? N7 A A 2150 ? ? C8 A A 2150 ? ? 108.85 103.90 4.95 0.50 N 338 1 N7 A A 2150 ? ? C8 A A 2150 ? ? N9 A A 2150 ? ? 117.30 113.80 3.50 0.50 N 339 1 N1 A C 2210 ? ? C2 A C 2210 ? ? O2 A C 2210 ? ? 123.08 118.90 4.18 0.60 N 340 1 N3 A C 2210 ? ? C2 A C 2210 ? ? O2 A C 2210 ? ? 117.55 121.90 -4.35 0.70 N 341 1 N1 A G 2212 ? ? C6 A G 2212 ? ? O6 A G 2212 ? ? 115.59 119.90 -4.31 0.60 N 342 1 C5 A G 2212 ? ? C6 A G 2212 ? ? O6 A G 2212 ? ? 132.98 128.60 4.38 0.60 N 343 1 N3 A G 2247 ? ? C4 A G 2247 ? ? C5 A G 2247 ? ? 131.87 128.60 3.27 0.50 N 344 1 N3 A G 2247 ? ? C4 A G 2247 ? ? N9 A G 2247 ? ? 122.19 126.00 -3.81 0.60 N 345 1 N3 A G 2248 ? ? C4 A G 2248 ? ? 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RELION 2.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6S12 'double helix' 6S12 'a-form double helix' 6S12 'parallel strands' 6S12 'hairpin loop' 6S12 tetraloop 6S12 'bulge loop' 6S12 'mismatched base pair' 6S12 'internal loop' 6S12 'triple helix' 6S12 'quadruple helix' 6S12 'three-way junction' 6S12 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A U 1 1_555 A A 2904 1_555 -0.137 -0.533 -1.013 -10.708 -20.627 3.858 1 A_U3:A2919_A A 3 ? 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A 191 ? ? ? 1 A C 210 1_555 A G 188 1_555 -0.085 -0.380 0.797 2.956 -3.905 -6.276 11 A_C212:G190_A A 212 ? A 190 ? 19 1 1 A C 211 1_555 A G 187 1_555 0.016 -0.365 0.589 -3.801 -9.197 -3.016 12 A_C213:G189_A A 213 ? A 189 ? 19 1 1 A G 212 1_555 A C 186 1_555 0.039 -0.201 -0.268 1.226 -2.743 -0.548 13 A_G214:C188_A A 214 ? A 188 ? 19 1 1 A G 213 1_555 A C 185 1_555 0.212 -0.194 -0.097 2.134 -12.634 -1.405 14 A_G215:C187_A A 215 ? A 187 ? 19 1 1 A G 215 1_555 A C 184 1_555 0.122 -0.510 1.267 8.980 -7.276 -1.625 15 A_G217:C186_A A 217 ? A 186 ? 19 1 1 A G 216 1_555 A A 183 1_555 0.818 1.258 0.161 9.581 -9.167 -28.403 16 A_G218:A185_A A 218 ? A 185 ? 8 1 1 A G 43 1_555 A C 475 1_555 0.266 -0.533 -0.702 1.027 -0.682 3.201 17 A_G45:C479_A A 45 ? A 479 ? 19 1 1 A A 42 1_555 A U 476 1_555 0.170 -0.496 -1.054 -14.094 1.433 4.185 18 A_A44:U480_A A 44 ? A 480 ? 20 1 1 A U 478 1_555 A A 41 1_555 -2.833 4.258 -0.520 1.019 -11.258 -107.557 19 A_U482:A43_A A 482 ? 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