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O18330 1 ? 432 ? 1 432 2 2 7ASD AB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 3 1 7ASD BA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 4 2 7ASD BB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 5 1 7ASD CA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 6 2 7ASD CB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 7 1 7ASD DA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 8 2 7ASD DB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 9 1 7ASD EA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 10 2 7ASD EB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 11 1 7ASD FA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 12 2 7ASD FB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 13 1 7ASD GA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 14 2 7ASD GB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 15 1 7ASD HA 1 ? 432 ? O18330 1 ? 432 ? 1 432 16 2 7ASD HB 1 ? 78 ? Q8ISL8 1 ? 78 ? 1 78 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 94R non-polymer . '(3beta,14beta,17alpha)-ergosta-5,24(28)-dien-3-ol' 24-methylenecholesterol 'C28 H46 O' 398.664 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SO4 non-polymer . 'SULFATE ION' ? 'O4 S -2' 96.063 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7ASD _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7ASD _struct.title 'Structure of native royal jelly filaments' _struct.pdbx_descriptor 'Major royal jelly protein 1, Apisimin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7ASD _struct_keywords.text 'protein filament, lipoprotein, glycosylation, royal jelly, major royal jelly protein, honeybee, PROTEIN FIBRIL' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN FIBRIL' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? 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ALA D 74 ? SER BB 56 ALA BB 74 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 SER E 46 ? SER E 56 ? SER CA 46 SER CA 56 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO E 171 ? VAL E 176 ? PRO CA 171 VAL CA 176 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 SER E 228 ? ASP E 232 ? SER CA 228 ASP CA 232 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP E 234 ? PHE E 237 ? ASP CA 234 PHE CA 237 5 ? 4 HELX_P HELX_P25 AC7 GLU E 281 ? THR E 285 ? GLU CA 281 THR CA 285 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO E 367 ? ARG E 371 ? PRO CA 367 ARG CA 371 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS E 384 ? ASN E 391 ? LYS CA 384 ASN CA 391 1 ? 8 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL E 407 ? ILE E 411 ? VAL CA 407 ILE CA 411 1 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 SER F 34 ? GLY F 52 ? SER CB 34 GLY CB 52 1 ? 19 HELX_P HELX_P30 AD3 SER F 56 ? ALA F 74 ? SER CB 56 ALA CB 74 1 ? 19 HELX_P HELX_P31 AD4 SER G 46 ? SER G 56 ? SER DA 46 SER DA 56 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO G 171 ? VAL G 176 ? PRO DA 171 VAL DA 176 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 SER G 228 ? ASP G 232 ? SER DA 228 ASP DA 232 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP G 234 ? 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SER HB 56 ALA HB 74 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 118 SG ? ? ? 1_555 A CYS 150 SG ? ? AA CYS 118 AA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 132 SG ? ? ? 1_555 A CYS 195 SG ? ? AA CYS 132 AA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 329 SG ? ? ? 1_555 A CYS 416 SG ? ? AA CYS 329 AA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 118 SG ? ? ? 1_555 C CYS 150 SG ? ? BA CYS 118 BA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 132 SG ? ? ? 1_555 C CYS 195 SG ? ? BA CYS 132 BA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 329 SG ? ? ? 1_555 C CYS 416 SG ? ? BA CYS 329 BA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf7 disulf ? ? E CYS 118 SG ? ? ? 1_555 E CYS 150 SG ? ? CA CYS 118 CA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf8 disulf ? ? E CYS 132 SG ? ? ? 1_555 E CYS 195 SG ? ? CA CYS 132 CA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf9 disulf ? ? E CYS 329 SG ? ? ? 1_555 E CYS 416 SG ? ? CA CYS 329 CA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf10 disulf ? ? G CYS 118 SG ? ? ? 1_555 G CYS 150 SG ? ? DA CYS 118 DA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf11 disulf ? ? G CYS 132 SG ? ? ? 1_555 G CYS 195 SG ? ? DA CYS 132 DA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 329 SG ? ? ? 1_555 G CYS 416 SG ? ? DA CYS 329 DA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf13 disulf ? ? I CYS 118 SG ? ? ? 1_555 I CYS 150 SG ? ? EA CYS 118 EA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? I CYS 132 SG ? ? ? 1_555 I CYS 195 SG ? ? EA CYS 132 EA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 329 SG ? ? ? 1_555 I CYS 416 SG ? ? EA CYS 329 EA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf16 disulf ? ? K CYS 118 SG ? ? ? 1_555 K CYS 150 SG ? ? FA CYS 118 FA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf17 disulf ? ? K CYS 132 SG ? ? ? 