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;MGGGDLNLKKSWHPQTLRNVEKVWKAEQKHEAERKKIEELQRELREERAREEMQRYAEDVGAVKKKEEKLDWMYQGPGGM VNRDEYLLGRPIDKYVFEKMEEKEAGCSSETGLLPGSIFAPSGANSLLDMASKIREDPLFIIRKKEEEKKREVLNNPVKM KKIKELLQMSLEKKEKKKKKEKKKKHKKHKHRSSSSDRSSSEDEHSAGRSQKKMANSSPVLSKVPGYGLQVRNSDRNQGL QGPLTAEQKRGHGMKNHSRSRSSSHSPPRHASKKSTREAGSRDRRSRSLGRRSRSPRPSKLHNSKVNRRETGQTRSPSPK KEVYQRRHAPGYTRKLSAEELERKRQEMMENAKWREEERLNILKRHAKDEEREQRLEKLDSRDGKFIHRMKLESASTSSL EDRVKRNIYSLQRTSVALEKNFMKR ; t ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MSERKVLNKYYPPDFDPSKIPKLKLPKDRQYVVRLMAPFNMRCKTCGEYIYKGKKFNARKETVQNEVYLGLPIFRFYIKC TRCLAEITFKTDPENTDYTMEHGATRNFQAEKLLEEEEKRVQKEREDEELNNPMKVLENRTKDSKLEMEVLENLQELKDL NQRQAHVDFEAMLRQHRL ; ;MSERKVLNKYYPPDFDPSKIPKLKLPKDRQYVVRLMAPFNMRCKTCGEYIYKGKKFNARKETVQNEVYLGLPIFRFYIKC TRCLAEITFKTDPENTDYTMEHGATRNFQAEKLLEEEEKRVQKEREDEELNNPMKVLENRTKDSKLEMEVLENLQELKDL NQRQAHVDFEAMLRQHRL ; u ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MAEYSYVKSTKLVLKGTKTKSKKKKSKDKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTL 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25 ;MAEYSYVKSTKLVLKGTKTKSKKKKSKDKKRKREEDEETQLDIVGIWWTVTNFGEISGTIAIEMDKGTYIHALDNGLFTL GAPHKEVDEGPSPPEQFTAVKLSDSRIALKSGYGKYLGINSDGLVVGRSDAIGPREQWEPVFQNGKMALLASNSCFIRCN EAGDIEAKSKTAGEEEMIKIRSCAERETKKKDDIPEEDKGNVKQCEINYVKKFQSFQDHKLKISKEDSKILKKARKDGFL HETLLDRRAKLKADRYCK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ZYM 2 1 ? 188 ? 36516 259 ? 446 ? 1 188 2 2 6ZYM 5 1 ? 116 ? 36515 1 ? 116 ? 1 116 3 3 6ZYM 6 1 ? 79 ? 6ZYM 1 ? 79 ? 1 79 4 4 6ZYM 9 1 ? 450 ? Q86X95 1 ? 450 ? 1 450 5 5 6ZYM A 1 ? 1755 ? Q6P2Q9 1 ? 1755 ? 1 1755 6 6 6ZYM B 1 ? 952 ? Q15029 1 ? 952 ? 1 952 7 7 6ZYM C 1 ? 536 ? Q13573 1 ? 536 ? 1 536 8 8 6ZYM D 1 ? 514 ? O43660 1 ? 514 ? 1 514 9 9 6ZYM E 1 ? 579 ? O60508 1 ? 579 ? 1 579 10 10 6ZYM F 1 ? 357 ? Q96DI7 1 ? 357 ? 1 357 11 11 6ZYM L 1 ? 802 ? Q99459 1 ? 802 ? 1 802 12 12 6ZYM O 1 ? 848 ? Q9BZJ0 1 ? 848 ? 1 848 13 13 6ZYM P 1 ? 218 ? Q9NW64 1 ? 218 ? 1 218 14 14 6ZYM Q 1 ? 144 ? P41223 1 ? 144 ? 1 144 15 15 6ZYM R 1 ? 229 ? Q9P013 1 ? 229 ? 1 229 16 16 6ZYM S 1 ? 2752 ? Q9UQ35 1 ? 2752 ? 1 2752 17 17 6ZYM T 1 ? 908 ? Q9HCG8 1 ? 908 ? 1 908 18 18 6ZYM V 1 ? 166 ? Q9Y3C6 1 ? 166 ? 1 166 19 19 6ZYM Y 1 ? 324 ? 6ZYM 1 ? 324 ? 1 324 20 19 6ZYM Z 1 ? 324 ? 6ZYM 1 ? 324 ? 1 324 21 20 6ZYM p 1 ? 654 ? Q9NW82 1 ? 654 ? 1 654 22 21 6ZYM r 1 ? 1227 ? Q92620 1 ? 1227 ? 1 1227 23 22 6ZYM s 1 ? 285 ? Q9ULR0 1 ? 285 ? 1 285 24 23 6ZYM t 1 ? 425 ? Q9NXE8 1 ? 425 ? 1 425 25 24 6ZYM u 1 ? 178 ? Q9BW85 1 ? 178 ? 1 178 26 25 6ZYM x 1 ? 258 ? Q14331 1 ? 258 ? 1 258 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GTP non-polymer n "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O14 P3' 523.180 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 IHP non-polymer . 'INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE' 'MYO-INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE; INOSITOL 1,2,3,4,5,6-HEXAKISPHOSPHATE' 'C6 H18 O24 P6' 660.035 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZYM _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6ZYM _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.011 ? 49836 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.200 ? 68647 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 22.138 ? 