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'Due to limited quality of the electron density, we were only able to trace some of the protein main chain as poly-Ala' 5 polymer nat ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; 134444.953 2 2.7.7.6 ? ? ? 6 polymer nat 'DNA helicase' 90052.516 2 3.6.4.12 ? ? ? 7 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 3 'RNAP subunit alpha,RNA polymerase subunit alpha,Transcriptase subunit alpha' 4 'RNAP subunit beta,RNA polymerase subunit beta,Transcriptase subunit beta' 5 ;RNAP subunit beta',RNA polymerase subunit beta',Transcriptase subunit beta' ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGIKQYSQEELKEMALVEIAHELFEEHKKPVPFQELLNEIASLLGVKKEELGDRIAQFYTDLNIDGRFLALSDQTWGLRS 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EEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVQELANKTEEDMMKVRNLGRKSLEEVKAKLEELGLGLRKDD ; U,V,u,v ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTGQLVQYGRHRQRRSYARISEVLELPNLIEIQTSSYQWFLDEGLREMFQDISPIEDFTGNLSLEFIDYSLGEPKYPVEE SKERDVTYSAPLRVKVRLINKETGEVKDQDVFMGDFPIMTDTGTFIINGAERVIVSQLVRSPSVYFSGKVDKNGKKGFTA TVIPNRGAWLEYETDAKDVVYVRIDRTRKLPVTVLLRALGFGSDQEILDLIGENEYLRNTLDKDNTENSDKALLEIYERL RPGEPPTVENAKSLLDSRFFDPKRYDLANVGRYKINKKLHIKNRLFNQRLAETLVDPETGEILAEKGQILDRRTLDKVLP YLENGIGFRKLYPNGGVVEDEVTLQSIKIFAPTDQEGEQVINVIGNAYIEEEIKNITPADIISSISYFFNLLHGVGDTDD IDHLGNRRLRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTNTITPQQLINIRPVIASIKEFFGSSQLSQFMDQTNPLAEL THKRRLSALGPGGLTRERAGMEVRDVHYSHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLSSYAKVNRFGFIETPYRRVDPETGKVTGR IDYLTADEEDNYVVAQANARLDDEGAFIDDSIVARFRGENTVVSRNRVDYMDVSPKQVVSAATACIPFLENDDSNRALMG ANMQRQAVPLMQPEAPFVGTGMEYVSGKDSGAAVICKHPGIVERVEAKNVWVRRYEEVDGQKVKGNLDKYSLLKFVRSNQ GTCYNQRPIVSVGDEVVKGEILADGPSMELGELALGRNVMVGFMTWDGYNYEDAIIMSERLVKDDVYTSIHIEEYESEAR 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;MNQQDKEWKEEQSRIDEVLKELEKKERFLETSAGGLKHDIIGLRKSFWEDVKVNFDDAHEAIETMASIKQQAELLSDREH NHRRMDQQLKRIHQLKKSPYFGRIDFIENGEEQAERIYIGLASCLDEKEEHFLIYDWRAPISSLYYNYSPGKAEYEVPGE TIEGEMVLKRQFMIKNGTLKAMFNTDMTIGDEMLQEVLSHHSDTQMKNIVSTIQKEQNQIIRNEKSKILIVQGAAGSGKT SAALQRVAYLLYRHRGVIDAGQIVLFSPNFLFNSYVSSVLPELGEENMEQATFQEYIEHRLGRKFKCESPFDQLEYCLTE TKGGDFPTRLAGITWKAGLSFQQFINEYVTRLSSEGMIFKNIIFRGQKLITKEQIQSYFYSLDQNHSIPNRMEQTAKWLL SELNKLEKKERRKDWVVHEAELLDKEDYLDVYKKLQERKRFSESTFNDYQREQQLLAAIIVKKAFKPLKQAVRLLAFLDV TQLYLQLFSGWGGKFQHEKMDAIGELTRSAFTDNKLLYEDAAPFLYMQDLIEGRKKNTKIKHLFIDEAQDYSPFQMAYMR SIFPAASMTVLGDINQSIYAHTINGDQRMDACFEDEPAEYVRLKRTYRSTRQIVEFTKAMLQDGADIEPFNRSGEMPLVV KTEGHESLCQKLAQEIGRLKKKGHETIAVICKTAHQCIQAHAHMSEYTDVRLIHKENQPFQKGVCVIPVYLAKGIEFDAV LVYDASEEHYHTEHDRRLLYTACTRAMHMLAVFYTGEASPFVTAVPPHLYQIAE ; H,h ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 ILE n 1 4 LYS n 1 5 GLN n 1 6 TYR n 1 7 SER n 1 8 GLN n 1 9 GLU n 1 10 GLU n 1 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'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 69 ? 'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 314 ? 'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 1193 ? 'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 1199 ? 'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 774 ? 