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_citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 13 _citation.language ? _citation.page_first 251 _citation.page_last 251 _citation.title 'Mapping inhibitory sites on the RNA polymerase of the 1918 pandemic influenza virus using nanobodies.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-27950-w _citation.pdbx_database_id_PubMed 35017564 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal 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LAKSVFNSLYASPQLEGFSAESRKLLLIVQALRDNLEPGTFDLGGLYEAIEECLINDPWVLLNASWFNSFLTHALR ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MDVNPTLLFLKVPAQNAISTTFPYTGDPPYSHGTGTGYTMDTVNRTHQYSEKGRWTTNTETGAPQLNPIDGPLPEDNEPS GYAQTDCVLEAMAFLEESHPGIFENSCLETMEVVQQTRVDKLTQGRQTYDWTLNRNQPAATALANTIEVFRSNGLTANES GRLIDFLKDVMESMDKEEMEITTHFQRKRRVRDNMTKKMVTQRTIGKKKQRLNKRSYLIRALTLNTMTKDAERGKLKRRA IATPGMQIRGFVYFVETLARSICEKLEQSGLPVGGNEKKAKLANVVRKMMTNSQDTELSFTITGDNTKWNENQNPRMFLA MITYITRNQPEWFRNVLSIAPIMFSNKMARLGKGYMFESKSMKLRTQIPAEMLASIDLKYFNDSTRKKIEKIRPLLIDGT ASLSPGMMMGMFNMLSTVLGVSILNLGQKRYTKTTYWWDGLQSSDDFALIVNAPNHEGIQAGVDRFYRTCKLLGINMSKK KSYINRTGTFEFTSFFYRYGFVANFSMELPSFGVSGINESADMSIGVTVIKNNMINNDLGPATAQMALQLFIKDYRYTYR CHRGDTQIQTRRSFEIKKLWEQTRSKAGLLVSDGGPNLYNIRNLHIPEVCLKWELMDEDYQGRLCNPLNPFVSHKEIESV NNAVMMPAHGPAKNMEYDAVATTHSWIPKRNRSILNTSQRGILEDEQMYQKCCNLFEKFFPSSSYRRPVGISSMVEAMVS RARIDARIDFESGRIKKEEFAEIMKICSTIEELRRQK ; ;MDVNPTLLFLKVPAQNAISTTFPYTGDPPYSHGTGTGYTMDTVNRTHQYSEKGRWTTNTETGAPQLNPIDGPLPEDNEPS 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LQMNSLKPEDTAVYYCAARFYGGGYYYQQREYSFWGQGTQVTVSSHHHHHHEPEA ; F ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLU n 1 3 ASP n 1 4 PHE n 1 5 VAL n 1 6 ARG n 1 7 GLN n 1 8 CYS n 1 9 PHE n 1 10 ASN n 1 11 PRO n 1 12 MET n 1 13 ILE n 1 14 VAL n 1 15 GLU n 1 16 LEU n 1 17 ALA n 1 18 GLU n 1 19 LYS n 1 20 ALA n 1 21 MET n 1 22 LYS n 1 23 GLU n 1 24 TYR n 1 25 GLY n 1 26 GLU n 1 27 ASP n 1 28 LEU n 1 29 LYS n 1 30 ILE n 1 31 GLU n 1 32 THR n 1 33 ASN n 1 34 LYS n 1 35 PHE n 1 36 ALA n 1 37 ALA n 1 38 ILE n 1 39 CYS n 1 40 THR n 1 41 HIS n 1 42 LEU n 1 43 GLU n 1 44 VAL n 1 45 CYS n 1 46 PHE n 1 47 MET n 1 48 TYR n 1 49 SER n 1 50 ASP n 1 51 PHE n 1 52 HIS n 1 53 PHE n 1 54 ILE n 1 55 ASN n 1 56 GLU n 1 57 ARG n 1 58 GLY n 1 59 GLU n 1 60 SER n 1 61 ILE n 1 62 ILE n 1 63 VAL n 1 64 GLU n 1 65 SER n 1 66 GLY n 1 67 ASP n 1 68 PRO n 1 69 ASN n 1 70 ALA n 1 71 LEU n 1 72 LEU n 1 73 LYS n 1 74 HIS n 1 75 ARG n 1 76 PHE n 1 77 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 4 1 sample 1 17 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? 