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_citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Poll, G.' 1 ? primary 'Pilsl, M.' 2 ? primary 'Griesenbeck, J.' 3 0000-0002-7817-6095 primary 'Tschochner, H.' 4 ? primary 'Milkereit, P.' 5 0000-0001-8850-9140 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '25S rRNA' 1097493.875 1 ? ? ? ? 2 polymer nat '5.8S rRNA' 50682.922 1 ? ? ? ? 3 polymer nat '5S rRNA' 38951.105 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '60S ribosomal protein L3' 43850.793 1 ? ? ? ? 5 polymer nat '60S ribosomal protein L4-A' 39159.125 1 ? ? ? ? 6 polymer nat '60S ribosomal protein L5' 33764.828 1 ? ? ? ? 7 polymer nat '60S ribosomal protein L6-A' 20000.564 1 ? ? ? ? 8 polymer nat '60S ribosomal protein L7-A' 27686.281 1 ? ? ? ? 9 polymer nat '60S ribosomal protein L9-A' 21605.061 1 ? ? ? ? 10 polymer nat '60S ribosomal 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UAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUA ACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAG AAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGAAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCCA GUGAAAUACCACUACCUUUAUAGUUUCUUUACUUAUUCAAUGAAGCGGAGCUGGAAUUCAUUUUCCACGUUCUAGCAUUC AAGGUCCCAUUCGGGGCUGAUCCGGGUUGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAACGA UAACGCAGAUGUCCUAAGGGGGGCUCAUGGAGAACAGAAAUCUCCAGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCCCCCUUGAUUUUG AUUUUCAGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGUCCCUCGGAAUUUGAGGCUAGAGGUGCCAG AAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCU CUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACC GUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUGUUACCGCAAUAGUAAUUGAACUUAGUACGAGAGGAACAGUUCA UUCGGAUAAUUGGUUUUUGCGGCUGUCUGAUCAGGCAUUGCCGCGAAGCUACCAUCCGCUGGAUUAUGGCUGAACGCCUC UAAGUCAGAAUCCAUGCUAGAACGCGGUGAUUUCUUUGCUCCACACAAUAUAGAUGGAUACGAAUAAGGCGUCCUUGUGG 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;AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAA UUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU ; 2 ? 3 polyribonucleotide no no ;GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAG UGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU ; ;GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUAGUUAAGCUGGUAAGAGCCUGACCGAGUAG UGUAGUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU ; 3 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVD TPPVVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYSAKYAQDGAGIERELARIKKYASVVRV LVHTQIRKTPLAQKKAHLAEIQLNGGSISEKVDWAREHFEKTVAVDSVFEQNEMIDAIAVTKGHGFEGVTHRWGTKKLPR