data_7MIB # _entry.id 7MIB # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.392 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7MIB pdb_00007mib 10.2210/pdb7mib/pdb WWPDB D_1000256309 ? ? EMDB EMD-23845 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2021-11-17 2 'Structure model' 1 1 2024-05-29 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_audit_revision_group.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_group.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_group.group 'Data collection' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' chem_comp_atom 2 2 'Structure model' chem_comp_bond # loop_ _database_PDB_caveat.id _database_PDB_caveat.text 1 ;Residues DC J 68 and DG J 69 that are next to each other in the sample sequence are not properly linked: distance between O3' and P is 3.76. ; 2 'There are several physically unrealistic interatomic distances present in the coordinates.' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7MIB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-04-16 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-23839 'other EM volume' EMDB . EMD-23840 'other EM volume' EMDB . EMD-23843 'other EM volume' EMDB 'Half integration complex of Cas4/Cas1/Cas2 and Cas4 still in the Non-PAM side' EMD-23845 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hu, C.Y.' 1 0000-0003-4509-4840 'Ke, A.K.' 2 0000-0001-5957-7822 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 598 _citation.language ? _citation.page_first 515 _citation.page_last 520 _citation.title 'Mechanism for Cas4-assisted directional spacer acquisition in CRISPR-Cas.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-021-03951-z _citation.pdbx_database_id_PubMed 34588691 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hu, C.' 1 ? primary 'Almendros, C.' 2 ? primary 'Nam, K.H.' 3 0000-0003-3268-354X primary 'Costa, A.R.' 4 0000-0001-6749-6408 primary 'Vink, J.N.A.' 5 ? primary 'Haagsma, A.C.' 6 ? primary 'Bagde, S.R.' 7 ? primary 'Brouns, S.J.J.' 8 0000-0002-9573-1724 primary 'Ke, A.' 9 0000-0001-5957-7822 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn 'DNA (31-MER)' 9510.105 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'CRISPR-associated exonuclease Cas4/endonuclease Cas1 fusion' 62598.496 4 3.1.-.-,3.1.12.1 ? ? ? 3 polymer man 'CRISPR-associated endoribonuclease Cas2' 11190.176 2 3.1.-.- ? ? ? 4 polymer syn 'DNA (64-MER)' 19659.529 1 ? ? ? ? 5 polymer syn ;DNA (5'-D(P*CP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*AP*GP*CP*C)-3') ; 3705.445 1 ? ? ? ? 6 polymer syn 'DNA (45-MER)' 13855.857 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC) (DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT) ; GTCGTAGCTGAGGCCTCAGCTACGACTTTTT G ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MAETDGSIPLIPVRMLNEHVYCPRLAYLMWVQGEFSHNEFTVDGVIRHRRVDAGGGVLPSETQEDSRIHARSVSLSSERL GITAKIDLVEGEGAYVSPVDYKRGKRPHVAGGAYEPERVQLCAQGLLLREHGFASDGGALYFVASRERVPVAFDDELIGR TLAAIDEMGRTALSGTMPPPLEDSPKCPRCSLVGICLPDEVRFLSHLSVEPRPIIPADGRGLPLYVQSPKAYVRKDGDCL 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;MEHLYIVSYDIRNQRRWRRLFKTMHGFGCWLQLSVFQCRLDRIRIIKMEAAINEIVNHAEDHVLILDLGPAENVKPKVSS IGKTFDPILRQAVIV ; ;MEHLYIVSYDIRNQRRWRRLFKTMHGFGCWLQLSVFQCRLDRIRIIKMEAAINEIVNHAEDHVLILDLGPAENVKPKVSS IGKTFDPILRQAVIV ; E,F ? 