1_555 K CYS 195 SG ? ? FA CYS 132 FA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf18 disulf ? ? K CYS 329 SG ? ? ? 1_555 K CYS 416 SG ? ? FA CYS 329 FA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf19 disulf ? ? M CYS 118 SG ? ? ? 1_555 M CYS 150 SG ? ? GA CYS 118 GA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf20 disulf ? ? M CYS 132 SG ? ? ? 1_555 M CYS 195 SG ? ? GA CYS 132 GA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf21 disulf ? ? M CYS 329 SG ? ? ? 1_555 M CYS 416 SG ? ? GA CYS 329 GA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf22 disulf ? ? O CYS 118 SG ? ? ? 1_555 O CYS 150 SG ? ? HA CYS 118 HA CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf23 disulf ? ? O CYS 132 SG ? ? ? 1_555 O CYS 195 SG ? ? HA CYS 132 HA CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf24 disulf ? ? O CYS 329 SG ? ? ? 1_555 O CYS 416 SG ? ? HA CYS 329 HA CYS 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale one ? A ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? AA ASN 28 AA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? AA ASN 144 AAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? AA ASN 177 A NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? BA ASN 28 BA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? BA ASN 144 BAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? C ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? BA ASN 177 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? E ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? CA ASN 28 CA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? E ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? CA ASN 144 CAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? E ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? CA ASN 177 C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? G ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? DA ASN 28 DA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? G ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? DA ASN 144 DAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? G ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? DA ASN 177 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? I ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? EA ASN 28 EA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? I ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? EA ASN 144 EAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? I ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? EA ASN 177 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? K ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? FA ASN 28 FA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? K ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? FA ASN 144 FAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? K ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? FA ASN 177 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? M ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? GA ASN 28 GA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? M ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? GA ASN 144 GAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? M ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? GA ASN 177 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? O ASN 28 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? HA ASN 28 HA NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? O ASN 144 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? HA ASN 144 HAc NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? O ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? HA ASN 177 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale25 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? AAc NAG 1 AAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale26 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A NAG 1 A NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale27 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? A NAG 2 A BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale28 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? BAc NAG 1 BAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale29 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale30 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? B NAG 2 B BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale31 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? CAc NAG 1 CAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale32 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale33 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? C NAG 2 C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale34 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? DAc NAG 1 DAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale35 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale36 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? D NAG 2 D BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale37 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? EAc