KTHRGLRKVACIGAWHPAHVMWSVARAGQRGYHSRTSINHKIYRVGKGDDEANGATSFDRTKKTITPMGGFVHYGEIKND FIMVKGCIPGNRKRIVTLRKSLYTNTSRKALEEVSLKWIDTASKFGKGRFQTPAEKHAFMGTLKKDL ; ;MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVD TPPVVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYSAKYAQDGAGIERELARIKKYASVVRV LVHTQIRKTPLAQKKAHLAEIQLNGGSISEKVDWAREHFEKTVAVDSVFEQNEMIDAIAVTKGHGFEGVTHRWGTKKLPR KTHRGLRKVACIGAWHPAHVMWSVARAGQRGYHSRTSINHKIYRVGKGDDEANGATSFDRTKKTITPMGGFVHYGEIKND FIMVKGCIPGNRKRIVTLRKSLYTNTSRKALEEVSLKWIDTASKFGKGRFQTPAEKHAFMGTLKKDL ; B ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSRPQVTVHSLTGEATANALPLPAVFSAPIRPDIVHTVFTSVNKNKRQAYAVSEKAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVGGG GTGRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYATASAIAATAVASLVLARGHRVEKIPEIPLVVSTDLESIQ KTKEAVAALKAVGAHSDLLKVLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVYAEDNGIVKALRNVPGVETANVASLNLLQLAP GAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKN KQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFTETLKHD ; ;MSRPQVTVHSLTGEATANALPLPAVFSAPIRPDIVHTVFTSVNKNKRQAYAVSEKAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVGGG GTGRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYATASAIAATAVASLVLARGHRVEKIPEIPLVVSTDLESIQ KTKEAVAALKAVGAHSDLLKVLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVYAEDNGIVKALRNVPGVETANVASLNLLQLAP GAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKN KQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFTETLKHD ; C ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAFQKDAKSSAYSSRFQTPFRRRREGKTDYYQRKRLVTQHKAKYNTPKYRLVVRFTNKDIICQIISSTITGDVVLAAAYS HELPRYGITHGLTNWAAAYATGLLIARRTLQKLGLDETYKGVEEVEGEYELTEAVEDGPRPFKVFLDIGLQRTTTGARVF GALKGASDGGLYVPHSENRFPGWDFETEEIDPELLRSYIFGGHVSQYMEELADDDEERFSELFKGYLADDIDADSLEDIY TSAHEAIRADPAFKPTEKKFTKEQYAAESKKYRQTKLSKEERAARVAAKIAALAGQQ ; ;MAFQKDAKSSAYSSRFQTPFRRRREGKTDYYQRKRLVTQHKAKYNTPKYRLVVRFTNKDIICQIISSTITGDVVLAAAYS HELPRYGITHGLTNWAAAYATGLLIARRTLQKLGLDETYKGVEEVEGEYELTEAVEDGPRPFKVFLDIGLQRTTTGARVF GALKGASDGGLYVPHSENRFPGWDFETEEIDPELLRSYIFGGHVSQYMEELADDDEERFSELFKGYLADDIDADSLEDIY TSAHEAIRADPAFKPTEKKFTKEQYAAESKKYRQTKLSKEERAARVAAKIAALAGQQ ; D ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSAQKAPKWYPSEDVAALKKTRKAARPQKLRASLVPGTVLILLAGRFRGKRVVYLKHLEDNTLLISGPFKVNGVPLRRVN ARYVIATSTKVSVEGVNVEKFNVEYFAKEKLTKKEKKEANLFPEQQNKEIKAERVEDQKVVDKALIAEIKKTPLLKQYLS ASFSLKNGDKPHMLKF ; ;MSAQKAPKWYPSEDVAALKKTRKAARPQKLRASLVPGTVLILLAGRFRGKRVVYLKHLEDNTLLISGPFKVNGVPLRRVN ARYVIATSTKVSVEGVNVEKFNVEYFAKEKLTKKEKKEANLFPEQQNKEIKAERVEDQKVVDKALIAEIKKTPLLKQYLS ASFSLKNGDKPHMLKF ; E ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAAEKILTPESQLKKSKAQQKTAEQVAAERAARKAANKEKRAIILERNAAYQKEYETAERNIIQAKRDAKAAGSYYVEAQ HKLVFVVRIKGINKIPPKPRKVLQLLRLTRINSGTFVKVTKATLELLKLIEPYVAYGYPSYSTIRQLVYKRGFGKINKQR VPLSDNAIIEANLGKYGILSIDDLIHEIITVGPHFKQANNFLWPFKLSNPSGGWGVPRKFKHFIQGGSFGNREEFINKLV KSMN ; ;MAAEKILTPESQLKKSKAQQKTAEQVAAERAARKAANKEKRAIILERNAAYQKEYETAERNIIQAKRDAKAAGSYYVEAQ HKLVFVVRIKGINKIPPKPRKVLQLLRLTRINSGTFVKVTKATLELLKLIEPYVAYGYPSYSTIRQLVYKRGFGKINKQR VPLSDNAIIEANLGKYGILSIDDLIHEIITVGPHFKQANNFLWPFKLSNPSGGWGVPRKFKHFIQGGSFGNREEFINKLV KSMN ; F ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MKYIQTEQQIEVPEGVTVSIKSRIVKVVGPRGTLTKNLKHIDVTFTKVNNQLIKVAVHNGGRKHVAALRTVKSLVDNMIT GVTKGYKYKMRYVYAHFPINVNIVEKDGAKFIEVRNFLGDKKIRNVPVRDGVTIEFSTNVKDEIVLSGNSVEDVSQNAAD LQQICRVRNKDIRKFLDGIYVSHKGFITEDL ; ;MKYIQTEQQIEVPEGVTVSIKSRIVKVVGPRGTLTKNLKHIDVTFTKVNNQLIKVAVHNGGRKHVAALRTVKSLVDNMIT GVTKGYKYKMRYVYAHFPINVNIVEKDGAKFIEVRNFLGDKKIRNVPVRDGVTIEFSTNVKDEIVLSGNSVEDVSQNAAD LQQICRVRNKDIRKFLDGIYVSHKGFITEDL ; H ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSAKAQNPMRDLKIEKLVLNISVGESGDRLTRASKVLEQLSGQTPVQSKARYTVRTFGIRRNEKIAVHVTVRGPKAEEIL ERGLKVKEYQLRDRNFSATGNFGFGIDEHIDLGIKYDPSIGIFGMDFYVVMNRPGARVTRRKRCKGTVGNSHKTTKEDTV SWFKQKYDADVLDK ; ;MSAKAQNPMRDLKIEKLVLNISVGESGDRLTRASKVLEQLSGQTPVQSKARYTVRTFGIRRNEKIAVHVTVRGPKAEEIL ERGLKVKEYQLRDRNFSATGNFGFGIDEHIDLGIKYDPSIGIFGMDFYVVMNRPGARVTRRKRCKGTVGNSHKTTKEDTV SWFKQKYDADVLDK ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MSTDSIVKASNWRLVEVGRVVLIKKGQSAGKLAAIVEIIDQKKVLIDGPKAGVPRQAINLGQVVLTPLTFALPRGARTAT VSKKWAAAAVCEKWAASSWAKKIAQRERRAALTDFERFQVMVLRKQKRYTVKKALAKA ; ;MSTDSIVKASNWRLVEVGRVVLIKKGQSAGKLAAIVEIIDQKKVLIDGPKAGVPRQAINLGQVVLTPLTFALPRGARTAT VSKKWAAAAVCEKWAASSWAKKIAQRERRAALTDFERFQVMVLRKQKRYTVKKALAKA ; M ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MSVEPVVVIDGKGHLVGRLASVVAKQLLNGQKIVVVRAEELNISGEFFRNKLKYHDFLRKATAFNKTRGPFHFRAPSRIF YKALRGMVSHKTARGKAALERLKVFEGIPPPYDKKKRVVVPQALRVLRLKPGRKYTTLGKLSTSVGWKYEDVVAKLEAKR KVSSAEYYAKKRAFTKKVASANATAAESDVAKQLAALGY ; ;MSVEPVVVIDGKGHLVGRLASVVAKQLLNGQKIVVVRAEELNISGEFFRNKLKYHDFLRKATAFNKTRGPFHFRAPSRIF YKALRGMVSHKTARGKAALERLKVFEGIPPPYDKKKRVVVPQALRVLRLKPGRKYTTLGKLSTSVGWKYEDVVAKLEAKR KVSSAEYYAKKRAFTKKVASANATAAESDVAKQLAALGY ; O ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MGIDHTSKQHKRSGHRTAPKSDNVYLKLLVKLYTFLARRTDAPFNKVVLKALFLSKINRPPVSVSRIARALKQEGAANKT VVVVGTVTDDARIFEFPKTTVAALRFTAGARAKIVKAGGECITLDQLAVRAPKGQNTLILRGPRNSREAVRHFGMGPHKG KAPRILSTGRKFERARGRRRSKGFKV ; ;MGIDHTSKQHKRSGHRTAPKSDNVYLKLLVKLYTFLARRTDAPFNKVVLKALFLSKINRPPVSVSRIARALKQEGAANKT VVVVGTVTDDARIFEFPKTTVAALRFTAGARAKIVKAGGECITLDQLAVRAPKGQNTLILRGPRNSREAVRHFGMGPHKG KAPRILSTGRKFERARGRRRSKGFKV ; Q ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MAHFKEYQVIGRRLPTESVPEPKLFRMRIFASNEVIAKSRYWYFLQKLHKVKKASGEIVSINQINEAHPTKVKNFGVWVR YDSRSGTHNMYKEIRDVSRVAAVETLYQDMAARHRARFRSIHILKVAEIEKTADVKRQYVKQFLTKDLKFPLPHRVQKST KTFSYKRPSTFY ; ;MAHFKEYQVIGRRLPTESVPEPKLFRMRIFASNEVIAKSRYWYFLQKLHKVKKASGEIVSINQINEAHPTKVKNFGVWVR YDSRSGTHNMYKEIRDVSRVAAVETLYQDMAARHRARFRSIHILKVAEIEKTADVKRQYVKQFLTKDLKFPLPHRVQKST KTFSYKRPSTFY ; S ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MGKSHGYRSRTRYMFQRDFRKHGAVHLSTYLKVYKVGDIVDIKANGSIQKGMPHKFYQGKTGVVYNVTKSSVGVIINKMV GNRYLEKRLNLRVEHIKHSKCRQEFLERVKANAAKRAEAKAQGVAVQLKRQPAQPRESRIVSTEGNVPQTLAPVPYETFI ; ;MGKSHGYRSRTRYMFQRDFRKHGAVHLSTYLKVYKVGDIVDIKANGSIQKGMPHKFYQGKTGVVYNVTKSSVGVIINKMV GNRYLEKRLNLRVEHIKHSKCRQEFLERVKANAAKRAEAKAQGVAVQLKRQPAQPRESRIVSTEGNVPQTLAPVPYETFI ; T ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MSGNGAQGTKFRISLGLPVGAIMNCADNSGARNLYIIAVKGSGSRLNRLPAASLGDMVMATVKKGKPELRKKVMPAIVVR QAKSWRRRDGVFLYFEDNAGVIANPKGEMKGSAITGPVGKECADLWPRVASNSGVVV ; ;MSGNGAQGTKFRISLGLPVGAIMNCADNSGARNLYIIAVKGSGSRLNRLPAASLGDMVMATVKKGKPELRKKVMPAIVVR QAKSWRRRDGVFLYFEDNAGVIANPKGEMKGSAITGPVGKECADLWPRVASNSGVVV ; V ? 17 'polypeptide(L)' no no 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IETYS ; ;MATRTQFENSNEIGVFSKLTNTYCLVAVGGSENFYSAFEAELGDAIPIVHTTIAGTRIIGRMTAGNRRGLLVPTQTTDQE LQHLRNSLPDSVKIQRVEERLSALGNVICCNDYVALVHPDIDRETEELISDVLGVEVFRQTISGNILVGSYCSLSNQGGL VHPQTSVQDQEELSSLLQVPLVAGTVNRGSSVVGAGMVVNDYLAVTGLDTTAPELSVIESIFRLQDAQPESISGNLRDTL IETYS ; y ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 U n 1 3 U n 1 4 U n 1 5 G n 1 6 A n 1 7 C n 1 8 C n 1 9 U n 1 10 C n 1 11 A n 1 12 A n 1 13 A n 1 14 U n 1 15 C n 1 16 A n 1 17 G n 1 18 G n 1 19 U n 1 20 A n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 A n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 A n 1 27 C n 1 28 C n 1 29 C n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 U n 1 33 G n 1 34 A n 1 35 A n 1 36 C n 1 37 U n 1 38 U n 1 39 A n 1 40 A n 1 41 G n 1 42 C n 1 43 A n 1 44 U n 1 45 A n 1 46 U n 1 47 C n 1 48 A n 1 49 A n 1 50 U n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 C n 1 55 G n 1 56 G n 1 57 A n 1 58 G n 1 59 G n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 A n 1 63 A n 1 64 G n 1 65 A n 1 66 A n 1 67 A n 1 68 C n 1 69 C n 1 70 A n 1 71 A n 1 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19 ;MASLPHPKIVKKHTKKFKRHHSDRYHRVAENWRKQKGIDSVVRRRFRGNISQPKIGYGSNKKTKFLSPSGHKTFLVANVK DLETLTMHTKTYAAEIAHNISAKNRVVILARAKALGIKVTNPKGRLALEA ; 1 20 UNP RL33A_YEAST P05744 ? 20 ;MAESHRLYVKGKHLSYQRSKRVNNPNVSLIKIEGVATPQDAQFYLGKRIAYVYRASKEVRGSKIRVMWGKVTRTHGNSGV VRATFRNNLPAKTFGASVRIFLYPSNI ; 1 21 UNP NOG2_YEAST P53742 ? 