data_7DR7 # _entry.id 7DR7 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.387 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7DR7 pdb_00007dr7 10.2210/pdb7dr7/pdb WWPDB D_1300019924 ? ? EMDB EMD-30825 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2021-01-20 2 'Structure model' 1 1 2021-02-17 3 'Structure model' 1 2 2024-03-27 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' chem_comp_atom 4 3 'Structure model' chem_comp_bond 5 3 'Structure model' database_2 # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 5 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 6 2 'Structure model' '_citation.page_first' 7 2 'Structure model' '_citation.page_last' 8 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 9 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 10 2 'Structure model' '_citation.title' 11 2 'Structure model' '_citation.year' 12 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 13 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7DR7 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-12-26 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'bovine 20S immunoproteasome' _pdbx_database_related.db_id EMD-30825 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Xu, C.' 1 ? 'Cong, Y.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 739 _citation.page_last 739 _citation.title 'Cryo-EM of mammalian PA28 alpha beta-iCP immunoproteasome reveals a distinct mechanism of proteasome activation by PA28 alpha beta.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-21028-3 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33531497 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Chen, J.' 1 ? primary 'Wang, Y.' 2 ? primary 'Xu, C.' 3 ? primary 'Chen, K.' 4 ? primary 'Zhao, Q.' 5 ? primary 'Wang, S.' 6 ? primary 'Yin, Y.' 7 ? primary 'Peng, C.' 8 0000-0002-6814-2676 primary 'Ding, Z.' 9 ? primary 'Cong, Y.' 10 0000-0002-7164-8694 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-7' 27911.912 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-5' 26435.977 2 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-1' 29625.654 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-3' 28441.197 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-6' 27432.459 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-2' 25927.535 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Proteasome subunit alpha type-4' 29525.842 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-3' 23016.947 2 3.4.25.1 ? ? ? 9 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-2' 22924.309 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-1' 26278.059 2 3.4.25.1 ? ? ? 11 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-4' 29057.018 2 3.4.25.1 ? ? ? 12 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-9' 23427.428 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-10' 29128.318 2 3.4.25.1 ? ? ? 14 polymer nat 'Proteasome subunit beta type-8' 30304.332 2 3.4.25.1 ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 8 'Proteasome chain 13,Proteasome component C10-II,Proteasome theta chain' 12 'Proteasome subunit beta-1i' 13 'Proteasome subunit beta-2i' 14 'Proteasome subunit beta-5i' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGKDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGKDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; A,O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; B,P ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPTQPADEPAEKADEPMEH ; ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPTQPADEPAEKADEPMEH ; C,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAG LLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYG YWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGEITNGRHEIVPKDVREEAEKYA KESLKEEDESDDDNM ; ;MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAG LLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYG YWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGEITNGRHEIVPKDVREEAEKYA KESLKEEDESDDDNM ; D,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; E,L ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; F,M ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; G,N ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCTEQMYGMCESLWEPNMDP EHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCTEQMYGMCESLWEPNMDP EHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; H,S ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADYLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISREKAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDRNGIHDLDNISFPKQGS ; ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADYLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISREKAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDRNGIHDLDNISFPKQGS ; I,T ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MLSSVAAYSGAGRDLAMEPHSSVGPLQLRFSPYAFNGGTVLAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVI GCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQR DSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALKVCIVTKEGIRGETVPLRK D ; ;MLSSVAAYSGAGRDLAMEPHSSVGPLQLRFSPYAFNGGTVLAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVI GCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQR DSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALKVCIVTKEGIRGETVPLRK D ; J,U ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MEALLESRSGLWAGGPAPGQFYRIPPTPGSSVDPVSALYGSPITRTQNPMVTGTSVLGLKFEGGVVIAADMLGSYGSLAR FRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGY ADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTEARELVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEK GVEIEGPLSAETNWDIAHMISGFE ; ;MEALLESRSGLWAGGPAPGQFYRIPPTPGSSVDPVSALYGSPITRTQNPMVTGTSVLGLKFEGGVVIAADMLGSYGSLAR FRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGY ADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTEARELVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEK GVEIEGPLSAETNWDIAHMISGFE ; K,V ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MLRTGAPNGDLPRAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLSPLHQHIYCALSGSAADAQAIADMAA YQLELHGMELEEPPLVLAAANVVRNITYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTMSGMLIRQPFAIGGSGSTYIYGYVDA AYKPGMSPEECRRFTTNAIALAMKRDGSSGGVIYLATITGAGVDHRVILGDELPRFYDE ; ;MLRTGAPNGDLPRAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLSPLHQHIYCALSGSAADAQAIADMAA YQLELHGMELEEPPLVLAAANVVRNITYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTMSGMLIRQPFAIGGSGSTYIYGYVDA AYKPGMSPEECRRFTTNAIALAMKRDGSSGGVIYLATITGAGVDHRVILGDELPRFYDE ; W,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MQKTVLEPQRGFSFENCERNAALQRALPGLRVPHARKTGTTIAGLVFQDGVILGADTRATNDSVVADKICEKIHFIAPKI YCCGAGVAADAEMTTRMAASNMELHALSTGRECRVATVTRMLRQTLFRYQGYVGASLIVGGVDFTGPQLYSVHPHGSYSR LPFTALGSGQDAAIAVLEDRFQPNMTLEAAQELLVEAITAGILGDLGSGGNVDACVITAAGAKMLRALSSPTKPIERSSQ YRFAPGTTPVLSQTVVPLTLELVEETVQAMDVE ; ;MQKTVLEPQRGFSFENCERNAALQRALPGLRVPHARKTGTTIAGLVFQDGVILGADTRATNDSVVADKICEKIHFIAPKI YCCGAGVAADAEMTTRMAASNMELHALSTGRECRVATVTRMLRQTLFRYQGYVGASLIVGGVDFTGPQLYSVHPHGSYSR LPFTALGSGQDAAIAVLEDRFQPNMTLEAAQELLVEAITAGILGDLGSGGNVDACVITAAGAKMLRALSSPTKPIERSSQ YRFAPGTTPVLSQTVVPLTLELVEETVQAMDVE ; X,1 ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MALLDVCGAPGGQRGDWAVPLAGSRQRSDPGHYGFSLRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGNGESKVQIEMAHGTTTLAFKF QHGVIVAVDSRASAGNYIATLKVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCLYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMC QYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNSHAYGVMDSGYRPDLSIEEAYDLGRRAIVHATHRDS YSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYREASQ ; ;MALLDVCGAPGGQRGDWAVPLAGSRQRSDPGHYGFSLRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGNGESKVQIEMAHGTTTLAFKF QHGVIVAVDSRASAGNYIATLKVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCLYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMC QYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNSHAYGVMDSGYRPDLSIEEAYDLGRRAIVHATHRDS YSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYREASQ ; Y,2 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 TYR n 1 4 ASP n 1 5 ARG n 1 6 ALA n 1 7 ILE n 1 8 THR n 1 9 VAL n 1 10 PHE n 1 11 SER n 1 12 PRO n 1 13 ASP n 1 14 GLY n 1 15 HIS n 1 16 LEU n 1 17 PHE 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_refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 49201 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.591 ? 66496 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.250 ? 29681 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 7455 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 8592 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7DR7 _struct.title 'bovine 20S immunoproteasome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7DR7 _struct_keywords.text 'proteasome, immunoproteasome, bovine spleen, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 5 ? M N N 6 ? N N N 7 ? O N N 1 ? P N N 2 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 8 ? T N N 9 ? U N N 10 ? V N N 11 ? W N N 12 ? X N N 13 ? Y N N 14 ? Z N N 12 ? AA N N 13 ? BA N N 14 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PSA7_BOVIN Q3ZBG0 ? 1 ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGKDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQPLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; 1 2 UNP PSA5_BOVIN Q5E987 ? 2 ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; 1 3 UNP PSA1_BOVIN Q3T0X5 ? 3 ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPTQPADEPAEKADEPMEH ; 1 4 UNP PSA3_BOVIN Q58DU5 ? 4 ;MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAG LLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYG YWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDVVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGEITNGRHEIVPKDVREEAEKYA KESLKEEDESDDDNM ; 1 5 UNP PSA6_BOVIN Q2YDE4 ? 5 ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; 1 6 UNP PSA2_BOVIN Q3T0Y5 ? 6 ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; 1 7 UNP PSA4_BOVIN Q3ZCK9 ? 7 ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; 1 8 UNP PSB3_BOVIN P33672 ? 8 ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCTEQMYGMCESLWEPNMDP EHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; 1 9 UNP PSB2_BOVIN Q5E9K0 ? 9 ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADYLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISREKAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDRNGIHDLDNISFPKQGS ; 1 10 UNP PSB1_BOVIN Q2TBX6 ? 10 ;MLSSVAAYSGAGRDLAMEPHSSVGPLQLRFSPYAFNGGTVLAIAGEDFSIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVI GCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQR DSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALKVCIVTKEGIRGETVPLRK D ; 1 11 UNP PSB4_BOVIN Q3T108 ? 11 ;MEALLESRSGLWAGGPAPGQFYRIPPTPGSSVDPVSALYGSPITRTQNPMVTGTSVLGLKFEGGVVIAADMLGSYGSLAR FRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPKAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGY ADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTEARELVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEK GVEIEGPLSAETNWDIAHMISGFE ; 1 12 UNP PSB9_BOVIN Q3SZC2 ? 12 ;MLRTGAPNGDLPRAGEVHTGTTIMAVEFDGGVVVGSDSRVSAGEAVVNRVFDKLSPLHQHIYCALSGSAADAQAIADMAA YQLELHGMELEEPPLVLAAANVVRNITYKYREDLSAHLMVAGWDQREGGQVYGTMSGMLIRQPFAIGGSGSTYIYGYVDA AYKPGMSPEECRRFTTNAIALAMKRDGSSGGVIYLATITGAGVDHRVILGDELPRFYDE ; 1 13 UNP PSB10_BOVIN Q3T0T1 ? 