data_7AJB # _entry.id 7AJB # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.338 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 7AJB WWPDB D_1292111450 EMDB EMD-11428 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-11428 'associated EM volume' PDB 'State1 monomer' 6ZPO unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7AJB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-09-29 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Spikes, T.E.' 1 0000-0002-2432-8006 'Montgomery, M.G.' 2 0000-0001-6142-9423 'Walker, J.E.' 3 0000-0001-7929-2162 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 118 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title ;Interface mobility between monomers in dimeric bovine ATP synthase participates in the ultrastructure of inner mitochondrial membranes. ; _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2021012118 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33542155 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Spikes, T.E.' 1 0000-0002-2432-8006 primary 'Montgomery, M.G.' 2 0000-0001-6142-9423 primary 'Walker, J.E.' 3 0000-0001-7929-2162 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase protein 8' 7944.523 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha, mitochondrial' 55302.191 6 ? ? ? ;Residue 1 of chains A, B, C. The uniprot database is misleading stating that GLN is the first residue. The DNA sequence for this protein encodes GLU. The actual residue is pyroGLU. However pyroGLU and pyroGLN are the same. Residue 481 in chains A, B, and C can be Gly or SER. e.g. in this structure should be GLY. We have seen SER in some of our previous structures of bovine F1-ATPase. We have used the following REMARK in other PDB files: Microhetrogeneity REMARK 999 SER 481 GLY IN CHAINS A, B AND C REMARK 999 WAS IDENTIFIED AS A GLY FROM THE PROTEIN REMARK 999 SEQUENCE. IN THE CDNA SEQUENCE, THE CODON FOR THIS REMARK 999 RESIDUE WAS AGC SER IN THREE CLONES WHILE IN TWO REMARK 999 OTHERS IT WAS GGC GLY. THE DIFFERENCE WAS THOUGHT TO REMARK 999 BE DUE TO A MUTATION OCCURRING DURING EITHER PROPAGATION REMARK 999 OF THE CLONES IN THE LIBRARY OR SUBCLONING INTO M13 REMARK 999 VECTORS. THE ELECTRON DENSITY SUGGESTS A GLY IN REMARK 999 THIS POSITION. ; 3 polymer nat 'ATP synthase subunit beta, mitochondrial' 51757.836 6 7.1.2.2 ? ? ? 4 polymer nat 'ATP synthase subunit gamma, mitochondrial' 30300.760 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'ATP synthase subunit delta, mitochondrial' 15074.813 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial' 5662.693 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'ATPase inhibitor, mitochondrial' 7462.098 2 ? ? ? 'Residues 1-60 of IF1 with a 6 His tag' 8 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial' 7653.034 16 ? ? ? 'Residue 43 is post translationally modified to tri-methyl-lysine' 9 polymer nat 'ATP synthase subunit O, mitochondrial' 20959.777 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 'ATP synthase subunit a' 24801.785 2 ? ? ? ? 11 polymer nat 'ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial' 24702.709 2 ? ? ? ? 12 polymer nat 'ATP synthase subunit d, mitochondrial' 18588.256 2 ? ? ? ? 13 polymer nat 'ATP synthase subunit e, mitochondrial' 8205.492 2 ? ? ? ? 14 polymer nat 'ATP synthase subunit f, mitochondrial' 10184.011 2 ? ? ? ? 15 polymer nat 'ATP synthase subunit g, mitochondrial' 11298.196 2 ? ? ? ? 16 polymer nat 'ATP synthase-coupling factor 6, mitochondrial' 8971.079 2 ? ? ? ? 17 polymer nat 'ATP synthase subunit ATP5MPL, mitochondrial' 6846.093 2 ? ? ? ? 18 polymer nat 'ATP synthase membrane subunit DAPIT, mitochondrial' 6312.383 2 ? ? ? ? 19 non-polymer syn CARDIOLIPIN 1464.043 6 ? ? ? ? 