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E . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7DAC _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLID-STATE NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7DAC _struct.title 'Human RIPK3 amyloid fibril revealed by solid-state NMR' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7DAC _struct_keywords.text 'programmed necrosis, amyloid, PROTEIN FIBRIL' _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN FIBRIL' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code RIPK3_HUMAN _struct_ref.pdbx_db_accession Q9Y572 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;SPGPRGNQGAERQGMNWSCRTPEPNPVTGRPLVNIYNCSGVQVGDNNYLTMQQTTALPTWGLAPSGKGRGLQHPPPVGSQ EGPKDPEAWSRPQGWYNHSGK ; _struct_ref.pdbx_align_begin 418 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7DAC A 8 ? 108 ? Q9Y572 418 ? 518 ? -28 72 2 1 7DAC B 8 ? 108 ? Q9Y572 418 ? 518 ? -28 72 3 1 7DAC C 8 ? 108 ? Q9Y572 418 ? 518 ? -28 72 4 1 7DAC D 8 ? 108 ? Q9Y572 418 ? 518 ? -28 72 5 1 7DAC E 8 ? 108 ? Q9Y572 418 ? 518 ? -28 72 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7DAC MET A 1 ? UNP Q9Y572 ? ? 'initiating methionine' -35 1 1 7DAC HIS A 2 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -34 2 1 7DAC HIS A 3 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -33 3 1 7DAC HIS A 4 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -32 4 1 7DAC HIS A 5 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -31 5 1 7DAC HIS A 6 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -30 6 1 7DAC HIS A 7 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -29 7 2 7DAC MET B 1 ? UNP Q9Y572 ? ? 'initiating methionine' -35 8 2 7DAC HIS B 2 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -34 9 2 7DAC HIS B 3 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -33 10 2 7DAC HIS B 4 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -32 11 2 7DAC HIS B 5 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -31 12 2 7DAC HIS B 6 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -30 13 2 7DAC HIS B 7 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -29 14 3 7DAC MET C 1 ? UNP Q9Y572 ? ? 'initiating methionine' -35 15 3 7DAC HIS C 2 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -34 16 3 7DAC HIS C 3 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -33 17 3 7DAC HIS C 4 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -32 18 3 7DAC HIS C 5 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -31 19 3 7DAC HIS C 6 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -30 20 3 7DAC HIS C 7 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -29 21 4 7DAC MET D 1 ? UNP Q9Y572 ? ? 