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EMD-11230 'other EM volume' PDB . 6ZPO unspecified EMDB . EMD-11342 'other EM volume' EMDB 'bovine ATP synthase monomer state 2 (combined)' EMD-11368 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6ZQM _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-07-10 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Spikes, T.E.' 1 0000-0002-2432-8006 'Montgomery, M.G.' 2 0000-0001-6142-9423 'Walker, J.E.' 3 0000-0001-7929-2162 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 117 _citation.language ? _citation.page_first 23519 _citation.page_last 23526 _citation.title 'Structure of the dimeric ATP synthase from bovine mitochondria.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2013998117 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32900941 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Spikes, T.E.' 1 0000-0002-2432-8006 primary 'Montgomery, M.G.' 2 ? primary 'Walker, J.E.' 3 0000-0001-7929-2162 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6ZQM _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ZQM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha, mitochondrial' 55302.191 3 ? ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase subunit beta, mitochondrial' 51757.836 3 7.1.2.2 ? ? ? 3 polymer nat 'ATP synthase subunit gamma, mitochondrial' 30300.760 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase subunit delta, mitochondrial' 15074.813 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial' 5662.693 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'ATPase inhibitor, mitochondrial' 7462.098 1 ? ? ? 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A postranslational modification.' 8 polymer nat 'ATP synthase subunit O, mitochondrial' 20959.777 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'ATP synthase protein 8' 7944.523 1 ? ? ? ? 10 polymer nat 'ATP synthase subunit a' 24801.785 1 ? ? ? ? 11 polymer nat 'ATP synthase subunit d, mitochondrial' 18588.256 1 ? ? ? ? 12 polymer nat 'ATP synthase subunit f, mitochondrial' 10184.011 1 ? ? ? ? 13 polymer nat 'ATP synthase subunit g, mitochondrial' 11298.196 1 ? ? ? ? 14 polymer nat 'ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial' 6846.093 1 ? ? ? ? 15 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial' 24702.709 1 ? ? ? ? 16 polymer nat 'ATP synthase-coupling factor 6, mitochondrial' 8971.079 1 ? ? ? ? 17 polymer nat 'ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial' 6312.383 1 ? ? ? ? 18 polymer nat 'ATP synthase subunit e, mitochondrial' 8205.492 1 ? ? ? ? 19 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 3 ? ? ? ? 20 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 5 ? ? ? ? 21 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 3 ? ? ? ? 22 non-polymer syn CARDIOLIPIN 1464.043 3 ? ? ? ? 23 non-polymer syn 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 722.970 2 ? ? ? ? 