13 ;MQKTVLEPQRGFSFENCERNAALQRALPGLRVPHARKTGTTIAGLVFQDGVILGADTRATNDSVVADKICEKIHFIAPKI YCCGAGVAADAEMTTRMAASNMELHALSTGRECRVATVTRMLRQTLFRYQGYVGASLIVGGVDFTGPQLYSVHPHGSYSR LPFTALGSGQDAAIAVLEDRFQPNMTLEAAQELLVEAITAGILGDLGSGGNVDACVITAAGAKMLRALSSPTKPIERSSQ YRFAPGTTPVLSQTVVPLTLELVEETVQAMDVE ; 1 14 UNP PSB8_BOVIN Q3T112 ? 14 ;MALLDVCGAPGGQRGDWAVPLAGSRQRSDPGHYGFSLRSPELALPRGMQPTEFFRSLGGNGESKVQIEMAHGTTTLAFKF QHGVIVAVDSRASAGNYIATLKVNKVIEINPYLLGTMSGCAADCLYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMC QYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDENGTRLSGNMFSTGSGNSHAYGVMDSGYRPDLSIEEAYDLGRRAIVHATHRDS YSGGVVNMYHMKEDGWVKVESTDVSDLMHQYREASQ ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7DR7 A 1 ? 248 ? Q3ZBG0 1 ? 248 ? 1 248 2 2 7DR7 B 1 ? 241 ? Q5E987 1 ? 241 ? 1 241 3 3 7DR7 C 1 ? 263 ? Q3T0X5 1 ? 263 ? 1 263 4 4 7DR7 D 1 ? 255 ? Q58DU5 1 ? 255 ? 1 255 5 5 7DR7 E 1 ? 246 ? Q2YDE4 1 ? 246 ? 1 246 6 6 7DR7 F 1 ? 234 ? Q3T0Y5 1 ? 234 ? 1 234 7 7 7DR7 G 1 ? 261 ? Q3ZCK9 1 ? 261 ? 1 261 8 8 7DR7 H 1 ? 205 ? P33672 1 ? 205 ? 1 205 9 9 7DR7 I 1 ? 201 ? Q5E9K0 1 ? 201 ? 1 201 10 10 7DR7 J 1 ? 241 ? Q2TBX6 1 ? 241 ? 1 241 11 11 7DR7 K 1 ? 264 ? Q3T108 1 ? 264 ? 1 264 12 5 7DR7 L 1 ? 246 ? Q2YDE4 1 ? 246 ? 1 246 13 6 7DR7 M 1 ? 234 ? Q3T0Y5 1 ? 234 ? 1 234 14 7 7DR7 N 1 ? 261 ? Q3ZCK9 1 ? 261 ? 1 261 15 1 7DR7 O 1 ? 248 ? Q3ZBG0 1 ? 248 ? 1 248 16 2 7DR7 P 1 ? 241 ? Q5E987 1 ? 241 ? 1 241 17 3 7DR7 Q 1 ? 263 ? Q3T0X5 1 ? 263 ? 1 263 18 4 7DR7 R 1 ? 255 ? Q58DU5 1 ? 255 ? 1 255 19 8 7DR7 S 1 ? 205 ? P33672 1 ? 205 ? 1 205 20 9 7DR7 T 1 ? 201 ? Q5E9K0 1 ? 201 ? 1 201 21 10 7DR7 U 1 ? 241 ? Q2TBX6 1 ? 241 ? 1 241 22 11 7DR7 V 1 ? 264 ? Q3T108 1 ? 264 ? 1 264 23 12 7DR7 W 1 ? 219 ? Q3SZC2 1 ? 219 ? 1 219 24 13 7DR7 X 1 ? 273 ? Q3T0T1 1 ? 273 ? 1 273 25 14 7DR7 Y 1 ? 276 ? Q3T112 1 ? 276 ? 1 276 26 12 7DR7 Z 1 ? 219 ? Q3SZC2 1 ? 219 ? 1 219 27 13 7DR7 1 1 ? 273 ? Q3T0T1 1 ? 273 ? 1 273 28 14 7DR7 2 1 ? 276 ? Q3T112 1 ? 276 ? 1 276 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 110850 ? 1 MORE -436 ? 1 'SSA (A^2)' 225920 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 16 ? 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anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? 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anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF6 4 5 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF7 4 5 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG2 4 5 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG3 4 5 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? 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ILE A 161 ? ALA A 158 ILE A 161 AA1 2 ALA A 32 ? ARG A 36 ? ALA A 32 ARG A 36 AA1 3 ILE A 40 ? GLU A 46 ? ILE A 40 GLU A 46 AA1 4 ILE A 206 ? ARG A 212 ? ILE A 206 ARG A 212 AA1 5 LYS A 218 ? ILE A 219 ? LYS A 218 ILE A 219 AA2 1 CYS A 63 ? ALA A 64 ? CYS A 63 ALA A 64 AA2 2 VAL A 69 ? GLY A 75 ? VAL A 69 GLY A 75 AA2 3 ILE A 129 ? ASP A 137 ? ILE A 129 ASP A 137 AA2 4 THR A 141 ? GLN A 146 ? THR A 141 GLN A 146 AA2 5 HIS A 154 ? ALA A 155 ? HIS A 154 ALA A 155 AA3 1 ALA B 167 ? ILE B 170 ? ALA B 167 ILE B 170 AA3 2 ALA B 37 ? THR B 42 ? ALA B 37 THR B 42 AA3 3 GLY B 45 ? GLU B 51 ? GLY B 45 GLU B 51 AA3 4 ILE B 215 ? GLN B 221 ? ILE B 215 GLN B 221 AA3 5 GLN B 224 ? MET B 228 ? GLN B 224 MET B 228 AA4 1 MET B 78 ? GLY B 80 ? MET B 78 GLY B 80 AA4 2 VAL B 139 ? ASP B 147 ? VAL B 139 ASP B 147 AA4 3 GLY B 150 ? MET B 156 ? GLY B 150 MET B 156 AA4 4 PHE B 162 ? CYS B 165 ? PHE B 162 CYS B 165 AA5 1 ALA C 158 ? ILE C 161 ? ALA C 158 ILE C 161 AA5 2 THR C 35 ? LYS C 39 ? 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