8767 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.083 ? 7701 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 7966 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6ZYM _struct.title 'Human C Complex Spliceosome - High-resolution CORE' _struct.pdbx_descriptor ;Corepressor interacting with RBPJ 1, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, SNW domain-containing protein 1, Pleiotropic regulator 1, Pre-mRNA-processing factor 17, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, Cell division cycle 5-like protein, Crooked neck-like protein 1, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, Protein BUD31 homolog, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1, WD repeat-containing protein 70, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, Pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, Splicing factor YJU2, Protein FRG1/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZYM _struct_keywords.text 'human C complex, spliceosome, hC, human step 1 spliceosome, SPLICING' _struct_keywords.pdbx_keywords SPLICING # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 19 ? U N N 20 ? V N N 21 ? W N N 22 ? X N N 23 ? Y N N 24 ? Z N N 25 ? AA N N 26 ? BA N N 26 ? CA N N 26 ? DA N N 26 ? EA N N 26 ? FA N N 27 ? GA N N 28 ? HA N N 29 ? IA N N 29 ? JA N N 29 ? KA N N 29 ? LA N N 29 ? MA N N 29 ? NA N N 29 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU E 27 ? TYR E 45 ? GLU A 27 TYR A 45 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO E 63 ? GLY E 74 ? PRO A 63 GLY A 74 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP E 84 ? ALA E 91 ? ASP A 84 ALA A 91 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 AA4 TYR E 94 ? GLU E 104 ? TYR A 94 GLU A 104 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE E 136 ? ARG E 156 ? ILE A 136 ARG A 156 1 ? 21 HELX_P HELX_P6 AA6 THR E 231 ? ALA E 242 ? THR A 231 ALA A 242 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP E 259 ? LEU E 269 ? ASP A 259 LEU A 269 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU E 311 ? PHE E 316 ? GLU A 311 PHE A 316 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO E 372 ? VAL E 384 ? PRO A 372 VAL A 384 5 ? 13 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN E 397 ? LEU E 404 ? ASN A 397 LEU A 404 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 AB2 ARG E 420 ? ILE E 424 ? ARG A 420 ILE A 424 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 VAL E 427 ? GLU E 433 ? VAL A 427 GLU A 433 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO E 440 ? LYS E 460 ? PRO A 440 LYS A 460 1 ? 21 HELX_P HELX_P14 AB5 TYR E 471 ? ALA E 478 ? TYR A 471 ALA A 478 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 AB6 TRP E 489 ? ASN E 505 ? TRP A 489 ASN A 505 1 ? 17 HELX_P HELX_P16 AB7 LEU E 506 ? LYS E 511 ? LEU A 506 LYS A 511 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 THR E 531 ? ARG E 539 ? THR A 531 ARG A 539 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY E 541 ? LEU E 566 ? GLY A 541 LEU A 566 1 ? 26 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP E 570 ? HIS E 584 ? ASP A 570 HIS A 584 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 AC2 HIS E 584 ? THR E 589 ? 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MG ? ? 