20 non-polymer syn 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 722.970 4 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'A6L,F-ATPase subunit 8' 2 'ATP synthase F1 subunit alpha' 4 'F-ATPase gamma subunit' 5 'F-ATPase delta subunit' 6 'ATPase subunit epsilon' 7 'Inhibitor of F(1)F(o)-ATPase,IF1' 8 ;ATP synthase lipid-binding protein,ATP synthase membrane subunit c locus 2,ATP synthase proteolipid P2,ATPase protein 9,ATPase subunit c ; 9 'ATP synthase peripheral stalk subunit OSCP,Oligomycin sensitivity conferral protein,OSCP' 10 'F-ATPase protein 6' 11 'ATP synthase peripheral stalk-membrane subunit b,ATP synthase subunit b,ATPase subunit b' 12 'ATPase subunit d,ATP synthase peripheral stalk subunit d' 13 'ATPase subunit e,ATP synthase membrane subunit e' 14 'ATP synthase membrane subunit f' 15 'ATPase subunit g,ATP synthase membrane subunit g' 16 'ATPase subunit F6,ATP synthase peripheral stalk subunit F6' 17 '6.8 kDa mitochondrial proteolipid,6.8 kDa mitochondrial proteolipid protein,MLQ' 18 'Diabetes-associated protein in insulin-sensitive tissues,Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTPTKMLKQNTPWETKWTKIYLPLLLPL 8,A8 ? 2 'polypeptide(L)' no no ;EKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; ;EKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG RGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAA PLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGS LTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREV AAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALL GKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA ; A,B,C,AA,AB,AC ? 3 'polypeptide(L)' no no ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD LTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDEL SEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEE HS ; ;AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL DSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFG GAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTG LTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADD LTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDEL SEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEE HS ; D,E,F,AD,AE,AF ? 4 'polypeptide(L)' no no ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD ; G,AG ? 5 'polypeptide(L)' no no ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; H,AH ? 6 'polypeptide(L)' no no VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE I,AI ? 7 'polypeptide(L)' no no GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH GSESGDNVRSSAGAVRDAGGAFGKREQAEEERYFRARAKEQLAALKKHHENEISHHAKEIHHHHHH J,AJ ? 8 'polypeptide(L)' no yes 'DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSL(M3L)QQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM' DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM K,L,M,N,O,P,Q,R,AK,AL,AM,AN,AO,AP,AQ,AR ? 9 'polypeptide(L)' no no ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; ;FAKLVRPPVQIYGIEGRYATALYSAASKQNKLEQVEKELLRVGQILKEPKMAASLLNPYVKRSVKVKSLSDMTAKEKFSP LTSNLINLLAENGRLTNTPAVISAFSTMMSVHRGEVPCTVTTASALDEATLTELKTVLKSFLSKGQVLKLEVKIDPSIMG GMIVRIGEKYVDMSAKTKIQKLSRAMREIL ; S,AS ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; ;MNENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIG STNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRL TANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT ; a,Aa ? 11 'polypeptide(L)' no no ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; ;PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGE FADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEKSQQALVQKRHYLFDVQRNNIAMALEVTYRERLHRVYREVKNRLDYHIS VQNMMRQKEQEHMINWVEKRVVQSISAQQEKETIAKCIADLKLLSKKAQAQPVM ; b,Ab ? 