'Bacillus subtilis' 1423 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 6ZFB 6ZFB ? 1 ? 1 2 UNP A0A410WI33_BACVA A0A410WI33 ? 2 MIYKVFYQEKADEVPVREKTDSLYIEGVSERDVRTKLKEKKLNIEFITPVNGAFLEYEQQSENFKVLEL 1 3 UNP A0A063XB83_BACIU A0A063XB83 ? 3 ;MIEIEKPKIETVEISDDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVTSIQIDGVLHEFSTIEGVVEDVTTIIL HIKKLALKIYSDEEKTLEIDVQGEGTVTAADITHDSDVEILNPDLHIATLGENASFRVRLTAQRGRGYTPADANKRDDQP IGVIPIDSIYTPVSRVSYQVENTRVGQVANYDKLTLDVWTDGSTGPKEAIALGSKILTEHLNIFVGLTDEAQHAEIMVEK EEDQKEKVLEMTIEELDLSVRSYNCLKRAGINTVQELANKTEEDMMKVRNLGRKSLEEVKAKLEELGLGLRKDD ; 1 4 UNP A0A2J0WBQ0_BACIU A0A2J0WBQ0 ? 4 ;MTGQLVQYGRHRQRRSYARISEVLELPNLIEIQTSSYQWFLDEGLREMFQDISPIEDFTGNLSLEFIDYSLGEPKYPVEE SKERDVTYSAPLRVKVRLINKETGEVKDQDVFMGDFPIMTDTGTFIINGAERVIVSQLVRSPSVYFSGKVDKNGKKGFTA TVIPNRGAWLEYETDAKDVVYVRIDRTRKLPVTVLLRALGFGSDQEILDLIGENEYLRNTLDKDNTENSDKALLEIYERL RPGEPPTVENAKSLLDSRFFDPKRYDLANVGRYKINKKLHIKNRLFNQRLAETLVDPETGEILAEKGQILDRRTLDKVLP YLENGIGFRKLYPNGGVVEDEVTLQSIKIFAPTDQEGEQVINVIGNAYIEEEIKNITPADIISSISYFFNLLHGVGDTDD IDHLGNRRLRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTNTITPQQLINIRPVIASIKEFFGSSQLSQFMDQTNPLAEL THKRRLSALGPGGLTRERAGMEVRDVHYSHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLSSYAKVNRFGFIETPYRRVDPETGKVTGR IDYLTADEEDNYVVAQANARLDDEGAFIDDSIVARFRGENTVVSRNRVDYMDVSPKQVVSAATACIPFLENDDSNRALMG ANMQRQAVPLMQPEAPFVGTGMEYVSGKDSGAAVICKHPGIVERVEAKNVWVRRYEEVDGQKVKGNLDKYSLLKFVRSNQ GTCYNQRPIVSVGDEVVKGEILADGPSMELGELALGRNVMVGFMTWDGYNYEDAIIMSERLVKDDVYTSIHIEEYESEAR DTKLGPEEITRDIPNVGEDALRNLDDRGIIRIGAEVKDGDLLVGKVTPKGVTELTAEERLLHAIFGEKAREVRDTSLRVP HGGGGIIHDVKVFNREDGDELPPGVNQLVRVYIVQKRKISEGDKMAGRHGNKGVISKILPEEDMPYLPDGTPIDIMLNPL GVPSRMNIGQVLELHMGMAARYLGIHIASPVFDGAREEDVWETLEEAGMSRDAKTVLYDGRTGEPFDNRVSVGIMYMIKL AHMVDDKLHARSTGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEILTVKSDDVVGRVKTYEAIVKGDNVP EPGVPESFKVLIKELQSLGMDVKILSGDEEEIEMRDLEDEEDAKQADGLALSGDEEPEETASADVERDVVTKE ; 1 5 UNP A0A063XB23_BACIU A0A063XB23 ? 5 ;MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCERIFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGV EVTRAKVRRERMGHIELAAPVSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLLSEKEYRAYLD KYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQGQRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRP MVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSHML KGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHLKMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADFDGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNIL NPKDGKPVVTPSQDMVLGNYYLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFTEEQRSKLLIT TVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGADVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKML DRMKNLGFKYSTKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYERVISIWSAAKDVIQGKLMKSL DELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGLMANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARKQVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAG IEEVWIRSAFTCNTPHGVCKRCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDITQGLPRIQELF EARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETRSYTAPYNSRLKVAEGDKITRGQVLTEGSIDPKELLKVTDL TTVQEYLLHEVQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFTEANKKVLLEGNRPATGRPVL LGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAAIKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE ; 1 6 UNP A0A164TSE8_BACIU A0A164TSE8 ? 