6 G 75 6 MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? metalc8 metalc ? ? C G 75 OP1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? 6 G 75 6 MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? metalc9 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 S G 59 OP2 ? ? 6 MG 101 Y G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? ? metalc10 metalc ? ? M CYS 24 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? P CYS 24 P ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? ? metalc11 metalc ? ? M CYS 27 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? P CYS 27 P ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc12 metalc ? ? M CYS 45 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? P CYS 45 P ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? ? metalc13 metalc ? ? M CYS 48 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? P CYS 48 P ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? ? metalc14 metalc ? ? M CYS 71 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? P CYS 71 P ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc15 metalc ? ? M CYS 74 SG ? ? ? 1_555 JA ZN . ZN ? ? P CYS 74 P ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc16 metalc ? ? M CYS 81 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? P CYS 81 P ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? ? metalc17 metalc ? ? M CYS 84 SG ? ? ? 1_555 IA ZN . ZN ? ? P CYS 84 P ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? ? metalc18 metalc ? ? M CYS 165 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? P CYS 165 P ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? ? metalc19 metalc ? ? M CYS 173 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? P CYS 173 P ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc20 metalc ? ? M CYS 179 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? P CYS 179 P ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? ? metalc21 metalc ? ? M HIS 183 NE2 ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? P HIS 183 P ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? ? metalc22 metalc ? ? N CYS 101 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? Q CYS 101 Q ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? ? metalc23 metalc ? ? N CYS 101 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? Q CYS 101 Q ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? ? metalc24 metalc ? ? N CYS 102 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? Q CYS 102 Q ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc25 metalc ? ? N CYS 105 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? Q CYS 105 Q ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? ? metalc26 metalc ? ? N CYS 105 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? Q CYS 105 Q ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.560 ? ? metalc27 metalc ? ? N CYS 117 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? Q CYS 117 Q ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc28 metalc ? ? N CYS 119 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? Q CYS 119 Q ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? ? metalc29 metalc ? ? N CYS 119 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? Q CYS 119 Q ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? ? metalc30 metalc ? ? N CYS 134 SG ? ? ? 