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EMDB EMD-31173 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'CrClp protease binding with co-chaperonin Cpn112023' _pdbx_database_related.db_id EMD-31173 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7EKQ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-04-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wang, N.' 1 ? 'Wang, Y.F.' 2 ? 'Cong, Y.' 3 ? 'Liu, C.M.' 4 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Plants _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2055-0278 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 7 _citation.language ? _citation.page_first 1505 _citation.page_last 1515 _citation.title 'The cryo-EM structure of the chloroplast ClpP complex.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41477-021-01020-x _citation.pdbx_database_id_PubMed 34782772 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wang, N.' 1 ? primary 'Wang, Y.' 2 0000-0001-9966-682X primary 'Zhao, Q.' 3 0000-0001-6555-4467 primary 'Zhang, X.' 4 ? primary 'Peng, C.' 5 0000-0003-0779-4037 primary 'Zhang, W.' 6 ? primary 'Liu, Y.' 7 ? primary 'Vallon, O.' 8 ? primary 'Schroda, M.' 9 ? primary 'Cong, Y.' 10 0000-0002-7164-8694 primary 'Liu, C.' 11 0000-0003-4982-4804 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7EKQ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7EKQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit' 26571.436 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit' 25815.459 3 3.4.21.92 ? ? ? 3 polymer nat 'ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit' 33229.863 3 3.4.21.92 ? ? ? 4 polymer nat 'ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit' 23105.768 3 3.4.21.92 ? ? ? 5 polymer nat 'ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit' 28136.010 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'ATP-dependent Clp 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_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;RRNVEARGIRRSPVVTPDIQIGHGEDAIEMDLYRYLLSNRIIFIGGYINDKMATQIVGSLMALEAVDENEDIRIYINSPG GQPYSVLGVVDAMQSIKPDVQTVALGACYSYASLVVAAGTKGKRYAMKNTRLMMTQPMGGSQGDIYQIKATVEELNALYQ IFSRYYMKFTGMNQDQIEQATCRDHFMTPEQAKLEGLIDEIIRGKGDYTVPPAIVRQFREVGLVDDLTPGPFLKVDCN ; ;RRNVEARGIRRSPVVTPDIQIGHGEDAIEMDLYRYLLSNRIIFIGGYINDKMATQIVGSLMALEAVDENEDIRIYINSPG GQPYSVLGVVDAMQSIKPDVQTVALGACYSYASLVVAAGTKGKRYAMKNTRLMMTQPMGGSQGDIYQIKATVEELNALYQ IFSRYYMKFTGMNQDQIEQATCRDHFMTPEQAKLEGLIDEIIRGKGDYTVPPAIVRQFREVGLVDDLTPGPFLKVDCN ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;ARRSVAARSSAPELWTPTSEVKLAVSSRNPHPPVVCQGPPPPNPLVIERFQGVVSQLFQQRIVRLGGAVDDDMANLLVAQ LLYLDSVDNKRDITMYVNSPGGSVTAGMAVFDTMRHIRPDVSTCCIGLAASMGAFILASGQAGKRYSLPNSRIMIHQPLG GAQGQATDIEIQANEILHHKLTLNGYLAQFTGQSMETITKDTDRDFFMSPQEAIEYGLVDAIISKPQMLQSREVALSS ; ;ARRSVAARSSAPELWTPTSEVKLAVSSRNPHPPVVCQGPPPPNPLVIERFQGVVSQLFQQRIVRLGGAVDDDMANLLVAQ LLYLDSVDNKRDITMYVNSPGGSVTAGMAVFDTMRHIRPDVSTCCIGLAASMGAFILASGQAGKRYSLPNSRIMIHQPLG GAQGQATDIEIQANEILHHKLTLNGYLAQFTGQSMETITKDTDRDFFMSPQEAIEYGLVDAIISKPQMLQSREVALSS ; B,D,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;NSQPIVAPRTAEMQGDPFGLLLRQRIVFLGGEVEDFGADAIISQLLLLDSQDPTKDIKIFINSPGGSVTAGMGIYDAMML CRADVNTYCFGLAASMGAFLLGAGKRGKRNSMPNSRIMIHQPLGGASGQAVDIEIQAKEIMYHKANLNRIMADYCQQPLS KIEEDTDRDRYMSPLEAKEYGLIDHIIGGEEAVFNVKGSLKKFPKIKEEFVTDKDDMVKRNIMDGDPFLSETPSWRFKSP QTEPYMPSQAPGSRWFRTRKVSKEDYKEMQEQRQAELMAESDDGKKSVKDRIDDAW ; ;NSQPIVAPRTAEMQGDPFGLLLRQRIVFLGGEVEDFGADAIISQLLLLDSQDPTKDIKIFINSPGGSVTAGMGIYDAMML CRADVNTYCFGLAASMGAFLLGAGKRGKRNSMPNSRIMIHQPLGGASGQAVDIEIQAKEIMYHKANLNRIMADYCQQPLS KIEEDTDRDRYMSPLEAKEYGLIDHIIGGEEAVFNVKGSLKKFPKIKEEFVTDKDDMVKRNIMDGDPFLSETPSWRFKSP QTEPYMPSQAPGSRWFRTRKVSKEDYKEMQEQRQAELMAESDDGKKSVKDRIDDAW ; C,E,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;NYLDQGALNNESGRSLYRKQTERVIQEEESKKVFMIINSFGGSVGNGITVHDALQFIKAGSLTLALGVAASAASLALAGG TIGERYVTEGCHTMIHQPEGGLNGQASDIWIDSQEIMKIRLDVAEIYSLSTYRPRHKILRDLDRDFYLTAMETIYYGLAD EIATNEVMHSIVEMTNQVWSYHDSKQERLLESRASLVGDSTQTQESNS ; ;NYLDQGALNNESGRSLYRKQTERVIQEEESKKVFMIINSFGGSVGNGITVHDALQFIKAGSLTLALGVAASAASLALAGG TIGERYVTEGCHTMIHQPEGGLNGQASDIWIDSQEIMKIRLDVAEIYSLSTYRPRHKILRDLDRDFYLTAMETIYYGLAD EIATNEVMHSIVEMTNQVWSYHDSKQERLLESRASLVGDSTQTQESNS ; H,J,M ? 5 'polypeptide(L)' no no ;AYGDYPNYPEGRPLFLPEAERFGNPPDLPSLLLQQRVIYISMPFLPSVTELVVAQCYYLDFDDRNRQRPIYVYLNSTGCI NDKGQAISADNEFYAIWAALGFTRAPLYTGVTWKAQNQAAVLLSAGQKGHRYSFPHAKISTAPPVMNRVFGQAVDAQLQA NELDYATKYYAAILARSTGKDLETCQKQYLSRKRYFSVKEAYEEGLVDKLVPGFMLNRFRKMQKDAGVGEEDLFDMNKPK FKFRRQ ; ;AYGDYPNYPEGRPLFLPEAERFGNPPDLPSLLLQQRVIYISMPFLPSVTELVVAQCYYLDFDDRNRQRPIYVYLNSTGCI NDKGQAISADNEFYAIWAALGFTRAPLYTGVTWKAQNQAAVLLSAGQKGHRYSFPHAKISTAPPVMNRVFGQAVDAQLQA NELDYATKYYAAILARSTGKDLETCQKQYLSRKRYFSVKEAYEEGLVDKLVPGFMLNRFRKMQKDAGVGEEDLFDMNKPK FKFRRQ ; I ? 6 'polypeptide(L)' no no ;RKLSHLRKKLWKEAGPPPDLATRLFSERIMYLGMPIDSSVAELLTAQLFVLVQEAPDPIFFYINSTGIAKSTTKFGNEHE AIAVYSMMKGVQKYCPIYTLCVGNAFGEAALLLSAGSPGKRAALRSSTIMLRQPLQRLGGMQASDIDIYRKITREKTATM 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;LVVHARASRYDRRKPPPPDLPSLLFDQRIVYLGMPLVPAVTELMVAELLYLEKQGATLPIEMLINSSGTTRQDGEILSFD SEGVALTSTMGFIKNPISTVNMGLAVGWSCVVLSFGRKGWRKSLPHSLAMIQQPRVPPTGQRQAIEVHIKWREVLDYKRE LLRMFSLGTGLPVDKLDADMQRPLYMRPQDALEYGIIDEIIEPNEDKAEKAAQYWIRSGRAESEGRLEQWQEYLSLQEEY ALKDSFRKVMTQDLRAAYRDTSSKLLKNSSRNMEQVQEFKERLPDDMLTENDEVRLPFSRDGVKLAILNAECYAERNIAR