'initiating methionine' -35 22 4 7DAC HIS D 2 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -34 23 4 7DAC HIS D 3 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -33 24 4 7DAC HIS D 4 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -32 25 4 7DAC HIS D 5 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -31 26 4 7DAC HIS D 6 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -30 27 4 7DAC HIS D 7 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -29 28 5 7DAC MET E 1 ? UNP Q9Y572 ? ? 'initiating methionine' -35 29 5 7DAC HIS E 2 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -34 30 5 7DAC HIS E 3 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -33 31 5 7DAC HIS E 4 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -32 32 5 7DAC HIS E 5 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -31 33 5 7DAC HIS E 6 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -30 34 5 7DAC HIS E 7 ? UNP Q9Y572 ? ? 'expression tag' -29 35 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9580 ? 1 MORE -34 ? 1 'SSA (A^2)' 8520 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 microscopy 'dark field beam-tilt electron microscope experiments determined the mass-per-length which indicated a one-fold amyloid structure' 2 1 none 'X-ray experiment displayed two typical distance of amyloid structure.' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL A 40 ? ASN A 44 ? VAL A 4 ASN A 8 AA1 2 VAL B 40 ? ASN B 44 ? VAL B 4 ASN B 8 AA1 3 VAL C 40 ? ASN C 44 ? VAL C 4 ASN C 8 AA1 4 LEU D 39 ? ASN D 44 ? LEU D 3 ASN D 8 AA1 5 LEU E 39 ? ASN E 44 ? LEU E 3 ASN E 8 AA2 1 VAL A 48 ? ASP A 52 ? VAL A 12 ASP A 16 AA2 2 VAL B 48 ? ASP B 52 ? VAL B 12 ASP B 16 AA2 3 GLY C 47 ? ASP C 52 ? GLY C 11 ASP C 16 AA2 4 GLY D 47 ? ASP D 52 ? GLY D 11 ASP D 16 AA2 5 VAL E 48 ? ASP E 52 ? VAL E 12 ASP E 16 AA3 1 LEU A 56 ? THR A 62 ? LEU A 20 THR A 26 AA3 2 LEU B 56 ? ALA B 63 ? LEU B 20 ALA B 27 AA3 3 LEU C 56 ? ALA C 63 ? LEU C 20 ALA C 27 AA3 4 LEU D 56 ? ALA D 63 ? LEU D 20 ALA D 27 AA3 5 MET E 58 ? ALA E 63 ? MET E 22 ALA E 27 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N ILE A 42 ? N ILE A 6 O ASN B 41 ? O ASN B 5 AA1 2 3 N TYR B 43 ? N TYR B 7 O ASN C 44 ? O ASN C 8 AA1 3 4 N TYR C 43 ? N TYR C 7 O ASN D 44 ? O ASN D 8 AA1 4 5 N TYR D 43 ? N TYR D 7 O ASN E 44 ? O ASN E 8 AA2 1 2 N VAL A 50 ? N VAL A 14 O GLN B 49 ? O GLN B 13 AA2 2 3 N VAL B 50 ? N VAL B 14 O GLN C 49 ? O GLN C 13 AA2 3 4 N VAL C 50 ? N VAL C 14 O GLY D 51 ? O GLY D 15 AA2 4 5 N VAL D 50 ? N VAL D 14 O GLY E 51 ? O GLY E 15 AA3 1 2 N THR A 61 ? N THR A 25 O THR B 62 ? O THR B 26 AA3 2 3 N THR B 61 ? N THR B 25 O THR C 62 ? O THR C 26 AA3 3 4 N THR C 61 ? N THR C 25 O THR D 62 ? O THR D 26 AA3 4 5 N THR D 61 ? N THR D 25 O THR E 62 ? O THR E 26 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 18 ? ? -144.09 -102.97 2 1 TYR B 7 ? ? -93.73 -68.96 3 1 ASN B 18 ? ? -139.36 -138.28 4 1 TYR C 7 ? ? -95.66 -67.10 5 1 TYR D 7 ? ? -96.84 -66.44 6 1 TYR E 7 ? ? -106.70 -70.67 7 1 ASN E 18 ? ? -114.83 -154.45 8 2 ASN A 18 ? ? -120.12 -96.65 9 2 TYR B 7 ? ? -91.10 -70.35 10 2 ASP B 16 ? ? -166.35 108.07 11 2 TYR C 7 ? ? -92.97 -71.12 12 2 TYR D 7 ? ? -93.62 -71.86 13 2 TYR E 7 ? ? -99.89 -80.78 14 3 TYR A 7 ? ? -96.79 -126.74 15 3 ASN A 18 ? ? 