88776 ? 5 1 sample 1 15 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? 88776 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PA_I18A0 Q3HM39 ? 1 ;MEDFVRQCFNPMIVELAEKAMKEYGEDLKIETNKFAAICTHLEVCFMYSDFHFINERGESIIVESGDPNALLKHRFEIIE GRDRTMAWTVVNSICNTTGAEKPKFLPDLYDYKENRFIEIGVTRREVHIYYLEKANKIKSEKTHIHIFSFTGEEMATKAD YTLDEESRARIKTRLFTIRQEMASRGLWDSFRQSERGEETIEERFEITGTMRRLADQSLPPNFSSLENFRAYVDGFEPNG YIEGKLSQMSKEVNARIEPFLKTTPRPLRLPDGPPCSQRSKFLLMDALKLSIEDPSHEGEGIPLYDAIKCMRTFFGWKEP NVVKPHEKGINPNYLLAWKQVLAELQDIENEEKIPKTKNMKKTSQLKWALGENMAPEKVDFDDCKDVSDLKQYDSDEPEL RSLASWIQSEFNKACELTDSSWIELDEIGEDVAPIEHIASMRRNYFTAEVSHCRATEYIMKGVYINTALLNASCAAMDDF QLIPMISKCRTKEGRRKTNLYGFIIKGRSHLRNDTDVVNFVSMEFSLTDPRLEPHKWEKYCVLEIGDMLLRSAIGQVSRP MFLYVRTNGTSKIKMKWGMEMRRCLLQSLQQIESMIEAESSVKEKDMTKEFFENKSETWPIGESPKGVEEGSIGKVCRTL LAKSVFNSLYASPQLEGFSAESRKLLLIVQALRDNLEPGTFDLGGLYEAIEECLINDPWVLLNASWFNSFLTHALR ; 1 2 UNP RDRP_I18A0 Q3HM40 ? 2 ;MDVNPTLLFLKVPAQNAISTTFPYTGDPPYSHGTGTGYTMDTVNRTHQYSEKGRWTTNTETGAPQLNPIDGPLPEDNEPS GYAQTDCVLEAMAFLEESHPGIFENSCLETMEVVQQTRVDKLTQGRQTYDWTLNRNQPAATALANTIEVFRSNGLTANES GRLIDFLKDVMESMDKEEMEITTHFQRKRRVRDNMTKKMVTQRTIGKKKQRLNKRSYLIRALTLNTMTKDAERGKLKRRA IATPGMQIRGFVYFVETLARSICEKLEQSGLPVGGNEKKAKLANVVRKMMTNSQDTELSFTITGDNTKWNENQNPRMFLA MITYITRNQPEWFRNVLSIAPIMFSNKMARLGKGYMFESKSMKLRTQIPAEMLASIDLKYFNDSTRKKIEKIRPLLIDGT ASLSPGMMMGMFNMLSTVLGVSILNLGQKRYTKTTYWWDGLQSSDDFALIVNAPNHEGIQAGVDRFYRTCKLLGINMSKK KSYINRTGTFEFTSFFYRYGFVANFSMELPSFGVSGINESADMSIGVTVIKNNMINNDLGPATAQMALQLFIKDYRYTYR CHRGDTQIQTRRSFEIKKLWEQTRSKAGLLVSDGGPNLYNIRNLHIPEVCLKWELMDEDYQGRLCNPLNPFVSHKEIESV NNAVMMPAHGPAKNMEYDAVATTHSWIPKRNRSILNTSQRGILEDEQMYQKCCNLFEKFFPSSSYRRPVGISSMVEAMVS RARIDARIDFESGRIKKEEFAEIMKICSTIEELRRQK ; 1 3 UNP PB2_I18A0 Q3HM41 ? 3 ;MERIKELRDLMSQSRTREILTKTTVDHMAIIKKYTSGRQEKNPALRMKWMMAMKYPITADKRIMEMIPERNEQGQTLWSK TNDAGSDRVMVSPLAVTWWNRNGPTTSAVHYPKIYKTYFEKVERLKHGTFGPVHFRNQVKIRRRVDINPGHADLSAKEAQ DVIMEVVFPNEVGARILTSESQLTITKEKKEELQDCKISPLMVAYMLERELVRKTRFLPVAGGTSSVYIEVLHLTQGTCW EQMYTPGGEVRNDDVDQSLIIAARNIVRRATVSADPLASLLEMCHSTQIGGIRMVDILRQNPTEEQAVDICKAAMGLRIS SSFSFGGFTFKRTSGSSVKREEEVLTGNLQTLKIRVHEGYEEFTMVGRRATAILRKATRRLIQLIVSGRDEQSIAEAIIV AMVFSQEDCMIKAVRGDLNFVNRANQRLNPMHQLLRHFQKDAKVLFQNWGIEPIDNVMGMIGILPDMTPSTEMSMRGVRV SKMGVDEYSSTERVVVSIDRFLRVRDQRGNVLLSPEEVSETQGTEKLTITYSSSMMWEVNGPESVLVNTYQWIIRNWETV KIQWSQNPTMLYNKMEFEPFQSLVPKAARGQYSGFVRTLFQQMRDVLGTFDTVQIIKLLPFAAAPPKQSRMQFSSLTVNV RGSGMRILVRGNSPVFNYNKATKRLTVLGKDAGALTEDPDEGTAGVESAVLRGFLILGKEDRRYGPALSINELSNLAKGE KANVLIGQGDVVLVMKRKRDSSILTDSQTATKRIRMAIN ; 1 4 UNP SPA_STAAU P38507 ? 