4 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DG)(DT)(DA)(DA)(DC)(DG)(DT)(DT)(DG) (DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG) (DC)(DC)(DA)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DT) (DT)(DG)(DA)(DA) ; CTGTGCCGTCCGTAACGTTGTCGATTTTTGTATTCCGGGGCCATGATGCCCCGGCCTCATTGAA H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DC)' CGGAAAAGAGCC I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DA)(DA)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DT) (DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DT) (DT)(DT)(DC)(DC)(DG) ; CAATGAGGCCGGGGCATCATGGCCCCGGAATACGGCTCTTTTCCG J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DG n 1 2 DT n 1 3 DC n 1 4 DG n 1 5 DT n 1 6 DA n 1 7 DG n 1 8 DC n 1 9 DT n 1 10 DG n 1 11 DA n 1 12 DG n 1 13 DG n 1 14 DC n 1 15 DC n 1 16 DT n 1 17 DC n 1 18 DA n 1 19 DG n 1 20 DC n 1 21 DT n 1 22 DA n 1 23 DC n 1 24 DG n 1 25 DA n 1 26 DC n 1 27 DT n 1 28 DT n 1 29 DT n 1 30 DT n 1 31 DT n 2 1 MET n 2 2 ALA n 2 3 GLU n 2 4 THR n 2 5 ASP n 2 6 GLY n 2 7 SER n 2 8 ILE n 2 9 PRO n 2 10 LEU n 2 11 ILE n 2 12 PRO n 2 13 VAL n 2 14 ARG n 2 15 MET n 2 16 LEU n 2 17 ASN n 2 18 GLU n 2 19 HIS n 2 20 VAL n 2 21 TYR n 2 22 CYS n 2 23 PRO n 2 24 ARG n 2 25 LEU n 2 26 ALA n 2 27 TYR n 2 28 LEU n 2 29 MET n 2 30 TRP n 2 31 VAL n 2 32 GLN n 2 33 GLY n 2 34 GLU n 2 35 PHE n 2 36 SER n 2 37 HIS n 2 38 ASN n 2 39 GLU n 2 40 PHE n 2 41 THR n 2 42 VAL n 2 43 ASP n 2 44 GLY n 2 45 VAL n 2 46 ILE n 2 47 ARG n 2 48 HIS n 2 49 ARG n 2 50 ARG n 2 51 VAL n 2 52 ASP n 2 53 ALA n 2 54 GLY n 2 55 GLY n 2 56 GLY n 2 57 VAL n 2 58 LEU n 2 59 PRO n 2 60 SER n 2 61 GLU n 2 62 THR n 2 63 GLN n 2 64 GLU n 2 65 ASP n 2 66 SER n 2 67 ARG n 2 68 ILE n 2 69 HIS n 2 70 ALA n 2 71 ARG n 2 72 SER n 2 73 VAL n 2 74 SER n 2 75 LEU n 2 76 SER n 2 77 SER n 2 78 GLU n 2 79 ARG n 2 80 LEU n 2 81 GLY n 2 82 ILE n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 LYS n 2 86 ILE n 2 87 ASP n 2 88 LEU n 2 89 VAL n 2 90 GLU n 2 91 GLY n 2 92 GLU n 2 93 GLY n 2 94 ALA n 2 95 TYR n 2 96 VAL n 2 97 SER n 2 98 PRO n 2 99 VAL n 2 100 ASP n 2 101 TYR n 2 102 LYS n 2 103 ARG n 2 104 GLY n 2 105 LYS n 2 106 ARG n 2 107 PRO n 2 108 HIS n 2 109 VAL n 2 110 ALA n 2 111 GLY n 2 112 GLY n 2 113 ALA n 2 114 TYR n 2 115 GLU n 2 116 PRO n 2 117 GLU n 2 118 ARG n 2 119 VAL n 2 120 GLN n 2 121 LEU n 2 122 CYS n 2 123 ALA n 2 124 GLN n 2 125 GLY n 2 126 LEU n 2 127 LEU n 2 128 LEU n 2 129 ARG n 2 130 GLU n 2 131 HIS n 2 132 GLY n 2 133 PHE n 2 134 ALA n 2 135 SER n 2 136 ASP n 2 137 GLY n 2 138 GLY n 2 139 ALA n 2 140 LEU n 2 141 TYR n 2 142 PHE n 2 143 VAL n 2 144 ALA n 2 145 SER n 2 146 ARG n 2 147 GLU n 2 148 ARG n 2 149 VAL n 2 150 PRO n 2 151 VAL n 2 152 ALA n 2 153 PHE n 2 154 ASP n 2 155 ASP n 2 156 GLU n 2 157 LEU n 2 158 ILE n 2 159 GLY n 2 160 ARG n 2 161 THR n 2 162 LEU n 2 163 ALA n 2 164 ALA n 2 165 ILE n 2 166 ASP n 2 167 GLU n 2 168 MET n 2 169 GLY n 2 170 ARG n 2 171 THR n 2 172 ALA n 2 173 LEU n 2 174 