12 'polypeptide(L)' no no ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; ;AGRKLALKTIDWVAFGEIIPRNQKAVANSLKSWNETLTSRLATLPEKPPAIDWAYYKANVAKAGLVDDFEKKFNALKVPI PEDKYTAQVDAEEKEDVKSCAEFLTQSKTRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIETL ; d,Ad ? 13 'polypeptide(L)' no no VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK VPPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK e,Ae ? 14 'polypeptide(L)' no no ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; ;ASVVPLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKH ERLRKYH ; f,Af ? 15 'polypeptide(L)' no no ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; ;AEFVRNLAEKAPALVNAAVTYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVAT EVWMWFYVGEIIGKRGIIGYDV ; g,Ag ? 16 'polypeptide(L)' no no NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS NKELDPVQKLFVDKIREYRTKRQTSGGPVDAGPEYQQDLDRELFKLKQMYGKADMNTFPNFTFEDPKFEVVEKPQS h,Ah ? 17 'polypeptide(L)' no no MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH MLQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALKASSAAPAHGHH j,Aj ? 18 'polypeptide(L)' no no AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT AGPEADAQFHFTGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLRSKKTPAVKAT k,Ak ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 PRO n 1 3 GLN n 1 4 LEU n 1 5 ASP n 1 6 THR n 1 7 SER n 1 8 THR n 1 9 TRP n 1 10 LEU n 1 11 THR n 1 12 MET n 1 13 ILE n 1 14 LEU n 1 15 SER n 1 16 MET n 1 17 PHE n 1 18 LEU n 1 19 THR n 1 20 LEU n 1 21 PHE n 1 22 ILE n 1 23 ILE n 1 24 PHE n 1 25 GLN n 1 26 LEU n 1 27 LYS n 1 28 VAL n 1 29 SER n 1 30 LYS n 1 31 HIS n 1 32 ASN n 1 33 PHE n 1 34 TYR n 1 35 HIS n 1 36 ASN n 1 37 PRO n 1 38 GLU n 1 39 LEU n 1 40 THR n 1 41 PRO n 1 42 THR n 1 43 LYS n 1 44 MET n 1 45 LEU n 1 46 LYS n 1 47 GLN n 1 48 ASN n 1 49 THR n 1 50 PRO n 1 51 TRP n 1 52 GLU n 1 53 THR n 1 54 LYS n 1 55 TRP n 1 56 THR n 1 57 LYS n 1 58 ILE n 1 59 TYR n 1 60 LEU n 1 61 PRO n 1 62 LEU n 1 63 LEU n 1 64 LEU n 1 65 PRO n 1 66 LEU n 2 1 GLU n 2 2 LYS n 2 3 THR n 2 4 GLY n 2 5 THR n 2 6 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'expression tag' 66 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CDL non-polymer . CARDIOLIPIN ;DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL; BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL ; 'C81 H156 O17 P2 -2' 1464.043 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 M3L 'L-peptide linking' n N-TRIMETHYLLYSINE ? 'C9 H21 N2 O2 1' 189.275 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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P M3L 43 C ? ? ? 1_555 P GLN 44 N ? ? O M3L 43 O GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale11 covale both ? Q LEU 42 C ? ? ? 1_555 Q M3L 43 N ? ? P LEU 42 P M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale12 covale both ? Q M3L 43 C ? ? ? 1_555 Q GLN 44 N ? ? P M3L 43 P GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale13 covale both ? R LEU 42 C ? ? ? 1_555 R M3L 43 N ? ? Q LEU 42 Q M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale14 covale both ? R M3L 43 C ? ? ? 1_555 R GLN 44 N ? ? Q M3L 43 Q GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale15 covale both ? S LEU 42 C ? ? ? 1_555 S M3L 43 N ? ? R LEU 42 R M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale16 covale both ? S M3L 43 C ? ? ? 1_555 S GLN 44 N ? ? R M3L 43 R GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale17 covale both ? OA LEU 42 C ? ? ? 1_555 OA M3L 43 N ? ? AK LEU 42 AK M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale18 covale both ? OA M3L 43 C ? ? ? 1_555 OA GLN 44 N ? ? AK M3L 43 AK GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale19 covale both ? PA LEU 42 C ? ? ? 1_555 PA M3L 43 N ? ? AL LEU 42 AL M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale20 covale both ? PA M3L 43 C ? ? ? 