78.48 -152.38 16 3 TYR B 7 ? ? -97.32 -111.06 17 3 TYR C 7 ? ? -99.87 -88.52 18 3 TYR D 7 ? ? -95.21 -72.23 19 3 TYR E 7 ? ? -107.51 -84.29 20 4 TYR A 7 ? ? -92.62 -114.80 21 4 TYR B 7 ? ? -92.12 -84.47 22 4 TYR C 7 ? ? -96.92 -84.36 23 4 TYR D 7 ? ? -95.80 -83.08 24 4 TYR E 7 ? ? -104.47 -87.09 25 5 LEU A 3 ? ? 57.56 83.72 26 5 TYR A 7 ? ? -99.32 -129.89 27 5 PRO B 2 ? ? -94.34 -77.23 28 5 LEU B 3 ? ? 70.72 74.84 29 5 TYR B 7 ? ? -100.82 -128.04 30 5 LEU C 3 ? ? 54.13 72.62 31 5 TYR C 7 ? ? -91.38 -142.19 32 5 PRO D 2 ? ? -96.57 -141.80 33 5 LEU D 3 ? ? 78.94 62.44 34 6 TYR A 7 ? ? -99.39 -127.59 35 6 TYR A 19 ? ? -170.55 149.10 36 6 TYR B 7 ? ? -100.90 -125.22 37 6 TYR C 7 ? ? -95.86 -125.53 38 6 TYR D 7 ? ? -94.06 -132.35 39 6 ASP D 16 ? ? 75.95 164.47 40 6 TYR E 7 ? ? -97.05 -148.68 41 7 ASN A 8 ? ? -173.01 -171.70 42 7 SER B 10 ? ? 84.51 -61.41 43 7 LEU C 3 ? ? 59.10 78.02 44 7 LEU D 3 ? ? 80.35 74.83 45 7 LEU E 3 ? ? 66.32 87.86 46 7 TYR E 7 ? ? -151.46 74.04 47 8 TYR A 7 ? ? -98.52 -129.84 48 8 SER A 10 ? ? -85.67 37.78 49 8 LEU B 3 ? ? -124.90 -153.92 50 8 TYR B 7 ? ? -98.92 -124.98 51 8 SER B 10 ? ? -86.04 42.24 52 8 ASP B 16 ? ? -98.16 -103.55 53 8 TYR C 7 ? ? -100.26 -127.14 54 8 SER C 10 ? ? -83.44 41.27 55 8 LEU D 3 ? ? -125.37 -154.48 56 8 TYR D 7 ? ? -98.84 -143.95 57 8 TYR E 7 ? ? -109.97 -168.86 58 8 SER E 10 ? ? -82.77 36.58 59 9 LEU A 3 ? ? 61.88 87.75 60 9 TYR A 7 ? ? -97.29 -126.81 61 9 SER A 10 ? ? -87.93 44.19 62 9 LEU B 3 ? ? 63.14 88.22 63 9 TYR B 7 ? ? -100.56 -134.80 64 9 SER B 10 ? ? -83.85 43.74 65 9 LEU C 3 ? ? 64.99 89.55 66 9 TYR C 7 ? ? -98.95 -137.52 67 9 SER C 10 ? ? -82.23 43.84 68 9 LEU D 3 ? ? 62.42 87.59 69 9 TYR D 7 ? ? -93.20 -151.49 70 9 ASN D 17 ? ? -172.72 -177.98 71 9 LEU E 3 ? ? 62.44 85.37 72 9 SER E 10 ? ? -83.15 49.89 73 9 ASN E 17 ? ? -173.04 -172.36 74 10 ASN B 18 ? ? 72.46 -139.61 75 10 ASN C 18 ? ? 76.92 -135.80 76 10 ASN D 18 ? ? -111.99 -154.09 77 10 GLN E 13 ? ? -168.72 81.20 78 11 ASN A 8 ? ? -174.47 -175.73 79 11 ASN A 18 ? ? -174.31 -169.88 80 11 ASN B 8 ? ? -132.77 -148.50 81 11 CYS B 9 ? ? -150.02 -23.52 82 11 ASN B 18 ? ? -101.23 -151.71 83 11 ASN C 8 ? ? -178.50 -135.01 84 11 SER C 10 ? ? 89.56 -63.08 85 11 SER D 10 ? ? 84.07 -86.26 86 11 LEU D 28 ? ? -130.52 -59.77 87 12 LEU A 3 ? ? 61.07 87.81 88 12 ASN A 8 ? ? -179.14 -155.30 89 12 ASP A 16 ? ? -171.83 -169.39 90 12 ASN A 18 ? ? 78.12 179.38 91 12 LEU B 3 ? ? 61.46 86.74 92 12 ASN B 8 ? ? -161.24 -166.64 93 12 VAL B 12 ? ? 167.93 121.21 94 12 ASP B 16 ? ? -171.24 -178.10 95 12 ASN B 18 ? ? 76.16 174.33 96 12 LEU C 3 ? ? 62.18 87.56 97 12 ASN C 8 ? ? -144.28 -156.36 98 12 ASP C 16 ? ? -174.24 -170.40 99 12 ASN C 18 ? ? 70.49 -177.71 100 12 LEU D 3 ? ? 61.64 91.09 101 12 ASN D 18 ? ? 76.91 163.57 102 12 LEU E 3 ? ? 