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B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 5 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 3 ? P N N 4 ? Q N N 5 ? R N N 4 ? S N N 5 ? T N N 6 ? U N N 3 ? V N N 4 ? W N N 5 ? X N N 4 ? Y N N 5 ? Z N N 6 ? AA N N 3 ? BA N N 4 ? CA N N 5 ? DA N N 4 ? EA N N 5 ? FA N N 6 ? GA N N 7 ? HA N N 7 ? IA N N 7 ? JA N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q5F8Z6_NEIG1 Q5F8Z6 ? 1 ;MNTPTDLKVTKRDGRLEAIDLDKIHRVVTWAAEGLENVSVSQVELKSHIQFYNGIRTDDIHETIIKAAADLISEDTPDYQ YLAARLAIFHLRKIAYGEYEPPHLYNHVKKLTDAGKYDRHILEDYSREEFDELNAYIDHERDMSFSYAAVKQLEGKYLVQ NRVTRQIYETPQFLYVLVAMCLFSKYPKEARLDYVKRFYDAVSTFKVSLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECDDSLDSIN ATTSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRGLDSEIRGGEARHTGCIPFFKMFQAAVKSCSQGGVRGGAATLFYPLWHIEAESLLV LKNNRGVEDNRIRQLDYGVQINRLLYTRLIKGGNITLFSPNEVSGLYEAFFADQDEFERLYTKYEQDPNIRKRIIPAADL FSTLMQERAGTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPRVAPVHQSNLCMEIALPTKPLDNINDPDGEIALCTLSAFNLGALNSLDEL EGLADLTVRALDALLDYQGYPVEAARTSTMDRRSLGIGVINYAYYLAKNGVRYSDGSALGLTHRTFEAIQYYLLKASANL AKEYGACTLFNQTVYSQGKLPIDTYKKDLDAVCGEPLHYDWESLRADIVKYGLRNSTLTALMPSETSSQIANATNGIEPP RGLVTVKASKDGILKQVVPEFETLKNAYETLWQLPGNEGYLKLVGVMQKFVDQAISANTAYDPGKFEGNKVSMKQMLKDL LTAYKYGVKTLYYHNTRDGADDTQTDIQDDGCAGGACKI ; 1 2 UNP Q5F8Z5_NEIG1 Q5F8Z5 ? 2 ;MSYSTFPKTKNDALKEPMFFGQPVNVARYDQQKYEVFEKLIEKQLSFFWRPEEIDVSRDRIDYANLPEHEKHIFISNLKY QTLLDSIQGRSPNVALLPLVSIPELETWVETWSFSETIHSRSYTHIIRNIVNDPSVVFDDIVENEYITARAEDIACYYDD LIEYTQYYNLLGEGVHNVGGKPVTVSLRGLKKKLYLCLMCVNVLEAIRFYVSFACSFAFAERELMEGNAKIIKLIARDEA LHLTGTQHMLNLMRSGVDDPEMAEIAAELQDECFQLFKKAAEQEKEWAAYLFKDGSMIGLNKEILSQYVEYITNLRMQAV GLPAGFEGANQNPIPWINAWLSSDNVQVAPQEVEISSYLIGQIDSEVNTDDLGDFEL ; 8 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7MDI A 15 ? 773 ? 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'expression tag' -4 39 3 7MDI LEU B 11 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -3 40 3 7MDI TYR B 12 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -2 41 3 7MDI PHE B 13 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -1 42 3 7MDI GLN B 14 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' 0 43 4 7MDI MET G 1 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'initiating methionine' -13 44 4 7MDI GLY G 2 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -12 45 4 7MDI HIS G 3 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -11 46 4 7MDI HIS G 4 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -10 47 4 7MDI HIS G 5 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -9 48 4 7MDI HIS G 6 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -8 49 4 7MDI HIS G 7 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -7 50 4 7MDI HIS G 8 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -6 51 4 7MDI GLU G 9 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -5 52 4 7MDI ASN G 10 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -4 53 4 7MDI LEU G 11 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -3 54 4 7MDI TYR G 12 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -2 55 4 7MDI PHE G 13 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -1 56 4 7MDI GLN G 14 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' 0 57 4 7MDI ASP G 248 ? UNP Q5F8Z5 LEU 241 conflict 234 58 5 7MDI MET D 1 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'initiating methionine' -13 59 5 7MDI GLY D 2 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -12 60 5 7MDI HIS D 3 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -11 61 5 7MDI HIS D 4 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -10 62 5 7MDI HIS D 5 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -9 63 5 7MDI HIS D 6 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -8 64 5 7MDI HIS D 7 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -7 65 5 7MDI HIS D 8 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -6 66 5 7MDI GLU D 9 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -5 67 5 7MDI ASN D 10 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -4 68 5 7MDI LEU D 11 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -3 69 5 7MDI TYR D 12 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -2 70 5 7MDI PHE D 13 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -1 71 5 7MDI GLN D 14 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' 0 72 6 7MDI MET F 1 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'initiating methionine' -13 73 6 7MDI GLY F 2 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -12 74 6 7MDI HIS F 3 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -11 75 6 7MDI HIS F 4 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -10 76 6 7MDI HIS F 5 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -9 77 6 7MDI HIS F 6 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -8 78 6 7MDI HIS F 7 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -7 79 6 7MDI HIS F 8 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -6 80 6 7MDI GLU F 9 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -5 81 6 7MDI ASN F 10 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -4 82 6 7MDI LEU F 11 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -3 83 6 7MDI TYR F 12 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -2 84 6 7MDI PHE F 13 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' -1 85 6 7MDI GLN F 14 ? UNP Q5F8Z5 ? ? 'expression tag' 0 86 6 7MDI ASP F 248 ? UNP Q5F8Z5 LEU 241 conflict 234 87 7 7MDI MET C 1 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'initiating methionine' -13 88 7 7MDI GLY C 2 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -12 89 7 7MDI HIS C 3 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -11 90 7 7MDI HIS C 4 ? UNP Q5F8Z6 ? ? 'expression tag' -10 91 7 7MDI HIS C 5 ? 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UNP Q5F8Z5 LEU 241 conflict 234 116 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 homology ;high homology to the E. coli ribonucleotide reductase that has been shown to form a homologous structure using SAXS and analytical ultracentrifugation ; 2 1 microscopy 'negative stain electron microscopy (also single particle in vitro)' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ILE A 38 ? 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D MG 805 D HOH 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc47 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 IA HOH . O ? ? D MG 805 D HOH 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? ? metalc48 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 IA HOH . O ? ? D MG 805 D HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? ? metalc49 metalc ? ? F ASP 99 OD2 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE1 ? ? F ASP 85 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? ? metalc50 metalc ? ? F GLU 130 OE1 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE1 ? ? F GLU 116 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? ? metalc51 metalc ? ? F GLU 130 OE1 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE2 ? ? F GLU 116 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? ? metalc52 metalc ? ? F GLU 130 OE2 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE2 ? ? F GLU 116 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.200 ? ? metalc53 metalc ? ? F HIS 133 ND1 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE1 ? ? F HIS 119 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? ? metalc54 metalc ? ? F HIS 256 ND1 ? ? ? 1_555 Z FEO . FE2 ? ? F HIS 242 F FEO 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? ? metalc55 metalc ? ? BA DTP . O1G ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? 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