21 ;MGTGKKEKSRRIREGDTKDGNLRVKGENFYRDSKRVKFLNMYTSGKEIRNKKGNLIRAASFQDSTIPDARVQPDRRWFGN TRVISQDALQHFRSALGETQKDTYQVLLRRNKLPMSLLEEKDADESPKARILDTESYADAFGPKAQRKRPRLAASNLEDL VKATNEDITKYEEKQVLDATLGLMGNQEDKENGWTSAAKEAIFSKGQSKRIWNELYKVIDSSDVVIHVLDARDPLGTRCK SVEEYMKKETPHKHLIYVLNKCDLVPTWVAAAWVKHLSKERPTLAFHASITNSFGKGSLIQLLRQFSQLHTDRKQISVGF IGYPNTGKSSIINTLRKKKVCQVAPIPGETKVWQYITLMKRIFLIDCPGIVPPSSKDSEEDILFRGVVRVEHVTHPEQYI PGVLKRCQVKHLERTYEISGWKDATEFIEILARKQGRLLKGGEPDESGVSKQILNDFNRGKIPWFVLPPEKEGEEKPKKK EVEKTA ; 1 22 UNP NSA2_YEAST P40078 ? 22 ;MPQNDYIERHIKQHGKRLDHEERKRKREARESHKISERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVSMRKKIKAHEQSKVKGSSKPL DTDGDALPTYLLDREQNNTAKAISSSIKQKRLEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVIKTGKSRSKSWKRMITKHTFVGEG FTRRPVKMERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILAVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGMVTAGGKVVWG KYAQVTNEPDRDGCVNAVLLV ; 1 23 UNP RLP24_YEAST Q07915 ? 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27 ;MATRTQFENSNEIGVFSKLTNTYCLVAVGGSENFYSAFEAELGDAIPIVHTTIAGTRIIGRMTAGNRRGLLVPTQTTDQE LQHLRNSLPDSVKIQRVEERLSALGNVICCNDYVALVHPDIDRETEELISDVLGVEVFRQTISGNILVGSYCSLSNQGGL VHPQTSVQDQEELSSLLQVPLVAGTVNRGSSVVGAGMVVNDYLAVTGLDTTAPELSVIESIFRLQDAQPESISGNLRDTL IETYS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7OHT 1 1 ? 3396 ? 7OHT 1 ? 3396 ? 1 3396 2 2 7OHT 2 1 ? 158 ? 7OHT 1 ? 158 ? 1 158 3 3 7OHT 3 1 ? 121 ? 834774822 459650 ? 459770 ? 1 121 4 4 7OHT B 1 ? 387 ? P14126 1 ? 387 ? 1 387 5 5 7OHT C 1 ? 362 ? P10664 1 ? 362 ? 1 362 6 6 7OHT D 1 ? 297 ? P26321 1 ? 297 ? 1 297 7 7 7OHT E 1 ? 176 ? Q02326 1 ? 176 ? 1 176 8 8 7OHT F 1 ? 244 ? P05737 1 ? 244 ? 1 244 9 9 7OHT H 1 ? 191 ? P05738 1 ? 191 ? 1 191 10 10 7OHT J 1 ? 174 ? P0C0W9 1 ? 174 ? 1 174 11 11 7OHT M 1 ? 138 ? P36105 1 ? 138 ? 1 138 12 12 7OHT O 1 ? 199 ? P26784 1 ? 199 ? 1 199 13 13 7OHT Q 1 ? 186 ? P0CX49 1 ? 186 ? 1 186 14 14 7OHT S 1 ? 172 ? P0CX23 1 ? 172 ? 1 172 15 15 7OHT T 1 ? 160 ? Q02753 1 ? 160 ? 1 160 16 16 7OHT V 1 ? 137 ? P0CX41 1 ? 137 ? 1 137 17 17 7OHT W 1 ? 236 ? P33201 1 ? 236 ? 1 236 18 18 7OHT b 1 ? 647 ? Q02892 1 ? 647 ? 1 647 19 19 7OHT e 1 ? 130 ? P38061 1 ? 130 ? 1 130 20 20 7OHT f 1 ? 107 ? P05744 1 ? 107 ? 1 107 21 21 7OHT m 1 ? 486 ? P53742 1 ? 486 ? 1 486 22 22 7OHT r 1 ? 261 ? P40078 1 ? 261 ? 1 261 23 23 7OHT u 1 ? 199 ? Q07915 1 ? 199 ? 1 199 24 24 7OHT v 1 ? 344 ? P36160 1 ? 344 ? 1 344 25 25 7OHT w 1 ? 203 ? Q08746 1 ? 203 ? 1 203 26 26 7OHT x 1 ? 515 ? P25382 1 ? 515 ? 1 515 27 27 7OHT y 1 ? 245 ? Q12522 1 ? 245 ? 