24 water nat water 18.015 17 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP synthase F1 subunit alpha' 3 'F-ATPase gamma subunit' 4 'F-ATPase delta subunit' 5 'ATPase subunit epsilon' 6 'Inhibitor of F(1)F(o)-ATPase,IF1' 7 ;ATP synthase lipid-binding protein,ATP synthase membrane subunit c locus 2,ATP synthase proteolipid P2,ATPase protein 9,ATPase subunit c ; 8 'ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP,Oligomycin sensitivity conferral protein,OSCP' 9 'A6L,F-ATPase subunit 8' 10 'F-ATPase protein 6' 11 'ATPase subunit d,ATP synthase peripheral stalk subunit d' 12 'ATP synthase membrane subunit f' 13 'ATPase subunit g,ATP synthase membrane subunit g' 14 '6.8 kDa mitochondrial proteolipid,6.8 kDa mitochondrial proteolipid protein,MLQ' 15 'ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b,ATP 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AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; ;EKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD 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;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE I ? 6 'polypeptide(L)' no no GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH J ? 7 'polypeptide(L)' no yes 'DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSL(M3L)QQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM' DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM K,L,M,N,O,P,Q,R ? 8 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; S ? 9 'polypeptide(L)' no no MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL 8 ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; a ? 11 'polypeptide(L)' no no ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; d ? 12 'polypeptide(L)' no no ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; f ? 13 'polypeptide(L)' no no ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; g ? 14 'polypeptide(L)' no no MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH j ? 15 'polypeptide(L)' no no ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; b ? 16 'polypeptide(L)' no no NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS h ? 17 'polypeptide(L)' no no AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT k ? 18 'polypeptide(L)' no no VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK e ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLU n 1 2 LYS n 1 3 THR n 1 4 GLY n 1 5 THR n 1 6 ALA n 1 7 GLU n 1 8 VAL n 1 9 SER n 1 10 SER n 1 11 ILE n 1 12 LEU n 1 13 GLU n 1 14 GLU n 1 15 ARG n 1 16 ILE n 1 17 LEU n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 ASP n 1 21 THR n 1 22 SER n 1 23 VAL n 1 24 ASP n 1 25 LEU n 1 26 GLU n 1 27 GLU n 1 28 THR n 1 29 GLY n 1 30 ARG n 1 31 VAL n 1 32 LEU n 1 33 SER n 1 34 ILE n 1 35 GLY n 1 36 ASP n 1 37 GLY n 1 38 ILE n 1 39 ALA n 1 40 ARG n 1 41 VAL n 1 42 HIS n 1 43 GLY n 1 44 LEU n 1 45 ARG n 1 46 ASN n 1 47 VAL n 1 48 GLN n 1 49 ALA n 1 50 GLU n 1 51 GLU n 1 52 MET n 1 53 VAL n 1 54 GLU n 1 55 PHE n 1 56 SER 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MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH 1 15 UNP AT5F1_BOVIN P13619 ? 15 ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; 43 16 UNP ATP5J_BOVIN P02721 ? 16 NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS 33 17 UNP ATPMD_BOVIN Q3ZBI7 ? 17 AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT 2 18 UNP ATP5I_BOVIN Q00361 ? 18 VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK 2 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ZQM A 1 ? 510 ? 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CARDIOLIPIN ;DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL; BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL ; 'C81 H156 O17 P2 -2' 1464.043 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 M3L 'L-peptide linking' n N-TRIMETHYLLYSINE ? 