63.45 88.70 103 12 ASN E 18 ? ? 92.26 139.40 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 7DAC _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 96 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 12 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 7DAC _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria medoid # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 '5 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] human RIPK3 fibrils, 95% H2O/5% D2O' '95% H2O/5% D2O' 'uniformly labeled human RIPK3 fibrils' 'gel solid' 'uniformly labeled human RIPK3 with 13C-gulcose and 15N-NH4Cl for carbon and nitrogen source, respectively.' 2 '5 mg/mL [U-100% 2-13C Glycerol; U-100% 15N] human RIPK3 fibrils, 95% H2O/5% D2O' '95% H2O/5% D2O' '2-13C glycerol, 15N labeled human RIPK3 fibrils' 'gel solid' '2-13C glycerol, 15N labeled human RIPK3 with 2-13C glycerol and 15N-NH4Cl for carbon and nitrogen source, respectively.' 3 '5 mg/mL [U-100% 1, 3-13C Glycerol; U-100% 15N] human RIPK3 fibrils, 95% H2O/5% D2O' '95% H2O/5% D2O' '1, 3-13C glycerol, 15N labeled human RIPK3 fibrils' 'gel solid' '1, 3-13C glycerol, 15N labeled human RIPK3 with 1, 3-13C glycerol and 15N-NH4Cl for carbon and nitrogen source, respectively.' 4 '5 mg/mL [U-50% 13C; natural abundance N][natural abandance 13C; U-50% 15N] human RIPK3 fibrils, 95% H2O/5% D2O' '95% H2O/5% D2O' '[U-50% 13C; natural abundance N][natural abandance 13C; U-50% 15N] mixed-labeled human RIPK3 fibrils' 'gel solid' '[U-50% 13C; natural abundance N] labeled human RIPK3 mixed with [natural abandance 13C; U-50% 15N] at 1:1 molar ratio.' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 'human RIPK3 fibrils' 5 ? mg/mL '[U-100% 13C; U-100% 15N]' 2 'human RIPK3 fibrils' 5 ? mg/mL '[U-100% 2-13C Glycerol; U-100% 15N]' 3 'human RIPK3 fibrils' 5 ? mg/mL '[U-100% 1, 3-13C Glycerol; U-100% 15N]' 4 'human RIPK3 fibrils' 5 ? mg/mL '[U-50% 13C; natural abundance N][natural abandance 13C; U-50% 15N]' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.5 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details 'dialyzed in H2O for 3 days with pH adjusted to 7.5' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err 0.5 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label H2O _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err 0.05 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err 0.01 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err 0.5 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D DARR 50ms mixing' 1 isotropic 15 1 1 '2D DARR 200ms mixing' 1 isotropic 16 1 1 '2D DARR 500ms mixing' 1 isotropic 2 1 1 '2D NcaCX 50ms mixing' 1 isotropic 3 1 1 '2D NcoCX 50ms mixing' 1 isotropic 4 1 1 '3D NCACX 50ms mixing' 1 isotropic 5 1 1 '3D NCOCX 50ms mixing' 1 isotropic 17 1 1 'zTEDOR 6.4ms mixing' 1 isotropic 19 1 1 'zTEDOR 8.5ms mixing' 1 isotropic 18 1 1 '2D RFDR 10.7ms mixing' 1 