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_pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'Structure model' author 'Coordinate replacement' 'Ligand identity' ? 3 3 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' Advisory 2 2 'Structure model' 'Atomic model' 3 2 'Structure model' 'Author supporting evidence' 4 2 'Structure model' 'Data collection' 5 2 'Structure model' 'Database references' 6 2 'Structure model' 'Derived calculations' 7 2 'Structure model' 'Non-polymer description' 8 2 'Structure model' 'Polymer sequence' 9 2 'Structure model' 'Refinement description' 10 2 'Structure model' 'Structure summary' 11 3 'Structure model' Advisory 12 3 'Structure model' 'Atomic model' 13 3 'Structure model' 'Data collection' 14 3 'Structure model' 'Derived calculations' 15 3 'Structure model' 'Refinement description' 16 3 'Structure model' 'Structure summary' 17 4 'Structure model' Advisory 18 4 'Structure model' 'Data collection' 19 4 'Structure model' 'Database references' 20 4 'Structure model' 'Refinement description' 21 4 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' atom_site 2 2 'Structure model' atom_type 3 2 'Structure model' audit_author 4 2 'Structure model' chem_comp 5 2 'Structure model' citation 6 2 'Structure model' citation_author 7 2 'Structure model' diffrn_source 8 2 'Structure model' entity 9 2 'Structure model' entity_poly 10 2 'Structure model' entity_poly_seq 11 2 'Structure model' pdbx_entity_instance_feature 12 2 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 13 2 'Structure model' pdbx_entry_details 14 2 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 15 2 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'_atom_site.label_atom_id' 8 2 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 9 2 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 10 2 'Structure model' '_chem_comp.formula' 11 2 'Structure model' '_chem_comp.formula_weight' 12 2 'Structure model' '_chem_comp.id' 13 2 'Structure model' '_chem_comp.name' 14 2 'Structure model' '_chem_comp.type' 15 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 16 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 17 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 18 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 19 2 'Structure model' '_citation.page_first' 20 2 'Structure model' '_citation.page_last' 21 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 22 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 23 2 'Structure model' '_citation.title' 24 2 'Structure model' '_citation.year' 25 2 'Structure model' '_diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline' 26 2 'Structure model' '_diffrn_source.pdbx_synchrotron_site' 27 2 'Structure model' 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Mycoplasma hyopneumoniae: interaction with a monoclonal antibody.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1107/S2059798320003903 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32355038 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Guasch, A.' 1 ? primary 'Montane, J.' 2 ? primary 'Moros, A.' 3 ? primary 'Pinol, J.' 4 ? primary 'Sitja, M.' 5 ? primary 'Gonzalez-Gonzalez, L.' 6 ? primary 'Fita, I.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man '46 kDa surface antigen' 42426.508 4 ? ? ? ? 2 polymer man 'Immunoglobulin light chain' 26370.238 4 ? ? ? ? 3 polymer man 'Immunoglobulin heavy chain' 52172.977 4 ? ? ? ? 4 non-polymer man beta-D-xylopyranose 150.130 4 ? ? ? ? 5 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SHMPQETISFYTIAGSQDDNNSQYFYNGAMKVLKELMKNSQNKIIDLSPEGENAVYVPGWNYGTAGQRIQSFLTINKDPA GGNKIKAVGSKPASIFKGFLAPNDGMAEQAITKLKLEGFDTQKIFVTGQDYNDKAKTFIKDGDQNMTIYKPDKVLGKVAV EVLRVLIAKKNKASRSEVENELKAKLPNISFKYDNQTYKVQGKNINTILVSPVIVTKANVDNPDALE ; A,B,S,T ? 