1_555 MA ZN . ZN ? ? Q CYS 134 Q ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? ? metalc31 metalc ? ? N CYS 137 SG ? ? ? 1_555 KA ZN . ZN ? ? Q CYS 137 Q ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? ? metalc32 metalc ? ? N CYS 139 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? Q CYS 139 Q ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? ? metalc33 metalc ? ? N CYS 142 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? Q CYS 142 Q ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? ? metalc34 metalc ? ? Y CYS 43 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? u CYS 43 u ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc35 metalc ? ? Y CYS 46 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? u CYS 46 u ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? ? metalc36 metalc ? ? Y CYS 80 SG ? ? ? 1_555 NA ZN . ZN ? ? u CYS 80 u ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A G 19 N1 ? ? ? 1_555 C A 56 N1 ? ? 2 G 19 6 A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 19 O6 ? ? ? 1_555 C A 56 N6 ? ? 2 G 19 6 A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 20 N1 ? ? ? 1_555 C C 55 N3 ? ? 2 G 20 6 C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 20 N2 ? ? ? 1_555 C C 55 O2 ? ? 2 G 20 6 C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 20 O6 ? ? ? 1_555 C C 55 N4 ? ? 2 G 20 6 C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A C 21 N3 ? ? ? 1_555 C G 54 N1 ? ? 2 C 21 6 G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A C 21 N4 ? ? ? 1_555 C G 54 O6 ? ? 2 C 21 6 G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A C 21 O2 ? ? ? 1_555 C G 54 N2 ? ? 2 C 21 6 G 54 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A U 22 N3 ? ? ? 1_555 C A 53 N1 ? ? 2 U 22 6 A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 22 O4 ? ? ? 1_555 C A 53 N6 ? ? 2 U 22 6 A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 25 N1 ? ? ? 1_555 C U 52 O2 ? ? 2 G 25 6 U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 25 O6 ? ? ? 1_555 C U 52 N3 ? ? 2 G 25 6 U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A A 26 N1 ? ? ? 1_555 C U 51 N3 ? ? 2 A 26 6 U 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A A 26 N6 ? ? ? 1_555 C U 51 O4 ? ? 2 A 26 6 U 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A U 27 N3 ? ? ? 1_555 C A 50 N1 ? ? 2 U 27 6 A 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A U 27 O4 ? ? ? 1_555 C A 50 N6 ? ? 2 U 27 6 A 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A C 28 N3 ? ? ? 1_555 C G 49 N1 ? ? 2 C 28 6 G 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A C 28 N4 ? ? ? 1_555 C G 49 O6 ? ? 2 C 28 6 G 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A C 28 O2 ? ? ? 1_555 C G 49 N2 ? ? 2 C 28 6 G 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A G 31 N1 ? ? ? 1_555 S C 158 N3 ? ? 2 G 31 Y C 158 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A G 31 N2 ? ? ? 1_555 S C 158 O2 ? ? 2 G 31 Y C 158 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A G 31 O6 ? ? ? 1_555 S C 158 N4 ? ? 2 G 31 Y C 158 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A G 33 N1 ? ? ? 1_555 S U 156 O2 ? ? 2 G 33 Y U 156 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A G 33 O6 ? ? ? 1_555 S U 156 N3 ? ? 2 G 33 Y U 156 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A U 34 O4 ? ? ? 