6 ;MNQQDKEWKEEQSRIDEVLKELEKKERFLETSAGGLKHDIIGLRKSFWEDVKVNFDDAHEAIETMASIKQQAELLSDREH NHRRMDQQLKRIHQLKKSPYFGRIDFIENGEEQAERIYIGLASCLDEKEEHFLIYDWRAPISSLYYNYSPGKAEYEVPGE TIEGEMVLKRQFMIKNGTLKAMFNTDMTIGDEMLQEVLSHHSDTQMKNIVSTIQKEQNQIIRNEKSKILIVQGAAGSGKT SAALQRVAYLLYRHRGVIDAGQIVLFSPNFLFNSYVSSVLPELGEENMEQATFQEYIEHRLGRKFKCESPFDQLEYCLTE TKGGDFPTRLAGITWKAGLSFQQFINEYVTRLSSEGMIFKNIIFRGQKLITKEQIQSYFYSLDQNHSIPNRMEQTAKWLL SELNKLEKKERRKDWVVHEAELLDKEDYLDVYKKLQERKRFSESTFNDYQREQQLLAAIIVKKAFKPLKQAVRLLAFLDV TQLYLQLFSGWGGKFQHEKMDAIGELTRSAFTDNKLLYEDAAPFLYMQDLIEGRKKNTKIKHLFIDEAQDYSPFQMAYMR SIFPAASMTVLGDINQSIYAHTINGDQRMDACFEDEPAEYVRLKRTYRSTRQIVEFTKAMLQDGADIEPFNRSGEMPLVV KTEGHESLCQKLAQEIGRLKKKGHETIAVICKTAHQCIQAHAHMSEYTDVRLIHKENQPFQKGVCVIPVYLAKGIEFDAV LVYDASEEHYHTEHDRRLLYTACTRAMHMLAVFYTGEASPFVTAVPPHLYQIAE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ZFB D 1 ? 139 ? 6ZFB 1 ? 1047 ? 1 1047 2 2 6ZFB E 1 ? 69 ? 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'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZFB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 95.58 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 6ZFB _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0025 ? 58503 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5594 ? 79051 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0420 ? 8907 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0036 ? 10325 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 26.3678 ? 7965 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6ZFB _struct.title 'Structure of the B. subtilis RNA POLYMERASE in complex with HelD (dimer)' _struct.pdbx_descriptor ;DNA-directed RNA polymerase subunit delta, RNA polymerase subunit omega, DNA-directed RNA polymerase subunit alpha (E.C.2.7.7.6), DNA-directed RNA polymerase subunit beta (E.C.2.7.7.6), DNA-directed RNA polymerase subunit beta' (E.C.2.7.7.6), DNA helicase (E.C.3.6.4.12) ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZFB _struct_keywords.text 'TRANSCRIPTION/DNA/RNA, DNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE, BACTERIAL, TRANSCRIPTION, Helicase' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 7 ? P N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 7 ? MET A 14 ? SER D 7 MET D 14 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 15 ? LYS A 28 ? ALA D 15 LYS D 28 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 32 ? LEU A 43 ? PRO D 32 LEU D 43 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU A 49 ? ASP A 65 ? 