isotropic 20 1 1 '2D INEPT-TOBSY' 1 isotropic 6 1 2 '2D DARR 50ms mixing' 1 isotropic 7 1 2 '2D DARR 200ms mixing' 1 isotropic 8 1 2 '2D DARR 500ms mixing' 1 isotropic 21 1 2 'zTEDOR 6.4ms mixing' 1 isotropic 22 1 2 'zTEDOR 8.5ms mixing' 1 isotropic 37 1 2 '2D NcaCX 50ms mixing' 1 isotropic 38 1 2 '2D NcoCX 50ms mixing' 1 isotropic 9 1 3 '2D DARR 50ms mixing' 1 isotropic 10 1 3 '2D DARR 200ms mixing' 1 isotropic 11 1 3 '2D DARR 500ms mixing' 1 isotropic 24 1 3 'zTEDOR 6.4ms mixing' 1 isotropic 26 1 3 'zTEDOR 8.5ms mixing' 1 isotropic 39 1 3 '2D NcaCX 50ms mixing' 1 isotropic 40 1 3 '2D NcoCX 50ms mixing' 1 isotropic 12 1 4 '2D DARR 50ms mixing' 1 isotropic 13 1 4 '2D DARR 200ms mixing' 1 isotropic 14 1 4 '2D DARR 500ms mixing' 1 isotropic 27 1 4 'zTEDOR 6.4ms mixing' 1 isotropic 28 1 4 'zTEDOR 8.5ms mixing' 1 isotropic 29 1 4 '2D NHHC' 1 anisotropic 30 1 1 '2D DARR 50ms mixing' 2 isotropic 31 1 1 '2D DARR 200ms mixing' 2 isotropic 32 1 1 '2D DARR 500ms mixing' 2 isotropic 33 1 1 '2D NcaCX 50ms mixing' 2 isotropic 34 1 1 '2D NcoCX 50ms mixing' 2 isotropic 35 1 1 '3D NCACX 50ms mixing' 2 isotropic 36 1 1 '3D NCOCX 50ms mixing' 2 isotropic # _pdbx_nmr_refine.entry_id 7DAC _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 2 # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 refinement CNS ? 'Brunger A. T. et.al.' 2 'structure calculation' 'X-PLOR NIH' ? 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 3 'chemical shift assignment' Sparky ? Goddard 4 'peak picking' Sparky ? Goddard # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET -35 ? A MET 1 2 1 Y 1 A HIS -34 ? A HIS 2 3 1 Y 1 A HIS -33 ? A HIS 3 4 1 Y 1 A HIS -32 ? A HIS 4 5 1 Y 1 A HIS -31 ? A HIS 5 6 1 Y 1 A HIS -30 ? A HIS 6 7 1 Y 1 A HIS -29 ? A HIS 7 8 1 Y 1 A SER -28 ? A SER 8 9 1 Y 1 A PRO -27 ? A PRO 9 10 1 Y 1 A GLY -26 ? A GLY 10 11 1 Y 1 A PRO -25 ? A PRO 11 12 1 Y 1 A ARG -24 ? A ARG 12 13 1 Y 1 A GLY -23 ? A GLY 13 14 1 Y 1 A ASN -22 ? A ASN 14 15 1 Y 1 A GLN -21 ? A GLN 15 16 1 Y 1 A GLY -20 ? A GLY 16 17 1 Y 1 A ALA -19 ? A ALA 17 18 1 Y 1 A GLU -18 ? A GLU 18 19 1 Y 1 A ARG -17 ? A ARG 19 20 1 Y 1 A GLN -16 ? A GLN 20 21 1 Y 1 A GLY -15 ? A GLY 21 22 1 Y 1 A MET -14 ? A MET 22 23 1 Y 1 A ASN -13 ? A ASN 23 24 1 Y 1 A TRP -12 ? A TRP 24 25 1 Y 1 A SER -11 ? A SER 25 26 1 Y 1 A CYS -10 ? A CYS 26 27 1 Y 1 A ARG -9 ? A ARG 27 28 1 Y 1 A THR -8 ? A THR 28 29 1 Y 1 A PRO -7 ? A PRO 29 30 1 Y 1 A GLU -6 ? A GLU 30 31 1 Y 1 A PRO -5 ? A PRO 31 32 1 Y 1 A ASN -4 ? A ASN 32 33 1 Y 1 A PRO -3 ? A PRO 33 34 1 Y 1 A VAL -2 ? A VAL 34 35 1 Y 1 A THR -1 ? A THR 35 36 1 Y 1 A GLY 0 ? A GLY 36 37 1 Y 1 A THR 30 ? A THR 66 38 1 Y 1 A TRP 31 ? A TRP 67 39 1 Y 1 A GLY 32 ? A GLY 68 40 1 Y 1 A LEU 33 ? A LEU 69 41 1 Y 1 A ALA 34 ? A ALA 70 42 1 Y 1 A PRO 35 ? A PRO 71 43 1 Y 1 A SER 36 ? A SER 72 44 1 Y 1 A GLY 37 ? A GLY 73 45 1 Y 1 A LYS 38 ? 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