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_citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.3389/fimmu.2021.662909 _citation.pdbx_database_id_PubMed 34135892 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Chuang, G.Y.' 1 ? primary 'Shen, C.H.' 2 ? primary 'Cheung, C.S.' 3 ? primary 'Gorman, J.' 4 ? primary 'Creanga, A.' 5 ? primary 'Joyce, M.G.' 6 ? primary 'Leung, K.' 7 ? primary 'Rawi, R.' 8 ? primary 'Wang, L.' 9 ? primary 'Yang, E.S.' 10 ? primary 'Yang, Y.' 11 ? primary 'Zhang, B.' 12 ? primary 'Zhang, Y.' 13 ? primary 'Kanekiyo, M.' 14 ? primary 'Zhou, T.' 15 ? primary 'DeKosky, B.J.' 16 ? primary 'Graham, B.S.' 17 ? primary 'Mascola, J.R.' 18 ? primary 'Kwong, P.D.' 19 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7KC1 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? 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'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7KC1 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7KC1 _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 17814 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.538 ? 24153 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.266 ? 2826 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.047 ? 2862 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 3021 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7KC1 _struct.title 'Cryo-EM structure of SRR2899884.46167H+MEDI8852L fab in complex with Victoria HA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7KC1 _struct_keywords.text 'Flu, HA, HV6-1, VRC, IMMUNE SYSTEM, IMMUNE SYSTEM-Viral Protein complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 6 ? Q N N 5 ? R N N 5 ? S N N 5 ? T N N 6 ? U N N 5 ? V N N 5 ? W N N 5 ? X N N 6 ? Y N N 7 ? Z N N 7 ? AA N N 7 ? BA N N 7 ? CA N N 7 ? DA N N 7 ? EA N N 7 ? FA N N 7 ? GA N N 7 ? HA N N 7 ? IA N N 7 ? JA N N 7 ? KA N N 7 ? LA N N 7 ? MA N N 7 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 81 ? GLY A 88 ? THR A 65 GLY A 72 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 89 ? ASP A 93 ? ASP A 73 ASP A 77 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 120 ? GLY A 132 ? 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GLN K 79 PHE K 83 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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E CYS 68 SG ? ? ? 1_555 E CYS 293 SG ? ? C CYS 52 C CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 80 SG ? ? ? 1_555 E CYS 92 SG ? ? C CYS 64 C CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf12 disulf ? ? E CYS 113 SG ? ? ? 1_555 E CYS 155 SG ? ? C CYS 97 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 297 SG ? ? ? 1_555 E CYS 321 SG ? ? C CYS 281 C CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf14 disulf ? ? F CYS 144 SG ? ? ? 1_555 F CYS 148 SG ? ? D CYS 144 D CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf15 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 99 SG ? ? E CYS 22 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf16 disulf ? ? H CYS 20 SG ? ? ? 1_555 H CYS 85 SG ? ? F CYS 23 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf17 disulf ? ? I CYS 30 SG ? ? ? 1_555 J CYS 137 SG ? ? G CYS 14 I CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? I CYS 68 SG ? ? ? 1_555 I CYS 293 SG ? ? G CYS 52 G CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf19 disulf ? ? I CYS 80 SG ? ? ? 1_555 I CYS 92 SG ? ? G CYS 64 G CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf20 disulf ? ? I CYS 113 SG ? ? ? 1_555 I CYS 155 SG ? ? G CYS 97 G CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf21 disulf ? ? I CYS 297 SG ? ? ? 1_555 I CYS 321 SG ? ? G CYS 281 G CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf22 disulf ? ? J CYS 144 SG ? ? ? 1_555 J CYS 148 SG ? ? I CYS 144 I CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf23 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 99 SG ? ? J CYS 22 J CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf24 disulf ? ? L CYS 20 SG ? ? ? 1_555 L CYS 85 SG ? ? K CYS 23 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? covale1 covale one ? A ASN 38 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 22 A NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 54 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 38 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 79 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 63 A NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? A ASN 126 A NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? A ASN 133 A NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 181 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 165 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 262 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 246 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 285 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 154 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? B ASN 154 B NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? E ASN 38 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 22 C NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? E ASN 54 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? C