2 'polypeptide(L)' no no ;METDTLLLWVLLLWVPGSTGDIVLTQSPASLVVSLGQRATISCRASQTVSTSSYSYMHWYQQKPGQPPKLLIYYASNLES GVPARFTGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQHSWDIPPTFGAGTKLELRRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFL NNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC ; ;METDTLLLWVLLLWVPGSTGDIVLTQSPASLVVSLGQRATISCRASQTVSTSSYSYMHWYQQKPGQPPKLLIYYASNLES GVPARFTGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQHSWDIPPTFGAGTKLELRRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFL NNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC ; C,I,M,Q ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MKMFTLLYLLTVVPGILSDVQLQESGPGLVKPSQTVSLTCTVTGISITTGNYRWSWIRQFPGNKLEWMGYISYSDTITYN PSLTSRTTITRDISRNQIFLEMNSLTAEDTATYYCAREGVLHWYFAVWGAGTTVTVSSAKTTPPSVYPLAPGCGDTTGSS 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'X-RAY DIFFRACTION' ? 15.8438 ? 9239 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.d_res_high 3.50 _refine_ls_shell.d_res_low 29.3 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 248 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 3972 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 92.59 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.1981 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.1787 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used ? _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # _struct.entry_id 6S3T _struct.title 'P46, an immunodominant surface protein from Mycoplasma hyopneumoniae' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6S3T _struct_keywords.text 'immunodominant surface protein Mycoplasma hyopneumoniae P46 Complex with monolonal antibody, PROTEIN BINDING' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN BINDING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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'initiating methionine' 32 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? trimeric 3 2 author_defined_assembly ? trimeric 3 3 author_defined_assembly ? trimeric 3 4 author_defined_assembly ? trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,G,H,M,N 2 1 B,I,J,O,P 3 1 C,D,K,Q,R 4 1 E,F,L,S,T # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle _struct_mon_prot_cis.pdbx_id . C SER 27 C SER 7 C PRO 8 C PRO 28 ? ? 1 -0.97 1 . C HIS 100 C HIS 80 C PRO 81 C PRO 101 ? ? 1 -0.56 2 . C ILE 118 C ILE 98 C PRO 99 C PRO 119 ? ? 1 -4.03 3 . C TYR 164 C TYR 144 C PRO 145 C PRO 165 ? ? 1 5.33 4 . D PHE 171 D PHE 153 D PRO 154 D PRO 172 ? ? 1 4.38 5 . D TRP 213 D TRP 195 D PRO 196 D PRO 214 ? ? 1 0.11 6 . E SER 27 I SER 7 I PRO 8 E PRO 28 ? ? 1 -6.33 7 . E HIS 100 I HIS 80 I PRO 81 E PRO 101 ? ? 1 -0.60 8 . E ILE 118 I ILE 98 I PRO 99 E PRO 119 ? ? 1 -3.89 9 . E TYR 164 I TYR 144 I PRO 145 E PRO 165 ? ? 1 4.63 10 . F PHE 171 E PHE 153 E PRO 154 F PRO 172 ? ? 1 1.09 11 . F TRP 213 E TRP 195 E PRO 196 F PRO 214 ? ? 1 1.10 12 . G SER 27 M SER 7 M PRO 8 G PRO 28 ? ? 1 -1.33 13 . G HIS 100 M HIS 80 M PRO 81 G PRO 101 ? ? 1 1.01 14 . G ILE 118 M ILE 98 M PRO 99 G PRO 119 ? ? 1 -6.04 15 . G TYR 164 M TYR 144 M PRO 145 G PRO 165 ? ? 1 2.64 16 . H PHE 171 N PHE 153 N PRO 154 H PRO 172 ? ? 1 4.22 17 . H TRP 213 N TRP 195 N PRO 196 H PRO 214 ? ? 1 -2.17 18 . I SER 27 Q SER 7 Q PRO 8 I PRO 28 ? ? 1 -1.72 19 . I HIS 100 Q HIS 80 Q PRO 81 I PRO 101 ? ? 1 0.89 20 . I ILE 118 Q ILE 98 Q PRO 99 I PRO 119 ? ? 1 -7.73 21 . I TYR 164 Q TYR 144 Q PRO 145 I PRO 165 ? ? 1 4.68 22 . J PHE 171 R PHE 153 R PRO 154 J PRO 172 ? ? 1 4.16 23 . J TRP 213 R TRP 195 R PRO 196 J PRO 214 ? ? 1 0.13 24 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 SG E CYS 22 ? ? 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