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# loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zanetti, G.' 1 0000-0003-1905-0342 'Hutchings, J.' 2 0000-0001-6841-8583 'Cheung, A.C.M.' 3 0000-0001-6430-5127 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 2034 _citation.page_last 2034 _citation.title 'Structure of the complete, membrane-assembled COPII coat reveals a complex interaction network.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-22110-6 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_cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ZGA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Protein transport protein SEC23' 85332.047 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Protein transport protein SEC24' 103733.250 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Small COPII coat GTPase SAR1' 21472.564 1 3.6.5.- ? ? ? 4 polymer man PRO-PRO-PRO 309.360 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Small COPII coat GTPase SAR1' 21359.406 1 3.6.5.- ? ? ? 6 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 4 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER' 522.196 2 ? ? ? ? 8 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 2 'Abnormal nuclear morphology 1' 3 'GTP-binding protein SAR1,Secretion-associated RAS-related protein 1' 5 'GTP-binding protein SAR1,Secretion-associated RAS-related protein 1' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;DFETNEDINGVRFTWNVFPSTRSDANSNVVPVGCLYTPLKEYDELNVAPYNPVVCSGPHCKSILNPYCVIDPRNSSWSCP ICNSRNHLPPQYTNLSQENMPLELQSTTIEYITNKPVTVPPIFFFVVDLTSETENLDSLKESIITSLSLLPPNALIGLIT YGNVVQLHDLSSETIDRCNVFRGDREYQLEALTEMLTGQKPTGPGGAASHLPNAMNKVTPFSLNRFFLPLEQVEFKLNQL LENLSPDQWSVPAGHRPLRATGSALNIASLLLQGCYKNIPARIILFASGPGTVAPGLIVNSELKDPLRSHHDIDSDHAQH 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EVYASADQLAIASFYNSKAVEKALNSSLDDARVLINKSVQDILATYKKEIVVSNTAGGAPLRLCANLRMFPLLMHSLTKH MAFRSGIVPSDHRASALNNLESLPLKYLIKNIYPDVYSLHDMADEAGLPVQTEDGEATGTIVLPQPINATSSLFERYGLY LIDNGNELFLWMGGDAVPALVFDVFGTQDIFDIPIGKQEIPVVENSEFNQRVRNIINQLRNHDDVITYQSLYIVRGASLS EPVNHASAREVATLRLWASSTLVEDKILNNESYREFLQIMKARISK ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MAGWDIFGWFRDVLASLGLWNKHGKLLFLGLDNAGKTTLLHMLKNDRLATLQPTWHPTSEELAIGNIKFTTFDLGGHIQA RRLWKDYFPEVNGIVFLVDAADPERFDEARVELDALFNIAELKDVPFVILGNKIDAPNAVSEAELRSALGLLNTTGSQRI EGQRPVEVFMCSVVMRNGYLEAFQWLSQYI ; ;MAGWDIFGWFRDVLASLGLWNKHGKLLFLGLDNAGKTTLLHMLKNDRLATLQPTWHPTSEELAIGNIKFTTFDLGGHIQA RRLWKDYFPEVNGIVFLVDAADPERFDEARVELDALFNIAELKDVPFVILGNKIDAPNAVSEAELRSALGLLNTTGSQRI EGQRPVEVFMCSVVMRNGYLEAFQWLSQYI ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no PPP PPP D,H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MAGWDIFGWFRDVLASLGLWNKHGKLLFLGLDNAGKTTLLHMLKNDRLATLQPTWHPTSEELAIGNIKFTTFDLGGHIQA RRLWKDYFPEVNGIVFLVDAADPERFDEARVELDALFNIAELKDVPFVILGNKIDAPNAVSEAELRSALGLLNTTGSQRI EGQRPVEVFMCSVVMRNGYLEAFQWLSQY ; ;MAGWDIFGWFRDVLASLGLWNKHGKLLFLGLDNAGKTTLLHMLKNDRLATLQPTWHPTSEELAIGNIKFTTFDLGGHIQA RRLWKDYFPEVNGIVFLVDAADPERFDEARVELDALFNIAELKDVPFVILGNKIDAPNAVSEAELRSALGLLNTTGSQRI EGQRPVEVFMCSVVMRNGYLEAFQWLSQY ; G ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASP n 1 2 PHE n 1 3 GLU n 1 4 THR n 1 5 ASN n 1 6 GLU n 1 7 ASP n 1 8 ILE n 1 9 ASN n 1 10 GLY n 1 11 VAL n 1 12 ARG n 1 13 PHE n 1 14 THR n 1 15 TRP n 1 16 ASN n 1 17 VAL n 1 18 PHE n 1 19 PRO n 1 20 SER n 1 21 THR n 1 22 ARG n 1 23 SER n 1 24 ASP n 1 25 ALA n 1 26 ASN n 1 27 SER n 1 28 ASN n 1 29 VAL n 1 30 VAL n 1 31 PRO n 1 32 VAL n 1 33 GLY n 1 34 CYS n 1 35 LEU n 1 36 TYR n 1 37 THR n 1 38 PRO n 1 39 LEU n 1 40 LYS n 1 41 GLU n 1 42 TYR n 1 43 ASP n 1 44 GLU n 1 45 LEU n 1 46 ASN n 1 47 VAL n 1 48 ALA n 1 49 PRO n 1 50 TYR n 1 51 ASN n 1 52 PRO n 1 53 VAL n 1 54 VAL n 1 55 CYS n 1 56 SER n 1 57 GLY n 1 58 PRO n 1 59 HIS n 1 60 CYS n 1 61 LYS n 1 62 SER n 1 63 ILE n 1 64 LEU n 1 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 767 ;Baker's yeast ; ? ? ? ? ? ? ? ? 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'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER' ? 'C10 H17 N6 O13 P3' 522.196 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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TYR G 179 SER G 187 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? 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G GNP 201 G MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 294 A . ? ALA 295 A PRO 295 A ? PRO 296 A 1 7.07 2 PHE 705 A . ? PHE 706 A PRO 706 A ? PRO 707 A 1 -13.92 3 ALA 294 E . ? ALA 295 E PRO 295 E ? PRO 296 E 1 -1.68 4 PHE 705 E . ? PHE 706 E PRO 706 E ? PRO 707 E 1 -19.80 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 11 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 6 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 11 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 6 7 ? anti-parallel AA6 7 8 ? parallel AA6 8 9 ? parallel AA6 9 10 ? parallel AA6 10 11 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? parallel AB6 4 5 ? parallel AB6 5 6 ? parallel AB7 1 2 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC3 7 8 ? parallel AC3 8 9 ? parallel AC3 9 10 ? parallel AC3 10 11 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 18 ? 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VAL G 166 MET G 170 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N PHE A 18 ? 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