SER n 2 175 GLY n 2 176 THR n 2 177 MET n 2 178 PRO n 2 179 PRO n 2 180 PRO n 2 181 LEU n 2 182 GLU n 2 183 ASP n 2 184 SER n 2 185 PRO n 2 186 LYS n 2 187 CYS n 2 188 PRO n 2 189 ARG n 2 190 CYS n 2 191 SER n 2 192 LEU n 2 193 VAL n 2 194 GLY n 2 195 ILE n 2 196 CYS n 2 197 LEU n 2 198 PRO n 2 199 ASP n 2 200 GLU n 2 201 VAL n 2 202 ARG n 2 203 PHE n 2 204 LEU n 2 205 SER n 2 206 HIS n 2 207 LEU n 2 208 SER n 2 209 VAL n 2 210 GLU n 2 211 PRO n 2 212 ARG n 2 213 PRO n 2 214 ILE n 2 215 ILE n 2 216 PRO n 2 217 ALA n 2 218 ASP n 2 219 GLY n 2 220 ARG n 2 221 GLY n 2 222 LEU n 2 223 PRO n 2 224 LEU n 2 225 TYR n 2 226 VAL n 2 227 GLN n 2 228 SER n 2 229 PRO n 2 230 LYS n 2 231 ALA n 2 232 TYR n 2 233 VAL n 2 234 ARG n 2 235 LYS n 2 236 ASP n 2 237 GLY n 2 238 ASP n 2 239 CYS n 2 240 LEU n 2 241 VAL n 2 242 ILE n 2 243 GLU n 2 244 GLU n 2 245 GLU n 2 246 ARG n 2 247 VAL n 2 248 ARG n 2 249 VAL n 2 250 ALA n 2 251 GLU n 2 252 ALA n 2 253 ARG n 2 254 LEU n 2 255 GLY n 2 256 GLU n 2 257 THR n 2 258 SER n 2 259 GLN n 2 260 VAL n 2 261 ALA n 2 262 LEU n 2 263 PHE n 2 264 GLY n 2 265 ASN n 2 266 ALA n 2 267 THR n 2 268 LEU n 2 269 THR n 2 270 THR n 2 271 ALA n 2 272 ALA n 2 273 LEU n 2 274 HIS n 2 275 GLU n 2 276 CYS n 2 277 LEU n 2 278 ARG n 2 279 ARG n 2 280 GLU n 2 281 ILE n 2 282 PRO n 2 283 VAL n 2 284 THR n 2 285 TRP n 2 286 LEU n 2 287 SER n 2 288 TYR n 2 289 GLY n 2 290 GLY n 2 291 TRP n 2 292 PHE n 2 293 MET n 2 294 GLY n 2 295 HIS n 2 296 THR n 2 297 VAL n 2 298 SER n 2 299 THR n 2 300 GLY n 2 301 HIS n 2 302 ARG n 2 303 ASN n 2 304 VAL n 2 305 GLU n 2 306 THR n 2 307 ARG n 2 308 THR n 2 309 TYR n 2 310 GLN n 2 311 TYR n 2 312 GLN n 2 313 ARG n 2 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44 DC 44 79 79 DC DC J . n J 6 45 DG 45 80 80 DG DG J . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7MIB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7MIB _struct.title 'Half integration complex of Cas4/Cas1/Cas2 with Cas4 still on the Non-PAM side' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7MIB _struct_keywords.text 'CRISPR/Cas, Cas4, PAM recognition, half integration, HYDROLASE-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7MIB 7MIB ? 1 ? 1 2 UNP CS4F1_GEOSL Q74H36 ? 2 ;MAETDGSIPLIPVRMLNEHVYCPRLAYLMWVQGEFSHNEFTVDGVIRHRRVDAGGGVLPSETQEDSRIHARSVSLSSERL GITAKIDLVEGEGAYVSPVDYKRGKRPHVAGGAYEPERVQLCAQGLLLREHGFASDGGALYFVASRERVPVAFDDELIGR TLAAIDEMGRTALSGTMPPPLEDSPKCPRCSLVGICLPDEVRFLSHLSVEPRPIIPADGRGLPLYVQSPKAYVRKDGDCL VIEEERVRVAEARLGETSQVALFGNATLTTAALHECLRREIPVTWLSYGGWFMGHTVSTGHRNVETRTYQYQRSFDPETC LNLARRWIVAKIANCRTLLRRNWRGEGDEAKAPPGLLMSLQDDMRHAMRAPSLEVLLGIEGASAGRYFQHFSRMLRGGDG EGMGFDFTTRNRRPPKDPVNALLSFAYAMLTREWTVALAAVGLDPYRGFYHQPRFGRPALALDMMEPFRPLIADSTVLMA INNGEIRTGDFVRSAGGCNLTDSARKRFIAGFERRMEQEVTHPIFKYTISYRRLLEVQARLLTRYLSGEIPAYPNFVTR ; 1 3 UNP CAS2_GEOSL Q74H35 ? 3 ;MEHLYIVSYDIRNQRRWRRLFKTMHGFGCWLQLSVFQCRLDRIRIIKMEAAINEIVNHAEDHVLILDLGPAENVKPKVSS IGKTFDPILRQAVIV ; 1 4 PDB 7MIB 7MIB ? 4 ? 1 5 PDB 7MIB 7MIB ? 5 ? 1 6 PDB 7MIB 7MIB ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7MIB G 1 ? 31 ? 7MIB 1 ? 31 ? 1 31 2 2 7MIB A 1 ? 559 ? Q74H36 1 ? 559 ? 1 559 3 2 7MIB B 1 ? 