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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 329 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4 ;MARVTVQDAVEKIGNRFDLVLVAARRARQMQVGGKDPLVPEENDKTTVIALREIEEGLINNQILDVRERQEQQEQEAAEL QAVTAIAEGRR ; 1 5 UNP C3TR27_ECOLX C3TR27 ? 5 ;MPFTLGQRWISDTESELGLGTVVAVDARTVTLLFPSTGENRLYARSDSPVTRVMFNPGDTITSHDGWQMQVEEVKEENGL LTYIGTRLDTEESGVALREVFLDSKLVFSKPQDRLFAGQIDRMDRFALRYRARKYSSEQFRMPYSGLRGQRTSLIPHQLN IAHDVGRRHAPRVLLADEVGLGKTIEAGMILHQQLLSGAAERVLIIVPETLQHQWLVEMLRRFNLRFALFDDERYAEAQH DAYNPFDTEQLVICSLDFARRSKQRLEHLCEAEWDLLVVDEAHHLVWSEDAPSREYQAIEQLAEHVPGVLLLTATPEQLG MESHFARLRLLDPNRFHDFAQFVEEQKNYRPVADAVAMLLAGNKLSNDELNMLGEMIGEQDIEPLLQAANSDSEDAQSAR QELVSMLMDRHGTSRVLFRNTRNGVKGFPKRELHTIKLPLPTQYQTAIKVSGIMGARKSAEDRARDMLYPERIYQEFEGD NATWWNFDPRVEWLMGYLTSHRSQKVLVICAKAATALQLEQVLREREGIRAAVFHEGMSIIERDRAAAWFAEEDTGAQVL LCSEIGSEGRNFQFASHMVMFDLPFNPDLLEQRIGRLDRIGQAHDIQIHVPYLEKTAQSVLVRWYHEGLDAFEHTCPTGR TIYDSVYNDLINYLASPDQTEGFDDLIKNCREQHEALKAQLEQGRDRLLEIHSNGGEKAQALAESIEEQDDDTNLIAFAM NLFDIIGINQDDRGDNMIVLTPSDHMLVPDFPGLSEDGITITFDREVALAREDAQFITWEHPLIRNGLDLILSGDTGSST ISLLKNKALPVGTLLVELIYVVEAQAPKQLQLNRFLPPTPVRMLLDKNGNNLAAQVEFETFNRQLNAVNRHTGSKLVNAV QQDVHAILQLGEAQIEKSARALIDAARNEADEKLSAELSRLEALRAVNPNIRDDELTAIESNRQQVMESLDQAGWRLDAL RLIVVTHQ ; 1 6 PDB 7M8E 7M8E ? 6 ? 1 7 PDB 7M8E 7M8E ? 7 ? 1 8 PDB 7M8E 7M8E ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7M8E A 1 ? 329 ? 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'expression tag' 1410 3 4 7M8E HIS D 1411 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1411 4 4 7M8E HIS D 1412 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1412 5 4 7M8E HIS D 1413 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1413 6 4 7M8E HIS D 1414 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1414 7 4 7M8E HIS D 1415 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1415 8 4 7M8E HIS D 1416 ? UNP D8ED86 ? ? 'expression tag' 1416 9 6 7M8E HIS F 1 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' -5 10 6 7M8E HIS F 2 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' -4 11 6 7M8E HIS F 3 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' -3 12 6 7M8E HIS F 4 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' -2 13 6 7M8E HIS F 5 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' -1 14 6 7M8E HIS F 6 ? UNP C3TR27 ? ? 'expression tag' 0 15 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7M8E _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7M8E _struct.title 'E.coli RNAP-RapA elongation complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7M8E _struct_keywords.text 'Swi2/snf2, RapA, ATPase, RNA polymerase, TRANSFERASE-HYDROLASE-DNA-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE/HYDROLASE/DNA/RNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 9 ? 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GLY B 34 SER B 50 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE B 78 ? LEU B 85 ? ILE B 78 LEU B 85 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO B 154 ? GLU B 162 ? PRO B 154 GLU B 162 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP B 212 ? GLU B 229 ? ASP B 212 GLU B 229 1 ? 