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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 462 Human ? GTF2H4 ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 71 Human ? 'GTF2H5, C6orf175, TTDA' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 782 Human ? 'ERCC3, XPB, XPBC' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 439 Human ? 'GTF2E1, TF2E1' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 8 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 'Biological sequence' 1 16 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 4 1 sample 1 106 'Human mastadenovirus C' ? 129951 ? 5 1 sample 1 106 'Human mastadenovirus C' ? 129951 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TF2H4_HUMAN Q92759 ? 1 ;MESTPSRGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFS KAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVL HFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSTEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQL SFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTVHQPGFIVVETNYRLYAYTE SELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDR LRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS ; 1 2 UNP TF2H5_HUMAN Q6ZYL4 ? 2 MVNVLKGVLIECDPAMKQFLLYLDESNALGKKFIIQDIDDTHVFVIAELVNVLQERVGELMDQNAFSLTQK 1 3 UNP ERCC3_HUMAN P19447 ? 3 ;MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAP DGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCT VSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTAESSGGPSTSRVTDPQG KSDIPMDLFDFYEQMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQ EKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKP IGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDL NFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIV FADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRL GRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAAT DLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVHPLFKRFRK ; 1 4 GB MK041240.1 1706691521 ? 4 ;CGGGTGTTCCTGAAGGGGGGCTATAAAAGGGGGTGGGGGCGCGTTCGTCCTCACTCTCTTCCGCATCGCTGTCTGCGAGG GCCAGCTGTTGGGGTGAGTACTCCCT ; 5990 5 GB MK041240.1 1706691521 ? 5 ;AGGGAGTACTCACCCCAACAGCTGGCCCTCGCAGACAGCGATGCGGAAGAGAGTGAGGACGAACGCGCCCCCACCCCCTT TTATAGCCCCCCTTCAGGAACACCCG ; 6095 6 UNP T2EA_HUMAN P29083 ? 6 ;MADPDVLTEVPAALKRLAKYVIRGFYGIEHALALDILIRNSCVKEEDMLELLKFDRKQLRSVLNNLKGDKFIKCRMRVET AADGKTTRHNYYFINYRTLVNVVKYKLDHMRRRIETDERDSTNRASFKCPVCSSTFTDLEANQLFDPMTGTFRCTFCHTE VEEDESAMPKKDARTLLARFNEQIEPIYALLRETEDVNLAYEILEPEPTEIPALKQSKDHAATTAGAASLAGGHHREAWA TKGPSYEDLYTQNVVINMDDQEDLHRASLEGKSAKERPIWLRESTVQGAYGSEDMKEGGIDMDAFQEREEGHAGPDDNEE VMRALLIHEKKTSSAMAGSVGAAAPVTAANGSDSESETSESDDDSPPRPAAVAVHKREEDEEEDDEFEEVADDPIVMVAG RPFSYSEVSQRPELVAQMTPEEKEAYIAMGQRMFEDLFE ; 1 7 PDB 7NVV 7NVV ? 7 ? 1 8 PDB 7NVV 7NVV ? 8 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7NVV 2 1 ? 462 ? Q92759 1 ? 462 ? 1 462 2 2 7NVV 5 1 ? 71 ? Q6ZYL4 1 ? 71 ? 1 71 3 3 7NVV 7 1 ? 782 ? P19447 1 ? 782 ? 1 782 4 4 7NVV N 1 ? 106 ? 1706691521 5990 ? 6095 ? -20 85 5 5 7NVV T 1 ? 106 ? 1706691521 6095 ? 5990 ? -85 20 6 6 7NVV W 1 ? 439 ? P29083 1 ? 439 ? 1 439 7 7 7NVV Y 1 ? 8 ? 7NVV 1 ? 8 ? 1 8 8 8 7NVV Z 1 ? 16 ? 7NVV 4 ? 19 ? 4 19 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BEF non-polymer . 'BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION' ? 'Be F3 -1' 66.007 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7NVV _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7NVV _struct.title 'XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3)' _struct.pdbx_descriptor ;General transcription factor IIH subunit 4, General transcription factor IIH subunit 5, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, General transcription factor IIE subunit 1, Unassigned peptide, likely XPB, Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta/DNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7NVV _struct_keywords.text 'Initiation, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 145 ? VAL A 164 ? VAL 2 145 VAL 2 164 1 ? 20 HELX_P HELX_P2 AA2 SER A 172 ? GLN A 181 ? SER 2 172 GLN 2 181 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 197 ? LEU A 206 ? THR 2 197 LEU 2 206 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 207 ? GLY A 227 ? ASP 2 207 GLY 2 227 1 ? 21 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 229 ? PHE A 242 ? ASP 2 229 PHE 2 242 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 256 ? PHE A 268 ? ASP 2 256 PHE 2 268 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 284 ? ASN A 289 ? THR 2 284 ASN 2 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 321 ? PHE A 331 ? SER 2 321 PHE 2 331 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 347 ? GLY A 358 ? THR 2 347 GLY 2 358 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 THR A 360 ? ARG A 371 ? THR 2 360 ARG 2 371 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 AB2 HIS A 373 ? GLN A 379 ? HIS 2 373 GLN 2 379 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO A 384 ? ASP A 399 ? PRO 2 384 ASP 2 399 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 414 ? GLY A 429 ? SER 2 414 GLY 2 429 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 AB5 GLY A 447 ? GLN A 458 ? GLY 2 447 GLN 2 458 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP B 13 ? ASN B 27 ? ASP 5 13 ASN 5 27 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 AB7 LEU B 49 ? ASN B 64 ? LEU 5 49 ASN 5 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL C 92 ? ALA C 104 ? VAL 7 92 ALA 7 104 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 THR C 119 ? GLY C 130 ? 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THR 7 705 THR 7 720 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 AF2 PRO F 278 ? GLU F 283 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id THR _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 380 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id A _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id THR _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 380 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id 2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 381 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 381 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -2.37 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 6 ? 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