559 ? Q74H36 1 ? 559 ? 1 559 4 2 7MIB C 1 ? 559 ? Q74H36 1 ? 559 ? 1 559 5 2 7MIB D 1 ? 559 ? Q74H36 1 ? 559 ? 1 559 6 3 7MIB E 1 ? 95 ? Q74H35 1 ? 95 ? 1 95 7 3 7MIB F 1 ? 95 ? Q74H35 1 ? 95 ? 1 95 8 4 7MIB H 1 ? 64 ? 7MIB 3 ? 66 ? 3 66 9 5 7MIB I 1 ? 12 ? 7MIB 1 ? 12 ? 1 12 10 6 7MIB J 1 ? 45 ? 7MIB 36 ? 80 ? 36 80 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 27470 ? 1 MORE -148 ? 1 'SSA (A^2)' 94770 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR B 269 ? ARG B 279 ? THR A 269 ARG A 279 1 ? 11 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN B 303 ? ASP B 316 ? ASN A 303 ASP A 316 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO B 317 ? TRP B 343 ? PRO A 317 TRP A 343 1 ? 27 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO B 353 ? ARG B 369 ? PRO A 353 ARG A 369 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU B 374 ? SER B 392 ? GLU A 374 SER A 392 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 422 ? ALA B 439 ? LEU A 422 ALA A 439 1 ? 18 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO B 458 ? MET B 464 ? PRO A 458 MET A 464 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 AA8 PHE B 468 ? ALA B 473 ? PHE A 468 ALA A 473 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 THR B 476 ? ILE B 481 ? THR A 476 ILE A 481 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 ARG B 487 ? GLY B 489 ? ARG A 487 GLY A 489 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 THR B 501 ? MET B 516 ? THR A 501 MET A 516 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 AB3 TYR B 531 ? SER B 547 ? TYR A 531 SER A 547 1 ? 17 HELX_P HELX_P13 AB4 ARG C 253 ? THR C 257 ? ARG B 253 THR B 257 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 ALA C 271 ? LEU C 277 ? ALA B 271 LEU B 277 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 ARG C 302 ? PHE C 315 ? ARG B 302 PHE B 315 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP C 316 ? LEU C 339 ? ASP B 316 LEU B 339 1 ? 24 HELX_P HELX_P17 AB8 PRO C 353 ? ARG C 369 ? PRO B 353 ARG B 369 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 AB9 SER C 372 ? ARG C 386 ? SER B 372 ARG B 386 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 TYR C 387 ? HIS C 390 ? TYR B 387 HIS B 390 5 ? 4 HELX_P HELX_P20 AC2 PHE C 391 ? ARG C 396 ? PHE B 391 ARG B 396 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 PRO C 418 ? LEU C 422 ? PRO B 418 LEU B 422 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 SER C 424 ? ALA C 440 ? SER B 424 ALA B 440 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 AC5 PRO C 458 ? MET C 465 ? PRO B 458 MET B 465 1 ? 8 HELX_P HELX_P24 AC6 PRO C 467 ? ILE C 472 ? PRO B 467 ILE B 472 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 ILE C 472 ? ASN C 482 ? ILE B 472 ASN B 482 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 ARG C 487 ? PHE C 491 ? ARG B 487 PHE B 491 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 THR C 501 ? GLU C 517 ? THR B 501 GLU B 517 1 ? 17 HELX_P HELX_P28 AD1 TYR C 531 ? LEU C 546 ? TYR B 531 LEU B 546 1 ? 