18 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU C 28 ? GLU C 40 ? LEU C 28 GLU C 40 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY C 48 ? SER C 55 ? GLY C 48 SER C 55 1 ? 8 HELX_P HELX_P12 AB3 ASP C 81 ? ARG C 88 ? ASP C 81 ARG C 88 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 THR C 207 ? LEU C 213 ? THR C 207 LEU C 213 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 AB5 THR C 216 ? PHE C 225 ? THR C 216 PHE C 225 1 ? 10 HELX_P HELX_P15 AB6 THR C 270 ? ASP C 281 ? THR C 270 ASP C 281 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO C 288 ? ILE C 292 ? PRO C 288 ILE C 292 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 LEU C 319 ? GLY C 329 ? LEU C 319 GLY C 329 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO C 345 ? ARG C 352 ? PRO C 345 ARG C 352 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP C 358 ? ARG C 371 ? ASP C 358 ARG C 371 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 AC2 THR C 377 ? PHE C 390 ? 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H DA 20 N1 ? ? ? 1_555 I U 2 N3 ? ? 2 DA 20 3 U 2 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-U PAIR' ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? H DG 22 N1 ? ? ? 1_555 I A 1 N1 ? ? 2 DG 22 3 A 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-A MISPAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 29 A . ? GLU 29 A PRO 30 A ? PRO 30 A 1 -4.53 2 GLU 29 B . ? GLU 29 B PRO 30 B ? PRO 30 B 1 -10.03 3 ALA 426 D . ? ALA 426 D PRO 427 D ? PRO 427 D 1 7.34 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 2 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 2 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 5 ? AF4 ? 4 ? AF5 ? 7 ? AF6 ? 6 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF5 1 2 ? parallel AF5 2 3 ? parallel AF5 3 4 ? parallel AF5 4 5 ? parallel AF5 5 6 ? parallel AF5 6 7 ? parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? parallel AF6 3 4 ? parallel AF6 4 5 ? parallel AF6 5 6 ? parallel AF7 1 2 ? parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? parallel AF9 1 2 ? parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ARG A 12 ? GLU A 17 ? ARG A 12 GLU A 17 AA1 2 ALA A 24 ? GLU A 29 ? ALA A 24 GLU A 29 AA1 3 ASP A 199 ? THR A 207 ? ASP A 199 THR A 207 AA1 4 VAL A 180 ? ALA A 189 ? VAL A 180 ALA A 189 AA2 1 GLU A 97 ? SER A 105 ? GLU A 97 SER A 105 AA2 2 SER A 139 ? ARG A 150 ? SER A 139 ARG A 150 AA2 3 PRO A 52 ? ILE A 61 ? PRO A 52 ILE A 61 AA2 4 LEU A 171 ? LEU A 172 ? LEU A 171 LEU A 172 AA3 1 VAL A 90 ? VAL A 92 ? VAL A 90 VAL A 92 AA3 2 VAL A 121 ? ILE A 123 ? VAL A 121 ILE A 123 AA4 1 GLY A 108 ? THR A 111 ? GLY A 108 THR A 111 AA4 2 VAL A 129 ? LEU A 133 ? VAL A 129 LEU A 133 AA5 1 TYR A 152 ? VAL A 153 ? TYR A 152 VAL A 153 AA5 2 ALA A 175 ? CYS A 176 ? ALA A 175 CYS A 176 AA6 1 ILE B 16 ? GLU B 17 ? ILE B 16 GLU B 17 AA6 2 HIS B 23 ? LEU B 31 ? HIS B 23 LEU B 31 AA6 3 ASP B 199 ? GLU B 206 ? ASP B 199 GLU B 206 AA6 4 ARG B 182 ? ALA B 184 ? ARG B 182 ALA B 184 AA7 1 ILE B 16 ? GLU B 17 ? ILE B 16 GLU B 17 AA7 2 HIS B 23 ? LEU B 31 ? HIS B 23 LEU B 31 AA7 3 ASP B 199 ? GLU B 206 ? 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