'C9 H21 N2 O2 1' 189.275 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.7171 ? 54883 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0466 ? 6353 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0041 ? 6942 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.8201 ? 5872 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6ZQM _struct.title 'bovine ATP synthase monomer state 2 (combined)' _struct.pdbx_descriptor ;ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, ATP synthase subunit beta, mitochondrial (E.C.7.1.2.2), ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, ATPase inhibitor, mitochondrial, ATP synthase subunit O, mitochondrial, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, ATP synthase subunit d, mitochondrial, ATP synthase-coupling factor 6, mitochondrial ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZQM _struct_keywords.text 'ATP synthase, mitochondria, mammalian, complex, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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THR 8 8 ILE 8 22 1 ? 15 HELX_P HELX_P176 AT5 ILE T 23 ? SER T 29 ? ILE 8 23 SER 8 29 1 ? 7 HELX_P HELX_P177 AT6 PHE U 6 ? ILE U 10 ? PHE a 6 ILE a 10 5 ? 5 HELX_P HELX_P178 AT7 LEU U 19 ? LEU U 30 ? LEU a 19 LEU a 30 1 ? 12 HELX_P HELX_P179 AT8 ASN U 40 ? SER U 59 ? ASN a 40 SER a 59 1 ? 20 HELX_P HELX_P180 AT9 ASN U 62 ? GLY U 86 ? ASN a 62 GLY a 86 1 ? 25 HELX_P HELX_P181 AU1 THR U 93 ? THR U 96 ? THR a 93 THR a 96 5 ? 4 HELX_P HELX_P182 AU2 GLN U 97 ? LYS U 120 ? GLN a 97 LYS a 120 1 ? 24 HELX_P HELX_P183 AU3 LYS U 120 ? HIS U 127 ? LYS a 120 HIS a 127 1 ? 8 HELX_P HELX_P184 AU4 PRO U 134 ? LEU U 137 ? PRO a 134 LEU a 137 5 ? 4 HELX_P HELX_P185 AU5 ILE U 138 ? MET U 182 ? ILE a 138 MET a 182 1 ? 45 HELX_P HELX_P186 AU6 SER U 185 ? ASN U 225 ? SER a 185 ASN a 225 1 ? 41 HELX_P HELX_P187 AU7 ASP V 11 ? GLY V 16 ? ASP d 11 GLY d 16 1 ? 6 HELX_P HELX_P188 AU8 GLU V 17 ? ILE V 19 ? GLU d 17 ILE d 19 5 ? 3 HELX_P HELX_P189 AU9 PRO V 20 ? ASN V 22 ? 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B MG 601 B HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? metalc13 metalc ? ? GA MG . MG ? ? ? 1_555 UA HOH . O ? ? B MG 601 B HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc14 metalc ? ? C THR 176 OG1 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? C THR 176 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? metalc15 metalc ? ? HA ATP . O2G ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc16 metalc ? ? HA ATP . O2B ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? C ATP 600 C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? metalc17 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc18 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? metalc19 metalc ? ? IA MG . MG ? ? ? 1_555 VA HOH . O ? ? C MG 601 C HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? metalc20 metalc ? ? D THR 167 OG1 ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? D THR 163 D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? metalc21 metalc ? ? JA ADP . O2B ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? 