16 HELX_P HELX_P29 AD2 VAL D 13 ? GLU D 18 ? VAL C 13 GLU C 18 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 HIS D 19 ? TYR D 21 ? HIS C 19 TYR C 21 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 AD4 CYS D 22 ? GLN D 32 ? CYS C 22 GLN C 32 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN D 38 ? ASP D 52 ? ASN C 38 ASP C 52 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 AD6 VAL D 109 ? ALA D 113 ? VAL C 109 ALA C 113 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 TYR D 114 ? HIS D 131 ? TYR C 114 HIS C 131 1 ? 18 HELX_P HELX_P35 AD8 ASP D 154 ? GLY D 175 ? ASP C 154 GLY C 175 1 ? 22 HELX_P HELX_P36 AD9 PRO D 185 ? SER D 191 ? PRO C 185 SER C 191 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 LEU D 192 ? LEU D 197 ? LEU C 192 LEU C 197 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 AE2 LEU D 197 ? SER D 205 ? LEU C 197 SER C 205 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 THR D 269 ? ARG D 279 ? THR C 269 ARG C 279 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 VAL D 304 ? PHE D 315 ? VAL C 304 PHE C 315 1 ? 12 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP D 316 ? ASN D 342 ? ASP C 316 ASN C 342 1 ? 27 HELX_P HELX_P42 AE6 PRO D 353 ? LEU D 360 ? PRO C 353 LEU C 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P43 AE7 GLN D 361 ? ARG D 369 ? GLN C 361 ARG C 369 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 AE8 SER D 372 ? HIS D 390 ? SER C 372 HIS C 390 1 ? 19 HELX_P HELX_P45 AE9 PHE D 391 ? LEU D 395 ? PHE C 391 LEU C 395 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 AF1 ASP D 417 ? VAL D 441 ? ASP C 417 VAL C 441 1 ? 25 HELX_P HELX_P47 AF2 MET D 464 ? ILE D 472 ? MET C 464 ILE C 472 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 AF3 ILE D 472 ? ASN D 483 ? ILE C 472 ASN C 483 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 AF4 ARG D 487 ? GLY D 489 ? ARG C 487 GLY C 489 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 AF5 THR D 501 ? MET D 516 ? THR C 501 MET C 516 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 SER D 530 ? GLY D 548 ? SER C 530 GLY C 548 1 ? 19 HELX_P HELX_P52 AF7 THR E 269 ? ARG E 279 ? THR D 269 ARG D 279 1 ? 11 HELX_P HELX_P53 AF8 ASN E 303 ? PHE E 315 ? ASN D 303 PHE D 315 1 ? 13 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP E 316 ? ARG E 340 ? ASP D 316 ARG D 340 1 ? 25 HELX_P HELX_P55 AG1 PRO E 353 ? ARG E 369 ? PRO D 353 ARG D 369 1 ? 17 HELX_P HELX_P56 AG2 SER E 372 ? HIS E 390 ? SER D 372 HIS D 390 1 ? 19 HELX_P HELX_P57 AG3 PHE E 391 ? LEU E 395 ? PHE D 391 LEU D 395 5 ? 5 HELX_P HELX_P58 AG4 ASP E 417 ? VAL E 441 ? ASP D 417 VAL D 441 1 ? 25 HELX_P HELX_P59 AG5 PRO E 458 ? GLU E 466 ? PRO D 458 GLU D 466 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 AG6 PRO E 467 ? ALA E 473 ? PRO D 467 ALA D 473 1 ? 7 HELX_P HELX_P61 AG7 ALA E 473 ? ASN E 483 ? ALA D 473 ASN D 483 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ARG E 487 ? GLY E 489 ? ARG D 487 GLY D 489 5 ? 3 HELX_P HELX_P63 AG9 THR E 501 ? GLU E 517 ? THR D 501 GLU D 517 1 ? 17 HELX_P HELX_P64 AH1 TYR E 531 ? LEU E 546 ? TYR D 531 LEU D 546 1 ? 16 HELX_P HELX_P65 AH2 ASN F 13 ? GLY F 26 ? ASN E 13 GLY E 26 1 ? 