3 ;FNKEQQNAFYEILNMPNLNEEQRNGFIQSLKDDPSQSANLLAEAKKLNESQAPKADNKFNKEQQNAFYEILHLPNLNEEQ RNGFIQSLKDDPSQSANLLAEAKKLNDAQAPKAD ; 158 5 PDB 7NJ4 7NJ4 ? 4 ? 1 6 PDB 7NJ4 7NJ4 ? 5 ? 1 7 PDB 7NJ4 7NJ4 ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7NJ4 A 1 ? 716 ? 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UNP Q3HM41 ? ? linker 765 6 3 7NJ4 GLY C 766 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 766 7 3 7NJ4 GLU C 767 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 767 8 3 7NJ4 LEU C 768 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 768 9 3 7NJ4 LYS C 769 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 769 10 3 7NJ4 THR C 770 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 770 11 3 7NJ4 ALA C 771 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 771 12 3 7NJ4 ALA C 772 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 772 13 3 7NJ4 LEU C 773 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 773 14 3 7NJ4 ALA C 774 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 774 15 3 7NJ4 GLN C 775 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 775 16 3 7NJ4 HIS C 776 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 776 17 3 7NJ4 ASP C 777 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 777 18 3 7NJ4 GLU C 778 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 778 19 3 7NJ4 ALA C 779 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 779 20 3 7NJ4 VAL C 780 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 780 21 3 7NJ4 ASP C 781 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 781 22 3 7NJ4 ASN C 782 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 782 23 3 7NJ4 LYS C 783 ? UNP Q3HM41 ? ? linker 783 24 4 7NJ4 HIS C 797 ? UNP P38507 ASN 171 conflict 797 25 4 7NJ4 LEU C 798 ? 