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PRO 54 x 1 -4.45 4 ILE 110 M . ? ILE 110 y PRO 111 M ? PRO 111 y 1 -0.36 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 7 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 3 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 3 ? AF6 ? 2 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 4 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 2 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 2 ? AG9 ? 2 ? AH1 ? 3 ? AH2 ? 2 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 2 ? AH5 ? 3 ? AH6 ? 3 ? AH7 ? 3 ? AH8 ? 2 ? AH9 ? 2 ? AI1 ? 5 ? AI2 ? 3 ? AI3 ? 2 ? AI4 ? 2 ? AI5 ? 2 ? AI6 ? 2 ? AI7 ? 2 ? AI8 ? 3 ? AI9 ? 2 ? AJ1 ? 2 ? AJ2 ? 2 ? AJ3 ? 2 ? AJ4 ? 3 ? AJ5 ? 2 ? AJ6 ? 2 ? AJ7 ? 3 ? AJ8 ? 3 ? AJ9 ? 4 ? AK1 ? 2 ? AK2 ? 3 ? AK3 ? 2 ? AK4 ? 2 ? AK5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC7 6 7 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD6 1 2 ? parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE7 2 3 ? parallel AE8 1 2 ? parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? parallel AF1 3 4 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH6 1 2 ? anti-parallel AH6 2 3 ? anti-parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH7 2 3 ? anti-parallel AH8 1 2 ? anti-parallel AH9 1 2 ? anti-parallel AI1 1 2 ? parallel AI1 2 3 ? anti-parallel AI1 3 4 ? parallel AI1 4 5 ? anti-parallel AI2 1 2 ? anti-parallel AI2 2 3 ? anti-parallel AI3 1 2 ? anti-parallel AI4 1 2 ? anti-parallel AI5 1 2 ? anti-parallel AI6 1 2 ? anti-parallel AI7 1 2 ? anti-parallel AI8 1 2 ? anti-parallel AI8 2 3 ? anti-parallel AI9 1 2 ? parallel AJ1 1 2 ? parallel AJ2 1 2 ? anti-parallel AJ3 1 2 ? anti-parallel AJ4 1 2 ? parallel AJ4 2 3 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? anti-parallel AJ7 2 3 ? anti-parallel AJ8 1 2 ? anti-parallel AJ8 2 3 ? anti-parallel AJ9 1 2 ? parallel AJ9 2 3 ? anti-parallel AJ9 3 4 ? anti-parallel AK1 1 2 ? anti-parallel AK2 1 2 ? parallel AK2 2 3 ? parallel AK3 1 2 ? parallel AK4 1 2 ? anti-parallel AK5 1 2 ? parallel AK5 2 3 ? parallel AK5 3 4 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 68 ? LEU A 69 ? PHE D 68 LEU D 69 AA1 2 GLY A 77 ? LEU A 78 ? GLY D 77 LEU D 78 AA2 1 LEU B 23 ? GLU B 26 ? LEU E 23 GLU E 26 AA2 2 ILE B 2 ? GLN B 8 ? ILE E 2 GLN E 8 AA2 3 ASN B 43 ? PRO B 49 ? ASN E 43 PRO E 49 AA3 1 VAL C 12 ? ILE C 14 ? VAL U 12 ILE U 14 AA3 2 GLY C 21 ? VAL C 25 ? GLY U 21 VAL U 25 AA3 3 LYS C 193 ? THR C 200 ? LYS U 193 THR U 200 AA3 4 VAL C 173 ? GLU C 181 ? VAL U 173 GLU U 181 AA4 1 LEU C 87 ? ILE C 89 ? LEU U 87 ILE U 89 AA4 2 VAL C 118 ? ILE C 120 ? VAL U 118 ILE U 120 AA5 1 THR C 96 ? GLN C 102 ? THR U 96 GLN U 102 AA5 2 SER C 135 ? THR C 141 ? SER U 135 THR U 141 AA6 1 THR C 106 ? THR C 108 ? THR U 106 THR U 108 AA6 2 HIS C 126 ? THR C 129 ? HIS U 126 THR U 129 AA7 1 VAL D 12 ? ASP D 16 ? VAL V 12 ASP V 16 AA7 2 GLY D 21 ? VAL D 25 ? GLY V 21 VAL V 25 AA7 3 THR D 195 ? VAL D 198 ? THR V 195 VAL V 198 AA8 1 ILE D 56 ? GLN D 57 ? ILE V 56 GLN V 57 AA8 2 PHE D 136 ? ALA D 142 ? PHE V 136 ALA V 142 AA8 3 LYS D 95 ? VAL D 101 ? LYS V 95 VAL V 101 AA9 1 LEU D 87 ? 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