14 HELX_P HELX_P66 AH3 ARG F 44 ? ILE F 55 ? ARG E 44 ILE E 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P67 AH4 VAL F 74 ? VAL F 78 ? VAL E 74 VAL E 78 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 AH5 ASN G 13 ? GLY G 26 ? ASN F 13 GLY F 26 1 ? 14 HELX_P HELX_P69 AH6 ARG G 44 ? ILE G 55 ? ARG F 44 ILE F 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P70 AH7 VAL G 74 ? VAL G 78 ? VAL F 74 VAL F 78 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 H DT 21 O4 ? ? G DC 3 H DT 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 H DG 20 O6 ? ? G DG 4 H DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DT 5 N3 ? ? ? 1_555 H DT 19 O4 ? ? G DT 5 H DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 H DT 19 N3 ? ? G DA 6 H DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 H DT 19 O4 ? ? G DA 6 H DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 8 N3 ? ? ? 1_555 H DG 17 N2 ? ? G DC 8 H DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 8 O2 ? ? ? 1_555 H DG 17 N1 ? ? G DC 8 H DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DT 9 N3 ? ? ? 1_555 H DA 15 N1 ? ? G DT 9 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DT 9 O4 ? ? ? 1_555 H DA 15 N6 ? ? G DT 9 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 H DA 15 N1 ? ? G DG 10 H DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 13 N1 ? ? ? 1_555 H DG 12 O6 ? ? G DG 13 H DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DC 15 N4 ? ? ? 1_555 H DT 9 O4 ? ? G DC 15 H DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DC 15 N3 ? ? ? 1_555 H DC 10 N4 ? ? G DC 15 H DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DT 16 N3 ? ? ? 1_555 H DG 8 O6 ? ? G DT 16 H DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DT 16 O4 ? ? ? 1_555 H DG 8 N1 ? ? G DT 16 H DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_27_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DT 16 N3 ? ? ? 1_555 H DT 9 O4 ? ? G DT 16 H DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DT 16 O2 ? ? ? 1_555 H DT 9 N3 ? ? G DT 16 H DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 17 N3 ? ? ? 1_555 H DC 7 N4 ? ? 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H 8 ? ? ? 1 A DG 19 1_555 H DG 5 1_555 -1.094 0.897 0.076 5.056 -17.542 -8.358 11 G_DG19:DG7_H G 19 ? H 7 ? ? ? 1 A DA 22 1_555 H DT 2 1_555 2.162 -5.562 0.285 6.214 24.910 127.485 12 G_DA22:DT4_H G 22 ? H 4 ? ? ? 1 H DG 30 1_555 J DG 35 1_555 2.259 0.679 1.514 16.149 30.658 17.593 13 H_DG32:DG70_J H 32 ? J 70 ? ? 1 1 H DT 31 1_555 J DA 32 1_555 0.376 -0.821 -0.675 17.654 -35.595 15.576 14 H_DT33:DA67_J H 33 ? J 67 ? ? 1 1 H DA 32 1_555 J DT 31 1_555 -0.210 -0.685 -0.446 -14.553 -23.936 9.905 15 H_DA34:DT66_J H 34 ? J 66 ? 20 1 1 H DT 33 1_555 J DA 30 1_555 -0.458 -0.445 -0.336 4.180 -13.967 13.387 16 H_DT35:DA65_J H 35 ? J 65 ? 20 1 1 H DT 34 1_555 J DA 29 1_555 0.108 0.072 1.034 -0.535 -24.314 16.469 17 H_DT36:DA64_J H 36 ? J 64 ? ? 1 1 H DC 35 1_555 J DG 28 1_555 0.081 -0.626 -0.603 2.931 -17.953 9.817 18 H_DC37:DG63_J H 37 ? J 63 ? 19 1 1 H DC 36 1_555 J DG 27 1_555 0.056 -0.613 -1.039 16.370 -31.278 16.466 19 H_DC38:DG62_J H 38 ? 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