1_555 PA GLN 44 N ? ? AL M3L 43 AL GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale21 covale both ? QA LEU 42 C ? ? ? 1_555 QA M3L 43 N ? ? AM LEU 42 AM M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale22 covale both ? QA M3L 43 C ? ? ? 1_555 QA GLN 44 N ? ? AM M3L 43 AM GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale23 covale both ? RA LEU 42 C ? ? ? 1_555 RA M3L 43 N ? ? AN LEU 42 AN M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale24 covale both ? RA M3L 43 C ? ? ? 1_555 RA GLN 44 N ? ? AN M3L 43 AN GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale25 covale both ? SA LEU 42 C ? ? ? 1_555 SA M3L 43 N ? ? AO LEU 42 AO M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale26 covale both ? SA M3L 43 C ? ? ? 1_555 SA GLN 44 N ? ? AO M3L 43 AO GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale27 covale both ? TA LEU 42 C ? ? ? 1_555 TA M3L 43 N ? ? AP LEU 42 AP M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale28 covale both ? TA M3L 43 C ? ? ? 1_555 TA GLN 44 N ? ? AP M3L 43 AP GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale29 covale both ? UA LEU 42 C ? ? ? 1_555 UA M3L 43 N ? ? AQ LEU 42 AQ M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale30 covale both ? UA M3L 43 C ? ? ? 1_555 UA GLN 44 N ? ? AQ M3L 43 AQ GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale31 covale both ? VA LEU 42 C ? ? ? 1_555 VA M3L 43 N ? ? AR LEU 42 AR M3L 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale32 covale both ? VA M3L 43 C ? ? ? 1_555 VA GLN 44 N ? ? AR M3L 43 AR GLN 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 269 B . ? ASP 269 A ASP 270 B ? ASP 270 A 1 10.43 2 ARG 362 B . ? ARG 362 A PRO 363 B ? PRO 363 A 1 5.96 3 ASP 269 C . ? ASP 269 B ASP 270 C ? ASP 270 B 1 -6.30 4 ARG 362 C . ? ARG 362 B PRO 363 C ? PRO 363 B 1 -1.63 5 ASP 269 D . ? ASP 269 C ASP 270 D ? ASP 270 C 1 -4.56 6 ARG 362 D . ? ARG 362 C PRO 363 D ? PRO 363 C 1 3.75 7 ASP 260 E . ? ASP 256 D ASN 261 E ? ASN 257 D 1 -12.99 8 TYR 349 E . ? TYR 345 D PRO 350 E ? PRO 346 D 1 -1.90 9 ASP 260 F . ? ASP 256 E ASN 261 F ? ASN 257 E 1 11.96 10 TYR 349 F . ? TYR 345 E PRO 350 F ? PRO 346 E 1 3.14 11 ASP 260 G . ? ASP 256 F ASN 261 G ? ASN 257 F 1 9.44 12 TYR 349 G . ? TYR 345 F PRO 350 G ? PRO 346 F 1 3.09 13 TRP 152 W . ? TRP 152 d PRO 153 W ? PRO 153 d 1 0.36 14 ASP 269 EA . ? ASP 269 AA ASP 270 EA ? ASP 270 AA 1 10.30 15 ARG 362 EA . ? ARG 362 AA PRO 363 EA ? PRO 363 AA 1 5.93 16 ASP 269 FA . ? ASP 269 AB ASP 270 FA ? ASP 270 AB 1 -6.23 17 ARG 362 FA . ? ARG 362 AB PRO 363 FA ? PRO 363 AB 1 -1.68 18 ASP 269 GA . ? ASP 269 AC ASP 270 GA ? ASP 270 AC 1 -4.55 19 ARG 362 GA . ? ARG 362 AC PRO 363 GA ? PRO 363 AC 1 3.78 20 ASP 260 HA . ? ASP 256 AD ASN 261 HA ? ASN 257 AD 1 -12.98 21 TYR 349 HA . ? TYR 345 AD PRO 350 HA ? PRO 346 AD 1 -1.81 22 ASP 260 IA . ? ASP 256 AE ASN 261 IA ? ASN 257 AE 1 11.92 23 TYR 349 IA . ? TYR 345 AE PRO 350 IA ? PRO 346 AE 1 3.16 24 ASP 260 JA . ? ASP 256 AF ASN 261 JA ? ASN 257 AF 1 9.44 25 TYR 349 JA . ? TYR 345 AF PRO 350 JA ? PRO 346 AF 1 3.07 26 TRP 152 ZA . ? TRP 152 Ad PRO 153 ZA ? PRO 153 Ad 1 0.38 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 7 ? B ? 2 ? C ? 6 ? D ? 7 ? E ? 2 ? F ? 3 ? G ? 4 ? H ? 7 ? I ? 2 ? J ? 5 ? K ? 7 ? L ? 2 ? M ? 5 ? N ? 7 ? O ? 2 ? P ? 6 ? Q ? 7 ? R ? 2 ? S ? 6 ? T ? 5 ? U ? 5 ? V ? 5 ? W ? 2 ? X ? 4 ? Y ? 7 ? Z ? 2 ? AA ? 6 ? AB ? 7 ? AC ? 2 ? AD ? 3 ? AE ? 4 ? AF ? 7 ? AG ? 2 ? AH ? 5 ? AI ? 7 ? AJ ? 2 ? AK ? 5 ? AL ? 7 ? AM ? 2 ? AN ? 6 ? AO ? 7 ? AP ? 2 ? AQ ? 6 ? AR ? 5 ? AS ? 5 ? AT ? 5 ? AU ? 