QVAANKVSVPDKWRAAYAARPAPAAPAAEVDYDALIRAVEAMDEKAFATTDLDTLVEQYRVPA ; ;LVVHARASRYDRRKPPPPDLPSLLFDQRIVYLGMPLVPAVTELMVAELLYLEKQGATLPIEMLINSSGTTRQDGEILSFD SEGVALTSTMGFIKNPISTVNMGLAVGWSCVVLSFGRKGWRKSLPHSLAMIQQPRVPPTGQRQAIEVHIKWREVLDYKRE LLRMFSLGTGLPVDKLDADMQRPLYMRPQDALEYGIIDEIIEPNEDKAEKAAQYWIRSGRAESEGRLEQWQEYLSLQEEY ALKDSFRKVMTQDLRAAYRDTSSKLLKNSSRNMEQVQEFKERLPDDMLTENDEVRLPFSRDGVKLAILNAECYAERNIAR QVAANKVSVPDKWRAAYAARPAPAAPAAEVDYDALIRAVEAMDEKAFATTDLDTLVEQYRVPA ; N ? 9 'polypeptide(L)' no no ;ATATAAPSELDDVGVSAAAESIIQYAINFARASETYEVHSWMVLMGILKYETCTAAKILKSLGLEDLYGAWNEVLWALNV CDGLQPRSFVTDIKFADRAFKVITAASDFAVWHGKDKMYSEDVLMALAAGGVLEDLFPDLNLSFERVRKAVEKESGRRYQ LPDETEEAGPLKSEDDVSFL ; ;ATATAAPSELDDVGVSAAAESIIQYAINFARASETYEVHSWMVLMGILKYETCTAAKILKSLGLEDLYGAWNEVLWALNV CDGLQPRSFVTDIKFADRAFKVITAASDFAVWHGKDKMYSEDVLMALAAGGVLEDLFPDLNLSFERVRKAVEKESGRRYQ LPDETEEAGPLKSEDDVSFL ; O ? 10 'polypeptide(L)' no no ;AASVTAEKAALDITKMTPIHDRVLIRPIEEEQKTAGGILLPKAPPKANSDAHIGEVLAVGSDVTLAVAKGDMVVFQKYAM AEVEVKEGQIIFVAEKSIMGKLE ; ;AASVTAEKAALDITKMTPIHDRVLIRPIEEEQKTAGGILLPKAPPKANSDAHIGEVLAVGSDVTLAVAKGDMVVFQKYAM AEVEVKEGQIIFVAEKSIMGKLE ; P ? 11 'polypeptide(L)' no no ;EAISVPAPFTKVAPKGDRVLVKVAEEEVKTRGGILLPPSAIKKPTSGEVVQLGDGRVGDGEVRPFYLQPGQTVVYSKFGF MYQDLKLSNGEEYILIREDDVIGIMPRANAQADDVPELQPLADRVLIKVEEVADVTMGGVFLPETAKERPLSGTVVRVGP GKYDKDAEGKRRTVPLAPGDKVLYFKYAGDNMETPSGDKFVVLRSDDVLCKA ; ;EAISVPAPFTKVAPKGDRVLVKVAEEEVKTRGGILLPPSAIKKPTSGEVVQLGDGRVGDGEVRPFYLQPGQTVVYSKFGF MYQDLKLSNGEEYILIREDDVIGIMPRANAQADDVPELQPLADRVLIKVEEVADVTMGGVFLPETAKERPLSGTVVRVGP GKYDKDAEGKRRTVPLAPGDKVLYFKYAGDNMETPSGDKFVVLRSDDVLCKA ; Q ? 12 'polypeptide(L)' no no ;ATPVPKQFKAVKPVGDRVLVKVDKEEAKSVGGVLLPASVRNKPTAGSIIALGDAKSVKLSDKVIYSKFAGTELELGGAEH VLLKEEDVIGVLSASEKIAQLKPLSDRILIKGAKAEDKTSGGVLLATESAEKPTFGTVVAVGEGREDEETKALVKPNVTV GATVMYSKYSGTEFEEDGDNYIVVRESDILAQLS ; ;ATPVPKQFKAVKPVGDRVLVKVDKEEAKSVGGVLLPASVRNKPTAGSIIALGDAKSVKLSDKVIYSKFAGTELELGGAEH VLLKEEDVIGVLSASEKIAQLKPLSDRILIKGAKAEDKTSGGVLLATESAEKPTFGTVVAVGEGREDEETKALVKPNVTV GATVMYSKYSGTEFEEDGDNYIVVRESDILAQLS ; R,S ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ARG n 1 2 ARG n 1 3 ASN n 1 4 VAL n 1 5 GLU n 1 6 ALA n 1 7 ARG n 1 8 GLY n 1 9 ILE n 1 10 ARG n 1 11 ARG n 1 12 SER n 1 13 PRO n 1 14 VAL n 1 15 VAL n 1 16 THR n 1 17 PRO n 1 18 ASP n 1 19 ILE n 1 20 GLN n 1 21 ILE n 1 22 GLY n 1 23 HIS n 1 24 GLY n 1 25 GLU n 1 26 ASP n 1 27 ALA n 1 28 ILE n 1 29 GLU n 1 30 MET n 1 31 ASP n 1 32 LEU n 1 33 TYR n 1 34 ARG n 1 35 TYR n 1 36 LEU n 1 37 LEU n 1 38 SER n 1 39 ASN n 1 40 ARG n 1 41 ILE n 1 42 ILE n 1 43 PHE n 1 44 ILE n 1 45 GLY n 1 46 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