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C SER 820 594 1 Y 1 C ALA 821 ? C ALA 821 595 1 Y 1 C ASN 822 ? C ASN 822 596 1 Y 1 C LEU 823 ? C LEU 823 597 1 Y 1 C LEU 824 ? C LEU 824 598 1 Y 1 C ALA 825 ? C ALA 825 599 1 Y 1 C GLU 826 ? C GLU 826 600 1 Y 1 C ALA 827 ? C ALA 827 601 1 Y 1 C LYS 828 ? C LYS 828 602 1 Y 1 C LYS 829 ? C LYS 829 603 1 Y 1 C LEU 830 ? C LEU 830 604 1 Y 1 C ASN 831 ? C ASN 831 605 1 Y 1 C ASP 832 ? C ASP 832 606 1 Y 1 C ALA 833 ? C ALA 833 607 1 Y 1 C GLN 834 ? C GLN 834 608 1 Y 1 C ALA 835 ? C ALA 835 609 1 Y 1 C PRO 836 ? C PRO 836 610 1 Y 1 C LYS 837 ? C LYS 837 611 1 Y 1 C VAL 838 ? C VAL 838 612 1 Y 1 C ASP 839 ? C ASP 839 613 1 Y 1 C ASN 840 ? C ASN 840 614 1 Y 1 C LYS 841 ? C LYS 841 615 1 Y 1 C PHE 842 ? C PHE 842 616 1 Y 1 C ASN 843 ? C ASN 843 617 1 Y 1 C LYS 844 ? C LYS 844 618 1 Y 1 C GLU 845 ? C GLU 845 619 1 Y 1 C GLN 846 ? C GLN 846 620 1 Y 1 C GLN 847 ? C GLN 847 621 1 Y 1 C ASN 848 ? C ASN 848 622 1 Y 1 C ALA 849 ? C ALA 849 623 1 Y 1 C PHE 850 ? C PHE 850 624 1 Y 1 C TYR 851 ? C TYR 851 625 1 Y 1 C GLU 852 ? C GLU 852 626 1 Y 1 C ILE 853 ? C ILE 853 627 1 Y 1 C LEU 854 ? C LEU 854 628 1 Y 1 C HIS 855 ? C HIS 855 629 1 Y 1 C LEU 856 ? C LEU 856 630 1 Y 1 C PRO 857 ? C PRO 857 631 1 Y 1 C ASN 858 ? C ASN 858 632 1 Y 1 C LEU 859 ? C LEU 859 633 1 Y 1 C ASN 860 ? C ASN 860 634 1 Y 1 C GLU 861 ? C GLU 861 635 1 Y 1 C GLU 862 ? C GLU 862 636 1 Y 1 C GLN 863 ? C GLN 863 637 1 Y 1 C ARG 864 ? C ARG 864 638 1 Y 1 C ASN 865 ? C ASN 865 639 1 Y 1 C ALA 866 ? C ALA 866 640 1 Y 1 C PHE 867 ? C PHE 867 641 1 Y 1 C ILE 868 ? C ILE 868 642 1 Y 1 C GLN 869 ? C GLN 869 643 1 Y 1 C SER 870 ? C SER 870 644 1 Y 1 C LEU 871 ? C LEU 871 645 1 Y 1 C LYS 872 ? C LYS 872 646 1 Y 1 C ALA 873 ? C ALA 873 647 1 Y 1 C ASP 874 ? C ASP 874 648 1 Y 1 C PRO 875 ? C PRO 875 649 1 Y 1 C SER 876 ? C SER 876 650 1 Y 1 C GLN 877 ? C GLN 877 651 1 Y 1 C SER 878 ? C SER 878 652 1 Y 1 C ALA 879 ? C ALA 879 653 1 Y 1 C ASN 880 ? C ASN 880 654 1 Y 1 C LEU 881 ? C LEU 881 655 1 Y 1 C LEU 882 ? 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F ALA 25 689 1 Y 1 F GLU 26 ? F GLU 26 690 1 Y 1 F ARG 27 ? F ARG 27 691 1 Y 1 F SER 28 ? F SER 28 692 1 Y 1 F PHE 29 ? F PHE 29 693 1 Y 1 F ASN 30 ? F ASN 30 694 1 Y 1 F SER 31 ? F SER 31 695 1 Y 1 F ALA 52 ? F ALA 52 696 1 Y 1 F PHE 53 ? F PHE 53 697 1 Y 1 F SER 54 ? F SER 54 698 1 Y 1 F GLY 55 ? F GLY 55 699 1 Y 1 F GLY 56 ? F GLY 56 700 1 Y 1 F PHE 57 ? F PHE 57 701 1 Y 1 F PHE 100 ? F PHE 100 702 1 Y 1 F TYR 101 ? F TYR 101 703 1 Y 1 F GLY 102 ? F GLY 102 704 1 Y 1 F GLY 103 ? F GLY 103 705 1 Y 1 F GLY 104 ? F GLY 104 706 1 Y 1 F TYR 105 ? F TYR 105 707 1 Y 1 F TYR 106 ? F TYR 106 708 1 Y 1 F TYR 107 ? F TYR 107 709 