1_555 S U 154 N3 ? ? 2 U 34 Y U 154 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A A 35 N1 ? ? ? 1_555 S U 153 N3 ? ? 2 A 35 Y U 153 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A A 35 N6 ? ? ? 1_555 S U 153 O4 ? ? 2 A 35 Y U 153 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 36 N2 ? ? ? 1_555 S U 60 O2 ? ? 2 G 36 Y U 60 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 36 N1 ? ? ? 1_555 S C 152 N3 ? ? 2 G 36 Y C 152 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A G 36 N2 ? ? ? 1_555 S C 152 O2 ? ? 2 G 36 Y C 152 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A G 36 O6 ? ? ? 1_555 S C 152 N4 ? ? 2 G 36 Y C 152 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A U 37 N3 ? ? ? 1_555 S A 151 N1 ? ? 2 U 37 Y A 151 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A U 37 O4 ? ? ? 1_555 S A 151 N6 ? ? 2 U 37 Y A 151 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A A 38 N1 ? ? ? 1_555 S U 150 N3 ? ? 2 A 38 Y U 150 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A A 38 N6 ? ? ? 1_555 S U 150 O4 ? ? 2 A 38 Y U 150 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A U 39 N3 ? ? ? 1_555 S A 149 N1 ? ? 2 U 39 Y A 149 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A U 39 O4 ? ? ? 1_555 S A 149 N6 ? ? 2 U 39 Y A 149 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A U 41 N3 ? ? ? 1_555 S U 145 O4 ? ? 2 U 41 Y U 145 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A U 41 O2 ? ? ? 1_555 S U 145 N3 ? ? 2 U 41 Y U 145 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A G 42 N1 ? ? ? 1_555 S G 143 O6 ? ? 2 G 42 Y G 143 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A U 43 O4 ? ? ? 1_555 S G 143 N1 ? ? 2 U 43 Y G 143 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? B C 4 N3 ? ? ? 1_555 B G 77 N1 ? ? 5 C 4 5 G 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? B C 4 N4 ? ? ? 1_555 B G 77 O6 ? ? 5 C 4 5 G 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? B C 4 O2 ? ? ? 1_555 B G 77 N2 ? ? 5 C 4 5 G 77 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? B U 5 N3 ? ? ? 1_555 B A 76 N1 ? ? 5 U 5 5 A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? B C 6 N4 ? ? ? 1_555 B G 75 O6 ? ? 5 C 6 5 G 75 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? B C 6 N4 ? ? ? 1_555 B A 76 N1 ? ? 5 C 6 5 A 76 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? B U 7 N3 ? ? ? 1_555 B U 74 O4 ? ? 5 U 7 5 U 74 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? B U 7 O2 ? ? ? 1_555 B U 74 N3 ? ? 5 U 7 5 U 74 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? B G 8 N3 ? ? ? 1_555 B C 73 N4 ? ? 5 G 8 5 C 73 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? B U 10 N3 ? ? ? 1_555 B A 67 N1 ? ? 5 U 10 5 A 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? B U 10 O4 ? ? ? 1_555 B A 67 N6 ? ? 5 U 10 5 A 67 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? 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AF3 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE3 5 6 ? anti-parallel AE3 6 7 ? anti-parallel AE3 7 8 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER E 127 ? 