NAG 1 EAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale38 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale39 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? E NAG 2 E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale40 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? FAc NAG 1 FAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale41 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale42 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale43 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? GAc NAG 1 GAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale44 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale45 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale46 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? HAc NAG 1 HAc NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale47 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale48 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? H NAG 2 H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 107 A . ? TYR 107 AA PRO 108 A ? PRO 108 AA 1 -2.70 2 LEU 363 A . ? LEU 363 AA PRO 364 A ? PRO 364 AA 1 -1.00 3 TYR 107 C . ? TYR 107 BA PRO 108 C ? PRO 108 BA 1 -2.68 4 LEU 363 C . ? LEU 363 BA PRO 364 C ? PRO 364 BA 1 -1.09 5 TYR 107 E . ? TYR 107 CA PRO 108 E ? PRO 108 CA 1 -2.71 6 LEU 363 E . ? LEU 363 CA PRO 364 E ? PRO 364 CA 1 -0.99 7 TYR 107 G . ? TYR 107 DA PRO 108 G ? PRO 108 DA 1 -2.73 8 LEU 363 G . ? LEU 363 DA PRO 364 G ? PRO 364 DA 1 -1.01 9 TYR 107 I . ? TYR 107 EA PRO 108 I ? PRO 108 EA 1 -2.80 10 LEU 363 I . ? LEU 363 EA PRO 364 I ? PRO 364 EA 1 -1.01 11 TYR 107 K . ? TYR 107 FA PRO 108 K ? PRO 108 FA 1 -2.84 12 LEU 363 K . ? LEU 363 FA PRO 364 K ? PRO 364 FA 1 -1.03 13 TYR 107 M . ? TYR 107 GA PRO 108 M ? PRO 108 GA 1 -2.70 14 LEU 363 M . ? LEU 363 GA PRO 364 M ? PRO 364 GA 1 -1.07 15 TYR 107 O . ? TYR 107 HA PRO 108 O ? PRO 108 HA 1 -2.75 16 LEU 363 O . ? LEU 363 HA PRO 364 O ? PRO 364 HA 1 -1.01 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 4 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 4 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 4 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 4 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 4 ? AG8 ? 4 ? AG9 ? 4 ? AH1 ? 2 ? AH2 ? 4 ? AH3 ? 2 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? anti-parallel AG6 1 2 ? parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH2 3 4 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH4 3 4 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH5 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ILE A 33 ? 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RELION 3.0 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'European Molecular Biology Organization (EMBO)' 'European Union' 'ALTF 793-2017' 1 'Human Frontier Science Program (HFSP)' 'European Union' LT000008/2018-L 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero Q 3 NAG 1 AAc NAG 1 AAc NAG 1440 n Q 3 NAG 2 AAc NAG 2 AAc NAG 1441 n R 4 NAG 1 A NAG 1 AAc NAG 1770 n R 4 NAG 2 A NAG 2 AAc NAG 1771 n R 4 BMA 3 A BMA 3 AAc BMA 1772 n S 3 NAG 1 BAc NAG 1 BAc NAG 1440 n S 3 NAG 2 BAc NAG 2 BAc NAG 1441 n T 4 NAG 1 B NAG 1 BAc NAG 1770 n T 4 NAG 2 B NAG 2 BAc NAG 1771 n T 4 BMA 3 B BMA 3 BAc BMA 1772 n U 3 NAG 1 CAc NAG 1 CAc NAG 1440 n U 3 NAG 2 CAc NAG 2 CAc NAG 1441 n V 4 NAG 1 C NAG 1 CAc NAG 1770 n V 4 NAG 2 C NAG 2 CAc NAG 1771 n V 4 BMA 3 C BMA 3 CAc BMA 1772 n W 3 NAG 1 DAc NAG 1 DAc NAG 1440 n W 3 NAG 2 DAc NAG 2 DAc NAG 1441 n X 4 NAG 1 D NAG 1 DAc NAG 1770 n X 4 NAG 2 D NAG 2 DAc NAG 1771 n X 4 BMA 3 D BMA 3 DAc BMA 1772 n Y 3 NAG 1 EAc NAG 1 EAc NAG 1440 n Y 3 NAG 2 EAc NAG 2 EAc NAG 1441 n Z 4 NAG 1 E NAG 1 EAc NAG 1770 n Z 4 NAG 2 E NAG 2 EAc NAG 1771 n Z 4 BMA 3 E BMA 3 EAc BMA 1772 n AA 3 NAG 1 FAc NAG 1 FAc NAG 1440 n AA 3 NAG 2 FAc NAG 2 FAc NAG 1441 n BA 4 NAG 1 F NAG 1 FAc NAG 1770 n BA 4 NAG 2 F NAG 2 FAc NAG 1771 n BA 4 BMA 3 F BMA 3 FAc BMA 1772 n CA 3 NAG 1 GAc NAG 1 GAc NAG 1440 n CA 3 NAG 2 GAc NAG 2 GAc NAG 1441 n DA 4 NAG 1 G NAG 1 GAc NAG 1770 n DA 4 NAG 2 G NAG 2 GAc NAG 1771 n DA 4 BMA 3 G BMA 3 GAc BMA 1772 n EA 3 NAG 1 HAc NAG 1 HAc NAG 1440 n EA 3 NAG 2 HAc NAG 2 HAc NAG 1441 n FA 4 NAG 1 H NAG 1 HAc NAG 1770 n FA 4 NAG 2 H NAG 2 HAc NAG 1771 n FA 4 BMA 3 H BMA 3 HAc BMA 1772 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 3 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 3 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 3 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 4 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 4 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 3 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 4 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 BMA 3 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 5 '(3beta,14beta,17alpha)-ergosta-5,24(28)-dien-3-ol' 94R 6 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 7 'SULFATE ION' SO4 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'Cryo-electron tomography, cryo-electron imaging and reconstruction.' #