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F MG 601 F HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 269 A . ? ASP 269 A ASP 270 A ? ASP 270 A 1 -5.29 2 ARG 362 A . ? ARG 362 A PRO 363 A ? PRO 363 A 1 2.84 3 ASP 269 B . ? ASP 269 B ASP 270 B ? 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W ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? parallel D 1 2 ? parallel D 2 3 ? parallel D 3 4 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel E 5 6 ? anti-parallel E 6 7 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel G 5 6 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? parallel J 2 3 ? parallel J 3 4 ? parallel J 4 5 ? parallel J 5 6 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? anti-parallel N 6 7 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? parallel P 4 5 ? parallel P 5 6 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? anti-parallel Q 6 7 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel S 2 3 ? parallel S 3 4 ? parallel S 4 5 ? parallel S 5 6 ? parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? parallel U 1 2 ? parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel V 4 5 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 THR A 28 ? 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GLY B 35 ? GLY B 29 GLY B 35 F 1 ASP B 96 ? VAL B 99 ? ASP B 96 VAL B 99 F 2 ALA B 125 ? ARG B 128 ? ALA B 125 ARG B 128 G 1 ILE B 350 ? LEU B 352 ? ILE B 350 LEU B 352 G 2 ARG B 164 ? GLY B 169 ? ARG B 164 GLY B 169 G 3 SER B 320 ? GLU B 328 ? SER B 320 GLU B 328 G 4 HIS B 263 ? ASP B 269 ? HIS B 263 ASP B 269 G 5 TYR B 200 ? ILE B 206 ? TYR B 200 ILE B 206 G 6 ILE B 230 ? ALA B 234 ? ILE B 230 ALA B 234 H 1 ILE C 87 ? LYS C 89 ? ILE C 87 LYS C 89 H 2 THR C 28 ? GLY C 35 ? THR C 28 GLY C 35 H 3 ILE C 38 ? GLY C 43 ? ILE C 38 GLY C 43 H 4 VAL C 71 ? VAL C 75 ? VAL C 71 VAL C 75 H 5 LYS C 60 ? LEU C 66 ? LYS C 60 LEU C 66 H 6 MET C 52 ? GLU C 54 ? MET C 52 GLU C 54 I 1 ASP C 96 ? VAL C 99 ? ASP C 96 VAL C 99 I 2 ALA C 125 ? ARG C 128 ? ALA C 125 ARG C 128 J 1 ILE C 350 ? LEU C 352 ? ILE C 350 LEU C 352 J 2 ARG C 164 ? GLY C 169 ? ARG C 164 GLY C 169 J 3 SER C 320 ? ILE C 327 ? SER C 320 ILE C 327 J 4 HIS C 263 ? ASP C 269 ? HIS C 263 ASP C 269 J 5 LEU C 199 ? ILE C 206 ? LEU C 199 ILE C 206 J 6 THR C 229 ? ALA C 234 ? THR C 229 ALA C 234 K 1 ARG D 16 ? ILE D 21 ? ARG D 12 ILE D 17 K 2 VAL D 24 ? GLN D 28 ? VAL D 20 GLN D 24 K 3 THR D 61 ? ALA D 66 ? THR D 57 ALA D 62 K 4 VAL D 50 ? HIS D 56 ? VAL D 46 HIS D 52 K 5 ALA D 39 ? VAL D 42 ? ALA D 35 VAL D 38 K 6 VAL D 79 ? ASP D 81 ? VAL D 75 ASP D 77 L 1 ARG D 87 ? VAL D 90 ? ARG D 83 VAL D 86 L 2 GLN D 116 ? ALA D 119 ? GLN D 112 ALA D 115 M 1 ILE D 156 ? GLY D 160 ? ILE D 152 GLY D 156 M 2 SER D 307 ? TYR D 315 ? SER D 303 TYR D 311 M 3 ASP D 254 ? ILE D 259 ? ASP D 250 ILE D 255 N 1 THR E 14 ? ARG E 16 ? THR E 10 ARG E 12 N 2 LYS E 78 ? ASP E 81 ? LYS E 74 ASP E 77 N 3 ALA E 39 ? VAL E 42 ? ALA E 35 VAL E 38 N 4 VAL E 50 ? VAL E 53 ? VAL E 46 VAL E 49 N 5 THR E 61 ? ALA E 66 ? THR E 57 ALA E 62 N 6 VAL E 24 ? GLN E 28 ? VAL E 20 GLN E 24 N 7 ARG E 16 ? ILE E 21 ? ARG E 12 ILE E 17 O 1 ARG E 87 ? PRO E 89 ? ARG E 83 PRO E 85 O 2 PHE E 117 ? ALA E 119 ? PHE E 113 ALA E 115 P 1 ALA E 335 ? VAL E 338 ? 