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PRO B 506 VAL B 509 AB4 3 ILE F 565 ? THR F 566 ? ILE B 565 THR B 566 AB4 4 MET F 475 ? TYR F 482 ? MET B 475 TYR B 482 AB4 5 HIS F 491 ? SER F 498 ? HIS B 491 SER B 498 AB4 6 TRP F 549 ? VAL F 550 ? TRP B 549 VAL B 550 AB5 1 ILE F 501 ? HIS F 502 ? ILE B 501 HIS B 502 AB5 2 ARG F 543 ? VAL F 544 ? ARG B 543 VAL B 544 AB6 1 LEU F 530 ? SER F 533 ? LEU B 530 SER B 533 AB6 2 HIS F 538 ? VAL F 541 ? HIS B 538 VAL B 541 AB7 1 THR F 618 ? VAL F 621 ? THR B 618 VAL B 621 AB7 2 HIS F 627 ? GLY F 631 ? HIS B 627 GLY B 631 AB7 3 ILE F 588 ? PRO F 594 ? ILE B 588 PRO B 594 AB7 4 ILE F 653 ? VAL F 655 ? ILE B 653 VAL B 655 AB8 1 THR F 618 ? VAL F 621 ? THR B 618 VAL B 621 AB8 2 HIS F 627 ? GLY F 631 ? HIS B 627 GLY B 631 AB8 3 ILE F 588 ? PRO F 594 ? ILE B 588 PRO B 594 AB8 4 VAL F 659 ? VAL F 660 ? VAL B 659 VAL B 660 AB9 1 CYS F 663 ? VAL F 666 ? CYS B 663 VAL B 666 AB9 2 PRO F 825 ? PRO F 839 ? PRO B 825 PRO B 839 AB9 3 LEU F 868 ? TYR F 869 ? LEU B 868 TYR B 869 AC1 1 HIS F 856 ? GLN F 859 ? 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Z LYS 170 9533 1 Y 1 x THR 171 ? Z THR 171 9534 1 Y 1 x ALA 172 ? Z ALA 172 9535 1 Y 1 x GLY 173 ? Z GLY 173 9536 1 Y 1 x GLU 174 ? Z GLU 174 9537 1 Y 1 x GLU 175 ? Z GLU 175 9538 1 Y 1 x GLU 176 ? Z GLU 176 9539 1 Y 1 x MET 177 ? Z MET 177 9540 1 Y 1 x ILE 178 ? Z ILE 178 9541 1 Y 1 x LYS 179 ? Z LYS 179 9542 1 Y 1 x ILE 180 ? Z ILE 180 9543 1 Y 1 x ARG 181 ? Z ARG 181 9544 1 Y 1 x SER 182 ? Z SER 182 9545 1 Y 1 x CYS 183 ? Z CYS 183 9546 1 Y 1 x ALA 184 ? Z ALA 184 9547 1 Y 1 x GLU 185 ? Z GLU 185 9548 1 Y 1 x ARG 186 ? Z ARG 186 9549 1 Y 1 x GLU 187 ? Z GLU 187 9550 1 Y 1 x THR 188 ? Z THR 188 9551 1 Y 1 x LYS 189 ? Z LYS 189 9552 1 Y 1 x LYS 190 ? Z LYS 190 9553 1 Y 1 x LYS 191 ? Z LYS 191 9554 1 Y 1 x ASP 192 ? Z ASP 192 9555 1 Y 1 x ASP 193 ? Z ASP 193 9556 1 Y 1 x ILE 194 ? Z ILE 194 9557 1 Y 1 x PRO 195 ? Z PRO 195 9558 1 Y 1 x GLU 196 ? Z GLU 196 9559 1 Y 1 x GLU 197 ? Z GLU 197 9560 1 Y 1 x ASP 198 ? Z ASP 198 9561 1 Y 1 x LYS 199 ? Z LYS 199 9562 1 Y 1 x GLY 200 ? Z GLY 200 9563 1 Y 1 x ASN 201 ? Z ASN 201 9564 1 Y 1 x VAL 202 ? Z VAL 202 9565 1 Y 1 x LYS 203 ? Z LYS 203 9566 1 Y 1 x GLN 204 ? Z GLN 204 9567 1 Y 1 x CYS 205 ? Z CYS 205 9568 1 Y 1 x GLU 206 ? Z GLU 206 9569 1 Y 1 x ILE 207 ? Z ILE 207 9570 1 Y 1 x ASN 208 ? Z ASN 208 9571 1 Y 1 x TYR 209 ? Z TYR 209 9572 1 Y 1 x VAL 210 ? Z VAL 210 9573 1 Y 1 x LYS 211 ? Z LYS 211 9574 1 Y 1 x LYS 212 ? Z LYS 212 9575 1 Y 1 x PHE 213 ? Z PHE 213 9576 1 Y 1 x GLN 214 ? Z GLN 214 9577 1 Y 1 x SER 215 ? Z SER 215 9578 1 Y 1 x PHE 216 ? Z PHE 216 9579 1 Y 1 x GLN 217 ? Z GLN 217 9580 1 Y 1 x ASP 218 ? Z ASP 218 9581 1 Y 1 x HIS 219 ? Z HIS 219 9582 1 Y 1 x LYS 220 ? Z LYS 220 9583 1 Y 1 x LEU 221 ? Z LEU 221 9584 1 Y 1 x LYS 222 ? Z LYS 222 9585 1 Y 1 x ILE 223 ? Z ILE 223 9586 1 Y 1 x SER 224 ? Z SER 224 9587 1 Y 1 x LYS 225 ? Z LYS 225 9588 1 Y 1 x GLU 226 ? Z GLU 226 9589 1 Y 1 x ASP 227 ? Z ASP 227 9590 1 Y 1 x SER 228 ? 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_em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain 'HeLa S3' _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 120 _em_image_recording.average_exposure_time 1 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 28279 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1751359 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? 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