ASN 38 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? E ASN 79 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 63 C NAG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? E ASN 142 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 126 C NAG 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? E ASN 149 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 133 C NAG 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? E ASN 181 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? C ASN 165 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 262 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? C ASN 246 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 285 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? F ASN 154 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? D ASN 154 D NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? 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N BMA 3 N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale36 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale37 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale38 covale both ? O BMA . O3 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale39 covale both ? O BMA . O6 ? ? ? 1_555 O MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale40 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale41 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale42 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale43 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale44 covale both ? Q BMA . O3 ? ? ? 1_555 Q MAN . C1 ? ? 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S BMA 3 S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale54 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale55 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale56 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale57 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale58 covale both ? U BMA . O3 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale59 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale60 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale61 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale62 covale both ? V BMA . O3 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale63 covale both ? V BMA . O6 ? ? ? 1_555 V MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale64 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale65 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale66 covale both ? W BMA . O3 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale67 covale both ? W BMA . O6 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale68 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale69 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? 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PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 2.0 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM103310 1 'Other private' 'United States' SF349247 2 'Other private' 'United States' 'Agouron Institute (F00316)' 3 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'NIH S10 OD019994-01' 4 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1038 n M 5 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1039 n M 5 BMA 3 M BMA 3 A BMA 1040 n M 5 MAN 4 M MAN 4 A MAN 1041 n M 5 MAN 5 M MAN 5 A MAN 1042 n N 5 NAG 1 N NAG 1 A NAG 1165 n N 5 NAG 2 N NAG 2 A NAG 1166 n N 5 BMA 3 N BMA 3 A BMA 1167 n N 5 MAN 4 N MAN 4 A MAN 1169 n N 5 MAN 5 N MAN 5 A MAN 1168 n O 5 NAG 1 O NAG 1 A NAG 1246 n O 5 NAG 2 O NAG 2 A NAG 1247 n O 5 BMA 3 O BMA 3 A BMA 1248 n O 5 MAN 4 O MAN 4 A MAN 1249 n O 5 MAN 5 O MAN 5 A MAN 1250 n P 6 NAG 1 P NAG 1 A NAG 1285 n P 6 NAG 2 P NAG 2 A NAG 1286 n P 6 BMA 3 P BMA 3 A BMA 1287 n Q 5 NAG 1 Q NAG 1 C NAG 1038 n Q 5 NAG 2 Q NAG 2 C NAG 1039 n Q 5 BMA 3 Q BMA 3 C BMA 1040 n Q 5 MAN 4 Q MAN 4 C MAN 1041 n Q 5 MAN 5 Q MAN 5 C MAN 1042 n R 5 NAG 1 R NAG 1 C NAG 1165 n R 5 NAG 2 R NAG 2 C NAG 1166 n R 5 BMA 3 R BMA 3 C BMA 1167 n R 5 MAN 4 R MAN 4 C MAN 1169 n R 5 MAN 5 R MAN 5 C MAN 1168 n S 5 NAG 1 S NAG 1 C NAG 1246 n S 5 NAG 2 S NAG 2 C NAG 1247 n S 5 BMA 3 S BMA 3 C BMA 1248 n S 5 MAN 4 S MAN 4 C MAN 1249 n S 5 MAN 5 S MAN 5 C MAN 1250 n T 6 NAG 1 T NAG 1 C NAG 1285 n T 6 NAG 2 T NAG 2 C NAG 1286 n T 6 BMA 3 T BMA 3 C BMA 1287 n U 5 NAG 1 U NAG 1 G NAG 1038 n U 5 NAG 2 U NAG 2 G NAG 1039 n U 5 BMA 3 U BMA 3 G BMA 1040 n U 5 MAN 4 U MAN 4 G MAN 1041 n U 5 MAN 5 U MAN 5 G MAN 1042 n V 5 NAG 1 V NAG 1 G NAG 1165 n V 5 NAG 2 V NAG 2 G NAG 1166 n V 5 BMA 3 V BMA 3 G BMA 1167 n V 5 MAN 4 V MAN 4 G MAN 1169 n V 5 MAN 5 V MAN 5 G MAN 1168 n W 5 NAG 1 W NAG 1 G NAG 1246 n W 5 NAG 2 W NAG 2 G NAG 1247 n W 5 BMA 3 W BMA 3 G BMA 1248 n W 5 MAN 4 W MAN 4 G MAN 1249 n W 5 MAN 5 W MAN 5 G MAN 1250 n X 6 NAG 1 X NAG 1 G NAG 1285 n X 6 NAG 2 X NAG 2 G NAG 1286 n X 6 BMA 3 X BMA 3 G BMA 1287 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 4 5 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 5 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 5 MAN 4 n 5 MAN 5 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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