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LYS G 172 ILE G 178 T 2 GLY G 158 ? ARG G 164 ? GLY G 158 ARG G 164 T 3 ILE G 68 ? VAL G 71 ? ILE G 68 VAL G 71 T 4 ILE G 105 ? VAL G 108 ? ILE G 105 VAL G 108 T 5 PHE G 124 ? PHE G 128 ? PHE G 124 PHE G 128 U 1 SER H 17 ? SER H 22 ? SER H 17 SER H 22 U 2 SER H 89 ? ALA H 94 ? SER H 89 ALA H 94 U 3 GLY H 80 ? VAL H 84 ? GLY H 80 VAL H 84 U 4 THR H 54 ? VAL H 57 ? THR H 54 VAL H 57 V 1 PHE H 45 ? ILE H 47 ? PHE H 45 ILE H 47 V 2 VAL H 33 ? VAL H 38 ? VAL H 33 VAL H 38 V 3 GLY H 61 ? ALA H 67 ? GLY H 61 ALA H 67 V 4 THR H 72 ? VAL H 77 ? THR H 72 VAL H 77 V 5 ALA H 97 ? THR H 99 ? ALA H 97 THR H 99 W 1 VAL S 152 ? ILE S 154 ? VAL S 152 ILE S 154 W 2 CYS S 118 ? THR S 122 ? CYS S 118 THR S 122 W 3 ILE S 163 ? ILE S 166 ? ILE S 163 ILE S 166 W 4 LYS S 169 ? ASP S 172 ? LYS S 169 ASP S 172 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 O GLY A 29 ? O GLY A 29 N VAL A 88 ? N VAL A 88 A 2 3 O LYS A 89 ? O LYS A 89 N GLU A 54 ? N GLU A 54 A 3 4 O GLU A 51 ? O GLU A 51 N SER A 63 ? N SER A 63 A 4 5 O MET A 62 ? O MET A 62 N VAL A 74 ? N VAL A 74 A 5 6 O VAL A 71 ? O VAL A 71 N VAL A 41 ? N VAL A 41 A 6 7 O ARG A 40 ? O ARG A 40 N SER A 33 ? N SER A 33 B 1 2 O VAL A 97 ? O VAL A 97 N ARG A 127 ? N ARG A 127 C 1 2 O ILE A 350 ? O ILE A 350 N LEU A 166 ? N LEU A 166 C 2 3 O ILE A 167 ? O ILE A 167 N ILE A 327 ? N ILE A 327 D 1 2 O ILE A 230 ? O ILE A 230 N CYS A 201 ? N CYS A 201 D 2 3 O TYR A 200 ? O TYR A 200 N LEU A 265 ? N LEU A 265 D 3 4 O ALA A 264 ? O ALA A 264 N SER A 320 ? N SER A 320 E 1 2 O GLY B 29 ? O GLY B 29 N VAL B 88 ? N VAL B 88 E 2 3 O LYS B 89 ? O LYS B 89 N GLU B 54 ? N GLU B 54 E 3 4 O VAL B 53 ? O VAL B 53 N GLY B 61 ? N GLY B 61 E 4 5 O MET B 62 ? O MET B 62 N VAL B 74 ? N VAL B 74 E 5 6 O VAL B 71 ? O VAL B 71 N VAL B 41 ? N VAL B 41 E 6 7 O ILE B 38 ? O ILE B 38 N GLY B 35 ? N GLY B 35 F 1 2 O VAL B 97 ? O VAL B 97 N ARG B 127 ? N ARG B 127 G 1 2 O ILE B 350 ? O ILE B 350 N ILE B 168 ? N ILE B 168 G 2 3 O GLU B 165 ? O GLU B 165 N ALA B 323 ? N ALA B 323 G 3 4 O SER B 320 ? O SER B 320 N ALA B 264 ? N ALA B 264 G 4 5 O LEU B 265 ? O LEU B 265 N TYR B 200 ? N TYR B 200 G 5 6 O TYR B 203 ? O TYR B 203 N ILE B 230 ? N ILE B 230 H 1 2 O VAL C 88 ? O VAL C 88 N GLY C 29 ? N GLY C 29 H 2 3 O ARG C 30 ? O ARG C 30 N HIS C 42 ? N HIS C 42 H 3 4 O ALA C 39 ? O ALA C 39 N VAL C 73 ? N VAL C 73 H 4 5 O GLY C 72 ? O GLY C 72 N ASN C 65 ? N ASN C 65 H 5 6 O GLY C 61 ? O GLY C 61 N VAL C 53 ? N VAL C 53 I 1 2 O VAL C 97 ? O VAL C 97 N ARG C 127 ? N ARG C 127 J 1 2 O ILE C 350 ? O ILE C 350 N ILE C 168 ? N ILE C 168 J 2 3 O GLU C 165 ? O GLU C 165 N ALA C 323 ? N ALA C 323 J 3 4 O SER C 320 ? O SER C 320 N ALA C 264 ? N ALA C 264 J 4 5 O HIS C 263 ? O HIS C 263 N TYR C 200 ? N TYR C 200 J 5 6 O CYS C 201 ? O CYS C 201 N ILE C 230 ? N ILE C 230 K 1 2 O ARG D 16 ? O ARG D 12 N GLN D 28 ? 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O SER H 17 N VAL H 90 ? N VAL H 90 U 2 3 O GLN H 91 ? O GLN H 91 N THR H 83 ? N THR H 83 U 3 4 O VAL H 82 ? O VAL H 82 N GLN H 56 ? N GLN H 56 V 1 2 O PHE H 45 ? O PHE H 45 N VAL H 38 ? N VAL H 38 V 2 3 O ARG H 34 ? O ARG H 34 N HIS H 66 ? N HIS H 66 V 3 4 O GLY H 61 ? O GLY H 61 N VAL H 77 ? N VAL H 77 V 4 5 O PHE H 76 ? O PHE H 76 N VAL H 98 ? N VAL H 98 W 1 2 O LYS S 153 ? O LYS S 153 N VAL S 120 ? N VAL S 120 W 2 3 O THR S 119 ? O THR S 119 N ARG S 165 ? N ARG S 165 W 3 4 O VAL S 164 ? O VAL S 164 N VAL S 171 ? 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