2 ? AV ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? parallel C 3 4 ? parallel C 4 5 ? parallel C 5 6 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel F 2 3 ? parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel H 6 7 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? parallel J 2 3 ? parallel J 3 4 ? parallel J 4 5 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? anti-parallel K 6 7 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? parallel M 3 4 ? parallel M 4 5 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? anti-parallel N 6 7 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? parallel P 4 5 ? parallel P 5 6 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? anti-parallel Q 6 7 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel S 2 3 ? parallel S 3 4 ? parallel S 4 5 ? parallel S 5 6 ? parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? parallel U 4 5 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel V 4 5 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel X 1 2 ? parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 4 5 ? anti-parallel Y 5 6 ? anti-parallel Y 6 7 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? parallel AA 2 3 ? parallel AA 3 4 ? parallel AA 4 5 ? parallel AA 5 6 ? parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AB 4 5 ? anti-parallel AB 5 6 ? anti-parallel AB 6 7 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? parallel AD 2 3 ? parallel AE 1 2 ? parallel AE 2 3 ? parallel AE 3 4 ? parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AF 4 5 ? anti-parallel AF 5 6 ? anti-parallel AF 6 7 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AH 1 2 ? parallel AH 2 3 ? parallel AH 3 4 ? parallel AH 4 5 ? parallel AI 1 2 ? anti-parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AI 4 5 ? anti-parallel AI 5 6 ? anti-parallel AI 6 7 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AK 1 2 ? parallel AK 2 3 ? parallel AK 3 4 ? parallel AK 4 5 ? parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AL 4 5 ? anti-parallel AL 5 6 ? anti-parallel AL 6 7 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? parallel AN 2 3 ? parallel AN 3 4 ? parallel AN 4 5 ? parallel AN 5 6 ? parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? anti-parallel AO 3 4 ? anti-parallel AO 4 5 ? anti-parallel AO 5 6 ? anti-parallel AO 6 7 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AQ 1 2 ? parallel AQ 2 3 ? parallel AQ 3 4 ? parallel AQ 4 5 ? parallel AQ 5 6 ? parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? parallel AR 3 4 ? parallel AR 4 5 ? parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? parallel AS 4 5 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AU 1 2 ? parallel AV 1 2 ? parallel AV 2 3 ? anti-parallel AV 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 THR B 28 ? ARG B 30 ? THR A 28 ARG A 30 A 2 ILE B 87 ? ARG B 90 ? ILE A 87 ARG A 90 A 3 GLU B 51 ? PHE B 55 ? GLU A 51 PHE A 55 A 4 LYS B 60 ? LEU B 66 ? LYS A 60 LEU A 66 A 5 VAL B 71 ? VAL B 75 ? VAL A 71 VAL A 75 A 6 ILE B 38 ? GLY B 43 ? ILE A 38 GLY A 43 A 7 GLY B 29 ? GLY B 35 ? GLY A 29 GLY A 35 B 1 ASP B 96 ? VAL B 99 ? ASP A 96 VAL A 99 B 2 ALA B 125 ? ARG B 128 ? ALA A 125 ARG A 128 C 1 VAL B 107 ? ASP B 109 ? VAL A 107 ASP A 109 C 2 THR B 229 ? ALA B 234 ? THR A 229 ALA A 234 C 3 TYR B 200 ? ILE B 206 ? TYR A 200 ILE A 206 C 4 HIS B 263 ? ASP B 269 ? HIS A 263 ASP A 269 C 5 SER B 320 ? GLU B 328 ? SER A 320 GLU A 328 C 6 ARG B 164 ? GLY B 169 ? ARG A 164 GLY A 169 D 1 THR C 28 ? ARG C 30 ? THR B 28 ARG B 30 D 2 ILE C 87 ? ARG C 90 ? ILE B 87 ARG B 90 D 3 MET C 52 ? PHE C 55 ? MET B 52 PHE B 55 D 4 LYS C 60 ? LEU C 66 ? LYS B 60 LEU B 66 D 5 VAL C 71 ? VAL C 75 ? VAL B 71 VAL B 75 D 6 ILE C 38 ? GLY C 43 ? ILE B 38 GLY B 43 D 7 GLY C 29 ? SER C 33 ? GLY B 29 SER B 33 E 1 ASP C 96 ? 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