1 Y 1 F GLN 108 ? F GLN 108 710 1 Y 1 F GLN 109 ? F GLN 109 711 1 Y 1 F ARG 110 ? F ARG 110 712 1 Y 1 F GLU 111 ? F GLU 111 713 1 Y 1 F TYR 112 ? F TYR 112 714 1 Y 1 F SER 125 ? F SER 125 715 1 Y 1 F HIS 126 ? F HIS 126 716 1 Y 1 F HIS 127 ? F HIS 127 717 1 Y 1 F HIS 128 ? F HIS 128 718 1 Y 1 F HIS 129 ? F HIS 129 719 1 Y 1 F HIS 130 ? F HIS 130 720 1 Y 1 F HIS 131 ? F HIS 131 721 1 Y 1 F GLU 132 ? F GLU 132 722 1 Y 1 F PRO 133 ? F PRO 133 723 1 Y 1 F GLU 134 ? F GLU 134 724 1 Y 1 F ALA 135 ? F ALA 135 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 166 mM NaCl 'Sodium chloride' 1 2 25 mM NaSCN 'Sodium thiocynate' 1 3 20 mM HEPES-Na Hepes 1 4 0.005 % Tween-20 Tween-20 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 2 ? ? 88776 ? ? 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? ? 2 3 ? ? 88776 ? ? 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? ? 3 4 ? ? 88776 ? ? 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? ? 4 4 ? ? 1280 ? ? 'Staphylococcus aureus' ? ? 5 5 ? ? 88776 ? ? 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' ? ? 6 6 ? ? 1579311 ? ? 'Camelidae mixed library' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 2 ? 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? 2 3 ? 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? 3 4 ? 7108 'Spodoptera frugiperda' ? ? 4 6 ? 562 'Escherichia coli' ? ? # _em_entity_assembly_synthetic.id 1 _em_entity_assembly_synthetic.entity_assembly_id 6 _em_entity_assembly_synthetic.cell ? _em_entity_assembly_synthetic.cellular_location ? _em_entity_assembly_synthetic.ncbi_tax_id 88776 _em_entity_assembly_synthetic.organ ? _em_entity_assembly_synthetic.organelle ? _em_entity_assembly_synthetic.organism 'Influenza A virus (A/Brevig Mission/1/1918(H1N1))' _em_entity_assembly_synthetic.strain ? _em_entity_assembly_synthetic.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 69 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? cryoSPARC 2.15 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.19 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2.15 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 2.15 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7NJ4 'double helix' 7NJ4 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 D C 4 1_555 E G 12 1_555 0.109 -0.199 -0.817 2.352 5.122 -4.117 1 E_C4:G12_D E 4 ? 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