1 245 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7OHT _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7OHT _struct.title 'Nog1-TAP associated immature ribosomal particles from S. cerevisiae after rpL2 expression shut down, population A' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7OHT _struct_keywords.text 'ribosomal assembly state, RIBOSOME' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 28 ? DA N N 29 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 HIS D 13 ? LEU D 17 ? HIS B 13 LEU B 17 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 SER D 111 ? TYR D 119 ? SER B 111 TYR B 119 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 AA3 PHE D 130 ? ALA D 138 ? 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A U 1218 O4 ? ? ? 1_555 A A 1287 N6 ? ? 1 U 1218 1 A 1287 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog459 hydrog ? ? A U 1218 N3 ? ? ? 1_555 A U 1288 O2 ? ? 1 U 1218 1 U 1288 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog460 hydrog ? ? A U 1218 O4 ? ? ? 1_555 A U 1288 N3 ? ? 1 U 1218 1 U 1288 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? ? hydrog461 hydrog ? ? A G 1222 N2 ? ? ? 1_555 A A 1286 N7 ? ? 1 G 1222 1 A 1286 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog462 hydrog ? ? A G 1222 N3 ? ? ? 1_555 A A 1286 N6 ? ? 1 G 1222 1 A 1286 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog463 hydrog ? ? A C 1224 N3 ? ? ? 1_555 A G 3116 N1 ? ? 1 C 1224 1 G 3116 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog464 hydrog ? ? A C 1224 N4 ? ? ? 1_555 A G 3116 O6 ? ? 1 C 1224 1 G 3116 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog465 hydrog ? ? A C 1224 O2 ? ? ? 1_555 A G 3116 N2 ? ? 1 C 1224 1 G 3116 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog466 hydrog ? ? 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'C-A MISPAIR' ? ? ? hydrog1262 hydrog ? ? C C 36 N3 ? ? ? 1_555 C G 41 N1 ? ? 3 C 36 3 G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1263 hydrog ? ? C C 36 N4 ? ? ? 1_555 C G 41 O6 ? ? 3 C 36 3 G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1264 hydrog ? ? C C 36 O2 ? ? ? 1_555 C G 41 N2 ? ? 3 C 36 3 G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1265 hydrog ? ? C G 37 N2 ? ? ? 1_555 C U 43 O4 ? ? 3 G 37 3 U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog1266 hydrog ? ? C G 37 N2 ? ? ? 1_555 C C 44 N3 ? ? 3 G 37 3 C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog1267 hydrog ? ? C U 38 O2 ? ? ? 1_555 C A 42 N6 ? ? 3 U 38 3 A 42 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog1268 hydrog ? ? C U 53 O2 ? ? ? 1_555 C A 55 N6 ? ? 3 U 53 3 A 55 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog1269 hydrog ? ? C U 54 O2 ? ? ? 