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O50329 1 ? 104 ? 1 104 2 2 7O41 A 1 ? 823 ? O50330 1 ? 823 ? 1 823 3 2 7O41 B 1 ? 823 ? O50330 1 ? 823 ? 1 823 4 3 7O41 D 1 ? 231 ? O50335 1 ? 231 ? 1 231 5 3 7O41 E 1 ? 231 ? O50335 1 ? 231 ? 1 231 6 3 7O41 F 1 ? 231 ? O50335 1 ? 231 ? 1 231 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 7O41 TRP C 24 ? UNP O50329 LEU 24 conflict 24 1 1 7O41 VAL C 26 ? UNP O50329 GLU 26 conflict 26 2 4 7O41 ALA D 188 ? UNP O50335 ARG 188 conflict 188 3 5 7O41 ALA E 188 ? UNP O50335 ARG 188 conflict 188 4 6 7O41 ALA F 188 ? UNP O50335 ARG 188 conflict 188 5 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7O41 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7O41 _struct.title ;Hexameric composite model of the Inner Membrane Complex (IMC) with the Arches from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM. ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7O41 _struct_keywords.text ;type IV secretion system, type 4 secretion system, T4SS, IMC, inner membrane complex, inner membrane, arches, periplasmic, R388 plasmid, conjugation, bacterial secretion, secretion, secretion system, protein complex, VirB3, VirB4, VirB8, TrwM, TrwK, TrwG, MEMBRANE PROTEIN ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ALA A 3 GLU A 13 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 AA6 PRO B 15 ? ILE B 20 ? PRO A 15 ILE A 20 5 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 SER B 53 ? SER B 72 ? SER A 53 SER A 72 1 ? 20 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN B 97 ? SER B 110 ? ASN A 97 SER A 110 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 AA9 VAL B 134 ? ARG B 141 ? VAL A 134 ARG A 141 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 THR B 145 ? PHE B 171 ? THR A 145 PHE A 171 1 ? 27 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA B 191 ? GLY B 202 ? ALA A 191 GLY A 202 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 LEU B 260 ? LEU B 264 ? LEU A 260 LEU A 264 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 AB4 SER B 280 ? ASP B 297 ? SER A 280 ASP A 297 1 ? 18 HELX_P HELX_P14 AB5 THR B 303 ? GLY B 319 ? THR A 303 GLY A 319 1 ? 17 HELX_P HELX_P15 AB6 THR B 336 ? VAL B 354 ? THR A 336 VAL A 354 1 ? 19 HELX_P HELX_P16 AB7 ALA B 364 ? ALA B 371 ? ALA A 364 ALA A 371 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 387 ? SER B 395 ? THR A 387 SER A 395 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 AB9 SER B 455 ? GLN B 469 ? SER A 455 GLN A 469 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 LYS B 470 ? LYS B 472 ? 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PRO A 805 VAL A 807 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 AD7 TRP B 808 ? ARG B 820 ? TRP A 808 ARG A 820 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 SER C 53 ? ILE C 71 ? SER B 53 ILE B 71 1 ? 19 HELX_P HELX_P36 AD9 ASN C 97 ? SER C 110 ? ASN B 97 SER B 110 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 AE1 GLN C 148 ? PHE C 171 ? GLN B 148 PHE B 171 1 ? 24 HELX_P HELX_P38 AE2 ALA C 191 ? GLY C 202 ? ALA B 191 GLY B 202 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 AE3 ARG C 213 ? MET C 218 ? ARG B 213 MET B 218 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 AE4 LEU C 260 ? GLU C 265 ? LEU B 260 GLU B 265 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 SER C 280 ? ASP C 297 ? SER B 280 ASP B 297 1 ? 18 HELX_P HELX_P42 AE6 ALA C 302 ? GLY C 319 ? ALA B 302 GLY B 319 1 ? 18 HELX_P HELX_P43 AE7 THR C 336 ? VAL C 354 ? THR B 336 VAL B 354 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA C 364 ? ALA C 371 ? ALA B 364 ALA B 371 1 ? 8 HELX_P HELX_P45 AE9 SER C 388 ? SER C 395 ? SER B 388 SER B 395 1 ? 8 HELX_P HELX_P46 AF1 GLY C 456 ? GLN C 469 ? GLY B 456 GLN B 469 1 ? 14 HELX_P HELX_P47 AF2 LYS C 470 ? LYS C 472 ? 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ASP D 27 SER D 62 1 ? 36 HELX_P HELX_P62 AG8 VAL D 96 ? ALA D 111 ? VAL D 96 ALA D 111 1 ? 16 HELX_P HELX_P63 AG9 THR D 116 ? LEU D 127 ? THR D 116 LEU D 127 1 ? 12 HELX_P HELX_P64 AH1 ALA D 129 ? LYS D 138 ? ALA D 129 LYS D 138 1 ? 10 HELX_P HELX_P65 AH2 LEU D 139 ? ASP D 141 ? LEU D 139 ASP D 141 5 ? 3 HELX_P HELX_P66 AH3 ALA D 145 ? LEU D 150 ? ALA D 145 LEU D 150 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 AH4 ARG D 206 ? LEU D 211 ? ARG D 206 LEU D 211 1 ? 6 HELX_P HELX_P68 AH5 GLU E 20 ? PHE E 61 ? GLU E 20 PHE E 61 1 ? 42 HELX_P HELX_P69 AH6 VAL E 96 ? ALA E 111 ? VAL E 96 ALA E 111 1 ? 16 HELX_P HELX_P70 AH7 THR E 116 ? LEU E 127 ? THR E 116 LEU E 127 1 ? 12 HELX_P HELX_P71 AH8 ALA E 129 ? LYS E 138 ? ALA E 129 LYS E 138 1 ? 10 HELX_P HELX_P72 AH9 LEU E 139 ? ASP E 141 ? LEU E 139 ASP E 141 5 ? 3 HELX_P HELX_P73 AI1 ALA E 145 ? LEU E 150 ? ALA E 145 LEU E 150 1 ? 6 HELX_P HELX_P74 AI2 ARG E 206 ? LEU E 211 ? ARG E 206 LEU E 211 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 AI3 GLY F 23 ? SER F 62 ? 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