1_555 C A 56 N6 ? ? 3 U 54 3 A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? ? hydrog1270 hydrog ? ? C C 68 N3 ? ? ? 1_555 C G 110 N1 ? ? 3 C 68 3 G 110 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1271 hydrog ? ? C C 68 N4 ? ? ? 1_555 C G 110 O6 ? ? 3 C 68 3 G 110 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1272 hydrog ? ? C C 68 O2 ? ? ? 1_555 C G 110 N2 ? ? 3 C 68 3 G 110 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1273 hydrog ? ? C C 68 N3 ? ? ? 1_555 C U 111 N3 ? ? 3 C 68 3 U 111 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog1274 hydrog ? ? C C 68 N4 ? ? ? 1_555 C U 111 O4 ? ? 3 C 68 3 U 111 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog1275 hydrog ? ? C C 69 N3 ? ? ? 1_555 C G 109 N1 ? ? 3 C 69 3 G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1276 hydrog ? ? C C 69 N4 ? ? ? 1_555 C G 109 O6 ? ? 3 C 69 3 G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1277 hydrog ? ? C C 69 O2 ? ? ? 1_555 C G 109 N2 ? ? 3 C 69 3 G 109 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1278 hydrog ? ? C U 70 N3 ? ? ? 1_555 C A 108 N1 ? ? 3 U 70 3 A 108 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1279 hydrog ? ? C U 70 O4 ? ? ? 1_555 C A 108 N6 ? ? 3 U 70 3 A 108 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 17 D . ? LEU 17 B PRO 18 D ? PRO 18 B 1 1.33 2 ILE 148 E . ? ILE 148 C PRO 149 E ? PRO 149 C 1 -1.02 3 HIS 40 F . ? HIS 40 D LYS 41 F ? LYS 41 D 1 -12.32 4 GLY 67 G . ? 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ALA Z 38 ? ILE x 34 ALA x 38 AE8 3 ILE Z 117 ? PRO Z 123 ? ILE x 117 PRO x 123 AE8 4 TYR Z 77 ? CYS Z 81 ? TYR x 77 CYS x 81 AE9 1 ILE Z 146 ? PHE Z 151 ? ILE x 146 PHE x 151 AE9 2 ARG Z 158 ? ALA Z 163 ? ARG x 158 ALA x 163 AE9 3 ALA Z 168 ? ASP Z 172 ? ALA x 168 ASP x 172 AE9 4 THR Z 177 ? LEU Z 182 ? THR x 177 LEU x 182 AF1 1 VAL Z 189 ? TRP Z 194 ? VAL x 189 TRP x 194 AF1 2 ILE Z 201 ? SER Z 205 ? ILE x 201 SER x 205 AF1 3 ILE Z 210 ? TRP Z 213 ? ILE x 210 TRP x 213 AF2 1 ILE Z 232 ? TRP Z 237 ? ILE x 232 TRP x 237 AF2 2 LEU Z 251 ? SER Z 255 ? LEU x 251 SER x 255 AF2 3 ILE Z 260 ? TRP Z 263 ? ILE x 260 TRP x 263 AF2 4 CYS Z 270 ? MET Z 274 ? CYS x 270 MET x 274 AF3 1 VAL Z 281 ? TRP Z 286 ? VAL x 281 TRP x 286 AF3 2 LEU Z 291 ? SER Z 296 ? LEU x 291 SER x 296 AF3 3 VAL Z 301 ? ASP Z 305 ? VAL x 301 ASP x 305 AF3 4 ARG Z 311 ? LEU Z 316 ? ARG x 311 LEU x 316 AF4 1 VAL Z 323 ? LEU Z 328 ? VAL x 323 LEU x 328 AF4 2 MET Z 374 ? SER Z 378 ? MET x 374 SER x 378 AF4 3 THR Z 382 ? 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